ModuleCall/GenSrc/bbSlicerResampleDTIVolume.cxx

   1 #include "bbSlicerResampleDTIVolume.h"
   2 #include "bbSlicerPackage.h"
   3
   4 namespace bbSlicer {
   5     BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE ( Slicer, ResampleDTIVolume )
   6     BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION ( ResampleDTIVolume, bbtk::AtomicBlackBox );
   7
   8     void ResampleDTIVolume::Process ( ) {
   9
  10         // GENERATED
  11
  12 int _argc =26;
  13 std::string lib = "/home/riveros/.slicer/Slicer4-bin/Slicer-build/lib/Slicer-4.0/cli-modules/libResampleDTILib.so";
  14 char * _argv[ ] = { Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputinputVolume( ) ) ) ,"@@@@@","") ),
  15 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputoutputVolume( ) ) ) ,"@@@@@","") ),
  16 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-R"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputreferenceVolume( ) ) ) ,"@@@@@"," -R ") ),
  17 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-f"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputtransformationFile( ) ) ) ,"@@@@@"," -f ") ),
  18 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-H"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputdeffield( ) ) ) ,"@@@@@"," -H ") ),
  19 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--hfieldtype"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputtypeOfField( ) ) ) ,"@@@@@"," --hfieldtype ") ),
  20 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-i"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputinterpolationType( ) ) ) ,"@@@@@"," -i ") ),
  21 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--correction"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputcorrection( ) ) ) ,"@@@@@"," --correction ") ),
  22 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-T"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputppd( ) ) ) ,"@@@@@"," -T ") ),
  23 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--transform_order"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputtransformsOrder( ) ) ) ,"@@@@@"," --transform_order ") ),
  24 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--notbulk"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputnotbulk( ) ) ) ,"@@@@@"," --notbulk ") ),
  25 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--spaceChange"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputspace( ) ) ) ,"@@@@@"," --spaceChange ") ),
  26 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-r"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputrotationPoint( ) ) ) ,"@@@@@"," -r ") ),
  27 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-c"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputcenteredTransform( ) ) ) ,"@@@@@"," -c ") ),
  28 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--image_center"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputimageCenter( ) ) ) ,"@@@@@"," --image_center ") ),
  29 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-b"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputinverseITKTransformation( ) ) ) ,"@@@@@"," -b ") ),
  30 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-s"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputoutputImageSpacing( ) ) ) ,"@@@@@"," -s ") ),
  31 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-z"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputoutputImageSize( ) ) ) ,"@@@@@"," -z ") ),
  32 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-O"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputoutputImageOrigin( ) ) ) ,"@@@@@"," -O ") ),
  33 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-d"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputdirectionMatrix( ) ) ) ,"@@@@@"," -d ") ),
  34 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-n"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputnumberOfThread( ) ) ) ,"@@@@@"," -n ") ),
  35 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-p"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputdefaultPixelValue( ) ) ) ,"@@@@@"," -p ") ),
  36 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-W"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputwindowFunction( ) ) ) ,"@@@@@"," -W ") ),
  37 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-o"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputsplineOrder( ) ) ) ,"@@@@@"," -o ") ),
  38 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-m"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputtransformMatrix( ) ) ) ,"@@@@@"," -m ") ),
  39 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-t"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputtransformType( ) ) ) ,"@@@@@"," -t ") ) };
  40
  41         // EO GENERATED
  42         this->execute( lib, _argc, _argv );
  43
  44     }
  45
  46     void ResampleDTIVolume::execute ( std::string lib, int _argc, char * _argv[] ) {
  47         void* handle = dlopen( lib.c_str( ), RTLD_NOW | RTLD_GLOBAL );
  48         if ( ! handle ) {
  49             std::cerr << "CAN'T OPEN LIBRARY: " << dlerror( ) << '\n';
  50             return;
  51         }
  52         typedef int (*method_t )( int argc, char * argv[] );
  53         // RESET ERROR
  54         dlerror( );
  55         // PROTOTYPE
  56         method_t myMethod = ( method_t ) dlsym( handle, "ModuleEntryPoint" );
  57         const char *dlsym_error = dlerror( );
  58         if ( dlsym_error ) {
  59             std::cerr << "CAN'T LOAD SYMBOL 'ModuleEntryPoint':" << dlsym_error << '\n';
  60             dlclose( handle );
  61             return;
  62         }
  63         // METHOD CALL
  64         myMethod( _argc, _argv );
  65         // CLOSING LIB
  66         dlclose( handle );
  67     }
  68
  69     void ResampleDTIVolume::bbUserSetDefaultValues ( ) {
  70     }
  71
  72     void ResampleDTIVolume::bbUserInitializeProcessing ( ) {
  73     }
  74
  75     void ResampleDTIVolume::bbUserFinalizeProcessing ( ) {
  76     }
  77 }
  78 // EO namespace bbSlicer
  79
  80