]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
ENH: update about GetMacAddress/CreateUniqueUID
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
3          smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
4          Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
5          code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
6          working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
7          problematic getIPAddress
8
9 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
10    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
11      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
12      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
13      shared libs.
14
15 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
16    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
17      sort DICOM files
18
19 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
20    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack 
21               for dealing with BIGENDIAN processors
22                         - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
23                         When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
24                         and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
25                         PixelWriteConveror, and avoid modifying the Pixel Area.
26                         Note :
27               Probabely, the same operation will have to be done when we want 
28               to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
29               and we are working onj Little Endian Processor
30                                                 
31 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
32    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
33      table.
34    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
35    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
36      all the dict content.
37    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
38      print
39    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
40
41 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
42    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
43                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
44
45 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
46    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
47    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
48    * gdcmPython/demo/ : add a new test
49
50 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
51    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
52         * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
53         * enhancement of Example/PrintDicomDir
54
55 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
56    * Now, python test might work on systems
57    * Add the PrintDicomDir test
58
59 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
60    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
61                 Explicit Big Endian Transfer Syntax files
62           (group and elem not swaped)
63         
64 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
65    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
66                 Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
67                           begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
68                           To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
69                           Document::HandleOutOfGroup0002() method 
70          * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
71               (related pb not yet solved)
72
73 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
74    * Bug fix for the python part use
75    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
76
77 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
78    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
79
80 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
81    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
82      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
83      the transfer syntax
84
85 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
86    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
87    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
88             to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
89                  and Transfer Syntax is Big Endian
90                  We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
91          * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
92          * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
93
94 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
95    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
96    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
97    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
98    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
99    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
100    gdcm::Global would destroy at exit).
101
102 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
103    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
104          environment. static const string in a header file used to be ill
105          initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
106          issue.
107
108 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
109    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
110       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
111       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
112       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
113          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
114
115 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
116    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
117      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
118      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
119      redirected to a file (ofstream).
120    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
121      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
122
123 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
124    * Removal of useless and dangerous methods :
125          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
126          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
127         * Removal of usless methods :
128          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
129    * Commenting out of probabely useless methods :
130          Dict::GetDictEntryNames()
131          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
132          DictSet::GetPubDictEntryNames()
133          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()                      
134         * ENH : New Dicom Dictionnary (with Value Multiplicity) is now used     
135         * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version    
136         * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
137            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
138                           Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods                        
139    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
140            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
141                                      Unused till now...                   
142         * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
143            should be used to write a method to replace the former
144            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
145
146 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
147    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
148      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
149      data in the DocEntry structure
150
151 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
152    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
153      And now use a static function call instead, with a global variable. i
154      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
155      and easier to use...hopefully
156
157 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
158    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
159
160 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
161    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
162
163 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
164    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
165      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
166
167 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
168    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
169    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
170      a file
171    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
172      when specifying the VR
173    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
174    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
175
176 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
177    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
178           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
179         * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
180         * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
181            in order to allow further VR modification by user
182    * REM : removal of once-called method File::WriteBase        
183                 integration of its code in formerly one-line method File::Write
184
185 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
186    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
187      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
188    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
189      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
190      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
191    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
192
193 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
194    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
195      empty Print Method
196    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
197
198 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
199    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
200    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
201    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
202    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
203    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
204
205 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
206    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
207      problems when compiling with the python wrapping
208
209 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
210    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
211      writting in ImplicitVR
212
213 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
214    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
215      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
216      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
217      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
218
219 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
220    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
221      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
222
223 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
224    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
225      Rename Decompressed to Raw
226    * Use the API changes in gdcm::File.
227    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
228      Memory leaks fixed
229
230 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
231    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
232      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
233      of Frames' field
234
235 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
236    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
237    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
238
239 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
240    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
241      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
242      solve it.
243
244 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
245    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
246      DocEntry. Now use methods of the Document !
247
248 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
249    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
250  
251 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
252    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
253    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
254    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
255    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
256      test to 0.0
257    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
258    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
259      containing found sequences
260
261 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
262    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
263      not at all time
264    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
265      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
266               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
267      and tests are now made on good variables
268
269 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
270    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
271    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
272      length
273    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
274    * Add vtkGdcmWriter example and test
275
276 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
277    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
278    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
279    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
280      SetValue
281    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
282    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
283
284 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
285    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
286    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
287
288 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
289    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
290      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
291      file isn't readable. 
292
293 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
294    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
295    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
296    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
297    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
298      method that is redondant with AddEntry.
299    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
300      SQItem
301
302 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
303    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
304    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
305    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
306
307 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
308    * Huge cleanup:
309      - Remove printf / sprintf
310      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
311      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
312        source
313      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
314        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
315      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
316        (plus it is not up to date)
317      - remove 'using namespace std' this is BAD !
318
319 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
320    * Remove memory leaks on the DicomDir
321    * Remove some useless data in DicomDirObject
322    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
323
324 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
325    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
326
327 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
328    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
329      future, with convertion)
330    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
331      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
332      from the output of the class
333
334 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
335    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
336
337 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
338    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
339      and vtkErrorMacro use.
340    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
341
342 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
343    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
344      file name in input
345    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
346    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
347      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
348      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
349      immediately after thee instruction.
350    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
351      file has been opened : the test must be made on the content of the 
352      pointer and not directly on the pointer !
353      Code formatting
354
355 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
356    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
357      the python part recompiles
358
359 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
360    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
361      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
362      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
363      all linux)
364
365 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
366    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
367      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
368      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
369      screen resolution, it's produce errors).
370      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
371    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
372    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
373      under windows at compilation
374    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
375      for grayscale images
376    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
377
378 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
379    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
380    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
381      tests on the image size X, Y, Z
382
383 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
384    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
385    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
386      between the class name and the file name
387
388 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
389    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
390      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
391      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
392      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
393      this variable content.
394
395 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
396    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
397      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
398      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
399      DocEntryArchive
400    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
401      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
402      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
403    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
404      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
405
406 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
407    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
408
409 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
410    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
411    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
412      the header.
413    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
414      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
415      write
416    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
417      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
418      is now on RGB data (as before my last commit
419    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
420
421 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
422    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
423      Add a print information of the type of the entry
424    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
425      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
426    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
427      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
428    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
429      any.
430    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
431
432 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
433    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
434      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
435      opened or not.
436
437 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
438    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
439      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
440    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
441      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
442      DocEntryArchive
443    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
444      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
445    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
446      - test the pixels written
447      - add test points to quickly find where is the error
448      - can set a file name input and output in arguments
449    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
450      amelioration of the test output
451
452 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
453    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
454      all replaced DocEntry's
455    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
456      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
457      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
458      header initial state.
459
460 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
461    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
462
463 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
464    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
465      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
466      then, it musn't change in the time.
467    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
468      header correctly. At this time, the change is only made for the first
469      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
470      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
471      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
472      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
473    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
474    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
475      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
476      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
477
478 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
479    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
480    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
481
482 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
483    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
484      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
485      is copied).
486    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
487      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
488    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
489
490 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
491    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
492      Two problems appear when doing it :
493       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
494         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
495         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
496         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
497         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
498         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
499         the gdcmBinEntry.
500       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
501         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
502         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
503         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
504         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
505    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
506
507 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
508    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
509    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
510      squeeze method
511
512 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
513    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
514    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
515      after it have been deleted
516
517 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
518    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
519    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
520    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
521      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
522      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
523
524 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
525     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
526     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
527     3. Use const ref when possible
528     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
529     5. A few more comments
530     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
531
532 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
533   * ENH: Slightly bigger patch:
534     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
535     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
536     3. File was not close properly in gdcmDict
537     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
538     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
539     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
540     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
541     8. Do not repeat virtual in subclasses
542     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
543
544 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
545   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
546     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
547     of a null character as defined by standard
548   
549 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
550   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
551     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
552
553 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
554   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
555   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
556     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
557
558 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
559   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
560     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
561     a verbose message is generated.
562     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
563     correctly close is a call to CloseFile.
564     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
565   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
566     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
567     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
568     header. A verbose is generated if these two size mismatch
569
570 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
571   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
572     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
573     break under windows (with msvc6 compilation).
574
575 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
576   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
577     compiling with MSVC6)
578
579 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
580   * Bugs fix for the Windows build with VC6
581   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
582     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
583     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
584     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
585   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
586     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
587     gdcm.i file)
588   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
589     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
590     std::cerr of vtk.
591
592 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
593   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
594   * gdcmPython/gdcm.i:
595     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
596     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
597       NOT need to be wrapped anymore.
598   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
599     DicomDir::Method) new example added.
600
601 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
602   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
603     A DicomString can contain as many \0 as they want
604     and it is *always* of even length.
605     We only support odd length for very rare case. 
606     And in the near future this should be removed.
607
608 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
609   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
610     little endian. This should -heopfully- fix some tests
611
612 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
613   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
614     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
615     the one comiled into lib
616
617 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
618   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
619     This should definitely solve any leak problem, and we should be
620     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
621
622 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
623   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
624   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
625   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
626   
627 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
628   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
629   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
630     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
631   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
632   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
633     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
634     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
635       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
636       no longer exists.
637
638 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
639   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
640    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
641    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
642    the class.
643   
644 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
645   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
646     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
647     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
648
649 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
650   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
651   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
652     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
653     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
654     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
655       CloseFile() anymore.
656     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
657       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
658       into File::Pixel_Data.
659
660 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
661   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
662     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
663   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
664     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
665     method:
666     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
667     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
668       method to those classes.
669     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
670       -- Added a ::Print() method.
671       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
672       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
673          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
674
675 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
676   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
677     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
678     doxygen.
679   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
680   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
681     pointlessly wrapped (see
682     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
683   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
684     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
685     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
686     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
687     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
688       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
689            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
690       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
691          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
692
693 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
694   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
695     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
696
697 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
698   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
699     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
700     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
701   * TODO added new entry.
702   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
703     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
704     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
705     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
706       variable names for semantical coherence.
707
708 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
709   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
710   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
711   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
712   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
713   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
714   compilation time jpeg option.
715
716 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
717   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
718     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
719     reproduce at home.
720   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
721   Thanks dcmtk crew !
722
723 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
724   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
725   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
726     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
727   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
728   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
729   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
730   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
731     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
732     from File:: to PixelConvert::.
733
734 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
735   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
736     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
737      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
738      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
739
740 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
741   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
742   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
743   like this:
744     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
745   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
746   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
747   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
748
749 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
750   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
751     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
752     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
753     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
754     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
755       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
756       (for the time being this is better than having them attach to
757        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
758     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
759       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
760     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
761       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
762       gdcmPixelConvert::
763
764 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
765   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
766   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
767     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
768       clean up of RLE related code. 
769   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
770     - src/gdcmRLE.cxx removed
771     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
772     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
773     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
774   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
775     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
776       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
777       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
778
779 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
780   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
781     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
782       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
783       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
784       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
785       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
786       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
787       offsets.
788   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
789     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
790         with the retired Parse7Fe0().
791     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
792     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
793
794 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
795   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
796     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
797     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
798     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
799   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
800     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
801       to return an unused length.
802
803 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
804   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
805     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
806     to use to do simple stuff.
807
808 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
809   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
810     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
811     copying of the file within different directory, configure header file to
812     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
813     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
814
815 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
816   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
817      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
818        with it's binary name).
819      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
820        the Website to be more complete.
821      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
822        doxygenated documentation.
823      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
824        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
825                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
826   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
827   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
828    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
829
830 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
831   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
832    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
833
834 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
835   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
836     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
837     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
838     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
839     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
840   * GDCMHOME clean up:
841     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
842       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
843       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
844   * Autotools clean up:
845     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
846     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
847
848 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
849   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
850   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
851   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
852
853 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
854   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
855     describing TODO entries and used it for new entries.
856   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
857     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
858     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
859   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
860     documentation itself, but the website) moved to html and
861     placed in directory Doc/Website:
862     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
863     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
864     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
865   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
866   * CMakeLists.txt changed accordingly.
867   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
868     DeveloppersPython.html
869   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
870
871 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
872   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
873     of gdcm Web site.
874
875 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
876   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
877     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
878     we can now delete[] it safely 
879   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
880     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
881   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
882
883 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
884   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
885     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
886     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
887     pointed content.
888
889 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
890   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
891   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
892
893 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
894   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
895     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
896     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
897     an example of usage.
898     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
899       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
900     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
901       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
902     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
903     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
904     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
905
906 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
907   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
908     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
909     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
910     in class 
911     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
912       and associated accessors. Doxygenation of the class.
913     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
914       accessors added.
915     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
916       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
917     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
918     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
919
920 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
921   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
922     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
923       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
924            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
925            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
926            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
927            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
928            the same group and element all share the same (group, element)
929            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
930            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
931            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
932            consider the following definition of a TagKey:
933            - let Group, Element be the string representation of the
934              group and element dicom tag members,
935            - let ItemNumber be the string representation of the integer
936              index of the considered item number of a sequence,
937            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
938            the form:
939               /ItemNumber#Group|Element
940            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
941            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
942               Group|Element<SeqTag>
943            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
944            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
945            string e.g.
946                0028|1201
947            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
948            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
949            string e.g.
950                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
951     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
952       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
953       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
954     - src/gdcmDocEntry.cxx:
955       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
956          Key member.
957       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
958     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
959     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
960       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
961       -- now has a new BaseTagKey member.
962       -- STYLE.
963   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
964     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
965     truly belongs.
966     This poses the problem with the semantics of the following lines
967        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
968        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
969        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
970     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
971     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
972     order to get things working the dicom dictionary was altered !
973     Please fix things urgently...
974   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
975     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
976     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
977     set to OW:
978       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
979       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
980       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
981   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
982     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
983   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
984
985 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
986   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
987
988 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
989   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
990     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
991   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
992   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
993
994 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
995   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
996     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
997   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
998     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
999   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1000     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1001   * TODO updated
1002   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1003     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1004   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1005   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1006     exception_on_error parameter.
1007     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1008     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1009     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1010
1011 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1012   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1013   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1014     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1015   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1016   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1017   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1018     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1019   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1020
1021 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1022   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1023     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1024
1025 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1026   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1027        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1028  
1029 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1030   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
1031         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1032
1033 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1034    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1035    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1036      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1037      is now in static in the gdcmDebug class
1038    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1039    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1040
1041 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1042    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1043      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1044    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1045      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1046      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1047      that displays position and size).
1048    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1049      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1050      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1051      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1052      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1053      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1054      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1055         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
1056      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1057      commiting changes).
1058    * Test/CMakeLists.txt:
1059       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1060       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1061         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1062         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1063    * TODO updated.
1064
1065 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1066    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1067      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1068      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1069      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1070      - removal of typedef duplication.
1071      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1072      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1073    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1074       - printf polluting ctest removed.
1075       - TAB removal for comminting
1076    * Test:
1077      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1078        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
1079        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1080        this test creates them.
1081        Note: we need to validate each reference image, but before that
1082              I'd like to rename them with a more explicit name...
1083      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1084    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
1085      including each header needed).
1086
1087 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1088    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1089      test suite to the Example directory. Are concerned:
1090      - PrintHeader.cxx
1091      - TestDcm2Acr.cxx
1092      - TestFindTags.cxx
1093      - TestWrite.cxx was
1094      - TestWriteSimple.cxx
1095    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1096      image gdcmData/oldACR00001.ima
1097
1098 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1099    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1100      with removal from gdcmData):
1101       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1102       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1103       - US.3405.1.dcm
1104      Added the following because after last cvs update, they cause
1105        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
1106      to segfault:
1107       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1108       - oldACR00001.ima
1109    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1110      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1111      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1112      form of test...
1113    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1114      we don't need to black list the following images anymore:
1115       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1116       - OT-PAL-8-face.dcm
1117       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1118    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1119      fixes and the beautified code ;-)
1120      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1121      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1122      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1123            improve the test suite). The bug could be detected by using
1124            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1125            or by using
1126            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1127            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1128
1129 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1130    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1131          - replace by uggly but working old code :-(
1132    A lot of things should be OK again.
1133    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
1134    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1135    (twice, withing a fortnigh ...)      
1136
1137 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1138    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1139      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1140    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1141      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1142      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1143                    - OT-PAL-8-face.dcm
1144                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1145    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1146      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1147      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1148      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1149      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
1150      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1151      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1152      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1153      image.
1154    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1155      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1156      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1157      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1158    
1159 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1160   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1161   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
1162                           (instead of infinite loop)
1163   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
1164
1165 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1166    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1167
1168 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1169    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1170            when SamplesPerPixel =3
1171          - now Write is no longer confused by 
1172           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1173          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
1174                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1175    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
1176            (in order to split the job that has not to be done 
1177            for gdcmDicomDir)
1178
1179 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1180    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1181      loop on the same image until memory went out. 
1182      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1183    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1184      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1185
1186 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1187    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
1188             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1189             is added a the end, when necessary.
1190             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
1191               now written correctly
1192             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
1193               (even for odd groups) 
1194         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1195                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1196
1197 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1198    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1199    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
1200      coding style).
1201
1202 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1203    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1204      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1205    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1206
1207 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1208    FIX : gdcmDocument.cxx
1209       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1210         code 'beautyfication' :-(
1211       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1212
1213 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1214    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
1215             : to allow user to create his own Sequences
1216    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1217
1218    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1219
1220    - gdcmBinEntry
1221      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1222   
1223    - gdcmDocEntry
1224      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1225      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1226   
1227    - gdcmDocEntrySet
1228      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1229      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1230      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1231      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1232      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
1233      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1234                                             guint16 element,
1235                                             std::string vr     = "unkn",
1236                                             std::string fourth = "unkn",
1237                                             std::string name   = "unkn"); 
1238      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
1239      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1240      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1241      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
1242      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1243      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1244      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1245      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1246   
1247    - gdcmDocument
1248      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1249      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1250      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1251      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1252      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1253                                         FILE *_fp, FileType type);
1254      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1255      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1256      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1257      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1258      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1259      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1260      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1261      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1262                                             guint16 element,
1263                                             std::string vr     = "unkn",
1264                                             std::string fourth = "unkn",
1265                                             std::string name   = "unkn");
1266      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1267      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1268      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1269      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1270                                                                                                                  
1271         - gdcmElementSet
1272           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1273           
1274    - gdcmSeqEntry
1275           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1276  
1277    - gdcmSQItem
1278      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1279      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
1280      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1281      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1282
1283    - gdcmValEntry
1284          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
1285                                   
1286 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1287     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1288       The default constructor invoked by the line
1289          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1290       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1291       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1292       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1293     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1294       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1295       Could anyone explain why ?
1296     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1297       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
1298       code related to gdcmBinEntry).
1299
1300 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1301     * In order to fix memory leaks:
1302      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1303        some delete calls.
1304      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1305      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1306        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1307        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1308        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1309      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1310      - src/gdcmDocument.cxx:
1311        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1312           from dynamic stores.
1313        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1314           was causing memory leaks.
1315      - src/gdcmSQItem.cxx:
1316        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1317           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1318        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1319           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1320           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1321           This avoids SegFaulting.
1322      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1323     * Conclusion:
1324      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1325        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1326        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1327      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1328        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1329      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1330        segfaults).
1331     * Erroneous leading white fix:
1332      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1333        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1334      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1335      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1336     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1337     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1338
1339
1340 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1341     * In order to fix writing of dicom files:
1342      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1343      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1344      - src/gdcmDocument.cxx:
1345        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1346        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1347        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1348           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1349           manner.
1350        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1351           to only declared) and build on top of
1352           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1353        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1354      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1355        for usage in destructor and treatement of promotion in
1356        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1357      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1358       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1359     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1360       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1361       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1362       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1363
1364 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1365     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1366       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1367       learned that:
1368           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1369           soon as possible by globally disabling memory caching.
1370           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1371           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1372       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1373       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1374       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1375     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1376       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1377       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1378       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1379         with 1.
1380       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1381       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1382       understand why the list is empty...).
1383     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1384     * Doc/License.txt added.
1385
1386 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1387     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1388       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1389         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1390         the padding problem.
1391       - general clean up, simplification, and coding style.
1392       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1393     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1394
1395 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
1396    *  gdcmSeqEntry.cxx
1397            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1398                 - fix the display of SQItem ordinal number
1399       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1400                 - remove some useless never written private methods     
1401                 
1402 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1403    * gdcmBinEntry.cxx 
1404       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1405            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1406               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1407                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1408    * dcmDocument.cxx
1409       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1410               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1411            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1412       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1413    * gdcmFile.cxx
1414       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1415    * gdcmSQItem.h
1416       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1417             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1418             \warning : some pb remaining around this number
1419                                 will be solved asap
1420       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1421    * gdcmValEntry.cxx 
1422       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1423
1424 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1425     * Memory leak hunt with the following command:
1426       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1427                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1428       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1429       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1430       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1431           grep "MEMORY LEAK" src/*
1432       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1433       -----
1434           #include <string>
1435           int main() {
1436              std::string name;
1437              char * test = "babo";
1438              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1439                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1440              name.clear();   //// Doesn't help !
1441              return 0;
1442           }
1443       -----
1444           #include <string>
1445           #include <iostream>
1446           int main() {
1447              std::string line;
1448              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1449              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1450                                         //// of 1320 bytes in call to
1451                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1452             return 0;
1453           }
1454       -----
1455
1456
1457 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1458     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1459       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1460         and related, moved away to gdcmDocument.
1461       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1462         the corresponding protected accessors of inherited class
1463         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1464         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1465       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1466       - Clean up of undefined or unused methods.
1467     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1468       account the changes to gdcmHeader.h).
1469     * src/gdcmDocument.h:
1470       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1471         changes to gdcmHeader.h).
1472       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1473         (see changes to gdcmHeader.h).
1474       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1475       - Clean up of undefined or unused methods.
1476     * src/gdcmDocument.cxx:
1477       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1478       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1479       - some std::string properly set to VRKey
1480     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1481       references to gdcmDocument. 
1482     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1483     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1484       cvs repository gdcmData.
1485
1486 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1487     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1488     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1489       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1490     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1491     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1492       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1493     * src/gdcmDocument.cxx: 
1494       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1495         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1496       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1497         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1498         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1499         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1500         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1501               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1502               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1503     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1504     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1505       now taken into account.
1506     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1507       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1508     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1509       on posix.
1510     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1511       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1512     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1513
1514 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1515     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1516       gdcmGlob
1517     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1518     * src/gdcmUtil.h : export methods
1519
1520 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1521     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1522       to right behavior
1523     * Initial addition of automatic python testing
1524     * Initial addition of automatic image comparison
1525
1526 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1527     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1528       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1529
1530 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1531      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1532      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1533      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1534
1535 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1536      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1537        new concepts (and new classes) :
1538        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1539         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1540         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1541        a Sequence is composed of Items.
1542        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1543        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1544        (never taken into account)
1545        Our unability to add a new 'entry' in the header
1546        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1547        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1548        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1549        nothing is finished.
1550        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1551
1552 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1553      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1554      
1555 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1556      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1557        file prefix (SetFilePrefix)
1558
1559 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1560      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1561        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1562        baseline.
1563      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1564        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1565
1566 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1567      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1568        dicom image
1569
1570 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1571      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1572      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1573        between the developper and user version.
1574      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1575      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1576
1577 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1578      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1579        when using cmake.
1580
1581 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1582      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1583                src directory, now generated in the build dir.
1584             2. Tests as mentionned smarter
1585             3. Some clean up
1586             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1587           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1588           where we could set the institution name / patient name...
1589
1590        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1591               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1592                  (this was not true before)
1593
1594 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1595      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1596            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1597      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1598            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1599            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1600      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1601            tree-like structure of a Dicom Header.
1602      * FIX Test code cleaning     
1603            
1604 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1605      * ENH: Adding automatic testing
1606        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1607        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1608        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1609        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1610           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1611           too many projects
1612      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1613      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1614        one file instead of seven + some small cleanup
1615
1616 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1617      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1618      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1619            Header printing. Example given with :
1620            > PrintHeader fileName  2 new
1621           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1622            
1623 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1624      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1625          1. I have added some unsigned where needed
1626          2. Some function parameter not used -> (void)
1627          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1628          4. g++ don't like character '\' in comment
1629          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1630                     this really need to be fixed
1631          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1632          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1633                     this also really need to be fixed
1634          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1635                     remove compression file 
1636                     (as we only do decompression, right ?)     
1637      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1638
1639 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1640      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1641            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1642            defaulted to yspacing
1643            
1644 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1645      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1646      * ENH add parameters :
1647                bool  exception_on_error = false, 
1648                bool  enable_sequences   = false,
1649                bool  ignore_shadow      = false
1650            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1651      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1652            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1653               
1654 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1655      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1656      
1657 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1658      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1659      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1660              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1661              
1662 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1663      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1664          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1665
1666 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1667      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1668        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1669        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1670        in gdcmHeader.
1671      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1672        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1673        already does the job.
1674      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1675        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1676
1677 2004-03-30 Benoit Regrain
1678      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1679        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1680        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1681
1682 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1683      * ENH : Check on file type to be written moved
1684              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1685      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1686              when end-of-list is reached
1687            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1688
1689 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1690      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1691      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1692      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1693        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1694
1695 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1696      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1697        now contains all the gdcmGlobal related code.
1698      * minor coding style and doxygenation changes.
1699
1700 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1701      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1702        now contains all the Debug related code.
1703      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1704      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1705        CreateCleanString) removed.
1706      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1707      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1708      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1709      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1710        src/gdcmDirList.cxx)
1711
1712 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1713      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1714
1715 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1716      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1717            big endian made volumes
1718      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1719            end user to instanciate class gdcmParser
1720           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1721
1722 2004-03-22 Benoit Regrain
1723      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1724      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1725              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1726
1727 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1728      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1729            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1730            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1731            or build from the files held (recursively) in a Directory
1732            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1733            gdcmObject::SetBoundaries() added
1734
1735 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1736      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1737                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1738      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1739            DICOMDIR
1740      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1741            about the name
1742
1743 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1744      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1745                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1746
1747 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1748      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1749            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1750            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1751            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1752            to allow making gdcDicomDir object.
1753      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1754           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1755
1756 2004-02-11 Benoit Regrain
1757      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1758              when using from python
1759
1760 2004-02-10 Benoit Regrain
1761      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1762      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1763      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1764              directory parsing
1765
1766 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1767      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1768              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1769              - class gdcmMeta created
1770      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1771              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1772      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1773
1774 2004-02-05 Benoit Regrain
1775      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1776              header entries
1777      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1778      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1779
1780 2004-02-04 Benoit Regrain
1781      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1782      * FIX : sort the images in the dicom dir
1783      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1784      * ADD : a python demo
1785
1786 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1787      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1788      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1789              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1790              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1791              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1792      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1793            to make full checking easier
1794         
1795 2004-02-04 Benoit Regrain
1796      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1797      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1798
1799 2004-02-03 Benoit Regrain
1800      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1801      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1802      * Bug fix and print add-on
1803
1804 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1805      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1806      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1807      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1808      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1809            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1810         
1811 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1812      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1813              iterator on last
1814              of the last synonym :-(
1815      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1816              for DICOMDIR ;-)
1817      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1818      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1819      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1820            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1821       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1822
1823 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1824      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1825            no longer writes 'Un' on disk
1826      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1827      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1828            the length (for Palette expanded images)
1829            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1830      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1831            (that broke Write). Replaced by UL.
1832            Aware user will reload the field if he 
1833            thinks it's necesssary
1834              
1835 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1836      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1837        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1838        IsReadable() methods.
1839        
1840      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1841       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1842       but so usefull for people that miss them ;-)
1843       
1844      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1845        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1846
1847 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1848      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1849
1850 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1851      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1852              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1853         The TRUE value for this param has to be used 
1854         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1855         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1856      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1857              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1858         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1859         
1860      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1861              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1862              Fixed
1863
1864      * gdcmHeader add the method
1865              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1866         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1867         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1868         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1869
1870 2004-01-26 Benoit Regrain
1871      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1872        in the print and add a third level of print to print them
1873
1874 2004-01-23 Benoit Regrain
1875      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1876      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1877      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1878        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1879
1880 2004-01-22 Benoit Regrain
1881      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1882      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1883
1884 2004-01-19 Benoit Regrain
1885      * Add the use of shadow dictionaries
1886      * bug fix and coding style
1887
1888 2004-01-19 Benoit Regrain
1889      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1890      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1891      * Add the update of header entries using the shadow library
1892
1893 2004-01-19 Benoit Regrain
1894      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1895      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1896        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1897        of dicom dir parsing
1898      * bug fix under python
1899
1900 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1901     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1902     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1903     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1904     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1905
1906 2004-01-15 Benoit Regrain
1907      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1908        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1909        when the gdcmDictSet will be destroyed
1910      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1911        gdcmDictSet
1912
1913 2004-01-15 Benoit Regrain
1914      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1915        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1916        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1917        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1918      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1919
1920 2004-01-14 Benoit Regrain
1921      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1922      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1923      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1924      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1925
1926 2004-01-13 Benoit Regrain
1927      * src/*.[h|cxx] : coding style
1928      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1929
1930 2004-01-13 Benoit Regrain
1931      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1932      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1933        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1934      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1935
1936 2004-01-12 Benoit Regrain
1937      * src/*.h : add comments
1938      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1939      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1940        directly setted in the source code
1941      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1942        gdcmTS and gdcmVR
1943
1944 2004-01-09 Benoit Regrain
1945      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1946      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1947
1948 2004-01-07 Benoit Regrain
1949      * Modification to compile with the distutils.
1950      * Bug fix in code
1951
1952 2003-12-10 Benoit Regrain
1953      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1954        can use a gdcmHeaderHelper to load data
1955      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1956        made in the source code
1957
1958 2003-12-10 Benoit Regrain
1959      * Update Windows projects and .cvsignore files
1960
1961 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1962      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1963            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1964            if he wants to.
1965            gdcmElValSet:Print takes it into account
1966
1967 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1968      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1969      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1970      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1971
1972 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1973       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1974              on the ListTag listElem member,
1975              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1976       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1977              with the tagHt member and the listElem member.
1978              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1979
1980       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1981              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1982                             if bug fixing is necessary), for internal
1983                             use only
1984              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1985                             or to allow Parser going on.
1986              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1987              with a length (not 0000) is found
1988       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1989                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1990                 (to be written)
1991
1992 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1993      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1994      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1995           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1996      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1997
1998 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1999      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2000
2001 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2002      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2003           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2004
2005 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2006      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2007      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2008              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2009              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2010
2011 2003-11-05 Benoit Regrain
2012      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2013                        : Explicit error messages
2014      * in __init__.py  : Related modif
2015
2016 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2017      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2018            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2019            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2020      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2021                     (vtkGdcmReader compliant)           
2022       
2023 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2024      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2025        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2026        
2027 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2028      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
2029            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2030
2031 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2032      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
2033                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2034              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2035              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2036              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2037              such an image :
2038              After gdcmHeader :
2039               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2040               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2041               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2042      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2043              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2044
2045 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2046      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2047              
2048 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2049      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
2050            being coherents dicom files.
2051      
2052 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2053      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2054            from medcon lib !
2055      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
2056      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2057      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2058      * ENH: Add include dir to medcon lib
2059      * FIX: only one function is being exported for now ! 
2060            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2061             
2062 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2063       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2064         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2065           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2066       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2067
2068 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2069       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2070         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2071         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2072       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2073       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2074
2075 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2076       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2077                                                
2078 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2079       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2080       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2081       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2082       
2083 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2084       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2085       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2086       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2087       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2088       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2089       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
2090              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2091         But it fasten debug compilation time.
2092             
2093 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2094       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2095         (they are compressed as 2 planes images, 
2096          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2097
2098 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2099       * Now CheckRead takes into account :
2100          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2101          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2102       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2103        (breaks DicomWorks)
2104
2105 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2106       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
2107              one should remove the '\'
2108         
2109 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2110       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
2111         (wrong lengths in header)
2112         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2113       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2114         (breaks DicomWorks)
2115
2116 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2117       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
2118         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2119
2120 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2121       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2122       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2123
2124 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2125       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2126      
2127 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2128       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2129         (the patch is easy to remove)
2130       * cosmetic changes to avoid warnings
2131       
2132 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2133       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
2134         no need to press 'r' now.
2135    
2136 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2137       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2138         to new Jpeg Lossless decompressor
2139       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2140       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2141       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2142                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
2143 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2144       * general anonymisation in gdcmData
2145       * adding the 'color files' from
2146         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2147       * adding some well knowed bugged-header images
2148       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2149         waiting for their inclusion in Python testsuite
2150
2151 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2152     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2153       no longer seg faults when file is not found
2154
2155 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2156      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
2157        MultiFrame images
2158
2159 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2160      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2161
2162 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2163      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2164         OpenFile takes it into account
2165      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2166      * Missing elements added in dicomV3.dic
2167       (just to be affraid : have a look at
2168        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2169        and do it again next year ;->
2170
2171 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2172      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
2173        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2174        But there are NOT. It's fixed !
2175        
2176 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2177      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2178      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
2179          
2180 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2181      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2182              an ACR-NEMA / DICOM one.
2183      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
2184              is not gdcm Readable
2185      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
2186              is now decoded.
2187         
2188 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2189      * FIX: CMake generate now documentation
2190      * ENH: out of source doc build !
2191      * ENH: Generate both user and dev documentation
2192      * ENH: Should work on windows too
2193      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
2194      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
2195      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2196      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
2197                      
2198 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2199      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2200      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2201      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
2202         window level & window width
2203
2204 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2205      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2206      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2207      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2208      
2209 2003-10-06  Emanuel Ollart
2210      * FIX : compilation process wad broken.
2211              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2212         
2213 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2214      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2215      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2216      
2217 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2218      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2219            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2220                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2221       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2222
2223 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2224       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
2225         to remain compliant with already defined strings, 
2226         like Transfert Syntax UID and others)
2227
2228 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2229       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2230              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2231         
2232 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2233       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2234       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2235
2236 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2237       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2238         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2239               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2240       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2241
2242 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2243       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2244
2245 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2246       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2247         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2248
2249 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2250       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2251          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2252          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2253          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2254           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
2255                                             YBR_RCT files.
2256           (no sample found :-(
2257
2258 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2259       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2260         Two reasons: - clear things
2261                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2262                        suffer anymore VC++ complains
2263
2264 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2265       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2266       * removed leaks
2267
2268 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2269       * The lines are now eigthy characters long.for 
2270         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
2271
2272 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2273       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2274         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2275         previous commis of Malaterre)
2276       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2277         before the last Malaterre's commit.
2278
2279 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2280       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2281         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2282       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2283         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2284
2285 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2286       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2287         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2288         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2289
2290 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2291       * Cosmetic changes:
2292         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2293           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2294           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2295           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2296         - PACKAGER corrected
2297         - DEVELOPPER added.
2298         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2299       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2300
2301 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2302       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2303
2304 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2305       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2306
2307 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2308       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2309
2310 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2311       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2312
2313 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2314       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2315         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2316         heuristics to get informations (look at different places).
2317       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2318         sorting DICOM images based on different strategies.
2319       * modified Makefiles accordingly.
2320
2321 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2322       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2323         when building in debug mode
2324       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2325         src/win32/gdcmdll.dsp
2326       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2327
2328 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2329       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2330             to valgrind.
2331
2332 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2333       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2334       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
2335                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2336       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2337
2338 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2339       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2340         the file
2341       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2342       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2343         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2344       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2345         symbols... future problem ?
2346
2347 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2348       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2349       * modified gdcm.dsw accordingly
2350
2351 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2352       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2353
2354 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2355       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2356         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2357       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2358         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2359         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2360
2361 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2362       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2363
2364 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2365       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2366       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2367       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2368       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2369       * PACKAGER : adding all concerning windows
2370
2371 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2372       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2373         garbage debug code.
2374       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2375       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2376         test suite reported error.
2377       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2378         packaging a new release).
2379       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2380       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2381       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2382         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2383         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2384
2385 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2386       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2387       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2388
2389 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2390       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2391         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2392         is made in an internal list to prevent this problem.
2393         Bug fix when output is empty.
2394         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2395         correction.
2396       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2397
2398 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2399       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2400       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2401         files. Added method to remove all files on the input
2402         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2403         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2404
2405 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2406       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2407         when using make instal.
2408       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2409         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2410
2411 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2412       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2413       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2414
2415 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2416       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2417         linux and WINDOWS !
2418       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2419       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2420
2421 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2422       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2423         addon of the jpeg library)
2424       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2425       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2426       * INSTALL now points to web documentation
2427
2428 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2429       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2430         gdcmUtil.h anymore.
2431       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2432         clean target.
2433       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2434         - to allow compilation with gcc 3.x
2435           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2436           -- small fixes on exceptions.
2437           Note: linking not tested !
2438         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2439           building stage.
2440       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2441         dependent convertion).
2442
2443 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2444       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2445         Changelog):
2446         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2447         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2448           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2449         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2450
2451 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2452       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2453         compile
2454       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2455         (FileName -> Filename)
2456
2457 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2458       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2459         - UpdateProgress method should now be effective
2460         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2461           to volumes),
2462         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2463           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2464           accelerating things).
2465         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2466           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2467           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2468           in the stack (for the caller to notice the problem).
2469
2470 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2471       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2472
2473 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2474       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2475         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2476         under Windows... thanks Windows !)
2477
2478 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2479       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2480         debug stage).
2481       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2482
2483 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2484       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2485
2486 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2487       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2488         called with different flags than the default ones (with automake).
2489         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2490            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2491         and went for warning fixes:
2492         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2493           up from unused variables.
2494         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2495       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2496
2497 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2498       * gdcmPython/gdcm.i:
2499         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2500           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2501           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2502         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2503           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2504           exported to Python a as cvar.
2505       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2506         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2507         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2508         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2509         C++ static methods).
2510       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2511         with the above changes.
2512
2513 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2514       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2515
2516 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2517       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2518         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2519         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2520          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2521          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2522            a wrapper
2523          - Wrapper interface which wrap sources
2524         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2525         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2526       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2527         files for compilation
2528
2529 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2530       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2531         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2532         - vtk/Makefile.am now builds a library
2533         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2534           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2535           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2536           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2537           import library.
2538         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2539           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2540           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2541           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2542           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2543         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2544           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2545         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2546           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2547       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2548       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2549         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2550         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2551         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2552         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2553         collision of various stl members (principally cout...).
2554       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2555         file.
2556       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2557         comply with above changes)
2558
2559 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2560       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2561       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2562         vtk data structure (an image Flip was required).
2563       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2564       * cosmetic changes in documentation.
2565
2566 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2567       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2568         unexisting file is given as argument.
2569       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2570         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2571         containing those images is now available at
2572           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2573         with the name gdcmData.
2574         All the python scripts (including the package initialisation file
2575         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2576         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2577
2578 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2579       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2580         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2581         demo of the usage of this class.
2582         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2583         at configure (or autogen.sh) stage.
2584
2585 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2586       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2587         Notes on valgrind:
2588           - maximum info is obtained with a command of the form:
2589             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2590                      --show-reachable=yes PrintHeader
2591           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2592             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2593             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2594             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2595              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2596       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2597         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2598         Note: some images don't seem to work e.g.
2599             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2600       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2601         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2602         make gdcm more thread friendly.
2603
2604 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2605       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2606           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2607         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2608           gdcmHeader::_dicom_vr.
2609         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2610         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2611           VRHT*.
2612         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2613
2614 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2615       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2616         make install stage.
2617
2618 2003-04-9 JPR
2619       * UpdateGroupLength replaced by new one
2620
2621 2003-04-7 JPR
2622       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2623         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2624
2625 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2626       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2627       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2628       * src:
2629         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2630         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2631           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2632         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2633           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2634           carried the same semantics.
2635           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2636         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2637           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2638         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2639       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2640       * gdcmGetXSize added
2641       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2642       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2643
2644 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2645       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2646         (to avoid double call by end user).
2647       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2648         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2649
2650 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2651       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2652         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2653           the html.users end users oriented documentation and
2654           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2655           oriented documentation.
2656         - README changed accordingly
2657         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2658         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2659           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2660         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2661           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2662           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2663       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2664         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2665       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2666         ill-formed documentation sections.
2667       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2668
2669 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2670       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2671       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2672         un*ces with sh-utils test utility.
2673       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2674       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2675       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2676       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2677       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2678
2679 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2680       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2681       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2682
2683 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2684       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2685       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2686       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2687       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2688         compilation work.
2689       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2690       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2691
2692 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2693       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2694         hence the user doesn't need this explicit call.
2695         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2696           i.e. LoadElements() call removed.
2697       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2698         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2699       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2700         for adding user defined new tags.
2701         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2702         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2703           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2704
2705 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2706       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2707         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2708         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2709         with the autotools, included the python wrappers part.
2710       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2711
2712 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2713       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2714
2715 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2716       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2717         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2718         for usage).
2719       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2720         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2721         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2722       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2723         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2724
2725 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2726       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2727         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2728         value of GDCM_DICT_PATH.
2729       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2730
2731 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2732       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2733       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2734       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2735         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2736         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2737
2738 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2739       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2740         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2741         gdcmHeader.h
2742       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2743         (as opposed to gdcm.h)
2744       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2745       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2746         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2747       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2748
2749 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2750       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2751         bug.
2752
2753 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2754       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2755         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2756         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2757         of hidding away the python related distutils specific files
2758         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2759         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2760         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2761         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2762
2763 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2764       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2765       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2766         among the list of sources.
2767
2768 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2769       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2770       * modifications in MSVC projects
2771
2772 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2773       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2774         looks like we can move back to original usage of exception within
2775         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2776         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2777       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2778         README file for usage added.
2779       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2780         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2781         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2782         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2783       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2784       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2785         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2786           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2787           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2788           instance of class gdcmHeader.
2789         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2790           require no instances at all to be invocated.
2791         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2792           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2793           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2794       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2795         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2796       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2797         the above to be effective.
2798       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2799         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2800       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2801         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2802         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2803         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2804         (for python dectection).
2805       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2806         now avoids publishing the empty entries.
2807
2808 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2809       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2810         ExtraPath reused :-P
2811       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2812
2813 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2814       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2815       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2816       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2817         and links
2818
2819 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2820       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2821         method. Doxygenation.
2822       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2823
2824 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2825       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2826         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2827         when using "python setup.py install".
2828       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2829         reexports the working classes.
2830       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2831         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2832         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2833         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2834         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2835         subdir (see the README file). This problem probably due to
2836         an combination of g++ and dynamic loading.
2837       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2838
2839 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2840       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2841         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2842         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2843         again in a python subdir, but the package itself is now in
2844         python/gdcmPython.
2845       * setup.py was cleaned up:
2846         - pythonIncludePath removed
2847         - python setup.py bdist target is now functional.
2848       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2849         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2850         accordingly.
2851
2852 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2853       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2854       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2855         distutils installer is operational.
2856       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2857           shadow classes (from gdcm.py).
2858         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2859           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2860         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2861
2862 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2863       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2864         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2865         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2866         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2867         dictionary.
2868         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2869           are now in the "???" group.
2870         - python/gdcm.i changed accordingly,
2871         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2872           of the above new functionalities in Python.
2873
2874 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2875       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2876         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2877           were definitively removed.
2878         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2879       * src/gdcmElValSet.cxx:
2880         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2881         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2882         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2883         - Added GetElementByName(string).
2884       * src/gdcmHeader.cxx: added
2885         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2886         - GetPubElValRepByName(string)
2887         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2888         - GetShaElValRepByName(string)
2889         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2890         - GetShaElValRepByName(string)
2891         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2892         - GetElValRepByName(string)
2893         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2894         - GetElValRepByName(string)
2895       * Doc/requirements.txt added.
2896
2897 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2898       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2899       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2900         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2901         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2902         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2903       * python/testSuite.py changed accordingly.
2904
2905 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2906       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2907         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2908              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2909               cannot be exported. [...]
2910               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2911               be exported. [...]
2912               This is caused by a designed limitation that once a template
2913               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2914               exported."
2915         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2916         limitation" of VC++ is a pitfall.
2917         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2918         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2919         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2920         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2921         library.
2922         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2923       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2924          dll under windows !!!!)
2925       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2926       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2927         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2928       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2929         (one) of image(s).
2930       * removed glib references
2931       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2932
2933 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2934       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2935         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2936         the files of the testsuite without using unittest.
2937       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2938       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2939       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2940         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2941
2942 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2943       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2944         values, but limits itself to values which are below a user specified
2945         size (by default 1024 bytes).
2946       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2947         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2948         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2949         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2950       * python/testSuite.py
2951         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2952         - two new examples added.
2953       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2954
2955 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2956       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2957         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2958       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2959       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2960       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2961
2962 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2963       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2964         the vr was also RET.
2965       * python/testSuite.py more tests added.
2966
2967 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2968       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2969       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2970       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2971         7.18 Integer types (see stdint.h)
2972         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2973       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2974         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2975         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2976         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2977         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2978         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2979         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2980         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2981
2982 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2983       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2984         VR files.
2985       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2986
2987 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2988       * Adaptation for porting to VC++:
2989         - src/gdcm.h
2990           o forced to use std namespace (for string to be known)
2991           o all class use __declspec export style on WIN32
2992         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2993           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2994       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2995         variable GDCM_DICT_PATH.
2996       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2997
2998 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2999       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3000         to native Python dictionary.
3001       * python/demo/test.py:
3002         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3003         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3004       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3005         PubElVals hashing table.
3006       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3007
3008 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3009       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3010         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3011       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3012       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3013       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3014         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3015       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3016
3017 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3018       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3019         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3020         that we can import de shadow classes without errors].
3021
3022 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3023       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3024       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3025       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3026       * src/Makefile prepared for python wrapping
3027
3028 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3029       * src/gdcmHeader.cxx :
3030         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3031           (see gdcmHeader::LoadElements).
3032         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3033           ReadInt16 and ReadInt32)
3034
3035 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3036       * src/gdcmHeader.cxx :
3037         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3038           method.
3039         - SetLgrElem renamed to SetLength
3040         - GetLgrElem renamed to GetLength
3041         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3042       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3043       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3044         due to IdoDude was cleaned out.
3045
3046 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3047       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3048         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3049         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3050         returning the unecessary skL (skipped length).
3051         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3052         it was redundant with the File position internals (by using
3053         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3054         jajun.
3055       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3056         on the libido specificities which are handled through class
3057         inheritance.
3058       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3059         added.
3060
3061 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3062       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3063         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3064
3065 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3066       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3067
3068 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3069       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3070         and _IdDcmSWAP_LONG.
3071
3072 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3073       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3074         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3075