ModuleCall/GenSrc/bbSlicerLinearregistration.h

   1 #ifndef __bbSlicerLinearregistration_h_INCLUDED__
   2 #define __bbSlicerLinearregistration_h_INCLUDED__
   3
   4 #include "bbSlicer_EXPORT.h"
   5 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
   6
   7 #include <vector>
   8 #include <cstdlib>
   9 #include <dlfcn.h>
  10 #include <sstream>
  11 #include <fstream>
  12 #include <iostream>
  13
  14 #include <ModuleDescriptionUtilities.h>
  15 #include <ModuleDescriptionParser.h>
  16 #include <ModuleParameterGroup.h>
  17 #include <ModuleDescription.h>
  18 #include <ModuleParameter.h>
  19
  20 #include "CreationTool.h"
  21
  22 namespace bbSlicer {
  23
  24     class bbSlicer_EXPORT Linearregistration
  25     :
  26     public bbtk::AtomicBlackBox {
  27         BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE ( Linearregistration , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  28
  29         // GENERATED ARGS
  30
  31 BBTK_DECLARE_INPUT ( FixedImageSmoothingFactor , int );
  32 BBTK_DECLARE_INPUT ( MovingImageSmoothingFactor , int );
  33 BBTK_DECLARE_INPUT ( HistogramBins , int );
  34 BBTK_DECLARE_INPUT ( SpatialSamples , int );
  35 BBTK_DECLARE_INPUT ( Iterations , std::vector<int> );
  36 BBTK_DECLARE_INPUT ( LearningRate , std::vector<double> );
  37 BBTK_DECLARE_INPUT ( TranslationScale , double );
  38 BBTK_DECLARE_INPUT ( InitialTransform , std::string );
  39 BBTK_DECLARE_INPUT ( FixedImageFileName , std::string );
  40 BBTK_DECLARE_INPUT ( MovingImageFileName , std::string );
  41 BBTK_DECLARE_INPUT ( OutputTransform , std::string );
  42 BBTK_DECLARE_INPUT ( ResampledImageFileName , std::string );
  43
  44         // EO GENERATED ARGS
  45
  46         BBTK_PROCESS ( Process ) ;
  47         void Process ( ) ;
  48     private:
  49         void execute ( std::string lib , int _argc , char * _argv[] ) ;
  50     } ;
  51
  52     BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX ( Linearregistration , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  53     BBTK_NAME ( "Linearregistration" ) ;
  54     BBTK_AUTHOR ( "Daniel Blezek" ) ;
  55     BBTK_DESCRIPTION ( "Registers two images together using a rigid transform and mutual information." ) ;
  56     BBTK_CATEGORY ( "Legacy.Registration" ) ;
  57
  58     // GENERATED DESCRPTION
  59
  60 BBTK_INPUT(Linearregistration , FixedImageSmoothingFactor , "FixedImageSmoothingFactor" , int, "");
  61 BBTK_INPUT(Linearregistration , MovingImageSmoothingFactor , "MovingImageSmoothingFactor" , int, "");
  62 BBTK_INPUT(Linearregistration , HistogramBins , "HistogramBins" , int, "");
  63 BBTK_INPUT(Linearregistration , SpatialSamples , "SpatialSamples" , int, "");
  64 BBTK_INPUT(Linearregistration , Iterations , "Iterations" , std::vector<int>, "");
  65 BBTK_INPUT(Linearregistration , LearningRate , "LearningRate" , std::vector<double>, "");
  66 BBTK_INPUT(Linearregistration , TranslationScale , "TranslationScale" , double, "");
  67 BBTK_INPUT(Linearregistration , InitialTransform , "InitialTransform" , std::string, "");
  68 BBTK_INPUT(Linearregistration , FixedImageFileName , "FixedImageFileName" , std::string, "");
  69 BBTK_INPUT(Linearregistration , MovingImageFileName , "MovingImageFileName" , std::string, "");
  70 BBTK_INPUT(Linearregistration , OutputTransform , "OutputTransform" , std::string, "");
  71 BBTK_INPUT(Linearregistration , ResampledImageFileName , "ResampledImageFileName" , std::string, "");
  72
  73     // EO GENERATED DESCRIPTION
  74
  75     BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX ( Linearregistration ) ;
  76 }
  77
  78 #endif // __bbSlicerLinearregistration_h_INCLUDED__
  79
  80