Linux/scripts/ThirdParty-install-ITK.sh

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24
  25 #!/bin/bash
  26
  27  echo  "in ThirdParty-install-ITK.sh, source " $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  28  if [ ! -f $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh ]
  29  then
  30    echo
  31    echo "..ERROR.."
  32    echo "==================================================="
  33    echo "REMEMBER !"
  34    echo ""
  35    echo "YOU NEED TO RUN 'Configure' (0) First !"
  36    echo "==================================================="
  37    echo
  38    echo
  39    exit 0
  40 fi
  41 echo $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  42 echo --- beg
  43 more $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  44 echo --- end
  45 source $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  46
  47    echo "------"
  48    echo $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  49    echo --generationdir--
  50    echo $generationdir
  51    echo --docgeneration--
  52    echo $docgeneration
  53    echo --installPrefix--
  54    echo $installPrefix
  55    echo --installPrefixThird--
  56    echo $installPrefixThird
  57    echo --buildType--
  58    echo $buildType
  59    echo --gdcmVersion--
  60    echo $gdcmVersion
  61    echo --ITKVersion--
  62    echo $ITKVersion
  63 #   echo --sourcesFrom--
  64 #   echo $sourcesFrom
  65 #   echo --scriptDir--
  66 #   echo $scriptDir
  67 #   echo --start_point--
  68 #   echo $start_point
  69    echo "------"
  70
  71
  72 #EED 2017-03-24
  73   source $PWD/scripts/LocalFunctions.sh
  74   if [ `getDistrib` == "CentOS" ] && [ `getKernelVersion` < "2.6.34" ]
  75   then
  76         stdCompiler=c++98
  77   else
  78         stdCompiler=c++11
  79   fi
  80
  81
  82
  83 scriptDir=$PWD
  84 sourcesDir=$generationdir/thirdparty_sources
  85 binDir=$generationdir/thirdparty_bin
  86 #EED itkfile=InsightToolkit-3.20.0.patchCreatis.tar.gz
  87
  88 if [ ! -e $generationdir ]
  89 then
  90    mkdir -p $generationdir
  91    chown -R $loginUserName  $generationdir
  92    chgrp -R $loginGroupName $generationdir
  93
  94 fi
  95 if [ ! -e $sourcesDir ]
  96 then
  97    mkdir -p $sourcesDir
  98    #was : (pb on MacOS?)
  99    #chown -R $loginUserName:$loginGroupName $sourcesDir
 100    chown -R $loginUserName  $sourcesDir
 101    chgrp -R $loginGroupName $sourcesDir
 102 fi
 103
 104 if [ ! -e $binDir ]
 105 then
 106    mkdir -p $binDir
 107    chown -R $loginUserName  $binDir
 108    chgrp -R $loginGroupName $binDir
 109 fi
 110
 111   echo "we remove old stuff"
 112   if [ $ITKVersion = ITK3 ]
 113   then
 114      rm -rf $sourcesDir/InsightToolkit*
 115      rm -rf $binDir/InsightToolkit*
 116   else
 117      rm -rf $sourcesDir/ITK*
 118      rm -rf $binDir/ITKt*
 119   fi
 120   cd $sourcesDir
 121
 122  echo "we download new stuff"
 123 #  if [ $ITKVersion = ITK3 ]
 124 #  then
 125 #     # deal with ITK3
 126 #     #EED itkfile=InsightToolkit-3.20.0.patchCreatis.tar.gz
 127 #     #EED libname=InsightToolkit-3.20.0
 128 #
 129 #     #EED itkfile=InsightToolkit-3.20.1.tar.gz
 130 #     #EED libname=InsightToolkit-3.20.1
 131 #
 132 #     itkfile=InsightToolkit-3.20.1-patchCreatis.tgz
 133 #     libname=InsightToolkit-3.20.1-patchCreatis
 134 #
 135 #  else
 136 #    # deal with ITK4
 137 #    itkfile=InsightToolkit-4.13.1.zip
 138 #    libname=InsightToolkit-4.13.1
 139 #  fi
 140
 141     itkfile=InsightToolkit-5.0.1.zip
 142     libname=InsightToolkit-5.0.1
 143
 144
 145 ##  if [ $OperatingSystem = "MacOS" ]
 146 ##    then
 147 ##      curl -O http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/$itkfile
 148 ##  else
 149 ## ##EED19mai2015      wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/software/public/creatools/crea_ThirdParty_Libraries/source/$itkfile
 150 ##      wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/$itkfile
 151 ## ##  tar -xzvf $itkfile
 152 ##  fi
 153
 154   wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/$itkfile
 155   unzip  $itkfile
 156
 157
 158 #fi # JPR ------------1
 159
 160 #if [ $buildType = "Debug" ]
 161 #then
 162 #   debug="ON"
 163 #else
 164 #   debug="OFF"
 165 #fi
 166
 167 # the following stupid test is used at debug time; Please don't remove!
 168 #if [ true = false ]
 169 if [ true = true ]
 170 then
 171
 172   dirInstall=$binDir/$libname-Bin
 173   export ITK_DIR=$installPrefixThird/lib/InsightToolkit/
 174   mkdir -p $dirInstall
 175   cd $dirInstall
 176
 177   cmake -G"Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
 178   ##cmake -G"CodeBlocks - Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
 179   cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE:STRING=$buildType -D CMAKE_INSTALL_PREFIX:PATH=$installPrefixThird CMakeCache.txt
 180   cmake -D BUILD_SHARED_LIBS:BOOL=ON -D BUILD_EXAMPLES:BOOL=OFF -D BUILD_TESTING:BOOL=OFF CMakeCache.txt
 181 #  if [ $ITKVersion = ITK3 ]
 182 #  then
 183 #    cmake -D ITK_USE_REVIEW:BOOL=ON CMakeCache.txt
 184 #  fi
 185 #  if [ $ITKVersion = ITK4 ]
 186 #  then
 187 ###EED ITK4.0
 188 ##     cmake -D ITKV3_COMPATIBILITY:BOOL=ON -D ITKGroup_Nonunit:BOOL=ON -D  ITKGroup_IO:BOOL=ON  -D Module_ITK-Deprecated:BOOL=ON -D Module_ITK-Review:BOOL=ON  CMakeCache.txt
 189 #
 190 ###EED ITK4.12
 191 ## -D ITK_USE_SYSTEM_GDCM=ON
 192 #     cmake -D ITKV3_COMPATIBILITY:BOOL=ON -D Module_ITKReview:BOOL=ON  CMakeCache.txt
 193 #  fi
 194
 195    cmake -D Module_ITKReview:BOOL=ON  CMakeCache.txt
 196    cmake -D CMAKE_CXX_FLAGS:STRING=-std=${stdCompiler} CMakeCache.txt
 197
 198   #uncomment following line if you want to use the bleeding edge of GDCM2!
 199   #cmake -D ITK_USE_SYSTEM_GDCM:BOOL=ON CMakeCache.txt
 200   cmake CMakeCache.txt
 201   make -j $corenumber
 202   make -j $corenumber install
 203   cd ..
 204 fi