bbtk_Slicer_PKG/src/bbSlicerMRIBiasFieldCorrection.cxx

   1 #include "bbSlicerMRIBiasFieldCorrection.h"
   2 #include "bbSlicerPackage.h"
   3
   4 namespace bbSlicer {
   5     BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE ( Slicer, MRIBiasFieldCorrection )
   6     BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION ( MRIBiasFieldCorrection, bbtk::AtomicBlackBox );
   7
   8     void MRIBiasFieldCorrection::Process ( ) {
   9
  10         // GENERATED
  11
  12 int _argc =10;
  13 std::string lib = "/home/riveros/.slicer/Slicer4-bin/Slicer-build/lib/Slicer-4.0/cli-modules/libMRIBiasFieldCorrectionLib.so";
  14 char * _argv[ ] = { Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--inputImage"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputInputImage( ) ) ),
  15 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--inputMask"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputInputMask( ) ) ),
  16 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--outputImage"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputOutputImage( ) ) ),
  17 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--algorithmType"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputAlgorithmType( ) ) ),
  18 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--shrinkFactor"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputShrinkFactor( ) ) ),
  19 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--maximumNumberOfIterations"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputMaximumNumberOfIterations( ) ) ),
  20 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--numberOfFittingLevels"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputNumberOfFittingLevels( ) ) ),
  21 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--wienerFilterNoise"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputWienerFilterNoise( ) ) ),
  22 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--fullWidthAtHalfMaximum"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputFullWidthAtHalfMaximum( ) ) ),
  23 Mthd::Aux::toCharArrray( Mthd::Aux::toString( "--convergenceThreshold"  ) + Mthd::Aux::toString( bbGetInputConvergenceThreshold( ) ) ) };
  24
  25         // EO GENERATED
  26         this->execute( lib, _argc, _argv );
  27
  28     }
  29
  30     void MRIBiasFieldCorrection::execute ( std::string lib, int _argc, char * _argv[] ) {
  31         void* handle = dlopen( lib.c_str( ), RTLD_NOW | RTLD_GLOBAL );
  32         if ( ! handle ) {
  33             std::cerr << "CAN'T OPEN LIBRARY: " << dlerror( ) << '\n';
  34             return;
  35         }
  36         typedef int (*method_t )( int argc, char * argv[] );
  37         // RESET ERROR
  38         dlerror( );
  39         // PROTOTYPE
  40         method_t myMethod = ( method_t ) dlsym( handle, "ModuleEntryPoint" );
  41         const char *dlsym_error = dlerror( );
  42         if ( dlsym_error ) {
  43             std::cerr << "CAN'T LOAD SYMBOL 'ModuleEntryPoint':" << dlsym_error << '\n';
  44             dlclose( handle );
  45             return;
  46         }
  47         // METHOD CALL
  48         myMethod( _argc, _argv );
  49         // CLOSING LIB
  50         dlclose( handle );
  51     }
  52
  53     void MRIBiasFieldCorrection::bbUserSetDefaultValues ( ) {
  54     }
  55
  56     void MRIBiasFieldCorrection::bbUserInitializeProcessing ( ) {
  57     }
  58
  59     void MRIBiasFieldCorrection::bbUserFinalizeProcessing ( ) {
  60     }
  61 }
  62 // EO namespace bbSlicer
  63
  64