]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* Remove useless constructor of gdcm::Document
[gdcm.git] / ChangeLog
1 Mon Oct 18 10:27:49 2005 by regrain
2    * Remove useless constructor of gdcm::Document
3    * Remove useless parameter in the constructor of gdcm::ElementSet
4    * Split gdcmCommon to separate the System specifications to the gdcm
5      specifications
6
7 Mon Oct 18 10:27:49 2005 by regrain
8    * Minor coding-style clean up
9    * Replace the ContentEntry and its derived classes (BinEntry and ValEntry)
10      by the DataEntry. This unique entry considers all datas like binary datas.
11      Some methods are added to interpret - at fly - the binary datas.
12      Due to this important change, some methods of the DocEntrySet, concerning
13      the BinEntry and ValEntry classes, are erased ; and new methods for the
14      DataEntry class are created.
15      Some methods to set the ValEntry or the BinEntry are renamed to
16      correspond to the new DataEntry, like for example :
17       - SetValEntry -> SetEntryString
18       - SetBinEntry -> SetEntryBinArea
19      This change will remove all useless creation of the string when working
20      directly on values.
21
22 Thu Aug 25 16:59:49 2005 by jpr
23    gdcmBinEntry.cxx
24    Now Print displays the BinEntry Content (if it's printable, and loaded)
25    Usefull for a lot od Implicit VR 'Bin'Entry (if we knew there VR, they wouldn't
26    be Bin ...)
27    Appreciate the difference having a look at PrintFile result for
28    gdcmData/SIEMENS_MAGNETOM-12-MONO2-FileSeq0.dcm.
29
30 Thu Aug 25 16:55:47 2005 by jpr
31    gdcmUtil.cxx
32    Add methods to check the 'printability' of a bin area
33
34 Thu Aug 25 15:45:40 2005  by jpr
35   gdcmBinEntry.cxx 
36   According to Mathieu's suggestion, Print now display FL BinEntries in a human
37   readable form
38
39 Thu Aug 25 15:12:43 2005 by jpr
40    gdcmDocEntry.cxx
41    According to Mathieu's suggestion, *all* the elements 0x000
42    are now named 'Group Length' (even if they belong to a Shadow Group')
43
44 Wed Aug 24 14:09:13 2005 by jpr
45   gdcmDocEntry.cxx,h, gdcmDocEntrySet.cxx,h
46   Removal of QD patch for Private Sequence + Immplicit VR.
47    Add a clean solution (Backtracking if an Item Starter is found
48     out of any SQItem)
49
50 Tue Aug 23 14:57:49 2005 by jpr
51    gdcmDocument.cxx
52    Brutal patch, waiting till we find a clever way to guess
53    if a doc entry is a Sequence,
54         - when it's odd number
55                   - and the file is Implicit VR Transfert Syntax
56 It solves temporarily some Philips Medical Systems image problems
57
58 Mon Aug 22 18:17:54 200 by jpr
59    gdcmUtil.cxx
60    Save a *few* microseconds at run time : inline method Util::GetVersion()
61    ;-)
62
63 Tue Aug 23 14:58:49 2005 by jpr
64    gdcmSeqEntry.cxx, gdcmDocEntry.cxx
65    Improve 'Print' methods
66
67 Sat Aug 20 11:10:24 2005by jpr
68    TestWriteSimple.cxx
69    Use new style FileHelper contructor
70
71 Sat Aug 20 11:04:50 2005 by jpr
72    gdcmFileHelper.cxx
73    FileHelper::Initialize() doesn't call GrabInformationFromFile(),
74    in order not to do the job twice when using new style FileHelper Constructor.
75
76 Fri Aug 19 18:31:07 2005 by malaterre
77   gdcmCommon.h
78   ENH: Provide a GetVersion function, apparently need for python
79
80 Fri Aug 19 15:12:15 2005 by jpr
81    gdcmFileHelper.cxx
82    Initialize UserFunction pointer to 0, even for 'deprecated' form 
83         of constructor.
84
85 Sat Jul 30 20:27:00 2005 by jpr
86    gdcmFileHelper.cxx, gdcmPixelReadConvertor.cxx
87       User is now allowed to pass a Pointer to a function of his own
88       to allow modification of pixel order (i.e. : Mirror, TopDown, )
89       to gdcm::FileHeleper, using SetUserFunction(userSuppliedFunction)
90       described as : void userSuppliedFunction(uint8_t *im, gdcm::File *f);
91       NB : the "uint8_t *" type of first param is just for prototyping.
92         User will Cast it according what he founds with f->GetPixelType()
93         See ctkgdcmSerieViewer for an example
94
95 Sat Jul 30 20:13:24 2005 by jpr
96    gdcmSerieHelper.cxx
97    Add SerieHelper::IsCoherent() method to allow checking that the files with same
98    Serie UID have the same sizes and pixel type.
99         
100 Fri Jul 29 17:07:16 2005 by jpr
101    gdcmSerieHelper.cxx
102    User may now use
103       SetSortOrderToDirect() or SetSortOrderToReverse()
104    to choose the ways the File* will be sorted.
105
106 Thu Jul 21 06:55:50 2005 by jpr
107    AnonymizeDicomDir.cxx, AnomymizeNoLoad.cxx, PrintFile.cxx, PrintDicomDir.cxx
108    Unify user interface
109
110 Thu Jul 21 06:55:30 2005 by jpr
111    exSerieHelper.cxx
112    Add an example of use for SerieHelper
113
114 Thu Jul 21 07:00:15 2005 by jpr
115    gdcmSerieHelper.cxx
116    Extend 'Restriction' syntax :
117    void SerieHelper::AddRestriction(uint16_t group, uint16_t elem,
118                                     std::string const &value, int op)
119    op belongs to :
120    /// \brief comparaison operators
121    enum CompOperators {
122       GDCM_EQUAL = 0,
123       GDCM_DIFFERENT,
124       GDCM_GREATER,
125       GDCM_GREATEROREQUAL,
126       GDCM_LESS,
127       GDCM_LESSOREQUAL
128    };
129
130 Wed Jul 20 15:39:00 2005  by jpr
131    AnonymizeNoLoad.cxx
132    AnonymizeNoLoad user can now ask for anonymization of 'BinEntries'
133    (e.g. Private entries when the TS is Implict VR)
134    AnonymizeNoLoad filein=... rubout=0x0009-0x0001,0x0013-0x1100
135    Thx to Luca Picello for reporting pb and supplying data to fix the bug.
136
137 Wed Jul 20 16:49:41 2005 by jpr
138    gdcmFile.cxx
139    Use GDCM_LEGACY for DicomDir, as well
140
141 Wed Jul 20 15:31:01 2005 by jpr
142    gdcmFile.cxx
143    We can now anonymize 'BinEntries' as well
144
145 Wed Jul 20 15:29:42 2005 by jpr
146    gdcmArgMgr.cxx
147    Add ArgMgrGetXInt16Enum to decode from the command line pairs of unsigned int
148    16, written in hexadecimal.
149    (usefull to allow terminal user to pass the (private) elements he wants to
150    anonymize)
151
152 Tue Jul 19 17:25:53 2005  by jpr
153    gdcmFile.cxx
154    Add some comments on the 'Patient Position'
155
156 Tue Jul 19 11:04:58 2005 by jpr
157    gdcmSerieHelper.cxx
158    Add SerieHelper::AddGdcmFile(File *header) method.
159     * \brief add a gdcm::File to the first (and supposed to be unique) list
160     *        of the gdcm::SerieHelper.
161     * \warning : this method should be used by aware users only!
162     *            User is supposed to know the files he want to deal with
163     *           and consider them they belong to the same Serie
164     *           (even if their Serie UID is different)
165     *           user will probabely OrderFileList() this list (actually, ordering
166     *           user choosen gdm::File is the sole interest of this method)
167     *           Moreover, using vtkGdcmReader::SetCoherentFileList() will avoid
168     *           vtkGdcmReader parsing twice the same files.
169     *           *no* coherence check is performed, but those specified
170     *           by SerieHelper::AddRestriction()
171
172 Mon Jul 18 12:20:20 2005 by jpr
173    gdcmCommon.cxx
174    In order to prepare the future extension of SerieHelper::AddRestriction (key,
175    string, operator)
176    operator = { EQUAL, DIFFERENT, LESS, LESSOREQUAL, GREATER, GREATEROOREQUAL}
177    add method
178    bool Util::CompareDicomString(const std::string &s1, const char *s2, int op)
179
180 Sun Jul 17 06:27:49 2005 by jpr
181    gdcmSerieHelper.cxx
182    Use new style for Loading files
183
184 Tue Jul 12 19:08:12 2005 by jpr
185    gdcmCommon.cxx, gdcmSQItem.cxx
186    To speed up DicomDir, instead of copying -and removing the source afterwards-
187    each entry of the SQItem (found after gdcm::Document parsing) towards
188    the gdcm::Object  belonging to the gdcm::DicomDir, we just copy
189    the chained list itself.
190
191 Tue Jul 12 16:55:43 2005 by jpr
192    AnonymizeNoLoad.cxx
193    AnonymizeNoLoad has now one more option :
194    dirin=
195    to give the (single Patient) directory name whose content we want to anonymize.
196
197 Mon Jul 11 10:20:25 2005 by jpr
198    gdcmDicomDirStudy.cxx
199    Reorder methods
200
201 Fri Jul 8 21:07:12 2005 by jpr
202    gdcmDicomDir...
203    Add the VISIT object within DicomDir
204
205 Fri Jul 8 12:15:08 2005 by jpr
206    gdcmDicomDir...
207    Use new style for DicomDir loading
208
209 Fri Jul 8 16:36:48 2005 by jpr
210    gdcmFileHelper.cxx
211    To remain unimpared, gdcm::FileHelper class needs also its
212    void FileHelper::SetLoadMode(int loadMode)
213    void FileHelper::SetFileName(std::string const &fileName)
214    bool FileHelper::Load()
215
216 Thu Jul 7 19:31:53 2005 by jpr
217    Example/*.cxx
218    Begin of kosherization of Example
219    New 'gdcm2' style.
220
221 Thu Jul 7 18:37:40 2005 by jpr
222    gdcmDocument.cxx
223    On the way to gdcm2 ...
224    Now, the stand way to use a file is :
225    gdcm::File *f = new gdcm::File();
226    f->SetLoadMode ( user say here what he wants *not* to load );
227    f->SetFileName("myFile.gdcm");
228    f->Load();
229    Old styles are kept, not to break the C++ API.
230       - gdcm::File *f = new gdcm::File("myFile.gdcm");
231       - f->Load("myFile.gdcm");
232    Due to the syntaxic abilities of Python maybe some troubles will occur
233    (not sure ...)
234
235 Thu Jul 7 15:55:39 2005 by jpr
236   gdcmDocument.cxx
237   Comment out the time consuming, never used/useless
238   'Extended tag' stuff for Sequence embedded Entries
239
240 Thu Jul 7 15:11:38 2005 by jpr
241   gdcmDocument.cxx
242   Move code lines LTTG so save some CPU time.
243   (hope so)
244
245 Tue Jun 7 13:12:10 2005 CEST by jpr
246    Example/*.cxx
247    Use Argument Manager in 'utilities'
248
249 Thu Jul 7 12:12:32 2005 by jpr
250    gdcmFile.cxx
251    Due to something stupid in the gdcm::File constructor, the file was parsed 
252    twice when we used old style, e.g :
253    gdcm::File *f = new gdcm::File(fileName);
254    instead of new style, e.g. :
255    gdcm::File *f = new gdcm::File( );
256    f->SetLoadMode ( choose what you want *not* to load here );
257    f->Load( filename );
258
259 Wed Jul 6 11:53:43 2005 by jpr
260    TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx
261    Now TestAllReadCompareDicom.cxx TestReadWriteReadCompare.cxx accept a third
262    param, in order not to have to recompile to gdcm::Debug::DebugOn().
263
264 Wed Jul 6 17:18:42 2005 by jpr
265    gdcmDocument.cxx
266    According to Mathieu's requirement, Load twice the same file keeps the rseult of
267    the first Load (instead of doing it twice)
268
269 Wed Jul 6 11:25:12 2005 by jpr
270    gdcmDocument.cxx
271    - Clean out the Entries if a Document is parsed more than once
272    - Uncomment (usefull) warning messages
273
274 Wed Jul 6 10:42:33 2005 by jpr
275    gdcmDocument.cxx
276    - Comment out a for the moment too much verbose warning message.
277    - Delay some statement as late as possible, to save some CPU time when they're
278      useless
279   
280 Wed Jul 6 13:01:08 2005 by jpr
281    gdcmFile.cxx
282    Now gdcmFile::Load() returns false if file is not gdcm parsable
283    Only gdcmDocument::Load() did it, before.
284    Thx to Benoit for reporting bug
285
286 Sun Jul 3 14:42:04 2005 by jpr
287    gdcmDocument.cxx
288    Should avoid some troubles with 'no length' SQItems within 'true length'
289    Sequences.
290    Thx to Loic Boussel for providing data to fix the bug.
291
292 Sun Jul 3 14:42:04 2005 by jpr
293    gdcmDocument.cxx
294    Should avoid some troubles with 'no length' SQItems within 'true length'
295    Sequences.
296    Thx to Loic Boussel for providing data to fix the bug.
297
298 Sun Jul 3 14:47:23 2005 by jpr 
299    gdcmSQItem.cxx
300    Enh warning message
301
302 Fri Jul 1 13:25:51 2005 by jpr
303    gdcmPixelReadConvert.cxx
304    Initialize RLEInfo and JPEGInfo to 0 a avoid further problems
305    (e.g. PrintFile on a DICOMDIR document)
306
307 Thu Jun 30 16:49:02 2005 by jpr
308    gdcmFile.cxx
309    Enhance gdcm::File::IsReable() heuristics to be able to process some Loic
310    Boussel's Hall of Shame Dicom images
311
312 Wed Jun 29 17:58:33 2005 by jpr
313    gdcmDocument.cxx
314    Add the NO_SHADOWSEQ load mode
315
316 2005-06-26 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
317     * Quite a few new dictionaries were added in gdcm. The file:
318       gdcm/Dict/README should always explain were the info was found
319       (in case of double check). Also some dict are still only
320       express as 'template' (they contain 'xx'), therefore
321       a python script should be run first to generate a full dict.
322       In the longer term this python script should be replaced by
323       a cmake script.
324
325 2005-06-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
326    * dicomV3.dic is deprecated in favor of gdcm.dic
327      There is now a dictionary per family:
328      - dicomV3.dic -> DICOM V3
329      - Papyrus.dic -> Papyrus
330      - NIH.dic     -> tags that were never allowed in the main standard
331
332 Fri Jun 24 12:50:20 2005 CEST by jpr
333    gdcmFile.cxx
334    Pixel Spacing related problems : update comments.
335    Thx to D. Clunie for providing data to check the code
336
337 Fri Jun 24 12:55:58 2005 by jpr
338    Summer nights are really too hot to sleep.
339    Coding style : kosherization of all the 'if's (300 amongst 900 were haram)
340
341 Thu Jun 23 11:20:23 2005 by jpr
342    gdcmDocument.cxx
343    Extend warning message, for debugging purpose
344
345 Wed Jun 22 10:11:23 2005 by jpr
346    gdcmFile.cxx
347    Coding Style
348
349 Wed Jun 22 10:00:29 2005  by jpr
350    gdcmPixelReadConvert.cxx
351    Fix misstyping, while removing spurious \t characters
352
353 Wed Jun 22 09:52:32 2005 by jpr
354    gdcmPixelReadConvert.cxx
355    Some constructors (at least one ...) use BitsAllocated =! BitsStored for
356    negative Pixels.
357    That break at lot of viewers ...
358    We now *propagate the sign bit* upon the unused ones, better than masking them
359    out.
360    Thx to Luca Picello for profiding data to fix the bug
361
362 Wed Jun 22 09:53:52 2005 by jpr
363    gdcmFileHelper.cxx
364    gdcm images are now "GDCM 1.1" built.
365
366 Mon Jun 20 19:10:17 2005 by jpr
367    gdcmFileHelper.cxx
368    Avoid re writing Palette Color Lookup Table UID when Palette Color is removed
369
370 Mon Jun 20 17:58:53 2005 by jpr
371    gdcmDocument.cxx
372    Preventive bug fix for LUT Data.
373    I said : LUT Date, *not* Palette Color
374
375 Sun Jun 19 17:57:29 2005 by jpr
376    gdcmDocumentcxx
377    To avoid warnings at compile time
378
379 Fri Jun 17 14:27:52 2005 by jpr
380    gdcmRLEFrames.cxx
381    Try to solve RLE pb
382
383 Fri Jun 17 14:36:07 2005 by jpr
384    gdcmDocument.cxx
385    Add comments
386
387 Fri Jun 17 14:35:00 2005 by jpr
388    gdcmFileHelper.cxx
389    Add some accessors for debugging purpose
390
391 Tue Jun 14 15:56:41 2005 by jpr
392    gdcmPixelReadConvert.cxx
393    Now gdcm deals with 16 bits per pixel images with 16 bits Palette colors
394    (3 * 65536 short int ...)
395    Nice fat header.
396    "Segmented Palettes" pb still pending, but I never saw any viewer dealing with it.
397
398 Mon Jun 13 17:43:48 2005 by jpr
399    gdcmPixelReadConvert.cxx
400    Some more oddities dealt with.
401    Doesn't work yet with 65536 entries 16 Bits LUT (?!?), with 16 bits pixels.
402    Still looking for accurate info on the web about it
403
404 Fri Jun 10 16:05:38 2005 by jpr
405    gdcmDocument.cxx
406    Bug fix in Load method.
407    Thx to Benoit for providing fix.
408 2005-06-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
409    * src/gdcmUtil.cxx : change call to Util::Format to sprintf because of 
410      lantency with the Util::Format function
411
412 Tue Jun 7 15:48:35 2005 by jpr
413    gdcmUtil.cxx
414    The highy time consuming method GetMacAdress is now called just once
415
416 Tue Jun 7 11:58:29 2005 by jpr
417    gdcmDicomDirElement.cxx
418    Use TranslateToKey better than Format
419
420 Tue Jun 7 12:07:20 by jpr
421    gdcmDictEntry.cxx
422    Remove some spurious calls to Format
423    // according to 'Purify', TranslateToKey is one of the most
424    // time consuming methods.
425    // Let's try to shorten it !
426
427 Mon Jun 6 14:37:58 2005
428    class ArgMgr (for Arguments Manager) is designed for
429        command line arguments management
430        (to make programmer's live easier)
431        (could be used for any kind of 'command line program')
432
433 2005-06-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
434    * Adding users file in CVSROOT for mail blaming 
435
436 2005-06-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
437    * Adding potential support for JPEG-LS DICOM files.
438
439 Fri Jun 3 18:05:23 2005 by jpr
440    gdcmDocument.cxx
441    Fix VR processing, to be CP-288 conform.
442    Now we can parse any kind of DICOM SR.
443
444 Fri Jun 3 11:05:15 2005 by jpr
445    gdcmDocument.h
446    Doxygenation
447
448 Thu Jun 2 15:42:18 2005 by jpr
449   gdcmDocument.cxx
450    Add warning about Load Mode
451
452 Thu Jun 2 16:20:14 2005 by jpr
453    gdcmFile.cxx
454    Harden gdcm::File::IsReadable(), in order not to be confused any longer
455    by lost of Pixel Element
456
457 Fri May 27 12:51:00 2005 by jpr
458    gdcmFileHelper.cxx
459    To avoid pushing out twice the meta elements, wile trying to write 'ACR-NEMA-
460    style.
461    And avoid some memry leaks -hope so-
462
463 Wed May 25 14:54:17 2005 by jpr
464    gdcmDocument.cxx
465    Should avoid some memory leaks
466
467 2005-05-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
468    * Adding potential support for mpeg and jpeg2000 through two new lin
469     - JasPer for JPEG2000
470     - libmpeg2 from the MPEG consortium
471     Also adding intial work to use this lib.
472
473 Fri May 20 10:27:55 2005 by jpr
474    gdcmFileHelper.cxx
475    To avoid warning.
476    (this time, it's wasn't dangerous at run time)
477
478 Thu May 19 17:31:21 2005 by jpr
479    gdcmFileHelper.cxx
480    FIX possible troubles when checking
481      'Hight Bit Position' vs 'Bits Allocated' and 'Bits Stored'
482    Thx to Mathieu for reporting bug
483
484 Wed May 18 12:12:07 2005 by jpr
485    gdcmDocument.cxx
486    Fix : now dcm deals with 'No preamble', Big Endian Explicit VR group 0002.
487    Thx to Dennis Hu for providing a sample image to fix the bug.
488
489 Tue May 17 14:44:09 2005 by jpr
490    gdcmFile.cxx
491    ENH : According to David Clunie's advice, we check now 'Imager Pixel Spacing'
492       before 'Pixel Spacing', when we want to get X or Y Spacing.
493
494 Tue May 17 19:10:49 2005 by jpr
495    gdcmFileHelper.cxx
496    ENH : Now, FileHelper::CheckMandatoryElements() makes some consistency checking,
497          at LTTG (Least Time To Go)
498          around Bits Allocated, Bits Stored, High Bit Position,
499          to avoid unaware user to mess up the stuff.
500
501 Tue May 3 11:43:04 2005 by jpr
502    gdcmDicomDir.h, .cxx
503    Load returns now a bool (allow user not to call IsReadable() )
504
505 Tue May 3 11:51:06 2005by jpr
506    gdcmFileHelper.cxx
507    Now the gdcm::File remains unimpaired after writting, in any case
508
509 Fri Apr 29 17:10:55 2005by jpr
510    gdcmDocument.cxx
511    Don't abort the prog when File not open
512
513 Wed Apr 27 12:00:35 2005 by jpr
514    gdcmFile.cxx
515    Removal of now useless lut-related stuff
516
517 Wed Apr 27 11:52:27 2005 by jpr
518    gdcmFile.cxx
519    Pb of 'Bits Allocated = 12' is now dealt with in
520    FileHelper::CheckMandatoryElements, no longer in File::Write.
521    Thx to Mathieu for reporting bug.
522
523 2005-04-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
524    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : update the test printed results and
525      description.
526
527 Tue Apr 26 18:18:23 2005 by jpr
528    gdcmDocument.cxx
529    Should leave gdcm::Document constructor in a much quicker
530    and much cleaner way when anything wrong occurs.
531
532 Tue Apr 26 18:25:49 2005 by jpr
533    gdcmPixelReadConvert.cxx
534    Prepare MPEG Dicom encapsulated processing (within a loooong future)
535
536 Fri Apr 22 14:59:58 2005 by jpr
537    gdcmDocument.cxx
538    Modify Print() output
539
540 Fri Apr 22 15:37:57 2005  by jpr
541    gdcmTS.cxx
542    Prepare (future) MPEG integration
543
544 Thu Apr 21 09:40:00 2005 by jpr
545    gdcmTS.cxx
546    Taking into account Dicom MPEG
547
548 2005-04-20 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
549    * FIX : Numerical exception on borland (cannot divide by 0, doh !)
550          But this is a case where we should really signify the user there is
551          few chance the serie is really a serie...
552
553 2005-04-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
554    * FIX : on X, the python part is correctly installed. All files are
555      installed in gdcm sub-directory
556
557 Tue Apr 19 11:58:19 2005 by jpr
558    gdcmDocEntry
559    Should suppress some warnings from Borland compiler
560
561 2005-04-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
562    * Builder/ : add something to facilitate the RPM creation of gdcm
563
564 2005-04-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
565    * Fix gdcmDirList::IsDirectory. Apparently borland did not like the ending
566      '/'
567    * Also fix compilation on gcc 3.3.5 does not have ios::failure either ...
568
569 Thu Apr 14 16:26:19 2005 by jpr
570    gdcmDicomDir.h, .cxx
571    Now, user can ask gdcm::DicomDir to skip SeqEntries or shadow groups, when
572    possible :
573      // Old style (still available) :
574      dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);
575
576     // new style (user is allowed no to load Sequences an/or Shadow Groups)
577     dcmdir = new gdcm::DicomDir( );
578     dcmdir->SetParseDir(true);
579     dcmdir->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);
580     dcmdir->Load(dirName);
581
582 2005-04-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
583    * vtk/vtkGdcmWriter fix bug when writing spacing. The Y spacing comes first
584      then the X spacing.
585     * Fix compilation on gcc 2.96 (which does not have ios::failure)
586
587 Mon Apr 4 17:15:24 2005 by jpr
588    gdcmFileHelper.cxx
589    Fix stupid bug when writting ACR-NEMA image from 'ACR-LibIDO' one.
590
591 2005-04-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
592    * src/gdcmDictGroupName.[h|cxx] : add a correlation between a group (number)
593      and it's representation name (for the NIH)
594
595 2005-03-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
596    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : problems of around of double to uint8, when
597      conversion of YBR to RGB pixels. So, now, the conversion is made using 
598      integers only
599
600 2005-03-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
601    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : now use test files (invented file
602      format) to replace 'at-run' dicom files generated by the 
603      TestAllReadCompareDicom test
604
605 Tue Mar 22 12:29:37 2005 by jpr
606    gdcmDocument.cxx
607    * FIX : element 0x0000 of shadow groups is now force to a ValEntry, 
608      and it's VR is forced to UL
609    * ENH : user id now allowed to tell he doesn't want to deal with Sequences
610       and/or with Shadow groups
611       use SetLoadMode (NO_SEQ | NO-SHADOW);
612
613 Tue Mar 22 12:40:13 2005 by jpr
614    gdcmFileHelper.cxx
615    *FIX Restore pushed out elements
616
617 Fri Mar 11 12:08:31 2005 by jpr
618    gdcmDocEntry.cxx
619    Remove spurious #define MAX_SIZE_PRINT_ELEMENT_VALUE
620
621 Fri Mar 11 12:12:13 2005 by jpr
622    gdcmFile.cxx
623    Final removal of gdcmFileHelper::InitializeDefaultFile();
624
625 Wed Mar 9 20:29:38 2005 by jpr
626    gdcmDicomDir.h, .cxx
627    Add Anonymize method (not yet fully checked)
628
629 2005-03-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
630    * src/gdcmFileHelper.cxx : remove memory leaks and bugs when writing files
631
632 Wed Mar 2 18:18:32 2005by jpr
633    gdcmFile.cxx
634    Fix gdcm::FileHelper::CheckMandatoryElements() to take into account David
635    Clunie's remarks.
636
637 2005-02-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
638    * src/gdcmFileHelper.cxx : JPR bad personal choices fix
639
640 Mon Feb 21 18:45:41 2005 by jpr
641    gdcmFileHelper.cxx
642    * Replace method CheckMetaElements by CheckManadatoryElements
643      To deal with the pb of UID's, and with Type 1 an Type 2 Entries
644      (probabely some stuff still missing)
645    * We shall have to decide the way we proceed to allow user 'freeze' Serie UID
646       between a given call and the next one (to add images to a Serie he just
647       created)
648   * We shall have to decide the way we proceed to allow user 'freeze' Study UID
649       between a given call and the next one, or to reuse an already existing
650       Study UID (i he wants to add his own Series to an already existing Study)
651
652 Thu Feb 17 17:18:33 2005 by jpr
653    gdcmFile.cxx
654    To avoid further pb, Initialize defaults now Photochromatic Interpretation to
655    MONOCHROME2 (low values = dark), better than MONOCHRONE1.
656    Thx to Benoit for reporting bug
657
658 Thu Feb 17 11:56:20 2005 by jpr
659    gdcmUtil.cxx
660    Prepare FileMetaInformationVersion (group 0002) management
661
662 Thu Feb 17 12:02:47 2005 by jpr
663    gdcmFile.cxx
664    Group 0002 management
665
666 Thu Feb 17 12:03:32 2005 by jpr
667    gdcmDocEntryArchive.cxx
668    Fix comments
669
670 Wed Feb 16 11:19:19 2005 CET by jpr
671    gdcmPixelReadConvert.cxx
672    Taking into account MONOCHROME1 + Signed Pixels (?!)
673
674 Tue Feb 15 19:12:34 2005  by jpr
675    gdcmFile.cxx
676    Taking into account the difference between MONOCHROME1 (low values = bright)
677    and MONOCHROME2 (low values = dark)
678
679 Mon Feb 14 11:45:04 2005by jpr
680    gdcmDocument.cxx
681    Remove some useless mask operations, to save CPU time
682
683 Mon Feb 14 15:51:10 2005 by jpr
684    gdcmUtil.cxx
685    *never* forget to re-compile just *before* committing!
686
687 Mon Feb 14 15:34:27 2005 by jpr
688    gdcmUtil.cxx
689    First commit on the post 1.0 (Version? / Tag? / Branch?) :
690    Fix Doxygen warnings
691
692 Mon Feb 14 11:45:47 2005 by jpr
693    gdcmValEntry.cxx
694    remove useless comments
695
696 2005-02-11 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
697    * Testing/TestMAkeIcon.cxx : complete the test
698
699 2005-02-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
700    * Testing/TestWriteSimple.cxx, TestSequence.cxx : fix memory leaks
701
702 Fri Feb 11 16:22:18 2005 by jpr
703    gdcmDocEntrySet.cxx
704    Typo, comments, doxygenation
705
706 Thu Feb 10 11:55:26 2005 by jpr
707    gdcmFile.cxx
708    AnonymizeNoLoad improvement
709
710 Thu Feb 10 10:07:19 2005 by jpr
711    gdcmFile.cxx
712    Duplicate Matthieu's hack to prevent bombing in Anonymize
713
714 Thu Feb 10 12:20:34 2005by jpr
715    gdcmDocEntrySrt.cxx
716    The following gdcm::DocEntrySet methods, no re-definable is child classes are no
717    longer virtual
718     virtual ValEntry *GetValEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
719     virtual BinEntry *GetBinEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
720     virtual SeqEntry *GetSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
721     virtual bool SetValEntry(std::string const &content,
722     virtual bool SetBinEntry(uint8_t *content, int lgth,
723     virtual bool SetValEntry(std::string const &content, ValEntry *entry);
724     virtual bool SetBinEntry(uint8_t *content, int lgth, BinEntry *entry);
725     virtual ValEntry *InsertValEntry(std::string const &value,
726     virtual BinEntry *InsertBinEntry(uint8_t *binArea, int lgth,
727     virtual SeqEntry *InsertSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
728
729 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
730    * src/gdcmFileHelper.[h|cxx] : now correctly set the VR of the datas when 
731      writting the file
732
733 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
734    * Test/VTKTestWriteSeq.cxx : add a VTK test to write sequences
735
736 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
737    * Test/ : accelerate tests (it's not very significant accelerations).
738      Remove TestCopyDicom that is redundant with TestCopyRescaleDicom
739
740 Mon Feb 7 15:48:34 2005 by jpr
741    gdcmDicomDir.h, .cxx
742    Add some commented out lines to prepare future version of 'Full DICOMDIR' stuff
743
744
745 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
746    * Testing/TestSequence.cxx : add test for sequences of images... test that
747      we have the same serie or the same study UID
748
749 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
750    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Now string are correctly converted in python
751      string type
752    * src/gdcmDict.h : remove commented code
753    * src/gdcmDocument.cxx : initialize values
754    * src/gdcmFile.cxx : bug fix when reading values
755    * gdcmPython/demo/ : change file names. Remove useless files
756
757 Sun Feb 6 15:31:09 2005 by jpr
758    gdcmDicomDirStudy.h
759    Update comments for DicomDir stuff
760
761 Sun Feb 6 15:39:35 2005 by jpr
762    gdcmDocument.cxx
763    * Add method File::AnonymizeNoLoad, to allow anomymizing files
764            even when the pixels are not gdcm Readable
765     * Add methods File::AddAnonymizeElement and File::ClearAnonymizeList
766             to allow user to choose the elements whose value
767             he wants to white out / replace
768
769 2005-02-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
770    * src/gdcmFile.cxx : remove the default array of initialization.
771      The static array contained pointers to non-static values (comming from
772      strings). To have coherences, when creating files, these values can't be
773      static. So, the array can't be static, too ! To simplify, the array have
774      been replaced by repeted lines to insert values in the File
775
776 Fri Feb 4 15:49:01 2005 by jpr
777    gdcmDocEntry.cxx
778    * Add GetFirstValEntry + GetNextValEntry, for Python users
779    * Some more Doxygenation + typo fixing
780
781 2005-02-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
782    * src/gdcmBinEntry.cxx : bug fix for BIG_ENDIAN part when writing the content
783    * gdcmPython/gdcm.i : rename gdcmHeader to gdcmHelper
784
785 Thu Feb 3 18:12:46 2005 by jpr
786    gdcmPixelReadConvert.cxx
787    Fix Doxygen warning
788
789 2005-02-02 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
790    * FIX SQItem::AddEntry inserts now *in the right place* any Entry
791               (Dicom Element) into the Sequence Item
792
793 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
794    * src/*.cxx : first parss to normalize file organisation
795
796 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
797    * src/gdcmDirList.[h|cxx] : add method to find a directory
798    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : bug fix under Windows
799
800 2005-01-31 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
801    * Finish cleaning up my JPEG mess. Should be ok now.
802    * Getting toward a RLE very similar to JPEG. Every RLE stuff is now self
803       contained within the RLE* class(doh!)
804
805 2005-01-30 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
806    * SerieHeader::SetDirectory() allow recursive exploration of the Directory
807    * SerieHeader::AddFileName() creates as many Coherent Files lists 
808              (same Serie UID) as it founds different Serie UID 
809               amongst the files instead of discarting any file 
810              that doesn't match with the first one he found.
811     * SerieHeader::OrderGdcmFileList has now one parameter : 
812                the Coherent Files list the user wants to sort
813    * SerieHeader::GetFirstCoherentFileList()  |
814    * SerieHeader::GetLastCoherentFileList()   | allow to parse 
815                the set of Coherent Files lists 
816    * const SerieHeader::GdcmFileList &GetGdcmFileList() is kept, for backwards
817                compatibility (it returns the *first* Coherent Files list, 
818                since there was only one before)
819    * Test/TestSerieHeader gets gdcmData as a default root directory
820   
821 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
822    * Remove friend between DocEntry and File classes
823    * Remove friend between PixelReadConverter and RLEFramesInfo, 
824      JPEGFragmentsInfo
825
826 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
827    * src/gdcmFile.cxx, gdcmDocument.cxx : fix the bug on the group|element
828      0002|0000. The value was incorrect.
829
830 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
831    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the gestion of UID
832
833 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
834    * src/gdcmUtil.cxx : compilation fix on Win32
835    * src/gdcmUtil.[h|cxx] : Set the default GDCM UID in a static constant
836      variable, to be easy found. Add methods to change the default UID.
837      Amelioration of the CreateUniqueUID to use the correct default UID.
838    * src/gdcmFile.cxx : correct use of the CreateUniqueUID method to create
839      a new file
840
841 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
842    * Test/TestVR.cxx : fix memory leaks
843
844 2005-01-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
845    * Rewrite the base 256 to base 10 conversion, using string operation only.
846      This allows us to get rid of the problematic 64bits integer type (does not
847      always exist on target platform).
848
849 2005-01-27 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
850    * Add construct and destructor to class gdcm::Debug to close the debug file
851           automatically
852    * Don't let uset to open twice the same file
853    * gdcm has now an official UID prefix,
854           supplied by http://www.medicalconnections.co.uk
855           1.2.826.0.1.3680043.2.1143
856           (Thx to Mathieu for providing URL)
857    * Add a forty-entries private Dicom Dictionary (Philips MR Intera)
858          to be able to perform some more tests
859    * gdcm::ContentEntry : Contructors and Destructor are now protected,
860          in order to be sure no user will try to use them.
861          (at user level, only the children classes are meaningfull)
862
863 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
864    * move RLEInfo & JPEGInfo from Document to File
865
866 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
867    * FIX : remove so many friend between classes
868
869 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
870    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : Bug fix when getting the value
871    * src/gdcmContentEntry.[h|cxx], gdcmValEntry.cxx : amelioration of code
872
873 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
874    In order to avoid missbehaviour :
875    . gdcm::DocEntry is now specialized in
876      - gdcm::SeqEntry (Dicom Sequence) as opposed to :
877      - gdcm::ContentEntry (Dicom entry with a 'content')
878    . gdcm::ContentEntry is specialized in
879      - gdcm::ValEntry (Dicom entry with a std::string representable value, i.e.
880        characters value, or integers)
881      - gdcm::BinEntry (Dicom entry with a non strig representable value
882    (user hasn't any longer to thing about the precedence of his dynamic_casts)
883
884 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
885    * Test/VTKTest*.cxx : bug fix under linux
886
887 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
888    * src/ : rename some methods on Entry (SetXxx, InsertXxx) to have a better
889      use with python. Some methods are moved from Document to ElementSet or
890      DocEntrySet. The equivalent methods to ElementSet have been added to 
891      SQItem and are virtual in DocEntrySet. Methods that may have the same code
892      in SQItem and ElementSet is directly placed in DocEntrySet
893
894 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
895    * Test/VTKTest*.cxx : remove the show variable in each test method because
896      it's useless (the viewer variable replace this variable)
897
898 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
899    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix on potential memory leak
900    * src/gdcmSQItem.cxx : initialize the SQItemNumber value in the constructor
901    * src/gdcmSQItem.[h|cxx], gdcmElementSet.[h|cxx], gdcmDicomDir*.[h|cxx] : 
902      Add ClearXxx methods to remove all the content of the list or map
903    * gdcmDocEntrySet.h : add GetFirst/NextEntry in pure virtual
904
905 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
906    * methods ReplaceOrCreate renamed as Insert
907      (nobody will be any longer confused by 'CreateOrReplace')
908   
909 2005-01-24 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
910    * Grealty simplify the JPEg decompression, no need to differenciate based on 
911      the JPEG possible type (with/without fragment, with/without multiple frame). 
912      Everything is done throught the JPEG IO Suspension mechanism in IJG
913
914 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
915    * Stage 3 of normalization :
916      in order to avoid any missunderstanding while reading method names :
917      - All the methods xxxEntry now deal with dicom Entries
918      - Methods GetEntry splitted into
919         GetEntryValue
920         GetEntryBinArea
921      - Method SetEntry renamed as SetEntryValue
922      - Method SetEntryBinArea let as it was
923
924 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
925     - Add empty nutshell for JPEG-LS (JPG-LS in NOT jpeg 'lossless')
926     - Position correctly the entry points for JPEG2000 and JPEG-LS
927       (Now Fragments info is get from the file, even for JPEG2000 and JPEG-LS)
928
929 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
930    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDict.h : rename AddNewXxx methods to AddXxx.
931    * src/gdcmDict.h : rename GetDictEntry moethod to GetEntry, to be coherent 
932      with other method names
933    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Add the typemaps for the TagName type
934    * Test/TestDicomDirElement.cxx : add new test
935
936 2005-01-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
937    * Finish the CreateUniqueUID stuff. Seems to compiled/runs on every
938      plateforms ITK support. Had some troubles with uint64_t on Win32, go to
939      http://msdn.microsoft.com/library/default.asp?url=/library/en-us/vclang/html/_langref_data_type_ranges.asp
940      for more info. Basically you can not used 'unsigned' __int8 in an ostream.
941      So can't you use __int64 in ostream at all.
942
943 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
944    * bug fix for compilation on MSVC6
945    * gdcmPython/gdcm.i : rename of classes missed
946
947 2005-01-21 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
948    * Stage 2 of names normalization :
949      - A gdcm::Document is now either a gdcm::DicomDir or a gdcm::File
950        (easy to understand ...)
951      - gdcm::FileHelper replaces old class gdcm::File
952
953 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
954    * gdcmDicomDirElement.[h|cxx] : change the AddEntry method. Now, it gets a
955      type and not a string. So, there remove problems on the format of the
956      string.
957
958 2005-01-20 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
959    * Add Example/TestPapyrus.cxx
960      - reads a Papyrus file (gdcm::Header compliant),
961      - gets the pixels of all the images, using low level iterators
962      - writes an multiframes Dicom image.
963    (Just to show it's *possible* to do that)
964     Uses SQItems accessors (we could use it as a 'Test' program, to improve test
965     coverage ...)
966
967 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
968    * src/gdcmDicomDirObject.h : set the FillObject method in protected.
969      Thus, DicomDirXXX are created with a flad that indicates if the created
970      object is empty or not (when not empty, the DicomDirElement is used to
971      fill the object)
972
973 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
974    * src/gdcmDicomDir.cxx : simplify the NewPatient method, like made in
975      gdcm::DicomDirPatient, gdcm::DicomDirStudy, gdcm::DicomDirSerie
976
977 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
978    * src/gdcmSQItem[h|cxx] : rename some methods to have coherent names
979
980 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
981    * src/gdcmDicomDir*.[h|cxx] : rename methods to be logik in their name.
982      Remove all access to the hash-tables or lists in the objects.
983
984 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
985    * src/gdcmDebug.h : remove the Debug test in the gdcmErrorMacro
986    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : rename the Initialise method to Initialize, to
987      be complient with all the gdcm source code
988
989 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
990    * src/gdcmDocEntry.h : DocEntry is now secure. User can't change the
991      DictEntry or the VR.
992
993 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
994    * gdcmPython/ : change GDCM_DATA_PATH to GDCM_DATA_ROOT to be complient with
995      all in gdcm
996
997 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
998    * Test/ : rename VTK tests to have a best name for the tests
999    * gdcmPython/demo/*.py.in : Change the InitTraversal/GetNextEntry use to
1000      GetFirstEntry/GetNextEntry use
1001
1002 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1003    * In SerieHeader::ImagePositionPatientOrdering()
1004      // a Dicom 'Serie' may contain scout views
1005      // and images may have differents directions.
1006      // -> More than one may have the same 'pos'
1007      // Sorting has then NO meaning !
1008      Thx to Eduardo Davila for reporting bug.
1009
1010 2005-01-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1011    * Test/ShowDicom.cxx, ShowDicomSeq.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : change the
1012      test. Now it's on image content and not on the resulting visualisation...
1013      might solve the problem on linux when using the OpenGL drivers
1014
1015 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1016    * ENH for DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, 
1017              DicomDirSerie, DicomDirImage
1018              Dict, DictSet classes :
1019          -add method GetFirstEntry to replace call to InitTraversal+GetNextEntry
1020          -remove InitTraversal method.
1021    * UPD Test programs + Example programs
1022
1023 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1024    * remove useless and never updated keyword \ingroup         
1025    * Solve pb when structure (list, map, ...) is empty.
1026      Thx to Benoit for reporting bug
1027
1028 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1029    * Taking into account of 'Transfer Syntax' value
1030        (for 'true' Dicom V3 files, the 'ACR-NEMA' heuristics sometimes gives
1031          unaccurate result)
1032
1033 2005-01-17 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1034    * src/gdcmUtil.cxx : bug fix to find the Windows MAC address. Now, there
1035      is no memory access violation
1036    * gdcmPython/demo : add python demos using VTK
1037
1038 2005-01-16 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1039     * FIX 'Dictionnary' is now spelt 'Dictionary'
1040           'wether' is now spelt 'whether'
1041           'archieve' is now spelt 'archive'   ;-)
1042
1043 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1044     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
1045           related methods, in order not to expose internal mechanisms
1046         InitTraversal();
1047         GetNextEntry();
1048     * REM methods that exposed internal mechanisms :
1049         DicomDir::GetDicomDirPatients()
1050         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
1051         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
1052         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
1053     * UPD Test programs :
1054         makeDicomDir.cxx
1055         BuildUpDicomDir.cxx
1056         TestDicomDir.cxx
1057      * UPD Example program
1058         PrintDicomDir.cxx
1059     * ADD DictSet methods
1060         InitTraversal()
1061         GetNextEntry()
1062
1063 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1064    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
1065     reason to have to methods, moreover with the second taking the ostream as
1066     *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
1067
1068 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1069    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
1070     smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
1071     Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
1072     code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
1073     working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
1074     problematic GctestetIPAddress
1075
1076 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1077    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
1078      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
1079      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
1080      shared libs.
1081
1082 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1083    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
1084      sort DICOM files
1085
1086 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1087    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack
1088          for dealing with BIGENDIAN processors
1089          - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
1090          When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
1091          and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
1092          PixelWriteConvertor, and avoid modifying the Pixel Area.
1093          Note :
1094          Probabely, the same operation will have to be done when we want 
1095          to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
1096          and we are working on Little Endian Processor
1097                   
1098 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1099    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
1100      table.
1101    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
1102    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
1103      all the dict content.
1104    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
1105      print
1106    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
1107
1108 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1109    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
1110                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
1111
1112 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1113    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
1114    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
1115    * gdcmPython/demo/ : add a new test
1116
1117 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1118    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
1119    * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
1120    * enhancement of Example/PrintDicomDir
1121
1122 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1123    * Now, python test might work on systems
1124    * Add the PrintDicomDir test
1125
1126 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1127    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
1128            Explicit Big Endian Transfer Syntax files
1129           (group and elem not swaped)
1130    
1131 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1132    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
1133            Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
1134            begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
1135            To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
1136            Document::HandleOutOfGroup0002() method 
1137     * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
1138               (related pb not yet solved)
1139
1140 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1141    * Bug fix for the python part use
1142    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
1143
1144 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1145    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
1146
1147 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1148    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
1149      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
1150      the transfer syntax
1151
1152 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1153    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
1154    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
1155        to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
1156        and Transfer Syntax is Big Endian
1157        We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
1158     * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
1159     * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
1160
1161 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1162    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
1163    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
1164    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
1165    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
1166    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
1167    gdcm::Global would destroy at exit).
1168
1169 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1170    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
1171     environment. static const string in a header file used to be ill
1172     initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
1173     issue.
1174
1175 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1176    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
1177       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
1178       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
1179       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
1180          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
1181
1182 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1183    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
1184      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
1185      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
1186      redirected to a file (ofstream).
1187    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
1188      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
1189
1190 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1191    * Removal of useless and dangerous methods :
1192          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
1193          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
1194    * Removal of usless methods :
1195          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
1196    * Commenting out of probabely useless methods :
1197          Dict::GetDictEntryNames()
1198          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
1199          DictSet::GetPubDictEntryNames()
1200          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()         
1201    * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used    
1202    * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version   
1203    * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
1204            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
1205            Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods           
1206    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
1207            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
1208                       Unused till now...           
1209    * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
1210            should be used to write a method to replace the former
1211            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
1212
1213 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1214    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
1215      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
1216      data in the DocEntry structure
1217
1218 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1219    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
1220      And now use a static function call instead, with a global variable. i
1221      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
1222      and easier to use...hopefully
1223
1224 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1225    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
1226
1227 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1228    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
1229
1230 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1231    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
1232      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
1233
1234 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1235    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
1236    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
1237      a file
1238    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
1239      when specifying the VR
1240    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
1241    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
1242
1243 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1244    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
1245           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
1246    * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
1247    * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
1248            in order to allow further VR modification by user
1249    * REM : removal of once-called method File::WriteBase   
1250            integration of its code in formerly one-line method File::Write
1251
1252 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1253    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
1254      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
1255    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
1256      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
1257      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
1258    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
1259
1260 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1261    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
1262      empty Print Method
1263    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
1264
1265 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1266    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
1267    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
1268    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
1269    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
1270    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
1271
1272 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1273    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
1274      problems when compiling with the python wrapping
1275
1276 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1277    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
1278      writting in ImplicitVR
1279
1280 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
1281    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
1282      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
1283      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
1284      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
1285
1286 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1287    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
1288      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
1289
1290 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1291    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
1292      Rename Decompressed to Raw
1293    * Use the API changes in gdcm::File.
1294    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
1295      Memory leaks fixed
1296
1297 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1298    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
1299      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
1300      of Frames' field
1301
1302 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1303    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
1304    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
1305
1306 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1307    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
1308      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
1309      solve it.
1310
1311 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1312    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
1313      DocEntry. Now use methods of the Document !
1314
1315 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1316    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
1317  
1318 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1319    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
1320    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
1321    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
1322    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
1323      test to 0.0
1324    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
1325    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
1326      containing found sequences
1327
1328 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1329    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
1330      not at all time
1331    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
1332      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
1333               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
1334      and tests are now made on good variables
1335
1336 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1337    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
1338    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
1339      length
1340    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
1341    * Add vtkGdcmWriter example and test
1342
1343 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1344    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
1345    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
1346    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
1347      SetValue
1348    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
1349    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
1350
1351 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1352    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
1353    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
1354
1355 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1356    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
1357      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
1358      file isn't readable. 
1359
1360 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1361    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
1362    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
1363    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
1364    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
1365      method that is redondant with AddEntry.
1366    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
1367      SQItem
1368
1369 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1370    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
1371    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
1372    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
1373
1374 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1375    * Huge cleanup:
1376      - Remove printf / sprintf
1377      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
1378      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
1379        source
1380      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
1381        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
1382      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
1383        (plus it is not up to date)
1384      - remove 'using namespace std' this is BAD !
1385
1386 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1387    * Remove memory leaks on the DicomDir
1388    * Remove some useless data in DicomDirObject
1389    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
1390
1391 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1392    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
1393
1394 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1395    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
1396      future, with convertion)
1397    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
1398      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
1399      from the output of the class
1400
1401 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1402    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
1403
1404 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1405    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
1406      and vtkErrorMacro use.
1407    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
1408
1409 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1410    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
1411      file name in input
1412    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
1413    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
1414      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
1415      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
1416      immediately after thee instruction.
1417    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
1418      file has been opened : the test must be made on the content of the 
1419      pointer and not directly on the pointer !
1420      Code formatting
1421
1422 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1423    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
1424      the python part recompiles
1425
1426 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1427    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
1428      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
1429      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
1430      all linux)
1431
1432 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1433    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
1434      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
1435      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
1436      screen resolution, it's produce errors).
1437      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
1438    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
1439    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
1440      under windows at compilation
1441    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
1442      for grayscale images
1443    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
1444
1445 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1446    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
1447    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
1448      tests on the image size X, Y, Z
1449
1450 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1451    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
1452    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
1453      between the class name and the file name
1454
1455 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1456    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
1457      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
1458      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
1459      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
1460      this variable content.
1461
1462 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1463    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
1464      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
1465      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
1466      DocEntryArchive
1467    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
1468      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
1469      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
1470    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
1471      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
1472
1473 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1474    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
1475
1476 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1477    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
1478    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
1479      the header.
1480    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
1481      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
1482      write
1483    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
1484      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
1485      is now on RGB data (as before my last commit
1486    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
1487
1488 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1489    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
1490      Add a print information of the type of the entry
1491    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
1492      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
1493    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
1494      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
1495    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
1496      any.
1497    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
1498
1499 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1500    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
1501      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
1502      opened or not.
1503
1504 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1505    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
1506      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
1507    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
1508      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
1509      DocEntryArchive
1510    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
1511      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
1512    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
1513      - test the pixels written
1514      - add test points to quickly find where is the error
1515      - can set a file name input and output in arguments
1516    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
1517      amelioration of the test output
1518
1519 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1520    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
1521      all replaced DocEntry's
1522    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
1523      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
1524      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
1525      header initial state.
1526
1527 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1528    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
1529
1530 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1531    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
1532      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
1533      then, it musn't change in the time.
1534    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
1535      header correctly. At this time, the change is only made for the first
1536      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
1537      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
1538      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
1539      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
1540    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
1541    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
1542      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
1543      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
1544
1545 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1546    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
1547    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
1548
1549 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1550    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
1551      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
1552      is copied).
1553    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
1554      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
1555    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
1556
1557 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1558    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
1559      Two problems appear when doing it :
1560       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
1561         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
1562         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
1563         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
1564         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
1565         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
1566         the gdcmBinEntry.
1567       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
1568         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
1569         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
1570         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
1571         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
1572    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
1573
1574 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1575    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
1576    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
1577      squeeze method
1578
1579 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1580    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
1581    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
1582      after it have been deleted
1583
1584 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1585    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
1586    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
1587    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
1588      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
1589      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
1590
1591 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1592     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
1593     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
1594     3. Use const ref when possible
1595     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
1596     5. A few more comments
1597     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
1598
1599 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1600   * ENH: Slightly bigger patch:
1601     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
1602     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
1603     3. File was not close properly in gdcmDict
1604     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
1605     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
1606     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
1607     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
1608     8. Do not repeat virtual in subclasses
1609     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
1610
1611 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1612   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
1613     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
1614     of a null character as defined by standard
1615   
1616 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1617   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
1618     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
1619
1620 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1621   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
1622   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
1623     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
1624
1625 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1626   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
1627     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
1628     a verbose message is generated.
1629     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
1630     correctly close is a call to CloseFile.
1631     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
1632   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
1633     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
1634     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
1635     header. A verbose is generated if these two size mismatch
1636
1637 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1638   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
1639     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
1640     break under windows (with msvc6 compilation).
1641
1642 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1643   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
1644     compiling with MSVC6)
1645
1646 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1647   * Bugs fix for the Windows build with VC6
1648   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
1649     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
1650     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
1651     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
1652   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
1653     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
1654     gdcm.i file)
1655   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
1656     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
1657     std::cerr of vtk.
1658
1659 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1660   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
1661   * gdcmPython/gdcm.i:
1662     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
1663     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
1664       NOT need to be wrapped anymore.
1665   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
1666     DicomDir::Method) new example added.
1667
1668 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1669   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
1670     A DicomString can contain as many \0 as they want
1671     and it is *always* of even length.
1672     We only support odd length for very rare case. 
1673     And in the near future this should be removed.
1674
1675 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1676   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
1677     little endian. This should -heopfully- fix some tests
1678
1679 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1680   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
1681     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
1682     the one comiled into lib
1683
1684 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1685   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
1686     This should definitely solve any leak problem, and we should be
1687     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
1688
1689 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1690   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
1691   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
1692   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
1693   
1694 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1695   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
1696   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
1697     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
1698   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
1699   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
1700     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
1701     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
1702       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
1703       no longer exists.
1704
1705 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1706   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
1707    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
1708    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
1709    the class.
1710   
1711 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1712   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
1713     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
1714     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
1715
1716 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1717   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
1718   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
1719     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
1720     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
1721     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
1722       CloseFile() anymore.
1723     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
1724       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
1725       into File::Pixel_Data.
1726
1727 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1728   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
1729     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
1730   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
1731     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
1732     method:
1733     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
1734     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
1735       method to those classes.
1736     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
1737       -- Added a ::Print() method.
1738       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
1739       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
1740          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
1741
1742 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1743   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
1744     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
1745     doxygen.
1746   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
1747   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
1748     pointlessly wrapped (see
1749     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
1750   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
1751     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
1752     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
1753     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
1754     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1755       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
1756            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
1757       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
1758          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
1759
1760 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1761   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
1762     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
1763
1764 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1765   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
1766     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
1767     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
1768   * TODO added new entry.
1769   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
1770     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1771     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
1772     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
1773       variable names for semantical coherence.
1774
1775 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1776   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
1777   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
1778   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
1779   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
1780   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
1781   compilation time jpeg option.
1782
1783 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1784   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
1785     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
1786     reproduce at home.
1787   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
1788   Thanks dcmtk crew !
1789
1790 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1791   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
1792   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
1793     matters, as stated in warning note at beginning of %include section).
1794   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
1795   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
1796   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
1797   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
1798     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
1799     from File:: to PixelConvert::.
1800
1801 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1802   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
1803     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1804      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
1805      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
1806
1807 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1808   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
1809   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
1810   like this:
1811     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
1812   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
1813   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
1814   the standard namespace (like LP, Unknown ...)
1815
1816 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1817   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
1818     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
1819     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
1820     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
1821     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
1822       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
1823       (for the time being this is better than having them attach to
1824        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
1825     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
1826       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
1827     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
1828       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
1829       gdcmPixelConvert::
1830
1831 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1832   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
1833   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
1834     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
1835       clean up of RLE related code. 
1836   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
1837     - src/gdcmRLE.cxx removed
1838     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
1839     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
1840     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
1841   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
1842     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
1843       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
1844       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
1845
1846 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1847   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
1848     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
1849       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
1850       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
1851       time ago, EXCEPT I forgot the OW case...
1852       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
1853       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
1854       offsets.
1855   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
1856     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
1857         with the retired Parse7Fe0().
1858     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
1859     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
1860
1861 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1862   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
1863     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
1864     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
1865     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
1866   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
1867     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
1868       to return an unused length.
1869
1870 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1871   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
1872     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
1873     to use to do simple stuff.
1874
1875 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1876   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
1877     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
1878     copying of the file within different directory, configure header file to
1879     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
1880     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
1881
1882 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1883   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
1884      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
1885        with it's binary name).
1886      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
1887        the Website to be more complete.
1888      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
1889        doxygenated documentation.
1890      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
1891        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
1892                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
1893   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
1894   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
1895    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1896
1897 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1898   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
1899    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1900
1901 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1902   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
1903     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
1904     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
1905     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
1906     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
1907   * GDCMHOME clean up:
1908     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
1909       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
1910       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
1911   * Autotools clean up:
1912     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
1913     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
1914
1915 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1916   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
1917   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
1918   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
1919
1920 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1921   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
1922     describing TODO entries and used it for new entries.
1923   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
1924     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
1925     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
1926   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
1927     documentation itself, but the website) moved to html and
1928     placed in directory Doc/Website:
1929     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
1930     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
1931     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
1932   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
1933   * CMakeLists.txt changed accordingly.
1934   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
1935     DeveloppersPython.html
1936   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
1937
1938 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1939   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
1940     of gdcm Web site.
1941
1942 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
1943   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
1944     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
1945     we can now delete[] it safely 
1946   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
1947     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
1948   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
1949
1950 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1951   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
1952     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
1953     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
1954     pointed content.
1955
1956 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1957   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
1958   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
1959
1960 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1961   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
1962     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
1963     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
1964     an example of usage.
1965     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
1966       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
1967     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
1968       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
1969     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
1970     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
1971     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
1972
1973 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1974   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
1975     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
1976     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
1977     in class 
1978     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
1979       and associated accessors. Doxygenation of the class.
1980     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
1981       accessors added.
1982     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
1983       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
1984     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
1985     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
1986
1987 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1988   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
1989     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
1990       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
1991            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
1992            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
1993            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
1994            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
1995            the same group and element all share the same (group, element)
1996            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
1997            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
1998            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
1999            consider the following definition of a TagKey:
2000            - let Group, Element be the string representation of the
2001              group and element dicom tag members,
2002            - let ItemNumber be the string representation of the integer
2003              index of the considered item number of a sequence,
2004            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
2005            the form:
2006               /ItemNumber#Group|Element
2007            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
2008            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
2009               Group|Element<SeqTag>
2010            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
2011            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
2012            string e.g.
2013                0028|1201
2014            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
2015            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
2016            string e.g.
2017                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
2018     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
2019       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
2020       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
2021     - src/gdcmDocEntry.cxx:
2022       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
2023          Key member.
2024       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
2025     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
2026     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
2027       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
2028       -- now has a new BaseTagKey member.
2029       -- STYLE.
2030   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
2031     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
2032     truly belongs.
2033     This poses the problem with the semantics of the following lines
2034        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
2035        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
2036        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
2037     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
2038     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
2039     order to get things working the dicom dictionary was altered !
2040     Please fix things urgently...
2041   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
2042     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
2043     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
2044     set to OW:
2045       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
2046       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
2047       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
2048   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
2049     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
2050   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
2051
2052 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2053   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
2054
2055 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2056   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
2057     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
2058   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
2059   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
2060
2061 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2062   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
2063     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
2064   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
2065     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
2066   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
2067     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
2068   * TODO updated
2069   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
2070     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
2071   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
2072   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
2073     exception_on_error parameter.
2074     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
2075     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
2076     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
2077
2078 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2079   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
2080   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
2081     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
2082   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
2083   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
2084   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
2085     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
2086   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
2087
2088 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2089   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
2090     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
2091
2092 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
2093   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
2094        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
2095  
2096 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
2097   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
2098         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
2099
2100 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2101    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
2102    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
2103      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
2104      is now in static in the gdcmDebug class
2105    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
2106    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
2107
2108 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2109    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
2110      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
2111    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
2112      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
2113      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
2114      that displays position and size).
2115    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
2116      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
2117      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
2118      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
2119      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
2120      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
2121      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
2122         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
2123      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
2124      commiting changes).
2125    * Test/CMakeLists.txt:
2126       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
2127       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
2128         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
2129         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
2130    * TODO updated.
2131
2132 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2133    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
2134      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
2135      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
2136      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
2137      - removal of typedef duplication.
2138      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
2139      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
2140    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
2141       - printf polluting ctest removed.
2142       - TAB removal for comminting
2143    * Test:
2144      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
2145        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
2146        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
2147        this test creates them.
2148        Note: we need to validate each reference image, but before that
2149              I'd like to rename them with a more explicit name...
2150      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
2151    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
2152      including each header needed).
2153
2154 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2155    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
2156      test suite to the Example directory. Are concerned:
2157      - PrintHeader.cxx
2158      - TestDcm2Acr.cxx
2159      - TestFindTags.cxx
2160      - TestWrite.cxx was
2161      - TestWriteSimple.cxx
2162    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
2163      image gdcmData/oldACR00001.ima
2164
2165 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2166    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
2167      with removal from gdcmData):
2168       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
2169       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
2170       - US.3405.1.dcm
2171      Added the following because after last cvs update, they cause
2172        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
2173      to segfault:
2174       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
2175       - oldACR00001.ima
2176    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
2177      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
2178      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
2179      form of test...
2180    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
2181      we don't need to black list the following images anymore:
2182       - 8BitsUncompressedColor.dcm
2183       - OT-PAL-8-face.dcm
2184       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
2185    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
2186      fixes and the beautified code ;-)
2187      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
2188      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
2189      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
2190            improve the test suite). The bug could be detected by using
2191            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
2192            or by using
2193            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
2194            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
2195
2196 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
2197    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
2198          - replace by uggly but working old code :-(
2199    A lot of things should be OK again.
2200    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
2201    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
2202    (twice, withing a fortnigh ...)    
2203
2204 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2205    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
2206      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
2207    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
2208      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
2209      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
2210                    - OT-PAL-8-face.dcm
2211                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
2212    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
2213      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
2214      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
2215      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
2216      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
2217      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
2218      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
2219      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
2220      image.
2221    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
2222      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
2223      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
2224      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
2225    
2226 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
2227   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
2228   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
2229                           (instead of infinite loop)
2230   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
2231
2232 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2233    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
2234
2235 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
2236    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
2237            when SamplesPerPixel =3
2238          - now Write is no longer confused by 
2239           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
2240          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
2241                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
2242    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
2243            (in order to split the job that has not to be done 
2244            for gdcmDicomDir)
2245
2246 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2247    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
2248      loop on the same image until memory went out. 
2249      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
2250    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
2251      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
2252
2253 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
2254    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
2255             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
2256             is added a the end, when necessary.
2257             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
2258               now written correctly
2259             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
2260               (even for odd groups) 
2261         Note : only Explicit Value Representation was checked.
2262                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
2263
2264 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2265    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
2266    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
2267      coding style).
2268
2269 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2270    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
2271      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
2272    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
2273
2274 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
2275    FIX : gdcmDocument.cxx
2276       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
2277         code 'beautyfication' :-(
2278       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
2279
2280 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
2281    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
2282             : to allow user to create his own Sequences
2283    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
2284
2285    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
2286
2287    - gdcmBinEntry
2288      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
2289   
2290    - gdcmDocEntry
2291      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
2292      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
2293   
2294    - gdcmDocEntrySet
2295      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
2296      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
2297      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
2298      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
2299      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);            
2300      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
2301                                             guint16 element,
2302                                             std::string vr     = "unkn",
2303                                             std::string fourth = "unkn",
2304                                             std::string name   = "unkn"); 
2305      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
2306      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
2307      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
2308      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
2309      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
2310      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
2311      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
2312      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
2313   
2314    - gdcmDocument
2315      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
2316      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
2317      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
2318      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
2319      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
2320                                         FILE *_fp, FileType type);
2321      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
2322      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
2323      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
2324      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
2325      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
2326      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
2327      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
2328      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
2329                                             guint16 element,
2330                                             std::string vr     = "unkn",
2331                                             std::string fourth = "unkn",
2332                                             std::string name   = "unkn");
2333      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
2334      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
2335      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
2336      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
2337                                              
2338    - gdcmElementSet
2339      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
2340      
2341    - gdcmSeqEntry
2342      ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
2343  
2344    - gdcmSQItem
2345      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
2346      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);         
2347      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
2348      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
2349
2350    - gdcmValEntry
2351     ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
2352               
2353 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2354     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
2355       The default constructor invoked by the line
2356          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
2357       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
2358       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
2359       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
2360     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
2361       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
2362       Could anyone explain why ?
2363     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
2364       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
2365       code related to gdcmBinEntry).
2366
2367 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2368     * In order to fix memory leaks:
2369      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
2370        some delete calls.
2371      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
2372      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
2373        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
2374        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
2375        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
2376      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
2377      - src/gdcmDocument.cxx:
2378        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
2379           from dynamic stores.
2380        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
2381           was causing memory leaks.
2382      - src/gdcmSQItem.cxx:
2383        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
2384           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
2385        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
2386           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
2387           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
2388           This avoids SegFaulting.
2389      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
2390     * Conclusion:
2391      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
2392        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
2393        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
2394      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
2395        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
2396      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
2397        segfaults).
2398     * Erroneous leading white fix:
2399      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
2400        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
2401      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
2402      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
2403     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
2404     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
2405
2406
2407 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2408     * In order to fix writing of dicom files:
2409      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
2410      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
2411      - src/gdcmDocument.cxx:
2412        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
2413        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
2414        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
2415           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
2416           manner.
2417        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
2418           to only declared) and build on top of
2419           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
2420        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
2421      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
2422        for usage in destructor and treatement of promotion in
2423        ::ReplaceOrCreateByNumber().
2424      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
2425       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
2426     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
2427       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
2428       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
2429       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
2430
2431 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2432     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
2433       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
2434       learned that:
2435           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
2436           soon as possible by globally disabling memory caching.
2437           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
2438           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
2439       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
2440       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
2441       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
2442     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
2443       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
2444       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
2445       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
2446         with 1.
2447       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
2448       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
2449       understand why the list is empty...).
2450     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
2451     * Doc/License.txt added.
2452
2453 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2454     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
2455       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
2456         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
2457         the padding problem.
2458       - general clean up, simplification, and coding style.
2459       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
2460     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
2461
2462 2004-06-14 Jean-Pierre Roux      
2463    *  gdcmSeqEntry.cxx
2464       - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
2465       - fix the display of SQItem ordinal number
2466       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
2467       - remove some useless never written private methods   
2468       
2469 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
2470    * gdcmBinEntry.cxx 
2471       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
2472       - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
2473          a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
2474          a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
2475    * dcmDocument.cxx
2476       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
2477          according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
2478       - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
2479       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
2480    * gdcmFile.cxx
2481       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
2482    * gdcmSQItem.h
2483       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
2484             a (relative) Item identier inside a given Sequence
2485             \warning : some pb remaining around this number
2486             will be solved asap
2487       - AddEntry now takes the Item Number as a param    
2488    * gdcmValEntry.cxx 
2489       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param   
2490
2491 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2492     * Memory leak hunt with the following command:
2493       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2494                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
2495       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
2496       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
2497       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
2498           grep "MEMORY LEAK" src/*
2499       Here are two typical examples which I can't help fixing:
2500       -----
2501           #include <string>
2502           int main() {
2503              std::string name;
2504              char * test = "babo";
2505              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
2506                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
2507              name.clear();   //// Doesn't help !
2508              return 0;
2509           }
2510       -----
2511           #include <string>
2512           #include <iostream>
2513           int main() {
2514              std::string line;
2515              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
2516              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
2517                                         //// of 1320 bytes in call to
2518                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
2519             return 0;
2520           }
2521       -----
2522
2523
2524 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2525     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
2526       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
2527         and related, moved away to gdcmDocument.
2528       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
2529         the corresponding protected accessors of inherited class
2530         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
2531         declared friend of class gdcmDocument (see below).
2532       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
2533       - Clean up of undefined or unused methods.
2534     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
2535       account the changes to gdcmHeader.h).
2536     * src/gdcmDocument.h:
2537       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
2538         changes to gdcmHeader.h).
2539       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
2540         (see changes to gdcmHeader.h).
2541       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
2542       - Clean up of undefined or unused methods.
2543     * src/gdcmDocument.cxx:
2544       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
2545       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
2546       - some std::string properly set to VRKey
2547     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
2548       references to gdcmDocument. 
2549     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
2550     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
2551       cvs repository gdcmData.
2552
2553 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2554     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
2555     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
2556       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
2557     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
2558     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
2559       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
2560     * src/gdcmDocument.cxx: 
2561       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
2562         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
2563       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
2564         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
2565         removed. Reverting to previous code segment with the proper
2566         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
2567         Note: this was (partially) breaking the python test suite
2568               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
2569               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
2570     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
2571     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
2572       now taken into account.
2573     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
2574       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
2575     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
2576       on posix.
2577     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
2578       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
2579     * .... alas, the python testSuite is still broken.
2580
2581 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2582     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
2583       gdcmGlob
2584     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
2585     * src/gdcmUtil.h : export methods
2586
2587 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2588     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
2589       to right behavior
2590     * Initial addition of automatic python testing
2591     * Initial addition of automatic image comparison
2592
2593 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2594     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
2595       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
2596
2597 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2598      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
2599      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
2600      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
2601
2602 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
2603      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
2604        new concepts (and new classes) :
2605        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
2606         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
2607         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
2608        a Sequence is composed of Items.
2609        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
2610        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
2611        (never taken into account)
2612        Our unability to add a new 'entry' in the header
2613        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
2614        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
2615        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
2616        nothing is finished.
2617        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
2618
2619 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2620      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
2621      
2622 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2623      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
2624        file prefix (SetFilePrefix)
2625
2626 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2627      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
2628        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
2629        baseline.
2630      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
2631        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
2632
2633 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2634      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
2635        dicom image
2636
2637 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2638      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
2639      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
2640        between the developper and user version.
2641      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
2642      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
2643
2644 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2645      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
2646        when using cmake.
2647
2648 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2649      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
2650                src directory, now generated in the build dir.
2651             2. Tests as mentionned smarter
2652             3. Some clean up
2653             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
2654           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
2655           where we could set the institution name / patient name...
2656
2657        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
2658               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
2659                  (this was not true before)
2660
2661 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
2662      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
2663            SeQuence indented printing of Dicom Header.
2664      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
2665            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
2666       Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
2667      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
2668            tree-like structure of a Dicom Header.
2669      * FIX Test code cleaning     
2670            
2671 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2672      * ENH: Adding automatic testing
2673        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
2674        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
2675        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
2676        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
2677           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
2678           too many projects
2679      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
2680      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
2681        one file instead of seven + some small cleanup
2682
2683 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
2684      * ENH Minor changes to the Print() methods.
2685      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
2686            Header printing. Example given with :
2687       > PrintHeader fileName  2 new
2688           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
2689       
2690 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2691      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
2692          1. I have added some unsigned where needed
2693          2. Some function parameter not used -> (void)
2694          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
2695          4. g++ don't like character '\' in comment
2696          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
2697                     this really need to be fixed
2698          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
2699          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
2700                     this also really need to be fixed
2701          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
2702                     remove compression file 
2703                     (as we only do decompression, right ?)     
2704      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
2705
2706 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
2707      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
2708            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
2709            defaulted to yspacing
2710       
2711 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
2712      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
2713      * ENH add parameters :
2714                bool  exception_on_error = false, 
2715                bool  enable_sequences   = false,
2716           bool  ignore_shadow      = false
2717            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
2718      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
2719            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
2720          
2721 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
2722      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
2723      
2724 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
2725      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
2726      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
2727              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
2728         
2729 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
2730      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
2731          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
2732
2733 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2734      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
2735        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
2736        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
2737        in gdcmHeader.
2738      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
2739        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
2740        already does the job.
2741      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
2742        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
2743
2744 2004-03-30 Benoit Regrain
2745      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
2746        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
2747        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
2748
2749 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
2750      * ENH : Check on file type to be written moved
2751              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
2752      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
2753              when end-of-list is reached
2754       : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
2755
2756 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2757      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
2758      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
2759      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
2760        equivalent to ExplicitVR in existing code).
2761
2762 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2763      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
2764        now contains all the gdcmGlobal related code.
2765      * minor coding style and doxygenation changes.
2766
2767 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2768      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
2769        now contains all the Debug related code.
2770      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
2771      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
2772        CreateCleanString) removed.
2773      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
2774      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
2775      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
2776      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
2777        src/gdcmDirList.cxx)
2778
2779 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
2780      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
2781
2782 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
2783      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
2784            big endian made volumes
2785      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
2786            end user to instanciate class gdcmParser
2787           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
2788
2789 2004-03-22 Benoit Regrain
2790      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
2791      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
2792              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
2793
2794 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
2795      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
2796            an already existing DICOMDIR file is consistent with
2797            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
2798            or build from the files held (recursively) in a Directory
2799            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
2800            gdcmObject::SetBoundaries() added
2801
2802 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
2803      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
2804                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
2805      * FIX now file names and directory name are written properly in the
2806            DICOMDIR
2807      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
2808            about the name
2809
2810 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2811      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
2812                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
2813
2814 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
2815      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
2816            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
2817            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
2818            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
2819       to allow making gdcDicomDir object.
2820      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
2821           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
2822
2823 2004-02-11 Benoit Regrain
2824      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
2825              when using from python
2826              
2827 2004-02-10 Benoit Regrain
2828      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
2829      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
2830      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
2831              directory parsing
2832
2833 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
2834      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
2835              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
2836              - class gdcmMeta created
2837      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
2838              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
2839      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
2840
2841 2004-02-05 Benoit Regrain
2842      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
2843              header entries
2844      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
2845      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
2846
2847 2004-02-04 Benoit Regrain
2848      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
2849      * FIX : sort the images in the dicom dir
2850      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
2851      * ADD : a python demo
2852
2853 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
2854      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
2855      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
2856              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
2857              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
2858              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
2859      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
2860            to make full checking easier
2861         
2862 2004-02-04 Benoit Regrain
2863      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
2864      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
2865
2866 2004-02-03 Benoit Regrain
2867      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
2868      * gdcmDicomDir : add the load of directory
2869      * Bug fix and print add-on
2870
2871 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
2872      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
2873      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
2874      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
2875      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
2876            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
2877         
2878 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
2879      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
2880              iterator on last
2881              of the last synonym :-(
2882      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
2883              for DICOMDIR ;-)
2884      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
2885      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
2886      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
2887            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
2888       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
2889
2890 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
2891      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
2892            no longer writes 'Un' on disk
2893      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
2894      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
2895            the length (for Palette expanded images)
2896            and Raw Length (non expanded image + Palette)
2897      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
2898            (that broke Write). Replaced by UL.
2899            Aware user will reload the field if he 
2900            thinks it's necesssary
2901              
2902 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
2903      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
2904        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
2905        IsReadable() methods.
2906        
2907      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
2908       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
2909       but so usefull for people that miss them ;-)
2910       
2911      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
2912        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
2913
2914 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
2915      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
2916
2917 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
2918      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
2919              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
2920         The TRUE value for this param has to be used 
2921         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
2922         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
2923      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
2924              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
2925         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
2926         
2927      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
2928              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
2929              Fixed
2930
2931      * gdcmHeader add the method
2932              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
2933         to get *all* the Header Entries with the same tag.
2934         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
2935         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
2936
2937 2004-01-26 Benoit Regrain
2938      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
2939        in the print and add a third level of print to print them
2940
2941 2004-01-23 Benoit Regrain
2942      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
2943      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
2944      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
2945        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
2946
2947 2004-01-22 Benoit Regrain
2948      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
2949      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
2950
2951 2004-01-19 Benoit Regrain
2952      * Add the use of shadow dictionaries
2953      * bug fix and coding style
2954
2955 2004-01-19 Benoit Regrain
2956      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
2957      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
2958      * Add the update of header entries using the shadow library
2959
2960 2004-01-19 Benoit Regrain
2961      * removal of file gdcmHeader2.cxx
2962      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
2963        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
2964        of dicom dir parsing
2965      * bug fix under python
2966
2967 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
2968     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
2969     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
2970     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
2971     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
2972
2973 2004-01-15 Benoit Regrain
2974      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
2975        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
2976        when the gdcmDictSet will be destroyed
2977      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
2978        gdcmDictSet
2979
2980 2004-01-15 Benoit Regrain
2981      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
2982        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
2983        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
2984        some memory and vtk seems to have some problems with that.
2985      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
2986
2987 2004-01-14 Benoit Regrain
2988      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
2989      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
2990      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
2991      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
2992
2993 2004-01-13 Benoit Regrain
2994      * src/*.[h|cxx] : coding style
2995      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
2996
2997 2004-01-13 Benoit Regrain
2998      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
2999      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
3000        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
3001      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
3002
3003 2004-01-12 Benoit Regrain
3004      * src/*.h : add comments
3005      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
3006      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
3007        directly setted in the source code
3008      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
3009        gdcmTS and gdcmVR
3010
3011 2004-01-09 Benoit Regrain
3012      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
3013      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
3014
3015 2004-01-07 Benoit Regrain
3016      * Modification to compile with the distutils.
3017      * Bug fix in code
3018
3019 2003-12-10 Benoit Regrain
3020      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
3021        can use a gdcmHeaderHelper to load data
3022      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
3023        made in the source code
3024
3025 2003-12-10 Benoit Regrain
3026      * Update Windows projects and .cvsignore files
3027
3028 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
3029      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
3030            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
3031            if he wants to.
3032            gdcmElValSet:Print takes it into account
3033
3034 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3035      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
3036      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
3037      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
3038
3039 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
3040       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
3041              on the ListTag listElem member,
3042              not longer on the TagElValueHT tagHt member
3043       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
3044              with the tagHt member and the listElem member.
3045         (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
3046
3047       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
3048              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
3049                        if bug fixing is necessary), for internal
3050              use only
3051         UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
3052                        or to allow Parser going on.
3053         Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
3054         with a length (not 0000) is found
3055       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
3056            because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
3057       (to be written)
3058
3059 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
3060      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
3061      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
3062           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
3063      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
3064
3065 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3066      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
3067
3068 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3069      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
3070           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
3071
3072 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
3073      * in testSuite.py : new files names for checking the package
3074      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
3075              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
3076              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
3077
3078 2003-11-05 Benoit Regrain
3079      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
3080                        : Explicit error messages
3081      * in __init__.py  : Related modif
3082
3083 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
3084      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
3085            to be used by aware (vtk) users that want to manage
3086            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
3087      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
3088                     (vtkGdcmReader compliant)           
3089       
3090 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
3091      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
3092        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
3093        
3094 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
3095      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
3096            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
3097
3098 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
3099      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
3100                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
3101              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
3102              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
3103              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
3104              such an image :
3105              After gdcmHeader :
3106               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
3107               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
3108               GetImageDataRaw returns the gray Plane
3109      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
3110              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
3111
3112 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
3113      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
3114              
3115 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3116      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
3117       being coherents dicom files.
3118      
3119 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3120      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
3121            from medcon lib !
3122      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
3123      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
3124      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
3125      * ENH: Add include dir to medcon lib
3126      * FIX: only one function is being exported for now ! 
3127            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
3128             
3129 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
3130       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
3131         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
3132           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
3133       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
3134
3135 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
3136       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
3137         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
3138         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
3139       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
3140       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
3141
3142 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3143       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
3144                                                
3145 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3146       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
3147       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
3148       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
3149       
3150 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3151       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
3152       * ENH: Try adding a search script for python site-package
3153       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
3154       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
3155       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
3156       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
3157              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
3158         But it fasten debug compilation time.
3159             
3160 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
3161       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
3162         (they are compressed as 2 planes images, 
3163          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
3164
3165 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
3166       * Now CheckRead takes into account :
3167          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
3168          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
3169       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
3170        (breaks DicomWorks)
3171
3172 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3173       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
3174              one should remove the '\'
3175         
3176 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
3177       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
3178         (wrong lengths in header)
3179         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
3180       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
3181         (breaks DicomWorks)
3182
3183 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
3184       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
3185         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
3186
3187 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
3188       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
3189       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
3190
3191 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
3192       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
3193      
3194 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
3195       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
3196         (the patch is easy to remove)
3197       * cosmetic changes to avoid warnings
3198       
3199 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3200       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
3201         no need to press 'r' now.
3202    
3203 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
3204       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
3205         to new Jpeg Lossless decompressor
3206       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
3207       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
3208       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
3209                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
3210 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
3211       * general anonymisation in gdcmData
3212       * adding the 'color files' from
3213         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
3214       * adding some well knowed bugged-header images
3215       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
3216         waiting for their inclusion in Python testsuite
3217
3218 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
3219     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
3220       no longer seg faults when file is not found
3221
3222 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
3223      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
3224        MultiFrame images
3225
3226 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3227      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
3228
3229 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
3230      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
3231         OpenFile takes it into account
3232      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
3233      * Missing elements added in dicomV3.dic
3234       (just to be affraid : have a look at
3235        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
3236        and do it again next year ;->
3237
3238 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
3239      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
3240        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
3241        But there are NOT. It's fixed !
3242        
3243 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3244      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
3245      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
3246          
3247 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
3248      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
3249              an ACR-NEMA / DICOM one.
3250      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
3251              is not gdcm Readable
3252      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
3253              is now decoded.
3254         
3255 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3256      * FIX: CMake generate now documentation
3257      * ENH: out of source doc build !
3258      * ENH: Generate both user and dev documentation
3259      * ENH: Should work on windows too
3260      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
3261      * FIX: make install should be ok now on Unix plateform
3262      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
3263      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
3264                      
3265 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3266      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
3267      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
3268      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
3269         window level & window width
3270
3271 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3272      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
3273      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
3274      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
3275      
3276 2003-10-06  Emanuel Ollart
3277      * FIX : compilation process wad broken.
3278              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
3279         
3280 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3281      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
3282      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
3283      
3284 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
3285      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
3286            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
3287                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
3288       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
3289
3290 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3291       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
3292         to remain compliant with already defined strings, 
3293         like Transfert Syntax UID and others)
3294
3295 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3296       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
3297              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
3298         
3299 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3300       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
3301       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
3302
3303 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3304       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
3305         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
3306               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
3307       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
3308
3309 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3310       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
3311
3312 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3313       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
3314         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
3315
3316 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3317       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
3318          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
3319          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
3320          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
3321           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
3322                                        YBR_RCT files.
3323           (no sample found :-(
3324
3325 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3326       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
3327         Two reasons: - clear things
3328                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
3329                        suffer anymore VC++ complains
3330
3331 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3332       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
3333       * removed leaks
3334
3335 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
3336       * The lines are now eigthy characters long for 
3337         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
3338
3339 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3340       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
3341         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
3342         previous commis of Malaterre)
3343       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
3344         before the last Malaterre's commit.
3345
3346 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3347       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
3348         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
3349       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
3350         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
3351
3352 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3353       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
3354         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
3355         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
3356
3357 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3358       * Cosmetic changes:
3359         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
3360           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
3361           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
3362           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
3363         - PACKAGER corrected
3364         - DEVELOPPER added.
3365         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
3366       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
3367
3368 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3369       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
3370
3371 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3372       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
3373
3374 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3375       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
3376
3377 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3378       * Fix a few delete/delete[] mismatch
3379
3380 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3381       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
3382         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
3383         heuristics to get informations (look at different places).
3384       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
3385         sorting DICOM images based on different strategies.
3386       * modified Makefiles accordingly.
3387
3388 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3389       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
3390         when building in debug mode
3391       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
3392         src/win32/gdcmdll.dsp
3393       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
3394
3395 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3396       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
3397             to valgrind.
3398
3399 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3400       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
3401       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
3402                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
3403       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
3404
3405 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3406       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
3407         the file
3408       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
3409       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
3410         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
3411       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
3412         symbols... future problem ?
3413
3414 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3415       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
3416       * modified gdcm.dsw accordingly
3417
3418 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3419       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
3420
3421 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3422       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
3423         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
3424       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
3425         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
3426         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
3427
3428 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3429       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
3430
3431 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3432       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
3433       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
3434       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
3435       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
3436       * PACKAGER : adding all concerning windows
3437
3438 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3439       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
3440         garbage debug code.
3441       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
3442       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
3443         test suite reported error.
3444       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
3445         packaging a new release).
3446       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
3447       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
3448       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
3449         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
3450         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
3451
3452 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3453       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
3454       * src/gdcmHeader.h : formatting code
3455
3456 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3457       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
3458         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
3459         is made in an internal list to prevent this problem.
3460         Bug fix when output is empty.
3461         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
3462         correction.
3463       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
3464
3465 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3466       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
3467       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
3468         files. Added method to remove all files on the input
3469         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
3470         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
3471
3472 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3473       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
3474         when using make instal.
3475       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
3476         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
3477
3478 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3479       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
3480       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
3481
3482 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3483       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
3484         linux and WINDOWS !
3485       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
3486       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
3487
3488 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3489       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
3490         addon of the jpeg library)
3491       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
3492       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
3493       * INSTALL now points to web documentation
3494
3495 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3496       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
3497         gdcmUtil.h anymore.
3498       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
3499         clean target.
3500       * src/gdcm*.[cxx|h] :
3501         - to allow compilation with gcc 3.x
3502           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
3503           -- small fixes on exceptions.
3504           Note: linking not tested !
3505         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
3506           building stage.
3507       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
3508         dependent convertion).
3509
3510 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3511       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
3512         Changelog):
3513         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
3514         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
3515           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
3516         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
3517
3518 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3519       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
3520         compile
3521       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
3522         (FileName -> Filename)
3523
3524 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3525       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
3526         - UpdateProgress method should now be effective
3527         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
3528           to volumes),
3529         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
3530           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
3531           accelerating things).
3532         - when building a stack of images/volumes, files which are not
3533           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
3534           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
3535           in the stack (for the caller to notice the problem).
3536
3537 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3538       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
3539
3540 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3541       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
3542         between standard library (std) and vtk library (problems are found
3543         under Windows... thanks Windows !)
3544
3545 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3546       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
3547         debug stage).
3548       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
3549
3550 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3551       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
3552
3553 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3554       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
3555         called with different flags than the default ones (with automake).
3556         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
3557            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
3558         and went for warning fixes:
3559         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
3560           up from unused variables.
3561         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
3562       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
3563
3564 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3565       * gdcmPython/gdcm.i:
3566         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
3567           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
3568           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
3569         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
3570           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
3571           exported to Python a as cvar.
3572       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
3573         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
3574         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
3575         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
3576         C++ static methods).
3577       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
3578         with the above changes.
3579
3580 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3581       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
3582
3583 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3584       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
3585         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
3586         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
3587          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
3588          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
3589            a wrapper
3590          - Wrapper interface which wrap sources
3591         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
3592         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
3593       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
3594         files for compilation
3595
3596 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
3597       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
3598         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
3599         - vtk/Makefile.am now builds a library
3600         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
3601           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
3602           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
3603           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
3604           import library.
3605         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
3606           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
3607           + vtk/vtkGdcmReader.so and
3608           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
3609           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
3610         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
3611           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
3612         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
3613           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
3614       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
3615       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
3616         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
3617         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
3618         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
3619         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
3620         collision of various stl members (principally cout...).
3621       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
3622         file.
3623       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
3624         comply with above changes)
3625
3626 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3627       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
3628       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
3629         vtk data structure (an image Flip was required).
3630       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
3631       * cosmetic changes in documentation.
3632
3633 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3634       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
3635         unexisting file is given as argument.
3636       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
3637         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
3638         containing those images is now available at
3639           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
3640         with the name gdcmData.
3641         All the python scripts (including the package initialisation file
3642         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
3643         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
3644
3645 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3646       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
3647         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
3648         demo of the usage of this class.
3649         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
3650         at configure (or autogen.sh) stage.
3651
3652 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3653       * More memory link related corrections and documentation fixes.
3654         Notes on valgrind:
3655           - maximum info is obtained with a command of the form:
3656             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
3657                      --show-reachable=yes PrintHeader
3658           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
3659             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
3660             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
3661             (in fact further invocation to the STL would recollect the
3662              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
3663       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
3664         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
3665         Note: some images don't seem to work e.g.
3666             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
3667       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
3668         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
3669         make gdcm more thread friendly.
3670
3671 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3672       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
3673           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
3674         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
3675           gdcmHeader::_dicom_vr.
3676         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
3677         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
3678           VRHT*.
3679         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
3680
3681 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3682       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
3683         make install stage.
3684
3685 2003-04-9 JPR
3686       * UpdateGroupLength replaced by new one
3687
3688 2003-04-7 JPR
3689       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
3690         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
3691
3692 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3693       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
3694       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
3695       * src:
3696         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
3697         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
3698           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
3699         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
3700           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
3701           carried the same semantics.
3702           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
3703         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
3704           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
3705         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
3706       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
3707       * gdcmGetXSize added
3708       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
3709       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
3710
3711 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3712       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
3713         (to avoid double call by end user).
3714       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
3715         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
3716
3717 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3718       * gdcm/Doc many doxygen changes:
3719         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
3720           the html.users end users oriented documentation and
3721           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
3722           oriented documentation.
3723         - README changed accordingly
3724         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
3725         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
3726           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
3727         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
3728           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
3729           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
3730       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
3731         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
3732       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
3733         ill-formed documentation sections.
3734       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
3735
3736 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3737       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
3738       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
3739         un*ces with sh-utils test utility.
3740       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
3741       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
3742       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
3743       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
3744       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
3745
3746 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3747       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
3748       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
3749
3750 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3751       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
3752       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
3753       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
3754       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
3755         compilation work.
3756       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
3757       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
3758
3759 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3760       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
3761         hence the user doesn't need this explicit call.
3762         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
3763           i.e. LoadElements() call removed.
3764       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
3765         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
3766       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
3767         for adding user defined new tags.
3768         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
3769         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
3770           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
3771
3772 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
3773       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
3774         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
3775         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
3776         with the autotools, included the python wrappers part.
3777       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
3778
3779 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3780       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
3781
3782 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3783       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
3784         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
3785         for usage).
3786       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
3787         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
3788         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
3789       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
3790         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
3791
3792 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3793       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
3794         in InstallMode or PreInstallMode but with an environment given
3795         value of GDCM_DICT_PATH.
3796       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
3797
3798 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3799       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
3800       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
3801       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
3802         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
3803         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
3804
3805 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3806       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
3807         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
3808         gdcmHeader.h
3809       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
3810         (as opposed to gdcm.h)
3811       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
3812       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
3813         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
3814       * autogen.sh removed history related references to crea package.
3815
3816 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3817       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
3818         bug.
3819
3820 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3821       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
3822         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
3823         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
3824         of hidding away the python related distutils specific files
3825         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
3826         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
3827         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
3828         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
3829
3830 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3831       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
3832       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
3833         among the list of sources.
3834
3835 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3836       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
3837       * modifications in MSVC projects
3838
3839 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3840       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
3841         looks like we can move back to original usage of exception within
3842         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
3843         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
3844       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
3845         README file for usage added.
3846       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
3847         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
3848         testing the proper parsing of a Dicom related file.
3849         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
3850       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
3851       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
3852         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
3853           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
3854           Dicom public dictionary were not accessible without an
3855           instance of class gdcmHeader.
3856         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
3857           require no instances at all to be invocated.
3858         - within gdcmDictSet this change required to change some method
3859           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
3860           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
3861       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
3862         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
3863       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
3864         the above to be effective.
3865       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
3866         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
3867       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
3868         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
3869         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
3870         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
3871         (for python dectection).
3872       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
3873         now avoids publishing the empty entries.
3874
3875 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3876       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
3877         ExtraPath reused :-P
3878       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
3879
3880 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3881       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
3882       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
3883       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
3884         and links
3885
3886 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3887       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
3888         method. Doxygenation.
3889       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
3890
3891 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3892       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
3893         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
3894         when using "python setup.py install".
3895       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
3896         reexports the working classes.
3897       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
3898         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
3899         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
3900         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
3901         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
3902         subdir (see the README file). This problem probably due to
3903         an combination of g++ and dynamic loading.
3904       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
3905
3906 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3907       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
3908         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
3909         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
3910         again in a python subdir, but the package itself is now in
3911         python/gdcmPython.
3912       * setup.py was cleaned up:
3913         - pythonIncludePath removed
3914         - python setup.py bdist target is now functional.
3915       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
3916         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
3917         accordingly.
3918
3919 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3920       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
3921       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
3922         distutils installer is operational.
3923       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
3924           shadow classes (from gdcm.py).
3925         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
3926           instead of gdcmPython/demo/load.py.
3927         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
3928
3929 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3930       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
3931         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
3932         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
3933         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
3934         dictionary.
3935         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had an unspecified fourth field
3936           are now in the "???" group.
3937         - python/gdcm.i changed accordingly,
3938         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
3939           of the above new functionalities in Python.
3940
3941 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3942       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
3943         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
3944           were definitively removed.
3945         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
3946       * src/gdcmElValSet.cxx:
3947         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
3948         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
3949         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
3950         - Added GetElementByName(string).
3951       * src/gdcmHeader.cxx: added
3952         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
3953         - GetPubElValRepByName(string)
3954         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
3955         - GetShaElValRepByName(string)
3956         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
3957         - GetShaElValRepByName(string)
3958         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
3959         - GetElValRepByName(string)
3960         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
3961         - GetElValRepByName(string)
3962       * Doc/requirements.txt added.
3963
3964 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3965       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
3966       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
3967         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
3968         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
3969         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
3970       * python/testSuite.py changed accordingly.
3971
3972 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
3973       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
3974         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
3975              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
3976               cannot be exported. [...]
3977               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
3978               be exported. [...]
3979               This is caused by a designed limitation that once a template
3980               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
3981               exported."
3982         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
3983         limitation" of VC++ is a pitfall.
3984         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
3985         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
3986         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
3987         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
3988         library.
3989         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
3990       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
3991          dll under windows !!!!)
3992       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
3993       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
3994         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
3995       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
3996         (one) of image(s).
3997       * removed glib references
3998       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
3999
4000 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4001       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
4002         that only displays required tags and testAll.py that parses all
4003         the files of the testsuite without using unittest.
4004       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
4005       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
4006       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
4007         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
4008
4009 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4010       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
4011         values, but limits itself to values which are below a user specified
4012         size (by default 1024 bytes).
4013       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
4014         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
4015         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
4016         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
4017       * python/testSuite.py
4018         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
4019         - two new examples added.
4020       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
4021
4022 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4023       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
4024         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindLength().
4025       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
4026       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
4027       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
4028
4029 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4030       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
4031         the vr was also RET.
4032       * python/testSuite.py more tests added.
4033
4034 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4035       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
4036       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
4037       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
4038         7.18 Integer types (see stdint.h)
4039         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
4040       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
4041         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
4042         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
4043         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
4044         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
4045         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
4046         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
4047         The rest of the changes we the necessary adaptations.
4048
4049 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4050       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
4051         VR files.
4052       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
4053
4054 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4055       * Adaptation for porting to VC++:
4056         - src/gdcm.h
4057           o forced to use std namespace (for string to be known)
4058           o all class use __declspec export style on WIN32
4059         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
4060           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
4061       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
4062         variable GDCM_DICT_PATH.
4063       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
4064
4065 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4066       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
4067         to native Python dictionary.
4068       * python/demo/test.py:
4069         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
4070         - takes an optional filename argument (the file to parse).
4071       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
4072         PubElVals hashing table.
4073       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
4074
4075 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4076       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
4077         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
4078       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
4079       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
4080       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
4081         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
4082       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
4083
4084 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4085       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
4086         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
4087         that we can import the shadow classes without errors].
4088
4089 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4090       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
4091       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
4092       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
4093       * src/Makefile prepared for python wrapping
4094
4095 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4096       * src/gdcmHeader.cxx :
4097         - Parsing of header is now separated from loading of element values
4098           (see gdcmHeader::LoadElements).
4099         - general clean up of hopefully all file access (creation of
4100           ReadInt16 and ReadInt32)
4101
4102 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4103       * src/gdcmHeader.cxx :
4104         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
4105           method.
4106         - SetLgrElem renamed to SetLength
4107         - GetLgrElem renamed to GetLength
4108         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
4109       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
4110       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
4111         due to IdoDude was cleaned out.
4112
4113 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4114       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
4115         concentrates on finding the value representation (when it exists).
4116         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
4117         returning the unecessary skL (skipped length).
4118         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
4119         it was redundant with the File position internals (by using
4120         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
4121         jajun.
4122       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
4123         on the libido specificities which are handled through class
4124         inheritance.
4125       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
4126         added.
4127
4128 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4129       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
4130         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
4131
4132 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4133       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
4134
4135 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4136       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
4137         and _IdDcmSWAP_LONG.
4138
4139 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4140       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
4141         May 23 2002. Needless to say we are running late...
4142