bbtk_Slicer_PKG/src/bbSlicerRobustMultiresolutionAffineRegistration.h

   1 #ifndef __bbSlicerRobustMultiresolutionAffineRegistration_h_INCLUDED__
   2 #define __bbSlicerRobustMultiresolutionAffineRegistration_h_INCLUDED__
   3
   4 #include "bbSlicer_EXPORT.h"
   5 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
   6
   7 #include <vector>
   8 #include <cstdlib>
   9 #include <dlfcn.h>
  10 #include <sstream>
  11 #include <fstream>
  12 #include <iostream>
  13
  14 #include <ModuleDescriptionUtilities.h>
  15 #include <ModuleDescriptionParser.h>
  16 #include <ModuleParameterGroup.h>
  17 #include <ModuleDescription.h>
  18 #include <ModuleParameter.h>
  19
  20 #include "CreationTool.h"
  21
  22 namespace bbSlicer {
  23
  24     class bbSlicer_EXPORT RobustMultiresolutionAffineRegistration
  25     :
  26     public bbtk::AtomicBlackBox {
  27         BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE ( RobustMultiresolutionAffineRegistration , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  28
  29         // GENERATED ARGS
  30
  31 BBTK_DECLARE_INPUT ( fixedImage , std::string );
  32 BBTK_DECLARE_INPUT ( movingImage , std::string );
  33 BBTK_DECLARE_INPUT ( resampledImage , std::string );
  34 BBTK_DECLARE_INPUT ( outputTransform , std::string );
  35 BBTK_DECLARE_INPUT ( fixedImageMask , std::string );
  36 BBTK_DECLARE_INPUT ( fixedImageROI , std::vector<float> );
  37 BBTK_DECLARE_INPUT ( numIterations , int );
  38 BBTK_DECLARE_INPUT ( numLineIterations , int );
  39 BBTK_DECLARE_INPUT ( stepSize , float );
  40 BBTK_DECLARE_INPUT ( stepTolerance , float );
  41 BBTK_DECLARE_INPUT ( metricTolerance , float );
  42
  43         // EO GENERATED ARGS
  44
  45         BBTK_PROCESS ( Process ) ;
  46         void Process ( ) ;
  47     private:
  48         void execute ( std::string lib , int _argc , char * _argv[] ) ;
  49     } ;
  50
  51     BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX ( RobustMultiresolutionAffineRegistration , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  52     BBTK_NAME ( "RobustMultiresolutionAffineRegistration" ) ;
  53     BBTK_AUTHOR ( "Casey B Goodlett" ) ;
  54     BBTK_DESCRIPTION ( "Provides affine registration using multiple resolution levels and decomposed affine transforms." ) ;
  55     BBTK_CATEGORY ( "Legacy.Registration" ) ;
  56
  57     // GENERATED DESCRPTION
  58
  59 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , fixedImage , "fixedImage" , std::string, "");
  60 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , movingImage , "movingImage" , std::string, "");
  61 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , resampledImage , "resampledImage" , std::string, "");
  62 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , outputTransform , "outputTransform" , std::string, "");
  63 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , fixedImageMask , "fixedImageMask" , std::string, "");
  64 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , fixedImageROI , "fixedImageROI" , std::vector<float>, "");
  65 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , numIterations , "numIterations" , int, "");
  66 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , numLineIterations , "numLineIterations" , int, "");
  67 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , stepSize , "stepSize" , float, "");
  68 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , stepTolerance , "stepTolerance" , float, "");
  69 BBTK_INPUT(RobustMultiresolutionAffineRegistration , metricTolerance , "metricTolerance" , float, "");
  70
  71     // EO GENERATED DESCRIPTION
  72
  73     BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX ( RobustMultiresolutionAffineRegistration ) ;
  74 }
  75
  76 #endif // __bbSlicerRobustMultiresolutionAffineRegistration_h_INCLUDED__
  77
  78