Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26 scriptDirName=$(dirname $(readlink -f $0) )
  27
  28 #########################################################################
  29 ############     Local Functions  #######################################
  30 #########################################################################
  31
  32 ##########################################
  33 # check that $1 is one of $2, $3, ...
  34 function checkVal  {
  35     local val=$1
  36     shift
  37     for x in $* ; do
  38         if [ "$val" == "$x" ] ; then
  39             echo "true"
  40             return
  41         fi
  42     done
  43     echo "false"
  44 }
  45
  46 ###########################################
  47 function bigDisplay {
  48     echo " ================================================================================================"
  49     echo " ================================================================================================"
  50     echo " ======= $1"
  51     echo " ================================================================================================"
  52     echo " ================================================================================================"
  53 }
  54
  55 ###########################################
  56 function checkDistrib {
  57     local OS=$1
  58
  59     if [ "`checkVal $OS MacOS Fedora Ubuntu Mandriva`" == "false" ] ; then
  60         echo "Operating System not supported: $OS"
  61         echo "Currently supported system: Fedora Ubuntu MacOS"
  62         exit 1
  63     fi
  64 }
  65
  66 ###########################################
  67 function getDistrib {
  68     local OS=`uname`
  69
  70       if [ "$OS" == Darwin ] ; then OS=MacOS;
  71     elif [ "$OS" == Linux  ] ; then OS=`awk 'NR==1{print $1}' /etc/issue`
  72     else OS=""
  73     fi
  74
  75 #    checkDistrib $OS
  76
  77     echo $OS
  78 }
  79
  80 ###########################################
  81 function getncore {
  82     if [ `uname` == Darwin ] ; then # MacOS
  83         system_profiler | grep Processor | awk '$1=="Number" {print $4}'
  84     else
  85         cat /proc/cpuinfo | grep processor | wc -l
  86     fi
  87 }
  88
  89 ###########################################
  90 function getbashrc {
  91     if [ ! -f $HOME/.bashrc ] ; then
  92         touch $HOME/.bashrc
  93     fi
  94     echo $HOME/.bashrc
  95
  96
  97 #    # Do it, while we are under user, not under root! # JPR
  98 #    if [ -f $HOME/.bashrc ] ; then
  99 #        echo $HOME/.bashrc
 100 #    else
 101 #        if [ -f $HOME/.profile ] ; then
 102 #            echo $HOME/.profile
 103 #        else
 104 #            echo "=============== BIG TROUBLE : neither $HOME/.bashrc nor $HOME/.profile file found" > /dev/stderr
 105 #            echo "=============== You'd better abort the program and (try to) fix the issue" > /dec/stderr
 106 #            read a # just to let the user time enough to read the message...
 107 #        fi
 108 #    fi
 109 }
 110
 111
 112 ###########################################
 113 function printconfig {
 114
 115     echo
 116     echo "Current Configuration:"
 117     echo "  Operating System                           : $OperatingSystem"
 118     echo "  Number of Cores                            : $corenumber"
 119     echo "  Name of the Generation Directory           : $generationdir"
 120     echo "  Install Prefix for Third Party Libraries   : $installPrefixThird"
 121     echo "  Install Prefix for CreaTools               : $installPrefix"
 122     echo "  Boolean for Doc Generation                 : $docgeneration"
 123     echo "  Where do you want to get source files from : $sourcesFrom"
 124     echo "  Login User Name                            : $loginUserName"
 125     echo "  Login Group Name                           : $loginGroupName"
 126     echo "  Build type                                 : $buildType"
 127     echo "  Gdcm version                               : $gdcmVersion"
 128     echo "  ITK version                                : $ITKVersion"
 129     echo
 130
 131 }
 132
 133
 134
 135 ##################################################################################################
 136 ##################################################################################################
 137 ##################################################################################################
 138 ##################################################################################################
 139 ##################################################################################################
 140 ##################################################################################################
 141
 142 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
 143
 144
 145 # default configuration parameters
 146 OperatingSystem=`getDistrib`
 147 corenumber=`getncore`
 148 generationdir=$HOME/Creatis/creaTools
 149 installPrefixThird=
 150 installPrefix=
 151 docgeneration=OFF
 152 sourcesFrom=GIT
 153
 154 loginUserName=$USER
 155 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
 156 buildType=Release
 157 gdcmVersion=GDCM1
 158 ITKVersion=ITK3
 159 export ETC_BASHRC=~/.bashrc
 160
 161
 162
 163
 164
 165 function usage {
 166     echo "installscript [options] command"
 167     echo "creatools configure/compile/install script"
 168     echo ""
 169     echo ""
 170     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
 171     echo ""
 172     echo ""
 173     echo "    command:"
 174     echo ""
 175     echo "    as a normal user:"
 176     echo "         config            : set the configuration parameters only"
 177     echo "         "
 178     echo "    need root password:"
 179     echo "         3rd               : Get, Compile, Install all 3rd party library "
 180     echo "         3rd-base          : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
 181     echo "         3rd-vtk           : Get, Compile, Install vtk"
 182     echo "         3rd-itk           : Get, Compile, Install itk"
 183     echo "         3rd-gdcm          : Get, Compile, Install gdcm"
 184     echo "         3rd-wx            : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
 185     echo "   "
 186     echo "    as a normal user:"
 187     echo "         creatools         : Get Compile and Install the CreaTools"
 188     echo "         creatools-get     : Get the CreaTools"
 189     echo "         creatools-cmp     : Compile the CreaTools"
 190     echo "         creatools-install : Install the CreaTools"
 191     echo "   "
 192     echo "         uninstall         : uninstall the creatools"
 193     echo "   "
 194     echo "         printconfig       : print the configuration"
 195     echo "         help              : print help"
 196     echo "         env               : print some environnement variables"
 197     echo ""
 198     echo "         all               : configure / compile / install"
 199     echo "         "
 200     echo "   "
 201     echo "   "
 202     echo "   "
 203     echo "   "
 204     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
 205     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
 206     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
 207     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 208     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 209     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 210     echo "        -html                 : get creatools from HTML"
 211     echo "        -git                  : get creatools from git (CREATIS user only)"
 212     echo "        -git-read-only        : get creatools from git (anonymously, no write access)"
 213     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 214     echo ""
 215     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 216     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 217     echo "        -doc           : generate documentation"
 218     echo "        -itk4          : use ITK4"
 219     echo ""
 220     exit 1
 221 }
 222
 223 ##################################################
 224 # parse command line
 225 while [ $# -ge 1 ] ; do
 226     case $1 in
 227         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 228         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 229         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 230         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 231         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 232         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 233         -html)              sourcesFrom=HTML;                          shift 1;;
 234         -git)               sourcesFrom=GIT;                           shift 1;;
 235         -git-read-only)     sourcesFrom=GIT-READ-ONLY;
 236 shift 1;;
 237         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 238         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 239         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 240         *) break;;
 241     esac
 242 done
 243
 244 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 245
 246 command=$1
 247
 248 # check that command is valid
 249 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 250     echo "Unrecognized command: $command"
 251     echo ""
 252     usage
 253 fi
 254
 255
 256 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 257 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 258     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 259         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 260         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 261         exit
 262     fi
 263     source $configureFile
 264     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 265         echo WARNING
 266         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 267         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 268         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 269         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 270         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 271         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 272
 273 #        exit
 274     fi
 275
 276 fi
 277
 278 ##################################################################################
 279 ############################ check configuration parameters
 280 # check distrib
 281 checkDistrib $OperatingSystem
 282
 283 # complete default install prefix
 284 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/creatools_install; fi
 285 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/thirdparty_install; fi
 286
 287 # check build type
 288 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 289     echo "Unsupported build type: $buildType"
 290     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 291     exit 1
 292 fi
 293
 294
 295 ##################################################################################
 296 ############################  write configuration file
 297 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 298     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 299     echo                                          >> $configureFile
 300     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 301     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 302     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 303     echo                                          >> $configureFile
 304     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 305     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 306     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 307     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 308     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 309     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 310     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 311     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 312     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 313     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 314     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 315     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 316     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 317 fi
 318
 319
 320
 321 ################################### print current configuration
 322 printconfig
 323
 324
 325 ##################################################################################
 326 ##################################################################################
 327 ############   Process commands
 328 ##################################################################################
 329 ##################################################################################
 330
 331
 332 ################################################################################## config printconfig
 333 # config or printconfig : already done
 334 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 335     exit
 336 fi
 337
 338 ################################################################################## creatools
 339 # download creatools
 340 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 341     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 342     bash scripts/CreaTools-load.sh
 343 fi
 344
 345 ################################################################################## 3rd library
 346 # install packaged dependencies as root
 347 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 348     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 349     if [ "`whoami`" == root ] ; then
 350        echo ThirdParty-install-Base-Stuff
 351        bash scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh
 352     else
 353         # must log as root
 354         echo "Please enter the root passwd to add necessary packages:";
 355         su -c "bash scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh"
 356     fi
 357     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 358 fi
 359
 360
 361
 362 # vtk
 363 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 364     bigDisplay "INSTALL VTK"
 365     source scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 366     cd $scriptDirName
 367 fi
 368
 369 # gdcm
 370 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 371     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 372     source scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 373     cd $scriptDirName
 374 fi
 375
 376 # itk
 377 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 378     bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 379     bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 380 fi
 381
 382 ## ??
 383 #if [ `checkVal $command all 3rd` == true ] ; then
 384 #    bash scripts/ThirdParty-install.sh
 385 #fi
 386
 387 # Setup the user .bashrc correctly
 388 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 389     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 390     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 391     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 392         bigDisplay "Third Party Install Done"
 393         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 394     fi
 395 fi
 396
 397 ################################################################################## creatools
 398 # compile creatools
 399 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 400     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 401     source $ETC_BASHRC
 402     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 403
 404     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 405     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 406         echo "You probabely made a mistake : "
 407         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 408         echo "Make sure you know the mistake"
 409         echo "Hit any key to continue"
 410         echo "Fix the mistake!"
 411         read a
 412     else
 413         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 414         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 415     fi
 416 fi
 417
 418 #install creatools
 419 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 420     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 421     source $ETC_BASHRC
 422     bash scripts/CreaTools-install.sh
 423     source $ETC_BASHRC
 424     echo " "
 425     echo " "
 426     echo " "
 427     echo " "
 428     echo "Close this window and continue...."
 429     echo " "
 430     echo " "
 431     echo " "
 432     read -p "Press [Enter] key to continue..."
 433 fi
 434
 435 ################################################################################## uninstall
 436 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 437     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 438     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 439 fi
 440
 441 ################################################################################## help
 442 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 443     cat README.txt
 444 fi
 445
 446 ################################################################################## print env variables
 447 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 448     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 449         echo WARNING
 450         echo
 451         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 452         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 453         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 454         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 455         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 456         echo
 457         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 458     fi
 459
 460     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 461         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 462         echo  ------
 463         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 464         echo  ------
 465     fi
 466
 467     echo
 468
 469     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 470        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 471        echo  ------
 472        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 473        echo  ------
 474        echo
 475        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 476     fi
 477
 478     echo  ------
 479     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 480     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 481     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 482     echo
 483     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 484     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 485     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 486     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 487     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 488     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 489     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 490     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 491     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 492     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 493     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 494     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 495     echo "==================================="
 496     echo
 497
 498 fi
 499
 500
 501