lib/creaVtk/creaVtkIma3DVector.cpp

   1 /*
   2 # ---------------------------------------------------------------------
   3 #
   4 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5 #                        pour la Sante)
   6 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9 #
  10 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15 #  or in the file LICENSE.txt.
  16 #
  17 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21 #  liability.
  22 #
  23 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25 # ------------------------------------------------------------------------
  26 */
  27
  28 #include "creaVtkIma3DVector.h"
  29
  30 creaVtkIma3DVector::creaVtkIma3DVector()
  31 {
  32 }
  33
  34 creaVtkIma3DVector::~creaVtkIma3DVector()
  35 {
  36 }
  37
  38 std::vector<vtkImageData*> creaVtkIma3DVector::Ima3DVectorM (int NbImagesPerRow, int NbImagesInMosaic, std::vector<vtkImageData*> bbGetInputIn)
  39 {
  40         int nbImagesPerRow =   NbImagesPerRow;
  41         int nbImagesInMosaic = NbImagesInMosaic;
  42
  43   if (nbImagesPerRow == 0 || nbImagesInMosaic == 0) {
  44                 std::cout << "Not possible" << std::endl;
  45         }
  46
  47         std::vector<vtkImageData*> imageIn = bbGetInputIn;
  48
  49         std::vector<vtkImageData*> mImageOut;
  50         for (int i = 0 ; i < (unsigned int)imageIn.size() ; i++) {
  51                         mImageOut.push_back( unMosaic(imageIn[i], NbImagesPerRow, NbImagesInMosaic) );
  52         }
  53
  54         return mImageOut;
  55 }
  56
  57 vtkImageData * creaVtkIma3DVector::unMosaic(vtkImageData *imageIn, int nbImagesPerRow, int numberOfImagesInMosaic)
  58 {
  59    int inputdims[3];
  60    int outputdims[3];
  61    imageIn->GetDimensions (inputdims);
  62    unsigned short *input = (unsigned short *)(imageIn->GetScalarPointer());
  63    imageIn->Update();
  64
  65    unsigned int div = (unsigned int)ceil(sqrt( (double)numberOfImagesInMosaic ) );
  66    outputdims[0] = inputdims[0] / div;
  67    outputdims[1] = inputdims[1] / div;
  68    outputdims[2] = numberOfImagesInMosaic;
  69
  70     vtkImageData *vtkImageOut;
  71     vtkImageOut = vtkImageData::New();
  72     vtkImageOut->SetDimensions( outputdims );
  73     vtkImageOut->SetExtent(0,outputdims[0]-1,0,outputdims[1]-1,0,outputdims[2]-1);
  74     vtkImageOut->SetWholeExtent(0,outputdims[0]-1,0,outputdims[1]-1,0,outputdims[2]-1);
  75     vtkImageOut->SetNumberOfScalarComponents(1);
  76 //vtkImageOut->SetSpacing( blabla );
  77     vtkImageOut->SetScalarType( VTK_UNSIGNED_SHORT );
  78     vtkImageOut->AllocateScalars();
  79     vtkImageOut->Update();
  80
  81     unsigned short *output =(unsigned short *)(vtkImageOut->GetScalarPointer());
  82
  83     unsigned short *dest = output;
  84     int dimXImageElem = outputdims[0];
  85     int dimYImageElem = outputdims[1];
  86     int lgrImage = dimXImageElem*dimYImageElem;
  87     int debImage;
  88     for (int i=0; i<numberOfImagesInMosaic; i++)
  89     {
  90        debImage=(i/nbImagesPerRow) * lgrImage*nbImagesPerRow + (i%nbImagesPerRow)*dimXImageElem;
  91        for(int j=0; j<dimYImageElem; j++)
  92        {
  93           memcpy(dest, input+debImage, dimXImageElem*sizeof(unsigned short));
  94           debImage += dimXImageElem*nbImagesPerRow;
  95           dest += dimXImageElem;
  96        }
  97     }
  98     return  vtkImageOut;
  99 }
 100
 101 //---------------------------------------------
 102 //Method template
 103 //---------------------------------------------
 104 /*
 105 void creaVtkIma3DVector::FunctionName(int& parameterA)
 106 {
 107   parameterA = 2 * parameterA;
 108   return;
 109 }
 110 */