Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26 scriptDirName=$(dirname $(readlink -f $0) )
  27
  28 #########################################################################
  29 ############     Local Functions  #######################################
  30 #########################################################################
  31
  32 ##########################################
  33 # check that $1 is one of $2, $3, ...
  34 function checkVal  {
  35     local val=$1
  36     shift
  37     for x in $* ; do
  38         if [ "$val" == "$x" ] ; then
  39             echo "true"
  40             return
  41         fi
  42     done
  43     echo "false"
  44 }
  45
  46 ###########################################
  47 function bigDisplay {
  48     echo " ================================================================================================"
  49     echo " ================================================================================================"
  50     echo " ======= $1"
  51     echo " ================================================================================================"
  52     echo " ================================================================================================"
  53 }
  54
  55 ###########################################
  56 function checkDistrib {
  57     local OS=$1
  58
  59     if [ "`checkVal $OS MacOS Fedora Ubuntu Mandriva`" == "false" ] ; then
  60         echo "Operating System not supported: $OS"
  61         echo "Currently supported system: Fedora Ubuntu MacOS"
  62         exit 1
  63     fi
  64 }
  65
  66 ###########################################
  67 function getDistrib {
  68     local OS=`uname`
  69
  70       if [ "$OS" == Darwin ] ; then OS=MacOS;
  71     elif [ "$OS" == Linux  ] ; then OS=`awk 'NR==1{print $1}' /etc/issue`
  72     else OS=""
  73     fi
  74
  75 #    checkDistrib $OS
  76
  77     echo $OS
  78 }
  79
  80 ###########################################
  81 function getncore {
  82     if [ `uname` == Darwin ] ; then # MacOS
  83         system_profiler | grep Processor | awk '$1=="Number" {print $4}'
  84     else
  85         cat /proc/cpuinfo | grep processor | wc -l
  86     fi
  87 }
  88
  89 ###########################################
  90 function getbashrc {
  91     if [ ! -f $HOME/.bashrc ] ; then
  92         touch $HOME/.bashrc
  93     fi
  94     echo $HOME/.bashrc
  95
  96
  97 #    # Do it, while we are under user, not under root! # JPR
  98 #    if [ -f $HOME/.bashrc ] ; then
  99 #        echo $HOME/.bashrc
 100 #    else
 101 #        if [ -f $HOME/.profile ] ; then
 102 #            echo $HOME/.profile
 103 #        else
 104 #            echo "=============== BIG TROUBLE : neither $HOME/.bashrc nor $HOME/.profile file found" > /dev/stderr
 105 #            echo "=============== You'd better abort the program and (try to) fix the issue" > /dec/stderr
 106 #            read a # just to let the user time enough to read the message...
 107 #        fi
 108 #    fi
 109 }
 110
 111
 112 ###########################################
 113 function printconfig {
 114
 115     echo
 116     echo "Current Configuration:"
 117     echo "  Operating System                           : $OperatingSystem"
 118     echo "  Number of Cores                            : $corenumber"
 119     echo "  Name of the Generation Directory           : $generationdir"
 120     echo "  Install Prefix for Third Party Libraries   : $installPrefixThird"
 121     echo "  Install Prefix for CreaTools               : $installPrefix"
 122     echo "  Boolean for Doc Generation                 : $docgeneration"
 123     echo "  Where do you want to get source files from : $sourcesFrom"
 124     echo "  Login User Name                            : $loginUserName"
 125     echo "  Login Group Name                           : $loginGroupName"
 126     echo "  Build type                                 : $buildType"
 127     echo "  Gdcm version                               : $gdcmVersion"
 128     echo "  ITK version                                : $ITKVersion"
 129     echo
 130
 131 }
 132
 133
 134
 135 ##################################################################################################
 136 ##################################################################################################
 137 ##################################################################################################
 138 ##################################################################################################
 139 ##################################################################################################
 140 ##################################################################################################
 141
 142 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
 143
 144
 145 # default configuration parameters
 146 OperatingSystem=`getDistrib`
 147 corenumber=`getncore`
 148 generationdir=$HOME/Creatis/creaTools
 149 installPrefixThird=
 150 installPrefix=
 151 docgeneration=OFF
 152 sourcesFrom=GIT
 153
 154 loginUserName=$USER
 155 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
 156 buildType=Release
 157 gdcmVersion=GDCM1
 158 ITKVersion=ITK3
 159 export ETC_BASHRC=~/.bashrc
 160
 161
 162
 163
 164
 165 function usage {
 166     echo "installscript [options] command"
 167     echo "creatools configure/compile/install script"
 168     echo ""
 169     echo ""
 170     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
 171     echo ""
 172     echo ""
 173     echo "    command:"
 174     echo ""
 175     echo "    as a normal user:"
 176     echo "         config                    : set the configuration parameters only"
 177     echo "         "
 178     echo "    need root password:"
 179     echo "         3rd                       : Get, Compile, Install all 3rd party library "
 180     echo "         3rd-base                  : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
 181     echo "         3rd-vtk                   : Get, Compile, Install vtk"
 182     echo "         3rd-itk                   : Get, Compile, Install itk"
 183     echo "         3rd-gdcm                  : Get, Compile, Install gdcm"
 184     echo "         3rd-wx                    : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
 185     echo "   "
 186     echo "    as a normal user:"
 187     echo "         creatools                 : Get Compile and Install the CreaTools"
 188     echo "         creatools-get             : Get the CreaTools"
 189     echo "         creatools-cmp             : Compile the CreaTools"
 190     echo "         creatools-install         : Install the CreaTools"
 191     echo "   "
 192     echo "         creatools-generateBinTGZ  : generation of CreaTools.tgz (binary version)"
 193     echo "   "
 194     echo "         uninstall                 : uninstall the creatools"
 195     echo "   "
 196     echo "         printconfig               : print the configuration"
 197     echo "         help                      : print help"
 198     echo "         env                       : print some environnement variables"
 199     echo ""
 200     echo "         all                       : configure / compile / install"
 201     echo "         "
 202     echo "   "
 203     echo "   "
 204     echo "   "
 205     echo "   "
 206     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
 207     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
 208     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
 209     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 210     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 211     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 212     echo "        -html                 : get creatools from HTML"
 213     echo "        -git                  : get creatools from git (CREATIS user only)"
 214     echo "        -git-read-only        : get creatools from git (anonymously, no write access)"
 215     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 216     echo ""
 217     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 218     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 219     echo "        -doc           : generate documentation"
 220     echo "        -itk4          : use ITK4"
 221     echo ""
 222     exit 1
 223 }
 224
 225 ##################################################
 226 # parse command line
 227 while [ $# -ge 1 ] ; do
 228     case $1 in
 229         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 230         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 231         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 232         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 233         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 234         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 235         -html)              sourcesFrom=HTML;                          shift 1;;
 236         -git)               sourcesFrom=GIT;                           shift 1;;
 237         -git-read-only)     sourcesFrom=GIT-READ-ONLY;
 238 shift 1;;
 239         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 240         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 241         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 242         *) break;;
 243     esac
 244 done
 245
 246 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 247
 248 command=$1
 249
 250 # check that command is valid
 251 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install creatools-generateBinTGZ uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 252     echo "Unrecognized command: $command"
 253     echo ""
 254     usage
 255 fi
 256
 257
 258 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 259 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 260     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 261         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 262         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 263         exit
 264     fi
 265     source $configureFile
 266     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 267         echo WARNING
 268         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 269         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 270         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 271         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 272         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 273         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 274
 275 #        exit
 276     fi
 277
 278 fi
 279
 280 ##################################################################################
 281 ############################ check configuration parameters
 282 # check distrib
 283 checkDistrib $OperatingSystem
 284
 285 # complete default install prefix
 286 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/creatools_install; fi
 287 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/thirdparty_install; fi
 288
 289 # check build type
 290 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 291     echo "Unsupported build type: $buildType"
 292     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 293     exit 1
 294 fi
 295
 296
 297 ##################################################################################
 298 ############################  write configuration file
 299 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 300     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 301     echo                                          >> $configureFile
 302     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 303     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 304     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 305     echo                                          >> $configureFile
 306     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 307     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 308     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 309     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 310     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 311     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 312     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 313     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 314     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 315     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 316     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 317     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 318     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 319 fi
 320
 321
 322
 323 ################################### print current configuration
 324 printconfig
 325
 326
 327 ##################################################################################
 328 ##################################################################################
 329 ############   Process commands
 330 ##################################################################################
 331 ##################################################################################
 332
 333
 334 ################################################################################## config printconfig
 335 # config or printconfig : already done
 336 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 337     exit
 338 fi
 339
 340 ################################################################################## creatools
 341 # download creatools
 342 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 343     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 344     bash scripts/CreaTools-load.sh
 345 fi
 346
 347 ################################################################################## 3rd library
 348 # install packaged dependencies as root
 349 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 350     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 351     if [ "`whoami`" == root ] ; then
 352        echo ThirdParty-install-Base-Stuff
 353        bash scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh
 354     else
 355         # must log as root
 356         echo "Please enter the root passwd to add necessary packages:";
 357         su -c "bash scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh"
 358     fi
 359     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 360 fi
 361
 362
 363
 364 # vtk
 365 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 366     bigDisplay "INSTALL VTK"
 367     source scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 368     cd $scriptDirName
 369 fi
 370
 371 # gdcm
 372 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 373     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 374     source scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 375     cd $scriptDirName
 376 fi
 377
 378 # itk
 379 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 380     bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 381     bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 382 fi
 383
 384 ## ??
 385 #if [ `checkVal $command all 3rd` == true ] ; then
 386 #    bash scripts/ThirdParty-install.sh
 387 #fi
 388
 389 # Setup the user .bashrc correctly
 390 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 391     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 392     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 393     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 394         bigDisplay "Third Party Install Done"
 395         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 396     fi
 397 fi
 398
 399 ################################################################################## creatools
 400 # compile creatools
 401 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 402     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 403     source $ETC_BASHRC
 404     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 405
 406     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 407     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 408         echo "You probabely made a mistake : "
 409         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 410         echo "Make sure you know the mistake"
 411         echo "Hit any key to continue"
 412         echo "Fix the mistake!"
 413         read a
 414     else
 415         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 416         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 417     fi
 418 fi
 419
 420 #install creatools
 421 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 422     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 423     source $ETC_BASHRC
 424     bash scripts/CreaTools-install.sh
 425     source $ETC_BASHRC
 426     echo " "
 427     echo " "
 428     echo " "
 429     echo " "
 430     echo "Open a new terminal to run creatools."
 431     echo "(Close this window and continue....) "
 432     echo " "
 433     echo " "
 434     read -p "Press [Enter] key to continue..."
 435 fi
 436
 437 #generate TGZ version of the bin (Creatools and ThirdParty)
 438 if [ `checkVal $command creatools-generateBinTGZ` == true ] ; then
 439     bash scripts/CreaTools-GenerateBinTGZ.sh
 440 fi
 441
 442 ################################################################################## uninstall
 443 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 444     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 445     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 446 fi
 447
 448 ################################################################################## help
 449 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 450     cat README.txt
 451 fi
 452
 453 ################################################################################## print env variables
 454 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 455     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 456         echo WARNING
 457         echo
 458         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 459         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 460         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 461         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 462         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 463         echo
 464         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 465     fi
 466
 467     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 468         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 469         echo  ------
 470         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 471         echo  ------
 472     fi
 473
 474     echo
 475
 476     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 477        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 478        echo  ------
 479        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 480        echo  ------
 481        echo
 482        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 483     fi
 484
 485     echo  ------
 486     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 487     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 488     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 489     echo
 490     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 491     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 492     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 493     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 494     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 495     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 496     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 497     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 498     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 499     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 500     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 501     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 502     echo "==================================="
 503     echo
 504
 505 fi
 506
 507
 508