Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26 #########################################################################
  27 ############     Local Functions  #######################################
  28 #########################################################################
  29
  30 ##########################################
  31 # check that $1 is one of $2, $3, ...
  32 function checkVal  {
  33     local val=$1
  34     shift
  35     for x in $* ; do
  36         if [ "$val" == "$x" ] ; then
  37             echo "true"
  38             return
  39         fi
  40     done
  41     echo "false"
  42 }
  43
  44 ###########################################
  45 function bigDisplay {
  46     echo " ================================================================================================"
  47     echo " ================================================================================================"
  48     echo " ======= $1"
  49     echo " ================================================================================================"
  50     echo " ================================================================================================"
  51 }
  52
  53 ###########################################
  54 function checkDistrib {
  55     local OS=$1
  56
  57     if [ "`checkVal $OS MacOS Fedora Ubuntu Mandriva`" == "false" ] ; then
  58         echo "Operating System not supported: $OS"
  59         echo "Currently supported system: Fedora Ubuntu MacOS"
  60         exit 1
  61     fi
  62 }
  63
  64 ###########################################
  65 function getDistrib {
  66     local OS=`uname`
  67
  68       if [ "$OS" == Darwin ] ; then OS=MacOS;
  69     elif [ "$OS" == Linux  ] ; then OS=`awk 'NR==1{print $1}' /etc/issue`
  70     else OS=""
  71     fi
  72
  73 #    checkDistrib $OS
  74
  75     echo $OS
  76 }
  77
  78 ###########################################
  79 function getncore {
  80     if [ `uname` == Darwin ] ; then # MacOS
  81         system_profiler | grep Processor | awk '$1=="Number" {print $4}'
  82     else
  83         cat /proc/cpuinfo | grep processor | wc -l
  84     fi
  85 }
  86
  87 ###########################################
  88 function getbashrc {
  89     if [ ! -f $HOME/.bashrc ] ; then
  90         touch $HOME/.bashrc
  91     fi
  92     echo $HOME/.bashrc
  93
  94
  95 #    # Do it, while we are under user, not under root! # JPR
  96 #    if [ -f $HOME/.bashrc ] ; then
  97 #        echo $HOME/.bashrc
  98 #    else
  99 #        if [ -f $HOME/.profile ] ; then
 100 #            echo $HOME/.profile
 101 #        else
 102 #            echo "=============== BIG TROUBLE : neither $HOME/.bashrc nor $HOME/.profile file found" > /dev/stderr
 103 #            echo "=============== You'd better abort the program and (try to) fix the issue" > /dec/stderr
 104 #            read a # just to let the user time enough to read the message...
 105 #        fi
 106 #    fi
 107 }
 108
 109
 110 ###########################################
 111 function printconfig {
 112
 113     echo
 114     echo "Current Configuration:"
 115     echo "  Operating System                           : $OperatingSystem"
 116     echo "  Number of Cores                            : $corenumber"
 117     echo "  Name of the Generation Directory           : $generationdir"
 118     echo "  Install Prefix for Third Party Libraries   : $installPrefixThird"
 119     echo "  Install Prefix for CreaTools               : $installPrefix"
 120     echo "  Boolean for Doc Generation                 : $docgeneration"
 121     echo "  Where do you want to get source files from : $sourcesFrom"
 122     echo "  Login User Name                            : $loginUserName"
 123     echo "  Login Group Name                           : $loginGroupName"
 124     echo "  Build type                                 : $buildType"
 125     echo "  Gdcm version                               : $gdcmVersion"
 126     echo "  ITK version                                : $ITKVersion"
 127     echo
 128
 129 }
 130
 131
 132
 133 ##################################################################################################
 134 ##################################################################################################
 135 ##################################################################################################
 136 ##################################################################################################
 137 ##################################################################################################
 138 ##################################################################################################
 139
 140 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
 141
 142
 143 # default configuration parameters
 144 OperatingSystem=`getDistrib`
 145 corenumber=`getncore`
 146 generationdir=$HOME/CreatoolsGenerationDir
 147 installPrefixThird=
 148 installPrefix=
 149 docgeneration=OFF
 150 sourcesFrom=HTML
 151
 152 loginUserName=$USER
 153 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
 154 buildType=RelWithDebug
 155 gdcmVersion=GDCM1
 156 ITKVersion=ITK3
 157 export ETC_BASHRC=`getbashrc`
 158
 159
 160
 161
 162
 163 function usage {
 164     echo "installscript [options] command"
 165     echo "creatools configure/compile/install script"
 166     echo ""
 167     echo ""
 168     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
 169     echo ""
 170     echo ""
 171     echo "    command:"
 172     echo "         all               : configure / compile / install"
 173     echo "         "
 174     echo "         config            : set the configuration parameters only"
 175     echo "         "
 176     echo "         3rd               : Get, Compile, Install all 3rd party library "
 177     echo "         3rd-base          : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
 178     echo "         3rd-vtk           : Get, Compile, Install vtk"
 179     echo "         3rd-itk           : Get, Compile, Install itk"
 180     echo "         3rd-gdcm          : Get, Compile, Install gdcm"
 181     echo "         3rd-wx            : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
 182     echo "   "
 183     echo "         creatools         : Get Compile and Install the CreaTools"
 184     echo "         creatools-get     : Get the CreaTools"
 185     echo "         creatools-cmp     : Compile the CreaTools"
 186     echo "         creatools-install : Install the CreaTools"
 187     echo "   "
 188     echo "         uninstall         : uninstall the creatools"
 189     echo "   "
 190     echo "         printconfig       : print the configuration"
 191     echo "         help              : print help"
 192     echo "         env               : print some environnement variables"
 193     echo "   "
 194     echo "   "
 195     echo "   "
 196     echo "   "
 197     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
 198     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
 199     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
 200     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 201     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 202     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 203     echo "        -git                  : get creatools from git (CREATIS user only)"
 204     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 205     echo ""
 206     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 207     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 208     echo "        -doc           : generate documentation"
 209     echo "        -itk4          : use ITK4"
 210     echo ""
 211     exit 1
 212 }
 213
 214 ##################################################
 215 # parse command line
 216 while [ $# -ge 1 ] ; do
 217     case $1 in
 218         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 219         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 220         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 221         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 222         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 223         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 224         -git)               sourcesFrom=GIT;                           shift 1;;
 225         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 226         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 227         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 228         *) break;;
 229     esac
 230 done
 231
 232 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 233
 234 command=$1
 235
 236 # check that command is valid
 237 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 238     echo "Unrecognized command: $command"
 239     echo ""
 240     usage
 241 fi
 242
 243
 244 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 245 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 246     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 247         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 248         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 249         exit
 250     fi
 251     source $configureFile
 252     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 253         echo WARNING
 254         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 255         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 256         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 257         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 258         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 259         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 260
 261 #        exit
 262     fi
 263
 264 fi
 265
 266 ##################################################################################
 267 ############################ check configuration parameters
 268 # check distrib
 269 checkDistrib $OperatingSystem
 270
 271 # complete default install prefix
 272 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/creatools_install; fi
 273 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/thirdparty_install; fi
 274
 275 # check build type
 276 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 277     echo "Unsupported build type: $buildType"
 278     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 279     exit 1
 280 fi
 281
 282
 283 ##################################################################################
 284 ############################  write configuration file
 285 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 286     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 287     echo                                          >> $configureFile
 288     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 289     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 290     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 291     echo                                          >> $configureFile
 292     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 293     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 294     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 295     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 296     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 297     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 298     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 299     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 300     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 301     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 302     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 303     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 304     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 305 fi
 306
 307
 308
 309 ################################### print current configuration
 310 printconfig
 311
 312
 313 ##################################################################################
 314 ##################################################################################
 315 ############   Process commands
 316 ##################################################################################
 317 ##################################################################################
 318
 319
 320 ################################################################################## config printconfig
 321 # config or printconfig : already done
 322 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 323     exit
 324 fi
 325
 326
 327 ################################################################################## 3rd library
 328 # install packaged dependencies as root
 329 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 330     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 331     if [ "`whoami`" == root ] ; then
 332         bash scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh
 333     else
 334         # must log as root
 335         echo "Please enter the root passwd to add necessary packages:";
 336         sudo su -c "bash scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh"
 337     fi
 338     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 339 fi
 340
 341
 342 # vtk
 343 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 344     bigDisplay "INSTALL VTK"
 345     bash scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 346 fi
 347
 348 # gdcm
 349 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 350     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 351     bash scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 352 fi
 353
 354 # itk
 355 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 356     bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 357     bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 358 fi
 359
 360 ## ??
 361 #if [ `checkVal $command all 3rd` == true ] ; then
 362 #    bash scripts/ThirdParty-install.sh
 363 #fi
 364
 365 # Setup the user .bashrc correctly
 366 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 367     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 368     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 369     source $ETC_BASHRC
 370     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 371         bigDisplay "Third Party Install Done"
 372         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 373     fi
 374 fi
 375
 376 ################################################################################## creatools
 377
 378 # download creatools
 379 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 380     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 381     bash scripts/CreaTools-load.sh
 382 fi
 383
 384 # compile creatools
 385 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 386     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 387     source $ETC_BASHRC
 388     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 389
 390     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 391     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 392         echo "You probabely made a mistake : "
 393         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 394         echo "Make sure you know the mistake"
 395         echo "Hit any key to continue"
 396         echo "Fix the mistake!"
 397         read a
 398     else
 399         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 400         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 401     fi
 402 fi
 403
 404 #install creatools
 405 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 406     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 407     source $ETC_BASHRC
 408     bash scripts/CreaTools-install.sh
 409     source $ETC_BASHRC
 410 fi
 411
 412 ################################################################################## uninstall
 413
 414 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 415     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 416     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 417 fi
 418
 419 ################################################################################## help
 420 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 421     cat README.txt
 422 fi
 423
 424 ################################################################################## print env variables
 425 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 426     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 427         echo WARNING
 428         echo
 429         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 430         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 431         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 432         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 433         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 434         echo
 435         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 436     fi
 437
 438     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 439         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 440         echo  ------
 441         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 442         echo  ------
 443     fi
 444
 445     echo
 446
 447     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 448        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 449        echo  ------
 450        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 451        echo  ------
 452        echo
 453        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 454     fi
 455
 456     echo  ------
 457     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 458     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 459     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 460     echo
 461     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 462     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 463     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 464     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 465     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 466     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 467     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 468     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 469     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 470     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 471     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 472     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 473     echo "==================================="
 474     echo
 475
 476 fi
 477
 478
 479