lib/kernel_ManagerContour_NDimensions/OutlineModelBuilder.h

   1 /*# ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
  25
  26 #ifndef __OUTLINE_MODEL_BUILDER__
  27 #define __OUTLINE_MODEL_BUILDER__
  28
  29
  30 //------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  31 // Includes
  32 //------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  33 #include <iostream>
  34 #include <vector>
  35 #include <string>
  36
  37
  38 #include "ReaderEnvironment.h"
  39 #include "SomeEnvironment.h"
  40 #include "ContourThing.h"
  41 #include "AxeThing.h"
  42 #include "ImageSourceThing.h"
  43 #include "ImageSectionThing.h"
  44
  45
  46
  47 class OutlineModelBuilder{
  48
  49 //------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  50 // Constructors & Destructors
  51 //------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  52 public:
  53
  54         /**
  55         * Creates an OutlineModelBuilder
  56         * @ param filesNames Paired set of files with the names of the files to read ConceptsFileName, ImageSourcesFile, ImageSectionsFile, AxeThingsFile, ContoursFile
  57         * @ param sources Paired set of sourceKeyName-ImageSourceThing
  58         * @ param sections Paired set of sectionKeyName-ImageSectionThing
  59         * @ param axes Paired set of axeKeyName-AxeThing
  60         * @ param outlines Paired set of contoKeyName-ContourThing
  61         */
  62         OutlineModelBuilder(std::string conceptsFile, std::string datadir = "data" );//std::map<std::string, std::string> filesNames, std::map<std::string, ImageSourceThing *> * sources, std::map<std::string, ImageSectionThing *>* sections, std::map<std::string, AxeThing *>* axes, std::map<std::string, ContourThing *>* outlines);
  63
  64         /**
  65         * Destroys an AxeThing
  66         */
  67         ~OutlineModelBuilder();
  68 //------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  69 // Methods
  70 //------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  71
  72         /**
  73         * Gets the ImageSourceThing environment
  74         *@param  ImSourceEnv
  75         */
  76     SomeEnvironment<ImageSourceThing *> * getImSourceEnv();
  77         /**
  78         * Gets the ImageSectionThing environment
  79         *@param  imSectionEnv
  80         */
  81         SomeEnvironment<ImageSectionThing *> * getImSectionEnv();
  82         /**
  83         * Gets the AxeThing environment
  84         *@param  AxesEnv
  85         */
  86         SomeEnvironment<AxeThing *> * getAxesEnv();
  87         /**
  88         * Gets the ContourThing environment
  89         * @param  ContourEnv
  90         */
  91         SomeEnvironment<ContourThing *> * getContourEnv();
  92
  93         /**
  94         * Builds the ImageSourceThing * environment
  95         * @param sourcesFile File path with the object key names and specific instants for each one
  96         * @param sources The sources to include in the enivorment
  97         */
  98         void buildImageSource_Envornment( std::string sourcesFile, std::map<std::string, ImageSourceThing *> * sources );
  99
 100         /**
 101         * Builds the ImageSectionThing * environment
 102         * @param sectionsFile File path with the object key names and specific instants for each one
 103         * @param sections The sections to include in the enivorment
 104         */
 105         void buildImageSection_Envornment( std::string sectionsFile, std::map<std::string, ImageSectionThing *>* sections );
 106
 107         /**
 108         * Builds the AxeThing * environment
 109         * @param axesFile File path with the object key names and specific instants for each one
 110         * @param axes The axes to include in the enivorment
 111         */
 112         void buildAxe_Envornment( std::string axesFile, std::map<std::string, AxeThing *>* axes );
 113
 114         /**
 115         * Builds the CountourThing * environment
 116         * @param outlinesFile File path with the object key names and specific instants for each one
 117         * @param outlines The outlines to include in the enivorment
 118         */
 119         void buildCountour_Envornment( std::string outlinesFile, std::map<std::string, ContourThing *>* outlines );
 120
 121 private:
 122 //------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 123 // Attributes
 124 //------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 125
 126         /**
 127         * Represents the environment builder based of reading files of axes
 128         */
 129         ReaderEnvironment<AxeThing *> *axesEnv_Reader;
 130
 131         /**
 132         *  Represents the environment builder based of reading files of section images
 133         */
 134         ReaderEnvironment<ImageSectionThing *> *imagesSectionEnv_Reader;
 135
 136         /**
 137         * Represents the environment builder based of reading files of source images (Generally a complete volume data per image)
 138         */
 139         ReaderEnvironment<ImageSourceThing *>  *imageSourceEnv_Reader;
 140
 141         /**
 142         * Represents the environment builder based of reading files of outlines (outlines)
 143         */
 144         ReaderEnvironment<ContourThing *> * outlinesEnv_Reader;
 145
 146         /*
 147         *
 148         */
 149         std::string conceptsFile;
 150
 151         std::string imagesSectionEnvOtherConceptsFN;
 152
 153         std::string outlinesEnvOtherConceptsFN;
 154
 155         std::string axesEnvOtherConceptsFN;
 156
 157
 158 };
 159 #endif
 160