]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
Update ChangeLog
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2005-01-16 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>                  
2          * FIX 'Dictionnary' is now spelt 'Dictionary'
3                'wether' is now spelt 'whether'
4                          'archieve' is now spelt 'archive'   ;-)
5
6 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
7     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
8                related methods, in order not to expose internal mechanisms
9         InitTraversal();
10         GetNextEntry();                          
11          * REM methods that exposed internal mechanisms :
12         DicomDir::GetDicomDirPatients()
13         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
14         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
15         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
16          * UPD Test programs :
17              makeDicomDir.cxx
18              BuildUpDicomDir.cxx
19              TestDicomDir.cxx
20           * UPD Example program
21              PrintDicomDir.cxx
22     * ADD DictSet methods
23         InitTraversal()
24         GetNextEntry()
25
26 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
27    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
28          reason to have to methods, moreover with the second takeing the ostream as
29          *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
30
31 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
32    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
33          smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
34          Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
35          code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
36          working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
37          problematic getIPAddress
38
39 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
40    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
41      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
42      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
43      shared libs.
44
45 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
46    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
47      sort DICOM files
48
49 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
50    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack 
51               for dealing with BIGENDIAN processors
52                         - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
53                         When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
54                         and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
55                         PixelWriteConveror, and avoid modifying the Pixel Area.
56                         Note :
57               Probabely, the same operation will have to be done when we want 
58               to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
59               and we are working onj Little Endian Processor
60                                                 
61 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
62    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
63      table.
64    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
65    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
66      all the dict content.
67    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
68      print
69    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
70
71 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
72    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
73                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
74
75 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
76    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
77    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
78    * gdcmPython/demo/ : add a new test
79
80 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
81    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
82         * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
83         * enhancement of Example/PrintDicomDir
84
85 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
86    * Now, python test might work on systems
87    * Add the PrintDicomDir test
88
89 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
90    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
91                 Explicit Big Endian Transfer Syntax files
92           (group and elem not swaped)
93         
94 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
95    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
96                 Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
97                           begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
98                           To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
99                           Document::HandleOutOfGroup0002() method 
100          * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
101               (related pb not yet solved)
102
103 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
104    * Bug fix for the python part use
105    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
106
107 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
108    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
109
110 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
111    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
112      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
113      the transfer syntax
114
115 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
116    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
117    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
118             to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
119                  and Transfer Syntax is Big Endian
120                  We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
121          * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
122          * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
123
124 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
125    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
126    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
127    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
128    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
129    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
130    gdcm::Global would destroy at exit).
131
132 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
133    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
134          environment. static const string in a header file used to be ill
135          initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
136          issue.
137
138 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
139    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
140       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
141       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
142       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
143          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
144
145 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
146    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
147      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
148      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
149      redirected to a file (ofstream).
150    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
151      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
152
153 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
154    * Removal of useless and dangerous methods :
155          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
156          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
157         * Removal of usless methods :
158          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
159    * Commenting out of probabely useless methods :
160          Dict::GetDictEntryNames()
161          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
162          DictSet::GetPubDictEntryNames()
163          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()                      
164         * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used      
165         * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version    
166         * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
167            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
168                           Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods                        
169    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
170            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
171                                      Unused till now...                   
172         * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
173            should be used to write a method to replace the former
174            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
175
176 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
177    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
178      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
179      data in the DocEntry structure
180
181 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
182    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
183      And now use a static function call instead, with a global variable. i
184      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
185      and easier to use...hopefully
186
187 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
188    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
189
190 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
191    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
192
193 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
194    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
195      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
196
197 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
198    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
199    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
200      a file
201    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
202      when specifying the VR
203    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
204    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
205
206 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
207    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
208           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
209         * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
210         * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
211            in order to allow further VR modification by user
212    * REM : removal of once-called method File::WriteBase        
213                 integration of its code in formerly one-line method File::Write
214
215 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
216    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
217      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
218    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
219      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
220      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
221    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
222
223 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
224    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
225      empty Print Method
226    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
227
228 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
229    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
230    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
231    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
232    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
233    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
234
235 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
236    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
237      problems when compiling with the python wrapping
238
239 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
240    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
241      writting in ImplicitVR
242
243 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
244    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
245      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
246      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
247      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
248
249 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
250    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
251      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
252
253 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
254    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
255      Rename Decompressed to Raw
256    * Use the API changes in gdcm::File.
257    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
258      Memory leaks fixed
259
260 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
261    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
262      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
263      of Frames' field
264
265 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
266    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
267    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
268
269 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
270    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
271      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
272      solve it.
273
274 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
275    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
276      DocEntry. Now use methods of the Document !
277
278 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
279    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
280  
281 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
282    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
283    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
284    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
285    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
286      test to 0.0
287    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
288    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
289      containing found sequences
290
291 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
292    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
293      not at all time
294    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
295      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
296               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
297      and tests are now made on good variables
298
299 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
300    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
301    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
302      length
303    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
304    * Add vtkGdcmWriter example and test
305
306 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
307    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
308    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
309    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
310      SetValue
311    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
312    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
313
314 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
315    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
316    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
317
318 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
319    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
320      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
321      file isn't readable. 
322
323 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
324    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
325    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
326    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
327    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
328      method that is redondant with AddEntry.
329    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
330      SQItem
331
332 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
333    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
334    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
335    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
336
337 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
338    * Huge cleanup:
339      - Remove printf / sprintf
340      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
341      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
342        source
343      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
344        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
345      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
346        (plus it is not up to date)
347      - remove 'using namespace std' this is BAD !
348
349 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
350    * Remove memory leaks on the DicomDir
351    * Remove some useless data in DicomDirObject
352    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
353
354 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
355    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
356
357 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
358    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
359      future, with convertion)
360    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
361      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
362      from the output of the class
363
364 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
365    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
366
367 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
368    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
369      and vtkErrorMacro use.
370    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
371
372 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
373    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
374      file name in input
375    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
376    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
377      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
378      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
379      immediately after thee instruction.
380    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
381      file has been opened : the test must be made on the content of the 
382      pointer and not directly on the pointer !
383      Code formatting
384
385 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
386    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
387      the python part recompiles
388
389 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
390    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
391      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
392      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
393      all linux)
394
395 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
396    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
397      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
398      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
399      screen resolution, it's produce errors).
400      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
401    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
402    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
403      under windows at compilation
404    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
405      for grayscale images
406    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
407
408 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
409    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
410    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
411      tests on the image size X, Y, Z
412
413 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
414    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
415    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
416      between the class name and the file name
417
418 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
419    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
420      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
421      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
422      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
423      this variable content.
424
425 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
426    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
427      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
428      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
429      DocEntryArchive
430    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
431      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
432      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
433    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
434      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
435
436 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
437    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
438
439 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
440    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
441    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
442      the header.
443    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
444      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
445      write
446    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
447      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
448      is now on RGB data (as before my last commit
449    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
450
451 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
452    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
453      Add a print information of the type of the entry
454    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
455      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
456    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
457      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
458    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
459      any.
460    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
461
462 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
463    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
464      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
465      opened or not.
466
467 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
468    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
469      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
470    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
471      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
472      DocEntryArchive
473    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
474      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
475    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
476      - test the pixels written
477      - add test points to quickly find where is the error
478      - can set a file name input and output in arguments
479    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
480      amelioration of the test output
481
482 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
483    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
484      all replaced DocEntry's
485    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
486      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
487      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
488      header initial state.
489
490 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
491    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
492
493 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
494    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
495      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
496      then, it musn't change in the time.
497    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
498      header correctly. At this time, the change is only made for the first
499      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
500      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
501      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
502      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
503    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
504    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
505      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
506      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
507
508 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
509    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
510    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
511
512 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
513    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
514      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
515      is copied).
516    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
517      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
518    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
519
520 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
521    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
522      Two problems appear when doing it :
523       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
524         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
525         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
526         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
527         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
528         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
529         the gdcmBinEntry.
530       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
531         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
532         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
533         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
534         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
535    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
536
537 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
538    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
539    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
540      squeeze method
541
542 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
543    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
544    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
545      after it have been deleted
546
547 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
548    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
549    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
550    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
551      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
552      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
553
554 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
555     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
556     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
557     3. Use const ref when possible
558     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
559     5. A few more comments
560     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
561
562 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
563   * ENH: Slightly bigger patch:
564     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
565     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
566     3. File was not close properly in gdcmDict
567     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
568     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
569     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
570     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
571     8. Do not repeat virtual in subclasses
572     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
573
574 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
575   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
576     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
577     of a null character as defined by standard
578   
579 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
580   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
581     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
582
583 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
584   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
585   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
586     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
587
588 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
589   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
590     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
591     a verbose message is generated.
592     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
593     correctly close is a call to CloseFile.
594     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
595   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
596     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
597     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
598     header. A verbose is generated if these two size mismatch
599
600 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
601   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
602     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
603     break under windows (with msvc6 compilation).
604
605 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
606   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
607     compiling with MSVC6)
608
609 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
610   * Bugs fix for the Windows build with VC6
611   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
612     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
613     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
614     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
615   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
616     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
617     gdcm.i file)
618   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
619     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
620     std::cerr of vtk.
621
622 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
623   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
624   * gdcmPython/gdcm.i:
625     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
626     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
627       NOT need to be wrapped anymore.
628   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
629     DicomDir::Method) new example added.
630
631 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
632   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
633     A DicomString can contain as many \0 as they want
634     and it is *always* of even length.
635     We only support odd length for very rare case. 
636     And in the near future this should be removed.
637
638 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
639   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
640     little endian. This should -heopfully- fix some tests
641
642 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
643   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
644     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
645     the one comiled into lib
646
647 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
648   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
649     This should definitely solve any leak problem, and we should be
650     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
651
652 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
653   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
654   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
655   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
656   
657 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
658   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
659   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
660     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
661   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
662   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
663     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
664     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
665       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
666       no longer exists.
667
668 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
669   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
670    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
671    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
672    the class.
673   
674 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
675   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
676     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
677     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
678
679 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
680   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
681   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
682     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
683     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
684     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
685       CloseFile() anymore.
686     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
687       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
688       into File::Pixel_Data.
689
690 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
691   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
692     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
693   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
694     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
695     method:
696     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
697     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
698       method to those classes.
699     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
700       -- Added a ::Print() method.
701       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
702       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
703          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
704
705 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
706   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
707     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
708     doxygen.
709   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
710   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
711     pointlessly wrapped (see
712     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
713   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
714     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
715     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
716     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
717     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
718       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
719            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
720       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
721          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
722
723 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
724   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
725     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
726
727 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
728   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
729     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
730     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
731   * TODO added new entry.
732   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
733     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
734     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
735     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
736       variable names for semantical coherence.
737
738 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
739   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
740   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
741   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
742   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
743   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
744   compilation time jpeg option.
745
746 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
747   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
748     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
749     reproduce at home.
750   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
751   Thanks dcmtk crew !
752
753 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
754   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
755   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
756     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
757   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
758   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
759   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
760   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
761     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
762     from File:: to PixelConvert::.
763
764 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
765   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
766     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
767      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
768      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
769
770 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
771   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
772   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
773   like this:
774     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
775   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
776   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
777   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
778
779 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
780   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
781     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
782     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
783     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
784     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
785       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
786       (for the time being this is better than having them attach to
787        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
788     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
789       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
790     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
791       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
792       gdcmPixelConvert::
793
794 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
795   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
796   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
797     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
798       clean up of RLE related code. 
799   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
800     - src/gdcmRLE.cxx removed
801     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
802     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
803     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
804   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
805     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
806       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
807       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
808
809 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
810   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
811     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
812       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
813       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
814       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
815       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
816       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
817       offsets.
818   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
819     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
820         with the retired Parse7Fe0().
821     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
822     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
823
824 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
825   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
826     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
827     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
828     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
829   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
830     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
831       to return an unused length.
832
833 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
834   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
835     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
836     to use to do simple stuff.
837
838 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
839   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
840     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
841     copying of the file within different directory, configure header file to
842     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
843     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
844
845 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
846   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
847      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
848        with it's binary name).
849      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
850        the Website to be more complete.
851      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
852        doxygenated documentation.
853      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
854        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
855                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
856   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
857   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
858    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
859
860 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
861   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
862    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
863
864 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
865   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
866     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
867     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
868     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
869     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
870   * GDCMHOME clean up:
871     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
872       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
873       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
874   * Autotools clean up:
875     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
876     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
877
878 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
879   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
880   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
881   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
882
883 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
884   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
885     describing TODO entries and used it for new entries.
886   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
887     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
888     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
889   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
890     documentation itself, but the website) moved to html and
891     placed in directory Doc/Website:
892     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
893     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
894     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
895   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
896   * CMakeLists.txt changed accordingly.
897   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
898     DeveloppersPython.html
899   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
900
901 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
902   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
903     of gdcm Web site.
904
905 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
906   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
907     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
908     we can now delete[] it safely 
909   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
910     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
911   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
912
913 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
914   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
915     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
916     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
917     pointed content.
918
919 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
920   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
921   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
922
923 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
924   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
925     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
926     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
927     an example of usage.
928     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
929       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
930     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
931       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
932     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
933     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
934     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
935
936 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
937   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
938     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
939     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
940     in class 
941     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
942       and associated accessors. Doxygenation of the class.
943     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
944       accessors added.
945     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
946       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
947     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
948     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
949
950 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
951   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
952     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
953       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
954            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
955            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
956            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
957            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
958            the same group and element all share the same (group, element)
959            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
960            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
961            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
962            consider the following definition of a TagKey:
963            - let Group, Element be the string representation of the
964              group and element dicom tag members,
965            - let ItemNumber be the string representation of the integer
966              index of the considered item number of a sequence,
967            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
968            the form:
969               /ItemNumber#Group|Element
970            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
971            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
972               Group|Element<SeqTag>
973            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
974            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
975            string e.g.
976                0028|1201
977            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
978            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
979            string e.g.
980                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
981     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
982       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
983       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
984     - src/gdcmDocEntry.cxx:
985       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
986          Key member.
987       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
988     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
989     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
990       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
991       -- now has a new BaseTagKey member.
992       -- STYLE.
993   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
994     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
995     truly belongs.
996     This poses the problem with the semantics of the following lines
997        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
998        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
999        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
1000     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
1001     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
1002     order to get things working the dicom dictionary was altered !
1003     Please fix things urgently...
1004   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
1005     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
1006     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
1007     set to OW:
1008       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
1009       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
1010       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
1011   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
1012     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
1013   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
1014
1015 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1016   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
1017
1018 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1019   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
1020     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
1021   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
1022   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
1023
1024 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1025   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
1026     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
1027   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
1028     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
1029   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1030     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1031   * TODO updated
1032   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1033     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1034   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1035   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1036     exception_on_error parameter.
1037     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1038     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1039     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1040
1041 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1042   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1043   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1044     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1045   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1046   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1047   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1048     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1049   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1050
1051 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1052   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1053     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1054
1055 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1056   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1057        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1058  
1059 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1060   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
1061         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1062
1063 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1064    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1065    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1066      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1067      is now in static in the gdcmDebug class
1068    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1069    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1070
1071 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1072    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1073      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1074    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1075      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1076      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1077      that displays position and size).
1078    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1079      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1080      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1081      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1082      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1083      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1084      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1085         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
1086      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1087      commiting changes).
1088    * Test/CMakeLists.txt:
1089       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1090       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1091         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1092         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1093    * TODO updated.
1094
1095 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1096    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1097      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1098      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1099      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1100      - removal of typedef duplication.
1101      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1102      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1103    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1104       - printf polluting ctest removed.
1105       - TAB removal for comminting
1106    * Test:
1107      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1108        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
1109        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1110        this test creates them.
1111        Note: we need to validate each reference image, but before that
1112              I'd like to rename them with a more explicit name...
1113      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1114    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
1115      including each header needed).
1116
1117 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1118    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1119      test suite to the Example directory. Are concerned:
1120      - PrintHeader.cxx
1121      - TestDcm2Acr.cxx
1122      - TestFindTags.cxx
1123      - TestWrite.cxx was
1124      - TestWriteSimple.cxx
1125    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1126      image gdcmData/oldACR00001.ima
1127
1128 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1129    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1130      with removal from gdcmData):
1131       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1132       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1133       - US.3405.1.dcm
1134      Added the following because after last cvs update, they cause
1135        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
1136      to segfault:
1137       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1138       - oldACR00001.ima
1139    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1140      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1141      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1142      form of test...
1143    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1144      we don't need to black list the following images anymore:
1145       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1146       - OT-PAL-8-face.dcm
1147       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1148    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1149      fixes and the beautified code ;-)
1150      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1151      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1152      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1153            improve the test suite). The bug could be detected by using
1154            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1155            or by using
1156            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1157            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1158
1159 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1160    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1161          - replace by uggly but working old code :-(
1162    A lot of things should be OK again.
1163    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
1164    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1165    (twice, withing a fortnigh ...)      
1166
1167 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1168    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1169      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1170    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1171      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1172      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1173                    - OT-PAL-8-face.dcm
1174                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1175    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1176      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1177      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1178      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1179      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
1180      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1181      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1182      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1183      image.
1184    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1185      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1186      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1187      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1188    
1189 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1190   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1191   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
1192                           (instead of infinite loop)
1193   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
1194
1195 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1196    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1197
1198 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1199    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1200            when SamplesPerPixel =3
1201          - now Write is no longer confused by 
1202           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1203          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
1204                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1205    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
1206            (in order to split the job that has not to be done 
1207            for gdcmDicomDir)
1208
1209 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1210    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1211      loop on the same image until memory went out. 
1212      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1213    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1214      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1215
1216 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1217    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
1218             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1219             is added a the end, when necessary.
1220             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
1221               now written correctly
1222             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
1223               (even for odd groups) 
1224         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1225                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1226
1227 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1228    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1229    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
1230      coding style).
1231
1232 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1233    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1234      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1235    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1236
1237 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1238    FIX : gdcmDocument.cxx
1239       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1240         code 'beautyfication' :-(
1241       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1242
1243 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1244    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
1245             : to allow user to create his own Sequences
1246    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1247
1248    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1249
1250    - gdcmBinEntry
1251      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1252   
1253    - gdcmDocEntry
1254      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1255      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1256   
1257    - gdcmDocEntrySet
1258      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1259      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1260      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1261      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1262      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
1263      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1264                                             guint16 element,
1265                                             std::string vr     = "unkn",
1266                                             std::string fourth = "unkn",
1267                                             std::string name   = "unkn"); 
1268      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
1269      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1270      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1271      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
1272      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1273      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1274      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1275      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1276   
1277    - gdcmDocument
1278      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1279      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1280      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1281      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1282      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1283                                         FILE *_fp, FileType type);
1284      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1285      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1286      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1287      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1288      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1289      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1290      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1291      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1292                                             guint16 element,
1293                                             std::string vr     = "unkn",
1294                                             std::string fourth = "unkn",
1295                                             std::string name   = "unkn");
1296      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1297      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1298      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1299      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1300                                                                                                                  
1301         - gdcmElementSet
1302           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1303           
1304    - gdcmSeqEntry
1305           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1306  
1307    - gdcmSQItem
1308      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1309      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
1310      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1311      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1312
1313    - gdcmValEntry
1314          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
1315                                   
1316 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1317     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1318       The default constructor invoked by the line
1319          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1320       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1321       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1322       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1323     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1324       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1325       Could anyone explain why ?
1326     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1327       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
1328       code related to gdcmBinEntry).
1329
1330 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1331     * In order to fix memory leaks:
1332      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1333        some delete calls.
1334      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1335      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1336        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1337        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1338        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1339      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1340      - src/gdcmDocument.cxx:
1341        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1342           from dynamic stores.
1343        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1344           was causing memory leaks.
1345      - src/gdcmSQItem.cxx:
1346        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1347           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1348        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1349           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1350           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1351           This avoids SegFaulting.
1352      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1353     * Conclusion:
1354      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1355        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1356        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1357      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1358        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1359      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1360        segfaults).
1361     * Erroneous leading white fix:
1362      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1363        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1364      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1365      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1366     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1367     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1368
1369
1370 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1371     * In order to fix writing of dicom files:
1372      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1373      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1374      - src/gdcmDocument.cxx:
1375        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1376        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1377        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1378           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1379           manner.
1380        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1381           to only declared) and build on top of
1382           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1383        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1384      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1385        for usage in destructor and treatement of promotion in
1386        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1387      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1388       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1389     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1390       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1391       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1392       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1393
1394 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1395     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1396       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1397       learned that:
1398           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1399           soon as possible by globally disabling memory caching.
1400           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1401           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1402       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1403       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1404       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1405     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1406       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1407       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1408       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1409         with 1.
1410       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1411       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1412       understand why the list is empty...).
1413     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1414     * Doc/License.txt added.
1415
1416 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1417     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1418       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1419         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1420         the padding problem.
1421       - general clean up, simplification, and coding style.
1422       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1423     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1424
1425 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
1426    *  gdcmSeqEntry.cxx
1427            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1428                 - fix the display of SQItem ordinal number
1429       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1430                 - remove some useless never written private methods     
1431                 
1432 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1433    * gdcmBinEntry.cxx 
1434       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1435            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1436               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1437                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1438    * dcmDocument.cxx
1439       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1440               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1441            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1442       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1443    * gdcmFile.cxx
1444       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1445    * gdcmSQItem.h
1446       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1447             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1448             \warning : some pb remaining around this number
1449                                 will be solved asap
1450       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1451    * gdcmValEntry.cxx 
1452       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1453
1454 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1455     * Memory leak hunt with the following command:
1456       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1457                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1458       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1459       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1460       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1461           grep "MEMORY LEAK" src/*
1462       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1463       -----
1464           #include <string>
1465           int main() {
1466              std::string name;
1467              char * test = "babo";
1468              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1469                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1470              name.clear();   //// Doesn't help !
1471              return 0;
1472           }
1473       -----
1474           #include <string>
1475           #include <iostream>
1476           int main() {
1477              std::string line;
1478              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1479              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1480                                         //// of 1320 bytes in call to
1481                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1482             return 0;
1483           }
1484       -----
1485
1486
1487 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1488     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1489       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1490         and related, moved away to gdcmDocument.
1491       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1492         the corresponding protected accessors of inherited class
1493         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1494         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1495       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1496       - Clean up of undefined or unused methods.
1497     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1498       account the changes to gdcmHeader.h).
1499     * src/gdcmDocument.h:
1500       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1501         changes to gdcmHeader.h).
1502       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1503         (see changes to gdcmHeader.h).
1504       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1505       - Clean up of undefined or unused methods.
1506     * src/gdcmDocument.cxx:
1507       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1508       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1509       - some std::string properly set to VRKey
1510     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1511       references to gdcmDocument. 
1512     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1513     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1514       cvs repository gdcmData.
1515
1516 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1517     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1518     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1519       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1520     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1521     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1522       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1523     * src/gdcmDocument.cxx: 
1524       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1525         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1526       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1527         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1528         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1529         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1530         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1531               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1532               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1533     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1534     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1535       now taken into account.
1536     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1537       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1538     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1539       on posix.
1540     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1541       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1542     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1543
1544 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1545     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1546       gdcmGlob
1547     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1548     * src/gdcmUtil.h : export methods
1549
1550 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1551     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1552       to right behavior
1553     * Initial addition of automatic python testing
1554     * Initial addition of automatic image comparison
1555
1556 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1557     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1558       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1559
1560 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1561      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1562      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1563      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1564
1565 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1566      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1567        new concepts (and new classes) :
1568        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1569         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1570         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1571        a Sequence is composed of Items.
1572        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1573        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1574        (never taken into account)
1575        Our unability to add a new 'entry' in the header
1576        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1577        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1578        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1579        nothing is finished.
1580        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1581
1582 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1583      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1584      
1585 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1586      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1587        file prefix (SetFilePrefix)
1588
1589 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1590      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1591        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1592        baseline.
1593      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1594        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1595
1596 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1597      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1598        dicom image
1599
1600 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1601      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1602      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1603        between the developper and user version.
1604      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1605      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1606
1607 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1608      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1609        when using cmake.
1610
1611 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1612      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1613                src directory, now generated in the build dir.
1614             2. Tests as mentionned smarter
1615             3. Some clean up
1616             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1617           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1618           where we could set the institution name / patient name...
1619
1620        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1621               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1622                  (this was not true before)
1623
1624 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1625      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1626            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1627      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1628            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1629            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1630      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1631            tree-like structure of a Dicom Header.
1632      * FIX Test code cleaning     
1633            
1634 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1635      * ENH: Adding automatic testing
1636        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1637        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1638        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1639        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1640           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1641           too many projects
1642      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1643      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1644        one file instead of seven + some small cleanup
1645
1646 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1647      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1648      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1649            Header printing. Example given with :
1650            > PrintHeader fileName  2 new
1651           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1652            
1653 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1654      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1655          1. I have added some unsigned where needed
1656          2. Some function parameter not used -> (void)
1657          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1658          4. g++ don't like character '\' in comment
1659          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1660                     this really need to be fixed
1661          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1662          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1663                     this also really need to be fixed
1664          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1665                     remove compression file 
1666                     (as we only do decompression, right ?)     
1667      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1668
1669 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1670      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1671            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1672            defaulted to yspacing
1673            
1674 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1675      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1676      * ENH add parameters :
1677                bool  exception_on_error = false, 
1678                bool  enable_sequences   = false,
1679                bool  ignore_shadow      = false
1680            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1681      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1682            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1683               
1684 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1685      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1686      
1687 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1688      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1689      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1690              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1691              
1692 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1693      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1694          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1695
1696 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1697      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1698        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1699        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1700        in gdcmHeader.
1701      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1702        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1703        already does the job.
1704      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1705        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1706
1707 2004-03-30 Benoit Regrain
1708      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1709        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1710        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1711
1712 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1713      * ENH : Check on file type to be written moved
1714              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1715      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1716              when end-of-list is reached
1717            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1718
1719 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1720      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1721      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1722      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1723        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1724
1725 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1726      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1727        now contains all the gdcmGlobal related code.
1728      * minor coding style and doxygenation changes.
1729
1730 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1731      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1732        now contains all the Debug related code.
1733      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1734      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1735        CreateCleanString) removed.
1736      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1737      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1738      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1739      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1740        src/gdcmDirList.cxx)
1741
1742 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1743      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1744
1745 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1746      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1747            big endian made volumes
1748      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1749            end user to instanciate class gdcmParser
1750           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1751
1752 2004-03-22 Benoit Regrain
1753      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1754      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1755              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1756
1757 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1758      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1759            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1760            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1761            or build from the files held (recursively) in a Directory
1762            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1763            gdcmObject::SetBoundaries() added
1764
1765 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1766      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1767                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1768      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1769            DICOMDIR
1770      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1771            about the name
1772
1773 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1774      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1775                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1776
1777 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1778      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1779            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1780            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1781            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1782            to allow making gdcDicomDir object.
1783      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1784           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1785
1786 2004-02-11 Benoit Regrain
1787      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1788              when using from python
1789
1790 2004-02-10 Benoit Regrain
1791      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1792      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1793      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1794              directory parsing
1795
1796 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1797      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1798              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1799              - class gdcmMeta created
1800      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1801              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1802      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1803
1804 2004-02-05 Benoit Regrain
1805      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1806              header entries
1807      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1808      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1809
1810 2004-02-04 Benoit Regrain
1811      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1812      * FIX : sort the images in the dicom dir
1813      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1814      * ADD : a python demo
1815
1816 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1817      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1818      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1819              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1820              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1821              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1822      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1823            to make full checking easier
1824         
1825 2004-02-04 Benoit Regrain
1826      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1827      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1828
1829 2004-02-03 Benoit Regrain
1830      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1831      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1832      * Bug fix and print add-on
1833
1834 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1835      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1836      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1837      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1838      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1839            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1840         
1841 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1842      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1843              iterator on last
1844              of the last synonym :-(
1845      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1846              for DICOMDIR ;-)
1847      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1848      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1849      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1850            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1851       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1852
1853 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1854      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1855            no longer writes 'Un' on disk
1856      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1857      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1858            the length (for Palette expanded images)
1859            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1860      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1861            (that broke Write). Replaced by UL.
1862            Aware user will reload the field if he 
1863            thinks it's necesssary
1864              
1865 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1866      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1867        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1868        IsReadable() methods.
1869        
1870      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1871       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1872       but so usefull for people that miss them ;-)
1873       
1874      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1875        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1876
1877 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1878      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1879
1880 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1881      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1882              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1883         The TRUE value for this param has to be used 
1884         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1885         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1886      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1887              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1888         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1889         
1890      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1891              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1892              Fixed
1893
1894      * gdcmHeader add the method
1895              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1896         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1897         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1898         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
1899
1900 2004-01-26 Benoit Regrain
1901      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1902        in the print and add a third level of print to print them
1903
1904 2004-01-23 Benoit Regrain
1905      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1906      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1907      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1908        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1909
1910 2004-01-22 Benoit Regrain
1911      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1912      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1913
1914 2004-01-19 Benoit Regrain
1915      * Add the use of shadow dictionaries
1916      * bug fix and coding style
1917
1918 2004-01-19 Benoit Regrain
1919      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1920      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1921      * Add the update of header entries using the shadow library
1922
1923 2004-01-19 Benoit Regrain
1924      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1925      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1926        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1927        of dicom dir parsing
1928      * bug fix under python
1929
1930 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1931     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1932     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1933     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1934     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1935
1936 2004-01-15 Benoit Regrain
1937      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1938        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1939        when the gdcmDictSet will be destroyed
1940      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1941        gdcmDictSet
1942
1943 2004-01-15 Benoit Regrain
1944      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1945        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1946        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1947        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1948      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1949
1950 2004-01-14 Benoit Regrain
1951      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1952      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1953      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1954      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1955
1956 2004-01-13 Benoit Regrain
1957      * src/*.[h|cxx] : coding style
1958      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1959
1960 2004-01-13 Benoit Regrain
1961      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1962      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1963        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1964      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1965
1966 2004-01-12 Benoit Regrain
1967      * src/*.h : add comments
1968      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1969      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
1970        directly setted in the source code
1971      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
1972        gdcmTS and gdcmVR
1973
1974 2004-01-09 Benoit Regrain
1975      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1976      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1977
1978 2004-01-07 Benoit Regrain
1979      * Modification to compile with the distutils.
1980      * Bug fix in code
1981
1982 2003-12-10 Benoit Regrain
1983      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1984        can use a gdcmHeaderHelper to load data
1985      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1986        made in the source code
1987
1988 2003-12-10 Benoit Regrain
1989      * Update Windows projects and .cvsignore files
1990
1991 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1992      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1993            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1994            if he wants to.
1995            gdcmElValSet:Print takes it into account
1996
1997 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1998      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1999      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
2000      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
2001
2002 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
2003       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
2004              on the ListTag listElem member,
2005              not longer on the TagElValueHT tagHt member
2006       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
2007              with the tagHt member and the listElem member.
2008              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
2009
2010       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
2011              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
2012                             if bug fixing is necessary), for internal
2013                             use only
2014              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
2015                             or to allow Parser going on.
2016              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
2017              with a length (not 0000) is found
2018       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
2019                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
2020                 (to be written)
2021
2022 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
2023      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
2024      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
2025           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
2026      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
2027
2028 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2029      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2030
2031 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2032      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2033           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2034
2035 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2036      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2037      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2038              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2039              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2040
2041 2003-11-05 Benoit Regrain
2042      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2043                        : Explicit error messages
2044      * in __init__.py  : Related modif
2045
2046 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2047      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2048            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2049            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2050      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2051                     (vtkGdcmReader compliant)           
2052       
2053 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2054      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2055        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2056        
2057 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2058      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
2059            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2060
2061 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2062      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
2063                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2064              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2065              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2066              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2067              such an image :
2068              After gdcmHeader :
2069               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2070               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2071               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2072      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2073              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2074
2075 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2076      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2077              
2078 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2079      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
2080            being coherents dicom files.
2081      
2082 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2083      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2084            from medcon lib !
2085      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
2086      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2087      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2088      * ENH: Add include dir to medcon lib
2089      * FIX: only one function is being exported for now ! 
2090            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2091             
2092 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2093       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2094         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2095           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2096       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2097
2098 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2099       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2100         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2101         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2102       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2103       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2104
2105 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2106       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2107                                                
2108 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2109       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2110       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2111       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2112       
2113 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2114       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2115       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2116       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2117       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2118       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2119       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
2120              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2121         But it fasten debug compilation time.
2122             
2123 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2124       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2125         (they are compressed as 2 planes images, 
2126          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2127
2128 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2129       * Now CheckRead takes into account :
2130          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2131          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2132       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2133        (breaks DicomWorks)
2134
2135 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2136       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
2137              one should remove the '\'
2138         
2139 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2140       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
2141         (wrong lengths in header)
2142         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2143       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2144         (breaks DicomWorks)
2145
2146 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2147       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
2148         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2149
2150 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2151       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2152       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2153
2154 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2155       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2156      
2157 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2158       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2159         (the patch is easy to remove)
2160       * cosmetic changes to avoid warnings
2161       
2162 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2163       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
2164         no need to press 'r' now.
2165    
2166 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2167       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2168         to new Jpeg Lossless decompressor
2169       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2170       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2171       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2172                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
2173 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2174       * general anonymisation in gdcmData
2175       * adding the 'color files' from
2176         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2177       * adding some well knowed bugged-header images
2178       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2179         waiting for their inclusion in Python testsuite
2180
2181 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2182     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2183       no longer seg faults when file is not found
2184
2185 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2186      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
2187        MultiFrame images
2188
2189 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2190      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2191
2192 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2193      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2194         OpenFile takes it into account
2195      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2196      * Missing elements added in dicomV3.dic
2197       (just to be affraid : have a look at
2198        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2199        and do it again next year ;->
2200
2201 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2202      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
2203        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2204        But there are NOT. It's fixed !
2205        
2206 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2207      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2208      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
2209          
2210 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2211      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2212              an ACR-NEMA / DICOM one.
2213      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
2214              is not gdcm Readable
2215      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
2216              is now decoded.
2217         
2218 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2219      * FIX: CMake generate now documentation
2220      * ENH: out of source doc build !
2221      * ENH: Generate both user and dev documentation
2222      * ENH: Should work on windows too
2223      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
2224      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
2225      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2226      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
2227                      
2228 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2229      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2230      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2231      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
2232         window level & window width
2233
2234 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2235      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2236      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2237      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2238      
2239 2003-10-06  Emanuel Ollart
2240      * FIX : compilation process wad broken.
2241              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2242         
2243 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2244      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2245      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2246      
2247 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2248      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2249            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2250                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2251       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2252
2253 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2254       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
2255         to remain compliant with already defined strings, 
2256         like Transfert Syntax UID and others)
2257
2258 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2259       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2260              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2261         
2262 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2263       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2264       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2265
2266 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2267       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2268         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2269               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2270       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2271
2272 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2273       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2274
2275 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2276       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2277         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2278
2279 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2280       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2281          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2282          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2283          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2284           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
2285                                             YBR_RCT files.
2286           (no sample found :-(
2287
2288 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2289       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2290         Two reasons: - clear things
2291                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2292                        suffer anymore VC++ complains
2293
2294 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2295       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2296       * removed leaks
2297
2298 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2299       * The lines are now eigthy characters long.for 
2300         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
2301
2302 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2303       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2304         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2305         previous commis of Malaterre)
2306       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2307         before the last Malaterre's commit.
2308
2309 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2310       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2311         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2312       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2313         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2314
2315 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2316       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2317         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2318         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2319
2320 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2321       * Cosmetic changes:
2322         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2323           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2324           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2325           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2326         - PACKAGER corrected
2327         - DEVELOPPER added.
2328         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2329       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2330
2331 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2332       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2333
2334 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2335       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2336
2337 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2338       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2339
2340 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2341       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2342
2343 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2344       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2345         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2346         heuristics to get informations (look at different places).
2347       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2348         sorting DICOM images based on different strategies.
2349       * modified Makefiles accordingly.
2350
2351 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2352       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2353         when building in debug mode
2354       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2355         src/win32/gdcmdll.dsp
2356       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2357
2358 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2359       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2360             to valgrind.
2361
2362 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2363       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2364       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
2365                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2366       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2367
2368 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2369       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2370         the file
2371       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2372       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2373         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2374       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2375         symbols... future problem ?
2376
2377 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2378       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2379       * modified gdcm.dsw accordingly
2380
2381 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2382       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2383
2384 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2385       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2386         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2387       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2388         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2389         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2390
2391 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2392       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2393
2394 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2395       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2396       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2397       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2398       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2399       * PACKAGER : adding all concerning windows
2400
2401 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2402       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2403         garbage debug code.
2404       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2405       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2406         test suite reported error.
2407       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2408         packaging a new release).
2409       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2410       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2411       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2412         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2413         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2414
2415 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2416       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2417       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2418
2419 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2420       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2421         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2422         is made in an internal list to prevent this problem.
2423         Bug fix when output is empty.
2424         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2425         correction.
2426       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2427
2428 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2429       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2430       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2431         files. Added method to remove all files on the input
2432         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2433         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2434
2435 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2436       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2437         when using make instal.
2438       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2439         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2440
2441 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2442       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2443       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2444
2445 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2446       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2447         linux and WINDOWS !
2448       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2449       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2450
2451 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2452       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2453         addon of the jpeg library)
2454       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2455       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2456       * INSTALL now points to web documentation
2457
2458 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2459       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2460         gdcmUtil.h anymore.
2461       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2462         clean target.
2463       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2464         - to allow compilation with gcc 3.x
2465           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2466           -- small fixes on exceptions.
2467           Note: linking not tested !
2468         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2469           building stage.
2470       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2471         dependent convertion).
2472
2473 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2474       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2475         Changelog):
2476         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2477         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2478           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2479         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2480
2481 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2482       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2483         compile
2484       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2485         (FileName -> Filename)
2486
2487 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2488       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2489         - UpdateProgress method should now be effective
2490         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2491           to volumes),
2492         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2493           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2494           accelerating things).
2495         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2496           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2497           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2498           in the stack (for the caller to notice the problem).
2499
2500 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2501       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2502
2503 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2504       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2505         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2506         under Windows... thanks Windows !)
2507
2508 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2509       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2510         debug stage).
2511       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2512
2513 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2514       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2515
2516 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2517       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2518         called with different flags than the default ones (with automake).
2519         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2520            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2521         and went for warning fixes:
2522         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2523           up from unused variables.
2524         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2525       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2526
2527 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2528       * gdcmPython/gdcm.i:
2529         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2530           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2531           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2532         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2533           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2534           exported to Python a as cvar.
2535       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2536         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2537         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2538         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2539         C++ static methods).
2540       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2541         with the above changes.
2542
2543 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2544       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2545
2546 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2547       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2548         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2549         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2550          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2551          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2552            a wrapper
2553          - Wrapper interface which wrap sources
2554         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2555         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2556       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2557         files for compilation
2558
2559 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2560       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2561         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2562         - vtk/Makefile.am now builds a library
2563         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2564           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2565           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2566           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2567           import library.
2568         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2569           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2570           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2571           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2572           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2573         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2574           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2575         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2576           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2577       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2578       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2579         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2580         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2581         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2582         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2583         collision of various stl members (principally cout...).
2584       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2585         file.
2586       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2587         comply with above changes)
2588
2589 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2590       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2591       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2592         vtk data structure (an image Flip was required).
2593       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2594       * cosmetic changes in documentation.
2595
2596 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2597       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2598         unexisting file is given as argument.
2599       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2600         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2601         containing those images is now available at
2602           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2603         with the name gdcmData.
2604         All the python scripts (including the package initialisation file
2605         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2606         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2607
2608 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2609       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2610         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2611         demo of the usage of this class.
2612         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2613         at configure (or autogen.sh) stage.
2614
2615 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2616       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2617         Notes on valgrind:
2618           - maximum info is obtained with a command of the form:
2619             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2620                      --show-reachable=yes PrintHeader
2621           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2622             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2623             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2624             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2625              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2626       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2627         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2628         Note: some images don't seem to work e.g.
2629             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2630       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2631         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2632         make gdcm more thread friendly.
2633
2634 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2635       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2636           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2637         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2638           gdcmHeader::_dicom_vr.
2639         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2640         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2641           VRHT*.
2642         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2643
2644 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2645       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2646         make install stage.
2647
2648 2003-04-9 JPR
2649       * UpdateGroupLength replaced by new one
2650
2651 2003-04-7 JPR
2652       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2653         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2654
2655 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2656       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2657       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2658       * src:
2659         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2660         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2661           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2662         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2663           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2664           carried the same semantics.
2665           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2666         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2667           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2668         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2669       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2670       * gdcmGetXSize added
2671       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2672       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2673
2674 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2675       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2676         (to avoid double call by end user).
2677       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2678         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2679
2680 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2681       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2682         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2683           the html.users end users oriented documentation and
2684           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2685           oriented documentation.
2686         - README changed accordingly
2687         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2688         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2689           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2690         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2691           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2692           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2693       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2694         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2695       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2696         ill-formed documentation sections.
2697       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2698
2699 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2700       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2701       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2702         un*ces with sh-utils test utility.
2703       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2704       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2705       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2706       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2707       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2708
2709 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2710       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2711       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2712
2713 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2714       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2715       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2716       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2717       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2718         compilation work.
2719       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2720       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2721
2722 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2723       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2724         hence the user doesn't need this explicit call.
2725         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2726           i.e. LoadElements() call removed.
2727       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2728         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2729       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2730         for adding user defined new tags.
2731         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2732         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2733           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2734
2735 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2736       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2737         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2738         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2739         with the autotools, included the python wrappers part.
2740       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2741
2742 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2743       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2744
2745 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2746       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2747         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2748         for usage).
2749       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2750         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2751         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2752       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2753         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2754
2755 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2756       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2757         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2758         value of GDCM_DICT_PATH.
2759       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2760
2761 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2762       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2763       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2764       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2765         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2766         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2767
2768 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2769       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2770         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2771         gdcmHeader.h
2772       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2773         (as opposed to gdcm.h)
2774       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2775       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2776         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2777       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2778
2779 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2780       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2781         bug.
2782
2783 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2784       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2785         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2786         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2787         of hidding away the python related distutils specific files
2788         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2789         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2790         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2791         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2792
2793 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2794       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2795       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2796         among the list of sources.
2797
2798 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2799       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2800       * modifications in MSVC projects
2801
2802 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2803       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2804         looks like we can move back to original usage of exception within
2805         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2806         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2807       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2808         README file for usage added.
2809       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2810         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2811         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2812         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2813       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2814       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2815         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2816           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2817           Dicom public dictionary were not accessible without an
2818           instance of class gdcmHeader.
2819         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2820           require no instances at all to be invocated.
2821         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2822           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2823           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2824       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2825         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2826       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2827         the above to be effective.
2828       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2829         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2830       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2831         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2832         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2833         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2834         (for python dectection).
2835       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2836         now avoids publishing the empty entries.
2837
2838 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2839       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2840         ExtraPath reused :-P
2841       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2842
2843 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2844       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2845       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2846       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2847         and links
2848
2849 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2850       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2851         method. Doxygenation.
2852       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2853
2854 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2855       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2856         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2857         when using "python setup.py install".
2858       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2859         reexports the working classes.
2860       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2861         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2862         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2863         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2864         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2865         subdir (see the README file). This problem probably due to
2866         an combination of g++ and dynamic loading.
2867       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2868
2869 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2870       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2871         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2872         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2873         again in a python subdir, but the package itself is now in
2874         python/gdcmPython.
2875       * setup.py was cleaned up:
2876         - pythonIncludePath removed
2877         - python setup.py bdist target is now functional.
2878       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2879         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2880         accordingly.
2881
2882 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2883       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2884       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2885         distutils installer is operational.
2886       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2887           shadow classes (from gdcm.py).
2888         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2889           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2890         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2891
2892 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2893       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2894         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2895         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2896         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2897         dictionary.
2898         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2899           are now in the "???" group.
2900         - python/gdcm.i changed accordingly,
2901         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2902           of the above new functionalities in Python.
2903
2904 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2905       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2906         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2907           were definitively removed.
2908         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2909       * src/gdcmElValSet.cxx:
2910         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2911         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2912         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2913         - Added GetElementByName(string).
2914       * src/gdcmHeader.cxx: added
2915         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2916         - GetPubElValRepByName(string)
2917         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2918         - GetShaElValRepByName(string)
2919         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2920         - GetShaElValRepByName(string)
2921         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2922         - GetElValRepByName(string)
2923         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2924         - GetElValRepByName(string)
2925       * Doc/requirements.txt added.
2926
2927 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2928       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2929       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2930         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2931         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2932         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2933       * python/testSuite.py changed accordingly.
2934
2935 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2936       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2937         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2938              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2939               cannot be exported. [...]
2940               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2941               be exported. [...]
2942               This is caused by a designed limitation that once a template
2943               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2944               exported."
2945         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2946         limitation" of VC++ is a pitfall.
2947         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2948         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2949         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2950         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2951         library.
2952         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2953       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2954          dll under windows !!!!)
2955       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2956       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2957         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2958       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2959         (one) of image(s).
2960       * removed glib references
2961       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2962
2963 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2964       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2965         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2966         the files of the testsuite without using unittest.
2967       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2968       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2969       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2970         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2971
2972 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2973       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2974         values, but limits itself to values which are below a user specified
2975         size (by default 1024 bytes).
2976       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2977         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2978         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2979         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2980       * python/testSuite.py
2981         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2982         - two new examples added.
2983       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2984
2985 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2986       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2987         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2988       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2989       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2990       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2991
2992 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2993       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2994         the vr was also RET.
2995       * python/testSuite.py more tests added.
2996
2997 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2998       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2999       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
3000       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
3001         7.18 Integer types (see stdint.h)
3002         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
3003       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
3004         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
3005         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
3006         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
3007         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
3008         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
3009         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
3010         The rest of the changes we the necessary adaptations.
3011
3012 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3013       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
3014         VR files.
3015       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
3016
3017 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3018       * Adaptation for porting to VC++:
3019         - src/gdcm.h
3020           o forced to use std namespace (for string to be known)
3021           o all class use __declspec export style on WIN32
3022         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
3023           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
3024       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
3025         variable GDCM_DICT_PATH.
3026       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
3027
3028 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3029       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3030         to native Python dictionary.
3031       * python/demo/test.py:
3032         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3033         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3034       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3035         PubElVals hashing table.
3036       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3037
3038 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3039       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3040         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3041       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3042       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3043       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3044         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3045       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3046
3047 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3048       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3049         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3050         that we can import de shadow classes without errors].
3051
3052 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3053       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3054       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3055       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3056       * src/Makefile prepared for python wrapping
3057
3058 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3059       * src/gdcmHeader.cxx :
3060         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3061           (see gdcmHeader::LoadElements).
3062         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3063           ReadInt16 and ReadInt32)
3064
3065 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3066       * src/gdcmHeader.cxx :
3067         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3068           method.
3069         - SetLgrElem renamed to SetLength
3070         - GetLgrElem renamed to GetLength
3071         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3072       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3073       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3074         due to IdoDude was cleaned out.
3075
3076 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3077       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3078         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3079         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3080         returning the unecessary skL (skipped length).
3081         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3082         it was redundant with the File position internals (by using
3083         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3084         jajun.
3085       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3086         on the libido specificities which are handled through class
3087         inheritance.
3088       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3089         added.
3090
3091 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3092       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3093         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3094
3095 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3096       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3097
3098 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3099       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3100         and _IdDcmSWAP_LONG.
3101
3102 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3103       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3104         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3105