Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26 scriptDirName=$(dirname $(readlink -f $0) )
  27
  28 #########################################################################
  29 ############     Local Functions  #######################################
  30 #########################################################################
  31
  32
  33 source scripts/LocalFunctions.sh
  34
  35 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
  36
  37
  38 # default configuration parameters
  39 OperatingSystem=`getDistrib`
  40 corenumber=`getncore`
  41 generationdir=$HOME/Creatis/creaTools
  42 installPrefixThird=
  43 installPrefix=
  44 docgeneration=OFF
  45 sourcesFrom=GIT
  46
  47 loginUserName=$USER
  48 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
  49 buildType=Release
  50 gdcmVersion=GDCM1
  51 ITKVersion=ITK3
  52 export ETC_BASHRC=`getbashrc`
  53
  54
  55 function usage {
  56     echo "installscript [options] command"
  57     echo "creatools configure/compile/install script"
  58     echo ""
  59     echo ""
  60     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
  61     echo ""
  62     echo ""
  63     echo "    command:"
  64     echo ""
  65     echo "    as a normal user:"
  66     echo "         config                    : set the configuration parameters only"
  67     echo "         "
  68     echo "    need root password:"
  69     echo "         3rd                       : Get, Compile, Install all 3rd party library "
  70     echo "         3rd-base                  : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
  71     echo "         3rd-vtk                   : Get, Compile, Install vtk"
  72     echo "         3rd-itk                   : Get, Compile, Install itk"
  73     echo "         3rd-gdcm                  : Get, Compile, Install gdcm"
  74     echo "         3rd-wx                    : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
  75     echo "   "
  76     echo "    as a normal user:"
  77     echo "         creatools                 : Get Compile and Install the CreaTools"
  78     echo "         creatools-get             : Get the CreaTools"
  79     echo "         creatools-cmp             : Compile the CreaTools"
  80     echo "         creatools-install         : Install the CreaTools"
  81     echo "   "
  82     echo "         creatools-generateBinTGZ  : generation of CreaTools.tgz (binary version)"
  83     echo "   "
  84     echo "         uninstall                 : uninstall the creatools"
  85     echo "   "
  86     echo "         printconfig               : print the configuration"
  87     echo "         help                      : print help"
  88     echo "         env                       : print some environnement variables"
  89     echo ""
  90     echo "         all                       : configure / compile / install"
  91     echo "         "
  92     echo "   "
  93     echo "   "
  94     echo "   "
  95     echo "   "
  96     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
  97     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
  98     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
  99     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 100     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 101     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 102     echo "        -html                 : get creatools from HTML"
 103     echo "        -git                  : get creatools from git (CREATIS user only)"
 104     echo "        -git-read-only        : get creatools from git (anonymously, no write access)"
 105     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 106     echo ""
 107     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 108     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 109     echo "        -doc           : generate documentation"
 110     echo "        -itk4          : use ITK4"
 111     echo ""
 112     exit 1
 113 }
 114
 115 ##################################################
 116 # parse command line
 117 while [ $# -ge 1 ] ; do
 118     case $1 in
 119         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 120         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 121         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 122         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 123         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 124         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 125         -html)              sourcesFrom=HTML;                          shift 1;;
 126         -git)               sourcesFrom=GIT;                           shift 1;;
 127         -git-read-only)     sourcesFrom=GIT-READ-ONLY;
 128 shift 1;;
 129         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 130         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 131         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 132         *) break;;
 133     esac
 134 done
 135
 136 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 137
 138 command=$1
 139
 140 # check that command is valid
 141 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install creatools-generateBinTGZ uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 142     echo "Unrecognized command: $command"
 143     echo ""
 144     usage
 145 fi
 146
 147
 148 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 149 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 150     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 151         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 152         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 153         exit
 154     fi
 155     source $configureFile
 156     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 157         echo WARNING
 158         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 159         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 160         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 161         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 162         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 163         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 164
 165 #        exit
 166     fi
 167
 168 fi
 169
 170 ##################################################################################
 171 ############################ check configuration parameters
 172 # check distrib
 173 checkDistrib $OperatingSystem
 174
 175 # complete default install prefix
 176 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/creatools_install; fi
 177 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/thirdparty_install; fi
 178
 179 # check build type
 180 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 181     echo "Unsupported build type: $buildType"
 182     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 183     exit 1
 184 fi
 185
 186
 187 ##################################################################################
 188 ############################  write configuration file
 189 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 190     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 191     echo                                          >> $configureFile
 192     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 193     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 194     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 195     echo                                          >> $configureFile
 196     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 197     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 198     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 199     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 200     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 201     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 202     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 203     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 204     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 205     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 206     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 207     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 208     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 209 fi
 210
 211
 212
 213 ################################### print current configuration
 214 printconfig
 215
 216
 217 ##################################################################################
 218 ##################################################################################
 219 ############   Process commands
 220 ##################################################################################
 221 ##################################################################################
 222
 223
 224 ################################################################################## config printconfig
 225 # config or printconfig : already done
 226 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 227     exit
 228 fi
 229
 230 ################################################################################## creatools
 231 # download creatools
 232 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 233     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 234     bash scripts/CreaTools-load.sh
 235 fi
 236
 237 ################################################################################## 3rd library
 238 # install packaged dependencies as root
 239 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 240     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 241     source scripts/CreaTools-configure.sh
 242     cd scripts
 243     source ThirdParty-install-Base-Stuff.sh $OperatingSystem
 244     cd ..
 245     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 246 fi
 247
 248 # vtk
 249 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 250     bigDisplay "INSTALL VTK"
 251     source scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 252     cd $scriptDirName
 253 fi
 254
 255 # gdcm
 256 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 257     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 258     source scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 259     cd $scriptDirName
 260 fi
 261
 262 # itk
 263 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 264     bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 265     bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 266     cd $scriptDirName
 267 fi
 268
 269
 270 # Setup the user .bashrc correctly
 271 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 272     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 273     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 274     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 275         bigDisplay "Third Party Install Done"
 276         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 277     fi
 278 fi
 279
 280 ################################################################################## creatools
 281 # compile creatools
 282 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 283     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 284 echo "EED installscript compile creatools"
 285 echo $ETC_BASHRC
 286     source $ETC_BASHRC
 287     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 288
 289     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 290     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 291         echo "You probabely made a mistake : "
 292         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 293         echo "Make sure you know the mistake"
 294         echo "Hit any key to continue"
 295         echo "Fix the mistake!"
 296         read a
 297     else
 298         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 299         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 300     fi
 301 fi
 302
 303 #install creatools
 304 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 305     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 306     source $ETC_BASHRC
 307     bash scripts/CreaTools-install.sh
 308     source $ETC_BASHRC
 309     echo " "
 310     echo " "
 311     echo " "
 312     echo " "
 313     echo "Open a new terminal to run creatools."
 314     echo "(Close this window and continue....) "
 315     echo " "
 316     echo " "
 317     ##EED read -p "Press [Enter] key to continue..."
 318 fi
 319
 320 #generate TGZ version of the bin (Creatools and ThirdParty)
 321 if [ `checkVal $command creatools-generateBinTGZ` == true ] ; then
 322     bash scripts/CreaTools-GenerateBinTGZ.sh
 323 fi
 324
 325 ################################################################################## uninstall
 326 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 327     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 328     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 329 fi
 330
 331 ################################################################################## help
 332 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 333     cat README.txt
 334 fi
 335
 336 ################################################################################## print env variables
 337 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 338     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 339         echo WARNING
 340         echo
 341         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 342         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 343         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 344         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 345         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 346         echo
 347         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 348     fi
 349
 350     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 351         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 352         echo  ------
 353         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 354         echo  ------
 355     fi
 356
 357     echo
 358
 359     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 360        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 361        echo  ------
 362        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 363        echo  ------
 364        echo
 365        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 366     fi
 367
 368     echo  ------
 369     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 370     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 371     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 372     echo
 373     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 374     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 375     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 376     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 377     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 378     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 379     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 380     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 381     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 382     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 383     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 384     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 385     echo "==================================="
 386     echo
 387
 388 fi
 389
 390
 391