tools/clitkDicom2Image.ggo

   1 # file clitkDicom2Image.ggo
   2 package "clitk"
   3 version "Try to convert a DICOM into an image (.hdr, .vox...) identifying all available series"
   4
   5 option "config"             -   "Config file"            string         no
   6 option "verbose"              v "Verbose"                        flag off
   7 option "tolerance"          t "Tolerance for slice position"     double default="0" no
   8 option "output"         o "Output image filename"               string  yes
   9 option "std_input"      - "Take the like of input file from stdin, to support huge lists of filenames" flag off
  10 option "focal_origin"   - "Output files with FOCAL-like origin, instead of the origin present in the dicom files" flag off
  11 option "patientSystem"  p "Open the image with patient coordinate system" flag off
  12 option "instanceNumber" n "Sort the images regarding instance number in dicom tag" flag off
  13 option "reverse"        r "Reverse the slice order" flag off