ModuleCall/GenSrc/bbSlicerN4ITKMRIBiascorrection.cxx

   1 #include "bbSlicerN4ITKMRIBiascorrection.h"
   2 #include "bbSlicerPackage.h"
   3
   4 namespace bbSlicer {
   5     BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE ( Slicer, N4ITKMRIBiascorrection )
   6     BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION ( N4ITKMRIBiascorrection, bbtk::AtomicBlackBox );
   7
   8     void N4ITKMRIBiascorrection::Process ( ) {
   9
  10         // GENERATED
  11
  12 int _argc =12;
  13 std::string lib = "/home/riveros/.slicer/Slicer4-bin/Slicer-build/lib/Slicer-4.0/cli-modules/libN4ITKBiasFieldCorrectionLib.so";
  14 char * _argv[ ] = { Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--inputimage"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputinputImageName( ) ) ) ,"@@@@@"," --inputimage ") ),
  15 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--maskimage"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputmaskImageName( ) ) ) ,"@@@@@"," --maskimage ") ),
  16 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--outputimage"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputoutputImageName( ) ) ) ,"@@@@@"," --outputimage ") ),
  17 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--outputbiasfield"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputoutputBiasFieldName( ) ) ) ,"@@@@@"," --outputbiasfield ") ),
  18 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--iterations"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputnumberOfIterations( ) ) ) ,"@@@@@"," --iterations ") ),
  19 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--convergencethreshold"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputconvergenceThreshold( ) ) ) ,"@@@@@"," --convergencethreshold ") ),
  20 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--meshresolution"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputinitialMeshResolution( ) ) ) ,"@@@@@"," --meshresolution ") ),
  21 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--splinedistance"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputsplineDistance( ) ) ) ,"@@@@@"," --splinedistance ") ),
  22 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--shrinkfactor"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputshrinkFactor( ) ) ) ,"@@@@@"," --shrinkfactor ") ),
  23 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--bsplineorder"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputbsplineOrder( ) ) ) ,"@@@@@"," --bsplineorder ") ),
  24 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--weightimage"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputweightImageName( ) ) ) ,"@@@@@"," --weightimage ") ),
  25 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--histogramsharpening"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputhistogramSharpening( ) ) ) ,"@@@@@"," --histogramsharpening ") ) };
  26
  27         // EO GENERATED
  28         this->execute( lib, _argc, _argv );
  29
  30     }
  31
  32     void N4ITKMRIBiascorrection::execute ( std::string lib, int _argc, char * _argv[] ) {
  33         void* handle = dlopen( lib.c_str( ), RTLD_NOW | RTLD_GLOBAL );
  34         if ( ! handle ) {
  35             std::cerr << "CAN'T OPEN LIBRARY: " << dlerror( ) << '\n';
  36             return;
  37         }
  38         typedef int (*method_t )( int argc, char * argv[] );
  39         // RESET ERROR
  40         dlerror( );
  41         // PROTOTYPE
  42         method_t myMethod = ( method_t ) dlsym( handle, "ModuleEntryPoint" );
  43         const char *dlsym_error = dlerror( );
  44         if ( dlsym_error ) {
  45             std::cerr << "CAN'T LOAD SYMBOL 'ModuleEntryPoint':" << dlsym_error << '\n';
  46             dlclose( handle );
  47             return;
  48         }
  49         // METHOD CALL
  50         myMethod( _argc, _argv );
  51         // CLOSING LIB
  52         dlclose( handle );
  53     }
  54
  55     void N4ITKMRIBiascorrection::bbUserSetDefaultValues ( ) {
  56     }
  57
  58     void N4ITKMRIBiascorrection::bbUserInitializeProcessing ( ) {
  59     }
  60
  61     void N4ITKMRIBiascorrection::bbUserFinalizeProcessing ( ) {
  62     }
  63 }
  64 // EO namespace bbSlicer
  65
  66