lib/creaVtk/creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData.cpp

   1 /*
   2 # ---------------------------------------------------------------------
   3 #
   4 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5 #                        pour la Sante)
   6 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9 #
  10 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15 #  or in the file LICENSE.txt.
  16 #
  17 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21 #  liability.
  22 #
  23 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25 # ------------------------------------------------------------------------
  26 */
  27
  28 #include "creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData.h"
  29 #include <math.h>
  30 creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData()
  31 {
  32 }
  33
  34 creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::~creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData()
  35 {
  36 }
  37
  38 std::vector<vtkImageData*> creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::unMosaicVectorVtkImageData (std::vector<vtkImageData*> imageInput, std::vector<int> NbImagesInMosaicVector)
  39 {
  40         std::vector<int> nbImagesPerRow;
  41         std::vector<int> nbImagesInMosaic;
  42
  43         for(int i = 0; i < NbImagesInMosaicVector.size(); i++){
  44                 nbImagesInMosaic.push_back(NbImagesInMosaicVector[i]);
  45                 nbImagesPerRow.push_back( ceil(sqrt(NbImagesInMosaicVector[i])) );
  46         }
  47
  48         if(imageInput.size() != NbImagesInMosaicVector.size()){
  49                 for(int j = NbImagesInMosaicVector.size(); j < imageInput.size(); j++)  {
  50                         nbImagesInMosaic.push_back( NbImagesInMosaicVector[NbImagesInMosaicVector.size()-1] );
  51                         nbImagesPerRow.push_back( ceil(sqrt(NbImagesInMosaicVector[NbImagesInMosaicVector.size()-1])) );
  52                 }
  53         }
  54
  55         if (nbImagesPerRow.size() == 0 || nbImagesInMosaic.size() == 0)
  56         {
  57                 std::cout << "VtkUnMosaicVectorVtkImageData ERROR: The number of Images by mosaic is not set " << std::endl;
  58         }
  59
  60         std::vector<vtkImageData*> imageIn = imageInput;
  61
  62         std::vector<vtkImageData*> mImageOut;
  63         for (int i = 0 ; i < (unsigned int)imageIn.size() ; i++) {
  64                         mImageOut.push_back( unMosaic(imageIn[i], nbImagesPerRow[i], nbImagesInMosaic[i]) );
  65         }
  66
  67         return mImageOut;
  68 }
  69
  70 vtkImageData * creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::unMosaic(vtkImageData *imageIn, int nbImagesPerRow, int numberOfImagesInMosaic)
  71 {
  72    int inputdims[3];
  73    int outputdims[3];
  74    imageIn->GetDimensions (inputdims);
  75    unsigned short *input = (unsigned short *)(imageIn->GetScalarPointer());
  76    imageIn->Update();
  77
  78    unsigned int div = (unsigned int)ceil(sqrt( (double)numberOfImagesInMosaic ) );
  79    outputdims[0] = inputdims[0] / div;
  80    outputdims[1] = inputdims[1] / div;
  81    outputdims[2] = numberOfImagesInMosaic;
  82
  83     vtkImageData *vtkImageOut;
  84     vtkImageOut = vtkImageData::New();
  85     vtkImageOut->SetDimensions( outputdims );
  86     vtkImageOut->SetExtent(0,outputdims[0]-1,0,outputdims[1]-1,0,outputdims[2]-1);
  87     vtkImageOut->SetWholeExtent(0,outputdims[0]-1,0,outputdims[1]-1,0,outputdims[2]-1);
  88     vtkImageOut->SetNumberOfScalarComponents(1);
  89 //vtkImageOut->SetSpacing( blabla );
  90     vtkImageOut->SetScalarType( VTK_UNSIGNED_SHORT );
  91     vtkImageOut->AllocateScalars();
  92     vtkImageOut->Update();
  93
  94     unsigned short *output =(unsigned short *)(vtkImageOut->GetScalarPointer());
  95
  96     unsigned short *dest = output;
  97     int dimXImageElem = outputdims[0];
  98     int dimYImageElem = outputdims[1];
  99     int lgrImage = dimXImageElem*dimYImageElem;
 100     int debImage;
 101     int i,j;
 102 //    for (i=0; i<numberOfImagesInMosaic; i++)
 103       for (i=numberOfImagesInMosaic-1; i>=0; i--)
 104     {
 105        debImage=(i/nbImagesPerRow) * lgrImage*nbImagesPerRow + (i%nbImagesPerRow)*dimXImageElem;
 106        for(j=0; j<dimYImageElem; j++)
 107 //       for(int j=dimYImageElem-1; j>=0; j--)
 108        {
 109           memcpy(dest, input+debImage, dimXImageElem*sizeof(unsigned short));
 110           debImage += dimXImageElem*nbImagesPerRow;
 111           dest += dimXImageElem;
 112        }
 113     }
 114     return  vtkImageOut;
 115 }
 116
 117 //---------------------------------------------
 118 //Method template
 119 //---------------------------------------------
 120 /*
 121 void creaVtkUnMosaicVectorVtkImageData::FunctionName(int& parameterA)
 122 {
 123   parameterA = 2 * parameterA;
 124   return;
 125 }
 126 */