vv/vvToolMedianFilter.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================*/
  18 /*=========================================================================
  19
  20   Program:   vv
  21   Module:    $RCSfile: vvToolMedianFilter.cxx,v $
  22   Language:  C++
  23   Date:      $Date: 2010/10/22 07:38:05 $
  24   Version:   $Revision: 1.5 $
  25   Author :   Bharath Navalpakkam (Bharath.Navalpakkam@creatis.insa-lyon.fr)
  26
  27   Copyright (C) 2010
  28   Léon Bérard cancer center http://www.centreleonberard.fr
  29   CREATIS                   http://www.creatis.insa-lyon.fr
  30
  31   This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  32   it under the terms of the GNU General Public License as published by
  33   the Free Software Foundation, version 3 of the License.
  34
  35   This program is distributed in the hope that it will be useful,
  36   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  37   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  38   GNU General Public License for more details.
  39
  40   You should have received a copy of the GNU General Public License
  41   along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  42
  43   =========================================================================*/
  44
  45 #include "vvToolMedianFilter.h"
  46 #include "vvSlicerManager.h"
  47 #include "vvSlicer.h"
  48 #include "vvToolInputSelectorWidget.h"
  49 #include "clitkMedianImageGenericFilter.h"
  50
  51 //------------------------------------------------------------------------------
  52 // Create the tool and automagically
  53 ADD_TOOL(vvToolMedianFilter);
  54 //------------------------------------------------------------------------------
  55
  56 //------------------------------------------------------------------------------
  57 vvToolMedianFilter::vvToolMedianFilter(vvMainWindowBase * parent, Qt::WindowFlags f)
  58   :vvToolWidgetBase(parent,f),
  59    vvToolBase<vvToolMedianFilter>(parent),
  60    Ui::vvToolMedianFilter()
  61 {
  62   // Setup the UI
  63   Ui_vvToolMedianFilter::setupUi(mToolWidget);
  64   mFilter = new clitk::MedianImageGenericFilter<args_info_clitkMedianImageFilter>;
  65
  66   // Main filter
  67   // Set how many inputs are needed for this tool
  68   AddInputSelector("Select one image", mFilter);
  69 }
  70
  71 //------------------------------------------------------------------------------
  72 vvToolMedianFilter::~vvToolMedianFilter()
  73 {
  74 }
  75 //------------------------------------------------------------------------------
  76 void vvToolMedianFilter::Initialize()
  77 {
  78   SetToolName("MedianFilter");
  79   SetToolMenuName("MedianFilter");
  80   SetToolIconFilename(":common/icons/ducky.png");
  81   SetToolTip("Make 'MedianFilter' on an image.");
  82   SetToolExperimental(true);
  83 }
  84 //------------------------------------------------------------------------------
  85
  86 void vvToolMedianFilter::apply()
  87 {
  88
  89   GetArgsInfoFromGUI();
  90   if (!mCurrentSlicerManager) close();
  91   QApplication::setOverrideCursor(QCursor(Qt::WaitCursor));
  92   // Main filter
  93   clitk::MedianImageGenericFilter<args_info_clitkMedianImageFilter>::Pointer filter =
  94     clitk::MedianImageGenericFilter<args_info_clitkMedianImageFilter>::New();
  95   filter->SetInputVVImage(mCurrentImage);
  96   filter->SetArgsInfo(mArgsInfo);
  97   filter->EnableReadOnDisk(false);
  98   filter->Update();
  99   // Output
 100   vvImage::Pointer output = filter->GetOutputVVImage();
 101   std::ostringstream osstream;
 102   osstream << "MedianFiltered_" << mCurrentSlicerManager->GetSlicer(0)->GetFileName() << ".mhd";
 103   AddImage(output,osstream.str());
 104   QApplication::restoreOverrideCursor();
 105   close();
 106 }
 107 //------------------------------------------------------------------------------
 108 void vvToolMedianFilter::GetArgsInfoFromGUI()
 109 {
 110   /* //KEEP THIS FOR READING GGO FROM FILE
 111     int argc=1;
 112     std::string a = "toto";
 113     char * const* argv = new char*;
 114     //a.c_str();
 115     struct cmdline_parser_params p;
 116     p.check_required = 0;
 117     int good = cmdline_parser_ext(argc, argv, &args_info, &p);
 118   DD(good);
 119   */
 120   mArgsInfo.radius_given=0;
 121   mArgsInfo.verbose_flag = false;
 122   // mArgsInfo.radius_arg = new int[3];
 123   // Required (even if not used)
 124   mArgsInfo.input_given = 0;
 125   mArgsInfo.output_given = 0;
 126   mArgsInfo.input_arg=new char;
 127   mArgsInfo.output_arg = new char;
 128   mArgsInfo.config_given=0;
 129   mArgsInfo.verbose_given=0;
 130 }
 131 //------------------------------------------------------------------------------
 132 void vvToolMedianFilter::InputIsSelected(vvSlicerManager *m)
 133 {
 134   mCurrentSlicerManager =m;
 135   // Specific for this gui
 136   mArgsInfo.radius_arg = new int[3];
 137   int checkdimensions=mCurrentSlicerManager->GetDimension();
 138   if(checkdimensions<3) {
 139     horizontalSlider_3->hide();
 140     spinBox_3->hide();
 141     mArgsInfo.radius_arg[2]=0;
 142     connect(horizontalSlider, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH1slider()));
 143     connect(horizontalSlider_2, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH2slider()));
 144   } else {
 145     horizontalSlider->show();
 146     horizontalSlider_2->show();
 147     horizontalSlider_3->show();
 148     connect(horizontalSlider, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH1slider()));
 149     connect(horizontalSlider_2, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH2slider()));
 150     connect(horizontalSlider_3, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH3slider()));
 151   }
 152 }
 153
 154 //-----------------------------------------------------------------------------
 155
 156 void vvToolMedianFilter::UpdateH1slider()
 157 {
 158
 159   mArgsInfo.radius_arg[0]=horizontalSlider->value();
 160   spinBox->setValue(mArgsInfo.radius_arg[0]);
 161 }
 162 void vvToolMedianFilter::UpdateH2slider()
 163 {
 164   mArgsInfo.radius_arg[1]=horizontalSlider_2->value();
 165   spinBox_2->setValue(mArgsInfo.radius_arg[1]);
 166 }
 167 void vvToolMedianFilter::UpdateH3slider()
 168 {
 169   mArgsInfo.radius_arg[2]=horizontalSlider_3->value();
 170   spinBox_3->setValue(mArgsInfo.radius_arg[2]);
 171 }