lib/creaVtk/creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData.cpp

   1 /*
   2 # ---------------------------------------------------------------------
   3 #
   4 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5 #                        pour la Sante)
   6 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9 #
  10 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15 #  or in the file LICENSE.txt.
  16 #
  17 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21 #  liability.
  22 #
  23 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25 # ------------------------------------------------------------------------
  26 */
  27
  28 #include "creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData.h"
  29
  30 #define _USE_MATH_DEFINES // for C
  31 #include <math.h>
  32
  33 creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData()
  34 {
  35 }
  36
  37 creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::~creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData()
  38 {
  39 }
  40
  41 std::vector<vtkImageData*> creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::unMosaicVectorVtkImageData (std::vector<vtkImageData*> imageInput, std::vector<int> NbImagesInMosaicVector)
  42 {
  43         std::vector<int> nbImagesPerRow;
  44         std::vector<int> nbImagesInMosaic;
  45         double imagesInMosaic;
  46
  47         for(int i = 0; i < NbImagesInMosaicVector.size(); i++)
  48         {
  49                 imagesInMosaic = NbImagesInMosaicVector[i];
  50                 nbImagesPerRow.push_back( ceil(sqrt(imagesInMosaic)) );
  51                 nbImagesInMosaic.push_back(NbImagesInMosaicVector[i]);
  52         }
  53
  54         if(imageInput.size() != NbImagesInMosaicVector.size())
  55         {
  56                 for(int j = NbImagesInMosaicVector.size(); j < imageInput.size(); j++)
  57                 {
  58                         imagesInMosaic = NbImagesInMosaicVector[NbImagesInMosaicVector.size()-1];
  59                         nbImagesPerRow.push_back( ceil(sqrt(imagesInMosaic)) );
  60                         nbImagesInMosaic.push_back( NbImagesInMosaicVector[NbImagesInMosaicVector.size()-1] );
  61                 }
  62         }
  63
  64         if (nbImagesPerRow.size() == 0 || nbImagesInMosaic.size() == 0)
  65         {
  66                 std::cout << "VtkUnMosaicVectorVtkImageData ERROR: The number of Images by mosaic is not set " << std::endl;
  67         }
  68
  69         std::vector<vtkImageData*> imageIn = imageInput;
  70
  71         std::vector<vtkImageData*> mImageOut;
  72         for (int i = 0 ; i < (unsigned int)imageIn.size() ; i++) {
  73                         mImageOut.push_back( unMosaic(imageIn[i], nbImagesPerRow[i], nbImagesInMosaic[i]) );
  74         }
  75
  76         return mImageOut;
  77 }
  78
  79 vtkImageData * creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::unMosaic(vtkImageData *imageIn, int nbImagesPerRow, int numberOfImagesInMosaic)
  80 {
  81    int inputdims[3];
  82    int outputdims[3];
  83    imageIn->GetDimensions (inputdims);
  84    unsigned short *input = (unsigned short *)(imageIn->GetScalarPointer());
  85    imageIn->Update();
  86
  87    unsigned int div = (unsigned int)ceil(sqrt( (double)numberOfImagesInMosaic ) );
  88    outputdims[0] = inputdims[0] / div;
  89    outputdims[1] = inputdims[1] / div;
  90    outputdims[2] = numberOfImagesInMosaic;
  91
  92     vtkImageData *vtkImageOut;
  93     vtkImageOut = vtkImageData::New();
  94     vtkImageOut->SetDimensions( outputdims );
  95     vtkImageOut->SetExtent(0,outputdims[0]-1,0,outputdims[1]-1,0,outputdims[2]-1);
  96     vtkImageOut->SetWholeExtent(0,outputdims[0]-1,0,outputdims[1]-1,0,outputdims[2]-1);
  97     vtkImageOut->SetNumberOfScalarComponents(1);
  98 //vtkImageOut->SetSpacing( blabla );
  99     vtkImageOut->SetScalarType( VTK_UNSIGNED_SHORT );
 100     vtkImageOut->AllocateScalars();
 101     vtkImageOut->Update();
 102
 103     unsigned short *output =(unsigned short *)(vtkImageOut->GetScalarPointer());
 104
 105     unsigned short *dest = output;
 106     int dimXImageElem = outputdims[0];
 107     int dimYImageElem = outputdims[1];
 108     int lgrImage = dimXImageElem*dimYImageElem;
 109     int debImage;
 110     int i,j;
 111 //    for (i=0; i<numberOfImagesInMosaic; i++)
 112       for (i=numberOfImagesInMosaic-1; i>=0; i--)
 113     {
 114        debImage=(i/nbImagesPerRow) * lgrImage*nbImagesPerRow + (i%nbImagesPerRow)*dimXImageElem;
 115        for(j=0; j<dimYImageElem; j++)
 116 //       for(int j=dimYImageElem-1; j>=0; j--)
 117        {
 118           memcpy(dest, input+debImage, dimXImageElem*sizeof(unsigned short));
 119           debImage += dimXImageElem*nbImagesPerRow;
 120           dest += dimXImageElem;
 121        }
 122     }
 123     return  vtkImageOut;
 124 }
 125
 126 //---------------------------------------------
 127 //Method template
 128 //---------------------------------------------
 129 /*
 130 void creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::FunctionName(int& parameterA)
 131 {
 132   parameterA = 2 * parameterA;
 133   return;
 134 }
 135 */