ModuleCall/GenSrc/bbSlicerResampleImageBRAINS.h

   1 #ifndef __bbSlicerResampleImageBRAINS_h_INCLUDED__
   2 #define __bbSlicerResampleImageBRAINS_h_INCLUDED__
   3
   4 #include "bbSlicer_EXPORT.h"
   5 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
   6
   7 #include <vector>
   8 #include <cstdlib>
   9 #include <dlfcn.h>
  10 #include <sstream>
  11 #include <fstream>
  12 #include <iostream>
  13
  14 #include <ModuleDescriptionUtilities.h>
  15 #include <ModuleDescriptionParser.h>
  16 #include <ModuleParameterGroup.h>
  17 #include <ModuleDescription.h>
  18 #include <ModuleParameter.h>
  19
  20 #include "CreationTool.h"
  21
  22 namespace bbSlicer {
  23
  24     class bbSlicer_EXPORT ResampleImageBRAINS
  25     :
  26     public bbtk::AtomicBlackBox {
  27         BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE ( ResampleImageBRAINS , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  28
  29         // GENERATED ARGS
  30
  31 BBTK_DECLARE_INPUT ( inputVolume , std::string );
  32 BBTK_DECLARE_INPUT ( referenceVolume , std::string );
  33 BBTK_DECLARE_INPUT ( outputVolume , std::string );
  34 BBTK_DECLARE_INPUT ( pixelType , std::string );
  35 BBTK_DECLARE_INPUT ( deformationVolume , std::string );
  36 BBTK_DECLARE_INPUT ( warpTransform , std::string );
  37 BBTK_DECLARE_INPUT ( interpolationMode , std::string );
  38 BBTK_DECLARE_INPUT ( inverseTransform , bool );
  39 BBTK_DECLARE_INPUT ( defaultValue , float );
  40 BBTK_DECLARE_INPUT ( gridSpacing , std::vector<int> );
  41 BBTK_DECLARE_INPUT ( numberOfThreads , int );
  42
  43         // EO GENERATED ARGS
  44
  45         BBTK_PROCESS ( Process ) ;
  46         void Process ( ) ;
  47     private:
  48         void execute ( std::string lib , int _argc , char * _argv[] ) ;
  49     } ;
  50
  51     BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX ( ResampleImageBRAINS , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  52     BBTK_NAME ( "ResampleImageBRAINS" ) ;
  53     BBTK_AUTHOR ( "This tool was developed by Vincent Magnotta, Greg Harris, and Hans Johnson." ) ;
  54     BBTK_DESCRIPTION ( "This program resamples an image image using a deformation field or a transform BSpline, Affine, Rigid, etc.." ) ;
  55     BBTK_CATEGORY ( "Registration" ) ;
  56
  57     // GENERATED DESCRPTION
  58
  59 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , inputVolume , "inputVolume" , std::string, "");
  60 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , referenceVolume , "referenceVolume" , std::string, "");
  61 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , outputVolume , "outputVolume" , std::string, "");
  62 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , pixelType , "pixelType" , std::string, "");
  63 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , deformationVolume , "deformationVolume" , std::string, "");
  64 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , warpTransform , "warpTransform" , std::string, "");
  65 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , interpolationMode , "interpolationMode" , std::string, "");
  66 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , inverseTransform , "inverseTransform" , bool, "");
  67 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , defaultValue , "defaultValue" , float, "");
  68 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , gridSpacing , "gridSpacing" , std::vector<int>, "");
  69 BBTK_INPUT(ResampleImageBRAINS , numberOfThreads , "numberOfThreads" , int, "");
  70
  71     // EO GENERATED DESCRIPTION
  72
  73     BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX ( ResampleImageBRAINS ) ;
  74 }
  75
  76 #endif // __bbSlicerResampleImageBRAINS_h_INCLUDED__
  77
  78