tools/clitkJacobianImageGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkJacobianImageGenericFilter_h
  19 #define clitkJacobianImageGenericFilter_h
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkJacobianImageGenericFilter.h
  23  * @author
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30
  31 // clitk include
  32 #include "clitkIO.h"
  33 #include "clitkCommon.h"
  34 #include "clitkJacobianImage_ggo.h"
  35
  36 //itk include
  37 #include "itkLightObject.h"
  38 #include "itkInverseDisplacementFieldImageFilter.h"
  39
  40 namespace clitk
  41 {
  42
  43   template<class args_info_type>
  44   class ITK_EXPORT JacobianImageGenericFilter : public itk::LightObject
  45   {
  46   public:
  47     //----------------------------------------
  48     // ITK
  49     //----------------------------------------
  50     typedef JacobianImageGenericFilter                   Self;
  51     typedef itk::LightObject                   Superclass;
  52     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  53     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  54
  55     // Method for creation through the object factory
  56     itkNewMacro(Self);
  57
  58     // Run-time type information (and related methods)
  59     itkTypeMacro( JacobianImageGenericFilter, LightObject );
  60
  61
  62     //----------------------------------------
  63     // Typedefs
  64     //----------------------------------------
  65
  66
  67     //----------------------------------------
  68     // Set & Get
  69     //----------------------------------------
  70     void SetArgsInfo(const args_info_type & a)
  71     {
  72       m_ArgsInfo=a;
  73       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  74       m_InputFileName=m_ArgsInfo.input_arg;
  75     }
  76
  77
  78     //----------------------------------------
  79     // Update
  80     //----------------------------------------
  81     void Update();
  82
  83   protected:
  84
  85     //----------------------------------------
  86     // Constructor & Destructor
  87     //----------------------------------------
  88     JacobianImageGenericFilter();
  89     ~JacobianImageGenericFilter() {};
  90
  91
  92     //----------------------------------------
  93     // Templated members
  94     //----------------------------------------
  95     template <unsigned int Dimension>  void UpdateWithDim(std::string PixelType);
  96     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndPixelType();
  97
  98
  99     //----------------------------------------
 100     // Data members
 101     //----------------------------------------
 102     args_info_type m_ArgsInfo;
 103     bool m_Verbose;
 104     std::string m_InputFileName;
 105
 106   };
 107
 108
 109 } // end namespace clitk
 110
 111 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 112 #include "clitkJacobianImageGenericFilter.txx"
 113 #endif
 114
 115 #endif // #define clitkJacobianImageGenericFilter_h