ModuleCall/GenSrc/bbSlicerCreateaDICOMSeries.h

   1 #ifndef __bbSlicerCreateaDICOMSeries_h_INCLUDED__
   2 #define __bbSlicerCreateaDICOMSeries_h_INCLUDED__
   3
   4 #include "bbSlicer_EXPORT.h"
   5 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
   6
   7 #include <vector>
   8 #include <cstdlib>
   9 #include <dlfcn.h>
  10 #include <sstream>
  11 #include <fstream>
  12 #include <iostream>
  13
  14 #include <ModuleDescriptionUtilities.h>
  15 #include <ModuleDescriptionParser.h>
  16 #include <ModuleParameterGroup.h>
  17 #include <ModuleDescription.h>
  18 #include <ModuleParameter.h>
  19
  20 #include "CreationTool.h"
  21
  22 namespace bbSlicer {
  23
  24     class bbSlicer_EXPORT CreateaDICOMSeries
  25     :
  26     public bbtk::AtomicBlackBox {
  27         BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE ( CreateaDICOMSeries , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  28
  29         // GENERATED ARGS
  30
  31 BBTK_DECLARE_INPUT ( patientName , std::string );
  32 BBTK_DECLARE_INPUT ( patientID , std::string );
  33 BBTK_DECLARE_INPUT ( patientComments , std::string );
  34 BBTK_DECLARE_INPUT ( studyID , std::string );
  35 BBTK_DECLARE_INPUT ( studyDate , std::string );
  36 BBTK_DECLARE_INPUT ( studyComments , std::string );
  37 BBTK_DECLARE_INPUT ( studyDescription , std::string );
  38 BBTK_DECLARE_INPUT ( modality , std::string );
  39 BBTK_DECLARE_INPUT ( manufacturer , std::string );
  40 BBTK_DECLARE_INPUT ( model , std::string );
  41 BBTK_DECLARE_INPUT ( seriesNumber , std::string );
  42 BBTK_DECLARE_INPUT ( seriesDescription , std::string );
  43 BBTK_DECLARE_INPUT ( rescaleIntercept , double );
  44 BBTK_DECLARE_INPUT ( rescaleSlope , double );
  45 BBTK_DECLARE_INPUT ( inputVolume , std::string );
  46 BBTK_DECLARE_INPUT ( dicomDirectory , std::string );
  47 BBTK_DECLARE_INPUT ( dicomPrefix , std::string );
  48 BBTK_DECLARE_INPUT ( dicomNumberFormat , std::string );
  49 BBTK_DECLARE_INPUT ( reverseImages , bool );
  50 BBTK_DECLARE_INPUT ( useCompression , bool );
  51
  52         // EO GENERATED ARGS
  53
  54         BBTK_PROCESS ( Process ) ;
  55         void Process ( ) ;
  56     private:
  57         void execute ( std::string lib , int _argc , char * _argv[] ) ;
  58     } ;
  59
  60     BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX ( CreateaDICOMSeries , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  61     BBTK_NAME ( "CreateaDICOMSeries" ) ;
  62     BBTK_AUTHOR ( "Bill Lorensen" ) ;
  63     BBTK_DESCRIPTION ( "Create a DICOM Series from a Slicer volume. User can specify values for selected DICOM tags in the UI. Given the number of tags DICOM series have, it is impossible to expose all tags in UI. So only important tags can be set by the user." ) ;
  64     BBTK_CATEGORY ( "Converters" ) ;
  65
  66     // GENERATED DESCRPTION
  67
  68 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , patientName , "patientName" , std::string, "");
  69 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , patientID , "patientID" , std::string, "");
  70 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , patientComments , "patientComments" , std::string, "");
  71 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , studyID , "studyID" , std::string, "");
  72 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , studyDate , "studyDate" , std::string, "");
  73 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , studyComments , "studyComments" , std::string, "");
  74 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , studyDescription , "studyDescription" , std::string, "");
  75 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , modality , "modality" , std::string, "");
  76 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , manufacturer , "manufacturer" , std::string, "");
  77 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , model , "model" , std::string, "");
  78 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , seriesNumber , "seriesNumber" , std::string, "");
  79 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , seriesDescription , "seriesDescription" , std::string, "");
  80 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , rescaleIntercept , "rescaleIntercept" , double, "");
  81 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , rescaleSlope , "rescaleSlope" , double, "");
  82 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , inputVolume , "inputVolume" , std::string, "");
  83 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , dicomDirectory , "dicomDirectory" , std::string, "");
  84 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , dicomPrefix , "dicomPrefix" , std::string, "");
  85 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , dicomNumberFormat , "dicomNumberFormat" , std::string, "");
  86 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , reverseImages , "reverseImages" , bool, "");
  87 BBTK_INPUT(CreateaDICOMSeries , useCompression , "useCompression" , bool, "");
  88
  89     // EO GENERATED DESCRIPTION
  90
  91     BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX ( CreateaDICOMSeries ) ;
  92 }
  93
  94 #endif // __bbSlicerCreateaDICOMSeries_h_INCLUDED__
  95
  96