ChangeLog

   1 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   2    * gdcmPython/ : change GDCM_DATA_PATH to GDCM_DATA_ROOT to be complient with
   3      all in gdcm
   4
   5 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   6    * Test/ : rename VTK tests to have a best name for the tests
   7    * gdcmPython/demo/*.py.in : Change the InitTraversal/GetNextEntry use to
   8      GetFirstEntry/GetNextEntry use
   9
  10 2005-01-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  11    * Test/ShowDicom.cxx, ShowDicomSeq.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : change the
  12      test. Now it's on image content and not on the resulting visualisation...
  13      might solve the problem on linux when using the OpenGL drivers
  14
  15 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  16    * ENH for DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy,
  17                   DicomDirSerie, DicomDirImage
  18                   Dict, DictSet classes :
  19          -add method GetFirstEntry to replace call to InitTraversal+GetNextEntry
  20          -remove InitTraversal method.
  21         * UPD Test programs + Example programs
  22
  23 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  24    remove useless and never updated keyword \ingroup
  25
  26 2005-01-17 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  27    * src/gdcmUtil.cxx : bug fix to find the Windows MAC address. Now, there
  28      is no memory access violation
  29    * gdcmPython/demo : add python demos using VTK
  30
  31 2005-01-16 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  32          * FIX 'Dictionnary' is now spelt 'Dictionary'
  33                'wether' is now spelt 'whether'
  34                          'archieve' is now spelt 'archive'   ;-)
  35
  36 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  37     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
  38                related methods, in order not to expose internal mechanisms
  39         InitTraversal();
  40         GetNextEntry();
  41          * REM methods that exposed internal mechanisms :
  42         DicomDir::GetDicomDirPatients()
  43         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
  44         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
  45         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
  46          * UPD Test programs :
  47              makeDicomDir.cxx
  48              BuildUpDicomDir.cxx
  49              TestDicomDir.cxx
  50           * UPD Example program
  51              PrintDicomDir.cxx
  52     * ADD DictSet methods
  53         InitTraversal()
  54         GetNextEntry()
  55
  56 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  57    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
  58          reason to have to methods, moreover with the second taking the ostream as
  59          *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
  60
  61 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  62    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
  63          smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
  64          Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
  65          code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
  66          working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
  67          problematic GctestetIPAddress
  68
  69 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  70    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
  71      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
  72      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
  73      shared libs.
  74
  75 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  76    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
  77      sort DICOM files
  78
  79 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  80    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack
  81               for dealing with BIGENDIAN processors
  82                         - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
  83                         When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
  84                         and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
  85                         PixelWriteConvertor, and avoid modifying the Pixel Area.
  86                         Note :
  87               Probabely, the same operation will have to be done when we want
  88               to write image with Big Endian Transfert Syntax,
  89               and we are working on Little Endian Processor
  90
  91 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  92    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
  93      table.
  94    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
  95    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
  96      all the dict content.
  97    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
  98      print
  99    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
 100
 101 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 102    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a
 103                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
 104
 105 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 106    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
 107    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
 108    * gdcmPython/demo/ : add a new test
 109
 110 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 111    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
 112         * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
 113         * enhancement of Example/PrintDicomDir
 114
 115 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 116    * Now, python test might work on systems
 117    * Add the PrintDicomDir test
 118
 119 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 120    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
 121                 Explicit Big Endian Transfer Syntax files
 122           (group and elem not swaped)
 123
 124 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 125    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
 126                 Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
 127                           begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
 128                           To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
 129                           Document::HandleOutOfGroup0002() method
 130          * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
 131               (related pb not yet solved)
 132
 133 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 134    * Bug fix for the python part use
 135    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
 136
 137 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 138    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
 139
 140 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 141    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
 142      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of
 143      the transfer syntax
 144
 145 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 146    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
 147    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
 148             to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
 149                  and Transfer Syntax is Big Endian
 150                  We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
 151          * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
 152          * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
 153
 154 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 155    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
 156    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
 157    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
 158    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
 159    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
 160    gdcm::Global would destroy at exit).
 161
 162 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 163    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
 164          environment. static const string in a header file used to be ill
 165          initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
 166          issue.
 167
 168 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 169    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
 170       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
 171       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
 172       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as
 173          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
 174
 175 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 176    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
 177      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
 178      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
 179      redirected to a file (ofstream).
 180    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
 181      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
 182
 183 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 184    * Removal of useless and dangerous methods :
 185          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
 186          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
 187         * Removal of usless methods :
 188          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
 189    * Commenting out of probabely useless methods :
 190          Dict::GetDictEntryNames()
 191          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
 192          DictSet::GetPubDictEntryNames()
 193          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()
 194         * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used
 195         * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version
 196         * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
 197            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
 198                           Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods
 199    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
 200            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
 201                                      Unused till now...
 202         * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
 203            should be used to write a method to replace the former
 204            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
 205
 206 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 207    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
 208      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
 209      data in the DocEntry structure
 210
 211 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 212    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
 213      And now use a static function call instead, with a global variable. i
 214      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
 215      and easier to use...hopefully
 216
 217 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 218    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
 219
 220 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 221    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
 222
 223 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 224    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
 225      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
 226
 227 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 228    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
 229    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
 230      a file
 231    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
 232      when specifying the VR
 233    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
 234    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
 235
 236 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 237    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
 238           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
 239         * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
 240         * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
 241            in order to allow further VR modification by user
 242    * REM : removal of once-called method File::WriteBase
 243                 integration of its code in formerly one-line method File::Write
 244
 245 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 246    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
 247      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
 248    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
 249      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
 250      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
 251    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
 252
 253 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 254    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
 255      empty Print Method
 256    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
 257
 258 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 259    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
 260    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
 261    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
 262    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
 263    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
 264
 265 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 266    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
 267      problems when compiling with the python wrapping
 268
 269 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 270    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
 271      writting in ImplicitVR
 272
 273 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
 274    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
 275      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
 276      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
 277      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
 278
 279 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 280    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
 281      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
 282
 283 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 284    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
 285      Rename Decompressed to Raw
 286    * Use the API changes in gdcm::File.
 287    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
 288      Memory leaks fixed
 289
 290 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 291    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
 292      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
 293      of Frames' field
 294
 295 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 296    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
 297    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
 298
 299 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 300    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
 301      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
 302      solve it.
 303
 304 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 305    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
 306      DocEntry. Now use methods of the Document !
 307
 308 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 309    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
 310
 311 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 312    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
 313    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
 314    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
 315    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
 316      test to 0.0
 317    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
 318    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
 319      containing found sequences
 320
 321 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 322    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
 323      not at all time
 324    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
 325      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
 326               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
 327      and tests are now made on good variables
 328
 329 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 330    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
 331    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
 332      length
 333    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
 334    * Add vtkGdcmWriter example and test
 335
 336 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 337    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
 338    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
 339    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
 340      SetValue
 341    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
 342    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
 343
 344 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 345    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
 346    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
 347
 348 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 349    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
 350      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
 351      file isn't readable.
 352
 353 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 354    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
 355    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
 356    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
 357    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
 358      method that is redondant with AddEntry.
 359    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
 360      SQItem
 361
 362 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 363    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
 364    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
 365    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
 366
 367 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 368    * Huge cleanup:
 369      - Remove printf / sprintf
 370      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
 371      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm
 372        source
 373      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should
 374        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
 375      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation
 376        (plus it is not up to date)
 377      - remove 'using namespace std' this is BAD !
 378
 379 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 380    * Remove memory leaks on the DicomDir
 381    * Remove some useless data in DicomDirObject
 382    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
 383
 384 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 385    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
 386
 387 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 388    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
 389      future, with convertion)
 390    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
 391      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
 392      from the output of the class
 393
 394 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 395    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
 396
 397 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 398    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
 399      and vtkErrorMacro use.
 400    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
 401
 402 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 403    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
 404      file name in input
 405    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
 406    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
 407      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
 408      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed
 409      immediately after thee instruction.
 410    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
 411      file has been opened : the test must be made on the content of the
 412      pointer and not directly on the pointer !
 413      Code formatting
 414
 415 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 416    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
 417      the python part recompiles
 418
 419 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 420    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
 421      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
 422      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
 423      all linux)
 424
 425 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 426    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
 427      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
 428      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
 429      screen resolution, it's produce errors).
 430      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
 431    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
 432    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
 433      under windows at compilation
 434    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
 435      for grayscale images
 436    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
 437
 438 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 439    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
 440    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
 441      tests on the image size X, Y, Z
 442
 443 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 444    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
 445    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
 446      between the class name and the file name
 447
 448 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 449    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
 450      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
 451      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
 452      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
 453      this variable content.
 454
 455 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 456    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
 457      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
 458      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
 459      DocEntryArchive
 460    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
 461      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
 462      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
 463    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
 464      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
 465
 466 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 467    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
 468
 469 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 470    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
 471    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
 472      the header.
 473    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
 474      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
 475      write
 476    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
 477      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
 478      is now on RGB data (as before my last commit
 479    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
 480
 481 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 482    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
 483      Add a print information of the type of the entry
 484    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
 485      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
 486    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
 487      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
 488    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
 489      any.
 490    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
 491
 492 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 493    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
 494      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
 495      opened or not.
 496
 497 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 498    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
 499      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
 500    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
 501      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the
 502      DocEntryArchive
 503    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
 504      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
 505    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
 506      - test the pixels written
 507      - add test points to quickly find where is the error
 508      - can set a file name input and output in arguments
 509    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx :
 510      amelioration of the test output
 511
 512 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 513    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
 514      all replaced DocEntry's
 515    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
 516      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
 517      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
 518      header initial state.
 519
 520 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 521    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
 522
 523 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 524    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
 525      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
 526      then, it musn't change in the time.
 527    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
 528      header correctly. At this time, the change is only made for the first
 529      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
 530      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
 531      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
 532      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
 533    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
 534    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
 535      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
 536      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
 537
 538 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 539    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
 540    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
 541
 542 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 543    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
 544      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
 545      is copied).
 546    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't
 547      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
 548    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
 549
 550 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 551    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
 552      Two problems appear when doing it :
 553       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
 554         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
 555         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
 556         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
 557         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
 558         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
 559         the gdcmBinEntry.
 560       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
 561         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
 562         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet
 563         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it,
 564         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
 565    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
 566
 567 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 568    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
 569    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
 570      squeeze method
 571
 572 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 573    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
 574    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
 575      after it have been deleted
 576
 577 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 578    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
 579    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
 580    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
 581      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
 582      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
 583
 584 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 585     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
 586     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
 587     3. Use const ref when possible
 588     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
 589     5. A few more comments
 590     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
 591
 592 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 593   * ENH: Slightly bigger patch:
 594     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
 595     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
 596     3. File was not close properly in gdcmDict
 597     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
 598     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
 599     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
 600     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
 601     8. Do not repeat virtual in subclasses
 602     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
 603
 604 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 605   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken
 606     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead
 607     of a null character as defined by standard
 608
 609 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 610   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
 611     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
 612
 613 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 614   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
 615   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
 616     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
 617
 618 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 619   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
 620     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
 621     a verbose message is generated.
 622     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
 623     correctly close is a call to CloseFile.
 624     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
 625   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
 626     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least
 627     case to the image size (calculated) or the image size specified in the
 628     header. A verbose is generated if these two size mismatch
 629
 630 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 631   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
 632     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
 633     break under windows (with msvc6 compilation).
 634
 635 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 636   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
 637     compiling with MSVC6)
 638
 639 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 640   * Bugs fix for the Windows build with VC6
 641   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
 642     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
 643     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
 644     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
 645   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
 646     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
 647     gdcm.i file)
 648   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
 649     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
 650     std::cerr of vtk.
 651
 652 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 653   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
 654   * gdcmPython/gdcm.i:
 655     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
 656     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
 657       NOT need to be wrapped anymore.
 658   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
 659     DicomDir::Method) new example added.
 660
 661 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 662   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
 663     A DicomString can contain as many \0 as they want
 664     and it is *always* of even length.
 665     We only support odd length for very rare case.
 666     And in the near future this should be removed.
 667
 668 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 669   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
 670     little endian. This should -heopfully- fix some tests
 671
 672 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 673   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
 674     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to
 675     the one comiled into lib
 676
 677 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 678   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
 679     This should definitely solve any leak problem, and we should be
 680     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
 681
 682 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 683   * STYLE: ivars should start with a capital letter.
 684   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref).
 685   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
 686
 687 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 688   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
 689   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
 690     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
 691   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
 692   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
 693     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
 694     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
 695       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
 696       no longer exists.
 697
 698 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 699   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly
 700    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all
 701    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on
 702    the class.
 703
 704 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 705   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp
 706     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be
 707     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
 708
 709 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 710   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
 711   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
 712     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
 713     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
 714     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
 715       CloseFile() anymore.
 716     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
 717       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
 718       into File::Pixel_Data.
 719
 720 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 721   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
 722     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
 723   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
 724     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
 725     method:
 726     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
 727     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
 728       method to those classes.
 729     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
 730       -- Added a ::Print() method.
 731       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
 732       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
 733          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
 734
 735 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 736   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
 737     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
 738     doxygen.
 739   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
 740   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
 741     pointlessly wrapped (see
 742     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
 743   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
 744     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
 745     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
 746     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
 747     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
 748       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
 749            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
 750       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
 751          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
 752
 753 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 754   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
 755     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
 756
 757 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 758   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
 759     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
 760     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
 761   * TODO added new entry.
 762   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
 763     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
 764     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
 765     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
 766       variable names for semantical coherence.
 767
 768 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 769   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
 770   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
 771   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
 772   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
 773   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
 774   compilation time jpeg option.
 775
 776 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 777   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
 778     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
 779     reproduce at home.
 780   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
 781   Thanks dcmtk crew !
 782
 783 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 784   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
 785   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
 786     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
 787   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
 788   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
 789   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
 790   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
 791     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
 792     from File:: to PixelConvert::.
 793
 794 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 795   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
 796     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
 797      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
 798      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
 799
 800 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 801   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
 802   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
 803   like this:
 804     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
 805   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
 806   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
 807   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
 808
 809 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 810   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
 811     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
 812     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
 813     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added
 814     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
 815       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
 816       (for the time being this is better than having them attach to
 817        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
 818     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
 819       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
 820     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
 821       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to
 822       gdcmPixelConvert::
 823
 824 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 825   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
 826   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
 827     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
 828       clean up of RLE related code.
 829   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
 830     - src/gdcmRLE.cxx removed
 831     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
 832     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
 833     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
 834   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
 835     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
 836       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
 837       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
 838
 839 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 840   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
 841     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
 842       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
 843       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
 844       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
 845       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
 846       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
 847       offsets.
 848   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
 849     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
 850         with the retired Parse7Fe0().
 851     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
 852     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
 853
 854 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 855   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
 856     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
 857     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
 858     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
 859   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
 860     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
 861       to return an unused length.
 862
 863 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 864   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
 865     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
 866     to use to do simple stuff.
 867
 868 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 869   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
 870     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
 871     copying of the file within different directory, configure header file to
 872     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
 873     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
 874
 875 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 876   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
 877      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
 878        with it's binary name).
 879      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
 880        the Website to be more complete.
 881      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on
 882        doxygenated documentation.
 883      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
 884        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
 885                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
 886   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
 887   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
 888    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
 889
 890 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 891   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
 892    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
 893
 894 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 895   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
 896     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
 897     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
 898     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
 899     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
 900   * GDCMHOME clean up:
 901     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
 902       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
 903       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
 904   * Autotools clean up:
 905     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
 906     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed
 907
 908 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 909   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
 910   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
 911   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
 912
 913 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 914   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
 915     describing TODO entries and used it for new entries.
 916   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
 917     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
 918     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
 919   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
 920     documentation itself, but the website) moved to html and
 921     placed in directory Doc/Website:
 922     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
 923     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
 924     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
 925   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
 926   * CMakeLists.txt changed accordingly.
 927   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
 928     DeveloppersPython.html
 929   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
 930
 931 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 932   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
 933     of gdcm Web site.
 934
 935 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
 936   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
 937     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
 938     we can now delete[] it safely
 939   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
 940     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
 941   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
 942
 943 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 944   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
 945     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
 946     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
 947     pointed content.
 948
 949 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 950   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
 951   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
 952
 953 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 954   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
 955     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
 956     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for
 957     an example of usage.
 958     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
 959       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
 960     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
 961       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
 962     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
 963     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
 964     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
 965
 966 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 967   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
 968     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
 969     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
 970     in class
 971     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
 972       and associated accessors. Doxygenation of the class.
 973     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
 974       accessors added.
 975     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
 976       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
 977     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
 978     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
 979
 980 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 981   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
 982     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
 983       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
 984            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
 985            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
 986            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
 987            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
 988            the same group and element all share the same (group, element)
 989            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
 990            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
 991            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
 992            consider the following definition of a TagKey:
 993            - let Group, Element be the string representation of the
 994              group and element dicom tag members,
 995            - let ItemNumber be the string representation of the integer
 996              index of the considered item number of a sequence,
 997            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
 998            the form:
 999               /ItemNumber#Group|Element
1000            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
1001            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
1002               Group|Element<SeqTag>
1003            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
1004            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
1005            string e.g.
1006                0028|1201
1007            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
1008            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
1009            string e.g.
1010                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
1011     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
1012       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the
1013       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
1014     - src/gdcmDocEntry.cxx:
1015       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
1016          Key member.
1017       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
1018     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
1019     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
1020       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
1021       -- now has a new BaseTagKey member.
1022       -- STYLE.
1023   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
1024     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
1025     truly belongs.
1026     This poses the problem with the semantics of the following lines
1027        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
1028        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
1029        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
1030     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
1031     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
1032     order to get things working the dicom dictionary was altered !
1033     Please fix things urgently...
1034   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
1035     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
1036     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
1037     set to OW:
1038       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
1039       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
1040       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
1041   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
1042     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
1043   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
1044
1045 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1046   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
1047
1048 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1049   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
1050     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
1051   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
1052   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
1053
1054 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1055   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
1056     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
1057   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
1058     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
1059   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1060     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1061   * TODO updated
1062   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1063     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1064   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1065   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1066     exception_on_error parameter.
1067     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1068     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1069     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1070
1071 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1072   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1073   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1074     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1075   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1076   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1077   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1078     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1079   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1080
1081 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1082   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1083     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1084
1085 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1086   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1087        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1088
1089 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1090   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields
1091         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1092
1093 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1094    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1095    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1096      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1097      is now in static in the gdcmDebug class
1098    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1099    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1100
1101 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1102    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1103      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1104    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1105      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1106      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1107      that displays position and size).
1108    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1109      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1110      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1111      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1112      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1113      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1114      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1115         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in
1116      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1117      commiting changes).
1118    * Test/CMakeLists.txt:
1119       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1120       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1121         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1122         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1123    * TODO updated.
1124
1125 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1126    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1127      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1128      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1129      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1130      - removal of typedef duplication.
1131      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1132      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1133    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1134       - printf polluting ctest removed.
1135       - TAB removal for comminting
1136    * Test:
1137      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1138        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in
1139        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1140        this test creates them.
1141        Note: we need to validate each reference image, but before that
1142              I'd like to rename them with a more explicit name...
1143      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1144    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to
1145      including each header needed).
1146
1147 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1148    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1149      test suite to the Example directory. Are concerned:
1150      - PrintHeader.cxx
1151      - TestDcm2Acr.cxx
1152      - TestFindTags.cxx
1153      - TestWrite.cxx was
1154      - TestWriteSimple.cxx
1155    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1156      image gdcmData/oldACR00001.ima
1157
1158 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1159    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1160      with removal from gdcmData):
1161       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1162       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1163       - US.3405.1.dcm
1164      Added the following because after last cvs update, they cause
1165        ctest -R TestReadWriteReadCompare
1166      to segfault:
1167       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1168       - oldACR00001.ima
1169    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1170      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1171      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1172      form of test...
1173    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1174      we don't need to black list the following images anymore:
1175       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1176       - OT-PAL-8-face.dcm
1177       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1178    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1179      fixes and the beautified code ;-)
1180      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1181      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1182      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1183            improve the test suite). The bug could be detected by using
1184            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1185            or by using
1186            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1187            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1188
1189 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1190    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1191          - replace by uggly but working old code :-(
1192    A lot of things should be OK again.
1193    It's really urgent to have a test suite that *tests*,
1194    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1195    (twice, withing a fortnigh ...)
1196
1197 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1198    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1199      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1200    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1201      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1202      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1203                    - OT-PAL-8-face.dcm
1204                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1205    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1206      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1207      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1208      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1209      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in
1210      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1211      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1212      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1213      image.
1214    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1215      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1216      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1217      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1218
1219 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1220   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1221   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names
1222                           (instead of infinite loop)
1223   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names
1224
1225 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1226    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1227
1228 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1229    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1230            when SamplesPerPixel =3
1231          - now Write is no longer confused by
1232           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1233          - "UN" value representation Elements are now written correctly
1234                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1235    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods
1236            (in order to split the job that has not to be done
1237            for gdcmDicomDir)
1238
1239 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1240    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1241      loop on the same image until memory went out.
1242      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1243    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1244      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1245
1246 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1247    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written
1248             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1249             is added a the end, when necessary.
1250             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are
1251               now written correctly
1252             - length compatible BinEntry are now loaded correctly
1253               (even for odd groups)
1254         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1255                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1256
1257 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1258    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1259    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of
1260      coding style).
1261
1262 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1263    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1264      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1265    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1266
1267 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1268    FIX : gdcmDocument.cxx
1269       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1270         code 'beautyfication' :-(
1271       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1272
1273 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1274    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level,
1275             : to allow user to create his own Sequences
1276    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1277
1278    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1279
1280    - gdcmBinEntry
1281      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1282
1283    - gdcmDocEntry
1284      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1285      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1286
1287    - gdcmDocEntrySet
1288      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1289      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1290      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1291      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1292      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);
1293      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group,
1294                                             guint16 element,
1295                                             std::string vr     = "unkn",
1296                                             std::string fourth = "unkn",
1297                                             std::string name   = "unkn");
1298      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1299      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1300      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1301      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1302      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1303      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1304      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1305      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1306
1307    - gdcmDocument
1308      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1309      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1310      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1311      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1312      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1313                                         FILE *_fp, FileType type);
1314      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1315      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1316      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1317      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1318      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1319      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1320      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1321      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group,
1322                                             guint16 element,
1323                                             std::string vr     = "unkn",
1324                                             std::string fourth = "unkn",
1325                                             std::string name   = "unkn");
1326      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1327      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1328      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1329      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1330
1331         - gdcmElementSet
1332           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1333
1334    - gdcmSeqEntry
1335           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1336
1337    - gdcmSQItem
1338      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1339      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1340      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1341      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1342
1343    - gdcmValEntry
1344          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype);
1345
1346 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1347     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1348       The default constructor invoked by the line
1349          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1350       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1351       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1352       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1353     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1354       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1355       Could anyone explain why ?
1356     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1357       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from
1358       code related to gdcmBinEntry).
1359
1360 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1361     * In order to fix memory leaks:
1362      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1363        some delete calls.
1364      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1365      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1366        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1367        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1368        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1369      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1370      - src/gdcmDocument.cxx:
1371        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1372           from dynamic stores.
1373        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1374           was causing memory leaks.
1375      - src/gdcmSQItem.cxx:
1376        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1377           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1378        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1379           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1380           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1381           This avoids SegFaulting.
1382      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1383     * Conclusion:
1384      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1385        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1386        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1387      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1388        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1389      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1390        segfaults).
1391     * Erroneous leading white fix:
1392      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1393        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1394      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1395      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1396     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1397     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1398
1399
1400 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1401     * In order to fix writing of dicom files:
1402      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1403      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1404      - src/gdcmDocument.cxx:
1405        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1406        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1407        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1408           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1409           manner.
1410        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1411           to only declared) and build on top of
1412           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1413        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1414      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1415        for usage in destructor and treatement of promotion in
1416        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1417      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1418       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1419     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1420       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1421       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1422       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1423
1424 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1425     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1426       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1427       learned that:
1428           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1429           soon as possible by globally disabling memory caching.
1430           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1431           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1432       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1433       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1434       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1435     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1436       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1437       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1438       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1439         with 1.
1440       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1441       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1442       understand why the list is empty...).
1443     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1444     * Doc/License.txt added.
1445
1446 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1447     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1448       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1449         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1450         the padding problem.
1451       - general clean up, simplification, and coding style.
1452       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1453     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1454
1455 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1456    *  gdcmSeqEntry.cxx
1457            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1458                 - fix the display of SQItem ordinal number
1459       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1460                 - remove some useless never written private methods
1461
1462 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1463    * gdcmBinEntry.cxx
1464       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1465            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1466               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1467                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1468    * dcmDocument.cxx
1469       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry,
1470               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1471            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1472       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1473    * gdcmFile.cxx
1474       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1475    * gdcmSQItem.h
1476       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide
1477             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1478             \warning : some pb remaining around this number
1479                                 will be solved asap
1480       - AddEntry now takes the Item Number as a param
1481    * gdcmValEntry.cxx
1482       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1483
1484 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1485     * Memory leak hunt with the following command:
1486       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1487                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1488       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1489       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1490       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with
1491           grep "MEMORY LEAK" src/*
1492       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1493       -----
1494           #include <string>
1495           int main() {
1496              std::string name;
1497              char * test = "babo";
1498              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1499                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1500              name.clear();   //// Doesn't help !
1501              return 0;
1502           }
1503       -----
1504           #include <string>
1505           #include <iostream>
1506           int main() {
1507              std::string line;
1508              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1509              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1510                                         //// of 1320 bytes in call to
1511                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1512             return 0;
1513           }
1514       -----
1515
1516
1517 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1518     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1519       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1520         and related, moved away to gdcmDocument.
1521       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1522         the corresponding protected accessors of inherited class
1523         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be
1524         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1525       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1526       - Clean up of undefined or unused methods.
1527     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1528       account the changes to gdcmHeader.h).
1529     * src/gdcmDocument.h:
1530       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1531         changes to gdcmHeader.h).
1532       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1533         (see changes to gdcmHeader.h).
1534       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1535       - Clean up of undefined or unused methods.
1536     * src/gdcmDocument.cxx:
1537       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1538       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1539       - some std::string properly set to VRKey
1540     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1541       references to gdcmDocument.
1542     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1543     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in
1544       cvs repository gdcmData.
1545
1546 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1547     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1548     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1549       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1550     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1551     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1552       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1553     * src/gdcmDocument.cxx:
1554       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1555         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1556       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1557         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1558         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1559         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1560         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1561               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1562               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1563     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1564     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1565       now taken into account.
1566     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1567       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1568     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1569       on posix.
1570     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1571       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1572     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1573
1574 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1575     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1576       gdcmGlob
1577     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1578     * src/gdcmUtil.h : export methods
1579
1580 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1581     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1582       to right behavior
1583     * Initial addition of automatic python testing
1584     * Initial addition of automatic image comparison
1585
1586 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1587     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1588       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1589
1590 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1591      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1592      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1593      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1594
1595 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1596      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1597        new concepts (and new classes) :
1598        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1599         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1600         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1601        a Sequence is composed of Items.
1602        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1603        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1604        (never taken into account)
1605        Our unability to add a new 'entry' in the header
1606        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1607        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1608        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1609        nothing is finished.
1610        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1611
1612 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1613      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1614
1615 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1616      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1617        file prefix (SetFilePrefix)
1618
1619 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1620      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1621        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1622        baseline.
1623      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1624        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1625
1626 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1627      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a
1628        dicom image
1629
1630 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1631      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1632      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1633        between the developper and user version.
1634      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1635      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1636
1637 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1638      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1639        when using cmake.
1640
1641 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1642      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in
1643                src directory, now generated in the build dir.
1644             2. Tests as mentionned smarter
1645             3. Some clean up
1646             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name
1647           this is interesting for 3rd party lib like ITK,
1648           where we could set the institution name / patient name...
1649
1650        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1651               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory
1652                  (this was not true before)
1653
1654 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1655      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow
1656            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1657      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1658            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1659            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1660      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1661            tree-like structure of a Dicom Header.
1662      * FIX Test code cleaning
1663
1664 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1665      * ENH: Adding automatic testing
1666        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1667        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1668        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1669        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting
1670           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load
1671           too many projects
1672      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1673      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1674        one file instead of seven + some small cleanup
1675
1676 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1677      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1678      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1679            Header printing. Example given with :
1680            > PrintHeader fileName  2 new
1681           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1682
1683 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1684      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1685          1. I have added some unsigned where needed
1686          2. Some function parameter not used -> (void)
1687          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1688          4. g++ don't like character '\' in comment
1689          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1690                     this really need to be fixed
1691          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1692          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid);
1693                     this also really need to be fixed
1694          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt,
1695                     remove compression file
1696                     (as we only do decompression, right ?)
1697      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1698
1699 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1700      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1701            when a single value is found (bug ?), xpacing is now
1702            defaulted to yspacing
1703
1704 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1705      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1706      * ENH add parameters :
1707                bool  exception_on_error = false,
1708                bool  enable_sequences   = false,
1709                bool  ignore_shadow      = false
1710            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1711      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1712            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files
1713
1714 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1715      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1716
1717 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1718      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1719      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1720              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1721
1722 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1723      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more
1724          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1725
1726 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1727      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1728        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1729        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1730        in gdcmHeader.
1731      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1732        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1733        already does the job.
1734      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1735        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1736
1737 2004-03-30 Benoit Regrain
1738      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1739        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1740        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1741
1742 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1743      * ENH : Check on file type to be written moved
1744              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1745      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1746              when end-of-list is reached
1747            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1748
1749 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1750      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1751      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1752      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1753        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1754
1755 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1756      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1757        now contains all the gdcmGlobal related code.
1758      * minor coding style and doxygenation changes.
1759
1760 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1761      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1762        now contains all the Debug related code.
1763      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1764      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1765        CreateCleanString) removed.
1766      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1767      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1768      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1769      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1770        src/gdcmDirList.cxx)
1771
1772 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1773      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1774
1775 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1776      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1777            big endian made volumes
1778      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1779            end user to instanciate class gdcmParser
1780           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1781
1782 2004-03-22 Benoit Regrain
1783      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1784      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1785              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1786
1787 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1788      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1789            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1790            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1791            or build from the files held (recursively) in a Directory
1792            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1793            gdcmObject::SetBoundaries() added
1794
1795 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1796      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1797                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1798      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1799            DICOMDIR
1800      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1801            about the name
1802
1803 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1804      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1805                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1806
1807 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1808      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1809            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1810            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1811            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1812            to allow making gdcDicomDir object.
1813      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1814           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1815
1816 2004-02-11 Benoit Regrain
1817      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1818              when using from python
1819
1820 2004-02-10 Benoit Regrain
1821      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1822      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1823      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1824              directory parsing
1825
1826 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1827      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1828              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1829              - class gdcmMeta created
1830      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1831              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1832      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1833
1834 2004-02-05 Benoit Regrain
1835      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1836              header entries
1837      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1838      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1839
1840 2004-02-04 Benoit Regrain
1841      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1842      * FIX : sort the images in the dicom dir
1843      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1844      * ADD : a python demo
1845
1846 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1847      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1848      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1849              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1850              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1851              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1852      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1853            to make full checking easier
1854
1855 2004-02-04 Benoit Regrain
1856      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1857      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1858
1859 2004-02-03 Benoit Regrain
1860      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1861      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1862      * Bug fix and print add-on
1863
1864 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1865      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1866      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1867      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements
1868      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered
1869            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1870
1871 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1872      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second'
1873              iterator on last
1874              of the last synonym :-(
1875      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except
1876              for DICOMDIR ;-)
1877      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1878      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity
1879      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1880            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1881       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1882
1883 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1884      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1885            no longer writes 'Un' on disk
1886      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1887      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1888            the length (for Palette expanded images)
1889            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1890      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1891            (that broke Write). Replaced by UL.
1892            Aware user will reload the field if he
1893            thinks it's necesssary
1894
1895 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1896      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR
1897        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new
1898        IsReadable() methods.
1899
1900      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1901       (no DOUBLE images in kosher DICOM,
1902       but so usefull for people that miss them ;-)
1903
1904      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1905        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1906
1907 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1908      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1909
1910 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1911      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow',
1912              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1913         The TRUE value for this param has to be used
1914         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1915         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1916      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1917              (even when an 'icone image sequence' is announced by the
1918         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1919
1920      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow
1921              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1922              Fixed
1923
1924      * gdcmHeader add the method
1925              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1926         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1927         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless*
1928         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
1929
1930 2004-01-26 Benoit Regrain
1931      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields
1932        in the print and add a third level of print to print them
1933
1934 2004-01-23 Benoit Regrain
1935      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1936      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1937      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1938        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1939
1940 2004-01-22 Benoit Regrain
1941      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1942      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1943
1944 2004-01-19 Benoit Regrain
1945      * Add the use of shadow dictionaries
1946      * bug fix and coding style
1947
1948 2004-01-19 Benoit Regrain
1949      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1950      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1951      * Add the update of header entries using the shadow library
1952
1953 2004-01-19 Benoit Regrain
1954      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1955      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1956        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1957        of dicom dir parsing
1958      * bug fix under python
1959
1960 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1961     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1962     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1963     * ADD add file gdcmHeader2.cxx
1964     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1965
1966 2004-01-15 Benoit Regrain
1967      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1968        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1969        when the gdcmDictSet will be destroyed
1970      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1971        gdcmDictSet
1972
1973 2004-01-15 Benoit Regrain
1974      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1975        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1976        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1977        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1978      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1979
1980 2004-01-14 Benoit Regrain
1981      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1982      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1983      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1984      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1985
1986 2004-01-13 Benoit Regrain
1987      * src/*.[h|cxx] : coding style
1988      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1989
1990 2004-01-13 Benoit Regrain
1991      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1992      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1993        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1994      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1995
1996 2004-01-12 Benoit Regrain
1997      * src/*.h : add comments
1998      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1999      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
2000        directly setted in the source code
2001      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
2002        gdcmTS and gdcmVR
2003
2004 2004-01-09 Benoit Regrain
2005      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
2006      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
2007
2008 2004-01-07 Benoit Regrain
2009      * Modification to compile with the distutils.
2010      * Bug fix in code
2011
2012 2003-12-10 Benoit Regrain
2013      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
2014        can use a gdcmHeaderHelper to load data
2015      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
2016        made in the source code
2017
2018 2003-12-10 Benoit Regrain
2019      * Update Windows projects and .cvsignore files
2020
2021 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
2022      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
2023            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
2024            if he wants to.
2025            gdcmElValSet:Print takes it into account
2026
2027 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2028      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
2029      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
2030      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
2031
2032 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
2033       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
2034              on the ListTag listElem member,
2035              not longer on the TagElValueHT tagHt member
2036       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
2037              with the tagHt member and the listElem member.
2038              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
2039
2040       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
2041              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
2042                             if bug fixing is necessary), for internal
2043                             use only
2044              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
2045                             or to allow Parser going on.
2046              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
2047              with a length (not 0000) is found
2048       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
2049                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
2050                 (to be written)
2051
2052 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
2053      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
2054      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
2055           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
2056      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
2057
2058 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2059      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2060
2061 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2062      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2063           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2064
2065 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2066      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2067      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2068              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2069              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2070
2071 2003-11-05 Benoit Regrain
2072      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2073                        : Explicit error messages
2074      * in __init__.py  : Related modif
2075
2076 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2077      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2078            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2079            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2080      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2081                     (vtkGdcmReader compliant)
2082
2083 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2084      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2085        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2086
2087 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2088      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h
2089            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2090
2091 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2092      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw
2093                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2094              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2095              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2096              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2097              such an image :
2098              After gdcmHeader :
2099               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2100               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2101               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2102      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2103              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2104
2105 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2106      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2107
2108 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2109      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm
2110            being coherents dicom files.
2111
2112 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2113      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2114            from medcon lib !
2115      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type
2116      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2117      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2118      * ENH: Add include dir to medcon lib
2119      * FIX: only one function is being exported for now !
2120            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2121
2122 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2123       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2124         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2125           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2126       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2127
2128 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2129       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2130         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2131         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2132       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2133       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2134
2135 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2136       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2137
2138 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2139       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2140       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2141       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2142
2143 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2144       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2145       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2146       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2147       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2148       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2149       * FIX: More pragma disable fro VC++,
2150              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2151         But it fasten debug compilation time.
2152
2153 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2154       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2155         (they are compressed as 2 planes images,
2156          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2157
2158 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2159       * Now CheckRead takes into account :
2160          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2161          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2162       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2163        (breaks DicomWorks)
2164
2165 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2166       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt
2167              one should remove the '\'
2168
2169 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2170       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image
2171         (wrong lengths in header)
2172         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2173       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2174         (breaks DicomWorks)
2175
2176 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2177       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script
2178         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2179
2180 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2181       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2182       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2183
2184 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2185       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2186
2187 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2188       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2189         (the patch is easy to remove)
2190       * cosmetic changes to avoid warnings
2191
2192 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2193       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up,
2194         no need to press 'r' now.
2195
2196 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2197       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2198         to new Jpeg Lossless decompressor
2199       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2200       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2201       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2202                                                   UNIT 11, Hop Cardio
2203 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2204       * general anonymisation in gdcmData
2205       * adding the 'color files' from
2206         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2207       * adding some well knowed bugged-header images
2208       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2209         waiting for their inclusion in Python testsuite
2210
2211 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2212     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2213       no longer seg faults when file is not found
2214
2215 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2216      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess
2217        MultiFrame images
2218
2219 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2220      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2221
2222 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2223      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2224         OpenFile takes it into account
2225      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2226      * Missing elements added in dicomV3.dic
2227       (just to be affraid : have a look at
2228        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2229        and do it again next year ;->
2230
2231 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2232      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of
2233        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2234        But there are NOT. It's fixed !
2235
2236 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2237      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2238      * FIX: vtkgdcm was not being installed
2239
2240 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2241      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2242              an ACR-NEMA / DICOM one.
2243      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file
2244              is not gdcm Readable
2245      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)"
2246              is now decoded.
2247
2248 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2249      * FIX: CMake generate now documentation
2250      * ENH: out of source doc build !
2251      * ENH: Generate both user and dev documentation
2252      * ENH: Should work on windows too
2253      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed
2254      * FIX: make install should be ok now on ùnix plateform
2255      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2256      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file
2257
2258 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2259      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2260      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2261      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control
2262         window level & window width
2263
2264 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2265      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2266      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2267      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2268
2269 2003-10-06  Emanuel Ollart
2270      * FIX : compilation process wad broken.
2271              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2272
2273 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2274      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2275      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2276
2277 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2278      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2279            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2280                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2281       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2282
2283 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2284       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces,
2285         to remain compliant with already defined strings,
2286         like Transfert Syntax UID and others)
2287
2288 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2289       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added,
2290              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2291
2292 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2293       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2294       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2295
2296 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2297       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2298         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2299               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2300       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2301
2302 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2303       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2304
2305 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2306       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added,
2307         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2308
2309 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2310       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2311          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2312          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2313          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2314           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT,
2315                                             YBR_RCT files.
2316           (no sample found :-(
2317
2318 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2319       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2320         Two reasons: - clear things
2321                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2322                        suffer anymore VC++ complains
2323
2324 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2325       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2326       * removed leaks
2327
2328 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2329       * The lines are now eigthy characters long.for
2330         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx
2331
2332 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2333       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2334         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2335         previous commis of Malaterre)
2336       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2337         before the last Malaterre's commit.
2338
2339 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2340       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2341         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2342       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2343         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2344
2345 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2346       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2347         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2348         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2349
2350 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2351       * Cosmetic changes:
2352         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2353           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2354           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2355           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2356         - PACKAGER corrected
2357         - DEVELOPPER added.
2358         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2359       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2360
2361 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2362       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2363
2364 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2365       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2366
2367 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2368       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2369
2370 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2371       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2372
2373 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2374       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2375         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2376         heuristics to get informations (look at different places).
2377       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2378         sorting DICOM images based on different strategies.
2379       * modified Makefiles accordingly.
2380
2381 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2382       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2383         when building in debug mode
2384       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2385         src/win32/gdcmdll.dsp
2386       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2387
2388 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2389       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2390             to valgrind.
2391
2392 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2393       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2394       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp :
2395                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2396       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2397
2398 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2399       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2400         the file
2401       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2402       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2403         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2404       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2405         symbols... future problem ?
2406
2407 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2408       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2409       * modified gdcm.dsw accordingly
2410
2411 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2412       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2413
2414 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2415       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2416         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2417       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2418         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2419         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2420
2421 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2422       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2423
2424 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2425       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2426       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2427       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2428       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2429       * PACKAGER : adding all concerning windows
2430
2431 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2432       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2433         garbage debug code.
2434       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2435       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2436         test suite reported error.
2437       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2438         packaging a new release).
2439       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2440       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2441       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2442         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2443         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2444
2445 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2446       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2447       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2448
2449 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2450       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2451         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2452         is made in an internal list to prevent this problem.
2453         Bug fix when output is empty.
2454         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2455         correction.
2456       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2457
2458 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2459       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2460       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2461         files. Added method to remove all files on the input
2462         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2463         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2464
2465 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2466       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2467         when using make instal.
2468       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2469         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2470
2471 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2472       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2473       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2474
2475 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2476       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2477         linux and WINDOWS !
2478       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2479       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2480
2481 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2482       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2483         addon of the jpeg library)
2484       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2485       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2486       * INSTALL now points to web documentation
2487
2488 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2489       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2490         gdcmUtil.h anymore.
2491       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2492         clean target.
2493       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2494         - to allow compilation with gcc 3.x
2495           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2496           -- small fixes on exceptions.
2497           Note: linking not tested !
2498         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2499           building stage.
2500       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2501         dependent convertion).
2502
2503 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2504       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2505         Changelog):
2506         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2507         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2508           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2509         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2510
2511 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2512       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2513         compile
2514       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2515         (FileName -> Filename)
2516
2517 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2518       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2519         - UpdateProgress method should now be effective
2520         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2521           to volumes),
2522         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2523           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2524           accelerating things).
2525         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2526           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2527           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2528           in the stack (for the caller to notice the problem).
2529
2530 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2531       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2532
2533 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2534       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2535         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2536         under Windows... thanks Windows !)
2537
2538 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2539       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2540         debug stage).
2541       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2542
2543 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2544       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2545
2546 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2547       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2548         called with different flags than the default ones (with automake).
2549         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2550            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2551         and went for warning fixes:
2552         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2553           up from unused variables.
2554         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2555       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2556
2557 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2558       * gdcmPython/gdcm.i:
2559         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2560           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2561           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2562         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2563           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2564           exported to Python a as cvar.
2565       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2566         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2567         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2568         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2569         C++ static methods).
2570       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2571         with the above changes.
2572
2573 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2574       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2575
2576 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2577       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2578         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2579         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2580          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2581          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2582            a wrapper
2583          - Wrapper interface which wrap sources
2584         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2585         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2586       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2587         files for compilation
2588
2589 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2590       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2591         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2592         - vtk/Makefile.am now builds a library
2593         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2594           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2595           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2596           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2597           import library.
2598         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2599           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2600           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2601           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2602           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2603         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2604           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2605         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2606           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2607       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2608       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2609         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2610         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2611         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2612         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2613         collision of various stl members (principally cout...).
2614       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2615         file.
2616       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2617         comply with above changes)
2618
2619 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2620       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2621       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2622         vtk data structure (an image Flip was required).
2623       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2624       * cosmetic changes in documentation.
2625
2626 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2627       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2628         unexisting file is given as argument.
2629       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2630         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2631         containing those images is now available at
2632           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2633         with the name gdcmData.
2634         All the python scripts (including the package initialisation file
2635         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2636         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2637
2638 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2639       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2640         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2641         demo of the usage of this class.
2642         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2643         at configure (or autogen.sh) stage.
2644
2645 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2646       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2647         Notes on valgrind:
2648           - maximum info is obtained with a command of the form:
2649             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2650                      --show-reachable=yes PrintHeader
2651           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2652             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2653             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2654             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2655              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2656       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2657         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2658         Note: some images don't seem to work e.g.
2659             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2660       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2661         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2662         make gdcm more thread friendly.
2663
2664 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2665       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2666           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2667         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2668           gdcmHeader::_dicom_vr.
2669         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2670         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2671           VRHT*.
2672         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2673
2674 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2675       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2676         make install stage.
2677
2678 2003-04-9 JPR
2679       * UpdateGroupLength replaced by new one
2680
2681 2003-04-7 JPR
2682       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2683         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2684
2685 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2686       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2687       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2688       * src:
2689         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2690         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2691           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2692         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2693           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2694           carried the same semantics.
2695           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2696         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2697           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2698         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2699       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2700       * gdcmGetXSize added
2701       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2702       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2703
2704 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2705       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2706         (to avoid double call by end user).
2707       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2708         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2709
2710 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2711       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2712         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2713           the html.users end users oriented documentation and
2714           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2715           oriented documentation.
2716         - README changed accordingly
2717         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2718         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2719           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2720         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2721           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2722           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2723       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2724         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2725       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2726         ill-formed documentation sections.
2727       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2728
2729 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2730       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2731       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2732         un*ces with sh-utils test utility.
2733       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2734       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2735       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2736       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2737       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2738
2739 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2740       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2741       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2742
2743 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2744       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2745       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2746       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2747       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2748         compilation work.
2749       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2750       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2751
2752 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2753       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2754         hence the user doesn't need this explicit call.
2755         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2756           i.e. LoadElements() call removed.
2757       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2758         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2759       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2760         for adding user defined new tags.
2761         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2762         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2763           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2764
2765 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2766       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2767         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2768         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2769         with the autotools, included the python wrappers part.
2770       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2771
2772 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2773       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2774
2775 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2776       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2777         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2778         for usage).
2779       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2780         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2781         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2782       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2783         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2784
2785 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2786       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2787         in InstallMode or PreInstallMode but with an environment given
2788         value of GDCM_DICT_PATH.
2789       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2790
2791 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2792       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2793       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2794       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2795         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2796         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2797
2798 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2799       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2800         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2801         gdcmHeader.h
2802       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2803         (as opposed to gdcm.h)
2804       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2805       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2806         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2807       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2808
2809 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2810       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2811         bug.
2812
2813 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2814       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2815         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2816         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2817         of hidding away the python related distutils specific files
2818         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2819         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2820         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2821         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2822
2823 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2824       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2825       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2826         among the list of sources.
2827
2828 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2829       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2830       * modifications in MSVC projects
2831
2832 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2833       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2834         looks like we can move back to original usage of exception within
2835         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2836         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2837       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2838         README file for usage added.
2839       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2840         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2841         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2842         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2843       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2844       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2845         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2846           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2847           Dicom public dictionary were not accessible without an
2848           instance of class gdcmHeader.
2849         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2850           require no instances at all to be invocated.
2851         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2852           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2853           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2854       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2855         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2856       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2857         the above to be effective.
2858       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2859         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2860       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2861         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2862         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2863         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2864         (for python dectection).
2865       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2866         now avoids publishing the empty entries.
2867
2868 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2869       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2870         ExtraPath reused :-P
2871       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2872
2873 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2874       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2875       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2876       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2877         and links
2878
2879 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2880       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2881         method. Doxygenation.
2882       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2883
2884 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2885       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2886         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2887         when using "python setup.py install".
2888       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2889         reexports the working classes.
2890       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2891         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2892         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2893         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2894         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2895         subdir (see the README file). This problem probably due to
2896         an combination of g++ and dynamic loading.
2897       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2898
2899 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2900       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2901         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2902         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2903         again in a python subdir, but the package itself is now in
2904         python/gdcmPython.
2905       * setup.py was cleaned up:
2906         - pythonIncludePath removed
2907         - python setup.py bdist target is now functional.
2908       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2909         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2910         accordingly.
2911
2912 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2913       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2914       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2915         distutils installer is operational.
2916       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2917           shadow classes (from gdcm.py).
2918         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2919           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2920         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2921
2922 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2923       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2924         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2925         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2926         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2927         dictionary.
2928         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2929           are now in the "???" group.
2930         - python/gdcm.i changed accordingly,
2931         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2932           of the above new functionalities in Python.
2933
2934 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2935       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2936         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2937           were definitively removed.
2938         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2939       * src/gdcmElValSet.cxx:
2940         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2941         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2942         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2943         - Added GetElementByName(string).
2944       * src/gdcmHeader.cxx: added
2945         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2946         - GetPubElValRepByName(string)
2947         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2948         - GetShaElValRepByName(string)
2949         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2950         - GetShaElValRepByName(string)
2951         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2952         - GetElValRepByName(string)
2953         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2954         - GetElValRepByName(string)
2955       * Doc/requirements.txt added.
2956
2957 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2958       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2959       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2960         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2961         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2962         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2963       * python/testSuite.py changed accordingly.
2964
2965 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2966       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2967         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2968              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2969               cannot be exported. [...]
2970               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2971               be exported. [...]
2972               This is caused by a designed limitation that once a template
2973               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2974               exported."
2975         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2976         limitation" of VC++ is a pitfall.
2977         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2978         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2979         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2980         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2981         library.
2982         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2983       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2984          dll under windows !!!!)
2985       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2986       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2987         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2988       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2989         (one) of image(s).
2990       * removed glib references
2991       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2992
2993 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2994       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2995         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2996         the files of the testsuite without using unittest.
2997       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2998       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2999       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
3000         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
3001
3002 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3003       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
3004         values, but limits itself to values which are below a user specified
3005         size (by default 1024 bytes).
3006       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
3007         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
3008         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
3009         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
3010       * python/testSuite.py
3011         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
3012         - two new examples added.
3013       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
3014
3015 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3016       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
3017         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
3018       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
3019       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
3020       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
3021
3022 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3023       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
3024         the vr was also RET.
3025       * python/testSuite.py more tests added.
3026
3027 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3028       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
3029       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
3030       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
3031         7.18 Integer types (see stdint.h)
3032         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
3033       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
3034         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
3035         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
3036         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
3037         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
3038         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
3039         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
3040         The rest of the changes we the necessary adaptations.
3041
3042 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3043       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
3044         VR files.
3045       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
3046
3047 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3048       * Adaptation for porting to VC++:
3049         - src/gdcm.h
3050           o forced to use std namespace (for string to be known)
3051           o all class use __declspec export style on WIN32
3052         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
3053           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
3054       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
3055         variable GDCM_DICT_PATH.
3056       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
3057
3058 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3059       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3060         to native Python dictionary.
3061       * python/demo/test.py:
3062         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3063         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3064       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3065         PubElVals hashing table.
3066       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3067
3068 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3069       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3070         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3071       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3072       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3073       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3074         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3075       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3076
3077 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3078       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3079         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3080         that we can import de shadow classes without errors].
3081
3082 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3083       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3084       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3085       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3086       * src/Makefile prepared for python wrapping
3087
3088 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3089       * src/gdcmHeader.cxx :
3090         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3091           (see gdcmHeader::LoadElements).
3092         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3093           ReadInt16 and ReadInt32)
3094
3095 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3096       * src/gdcmHeader.cxx :
3097         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3098           method.
3099         - SetLgrElem renamed to SetLength
3100         - GetLgrElem renamed to GetLength
3101         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3102       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3103       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3104         due to IdoDude was cleaned out.
3105
3106 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3107       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3108         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3109         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3110         returning the unecessary skL (skipped length).
3111         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3112         it was redundant with the File position internals (by using
3113         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3114         jajun.
3115       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3116         on the libido specificities which are handled through class
3117         inheritance.
3118       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3119         added.
3120
3121 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3122       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3123         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3124
3125 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3126       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3127
3128 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3129       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3130         and _IdDcmSWAP_LONG.
3131
3132 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3133       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3134         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3135