vv/vvMainWindow.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef VVMAINWINDOW_H
  20 #define VVMAINWINDOW_H
  21
  22 #include <iostream>
  23 #include <vector>
  24 #include "ui_vvMainWindow.h"
  25 #include "vvMainWindowBase.h"
  26 #include "vvToolManager.h"
  27 #include "vvImageReader.h"
  28 #include "vvMesh.h"
  29 #include "clitkMemoryUsage.h"
  30
  31 #include "vtkSmartPointer.h"
  32
  33
  34 class vvSlicerManager;
  35 class vvHelpDialog;
  36 class vvDocumentation;
  37 class vtkRenderWindowInteractor;
  38 class vtkImageData;
  39 class vtkRenderer;
  40 class vtkMatrix4x4;
  41 class vvDicomSeriesSelector;
  42 #if CLITK_USE_PACS_CONNECTION
  43 class vvQPacsConnection;
  44 #endif
  45 class vvSlicer;
  46 class QTreeWidget;
  47
  48 //------------------------------------------------------------------------------
  49 class vvMainWindow: public vvMainWindowBase,
  50                     private Ui::vvMainWindow
  51 {
  52   Q_OBJECT
  53
  54   public:
  55   vvMainWindow();
  56   ~vvMainWindow();
  57   void LoadImages(std::vector<std::string> filenames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  58   vvSlicerManager * AddImage(vvImage::Pointer image,std::string filename);
  59   void AddField(QString file,int index);
  60   bool CheckAddedImage(int index, QString imageType);
  61   void AddOverlayImage(int index, std::vector<std::string> fileNames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  62   void AddFusionImage(int index, std::vector<std::string> fileNames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  63   void AddROI(int index, QString filename);
  64
  65   //Process the sequence for fusion:
  66   void AddFusionSequence(int index, std::vector<std::string> fileNames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  67
  68   void AddLandmarks(int index, std::vector<std::string>);
  69 ///Adds a mesh to a SlicerManager, with optional warping by vector field
  70   void AddContour(int image_index, vvMesh::Pointer contour, bool propagation);
  71   ///This is used to show an image when opened or computed
  72   void ShowLastImage();
  73   void SaveCurrentStateAs(const std::string& stateFile);
  74   void ReadSavedStateFile(const std::string& stateFile);
  75         void LinkAllImages();
  76
  77   virtual void UpdateCurrentSlicer();
  78   virtual QTabWidget * GetTab();
  79   QTreeWidget* GetTree() { return DataTree; }
  80   //vvMainWindowToolInfo * GetInfoForTool();
  81 //   void AddRunningTool(vvToolCreatorBase * tool);
  82
  83 public slots:
  84   ///Allows the user to open and select various surfaces contained in a dicom-struct file
  85   void AddDCStructContour(int index, QString file);
  86   void OpenDCStructContour();
  87   ///Computes the midposition image of a 4D sequence with a VF and displays it
  88   void ComputeMidPosition();
  89   void OpenImages();
  90   ///Slot triggered by the dynamically-generated recent file menu actions
  91   void OpenRecentImage();
  92   void OpenImageWithTime();
  93   void MergeImages();
  94   void SliceImages();
  95   void MergeImagesWithTime();
  96   void OpenDicom();
  97 #if CLITK_USE_PACS_CONNECTION
  98   void ConnectPacs();
  99 #endif
 100   ///Open a vtkPolyData surface mesh and display it over the current image
 101   void OpenVTKContour();
 102   void SaveAs();
 103   void SaveCurrentState();
 104   void ReadSavedState();
 105   void CurrentImageChanged(std::string id);
 106   void CurrentPickedImageChanged(std::string id);
 107   void ImageInfoChanged();
 108   void ShowHelpDialog();
 109   void ShowDocumentation();
 110   void PopupRegisterForm(bool checkCanPush=false);
 111   void ComputeDeformableRegistration();
 112   void WarpImage();
 113   void ChangeViewMode();
 114   void DisplayChanged(QTreeWidgetItem *item, int column);
 115   void CloseImage(QTreeWidgetItem* item, int column);
 116   void ReloadImage(QTreeWidgetItem* item, int column);
 117   void MousePositionChanged(int visibility, double x, double y, double z, double X, double Y, double Z , double value);
 118   void VectorChanged(int visibility, double x, double y, double z, double value);
 119   void OverlayChanged(int visibility, double valueOver, double valueRef);
 120   void FusionChanged(int visibility, double value);
 121   //void FusionSequenceChanged(int visibility, double value);
 122   void SegmentationOnCurrentImage();
 123   void SurfaceViewerLaunch();
 124
 125   void WindowLevelChanged();
 126   void UpdateSlice(int slicer, int slice);
 127   void UpdateTSlice(int slicer, int slice, int code=-1);
 128   void UpdateSliceRange(int slicer, int min, int max, int tmin, int tmax);
 129   void WindowLevelEdited();
 130   void SetWindowLevel(double w, double l);
 131   void UpdateColorMap();
 132   void UpdateWindowLevel();
 133   void UpdateSlicingPreset();
 134   void SwitchWindowLevel();
 135   void ApplyWindowLevelToAllImages();
 136   void ApplyWindowToSetOfImages(double window, unsigned int indexMin, unsigned int indexMax);
 137   void ApplyLevelToSetOfImages(double level, unsigned int indexMin, unsigned int indexMax);
 138   void UpdateLinkManager(std::string id, int slicer, double x, double y, double z, int temps);
 139   void UpdateLinkedNavigation(std::string id, vvSlicerManager *sm, vvSlicer* refSlicer);
 140   void AddLink(QString image1,QString image2,bool fromPanel = true);
 141   void RemoveLink(QString image1,QString image2);
 142   void ChangeImageWithIndexOffset(vvSlicerManager *sm, int slicer, int offset);
 143
 144   ///Generic method called when any one of the horizontal sliders is moved
 145   void HorizontalSliderMoved(int value,int column, int slicer_index);
 146   void NOHorizontalSliderMoved();
 147   void NEHorizontalSliderMoved();
 148   void SOHorizontalSliderMoved();
 149   void SEHorizontalSliderMoved();
 150
 151   void NOVerticalSliderChanged();
 152   void NEVerticalSliderChanged();
 153   void SOVerticalSliderChanged();
 154   void SEVerticalSliderChanged();
 155
 156   void SaveNEScreenshot();
 157   void SaveNOScreenshot();
 158   void SaveSEScreenshot();
 159   void SaveSOScreenshot();
 160   void SaveScreenshotAllSlices();
 161
 162   void ShowContextMenu(QPoint point);
 163   void CloseImage();
 164   void ReloadImage();
 165   void OpenField();
 166   void SelectOverlayImage();
 167   void SelectFusionImage();
 168   //select the file(s) from the disk containing the image sequence to fuse
 169   void SelectFusionSequence();
 170   void SelectFusionSequenceCorrespondances();
 171
 172   void ResetTransformationToIdentity();
 173
 174   void SetVFProperty(int subsampling,int scale,int lut, int width, double r, double g, double b);
 175   void SetOverlayProperty(int color, int linked, double window, double level);
 176   void SetFusionProperty(int opacity, int tresOpacity, int colormap,double window,double level, bool showLegend);
 177   void SetFusionSequenceProperty(int fusionSequenceFrameIndex, bool spatialSyncFlag, unsigned int fusionSequenceNbFrames, bool temporalSyncFlag);
 178
 179   void GoToCursor();
 180   void GoToLandmark();
 181   void PlayPause();
 182   void PlayNext();
 183   void ChangeFrameRate(int rate) {
 184     mFrameRate = rate;
 185   }
 186   void UpdateRenderWindows();
 187   void UpdateMemoryUsage();
 188   void show();
 189
 190 protected:
 191
 192   void createRecentlyOpenedFilesMenu();
 193   void updateRecentlyOpenedFilesMenu(const std::list<std::string> &files);
 194
 195 private:
 196
 197   //variables
 198   // std::vector<vvSlicerManager*> mSlicerManagers;
 199   vvHelpDialog *help_dialog;
 200   vvDocumentation *documentation;
 201   vvDicomSeriesSelector *dicomSeriesSelector;
 202
 203 #if CLITK_USE_PACS_CONNECTION
 204   vvQPacsConnection *PacsConnection;
 205 #endif
 206
 207   bool viewMode;
 208   bool playMode;
 209
 210   //functions
 211   void UpdateTree();
 212   ///Adds a vector field to slicer manager index
 213   void WarpImage(vvSlicerManager* selected_slicer,int reference_phase);
 214   void AddFieldEntry(QString filename,int index,bool from_disk);
 215   void AddField(vvImage::Pointer vf,QString file,int index);
 216   void InitDisplay();
 217   ///Sets the render window and LUT for the last SlicerManager
 218   void InitSlicers();
 219   void DisplaySliders(int slicer, int window);
 220   QString GetSizeInBytes(unsigned long size);
 221   QString GetVectorDoubleAsString(std::vector<double> vectorDouble);
 222   QString GetVectorIntAsString(std::vector<int> vectorInt);
 223   int GetSlicerIndexFromItem(QTreeWidgetItem* item); //this actually returns the SlicerManager index TODO: rename it to GetSlicerManagerIndexFromItem
 224   QTreeWidgetItem* GetItemFromSlicerManager(vvSlicerManager* sm);
 225   void SaveScreenshot(QVTKWidget *widget);
 226   int GetImageDuplicateFilenameNumber(std::string filename);
 227
 228   QMenu contextMenu;
 229   QMenu* recentlyOpenedFilesMenu;
 230   //QMenu *AddSubImageMenu;
 231   std::vector<QAction*> contextActions;
 232   std::vector<QSlider*> horizontalSliders;
 233   std::vector<QSlider*> verticalSliders;
 234   int mFrameRate;
 235
 236   std::string mCurrentSelectedImageId;
 237   std::string mCurrentPickedImageId;
 238   unsigned int mCurrentPickedImageIndex;
 239
 240   // vvMainWindowToolInfo * mCurrentToolInfo;
 241   // std::vector<vvToolCreatorBase*> mListOfRunningTool;
 242
 243   static vvMainWindow * mSingleton;
 244
 245   int mCurrentTime;
 246
 247 };
 248
 249 #endif