bbtk_Slicer_PKG/src/bbSlicerFiducialRegistration.h

   1 #ifndef __bbSlicerFiducialRegistration_h_INCLUDED__
   2 #define __bbSlicerFiducialRegistration_h_INCLUDED__
   3
   4 #include "bbSlicer_EXPORT.h"
   5 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
   6
   7 #include <vector>
   8 #include <cstdlib>
   9 #include <dlfcn.h>
  10 #include <sstream>
  11 #include <fstream>
  12 #include <iostream>
  13
  14 #include <ModuleDescriptionUtilities.h>
  15 #include <ModuleDescriptionParser.h>
  16 #include <ModuleParameterGroup.h>
  17 #include <ModuleDescription.h>
  18 #include <ModuleParameter.h>
  19
  20 #include "CreationTool.h"
  21
  22 namespace bbSlicer {
  23
  24     class bbSlicer_EXPORT FiducialRegistration
  25     :
  26     public bbtk::AtomicBlackBox {
  27         BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE ( FiducialRegistration , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  28
  29         // GENERATED ARGS
  30
  31 BBTK_DECLARE_INPUT ( fixedLandmarks , std::vector<std::vector<float> > );
  32 BBTK_DECLARE_INPUT ( movingLandmarks , std::vector<std::vector<float> > );
  33 BBTK_DECLARE_INPUT ( saveTransform , std::string );
  34 BBTK_DECLARE_INPUT ( transformType , std::string );
  35
  36         // EO GENERATED ARGS
  37
  38         BBTK_PROCESS ( Process ) ;
  39         void Process ( ) ;
  40     private:
  41         void execute ( std::string lib , int _argc , char * _argv[] ) ;
  42     } ;
  43
  44     BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX ( FiducialRegistration , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  45     BBTK_NAME ( "FiducialRegistration" ) ;
  46     BBTK_AUTHOR ( "Casey B Goodlett" ) ;
  47     BBTK_DESCRIPTION ( "Computes a rigid, similarity or affine transform from a matched list of fiducials" ) ;
  48     BBTK_CATEGORY ( "Registration.Specialized" ) ;
  49
  50     // GENERATED DESCRPTION
  51
  52 BBTK_INPUT(FiducialRegistration , fixedLandmarks , "fixedLandmarks" , std::vector<std::vector<float> >, "");
  53 BBTK_INPUT(FiducialRegistration , movingLandmarks , "movingLandmarks" , std::vector<std::vector<float> >, "");
  54 BBTK_INPUT(FiducialRegistration , saveTransform , "saveTransform" , std::string, "");
  55 BBTK_INPUT(FiducialRegistration , transformType , "transformType" , std::string, "");
  56
  57     // EO GENERATED DESCRIPTION
  58
  59     BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX ( FiducialRegistration ) ;
  60 }
  61
  62 #endif // __bbSlicerFiducialRegistration_h_INCLUDED__
  63
  64