bbtk_Slicer_PKG/src/bbSlicerFastNonrigidBSplineregistration.h

   1 #ifndef __bbSlicerFastNonrigidBSplineregistration_h_INCLUDED__
   2 #define __bbSlicerFastNonrigidBSplineregistration_h_INCLUDED__
   3
   4 #include "bbSlicer_EXPORT.h"
   5 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
   6
   7 #include <vector>
   8 #include <cstdlib>
   9 #include <dlfcn.h>
  10 #include <sstream>
  11 #include <fstream>
  12 #include <iostream>
  13
  14 #include <ModuleDescriptionUtilities.h>
  15 #include <ModuleDescriptionParser.h>
  16 #include <ModuleParameterGroup.h>
  17 #include <ModuleDescription.h>
  18 #include <ModuleParameter.h>
  19
  20 #include "CreationTool.h"
  21
  22 namespace bbSlicer {
  23
  24     class bbSlicer_EXPORT FastNonrigidBSplineregistration
  25     :
  26     public bbtk::AtomicBlackBox {
  27         BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE ( FastNonrigidBSplineregistration , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  28
  29         // GENERATED ARGS
  30
  31 BBTK_DECLARE_INPUT ( Iterations , int );
  32 BBTK_DECLARE_INPUT ( gridSize , int );
  33 BBTK_DECLARE_INPUT ( HistogramBins , int );
  34 BBTK_DECLARE_INPUT ( SpatialSamples , int );
  35 BBTK_DECLARE_INPUT ( ConstrainDeformation , bool );
  36 BBTK_DECLARE_INPUT ( MaximumDeformation , float );
  37 BBTK_DECLARE_INPUT ( DefaultPixelValue , int );
  38 BBTK_DECLARE_INPUT ( InitialTransform , std::string );
  39 BBTK_DECLARE_INPUT ( FixedImageFileName , std::string );
  40 BBTK_DECLARE_INPUT ( MovingImageFileName , std::string );
  41 BBTK_DECLARE_INPUT ( OutputTransform , std::string );
  42 BBTK_DECLARE_INPUT ( OutputWarp , std::string );
  43 BBTK_DECLARE_INPUT ( ResampledImageFileName , std::string );
  44
  45         // EO GENERATED ARGS
  46
  47         BBTK_PROCESS ( Process ) ;
  48         void Process ( ) ;
  49     private:
  50         void execute ( std::string lib , int _argc , char * _argv[] ) ;
  51     } ;
  52
  53     BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX ( FastNonrigidBSplineregistration , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  54     BBTK_NAME ( "FastNonrigidBSplineregistration" ) ;
  55     BBTK_AUTHOR ( "Bill Lorensen" ) ;
  56     BBTK_DESCRIPTION ( "Registers two images together using BSpline transform and mutual information." ) ;
  57     BBTK_CATEGORY ( "Legacy.Registration" ) ;
  58
  59     // GENERATED DESCRPTION
  60
  61 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , Iterations , "Iterations" , int, "");
  62 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , gridSize , "gridSize" , int, "");
  63 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , HistogramBins , "HistogramBins" , int, "");
  64 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , SpatialSamples , "SpatialSamples" , int, "");
  65 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , ConstrainDeformation , "ConstrainDeformation" , bool, "");
  66 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , MaximumDeformation , "MaximumDeformation" , float, "");
  67 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , DefaultPixelValue , "DefaultPixelValue" , int, "");
  68 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , InitialTransform , "InitialTransform" , std::string, "");
  69 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , FixedImageFileName , "FixedImageFileName" , std::string, "");
  70 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , MovingImageFileName , "MovingImageFileName" , std::string, "");
  71 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , OutputTransform , "OutputTransform" , std::string, "");
  72 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , OutputWarp , "OutputWarp" , std::string, "");
  73 BBTK_INPUT(FastNonrigidBSplineregistration , ResampledImageFileName , "ResampledImageFileName" , std::string, "");
  74
  75     // EO GENERATED DESCRIPTION
  76
  77     BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX ( FastNonrigidBSplineregistration ) ;
  78 }
  79
  80 #endif // __bbSlicerFastNonrigidBSplineregistration_h_INCLUDED__
  81
  82