bbtk_Slicer_PKG/src/bbSlicerThresholdImage.h

   1 #ifndef __bbSlicerThresholdImage_h_INCLUDED__
   2 #define __bbSlicerThresholdImage_h_INCLUDED__
   3
   4 #include "bbSlicer_EXPORT.h"
   5 #include "bbtkAtomicBlackBox.h"
   6
   7 #include <vector>
   8 #include <cstdlib>
   9 #include <dlfcn.h>
  10 #include <sstream>
  11 #include <fstream>
  12 #include <iostream>
  13
  14 #include <ModuleDescriptionUtilities.h>
  15 #include <ModuleDescriptionParser.h>
  16 #include <ModuleParameterGroup.h>
  17 #include <ModuleDescription.h>
  18 #include <ModuleParameter.h>
  19
  20 #include "CreationTool.h"
  21
  22 namespace bbSlicer {
  23
  24     class bbSlicer_EXPORT ThresholdImage
  25     :
  26     public bbtk::AtomicBlackBox {
  27         BBTK_BLACK_BOX_INTERFACE ( ThresholdImage , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  28
  29         // GENERATED ARGS
  30
  31 BBTK_DECLARE_INPUT ( InputVolume , std::string );
  32 BBTK_DECLARE_INPUT ( OutputVolume , std::string );
  33 BBTK_DECLARE_INPUT ( ThresholdValue , int );
  34 BBTK_DECLARE_INPUT ( Lower , int );
  35 BBTK_DECLARE_INPUT ( Upper , int );
  36 BBTK_DECLARE_INPUT ( OutsideValue , int );
  37 BBTK_DECLARE_INPUT ( ThresholdType , std::string );
  38
  39         // EO GENERATED ARGS
  40
  41         BBTK_PROCESS ( Process ) ;
  42         void Process ( ) ;
  43     private:
  44         void execute ( std::string lib , int _argc , char * _argv[] ) ;
  45     } ;
  46
  47     BBTK_BEGIN_DESCRIBE_BLACK_BOX ( ThresholdImage , bbtk::AtomicBlackBox ) ;
  48     BBTK_NAME ( "ThresholdImage" ) ;
  49     BBTK_AUTHOR ( "Nicole Aucoin, BWH (Ron Kikinis, BWH)" ) ;
  50     BBTK_DESCRIPTION ( "<p>Threshold an image.</p><p>Set image values to a user-specified outside value if they are below, above, or between simple threshold values.</p><p>ThresholdAbove: The values greater than or equal to the threshold value are set to OutsideValue.</p><p>ThresholdBelow: The values less than or equal to the threshold value are set to OutsideValue.</p><p>ThresholdOutside: The values outside the range Lower-Upper are set to OutsideValue.</p><p>Although all image types are supported on input, only signed types are produced.</p><p>" ) ;
  51     BBTK_CATEGORY ( "Filtering" ) ;
  52
  53     // GENERATED DESCRPTION
  54
  55 BBTK_INPUT(ThresholdImage , InputVolume , "InputVolume" , std::string, "");
  56 BBTK_INPUT(ThresholdImage , OutputVolume , "OutputVolume" , std::string, "");
  57 BBTK_INPUT(ThresholdImage , ThresholdValue , "ThresholdValue" , int, "");
  58 BBTK_INPUT(ThresholdImage , Lower , "Lower" , int, "");
  59 BBTK_INPUT(ThresholdImage , Upper , "Upper" , int, "");
  60 BBTK_INPUT(ThresholdImage , OutsideValue , "OutsideValue" , int, "");
  61 BBTK_INPUT(ThresholdImage , ThresholdType , "ThresholdType" , std::string, "");
  62
  63     // EO GENERATED DESCRIPTION
  64
  65     BBTK_END_DESCRIBE_BLACK_BOX ( ThresholdImage ) ;
  66 }
  67
  68 #endif // __bbSlicerThresholdImage_h_INCLUDED__
  69
  70