]> Creatis software - creaToolsTools.git/commitdiff
All Linux
authorEduardo DAVILA <eduardo.davila@creatis.insa-lyon.fr>
Mon, 15 Jun 2020 12:57:14 +0000 (14:57 +0200)
committerEduardo DAVILA <eduardo.davila@creatis.insa-lyon.fr>
Mon, 15 Jun 2020 12:57:14 +0000 (14:57 +0200)
Linux/scripts/CreaTools-configure.sh [new file with mode: 0644]
Linux/scripts/Install-Creatools-Bin.sh
Linux/scripts/Install-Creatools-Bin.sh-downloadTool [new file with mode: 0755]
Linux/scripts/Install-Creatools-Final_User.sh [new file with mode: 0755]
Linux/scripts/LocalFunctions.sh
Linux/scripts/TPLaux-bashrc.sh [new file with mode: 0644]
Linux/scripts/ThirdParty-install-Base-Stuff.sh

diff --git a/Linux/scripts/CreaTools-configure.sh b/Linux/scripts/CreaTools-configure.sh
new file mode 100644 (file)
index 0000000..1731f99
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,19 @@
+#!/bin/bash
+
+#File generated by 'installscript'
+#DO NOT edit !
+#(except if you *do* know what you do)
+
+OperatingSystem=Fedora
+corenumber=7
+generationdir=/home/davila/Creatis/C10
+installPrefix=/home/davila/Creatis/C10/ci
+installPrefixThird=/home/davila/Creatis/C10/tpli
+docgeneration=OFF
+sourcesFrom=GIT
+loginUserName=davila
+loginGroupName=davila
+buildType=Release
+gdcmVersion=GDCM1
+ITKVersion=ITK4
+ETC_BASHRC=/home/davila/.bashrc
index 968e26e5dd4cfbe542cc1079dc5393c74512776b..3150f01531df7c1fe27406c271a3d36f4c61c4a8 100755 (executable)
@@ -1,75 +1,3 @@
-# ---------------------------------------------------------------------
-#
-# Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image 
-#                        pour la Santé)
-# Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
-#
-#  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and 
-#  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use, 
-#  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B 
-#  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL 
-#  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html 
-#  or in the file LICENSE.txt.
-#
-#  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
-#  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
-#  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
-#  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
-#  liability. 
-#
-#  The fact that you are presently reading this means that you have had
-#  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
-# ------------------------------------------------------------------------  
-
-#!/bin/bash -e
-
-###########################################
-function getDistrib {
-    local OS=`uname`
-
-      if [ "$OS" == Darwin ] ; then OS=MacOS;
-##EED2016-10-15    
-##    elif [ "$OS" == Linux  ] ; then OS=$(lsb_release -i | awk '{print $3}')
-       elif [ "$OS" == Linux  ] ; then OS=`awk 'NR==1{print $1}' /etc/system-release`
-
-    else OS=""
-    fi
-# checkDistrib $OS
-    echo $OS
-}
-
-
-OperatingSystem=`getDistrib`
-
-  case "$OperatingSystem" in
-  Mandriva)
-     echo Root password:
-     su -c "urpmi aria2"
-         downloadCommand=aria2c 
-     ;;
-  Fedora)
-       ARIA2EXIST=$(rpm -qa | grep aria2 | wc -l)      
-       if [ "$ARIA2EXIST" -eq '1' ]; then 
-       echo Root password:
-       su -c "dnf install aria2 -y"
-       fi
-       downloadCommand=aria2c
-    ;;
-  Ubuntu)
-     echo Root password:
-     su -c "apt-get --yes install wget"
-         downloadCommand=wget 
-     ;;
-  MacOS)
-     port install curl -y
-         downloadCommand=curl 
-     ;;
-  *)
-     echo " '$OperatingSystem' : Unknown (for us...) Operating Sytem "
-     echo " Allowed values are (right now) Fedora, Ubuntu, MacOS "
-//     exit 0
-     ;;
-  esac
 
 CREATOOLSBINDIR=Creatools-Bin
 rm -rf $CREATOOLSBINDIR
diff --git a/Linux/scripts/Install-Creatools-Bin.sh-downloadTool b/Linux/scripts/Install-Creatools-Bin.sh-downloadTool
new file mode 100755 (executable)
index 0000000..368357c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,95 @@
+# ---------------------------------------------------------------------
+#
+# Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image 
+#                        pour la Santé)
+# Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
+#
+#  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and 
+#  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use, 
+#  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B 
+#  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL 
+#  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html 
+#  or in the file LICENSE.txt.
+#
+#  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
+#  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
+#  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
+#  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
+#  liability. 
+#
+#  The fact that you are presently reading this means that you have had
+#  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
+# ------------------------------------------------------------------------  
+
+#!/bin/bash -e
+
+###########################################
+function getDistrib {
+    local OS=`uname`
+
+       if [ "$OS" == Darwin ] ; then OS=MacOS;
+##EED2016-10-15    
+##    elif [ "$OS" == Linux  ] ; then OS=$(lsb_release -i | awk '{print $3}')
+       elif [ "$OS" == Linux  ] ; then 
+               OS=`awk 'NR==1{print $1}' /etc/system-release`
+               if [ "$OS" == "" ] ; then 
+                       OS=$(lsb_release -i | awk '{print $3}')
+               fi
+    else OS=""
+    fi
+# checkDistrib $OS
+    echo $OS
+}
+
+
+OperatingSystem=`getDistrib`
+
+echo 
+echo
+echo $OperatingSystem
+echo
+  case "$OperatingSystem" in
+  Mandriva)
+       ARIA2EXIST=$(rpm -qa | grep aria2 | wc -l)      
+       if [ "$ARIA2EXIST" = "0" ]; then 
+            echo "Install aria2 (download tool) Root password:"
+            su -c "urpmi aria2"
+       fi
+       downloadCommand=aria2c 
+    ;;
+  Fedora)
+       ARIA2EXIST=$(rpm -qa | grep aria2 | wc -l)      
+       if [ "$ARIA2EXIST" = "0" ]; then 
+        echo "Install aria2 (download tool) Root password:"
+       su -c "dnf install aria2 -y"
+       fi
+       downloadCommand=aria2c
+    ;;
+  Debian)
+       WGETEXIST=$(dpkg -l | grep wget | wc -l)        
+       if [ "$WGETEXIST" = "0" ]; then 
+        echo "Install wget (download tool) Root password:"
+       su -c "apt-get --yes  install wget "
+       fi
+       downloadCommand=wget
+    ;;
+  Ubuntu)
+       WGETEXIST=$(dpkg -l | grep wget | wc -l)        
+       if [ "$WGETEXIST" = "0" ]; then 
+       echo "Install wget (download tool) Root password:"
+       su -c "apt-get --yes install wget"
+       fi
+         downloadCommand=wget 
+     ;;
+  MacOS)
+     port install curl -y
+         downloadCommand=curl 
+     ;;
+  *)
+     echo " '$OperatingSystem' : Unknown (for us...) Operating Sytem "
+     echo " Allowed values are (right now) Fedora, Ubuntu, MacOS "
+//     exit 0
+     ;;
+  esac
+
+
diff --git a/Linux/scripts/Install-Creatools-Final_User.sh b/Linux/scripts/Install-Creatools-Final_User.sh
new file mode 100755 (executable)
index 0000000..3c54457
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+
+CREATOOLSBINDIR=Creatools-Bin
+rm -rf $CREATOOLSBINDIR
+mkdir $CREATOOLSBINDIR
+cd $CREATOOLSBINDIR
+$downloadCommand http://www.creatis.insa-lyon.fr/software/public/creatools/creaTools/creatools-Linux-Bin.sh
+source creatools-Linux-Bin.sh  Final_User
+cd ..
+
+
index 662fbae0d65c126df57ced28728e28c141813ad4..ecc8a8cee852aca26c0a972997c2824bee41d1bc 100644 (file)
@@ -51,7 +51,7 @@ function bigDisplay {
 ###########################################
 function checkDistrib {
     local OS=$1
-    if [ "`checkVal $OS MacOS Fedora Ubuntu Mandriva CentOS`" == "false" ] ; then
+    if [ "`checkVal $OS MacOS Fedora Ubuntu Mandriva CentOS Debian`" == "false" ] ; then
         echo "Operating System not supported: $OS"
         echo "Currently supported system: Fedora Ubuntu MacOS"
         exit 1
@@ -84,6 +84,7 @@ function getDistribVersion {
     elif [ "$DISTRIB" == Fedora  ] ; then OSVersion=`awk 'NR==1{print $3}' /etc/system-release`
     elif [ "$DISTRIB" == Ubuntu  ] ; then OSVersion=`awk 'NR==1{print $2}' /etc/issue`
     elif [ "$DISTRIB" == CentOS  ] ; then OSVersion=`awk 'NR==1{print $3}' /etc/issue`
+    elif [ "$DISTRIB" == Debian  ] ; then OSVersion=`awk 'NR==1{print $3}' /etc/issue`
     else OSVersion="VOID_EED"
     fi
     echo $OSVersion
@@ -97,6 +98,7 @@ function getKernelVersion {
     elif [ "$DISTRIB" == Fedora  ] ; then KernelVersion=$(uname -a | awk '{print $3}')
     elif [ "$DISTRIB" == Ubuntu  ] ; then KernelVersion=$(uname -a | awk '{print $3}')
     elif [ "$DISTRIB" == CentOS  ] ; then KernelVersion=$(uname -a | awk '{print $3}')
+    elif [ "$DISTRIB" == Debian  ] ; then KernelVersion=$(uname -a | awk '{print $3}')
     else KernelVersion="VOID_EED"
     fi
     echo $KernelVersion
@@ -113,6 +115,7 @@ function getDownloadCommand {
     elif [ "$DISTRIB" == Fedora  ] ; then downloadCommand='aria2c -x 16'
     elif [ "$DISTRIB" == CentOs  ] ; then downloadCommand='aria2c -x 16'
     elif [ "$DISTRIB" == Ubuntu  ] ; then downloadCommand=wget
+    elif [ "$DISTRIB" == Debian  ] ; then downloadCommand=wget
     else downloadCommand="VOID_EED"
     fi
     echo $downloadCommand
diff --git a/Linux/scripts/TPLaux-bashrc.sh b/Linux/scripts/TPLaux-bashrc.sh
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7ac39b9
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,38 @@
+# ---------------------------------------------------------------------
+#
+# Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image 
+#                        pour la Santé)
+# Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
+#
+#  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and 
+#  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use, 
+#  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B 
+#  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL 
+#  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html 
+#  or in the file LICENSE.txt.
+#
+#  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
+#  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
+#  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
+#  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
+#  liability. 
+#
+#  The fact that you are presently reading this means that you have had
+#  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
+# ------------------------------------------------------------------------  
+
+
+#!/bin/bash
+
+echo "---TPLaux-bashrc.sh---"
+echo $ETC_BASHRC
+echo "installPrefixTPLaux: " $installPrefixTPLaux
+
+# Cleanning  line in .bashrc file
+sed -i -e '/.*installPrefixTPLaux*/ d' $ETC_BASHRC
+sed -i -e '/.*creatools_TPLaux_config.*/ d' $ETC_BASHRC
+
+echo "====================================================ETC_BASHRC "  $ETC_BASHRC 
+echo installPrefixTPLaux=$installPrefixTPLaux >> $ETC_BASHRC
+echo '[ -f "$installPrefixTPLaux/share/creatools/creatools_TPLaux_config.sh" ] &&  source $installPrefixTPLaux/share/creatools/creatools_TPLaux_config.sh $installPrefixTPLaux' >> $ETC_BASHRC 
+
index 7caf9ca714ec77f2d6b156441a88fd214833637d..4db306e46ed1a0a49e8f99a55d38228b42e036ac 100644 (file)
@@ -33,7 +33,7 @@ echo "OperatingSystem = $OperatingSystem"
        bash ThirdParty-install-Base-rpm.sh $OperatingSystem
     else 
         # must log as root
-        echo "Please enter the root passwd to add necessary packages:"; 
+        echo "Creatools need to install some RPM pakages. Please enter the root passwd :"; 
         if [ "Ubuntu" == $OperatingSystem ] ; then
            sudo bash ThirdParty-install-Base-rpm.sh $OperatingSystem
         elif [ "MacOS" == $OperatingSystem ] ; then