PackRecalage/src/bbPackRecalageReSlicerBox.cxx

   1 #include "bbPackRecalageReSlicerBox.h"
   2 #include "bbPackRecalagePackage.h"
   3
   4 namespace bbPackRecalage
   5 {
   6
   7 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(PackRecalage,ReSlicerBox)
   8 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ReSlicerBox,bbtk::AtomicBlackBox);
   9 void ReSlicerBox::Process()
  10 {
  11
  12         if(!bbGetInputOrigin().empty())
  13         {
  14                 image = vtkImageChangeInformation::New();
  15                 image->SetInput( bbGetInputIn() );
  16                 image->SetOutputSpacing( 1,1,1 );
  17
  18                 slicer =vtkImageReslice::New();
  19                 slicer->SetInput( image->GetOutput() );
  20                 slicer->SetResliceTransform(bbGetInputTransform());
  21                 slicer->SetOutputOrigin( 0 , 0 , 0 );
  22                 slicer->SetOutputOrigin( -(bbGetInputOrigin()[0]) , -(bbGetInputOrigin()[1]) , -(bbGetInputOrigin()[2]) );
  23                 std::cout << "Reslicer: Origin points: X = " <<  bbGetInputOrigin()[0] << " Y = " << bbGetInputOrigin()[1] << " Z = " << bbGetInputOrigin()[2] << std::endl;
  24                 slicer->Update();
  25
  26                 imageResult = vtkImageChangeInformation::New();
  27                 imageResult->SetInput( slicer->GetOutput() );
  28                 double spc[3];
  29                 bbGetInputIn()->GetSpacing(spc);
  30                 imageResult->SetOutputSpacing( spc );
  31                 imageResult->SetOutputOrigin( 0,0,0 );
  32
  33                 bbSetOutputOut( imageResult->GetOutput() );
  34         }
  35         else
  36         {
  37                 bbSetOutputOut( bbGetInputIn() );
  38         }
  39
  40 }
  41 void ReSlicerBox::bbUserSetDefaultValues()
  42 {
  43
  44         std::vector<int> nuevo(3,0);
  45         nuevo.push_back(0);
  46         bbSetInputOrigin(nuevo);
  47     bbSetInputIn(NULL);
  48     bbSetInputTransform(vtkIdentityTransform::New());
  49     bbSetOutputOut(NULL);
  50
  51 }
  52 void ReSlicerBox::bbUserInitializeProcessing()
  53 {
  54
  55 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
  56 //    Here does nothing
  57 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
  58 //    if any
  59         image = vtkImageChangeInformation::New();
  60     slicer =vtkImageReslice::New();
  61         imageResult = vtkImageChangeInformation::New();
  62 }
  63 void ReSlicerBox::bbUserFinalizeProcessing()
  64 {
  65
  66 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
  67 //    Here does nothing
  68 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
  69 //    if any
  70         image->Delete();
  71         slicer->Delete();
  72     imageResult->Delete();
  73 }
  74 }
  75 // EO namespace bbPackRecalage
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