Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26 #########################################################################
  27 ############     Local Functions  #######################################
  28 #########################################################################
  29
  30 ##########################################
  31 # check that $1 is one of $2, $3, ...
  32 function checkVal  {
  33     local val=$1
  34     shift
  35     for x in $* ; do
  36         if [ "$val" == "$x" ] ; then
  37             echo "true"
  38             return
  39         fi
  40     done
  41     echo "false"
  42 }
  43
  44 ###########################################
  45 function bigDisplay {
  46     echo " ================================================================================================"
  47     echo " ================================================================================================"
  48     echo " ======= $1"
  49     echo " ================================================================================================"
  50     echo " ================================================================================================"
  51 }
  52
  53 ###########################################
  54 function checkDistrib {
  55     local OS=$1
  56
  57     if [ "`checkVal $OS MacOS Fedora Ubuntu Mandriva`" == "false" ] ; then
  58         echo "Operating System not supported: $OS"
  59         echo "Currently supported system: Fedora Ubuntu MacOS"
  60         exit 1
  61     fi
  62 }
  63
  64 ###########################################
  65 function getDistrib {
  66     local OS=`uname`
  67
  68       if [ "$OS" == Darwin ] ; then OS=MacOS;
  69     elif [ "$OS" == Linux  ] ; then OS=`awk 'NR==1{print $1}' /etc/issue`
  70     else OS=""
  71     fi
  72
  73 #    checkDistrib $OS
  74
  75     echo $OS
  76 }
  77
  78 ###########################################
  79 function getncore {
  80     if [ `uname` == Darwin ] ; then # MacOS
  81         system_profiler | grep Processor | awk '$1=="Number" {print $4}'
  82     else
  83         cat /proc/cpuinfo | grep processor | wc -l
  84     fi
  85 }
  86
  87 ###########################################
  88 function getbashrc {
  89     if [ ! -f $HOME/.bashrc ] ; then
  90         touch $HOME/.bashrc
  91     fi
  92     echo $HOME/.bashrc
  93
  94
  95 #    # Do it, while we are under user, not under root! # JPR
  96 #    if [ -f $HOME/.bashrc ] ; then
  97 #        echo $HOME/.bashrc
  98 #    else
  99 #        if [ -f $HOME/.profile ] ; then
 100 #            echo $HOME/.profile
 101 #        else
 102 #            echo "=============== BIG TROUBLE : neither $HOME/.bashrc nor $HOME/.profile file found" > /dev/stderr
 103 #            echo "=============== You'd better abort the program and (try to) fix the issue" > /dec/stderr
 104 #            read a # just to let the user time enough to read the message...
 105 #        fi
 106 #    fi
 107 }
 108
 109
 110 ###########################################
 111 function printconfig {
 112
 113     echo
 114     echo "Current Configuration:"
 115     echo "  Operating System                           : $OperatingSystem"
 116     echo "  Number of Cores                            : $corenumber"
 117     echo "  Name of the Generation Directory           : $generationdir"
 118     echo "  Install Prefix for Third Party Libraries   : $installPrefixThird"
 119     echo "  Install Prefix for CreaTools               : $installPrefix"
 120     echo "  Boolean for Doc Generation                 : $docgeneration"
 121     echo "  Where do you want to get source files from : $sourcesFrom"
 122     if [ $sourcesFrom = CVS ] ; then
 123     echo "  CVS User Name                              : $cvsUserName"
 124     fi
 125     echo "  Login User Name                            : $loginUserName"
 126     echo "  Login Group Name                           : $loginGroupName"
 127     echo "  Build type                                 : $buildType"
 128     echo "  Gdcm version                               : $gdcmVersion"
 129     echo "  ITK version                                : $ITKVersion"
 130     echo
 131
 132 }
 133
 134
 135
 136 ##################################################################################################
 137 ##################################################################################################
 138 ##################################################################################################
 139 ##################################################################################################
 140 ##################################################################################################
 141 ##################################################################################################
 142
 143 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
 144
 145
 146 # default configuration parameters
 147 OperatingSystem=`getDistrib`
 148 corenumber=`getncore`
 149 generationdir=$HOME/CreatoolsGenerationDir
 150 installPrefixThird=
 151 installPrefix=
 152 docgeneration=OFF
 153 sourcesFrom=HTML
 154
 155 cvsUserName=
 156 loginUserName=$USER
 157 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
 158 buildType=RelWithDebug
 159 gdcmVersion=GDCM1
 160 ITKVersion=ITK3
 161 export ETC_BASHRC=`getbashrc`
 162
 163
 164
 165
 166
 167 function usage {
 168     echo "installscript [options] command"
 169     echo "creatools configure/compile/install script"
 170     echo ""
 171     echo ""
 172     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
 173     echo ""
 174     echo ""
 175     echo "    command:"
 176     echo "         all               : configure / compile / install"
 177     echo "         "
 178     echo "         config            : set the configuration parameters only"
 179     echo "         "
 180     echo "         3rd               : Get, Compile, Install all 3rd party library "
 181     echo "         3rd-base          : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
 182     echo "         3rd-vtk           : Get, Compile, Install vtk"
 183     echo "         3rd-itk           : Get, Compile, Install itk"
 184     echo "         3rd-gdcm          : Get, Compile, Install gdcm"
 185     echo "         3rd-wx            : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
 186     echo "   "
 187     echo "         creatools         : Get Compile and Install the CreaTools"
 188     echo "         creatools-get     : Get the CreaTools"
 189     echo "         creatools-cmp     : Compile the CreaTools"
 190     echo "         creatools-install : Install the CreaTools"
 191     echo "   "
 192     echo "         uninstall         : uninstall the creatools"
 193     echo "   "
 194     echo "         printconfig       : print the configuration"
 195     echo "         help              : print help"
 196     echo "         env               : print some environnement variables"
 197     echo "   "
 198     echo "   "
 199     echo "   "
 200     echo "   "
 201     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
 202     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
 203     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
 204     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 205     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 206     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 207     echo "        -cvs <cvsusername>    : get creatools from cvs (CREATIS user only)"
 208     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 209     echo ""
 210     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 211     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 212     echo "        -doc           : generate documentation"
 213     echo "        -itk4          : use ITK4"
 214     echo ""
 215     exit 1
 216 }
 217
 218 ##################################################
 219 # parse command line
 220 while [ $# -ge 1 ] ; do
 221     case $1 in
 222         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 223         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 224         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 225         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 226         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 227         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 228         -cvs)               sourcesFrom=CVS; cvsUserName=$2;           shift 2;;
 229         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 230         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 231         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 232         *) break;;
 233     esac
 234 done
 235
 236 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 237
 238 command=$1
 239
 240 # check that command is valid
 241 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 242     echo "Unrecognized command: $command"
 243     echo ""
 244     usage
 245 fi
 246
 247
 248 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 249 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 250     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 251         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 252         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 253         exit
 254     fi
 255     source $configureFile
 256     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 257         echo WARNING
 258         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 259         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 260         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 261         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 262         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 263         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 264
 265 #        exit
 266     fi
 267
 268 fi
 269
 270 ##################################################################################
 271 ############################ check configuration parameters
 272 # check distrib
 273 checkDistrib $OperatingSystem
 274
 275 # complete default install prefix
 276 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/creatools_install; fi
 277 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/thirdparty_install; fi
 278
 279 # check build type
 280 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 281     echo "Unsupported build type: $buildType"
 282     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 283     exit 1
 284 fi
 285
 286
 287 ##################################################################################
 288 ############################  write configuration file
 289 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 290     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 291     echo                                          >> $configureFile
 292     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 293     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 294     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 295     echo                                          >> $configureFile
 296     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 297     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 298     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 299     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 300     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 301     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 302     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 303     echo "cvsUserName=$cvsUserName"               >> $configureFile
 304     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 305     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 306     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 307     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 308     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 309     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 310 fi
 311
 312
 313
 314 ################################### print current configuration
 315 printconfig
 316
 317
 318 ##################################################################################
 319 ##################################################################################
 320 ############   Process commands
 321 ##################################################################################
 322 ##################################################################################
 323
 324
 325 ################################################################################## config printconfig
 326 # config or printconfig : already done
 327 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 328     exit
 329 fi
 330
 331
 332 ################################################################################## 3rd library
 333 # install packaged dependencies as root
 334 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 335     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 336     if [ "`whoami`" == root ] ; then
 337         bash scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh
 338     else
 339         # must log as root
 340         echo "Please enter the root passwd to add necessary packages:";
 341         su -c "bash scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh"
 342     fi
 343     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 344 fi
 345
 346 # vtk
 347 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 348     bigDisplay "INSTALL VTK"
 349     bash scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 350 fi
 351
 352 # gdcm
 353 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 354     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 355     bash scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 356 fi
 357
 358 # itk
 359 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 360     bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 361     bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 362 fi
 363
 364 ## ??
 365 #if [ `checkVal $command all 3rd` == true ] ; then
 366 #    bash scripts/ThirdParty-install.sh
 367 #fi
 368
 369 # Setup the user .bashrc correctly
 370 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 371     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 372     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 373     source $ETC_BASHRC
 374     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 375         bigDisplay "Third Party Install Done"
 376         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 377     fi
 378 fi
 379
 380 ################################################################################## creatools
 381
 382 # download creatools
 383 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 384     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 385     bash scripts/CreaTools-load.sh
 386 fi
 387
 388 # compile creatools
 389 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 390     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 391     source $ETC_BASHRC
 392     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 393
 394     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 395     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 396         echo "You probabely made a mistake : "
 397         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 398         echo "Make sure you know the mistake"
 399         echo "Hit any key to continue"
 400         echo "Fix the mistake!"
 401         read a
 402     else
 403         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 404         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 405     fi
 406 fi
 407
 408 #install creatools
 409 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 410     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 411     source $ETC_BASHRC
 412     bash scripts/CreaTools-install.sh
 413     source $ETC_BASHRC
 414 fi
 415
 416 ################################################################################## uninstall
 417
 418 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 419     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 420     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 421 fi
 422
 423 ################################################################################## help
 424 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 425     cat README.txt
 426 fi
 427
 428 ################################################################################## print env variables
 429 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 430     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 431         echo WARNING
 432         echo
 433         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 434         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 435         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 436         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 437         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 438         echo
 439         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 440     fi
 441
 442     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 443         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 444         echo  ------
 445         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 446         echo  ------
 447     fi
 448
 449     echo
 450
 451     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 452        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 453        echo  ------
 454        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 455        echo  ------
 456        echo
 457        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 458     fi
 459
 460     echo  ------
 461     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 462     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 463     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 464     echo
 465     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 466     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 467     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 468     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 469     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 470     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 471     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 472     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 473     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 474     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 475     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 476     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 477     echo "==================================="
 478     echo
 479
 480 fi
 481
 482
 483