tools/clitkAffineTransformGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkAffineTransformGenericFilter_h
  19 #define clitkAffineTransformGenericFilter_h
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkAffineTransformGenericFilter.h
  23  * @author jefvdmb@gmail.com
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30
  31 // clitk include
  32 #include "clitkIO.h"
  33 #include "clitkCommon.h"
  34 #include "clitkAffineTransform_ggo.h"
  35 #include "clitkTransformUtilities.h"
  36 #include "clitkGenericInterpolator.h"
  37 #include "clitkGenericVectorInterpolator.h"
  38
  39 //itk include
  40 #include "itkLightObject.h"
  41 #include "itkAffineTransform.h"
  42 #include "itkResampleImageFilter.h"
  43 #if ( ITK_VERSION_MAJOR < 5 )
  44 #include "itkVectorResampleImageFilter.h"
  45 #endif
  46
  47
  48 namespace clitk
  49 {
  50
  51
  52   template<class args_info_type>
  53   class ITK_EXPORT AffineTransformGenericFilter : public itk::LightObject
  54   {
  55   public:
  56     //----------------------------------------
  57     // ITK
  58     //----------------------------------------
  59     typedef AffineTransformGenericFilter                   Self;
  60     typedef itk::LightObject                   Superclass;
  61     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  62     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  63
  64     // Method for creation through the object factory
  65     itkNewMacro(Self);
  66
  67     // Run-time type information (and related methods)
  68     itkTypeMacro( AffineTransformGenericFilter, LightObject );
  69
  70
  71     //----------------------------------------
  72     // Typedefs
  73     //----------------------------------------
  74
  75
  76     //----------------------------------------
  77     // Set & Get
  78     //----------------------------------------
  79     void SetArgsInfo(const args_info_type & a)
  80     {
  81       m_ArgsInfo=a;
  82       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  83       m_InputFileName=m_ArgsInfo.input_arg;
  84     }
  85
  86
  87     //----------------------------------------
  88     // Update
  89     //----------------------------------------
  90     void Update();
  91
  92
  93     //----------------------------------------
  94     // Compute bounding box
  95     //----------------------------------------
  96     vnl_vector<double> ComputeSize(vnl_vector<double> inputSize, vnl_matrix<double> transformationMatrix, bool returnMin);
  97
  98   protected:
  99
 100     //----------------------------------------
 101     // Constructor & Destructor
 102     //----------------------------------------
 103     AffineTransformGenericFilter();
 104     ~AffineTransformGenericFilter() {};
 105
 106
 107     //----------------------------------------
 108     // Templated members
 109     //----------------------------------------
 110     template <unsigned int Dimension>  void UpdateWithDim(std::string PixelType, int Components);
 111     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndPixelType();
 112     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndVectorType();
 113
 114     //----------------------------------------
 115     // Data members
 116     //----------------------------------------
 117     args_info_type m_ArgsInfo;
 118     bool m_Verbose;
 119     std::string m_InputFileName;
 120
 121   };
 122
 123
 124 } // end namespace clitk
 125
 126 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 127 #include "clitkAffineTransformGenericFilter.txx"
 128 #endif
 129
 130 #endif // #define clitkAffineTransformGenericFilter_h