]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* Builder/ : add something to facilitate the RPM creation of gdcm
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2005-04-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2    * Builder/ : add something to facilitate the RPM creation of gdcm
3
4 2005-04-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
5    * Fix gdcmDirList::IsDirectory. Apparently borland did not like the ending
6          '/'
7    * Also fix compilation on gcc 3.3.5 does not have ios::failure either ...
8
9 2005-04-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
10    * vtk/vtkGdcmWriter fix bug when writing spacing. The Y spacing comes first
11            then the X spacing.
12          * Fix compilation on gcc 2.96 (which does not have ios::failure)
13
14 2005-04-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
15    * src/gdcmDictGroupName.[h|cxx] : add a correlation between a group (number)
16      and it's representation name (for the NIH)
17
18 2005-03-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
19    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : problems of around of double to uint8, when
20      conversion of YBR to RGB pixels. So, now, the conversion is made using 
21      integers only
22
23 2005-03-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
24    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : now use test files (invented file
25      format) to replace 'at-run' dicom files generated by the 
26      TestAllReadCompareDicom test
27
28 2005-03-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
29    * src/gdcmFileHelper.cxx : remove memory leaks and bugs when writing files
30
31 2005-02-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
32    * src/gdcmFileHelper.cxx : JPR bad personal choices fix
33
34 2005-02-11 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
35    * Testing/TestMAkeIcon.cxx : complete the test
36
37 2005-02-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
38    * Testing/TestWriteSimple.cxx, TestSequence.cxx : fix memroy leaks
39
40 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
41    * src/gdcmFileHelper.[h|cxx] : now correctly set the VR of the datas when 
42      writting the file
43
44 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
45    * Test/VTKTestWriteSeq.cxx : add a VTK test to write sequences
46
47 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
48    * Test/ : accelerate tests (it's not very significant accelerations).
49      Remove TestCopyDicom that is redundant with TestCopyRescaleDicom
50
51 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
52    * Testing/TestSequence.cxx : add test for sequences of images... test that
53      we have the same serie or the same study UID
54
55 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
56    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Now string are correctly converted in python
57      string type
58    * src/gdcmDict.h : remove commented code
59    * src/gdcmDocument.cxx : initialize values
60    * src/gdcmFile.cxx : bug fix when reading values
61    * gdcmPython/demo/ : change file names. Remove useless files
62
63 2005-02-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
64    * src/gdcmFile.cxx : remove the default array of initialization.
65      The static array contained pointers to non-static values (comming from
66      strings). To have coherences, when creating files, these values can't be
67      static. So, the array can't be static, too ! To simplify, the array have
68      been replaced by repeted lines to insert values in the File
69
70 2005-02-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
71    * src/gdcmBinEntry.cxx : bug fix for BIG_ENDIAN part when writing the content
72    * gdcmPython/gdcm.i : rename gdcmHeader to gdcmHelper
73
74 2005-02-02 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
75    * FIX SQItem::AddEntry inserts now *in the right place* any Entry
76               (Dicom Element) into the Sequence Item
77
78 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
79    * src/*.cxx : first parss to normalize file organisation
80
81 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
82    * src/gdcmDirList.[h|cxx] : add method to find a directory
83    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : bug fix under Windows
84
85 2005-01-31 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
86    * Finish cleaning up my JPEG mess. Should be ok now.
87    * Getting toward a RLE very similar to JPEG. Every RLE stuff is now self
88           contained within the RLE* class(doh!)
89
90 2005-01-30 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
91    * SerieHeader::SetDirectory() allow recursive exploration of the Directory
92         * SerieHeader::AddFileName() creates as many Coherent Files lists 
93                       (same Serie UID) as it founds different Serie UID 
94                                            amongst the files instead of discarting any file 
95                                                 that doesn't match with the first one he found.
96         * SerieHeader::OrderGdcmFileList has now one parameter : 
97                        the Coherent Files list the user wants to sort
98    * SerieHeader::GetFirstCoherentFileList()  |
99    * SerieHeader::GetLastCoherentFileList()   | allow to parse 
100                        the set of Coherent Files lists 
101    * const SerieHeader::GdcmFileList &GetGdcmFileList() is kept, for backwards
102                        compatibility (it returns the *first* Coherent Files list, 
103                                                 since there was only one before)
104         * Test/TestSerieHeader gets gdcmData as a default root directory                
105                                           
106 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
107    * Remove friend between DocEntry and File classes
108    * Remove friend between PixelReadConverter and RLEFramesInfo, 
109      JPEGFragmentsInfo
110
111 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
112    * src/gdcmFile.cxx, gdcmDocument.cxx : fix the bug on the group|element
113      0002|0000. The value was incorrect.
114
115 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
116    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the gestion of UID
117
118 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
119    * src/gdcmUtil.cxx : compilation fix on Win32
120    * src/gdcmUtil.[h|cxx] : Set the default GDCM UID in a static constant
121      variable, to be easy found. Add methods to change the default UID.
122      Amelioration of the CreateUniqueUID to use the correct default UID.
123    * src/gdcmFile.cxx : correct use of the CreateUniqueUID method to create
124      a new file
125
126 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
127    * Test/TestVR.cxx : fix memory leaks
128
129 2005-01-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
130    * Rewrite the base 256 to base 10 conversion, using string operation only.
131          This allows us to get rid of the problematic 64bits integer type (does not
132          always exist on target platform).
133
134 2005-01-27 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
135    * Add construct and destructor to class gdcm::Debug to close the debug file
136           automatically
137    * Don't let uset to open twice the same file
138    * gdcm has now an official UID prefix,
139           supplied by http://www.medicalconnections.co.uk
140           1.2.826.0.1.3680043.2.1143
141           (Thx to Mathieu for providing URL)
142    * Add a forty-entries private Dicom Dictionary (Philips MR Intera)
143          to be able to perform some more tests
144    * gdcm::ContentEntry : Contructors and Destructor are now protected,
145          in order to be sure no user will try to use them.
146          (at user level, only the children classes are meaningfull)
147
148 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
149    * move RLEInfo & JPEGInfo from Document to File
150
151 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
152    * FIX : remove so many friend between classes
153
154 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
155    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : Bug fix when getting the value
156    * src/gdcmContentEntry.[h|cxx], gdcmValEntry.cxx : amelioration of code
157
158 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
159    In order to avoid missbehaviour :
160    . gdcm::DocEntry is now specialized in
161      - gdcm::SeqEntry (Dicom Sequence) as opposed to :
162      - gdcm::ContentEntry (Dicom entry with a 'content')
163    . gdcm::ContentEntry is specialized in
164      - gdcm::ValEntry (Dicom entry with a std::string representable value, i.e.
165        characters value, or integers)
166      - gdcm::BinEntry (Dicom entry with a non strig representable value
167    (user hasn't any longer to thing about the precedence of his dynamic_casts)
168
169 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
170    * Test/VTKTest*.cxx : bug fix under linux
171
172 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
173    * src/ : rename some methods on Entry (SetXxx, InsertXxx) to have a better
174      use with python. Some methods are moved from Document to ElementSet or
175      DocEntrySet. The equivalent methods to ElementSet have been added to 
176      SQItem and are virtual in DocEntrySet. Methods that may have the same code
177      in SQItem and ElementSet is directly placed in DocEntrySet
178
179 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
180    * Test/VTKTest*.cxx : remove the show variable in each test method because
181      it's useless (the viewer variable replace this variable)
182
183 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
184    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix on potential memory leak
185    * src/gdcmSQItem.cxx : initialize the SQItemNumber value in the constructor
186    * src/gdcmSQItem.[h|cxx], gdcmElementSet.[h|cxx], gdcmDicomDir*.[h|cxx] : 
187      Add ClearXxx methods to remove all the content of the list or map
188    * gdcmDocEntrySet.h : add GetFirst/NextEntry in pure virtual
189
190 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
191    * methods ReplaceOrCreate renamed as Insert
192      (nobody will be any longer confused by 'CreateOrReplace')
193   
194 2005-01-24 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
195    * Grealty simplify the JPEg decompression, no need to differenciate based on 
196      the JPEG possible type (with/without fragment, with/without multiple frame). 
197      Everything is done throught the JPEG IO Suspension mechanism in IJG
198
199 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
200    * Stage 3 of normalization :
201      in order to avoid any missunderstanding while reading method names :
202      - All the methods xxxEntry now deal with dicom Entries
203      - Methods GetEntry splitted into
204         GetEntryValue
205         GetEntryBinArea
206      - Method SetEntry renamed as SetEntryValue
207      - Method SetEntryBinArea let as it was
208
209 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
210     - Add empty nutshell for JPEG-LS (JPG-LS in NOT jpeg 'lossless')
211     - Position correctly the entry points for JPEG2000 and JPEG-LS
212       (Now Fragments info is get from the file, even for JPEG2000 and JPEG-LS)
213
214 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
215    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDict.h : rename AddNewXxx methods to AddXxx.
216    * src/gdcmDict.h : rename GetDictEntry moethod to GetEntry, to be coherent 
217      with other method names
218    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Add the typemaps for the TagName type
219    * Test/TestDicomDirElement.cxx : add new test
220
221 2005-01-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
222    * Finish the CreateUniqueUID stuff. Seems to compiled/runs on every
223      plateforms ITK support. Had some troubles with uint64_t on Win32, go to
224      http://msdn.microsoft.com/library/default.asp?url=/library/en-us/vclang/html/_langref_data_type_ranges.asp
225      for more info. Basically you can not used 'unsigned' __int8 in an ostream.
226      So can't you use __int64 in ostream at all.
227
228 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
229    * bug fix for compilation on MSVC6
230    * gdcmPython/gdcm.i : rename of classes missed
231
232 2005-01-21 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
233    * Stage 2 of names normalization :
234      - A gdcm::Document is now either a gdcm::DicomDir or a gdcm::File
235        (easy to understand ...)
236      - gdcm::FileHelper replaces old class gdcm::File
237
238 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
239    * gdcmDicomDirElement.[h|cxx] : change the AddEntry method. Now, it gets a
240      type and not a string. So, there remove problems on the format of the
241      string.
242
243 2005-01-20 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
244    * Add Example/TestPapyrus.cxx
245      - reads a Papyrus file (gdcm::Header compliant),
246      - gets the pixels of all the images, using low level iterators
247      - writes an multiframes Dicom image.
248    (Just to show it's *possible* to do that)
249     Uses SQItems accessors (we could use it as a 'Test' program, to improve test
250     coverage ...)
251
252 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
253    * src/gdcmDicomDirObject.h : set the FillObject method in protected.
254      Thus, DicomDirXXX are created with a flad that indicates if the created
255      object is empty or not (when not empty, the DicomDirElement is used to
256      fill the object)
257
258 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
259    * src/gdcmDicomDir.cxx : simplify the NewPatient method, like made in
260      gdcm::DicomDirPatient, gdcm::DicomDirStudy, gdcm::DicomDirSerie
261
262 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
263    * src/gdcmSQItem[h|cxx] : rename some methods to have coherent names
264
265 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
266    * src/gdcmDicomDir*.[h|cxx] : rename methods to be logik in their name.
267      Remove all access to the hash-tables or lists in the objects.
268
269 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
270    * src/gdcmDebug.h : remove the Debug test in the gdcmErrorMacro
271    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : rename the Initialise method to Initialize, to
272      be complient with all the gdcm source code
273
274 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
275    * src/gdcmDocEntry.h : DocEntry is now secure. User can't change the
276      DictEntry or the VR.
277
278 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
279    * gdcmPython/ : change GDCM_DATA_PATH to GDCM_DATA_ROOT to be complient with
280      all in gdcm
281
282 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
283    * Test/ : rename VTK tests to have a best name for the tests
284    * gdcmPython/demo/*.py.in : Change the InitTraversal/GetNextEntry use to
285      GetFirstEntry/GetNextEntry use
286
287 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
288    * In SerieHeader::ImagePositionPatientOrdering()
289      // a Dicom 'Serie' may contain scout views
290      // and images may have differents directions.
291      // -> More than one may have the same 'pos'
292      // Sorting has then NO meaning !
293      Thx to Eduardo Davila for reporting bug.
294
295 2005-01-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
296    * Test/ShowDicom.cxx, ShowDicomSeq.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : change the
297      test. Now it's on image content and not on the resulting visualisation...
298      might solve the problem on linux when using the OpenGL drivers
299
300 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
301    * ENH for DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, 
302              DicomDirSerie, DicomDirImage
303              Dict, DictSet classes :
304          -add method GetFirstEntry to replace call to InitTraversal+GetNextEntry
305          -remove InitTraversal method.
306    * UPD Test programs + Example programs
307
308 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
309    * remove useless and never updated keyword \ingroup         
310    * Solve pb when structure (list, map, ...) is empty.
311      Thx to Benoit for reporting bug
312
313 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
314    * Taking into account of 'Transfer Syntax' value
315        (for 'true' Dicom V3 files, the 'ACR-NEMA' heuristics sometimes gives
316          unaccurate result)
317
318 2005-01-17 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
319    * src/gdcmUtil.cxx : bug fix to find the Windows MAC address. Now, there
320      is no memory access violation
321    * gdcmPython/demo : add python demos using VTK
322
323 2005-01-16 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
324     * FIX 'Dictionnary' is now spelt 'Dictionary'
325           'wether' is now spelt 'whether'
326           'archieve' is now spelt 'archive'   ;-)
327
328 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
329     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
330           related methods, in order not to expose internal mechanisms
331         InitTraversal();
332         GetNextEntry();
333     * REM methods that exposed internal mechanisms :
334         DicomDir::GetDicomDirPatients()
335         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
336         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
337         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
338     * UPD Test programs :
339         makeDicomDir.cxx
340         BuildUpDicomDir.cxx
341         TestDicomDir.cxx
342      * UPD Example program
343         PrintDicomDir.cxx
344     * ADD DictSet methods
345         InitTraversal()
346         GetNextEntry()
347
348 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
349    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
350     reason to have to methods, moreover with the second taking the ostream as
351     *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
352
353 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
354    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
355     smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
356     Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
357     code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
358     working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
359     problematic GctestetIPAddress
360
361 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
362    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
363      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
364      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
365      shared libs.
366
367 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
368    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
369      sort DICOM files
370
371 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
372    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack
373          for dealing with BIGENDIAN processors
374          - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
375          When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
376          and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
377          PixelWriteConvertor, and avoid modifying the Pixel Area.
378          Note :
379          Probabely, the same operation will have to be done when we want 
380          to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
381          and we are working on Little Endian Processor
382                   
383 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
384    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
385      table.
386    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
387    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
388      all the dict content.
389    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
390      print
391    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
392
393 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
394    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
395                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
396
397 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
398    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
399    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
400    * gdcmPython/demo/ : add a new test
401
402 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
403    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
404    * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
405    * enhancement of Example/PrintDicomDir
406
407 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
408    * Now, python test might work on systems
409    * Add the PrintDicomDir test
410
411 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
412    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
413            Explicit Big Endian Transfer Syntax files
414           (group and elem not swaped)
415    
416 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
417    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
418            Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
419            begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
420            To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
421            Document::HandleOutOfGroup0002() method 
422     * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
423               (related pb not yet solved)
424
425 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
426    * Bug fix for the python part use
427    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
428
429 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
430    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
431
432 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
433    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
434      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
435      the transfer syntax
436
437 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
438    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
439    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
440        to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
441        and Transfer Syntax is Big Endian
442        We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
443     * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
444     * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
445
446 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
447    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
448    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
449    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
450    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
451    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
452    gdcm::Global would destroy at exit).
453
454 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
455    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
456     environment. static const string in a header file used to be ill
457     initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
458     issue.
459
460 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
461    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
462       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
463       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
464       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
465          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
466
467 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
468    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
469      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
470      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
471      redirected to a file (ofstream).
472    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
473      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
474
475 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
476    * Removal of useless and dangerous methods :
477          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
478          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
479    * Removal of usless methods :
480          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
481    * Commenting out of probabely useless methods :
482          Dict::GetDictEntryNames()
483          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
484          DictSet::GetPubDictEntryNames()
485          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()         
486    * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used    
487    * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version   
488    * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
489            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
490            Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods           
491    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
492            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
493                       Unused till now...           
494    * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
495            should be used to write a method to replace the former
496            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
497
498 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
499    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
500      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
501      data in the DocEntry structure
502
503 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
504    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
505      And now use a static function call instead, with a global variable. i
506      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
507      and easier to use...hopefully
508
509 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
510    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
511
512 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
513    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
514
515 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
516    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
517      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
518
519 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
520    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
521    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
522      a file
523    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
524      when specifying the VR
525    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
526    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
527
528 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
529    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
530           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
531    * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
532    * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
533            in order to allow further VR modification by user
534    * REM : removal of once-called method File::WriteBase   
535            integration of its code in formerly one-line method File::Write
536
537 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
538    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
539      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
540    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
541      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
542      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
543    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
544
545 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
546    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
547      empty Print Method
548    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
549
550 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
551    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
552    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
553    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
554    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
555    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
556
557 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
558    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
559      problems when compiling with the python wrapping
560
561 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
562    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
563      writting in ImplicitVR
564
565 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
566    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
567      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
568      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
569      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
570
571 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
572    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
573      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
574
575 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
576    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
577      Rename Decompressed to Raw
578    * Use the API changes in gdcm::File.
579    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
580      Memory leaks fixed
581
582 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
583    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
584      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
585      of Frames' field
586
587 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
588    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
589    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
590
591 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
592    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
593      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
594      solve it.
595
596 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
597    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
598      DocEntry. Now use methods of the Document !
599
600 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
601    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
602  
603 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
604    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
605    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
606    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
607    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
608      test to 0.0
609    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
610    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
611      containing found sequences
612
613 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
614    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
615      not at all time
616    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
617      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
618               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
619      and tests are now made on good variables
620
621 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
622    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
623    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
624      length
625    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
626    * Add vtkGdcmWriter example and test
627
628 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
629    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
630    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
631    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
632      SetValue
633    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
634    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
635
636 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
637    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
638    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
639
640 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
641    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
642      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
643      file isn't readable. 
644
645 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
646    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
647    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
648    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
649    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
650      method that is redondant with AddEntry.
651    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
652      SQItem
653
654 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
655    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
656    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
657    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
658
659 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
660    * Huge cleanup:
661      - Remove printf / sprintf
662      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
663      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
664        source
665      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
666        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
667      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
668        (plus it is not up to date)
669      - remove 'using namespace std' this is BAD !
670
671 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
672    * Remove memory leaks on the DicomDir
673    * Remove some useless data in DicomDirObject
674    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
675
676 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
677    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
678
679 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
680    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
681      future, with convertion)
682    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
683      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
684      from the output of the class
685
686 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
687    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
688
689 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
690    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
691      and vtkErrorMacro use.
692    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
693
694 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
695    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
696      file name in input
697    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
698    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
699      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
700      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
701      immediately after thee instruction.
702    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
703      file has been opened : the test must be made on the content of the 
704      pointer and not directly on the pointer !
705      Code formatting
706
707 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
708    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
709      the python part recompiles
710
711 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
712    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
713      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
714      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
715      all linux)
716
717 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
718    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
719      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
720      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
721      screen resolution, it's produce errors).
722      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
723    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
724    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
725      under windows at compilation
726    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
727      for grayscale images
728    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
729
730 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
731    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
732    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
733      tests on the image size X, Y, Z
734
735 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
736    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
737    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
738      between the class name and the file name
739
740 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
741    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
742      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
743      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
744      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
745      this variable content.
746
747 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
748    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
749      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
750      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
751      DocEntryArchive
752    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
753      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
754      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
755    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
756      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
757
758 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
759    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
760
761 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
762    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
763    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
764      the header.
765    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
766      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
767      write
768    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
769      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
770      is now on RGB data (as before my last commit
771    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
772
773 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
774    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
775      Add a print information of the type of the entry
776    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
777      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
778    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
779      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
780    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
781      any.
782    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
783
784 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
785    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
786      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
787      opened or not.
788
789 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
790    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
791      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
792    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
793      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
794      DocEntryArchive
795    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
796      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
797    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
798      - test the pixels written
799      - add test points to quickly find where is the error
800      - can set a file name input and output in arguments
801    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
802      amelioration of the test output
803
804 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
805    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
806      all replaced DocEntry's
807    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
808      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
809      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
810      header initial state.
811
812 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
813    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
814
815 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
816    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
817      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
818      then, it musn't change in the time.
819    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
820      header correctly. At this time, the change is only made for the first
821      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
822      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
823      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
824      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
825    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
826    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
827      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
828      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
829
830 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
831    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
832    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
833
834 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
835    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
836      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
837      is copied).
838    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
839      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
840    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
841
842 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
843    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
844      Two problems appear when doing it :
845       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
846         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
847         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
848         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
849         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
850         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
851         the gdcmBinEntry.
852       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
853         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
854         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
855         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
856         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
857    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
858
859 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
860    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
861    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
862      squeeze method
863
864 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
865    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
866    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
867      after it have been deleted
868
869 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
870    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
871    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
872    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
873      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
874      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
875
876 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
877     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
878     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
879     3. Use const ref when possible
880     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
881     5. A few more comments
882     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
883
884 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
885   * ENH: Slightly bigger patch:
886     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
887     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
888     3. File was not close properly in gdcmDict
889     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
890     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
891     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
892     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
893     8. Do not repeat virtual in subclasses
894     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
895
896 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
897   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
898     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
899     of a null character as defined by standard
900   
901 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
902   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
903     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
904
905 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
906   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
907   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
908     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
909
910 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
911   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
912     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
913     a verbose message is generated.
914     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
915     correctly close is a call to CloseFile.
916     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
917   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
918     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
919     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
920     header. A verbose is generated if these two size mismatch
921
922 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
923   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
924     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
925     break under windows (with msvc6 compilation).
926
927 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
928   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
929     compiling with MSVC6)
930
931 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
932   * Bugs fix for the Windows build with VC6
933   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
934     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
935     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
936     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
937   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
938     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
939     gdcm.i file)
940   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
941     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
942     std::cerr of vtk.
943
944 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
945   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
946   * gdcmPython/gdcm.i:
947     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
948     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
949       NOT need to be wrapped anymore.
950   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
951     DicomDir::Method) new example added.
952
953 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
954   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
955     A DicomString can contain as many \0 as they want
956     and it is *always* of even length.
957     We only support odd length for very rare case. 
958     And in the near future this should be removed.
959
960 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
961   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
962     little endian. This should -heopfully- fix some tests
963
964 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
965   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
966     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
967     the one comiled into lib
968
969 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
970   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
971     This should definitely solve any leak problem, and we should be
972     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
973
974 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
975   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
976   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
977   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
978   
979 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
980   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
981   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
982     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
983   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
984   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
985     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
986     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
987       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
988       no longer exists.
989
990 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
991   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
992    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
993    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
994    the class.
995   
996 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
997   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
998     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
999     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
1000
1001 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1002   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
1003   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
1004     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
1005     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
1006     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
1007       CloseFile() anymore.
1008     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
1009       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
1010       into File::Pixel_Data.
1011
1012 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1013   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
1014     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
1015   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
1016     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
1017     method:
1018     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
1019     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
1020       method to those classes.
1021     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
1022       -- Added a ::Print() method.
1023       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
1024       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
1025          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
1026
1027 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1028   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
1029     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
1030     doxygen.
1031   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
1032   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
1033     pointlessly wrapped (see
1034     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
1035   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
1036     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
1037     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
1038     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
1039     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1040       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
1041            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
1042       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
1043          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
1044
1045 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1046   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
1047     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
1048
1049 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1050   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
1051     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
1052     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
1053   * TODO added new entry.
1054   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
1055     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1056     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
1057     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
1058       variable names for semantical coherence.
1059
1060 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1061   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
1062   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
1063   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
1064   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
1065   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
1066   compilation time jpeg option.
1067
1068 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1069   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
1070     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
1071     reproduce at home.
1072   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
1073   Thanks dcmtk crew !
1074
1075 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1076   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
1077   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
1078     matters, as stated in warning note at beginning of %include section).
1079   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
1080   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
1081   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
1082   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
1083     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
1084     from File:: to PixelConvert::.
1085
1086 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1087   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
1088     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1089      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
1090      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
1091
1092 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1093   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
1094   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
1095   like this:
1096     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
1097   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
1098   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
1099   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
1100
1101 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1102   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
1103     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
1104     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
1105     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
1106     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
1107       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
1108       (for the time being this is better than having them attach to
1109        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
1110     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
1111       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
1112     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
1113       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
1114       gdcmPixelConvert::
1115
1116 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1117   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
1118   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
1119     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
1120       clean up of RLE related code. 
1121   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
1122     - src/gdcmRLE.cxx removed
1123     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
1124     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
1125     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
1126   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
1127     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
1128       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
1129       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
1130
1131 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1132   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
1133     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
1134       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
1135       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
1136       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
1137       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
1138       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
1139       offsets.
1140   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
1141     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
1142         with the retired Parse7Fe0().
1143     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
1144     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
1145
1146 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1147   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
1148     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
1149     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
1150     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
1151   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
1152     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
1153       to return an unused length.
1154
1155 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1156   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
1157     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
1158     to use to do simple stuff.
1159
1160 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1161   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
1162     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
1163     copying of the file within different directory, configure header file to
1164     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
1165     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
1166
1167 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1168   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
1169      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
1170        with it's binary name).
1171      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
1172        the Website to be more complete.
1173      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
1174        doxygenated documentation.
1175      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
1176        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
1177                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
1178   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
1179   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
1180    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1181
1182 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1183   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
1184    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1185
1186 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1187   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
1188     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
1189     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
1190     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
1191     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
1192   * GDCMHOME clean up:
1193     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
1194       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
1195       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
1196   * Autotools clean up:
1197     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
1198     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
1199
1200 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1201   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
1202   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
1203   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
1204
1205 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1206   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
1207     describing TODO entries and used it for new entries.
1208   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
1209     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
1210     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
1211   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
1212     documentation itself, but the website) moved to html and
1213     placed in directory Doc/Website:
1214     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
1215     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
1216     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
1217   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
1218   * CMakeLists.txt changed accordingly.
1219   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
1220     DeveloppersPython.html
1221   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
1222
1223 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1224   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
1225     of gdcm Web site.
1226
1227 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
1228   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
1229     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
1230     we can now delete[] it safely 
1231   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
1232     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
1233   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
1234
1235 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1236   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
1237     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
1238     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
1239     pointed content.
1240
1241 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1242   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
1243   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
1244
1245 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1246   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
1247     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
1248     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
1249     an example of usage.
1250     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
1251       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
1252     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
1253       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
1254     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
1255     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
1256     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
1257
1258 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1259   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
1260     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
1261     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
1262     in class 
1263     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
1264       and associated accessors. Doxygenation of the class.
1265     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
1266       accessors added.
1267     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
1268       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
1269     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
1270     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
1271
1272 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1273   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
1274     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
1275       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
1276            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
1277            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
1278            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
1279            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
1280            the same group and element all share the same (group, element)
1281            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
1282            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
1283            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
1284            consider the following definition of a TagKey:
1285            - let Group, Element be the string representation of the
1286              group and element dicom tag members,
1287            - let ItemNumber be the string representation of the integer
1288              index of the considered item number of a sequence,
1289            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
1290            the form:
1291               /ItemNumber#Group|Element
1292            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
1293            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
1294               Group|Element<SeqTag>
1295            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
1296            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
1297            string e.g.
1298                0028|1201
1299            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
1300            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
1301            string e.g.
1302                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
1303     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
1304       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
1305       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
1306     - src/gdcmDocEntry.cxx:
1307       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
1308          Key member.
1309       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
1310     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
1311     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
1312       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
1313       -- now has a new BaseTagKey member.
1314       -- STYLE.
1315   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
1316     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
1317     truly belongs.
1318     This poses the problem with the semantics of the following lines
1319        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
1320        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
1321        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
1322     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
1323     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
1324     order to get things working the dicom dictionary was altered !
1325     Please fix things urgently...
1326   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
1327     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
1328     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
1329     set to OW:
1330       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
1331       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
1332       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
1333   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
1334     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
1335   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
1336
1337 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1338   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
1339
1340 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1341   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
1342     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
1343   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
1344   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
1345
1346 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1347   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
1348     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
1349   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
1350     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
1351   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1352     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1353   * TODO updated
1354   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1355     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1356   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1357   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1358     exception_on_error parameter.
1359     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1360     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1361     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1362
1363 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1364   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1365   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1366     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1367   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1368   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1369   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1370     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1371   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1372
1373 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1374   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1375     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1376
1377 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1378   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1379        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1380  
1381 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1382   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
1383         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1384
1385 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1386    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1387    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1388      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1389      is now in static in the gdcmDebug class
1390    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1391    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1392
1393 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1394    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1395      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1396    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1397      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1398      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1399      that displays position and size).
1400    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1401      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1402      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1403      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1404      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1405      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1406      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1407         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
1408      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1409      commiting changes).
1410    * Test/CMakeLists.txt:
1411       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1412       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1413         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1414         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1415    * TODO updated.
1416
1417 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1418    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1419      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1420      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1421      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1422      - removal of typedef duplication.
1423      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1424      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1425    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1426       - printf polluting ctest removed.
1427       - TAB removal for comminting
1428    * Test:
1429      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1430        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
1431        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1432        this test creates them.
1433        Note: we need to validate each reference image, but before that
1434              I'd like to rename them with a more explicit name...
1435      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1436    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
1437      including each header needed).
1438
1439 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1440    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1441      test suite to the Example directory. Are concerned:
1442      - PrintHeader.cxx
1443      - TestDcm2Acr.cxx
1444      - TestFindTags.cxx
1445      - TestWrite.cxx was
1446      - TestWriteSimple.cxx
1447    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1448      image gdcmData/oldACR00001.ima
1449
1450 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1451    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1452      with removal from gdcmData):
1453       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1454       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1455       - US.3405.1.dcm
1456      Added the following because after last cvs update, they cause
1457        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
1458      to segfault:
1459       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1460       - oldACR00001.ima
1461    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1462      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1463      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1464      form of test...
1465    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1466      we don't need to black list the following images anymore:
1467       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1468       - OT-PAL-8-face.dcm
1469       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1470    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1471      fixes and the beautified code ;-)
1472      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1473      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1474      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1475            improve the test suite). The bug could be detected by using
1476            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1477            or by using
1478            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1479            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1480
1481 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1482    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1483          - replace by uggly but working old code :-(
1484    A lot of things should be OK again.
1485    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
1486    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1487    (twice, withing a fortnigh ...)    
1488
1489 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1490    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1491      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1492    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1493      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1494      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1495                    - OT-PAL-8-face.dcm
1496                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1497    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1498      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1499      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1500      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1501      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
1502      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1503      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1504      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1505      image.
1506    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1507      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1508      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1509      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1510    
1511 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1512   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1513   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
1514                           (instead of infinite loop)
1515   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
1516
1517 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1518    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1519
1520 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1521    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1522            when SamplesPerPixel =3
1523          - now Write is no longer confused by 
1524           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1525          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
1526                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1527    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
1528            (in order to split the job that has not to be done 
1529            for gdcmDicomDir)
1530
1531 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1532    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1533      loop on the same image until memory went out. 
1534      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1535    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1536      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1537
1538 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1539    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
1540             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1541             is added a the end, when necessary.
1542             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
1543               now written correctly
1544             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
1545               (even for odd groups) 
1546         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1547                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1548
1549 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1550    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1551    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
1552      coding style).
1553
1554 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1555    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1556      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1557    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1558
1559 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1560    FIX : gdcmDocument.cxx
1561       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1562         code 'beautyfication' :-(
1563       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1564
1565 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1566    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
1567             : to allow user to create his own Sequences
1568    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1569
1570    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1571
1572    - gdcmBinEntry
1573      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1574   
1575    - gdcmDocEntry
1576      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1577      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1578   
1579    - gdcmDocEntrySet
1580      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1581      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1582      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1583      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1584      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);            
1585      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1586                                             guint16 element,
1587                                             std::string vr     = "unkn",
1588                                             std::string fourth = "unkn",
1589                                             std::string name   = "unkn"); 
1590      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
1591      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1592      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1593      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
1594      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1595      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1596      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1597      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1598   
1599    - gdcmDocument
1600      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1601      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1602      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1603      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1604      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1605                                         FILE *_fp, FileType type);
1606      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1607      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1608      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1609      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1610      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1611      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1612      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1613      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1614                                             guint16 element,
1615                                             std::string vr     = "unkn",
1616                                             std::string fourth = "unkn",
1617                                             std::string name   = "unkn");
1618      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1619      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1620      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1621      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1622                                              
1623    - gdcmElementSet
1624      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1625      
1626    - gdcmSeqEntry
1627      ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1628  
1629    - gdcmSQItem
1630      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1631      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);         
1632      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1633      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1634
1635    - gdcmValEntry
1636     ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
1637               
1638 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1639     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1640       The default constructor invoked by the line
1641          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1642       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1643       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1644       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1645     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1646       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1647       Could anyone explain why ?
1648     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1649       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
1650       code related to gdcmBinEntry).
1651
1652 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1653     * In order to fix memory leaks:
1654      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1655        some delete calls.
1656      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1657      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1658        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1659        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1660        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1661      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1662      - src/gdcmDocument.cxx:
1663        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1664           from dynamic stores.
1665        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1666           was causing memory leaks.
1667      - src/gdcmSQItem.cxx:
1668        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1669           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1670        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1671           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1672           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1673           This avoids SegFaulting.
1674      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1675     * Conclusion:
1676      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1677        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1678        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1679      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1680        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1681      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1682        segfaults).
1683     * Erroneous leading white fix:
1684      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1685        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1686      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1687      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1688     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1689     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1690
1691
1692 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1693     * In order to fix writing of dicom files:
1694      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1695      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1696      - src/gdcmDocument.cxx:
1697        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1698        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1699        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1700           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1701           manner.
1702        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1703           to only declared) and build on top of
1704           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1705        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1706      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1707        for usage in destructor and treatement of promotion in
1708        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1709      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1710       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1711     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1712       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1713       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1714       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1715
1716 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1717     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1718       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1719       learned that:
1720           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1721           soon as possible by globally disabling memory caching.
1722           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1723           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1724       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1725       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1726       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1727     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1728       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1729       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1730       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1731         with 1.
1732       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1733       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1734       understand why the list is empty...).
1735     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1736     * Doc/License.txt added.
1737
1738 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1739     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1740       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1741         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1742         the padding problem.
1743       - general clean up, simplification, and coding style.
1744       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1745     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1746
1747 2004-06-14 Jean-Pierre Roux      
1748    *  gdcmSeqEntry.cxx
1749       - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1750       - fix the display of SQItem ordinal number
1751       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1752       - remove some useless never written private methods   
1753       
1754 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1755    * gdcmBinEntry.cxx 
1756       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1757       - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1758          a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1759          a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1760    * dcmDocument.cxx
1761       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1762          according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1763       - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1764       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1765    * gdcmFile.cxx
1766       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1767    * gdcmSQItem.h
1768       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1769             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1770             \warning : some pb remaining around this number
1771             will be solved asap
1772       - AddEntry now takes the Item Number as a param    
1773    * gdcmValEntry.cxx 
1774       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param   
1775
1776 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1777     * Memory leak hunt with the following command:
1778       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1779                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1780       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1781       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1782       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1783           grep "MEMORY LEAK" src/*
1784       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1785       -----
1786           #include <string>
1787           int main() {
1788              std::string name;
1789              char * test = "babo";
1790              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1791                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1792              name.clear();   //// Doesn't help !
1793              return 0;
1794           }
1795       -----
1796           #include <string>
1797           #include <iostream>
1798           int main() {
1799              std::string line;
1800              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1801              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1802                                         //// of 1320 bytes in call to
1803                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1804             return 0;
1805           }
1806       -----
1807
1808
1809 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1810     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1811       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1812         and related, moved away to gdcmDocument.
1813       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1814         the corresponding protected accessors of inherited class
1815         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1816         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1817       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1818       - Clean up of undefined or unused methods.
1819     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1820       account the changes to gdcmHeader.h).
1821     * src/gdcmDocument.h:
1822       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1823         changes to gdcmHeader.h).
1824       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1825         (see changes to gdcmHeader.h).
1826       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1827       - Clean up of undefined or unused methods.
1828     * src/gdcmDocument.cxx:
1829       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1830       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1831       - some std::string properly set to VRKey
1832     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1833       references to gdcmDocument. 
1834     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1835     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1836       cvs repository gdcmData.
1837
1838 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1839     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1840     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1841       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1842     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1843     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1844       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1845     * src/gdcmDocument.cxx: 
1846       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1847         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1848       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1849         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1850         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1851         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1852         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1853               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1854               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1855     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1856     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1857       now taken into account.
1858     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1859       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1860     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1861       on posix.
1862     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1863       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1864     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1865
1866 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1867     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1868       gdcmGlob
1869     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1870     * src/gdcmUtil.h : export methods
1871
1872 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1873     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1874       to right behavior
1875     * Initial addition of automatic python testing
1876     * Initial addition of automatic image comparison
1877
1878 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1879     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1880       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1881
1882 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1883      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1884      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1885      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1886
1887 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1888      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1889        new concepts (and new classes) :
1890        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1891         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1892         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1893        a Sequence is composed of Items.
1894        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1895        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1896        (never taken into account)
1897        Our unability to add a new 'entry' in the header
1898        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1899        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1900        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1901        nothing is finished.
1902        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1903
1904 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1905      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1906      
1907 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1908      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1909        file prefix (SetFilePrefix)
1910
1911 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1912      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1913        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1914        baseline.
1915      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1916        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1917
1918 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1919      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1920        dicom image
1921
1922 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1923      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1924      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1925        between the developper and user version.
1926      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1927      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1928
1929 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1930      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1931        when using cmake.
1932
1933 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1934      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1935                src directory, now generated in the build dir.
1936             2. Tests as mentionned smarter
1937             3. Some clean up
1938             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1939           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1940           where we could set the institution name / patient name...
1941
1942        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1943               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1944                  (this was not true before)
1945
1946 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1947      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1948            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1949      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1950            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1951       Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1952      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1953            tree-like structure of a Dicom Header.
1954      * FIX Test code cleaning     
1955            
1956 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1957      * ENH: Adding automatic testing
1958        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1959        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1960        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1961        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1962           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1963           too many projects
1964      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1965      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1966        one file instead of seven + some small cleanup
1967
1968 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1969      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1970      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1971            Header printing. Example given with :
1972       > PrintHeader fileName  2 new
1973           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1974       
1975 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1976      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1977          1. I have added some unsigned where needed
1978          2. Some function parameter not used -> (void)
1979          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1980          4. g++ don't like character '\' in comment
1981          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1982                     this really need to be fixed
1983          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1984          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1985                     this also really need to be fixed
1986          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1987                     remove compression file 
1988                     (as we only do decompression, right ?)     
1989      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1990
1991 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1992      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1993            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1994            defaulted to yspacing
1995       
1996 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1997      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1998      * ENH add parameters :
1999                bool  exception_on_error = false, 
2000                bool  enable_sequences   = false,
2001           bool  ignore_shadow      = false
2002            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
2003      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
2004            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
2005          
2006 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
2007      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
2008      
2009 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
2010      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
2011      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
2012              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
2013         
2014 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
2015      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
2016          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
2017
2018 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2019      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
2020        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
2021        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
2022        in gdcmHeader.
2023      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
2024        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
2025        already does the job.
2026      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
2027        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
2028
2029 2004-03-30 Benoit Regrain
2030      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
2031        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
2032        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
2033
2034 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
2035      * ENH : Check on file type to be written moved
2036              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
2037      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
2038              when end-of-list is reached
2039       : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
2040
2041 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2042      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
2043      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
2044      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
2045        equivalent to ExplicitVR in existing code).
2046
2047 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2048      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
2049        now contains all the gdcmGlobal related code.
2050      * minor coding style and doxygenation changes.
2051
2052 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2053      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
2054        now contains all the Debug related code.
2055      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
2056      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
2057        CreateCleanString) removed.
2058      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
2059      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
2060      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
2061      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
2062        src/gdcmDirList.cxx)
2063
2064 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
2065      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
2066
2067 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
2068      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
2069            big endian made volumes
2070      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
2071            end user to instanciate class gdcmParser
2072           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
2073
2074 2004-03-22 Benoit Regrain
2075      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
2076      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
2077              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
2078
2079 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
2080      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
2081            an already existing DICOMDIR file is consistent with
2082            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
2083            or build from the files held (recursively) in a Directory
2084            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
2085            gdcmObject::SetBoundaries() added
2086
2087 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
2088      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
2089                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
2090      * FIX now file names and directory name are written properly in the
2091            DICOMDIR
2092      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
2093            about the name
2094
2095 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2096      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
2097                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
2098
2099 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
2100      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
2101            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
2102            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
2103            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
2104       to allow making gdcDicomDir object.
2105      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
2106           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
2107
2108 2004-02-11 Benoit Regrain
2109      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
2110              when using from python
2111              
2112 2004-02-10 Benoit Regrain
2113      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
2114      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
2115      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
2116              directory parsing
2117
2118 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
2119      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
2120              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
2121              - class gdcmMeta created
2122      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
2123              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
2124      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
2125
2126 2004-02-05 Benoit Regrain
2127      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
2128              header entries
2129      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
2130      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
2131
2132 2004-02-04 Benoit Regrain
2133      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
2134      * FIX : sort the images in the dicom dir
2135      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
2136      * ADD : a python demo
2137
2138 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
2139      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
2140      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
2141              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
2142              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
2143              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
2144      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
2145            to make full checking easier
2146         
2147 2004-02-04 Benoit Regrain
2148      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
2149      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
2150
2151 2004-02-03 Benoit Regrain
2152      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
2153      * gdcmDicomDir : add the load of directory
2154      * Bug fix and print add-on
2155
2156 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
2157      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
2158      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
2159      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
2160      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
2161            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
2162         
2163 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
2164      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
2165              iterator on last
2166              of the last synonym :-(
2167      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
2168              for DICOMDIR ;-)
2169      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
2170      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
2171      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
2172            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
2173       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
2174
2175 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
2176      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
2177            no longer writes 'Un' on disk
2178      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
2179      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
2180            the length (for Palette expanded images)
2181            and Raw Length (non expanded image + Palette)
2182      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
2183            (that broke Write). Replaced by UL.
2184            Aware user will reload the field if he 
2185            thinks it's necesssary
2186              
2187 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
2188      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
2189        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
2190        IsReadable() methods.
2191        
2192      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
2193       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
2194       but so usefull for people that miss them ;-)
2195       
2196      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
2197        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
2198
2199 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
2200      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
2201
2202 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
2203      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
2204              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
2205         The TRUE value for this param has to be used 
2206         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
2207         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
2208      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
2209              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
2210         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
2211         
2212      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
2213              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
2214              Fixed
2215
2216      * gdcmHeader add the method
2217              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
2218         to get *all* the Header Entries with the same tag.
2219         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
2220         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
2221
2222 2004-01-26 Benoit Regrain
2223      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
2224        in the print and add a third level of print to print them
2225
2226 2004-01-23 Benoit Regrain
2227      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
2228      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
2229      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
2230        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
2231
2232 2004-01-22 Benoit Regrain
2233      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
2234      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
2235
2236 2004-01-19 Benoit Regrain
2237      * Add the use of shadow dictionaries
2238      * bug fix and coding style
2239
2240 2004-01-19 Benoit Regrain
2241      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
2242      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
2243      * Add the update of header entries using the shadow library
2244
2245 2004-01-19 Benoit Regrain
2246      * removal of file gdcmHeader2.cxx
2247      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
2248        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
2249        of dicom dir parsing
2250      * bug fix under python
2251
2252 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
2253     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
2254     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
2255     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
2256     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
2257
2258 2004-01-15 Benoit Regrain
2259      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
2260        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
2261        when the gdcmDictSet will be destroyed
2262      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
2263        gdcmDictSet
2264
2265 2004-01-15 Benoit Regrain
2266      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
2267        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
2268        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
2269        some memory and vtk seems to have some problems with that.
2270      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
2271
2272 2004-01-14 Benoit Regrain
2273      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
2274      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
2275      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
2276      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
2277
2278 2004-01-13 Benoit Regrain
2279      * src/*.[h|cxx] : coding style
2280      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
2281
2282 2004-01-13 Benoit Regrain
2283      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
2284      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
2285        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
2286      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
2287
2288 2004-01-12 Benoit Regrain
2289      * src/*.h : add comments
2290      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
2291      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
2292        directly setted in the source code
2293      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
2294        gdcmTS and gdcmVR
2295
2296 2004-01-09 Benoit Regrain
2297      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
2298      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
2299
2300 2004-01-07 Benoit Regrain
2301      * Modification to compile with the distutils.
2302      * Bug fix in code
2303
2304 2003-12-10 Benoit Regrain
2305      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
2306        can use a gdcmHeaderHelper to load data
2307      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
2308        made in the source code
2309
2310 2003-12-10 Benoit Regrain
2311      * Update Windows projects and .cvsignore files
2312
2313 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
2314      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
2315            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
2316            if he wants to.
2317            gdcmElValSet:Print takes it into account
2318
2319 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2320      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
2321      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
2322      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
2323
2324 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
2325       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
2326              on the ListTag listElem member,
2327              not longer on the TagElValueHT tagHt member
2328       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
2329              with the tagHt member and the listElem member.
2330         (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
2331
2332       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
2333              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
2334                        if bug fixing is necessary), for internal
2335              use only
2336         UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
2337                        or to allow Parser going on.
2338         Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
2339         with a length (not 0000) is found
2340       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
2341            because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
2342       (to be written)
2343
2344 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
2345      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
2346      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
2347           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
2348      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
2349
2350 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2351      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2352
2353 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2354      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2355           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2356
2357 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2358      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2359      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2360              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2361              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2362
2363 2003-11-05 Benoit Regrain
2364      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2365                        : Explicit error messages
2366      * in __init__.py  : Related modif
2367
2368 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2369      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2370            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2371            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2372      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2373                     (vtkGdcmReader compliant)           
2374       
2375 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2376      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2377        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2378        
2379 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2380      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
2381            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2382
2383 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2384      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
2385                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2386              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2387              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2388              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2389              such an image :
2390              After gdcmHeader :
2391               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2392               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2393               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2394      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2395              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2396
2397 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2398      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2399              
2400 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2401      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
2402       being coherents dicom files.
2403      
2404 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2405      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2406            from medcon lib !
2407      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
2408      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2409      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2410      * ENH: Add include dir to medcon lib
2411      * FIX: only one function is being exported for now ! 
2412            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2413             
2414 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2415       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2416         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2417           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2418       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2419
2420 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2421       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2422         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2423         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2424       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2425       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2426
2427 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2428       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2429                                                
2430 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2431       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2432       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2433       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2434       
2435 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2436       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2437       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2438       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2439       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2440       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2441       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
2442              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2443         But it fasten debug compilation time.
2444             
2445 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2446       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2447         (they are compressed as 2 planes images, 
2448          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2449
2450 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2451       * Now CheckRead takes into account :
2452          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2453          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2454       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2455        (breaks DicomWorks)
2456
2457 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2458       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
2459              one should remove the '\'
2460         
2461 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2462       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
2463         (wrong lengths in header)
2464         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2465       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2466         (breaks DicomWorks)
2467
2468 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2469       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
2470         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2471
2472 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2473       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2474       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2475
2476 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2477       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2478      
2479 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2480       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2481         (the patch is easy to remove)
2482       * cosmetic changes to avoid warnings
2483       
2484 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2485       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
2486         no need to press 'r' now.
2487    
2488 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2489       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2490         to new Jpeg Lossless decompressor
2491       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2492       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2493       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2494                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
2495 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2496       * general anonymisation in gdcmData
2497       * adding the 'color files' from
2498         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2499       * adding some well knowed bugged-header images
2500       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2501         waiting for their inclusion in Python testsuite
2502
2503 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2504     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2505       no longer seg faults when file is not found
2506
2507 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2508      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
2509        MultiFrame images
2510
2511 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2512      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2513
2514 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2515      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2516         OpenFile takes it into account
2517      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2518      * Missing elements added in dicomV3.dic
2519       (just to be affraid : have a look at
2520        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2521        and do it again next year ;->
2522
2523 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2524      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
2525        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2526        But there are NOT. It's fixed !
2527        
2528 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2529      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2530      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
2531          
2532 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2533      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2534              an ACR-NEMA / DICOM one.
2535      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
2536              is not gdcm Readable
2537      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
2538              is now decoded.
2539         
2540 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2541      * FIX: CMake generate now documentation
2542      * ENH: out of source doc build !
2543      * ENH: Generate both user and dev documentation
2544      * ENH: Should work on windows too
2545      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
2546      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
2547      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2548      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
2549                      
2550 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2551      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2552      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2553      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
2554         window level & window width
2555
2556 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2557      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2558      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2559      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2560      
2561 2003-10-06  Emanuel Ollart
2562      * FIX : compilation process wad broken.
2563              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2564         
2565 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2566      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2567      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2568      
2569 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2570      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2571            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2572                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2573       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2574
2575 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2576       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
2577         to remain compliant with already defined strings, 
2578         like Transfert Syntax UID and others)
2579
2580 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2581       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2582              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2583         
2584 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2585       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2586       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2587
2588 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2589       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2590         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2591               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2592       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2593
2594 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2595       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2596
2597 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2598       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2599         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2600
2601 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2602       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2603          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2604          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2605          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2606           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
2607                                        YBR_RCT files.
2608           (no sample found :-(
2609
2610 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2611       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2612         Two reasons: - clear things
2613                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2614                        suffer anymore VC++ complains
2615
2616 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2617       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2618       * removed leaks
2619
2620 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2621       * The lines are now eigthy characters long.for 
2622         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
2623
2624 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2625       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2626         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2627         previous commis of Malaterre)
2628       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2629         before the last Malaterre's commit.
2630
2631 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2632       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2633         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2634       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2635         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2636
2637 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2638       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2639         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2640         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2641
2642 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2643       * Cosmetic changes:
2644         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2645           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2646           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2647           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2648         - PACKAGER corrected
2649         - DEVELOPPER added.
2650         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2651       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2652
2653 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2654       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2655
2656 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2657       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2658
2659 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2660       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2661
2662 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2663       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2664
2665 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2666       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2667         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2668         heuristics to get informations (look at different places).
2669       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2670         sorting DICOM images based on different strategies.
2671       * modified Makefiles accordingly.
2672
2673 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2674       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2675         when building in debug mode
2676       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2677         src/win32/gdcmdll.dsp
2678       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2679
2680 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2681       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2682             to valgrind.
2683
2684 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2685       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2686       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
2687                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2688       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2689
2690 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2691       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2692         the file
2693       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2694       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2695         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2696       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2697         symbols... future problem ?
2698
2699 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2700       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2701       * modified gdcm.dsw accordingly
2702
2703 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2704       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2705
2706 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2707       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2708         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2709       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2710         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2711         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2712
2713 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2714       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2715
2716 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2717       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2718       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2719       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2720       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2721       * PACKAGER : adding all concerning windows
2722
2723 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2724       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2725         garbage debug code.
2726       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2727       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2728         test suite reported error.
2729       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2730         packaging a new release).
2731       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2732       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2733       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2734         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2735         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2736
2737 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2738       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2739       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2740
2741 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2742       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2743         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2744         is made in an internal list to prevent this problem.
2745         Bug fix when output is empty.
2746         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2747         correction.
2748       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2749
2750 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2751       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2752       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2753         files. Added method to remove all files on the input
2754         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2755         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2756
2757 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2758       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2759         when using make instal.
2760       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2761         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2762
2763 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2764       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2765       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2766
2767 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2768       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2769         linux and WINDOWS !
2770       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2771       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2772
2773 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2774       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2775         addon of the jpeg library)
2776       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2777       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2778       * INSTALL now points to web documentation
2779
2780 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2781       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2782         gdcmUtil.h anymore.
2783       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2784         clean target.
2785       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2786         - to allow compilation with gcc 3.x
2787           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2788           -- small fixes on exceptions.
2789           Note: linking not tested !
2790         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2791           building stage.
2792       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2793         dependent convertion).
2794
2795 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2796       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2797         Changelog):
2798         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2799         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2800           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2801         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2802
2803 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2804       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2805         compile
2806       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2807         (FileName -> Filename)
2808
2809 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2810       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2811         - UpdateProgress method should now be effective
2812         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2813           to volumes),
2814         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2815           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2816           accelerating things).
2817         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2818           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2819           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2820           in the stack (for the caller to notice the problem).
2821
2822 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2823       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2824
2825 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2826       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2827         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2828         under Windows... thanks Windows !)
2829
2830 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2831       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2832         debug stage).
2833       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2834
2835 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2836       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2837
2838 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2839       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2840         called with different flags than the default ones (with automake).
2841         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2842            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2843         and went for warning fixes:
2844         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2845           up from unused variables.
2846         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2847       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2848
2849 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2850       * gdcmPython/gdcm.i:
2851         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2852           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2853           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2854         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2855           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2856           exported to Python a as cvar.
2857       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2858         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2859         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2860         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2861         C++ static methods).
2862       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2863         with the above changes.
2864
2865 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2866       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2867
2868 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2869       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2870         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2871         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2872          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2873          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2874            a wrapper
2875          - Wrapper interface which wrap sources
2876         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2877         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2878       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2879         files for compilation
2880
2881 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2882       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2883         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2884         - vtk/Makefile.am now builds a library
2885         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2886           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2887           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2888           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2889           import library.
2890         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2891           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2892           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2893           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2894           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2895         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2896           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2897         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2898           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2899       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2900       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2901         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2902         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2903         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2904         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2905         collision of various stl members (principally cout...).
2906       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2907         file.
2908       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2909         comply with above changes)
2910
2911 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2912       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2913       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2914         vtk data structure (an image Flip was required).
2915       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2916       * cosmetic changes in documentation.
2917
2918 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2919       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2920         unexisting file is given as argument.
2921       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2922         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2923         containing those images is now available at
2924           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2925         with the name gdcmData.
2926         All the python scripts (including the package initialisation file
2927         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2928         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2929
2930 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2931       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2932         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2933         demo of the usage of this class.
2934         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2935         at configure (or autogen.sh) stage.
2936
2937 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2938       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2939         Notes on valgrind:
2940           - maximum info is obtained with a command of the form:
2941             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2942                      --show-reachable=yes PrintHeader
2943           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2944             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2945             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2946             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2947              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2948       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2949         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2950         Note: some images don't seem to work e.g.
2951             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2952       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2953         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2954         make gdcm more thread friendly.
2955
2956 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2957       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2958           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2959         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2960           gdcmHeader::_dicom_vr.
2961         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2962         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2963           VRHT*.
2964         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2965
2966 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2967       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2968         make install stage.
2969
2970 2003-04-9 JPR
2971       * UpdateGroupLength replaced by new one
2972
2973 2003-04-7 JPR
2974       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2975         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2976
2977 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2978       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2979       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2980       * src:
2981         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2982         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2983           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2984         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2985           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2986           carried the same semantics.
2987           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2988         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2989           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2990         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2991       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2992       * gdcmGetXSize added
2993       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2994       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2995
2996 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2997       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2998         (to avoid double call by end user).
2999       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
3000         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
3001
3002 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3003       * gdcm/Doc many doxygen changes:
3004         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
3005           the html.users end users oriented documentation and
3006           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
3007           oriented documentation.
3008         - README changed accordingly
3009         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
3010         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
3011           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
3012         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
3013           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
3014           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
3015       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
3016         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
3017       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
3018         ill-formed documentation sections.
3019       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
3020
3021 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3022       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
3023       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
3024         un*ces with sh-utils test utility.
3025       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
3026       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
3027       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
3028       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
3029       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
3030
3031 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3032       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
3033       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
3034
3035 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3036       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
3037       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
3038       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
3039       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
3040         compilation work.
3041       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
3042       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
3043
3044 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3045       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
3046         hence the user doesn't need this explicit call.
3047         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
3048           i.e. LoadElements() call removed.
3049       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
3050         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
3051       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
3052         for adding user defined new tags.
3053         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
3054         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
3055           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
3056
3057 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
3058       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
3059         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
3060         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
3061         with the autotools, included the python wrappers part.
3062       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
3063
3064 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3065       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
3066
3067 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3068       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
3069         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
3070         for usage).
3071       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
3072         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
3073         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
3074       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
3075         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
3076
3077 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3078       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
3079         in InstallMode or PreInstallMode but with an environment given
3080         value of GDCM_DICT_PATH.
3081       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
3082
3083 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3084       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
3085       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
3086       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
3087         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
3088         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
3089
3090 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3091       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
3092         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
3093         gdcmHeader.h
3094       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
3095         (as opposed to gdcm.h)
3096       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
3097       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
3098         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
3099       * autogen.sh removed history related references to crea package.
3100
3101 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3102       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
3103         bug.
3104
3105 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3106       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
3107         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
3108         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
3109         of hidding away the python related distutils specific files
3110         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
3111         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
3112         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
3113         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
3114
3115 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3116       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
3117       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
3118         among the list of sources.
3119
3120 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3121       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
3122       * modifications in MSVC projects
3123
3124 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3125       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
3126         looks like we can move back to original usage of exception within
3127         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
3128         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
3129       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
3130         README file for usage added.
3131       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
3132         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
3133         testing the proper parsing of a Dicom related file.
3134         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
3135       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
3136       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
3137         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
3138           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
3139           Dicom public dictionary were not accessible without an
3140           instance of class gdcmHeader.
3141         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
3142           require no instances at all to be invocated.
3143         - within gdcmDictSet this change required to change some method
3144           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
3145           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
3146       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
3147         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
3148       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
3149         the above to be effective.
3150       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
3151         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
3152       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
3153         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
3154         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
3155         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
3156         (for python dectection).
3157       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
3158         now avoids publishing the empty entries.
3159
3160 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3161       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
3162         ExtraPath reused :-P
3163       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
3164
3165 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3166       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
3167       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
3168       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
3169         and links
3170
3171 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3172       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
3173         method. Doxygenation.
3174       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
3175
3176 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3177       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
3178         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
3179         when using "python setup.py install".
3180       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
3181         reexports the working classes.
3182       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
3183         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
3184         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
3185         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
3186         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
3187         subdir (see the README file). This problem probably due to
3188         an combination of g++ and dynamic loading.
3189       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
3190
3191 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3192       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
3193         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
3194         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
3195         again in a python subdir, but the package itself is now in
3196         python/gdcmPython.
3197       * setup.py was cleaned up:
3198         - pythonIncludePath removed
3199         - python setup.py bdist target is now functional.
3200       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
3201         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
3202         accordingly.
3203
3204 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3205       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
3206       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
3207         distutils installer is operational.
3208       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
3209           shadow classes (from gdcm.py).
3210         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
3211           instead of gdcmPython/demo/load.py.
3212         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
3213
3214 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3215       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
3216         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
3217         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
3218         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
3219         dictionary.
3220         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had an unspecified fourth field
3221           are now in the "???" group.
3222         - python/gdcm.i changed accordingly,
3223         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
3224           of the above new functionalities in Python.
3225
3226 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3227       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
3228         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
3229           were definitively removed.
3230         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
3231       * src/gdcmElValSet.cxx:
3232         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
3233         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
3234         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
3235         - Added GetElementByName(string).
3236       * src/gdcmHeader.cxx: added
3237         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
3238         - GetPubElValRepByName(string)
3239         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
3240         - GetShaElValRepByName(string)
3241         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
3242         - GetShaElValRepByName(string)
3243         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
3244         - GetElValRepByName(string)
3245         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
3246         - GetElValRepByName(string)
3247       * Doc/requirements.txt added.
3248
3249 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3250       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
3251       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
3252         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
3253         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
3254         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
3255       * python/testSuite.py changed accordingly.
3256
3257 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
3258       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
3259         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
3260              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
3261               cannot be exported. [...]
3262               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
3263               be exported. [...]
3264               This is caused by a designed limitation that once a template
3265               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
3266               exported."
3267         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
3268         limitation" of VC++ is a pitfall.
3269         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
3270         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
3271         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
3272         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
3273         library.
3274         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
3275       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
3276          dll under windows !!!!)
3277       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
3278       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
3279         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
3280       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
3281         (one) of image(s).
3282       * removed glib references
3283       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
3284
3285 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3286       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
3287         that only displays required tags and testAll.py that parses all
3288         the files of the testsuite without using unittest.
3289       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
3290       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
3291       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
3292         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
3293
3294 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3295       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
3296         values, but limits itself to values which are below a user specified
3297         size (by default 1024 bytes).
3298       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
3299         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
3300         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
3301         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
3302       * python/testSuite.py
3303         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
3304         - two new examples added.
3305       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
3306
3307 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3308       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
3309         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindLength().
3310       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
3311       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
3312       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
3313
3314 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3315       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
3316         the vr was also RET.
3317       * python/testSuite.py more tests added.
3318
3319 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3320       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
3321       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
3322       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
3323         7.18 Integer types (see stdint.h)
3324         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
3325       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
3326         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
3327         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
3328         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
3329         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
3330         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
3331         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
3332         The rest of the changes we the necessary adaptations.
3333
3334 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3335       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
3336         VR files.
3337       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
3338
3339 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3340       * Adaptation for porting to VC++:
3341         - src/gdcm.h
3342           o forced to use std namespace (for string to be known)
3343           o all class use __declspec export style on WIN32
3344         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
3345           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
3346       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
3347         variable GDCM_DICT_PATH.
3348       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
3349
3350 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3351       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3352         to native Python dictionary.
3353       * python/demo/test.py:
3354         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3355         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3356       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3357         PubElVals hashing table.
3358       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3359
3360 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3361       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3362         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3363       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3364       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3365       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3366         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3367       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3368
3369 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3370       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3371         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3372         that we can import the shadow classes without errors].
3373
3374 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3375       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3376       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3377       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3378       * src/Makefile prepared for python wrapping
3379
3380 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3381       * src/gdcmHeader.cxx :
3382         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3383           (see gdcmHeader::LoadElements).
3384         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3385           ReadInt16 and ReadInt32)
3386
3387 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3388       * src/gdcmHeader.cxx :
3389         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3390           method.
3391         - SetLgrElem renamed to SetLength
3392         - GetLgrElem renamed to GetLength
3393         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3394       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3395       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3396         due to IdoDude was cleaned out.
3397
3398 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3399       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3400         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3401         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3402         returning the unecessary skL (skipped length).
3403         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3404         it was redundant with the File position internals (by using
3405         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3406         jajun.
3407       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3408         on the libido specificities which are handled through class
3409         inheritance.
3410       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3411         added.
3412
3413 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3414       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3415         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3416
3417 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3418       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3419
3420 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3421       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3422         and _IdDcmSWAP_LONG.
3423
3424 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3425       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3426         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3427