bbtk_creaVtk_PKG/src/bbcreaVtkReadMHDPlane.cxx

   1 //=====
   2 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
   3 //=====
   4 #include "bbcreaVtkReadMHDPlane.h"
   5 #include "bbcreaVtkPackage.h"
   6
   7 #include "stdio.h"
   8
   9 namespace bbcreaVtk
  10 {
  11
  12 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(creaVtk,ReadMHDPlane)
  13 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ReadMHDPlane,bbtk::AtomicBlackBox);
  14 //=====
  15 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  16 //=====
  17 void ReadMHDPlane::Process()
  18 {
  19
  20 // THE MAIN PROCESSING METHOD BODY
  21 //   Here we simply set the input 'In' value to the output 'Out'
  22 //   And print out the output value
  23 // INPUT/OUTPUT ACCESSORS ARE OF THE FORM :
  24 //    void bbSet{Input|Output}NAME(const TYPE&)
  25 //    const TYPE& bbGet{Input|Output}NAME() const
  26 //    Where :
  27 //    * NAME is the name of the input/output
  28 //      (the one provided in the attribute 'name' of the tag 'input')
  29 //    * TYPE is the C++ type of the input/output
  30 //      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
  31
  32 //    bbSetOutputOut( bbGetInputIn() );
  33 //    std::cout << "Output value = " <<bbGetOutputOut() << std::endl;
  34
  35
  36
  37
  38         long int newHeaderSize;
  39         std::string newFileName=bbGetInputFileName()+"-OneSlice";
  40
  41     int sx,sy;
  42     char mystring[250];
  43     char strTmp[20];
  44     FILE *ffOut = fopen(newFileName.c_str(),"w+");
  45     FILE *ffIn  = fopen(bbGetInputFileName().c_str(),"r+");
  46
  47     while(!feof(ffIn))
  48     {
  49         strcpy(mystring,"\n");
  50         fgets(mystring,250,ffIn);
  51         if (strncmp("NDims",mystring,5)==0) {strcpy(mystring,"NDims = 2\n");}
  52         if (strncmp("DimSize",mystring,6)==0)
  53         {
  54                 sscanf(mystring,"%s %s %d %d",strTmp, strTmp, &sx, &sy);
  55                 sprintf(mystring,"DimSize = %d %d\n",sx,sy);
  56                 newHeaderSize = sx*sy*bbGetInputSlice();
  57         }
  58         if (strncmp("ElementType = MET_USHORT",mystring,24)==0) { newHeaderSize=newHeaderSize*2; }
  59         if (strncmp("ElementType = MET_SHORT",mystring,23)==0) { newHeaderSize=newHeaderSize*2; }
  60         if (strncmp("ElementType = MET_FLOAT",mystring,23)==0) { newHeaderSize=newHeaderSize*2; }
  61         if (strncmp("Offset",mystring,6)==0) {strcpy(mystring,"Offset = 0 0 0\n");}
  62         if (strncmp("HeaderSize",mystring,10)==0) {strcpy(mystring,"");}
  63         if (strncmp("ElementDataFile",mystring,15)==0)
  64         {
  65                 fprintf(ffOut,"HeaderSize = %ld\n\n", newHeaderSize );
  66         }
  67         fprintf(ffOut,mystring);
  68     }
  69
  70 /*
  71    fprintf(ff,"ObjectType = Image\n");
  72    fprintf(ff,"NDims = 2\n");
  73    fprintf(ff,"BinaryData = True\n");
  74    fprintf(ff,"BinaryDataByteOrderMSB = False\n");
  75    fprintf(ff,"CompressedData = False\n");
  76    fprintf(ff,"TransformMatrix = 1 0 0 0 1 0 0 0 1\n");
  77    fprintf(ff,"CenterOfRotation = 0 0 0\n");
  78    fprintf(ff,"ElementSpacing = 0.7 0.7 0.7\n");
  79    fprintf(ff,"DimSize = 512 512\n");
  80    fprintf(ff,"AnatomicalOrientation = ???\n");
  81    fprintf(ff,"ElementType = MET_SHORT\n");
  82    fprintf(ff,"ElementNumberOfChannels = 1\n");
  83    fprintf(ff,"Offset = 0 0 0\n");
  84    fprintf(ff,"HeaderSize = %ld\n", newHeaderSize );
  85    fprintf(ff,"ElementDataFile = inspi1_ana.raw\n");
  86 */
  87
  88    fclose(ffIn);
  89    fclose(ffOut);
  90
  91
  92    vtkMetaImageReader * reader = vtkMetaImageReader::New();
  93    reader->SetFileName( newFileName.c_str() );
  94    reader->Update();
  95
  96    bbSetOutputOut( reader->GetOutput() );
  97
  98
  99 }
 100 //=====
 101 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 102 //=====
 103 void ReadMHDPlane::bbUserSetDefaultValues()
 104 {
 105
 106 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX
 107 //    Here we initialize the input 'In' to 0
 108    bbSetInputFileName("");
 109    bbSetInputSlice(0);
 110
 111 }
 112 //=====
 113 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 114 //=====
 115 void ReadMHDPlane::bbUserInitializeProcessing()
 116 {
 117
 118 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
 119 //    Here does nothing
 120 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
 121 //    if any
 122
 123
 124 }
 125 //=====
 126 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 127 //=====
 128 void ReadMHDPlane::bbUserFinalizeProcessing()
 129 {
 130
 131 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
 132 //    Here does nothing
 133 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
 134 //    if any
 135
 136 }
 137 }
 138 // EO namespace bbcreaVtk
 139
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