bbtk_Slicer_PKG/src/bbSlicerFastAffineregistration.cxx

   1 #include "bbSlicerFastAffineregistration.h"
   2 #include "bbSlicerPackage.h"
   3
   4 namespace bbSlicer {
   5     BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE ( Slicer, FastAffineregistration )
   6     BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION ( FastAffineregistration, bbtk::AtomicBlackBox );
   7
   8     void FastAffineregistration::Process ( ) {
   9
  10         // GENERATED
  11
  12 int _argc =11;
  13 std::string lib = "/home/riveros/.slicer/Slicer4-bin/Slicer-build/lib/Slicer-4.0/cli-modules/libAffineRegistrationLib.so";
  14 char * _argv[ ] = { Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--fixedsmoothingfactor"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputFixedImageSmoothingFactor( ) ) ) ,"@@@@@"," --fixedsmoothingfactor ") ),
  15 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--movingsmoothingfactor"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputMovingImageSmoothingFactor( ) ) ) ,"@@@@@"," --movingsmoothingfactor ") ),
  16 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-b"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputHistogramBins( ) ) ) ,"@@@@@"," -b ") ),
  17 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-s"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputSpatialSamples( ) ) ) ,"@@@@@"," -s ") ),
  18 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-i"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputIterations( ) ) ) ,"@@@@@"," -i ") ),
  19 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "-t"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputTranslationScale( ) ) ) ,"@@@@@"," -t ") ),
  20 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--initialtransform"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputInitialTransform( ) ) ) ,"@@@@@"," --initialtransform ") ),
  21 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputFixedImageFileName( ) ) ) ,"@@@@@","") ),
  22 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputMovingImageFileName( ) ) ) ,"@@@@@","") ),
  23 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--outputtransform"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputOutputTransform( ) ) ) ,"@@@@@"," --outputtransform ") ),
  24 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--resampledmovingfilename"  ) + Mthd::Aux::replace_str ( ( Mthd::Aux::toString( bbGetInputResampledImageFileName( ) ) ) ,"@@@@@"," --resampledmovingfilename ") ) };
  25
  26         // EO GENERATED
  27         this->execute( lib, _argc, _argv );
  28
  29     }
  30
  31     void FastAffineregistration::execute ( std::string lib, int _argc, char * _argv[] ) {
  32         void* handle = dlopen( lib.c_str( ), RTLD_NOW | RTLD_GLOBAL );
  33         if ( ! handle ) {
  34             std::cerr << "CAN'T OPEN LIBRARY: " << dlerror( ) << '\n';
  35             return;
  36         }
  37         typedef int (*method_t )( int argc, char * argv[] );
  38         // RESET ERROR
  39         dlerror( );
  40         // PROTOTYPE
  41         method_t myMethod = ( method_t ) dlsym( handle, "ModuleEntryPoint" );
  42         const char *dlsym_error = dlerror( );
  43         if ( dlsym_error ) {
  44             std::cerr << "CAN'T LOAD SYMBOL 'ModuleEntryPoint':" << dlsym_error << '\n';
  45             dlclose( handle );
  46             return;
  47         }
  48         // METHOD CALL
  49         myMethod( _argc, _argv );
  50         // CLOSING LIB
  51         dlclose( handle );
  52     }
  53
  54     void FastAffineregistration::bbUserSetDefaultValues ( ) {
  55     }
  56
  57     void FastAffineregistration::bbUserInitializeProcessing ( ) {
  58     }
  59
  60     void FastAffineregistration::bbUserFinalizeProcessing ( ) {
  61     }
  62 }
  63 // EO namespace bbSlicer
  64
  65