src/creaImageIODicomScanner.h

   1 /*
   2 # ---------------------------------------------------------------------
   3 #
   4 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5 #                        pour la Santé)
   6 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9 #
  10 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15 #  or in the file LICENSE.txt.
  16 #
  17 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21 #  liability.
  22 #
  23 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25 # ------------------------------------------------------------------------
  26 */
  27
  28 #ifndef __creaImageIODicomScanner_h_INCLUDED__
  29 #define __creaImageIODicomScanner_h_INCLUDED__
  30
  31 #include "creaImageIOTree.h"
  32
  33 #if defined(USE_GDCM2)
  34 #include <gdcmReader.h>
  35 #include <vtkGDCMImageReader.h>
  36 #include <gdcmScanner.h>
  37 #endif
  38
  39 class vtkGDCMImageReader;
  40
  41 namespace creaImageIO
  42 {
  43
  44
  45   /**
  46    * \ingroup IO
  47    */
  48
  49   //=====================================================================
  50   /// Concrete image reader for DICOM images
  51   class DicomImageScanner
  52   {
  53   public:
  54     DicomImageScanner();
  55     virtual ~DicomImageScanner();
  56
  57         /// Add file extensions read by the reader
  58     bool addDirectory(std::string& filename,   std::map<std::string,std::string>& attr);
  59
  60         /// return for a file a 2D VTkImage
  61     virtual vtkImageData* ReadImage(const std::string& filename);
  62         /// Read the attributes for a file
  63     virtual void ReadAttributes(const std::string& filename,
  64                                 tree::AttributeMapType& attr);
  65         void ReadAttributes2(const std::string& filename,
  66                                 tree::AttributeMapType& attr);
  67
  68          std::string irclean(const std::string& str);
  69   private:
  70           const std::string GetStringValueFromTag( const gdcm::DataElement& ds);
  71           vtkGDCMImageReader *mReader;
  72           gdcm::Scanner mscan;
  73           bool b_loaded;
  74
  75   };
  76   //=====================================================================
  77
  78
  79
  80 } // namespace creaImageIO
  81
  82
  83
  84 #endif // #ifndef __creaImageIODicomScanner_h_INCLUDED__