bbtk/src/bbcreaImageIOImagesChooserDialogBox.xml

   1 <!--
   2         # ---------------------------------------------------------------------
   3         #
   4         # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5         #                        pour la Santé)
   6         # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7         # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8         # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9         #
  10         #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11         #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12         #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13         #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14         #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15         #  or in the file LICENSE.txt.
  16         #
  17         #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18         #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19         #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20         #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21         #  liability.
  22         #
  23         #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24         #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25         # ------------------------------------------------------------------------
  26 -->
  27
  28 <?xml version="1.0" encoding="iso-8859-1"?>
  29 <!--==========================================================================
  30    STARTS THE DESCRIPTION OF THE BLACK BOX -->
  31 <blackbox name="ImagesChooserDialogBox">
  32   <!--========================================================================
  33     THE BOX DOCUMENTATION -->
  34   <author>cervenansky.frederic@creatis.insa-lyon.fr</author>
  35   <description>
  36     ImagesChooserDialogBox is a simple application to select file(s) or directory or data from Gimmick database and display them. It handles DICOM, jpg, tif, png, bmp and mhd.
  37   </description>
  38   <category>image;reader;dicom;</category>
  39
  40   <!--========================================================================
  41     #include directives to be put in the .h generated
  42     There must be one tag per file to include -->
  43   <include>creaImageIOWxSimpleDlg.h</include>
  44   <!--========================================================================
  45     INPUTS/OUTPUTS DECLARATION -->
  46
  47   <input name="Title" type="std::string" description="Title of the dialog"/>
  48
  49
  50
  51   <typedef>
  52     <PRE>
  53       typedef std::vector<std::string> VectorStringType;</PRE>
  54   </typedef>
  55   <input name="DicomTags" type="VectorStringType" description="Dicom Tags"/>
  56
  57   <typedef>
  58     <PRE>
  59       typedef std::vector<vtkImageData*> OutputImagesType;</PRE>
  60   </typedef>
  61   <output name="Out" type="vtkImageData*" description="The selected image"/>
  62   <output name="OutImages" type="OutputImagesType" description="Vector of selected images"/>
  63
  64   <typedef>
  65     <PRE>
  66       typedef std::map<std::string, std::string> MapInfoDicom;</PRE>
  67   </typedef>
  68
  69   <typedef>
  70     <PRE>
  71       typedef std::vector< MapInfoDicom > VectorMapInfoDicom;</PRE>
  72   </typedef>
  73
  74   <output name="DicomInfo" type="VectorMapInfoDicom" description="Map of Dicom tags"/>
  75
  76   <!--========================================================================
  77     PROCESS section -->
  78
  79   <process>
  80     <PRE>
  81         creaImageIO::WxSimpleDlg dlg(0,crea::std2wx(bbGetInputTitle()),"localdatabase_Descriptor.dscp","Local Database");
  82                 dlg.ShowModal();
  83                 bbSetOutputDicomInfo( dlg.getDicomInfoImagesSelected() );
  84                 if (dlg.getImagesSelected().size()!=0){
  85                   if(dlg.getImagesSelected().size() ==1)
  86                   {
  87                         bbSetOutputOut( dlg.getImagesSelected()[0] );
  88                   } else {
  89                           // FCY: it will be a big problem if we have several kind of data in the same folder.
  90                           // creation of a huge vtkImageData!!!!
  91                           vtkImageData* first = dlg.getImagesSelected()[0];
  92                           int dim[3];
  93                           first->GetDimensions(dim);
  94                           if (dim[2]==1){
  95                                  vtkImageData *out;
  96                                 out  = vtkImageData::New();
  97                                 out->SetScalarType(first->GetScalarType());
  98                                 out->SetNumberOfScalarComponents(first->GetNumberOfScalarComponents());
  99                                 int ext[6];
 100                                 first->GetWholeExtent(ext);
 101                                 if(ext[5] == 0)
 102                                 {
 103                                    ext[5] = dlg.getImagesSelected().size()-1;
 104                                  } else {
 105                                         ext[5] = ext[5] * dlg.getImagesSelected().size()-1; // to deal with multiframes
 106                                 } // ext
 107                                 out->SetExtent(ext);
 108                                 double spac[3];
 109                                 first->GetDimensions(dim);
 110                                 first->GetSpacing(spac);
 111                                 if (spac[0]==spac[1])
 112                                 {
 113                                         spac[2]=spac[0];
 114                                 }
 115                                 out->SetSpacing(spac);
 116                                 out->SetDimensions(dim[0], dim[1], dlg.getImagesSelected().size() );
 117                                 out->AllocateScalars();
 118                                 out->Update();
 119                                 unsigned long imsize = dim[0] * dim[1];
 120                                 imsize = imsize * dim[2];  // deal with multiframes here
 121                                 // differents formats char , short, etc...
 122                                 // differents components 1..3  ex. jpg ->RGB 3
 123                                 imsize = imsize * first->GetScalarSize() * first->GetNumberOfScalarComponents();
 124                                 int slice,sizeImageVector=dlg.getImagesSelected().size();
 125                                 for (slice=0 ; slice<sizeImageVector ; slice++)
 126                                 {
 127                                         vtkImageData *img = dlg.getImagesSelected()[slice];
 128                                         memcpy(out->GetScalarPointer(0,0,slice), img->GetScalarPointer(0,0,0), imsize);
 129                                 //img->Delete();
 130                                  } // for slice
 131
 132 //EED This is NOT working. The iteration over the pointer vtkImageData
 133 //                      int slice=0;
 134 //                      std::vector<vtkImageData*>::iterator it;
 135 //                      for (it=dlg.getImagesSelected().begin(); it!=dlg.getImagesSelected().end(); ++it)
 136 //                      {
 137 //                                memcpy(out->GetScalarPointer(0,0,slice), (*it)->GetScalarPointer(0,0,0), imsize);
 138 //                                slice++;
 139 //                      }
 140 //                     //for (it=dlg.getImagesSelected().begin(); it!=dlg.getImagesSelected().end(); ++it)
 141 //                      //  {
 142 //                      //      (*it)->Delete();
 143 //                      //  }
 144
 145                                 bbSetOutputOut(out);
 146                         } else {
 147                          bbSetOutputOut(first);
 148                         } // dim
 149                   }
 150                 } else {
 151                 bbSetOutputOut( NULL );
 152         } // dlg.getImagesSelected().size()!=0
 153         bbSetOutputOutImages( dlg.getImagesSelected());
 154 printf("EED  creaImageIOWxSimpleDlg 5 \n");
 155     </PRE>
 156   </process>
 157
 158   <!--======================================================================
 159    CONSTRUCTORS / DESTRUCTORS (OPTIONAL) -->
 160
 161
 162   <defaultValues>
 163   <PRE>
 164
 165   </PRE>
 166   </defaultValues>
 167
 168
 169
 170 </blackbox>
 171