ModuleCall/GenSrc/bbSlicerVotingBinaryHoleFilling.h

   1 #ifndef __bbSlicerVotingBinaryHoleFilling_h_INCLUDED__
   2 #define __bbSlicerVotingBinaryHoleFilling_h_INCLUDED__
   3
   4 #include "bbSlicer_EXPORT.h"
   5 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
   6
   7 #include <vector>
   8 #include <cstdlib>
   9 #include <dlfcn.h>
  10 #include <sstream>
  11 #include <fstream>
  12 #include <iostream>
  13
  14 #include <ModuleDescriptionUtilities.h>
  15 #include <ModuleDescriptionParser.h>
  16 #include <ModuleParameterGroup.h>
  17 #include <ModuleDescription.h>
  18 #include <ModuleParameter.h>
  19
  20 #include "CreationTool.h"
  21
  22 namespace bbSlicer {
  23
  24     class bbSlicer_EXPORT VotingBinaryHoleFilling
  25     :
  26     public bbtk::AtomicBlackBox {
  27         BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE ( VotingBinaryHoleFilling , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  28
  29         // GENERATED ARGS
  30
  31 BBTK_DECLARE_INPUT ( radius , std::vector<int> );
  32 BBTK_DECLARE_INPUT ( majorityThreshold , int );
  33 BBTK_DECLARE_INPUT ( background , int );
  34 BBTK_DECLARE_INPUT ( foreground , int );
  35 BBTK_DECLARE_INPUT ( inputVolume , std::string );
  36 BBTK_DECLARE_INPUT ( outputVolume , std::string );
  37
  38         // EO GENERATED ARGS
  39
  40         BBTK_PROCESS ( Process ) ;
  41         void Process ( ) ;
  42     private:
  43         void execute ( std::string lib , int _argc , char * _argv[] ) ;
  44     } ;
  45
  46     BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX ( VotingBinaryHoleFilling , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  47     BBTK_NAME ( "VotingBinaryHoleFilling" ) ;
  48     BBTK_AUTHOR ( "Bill Lorensen" ) ;
  49     BBTK_DESCRIPTION ( "Applies a voting operation in order to fill-in cavities. This can be used for smoothing contours and for filling holes in binary images. This technique is used frequently when segmenting complete organs that may have ducts or vasculature that may not have been included in the initial segmentation, e.g. lungs, kidneys, liver." ) ;
  50     BBTK_CATEGORY ( "Filtering" ) ;
  51
  52     // GENERATED DESCRPTION
  53
  54 BBTK_INPUT(VotingBinaryHoleFilling , radius , "radius" , std::vector<int>, "");
  55 BBTK_INPUT(VotingBinaryHoleFilling , majorityThreshold , "majorityThreshold" , int, "");
  56 BBTK_INPUT(VotingBinaryHoleFilling , background , "background" , int, "");
  57 BBTK_INPUT(VotingBinaryHoleFilling , foreground , "foreground" , int, "");
  58 BBTK_INPUT(VotingBinaryHoleFilling , inputVolume , "inputVolume" , std::string, "");
  59 BBTK_INPUT(VotingBinaryHoleFilling , outputVolume , "outputVolume" , std::string, "");
  60
  61     // EO GENERATED DESCRIPTION
  62
  63     BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX ( VotingBinaryHoleFilling ) ;
  64 }
  65
  66 #endif // __bbSlicerVotingBinaryHoleFilling_h_INCLUDED__
  67
  68