ChangeLog

   1 2005-01-17 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   2    * src/gdcmUtil.cxx : bug fix to find the Windows MAC address. Now, there
   3      is no memory access violation
   4    * gdcmPython/demo : add python demos using VTK
   5
   6 2005-01-16 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
   7          * FIX 'Dictionnary' is now spelt 'Dictionary'
   8                'wether' is now spelt 'whether'
   9                          'archieve' is now spelt 'archive'   ;-)
  10
  11 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  12     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
  13                related methods, in order not to expose internal mechanisms
  14         InitTraversal();
  15         GetNextEntry();
  16          * REM methods that exposed internal mechanisms :
  17         DicomDir::GetDicomDirPatients()
  18         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
  19         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
  20         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
  21          * UPD Test programs :
  22              makeDicomDir.cxx
  23              BuildUpDicomDir.cxx
  24              TestDicomDir.cxx
  25           * UPD Example program
  26              PrintDicomDir.cxx
  27     * ADD DictSet methods
  28         InitTraversal()
  29         GetNextEntry()
  30
  31 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  32    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
  33          reason to have to methods, moreover with the second takeing the ostream as
  34          *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
  35
  36 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  37    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
  38          smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
  39          Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
  40          code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
  41          working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
  42          problematic getIPAddress
  43
  44 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  45    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
  46      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
  47      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
  48      shared libs.
  49
  50 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  51    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
  52      sort DICOM files
  53
  54 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  55    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack
  56               for dealing with BIGENDIAN processors
  57                         - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
  58                         When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
  59                         and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
  60                         PixelWriteConveror, and avoid modifying the Pixel Area.
  61                         Note :
  62               Probabely, the same operation will have to be done when we want
  63               to write image with Big Endian Transfert Syntax,
  64               and we are working onj Little Endian Processor
  65
  66 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  67    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
  68      table.
  69    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
  70    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
  71      all the dict content.
  72    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
  73      print
  74    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
  75
  76 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  77    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a
  78                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
  79
  80 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  81    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
  82    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
  83    * gdcmPython/demo/ : add a new test
  84
  85 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  86    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
  87         * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
  88         * enhancement of Example/PrintDicomDir
  89
  90 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  91    * Now, python test might work on systems
  92    * Add the PrintDicomDir test
  93
  94 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
  95    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
  96                 Explicit Big Endian Transfer Syntax files
  97           (group and elem not swaped)
  98
  99 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 100    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
 101                 Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
 102                           begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
 103                           To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
 104                           Document::HandleOutOfGroup0002() method
 105          * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
 106               (related pb not yet solved)
 107
 108 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 109    * Bug fix for the python part use
 110    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
 111
 112 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 113    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
 114
 115 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 116    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
 117      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of
 118      the transfer syntax
 119
 120 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 121    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
 122    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
 123             to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
 124                  and Transfer Syntax is Big Endian
 125                  We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
 126          * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
 127          * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
 128
 129 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 130    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
 131    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
 132    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
 133    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
 134    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
 135    gdcm::Global would destroy at exit).
 136
 137 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 138    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
 139          environment. static const string in a header file used to be ill
 140          initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
 141          issue.
 142
 143 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 144    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
 145       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
 146       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
 147       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as
 148          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
 149
 150 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 151    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
 152      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
 153      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
 154      redirected to a file (ofstream).
 155    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
 156      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
 157
 158 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 159    * Removal of useless and dangerous methods :
 160          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
 161          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
 162         * Removal of usless methods :
 163          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
 164    * Commenting out of probabely useless methods :
 165          Dict::GetDictEntryNames()
 166          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
 167          DictSet::GetPubDictEntryNames()
 168          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()
 169         * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used
 170         * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version
 171         * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
 172            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
 173                           Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods
 174    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
 175            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
 176                                      Unused till now...
 177         * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
 178            should be used to write a method to replace the former
 179            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
 180
 181 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 182    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
 183      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
 184      data in the DocEntry structure
 185
 186 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 187    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
 188      And now use a static function call instead, with a global variable. i
 189      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
 190      and easier to use...hopefully
 191
 192 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 193    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
 194
 195 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 196    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
 197
 198 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 199    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
 200      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
 201
 202 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 203    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
 204    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
 205      a file
 206    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
 207      when specifying the VR
 208    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
 209    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
 210
 211 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
 212    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
 213           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
 214         * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
 215         * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
 216            in order to allow further VR modification by user
 217    * REM : removal of once-called method File::WriteBase
 218                 integration of its code in formerly one-line method File::Write
 219
 220 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 221    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
 222      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
 223    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
 224      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
 225      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
 226    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
 227
 228 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 229    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
 230      empty Print Method
 231    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
 232
 233 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 234    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
 235    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
 236    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
 237    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
 238    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
 239
 240 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 241    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
 242      problems when compiling with the python wrapping
 243
 244 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 245    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
 246      writting in ImplicitVR
 247
 248 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
 249    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
 250      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
 251      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
 252      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
 253
 254 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 255    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
 256      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
 257
 258 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 259    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
 260      Rename Decompressed to Raw
 261    * Use the API changes in gdcm::File.
 262    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
 263      Memory leaks fixed
 264
 265 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 266    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
 267      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
 268      of Frames' field
 269
 270 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 271    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
 272    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
 273
 274 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 275    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
 276      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
 277      solve it.
 278
 279 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 280    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
 281      DocEntry. Now use methods of the Document !
 282
 283 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 284    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
 285
 286 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 287    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
 288    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
 289    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
 290    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
 291      test to 0.0
 292    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
 293    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
 294      containing found sequences
 295
 296 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 297    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
 298      not at all time
 299    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
 300      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
 301               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
 302      and tests are now made on good variables
 303
 304 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 305    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
 306    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
 307      length
 308    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
 309    * Add vtkGdcmWriter example and test
 310
 311 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 312    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
 313    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
 314    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
 315      SetValue
 316    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
 317    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
 318
 319 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 320    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
 321    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
 322
 323 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 324    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
 325      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
 326      file isn't readable.
 327
 328 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 329    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
 330    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
 331    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
 332    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
 333      method that is redondant with AddEntry.
 334    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
 335      SQItem
 336
 337 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 338    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
 339    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
 340    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
 341
 342 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 343    * Huge cleanup:
 344      - Remove printf / sprintf
 345      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
 346      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm
 347        source
 348      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should
 349        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
 350      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation
 351        (plus it is not up to date)
 352      - remove 'using namespace std' this is BAD !
 353
 354 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 355    * Remove memory leaks on the DicomDir
 356    * Remove some useless data in DicomDirObject
 357    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
 358
 359 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 360    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
 361
 362 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 363    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
 364      future, with convertion)
 365    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
 366      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
 367      from the output of the class
 368
 369 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 370    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
 371
 372 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 373    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
 374      and vtkErrorMacro use.
 375    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
 376
 377 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 378    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
 379      file name in input
 380    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
 381    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
 382      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
 383      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed
 384      immediately after thee instruction.
 385    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
 386      file has been opened : the test must be made on the content of the
 387      pointer and not directly on the pointer !
 388      Code formatting
 389
 390 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 391    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
 392      the python part recompiles
 393
 394 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 395    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
 396      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
 397      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
 398      all linux)
 399
 400 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 401    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
 402      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
 403      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
 404      screen resolution, it's produce errors).
 405      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
 406    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
 407    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
 408      under windows at compilation
 409    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
 410      for grayscale images
 411    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
 412
 413 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 414    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
 415    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
 416      tests on the image size X, Y, Z
 417
 418 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 419    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
 420    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
 421      between the class name and the file name
 422
 423 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 424    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
 425      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
 426      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
 427      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
 428      this variable content.
 429
 430 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 431    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
 432      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
 433      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
 434      DocEntryArchive
 435    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
 436      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
 437      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
 438    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
 439      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
 440
 441 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 442    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
 443
 444 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 445    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
 446    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
 447      the header.
 448    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
 449      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
 450      write
 451    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
 452      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
 453      is now on RGB data (as before my last commit
 454    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
 455
 456 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 457    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
 458      Add a print information of the type of the entry
 459    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
 460      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
 461    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
 462      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
 463    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
 464      any.
 465    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
 466
 467 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 468    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
 469      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
 470      opened or not.
 471
 472 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 473    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
 474      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
 475    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
 476      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the
 477      DocEntryArchive
 478    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
 479      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
 480    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
 481      - test the pixels written
 482      - add test points to quickly find where is the error
 483      - can set a file name input and output in arguments
 484    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx :
 485      amelioration of the test output
 486
 487 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 488    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
 489      all replaced DocEntry's
 490    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
 491      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
 492      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
 493      header initial state.
 494
 495 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 496    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
 497
 498 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 499    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
 500      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
 501      then, it musn't change in the time.
 502    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
 503      header correctly. At this time, the change is only made for the first
 504      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
 505      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
 506      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
 507      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
 508    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
 509    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
 510      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
 511      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
 512
 513 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 514    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
 515    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
 516
 517 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 518    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
 519      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
 520      is copied).
 521    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't
 522      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
 523    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
 524
 525 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 526    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
 527      Two problems appear when doing it :
 528       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
 529         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
 530         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
 531         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
 532         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
 533         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
 534         the gdcmBinEntry.
 535       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
 536         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
 537         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet
 538         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it,
 539         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
 540    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
 541
 542 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 543    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
 544    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
 545      squeeze method
 546
 547 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 548    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
 549    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
 550      after it have been deleted
 551
 552 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 553    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
 554    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
 555    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
 556      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
 557      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
 558
 559 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 560     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
 561     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
 562     3. Use const ref when possible
 563     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
 564     5. A few more comments
 565     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
 566
 567 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 568   * ENH: Slightly bigger patch:
 569     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
 570     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
 571     3. File was not close properly in gdcmDict
 572     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
 573     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
 574     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
 575     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
 576     8. Do not repeat virtual in subclasses
 577     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
 578
 579 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 580   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken
 581     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead
 582     of a null character as defined by standard
 583
 584 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 585   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
 586     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
 587
 588 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 589   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
 590   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
 591     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
 592
 593 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 594   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
 595     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
 596     a verbose message is generated.
 597     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
 598     correctly close is a call to CloseFile.
 599     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
 600   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
 601     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least
 602     case to the image size (calculated) or the image size specified in the
 603     header. A verbose is generated if these two size mismatch
 604
 605 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 606   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
 607     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
 608     break under windows (with msvc6 compilation).
 609
 610 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 611   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
 612     compiling with MSVC6)
 613
 614 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 615   * Bugs fix for the Windows build with VC6
 616   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
 617     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
 618     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
 619     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
 620   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
 621     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
 622     gdcm.i file)
 623   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
 624     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
 625     std::cerr of vtk.
 626
 627 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 628   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
 629   * gdcmPython/gdcm.i:
 630     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
 631     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
 632       NOT need to be wrapped anymore.
 633   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
 634     DicomDir::Method) new example added.
 635
 636 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 637   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
 638     A DicomString can contain as many \0 as they want
 639     and it is *always* of even length.
 640     We only support odd length for very rare case.
 641     And in the near future this should be removed.
 642
 643 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 644   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
 645     little endian. This should -heopfully- fix some tests
 646
 647 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 648   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
 649     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to
 650     the one comiled into lib
 651
 652 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 653   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
 654     This should definitely solve any leak problem, and we should be
 655     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
 656
 657 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 658   * STYLE: ivars should start with a capital letter.
 659   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref).
 660   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
 661
 662 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 663   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
 664   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
 665     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
 666   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
 667   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
 668     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
 669     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
 670       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
 671       no longer exists.
 672
 673 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 674   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly
 675    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all
 676    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on
 677    the class.
 678
 679 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 680   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp
 681     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be
 682     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
 683
 684 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 685   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
 686   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
 687     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
 688     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
 689     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
 690       CloseFile() anymore.
 691     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
 692       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
 693       into File::Pixel_Data.
 694
 695 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 696   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
 697     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
 698   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
 699     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
 700     method:
 701     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
 702     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
 703       method to those classes.
 704     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
 705       -- Added a ::Print() method.
 706       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
 707       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
 708          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
 709
 710 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 711   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
 712     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
 713     doxygen.
 714   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
 715   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
 716     pointlessly wrapped (see
 717     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
 718   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
 719     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
 720     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
 721     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
 722     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
 723       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
 724            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
 725       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
 726          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
 727
 728 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 729   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
 730     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
 731
 732 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 733   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
 734     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
 735     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
 736   * TODO added new entry.
 737   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
 738     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
 739     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
 740     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
 741       variable names for semantical coherence.
 742
 743 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 744   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
 745   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
 746   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
 747   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
 748   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
 749   compilation time jpeg option.
 750
 751 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 752   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
 753     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
 754     reproduce at home.
 755   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
 756   Thanks dcmtk crew !
 757
 758 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 759   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
 760   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
 761     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
 762   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
 763   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
 764   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
 765   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
 766     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
 767     from File:: to PixelConvert::.
 768
 769 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 770   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
 771     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
 772      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
 773      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
 774
 775 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 776   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
 777   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
 778   like this:
 779     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
 780   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
 781   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
 782   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
 783
 784 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 785   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
 786     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
 787     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
 788     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added
 789     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
 790       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
 791       (for the time being this is better than having them attach to
 792        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
 793     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
 794       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
 795     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
 796       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to
 797       gdcmPixelConvert::
 798
 799 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 800   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
 801   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
 802     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
 803       clean up of RLE related code.
 804   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
 805     - src/gdcmRLE.cxx removed
 806     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
 807     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
 808     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
 809   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
 810     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
 811       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
 812       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
 813
 814 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 815   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
 816     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
 817       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
 818       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
 819       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
 820       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
 821       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
 822       offsets.
 823   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
 824     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
 825         with the retired Parse7Fe0().
 826     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
 827     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
 828
 829 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 830   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
 831     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
 832     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
 833     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
 834   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
 835     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
 836       to return an unused length.
 837
 838 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 839   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
 840     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
 841     to use to do simple stuff.
 842
 843 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
 844   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
 845     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
 846     copying of the file within different directory, configure header file to
 847     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
 848     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
 849
 850 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 851   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
 852      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
 853        with it's binary name).
 854      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
 855        the Website to be more complete.
 856      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on
 857        doxygenated documentation.
 858      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
 859        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
 860                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
 861   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
 862   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
 863    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
 864
 865 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 866   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
 867    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
 868
 869 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 870   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
 871     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
 872     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
 873     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
 874     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
 875   * GDCMHOME clean up:
 876     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
 877       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
 878       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
 879   * Autotools clean up:
 880     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
 881     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed
 882
 883 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 884   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
 885   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
 886   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
 887
 888 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 889   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
 890     describing TODO entries and used it for new entries.
 891   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
 892     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
 893     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
 894   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
 895     documentation itself, but the website) moved to html and
 896     placed in directory Doc/Website:
 897     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
 898     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
 899     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
 900   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
 901   * CMakeLists.txt changed accordingly.
 902   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
 903     DeveloppersPython.html
 904   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
 905
 906 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 907   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
 908     of gdcm Web site.
 909
 910 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
 911   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
 912     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
 913     we can now delete[] it safely
 914   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
 915     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
 916   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
 917
 918 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 919   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
 920     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
 921     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
 922     pointed content.
 923
 924 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 925   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
 926   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
 927
 928 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 929   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
 930     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
 931     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for
 932     an example of usage.
 933     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
 934       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
 935     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
 936       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
 937     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
 938     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
 939     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
 940
 941 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 942   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
 943     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
 944     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
 945     in class
 946     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
 947       and associated accessors. Doxygenation of the class.
 948     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
 949       accessors added.
 950     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
 951       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
 952     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
 953     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
 954
 955 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 956   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
 957     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
 958       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
 959            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
 960            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
 961            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
 962            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
 963            the same group and element all share the same (group, element)
 964            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
 965            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
 966            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
 967            consider the following definition of a TagKey:
 968            - let Group, Element be the string representation of the
 969              group and element dicom tag members,
 970            - let ItemNumber be the string representation of the integer
 971              index of the considered item number of a sequence,
 972            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
 973            the form:
 974               /ItemNumber#Group|Element
 975            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
 976            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
 977               Group|Element<SeqTag>
 978            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
 979            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
 980            string e.g.
 981                0028|1201
 982            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
 983            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
 984            string e.g.
 985                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
 986     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
 987       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the
 988       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
 989     - src/gdcmDocEntry.cxx:
 990       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
 991          Key member.
 992       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
 993     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
 994     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
 995       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
 996       -- now has a new BaseTagKey member.
 997       -- STYLE.
 998   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
 999     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
1000     truly belongs.
1001     This poses the problem with the semantics of the following lines
1002        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
1003        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
1004        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
1005     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
1006     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
1007     order to get things working the dicom dictionary was altered !
1008     Please fix things urgently...
1009   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
1010     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
1011     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
1012     set to OW:
1013       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
1014       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
1015       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
1016   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
1017     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
1018   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
1019
1020 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1021   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
1022
1023 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1024   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
1025     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
1026   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
1027   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
1028
1029 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1030   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
1031     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
1032   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
1033     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
1034   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1035     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1036   * TODO updated
1037   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1038     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1039   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1040   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1041     exception_on_error parameter.
1042     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1043     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1044     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1045
1046 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1047   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1048   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1049     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1050   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1051   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1052   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1053     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1054   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1055
1056 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1057   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1058     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1059
1060 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1061   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1062        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1063
1064 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1065   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields
1066         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1067
1068 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1069    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1070    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1071      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1072      is now in static in the gdcmDebug class
1073    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1074    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1075
1076 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1077    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1078      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1079    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1080      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1081      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1082      that displays position and size).
1083    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1084      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1085      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1086      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1087      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1088      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1089      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1090         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in
1091      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1092      commiting changes).
1093    * Test/CMakeLists.txt:
1094       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1095       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1096         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1097         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1098    * TODO updated.
1099
1100 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1101    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1102      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1103      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1104      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1105      - removal of typedef duplication.
1106      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1107      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1108    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1109       - printf polluting ctest removed.
1110       - TAB removal for comminting
1111    * Test:
1112      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1113        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in
1114        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1115        this test creates them.
1116        Note: we need to validate each reference image, but before that
1117              I'd like to rename them with a more explicit name...
1118      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1119    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to
1120      including each header needed).
1121
1122 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1123    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1124      test suite to the Example directory. Are concerned:
1125      - PrintHeader.cxx
1126      - TestDcm2Acr.cxx
1127      - TestFindTags.cxx
1128      - TestWrite.cxx was
1129      - TestWriteSimple.cxx
1130    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1131      image gdcmData/oldACR00001.ima
1132
1133 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1134    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1135      with removal from gdcmData):
1136       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1137       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1138       - US.3405.1.dcm
1139      Added the following because after last cvs update, they cause
1140        ctest -R TestReadWriteReadCompare
1141      to segfault:
1142       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1143       - oldACR00001.ima
1144    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1145      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1146      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1147      form of test...
1148    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1149      we don't need to black list the following images anymore:
1150       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1151       - OT-PAL-8-face.dcm
1152       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1153    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1154      fixes and the beautified code ;-)
1155      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1156      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1157      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1158            improve the test suite). The bug could be detected by using
1159            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1160            or by using
1161            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1162            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1163
1164 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1165    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1166          - replace by uggly but working old code :-(
1167    A lot of things should be OK again.
1168    It's really urgent to have a test suite that *tests*,
1169    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1170    (twice, withing a fortnigh ...)
1171
1172 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1173    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1174      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1175    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1176      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1177      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1178                    - OT-PAL-8-face.dcm
1179                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1180    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1181      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1182      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1183      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1184      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in
1185      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1186      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1187      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1188      image.
1189    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1190      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1191      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1192      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1193
1194 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1195   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1196   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names
1197                           (instead of infinite loop)
1198   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names
1199
1200 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1201    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1202
1203 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1204    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1205            when SamplesPerPixel =3
1206          - now Write is no longer confused by
1207           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1208          - "UN" value representation Elements are now written correctly
1209                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1210    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods
1211            (in order to split the job that has not to be done
1212            for gdcmDicomDir)
1213
1214 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1215    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1216      loop on the same image until memory went out.
1217      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1218    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1219      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1220
1221 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1222    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written
1223             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1224             is added a the end, when necessary.
1225             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are
1226               now written correctly
1227             - length compatible BinEntry are now loaded correctly
1228               (even for odd groups)
1229         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1230                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1231
1232 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1233    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1234    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of
1235      coding style).
1236
1237 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1238    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1239      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1240    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1241
1242 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1243    FIX : gdcmDocument.cxx
1244       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1245         code 'beautyfication' :-(
1246       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1247
1248 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1249    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level,
1250             : to allow user to create his own Sequences
1251    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1252
1253    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1254
1255    - gdcmBinEntry
1256      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1257
1258    - gdcmDocEntry
1259      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1260      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1261
1262    - gdcmDocEntrySet
1263      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1264      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1265      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1266      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1267      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);
1268      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group,
1269                                             guint16 element,
1270                                             std::string vr     = "unkn",
1271                                             std::string fourth = "unkn",
1272                                             std::string name   = "unkn");
1273      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1274      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1275      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1276      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1277      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1278      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1279      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1280      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1281
1282    - gdcmDocument
1283      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1284      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1285      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1286      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1287      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1288                                         FILE *_fp, FileType type);
1289      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1290      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1291      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1292      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1293      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1294      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1295      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1296      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group,
1297                                             guint16 element,
1298                                             std::string vr     = "unkn",
1299                                             std::string fourth = "unkn",
1300                                             std::string name   = "unkn");
1301      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1302      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1303      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1304      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1305
1306         - gdcmElementSet
1307           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1308
1309    - gdcmSeqEntry
1310           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1311
1312    - gdcmSQItem
1313      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1314      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1315      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1316      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1317
1318    - gdcmValEntry
1319          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype);
1320
1321 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1322     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1323       The default constructor invoked by the line
1324          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1325       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1326       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1327       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1328     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1329       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1330       Could anyone explain why ?
1331     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1332       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from
1333       code related to gdcmBinEntry).
1334
1335 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1336     * In order to fix memory leaks:
1337      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1338        some delete calls.
1339      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1340      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1341        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1342        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1343        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1344      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1345      - src/gdcmDocument.cxx:
1346        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1347           from dynamic stores.
1348        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1349           was causing memory leaks.
1350      - src/gdcmSQItem.cxx:
1351        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1352           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1353        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1354           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1355           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1356           This avoids SegFaulting.
1357      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1358     * Conclusion:
1359      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1360        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1361        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1362      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1363        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1364      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1365        segfaults).
1366     * Erroneous leading white fix:
1367      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1368        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1369      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1370      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1371     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1372     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1373
1374
1375 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1376     * In order to fix writing of dicom files:
1377      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1378      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1379      - src/gdcmDocument.cxx:
1380        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1381        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1382        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1383           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1384           manner.
1385        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1386           to only declared) and build on top of
1387           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1388        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1389      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1390        for usage in destructor and treatement of promotion in
1391        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1392      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1393       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1394     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1395       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1396       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1397       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1398
1399 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1400     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1401       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1402       learned that:
1403           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1404           soon as possible by globally disabling memory caching.
1405           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1406           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1407       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1408       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1409       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1410     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1411       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1412       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1413       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1414         with 1.
1415       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1416       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1417       understand why the list is empty...).
1418     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1419     * Doc/License.txt added.
1420
1421 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1422     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1423       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1424         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1425         the padding problem.
1426       - general clean up, simplification, and coding style.
1427       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1428     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1429
1430 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1431    *  gdcmSeqEntry.cxx
1432            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1433                 - fix the display of SQItem ordinal number
1434       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1435                 - remove some useless never written private methods
1436
1437 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1438    * gdcmBinEntry.cxx
1439       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1440            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1441               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1442                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1443    * dcmDocument.cxx
1444       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry,
1445               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1446            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1447       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1448    * gdcmFile.cxx
1449       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1450    * gdcmSQItem.h
1451       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide
1452             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1453             \warning : some pb remaining around this number
1454                                 will be solved asap
1455       - AddEntry now takes the Item Number as a param
1456    * gdcmValEntry.cxx
1457       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1458
1459 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1460     * Memory leak hunt with the following command:
1461       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1462                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1463       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1464       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1465       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with
1466           grep "MEMORY LEAK" src/*
1467       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1468       -----
1469           #include <string>
1470           int main() {
1471              std::string name;
1472              char * test = "babo";
1473              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1474                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1475              name.clear();   //// Doesn't help !
1476              return 0;
1477           }
1478       -----
1479           #include <string>
1480           #include <iostream>
1481           int main() {
1482              std::string line;
1483              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1484              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1485                                         //// of 1320 bytes in call to
1486                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1487             return 0;
1488           }
1489       -----
1490
1491
1492 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1493     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1494       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1495         and related, moved away to gdcmDocument.
1496       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1497         the corresponding protected accessors of inherited class
1498         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be
1499         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1500       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1501       - Clean up of undefined or unused methods.
1502     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1503       account the changes to gdcmHeader.h).
1504     * src/gdcmDocument.h:
1505       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1506         changes to gdcmHeader.h).
1507       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1508         (see changes to gdcmHeader.h).
1509       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1510       - Clean up of undefined or unused methods.
1511     * src/gdcmDocument.cxx:
1512       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1513       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1514       - some std::string properly set to VRKey
1515     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1516       references to gdcmDocument.
1517     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1518     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in
1519       cvs repository gdcmData.
1520
1521 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1522     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1523     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1524       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1525     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1526     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1527       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1528     * src/gdcmDocument.cxx:
1529       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1530         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1531       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1532         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1533         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1534         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1535         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1536               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1537               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1538     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1539     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1540       now taken into account.
1541     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1542       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1543     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1544       on posix.
1545     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1546       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1547     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1548
1549 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1550     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1551       gdcmGlob
1552     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1553     * src/gdcmUtil.h : export methods
1554
1555 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1556     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1557       to right behavior
1558     * Initial addition of automatic python testing
1559     * Initial addition of automatic image comparison
1560
1561 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1562     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1563       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1564
1565 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1566      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1567      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1568      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1569
1570 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1571      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1572        new concepts (and new classes) :
1573        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1574         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1575         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1576        a Sequence is composed of Items.
1577        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1578        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1579        (never taken into account)
1580        Our unability to add a new 'entry' in the header
1581        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1582        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1583        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1584        nothing is finished.
1585        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1586
1587 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1588      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1589
1590 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1591      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1592        file prefix (SetFilePrefix)
1593
1594 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1595      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1596        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1597        baseline.
1598      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1599        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1600
1601 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1602      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a
1603        dicom image
1604
1605 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1606      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1607      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1608        between the developper and user version.
1609      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1610      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1611
1612 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1613      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1614        when using cmake.
1615
1616 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1617      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in
1618                src directory, now generated in the build dir.
1619             2. Tests as mentionned smarter
1620             3. Some clean up
1621             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name
1622           this is interesting for 3rd party lib like ITK,
1623           where we could set the institution name / patient name...
1624
1625        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1626               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory
1627                  (this was not true before)
1628
1629 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1630      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow
1631            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1632      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1633            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1634            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1635      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1636            tree-like structure of a Dicom Header.
1637      * FIX Test code cleaning
1638
1639 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1640      * ENH: Adding automatic testing
1641        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1642        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1643        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1644        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting
1645           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load
1646           too many projects
1647      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1648      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1649        one file instead of seven + some small cleanup
1650
1651 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1652      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1653      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1654            Header printing. Example given with :
1655            > PrintHeader fileName  2 new
1656           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1657
1658 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1659      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1660          1. I have added some unsigned where needed
1661          2. Some function parameter not used -> (void)
1662          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1663          4. g++ don't like character '\' in comment
1664          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1665                     this really need to be fixed
1666          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1667          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid);
1668                     this also really need to be fixed
1669          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt,
1670                     remove compression file
1671                     (as we only do decompression, right ?)
1672      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1673
1674 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1675      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1676            when a single value is found (bug ?), xpacing is now
1677            defaulted to yspacing
1678
1679 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1680      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1681      * ENH add parameters :
1682                bool  exception_on_error = false,
1683                bool  enable_sequences   = false,
1684                bool  ignore_shadow      = false
1685            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1686      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1687            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files
1688
1689 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1690      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1691
1692 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1693      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1694      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1695              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1696
1697 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1698      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more
1699          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1700
1701 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1702      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1703        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1704        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1705        in gdcmHeader.
1706      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1707        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1708        already does the job.
1709      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1710        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1711
1712 2004-03-30 Benoit Regrain
1713      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1714        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1715        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1716
1717 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1718      * ENH : Check on file type to be written moved
1719              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1720      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1721              when end-of-list is reached
1722            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1723
1724 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1725      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1726      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1727      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1728        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1729
1730 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1731      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1732        now contains all the gdcmGlobal related code.
1733      * minor coding style and doxygenation changes.
1734
1735 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1736      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1737        now contains all the Debug related code.
1738      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1739      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1740        CreateCleanString) removed.
1741      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1742      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1743      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1744      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1745        src/gdcmDirList.cxx)
1746
1747 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1748      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1749
1750 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1751      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1752            big endian made volumes
1753      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1754            end user to instanciate class gdcmParser
1755           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1756
1757 2004-03-22 Benoit Regrain
1758      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1759      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1760              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1761
1762 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1763      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1764            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1765            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1766            or build from the files held (recursively) in a Directory
1767            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1768            gdcmObject::SetBoundaries() added
1769
1770 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1771      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1772                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1773      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1774            DICOMDIR
1775      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1776            about the name
1777
1778 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1779      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1780                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1781
1782 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1783      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1784            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1785            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1786            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1787            to allow making gdcDicomDir object.
1788      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1789           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1790
1791 2004-02-11 Benoit Regrain
1792      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1793              when using from python
1794
1795 2004-02-10 Benoit Regrain
1796      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1797      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1798      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1799              directory parsing
1800
1801 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1802      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1803              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1804              - class gdcmMeta created
1805      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1806              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1807      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1808
1809 2004-02-05 Benoit Regrain
1810      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1811              header entries
1812      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1813      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1814
1815 2004-02-04 Benoit Regrain
1816      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1817      * FIX : sort the images in the dicom dir
1818      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1819      * ADD : a python demo
1820
1821 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1822      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1823      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1824              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1825              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1826              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1827      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1828            to make full checking easier
1829
1830 2004-02-04 Benoit Regrain
1831      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1832      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1833
1834 2004-02-03 Benoit Regrain
1835      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1836      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1837      * Bug fix and print add-on
1838
1839 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1840      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1841      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1842      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements
1843      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered
1844            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1845
1846 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1847      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second'
1848              iterator on last
1849              of the last synonym :-(
1850      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except
1851              for DICOMDIR ;-)
1852      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1853      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity
1854      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1855            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1856       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1857
1858 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1859      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1860            no longer writes 'Un' on disk
1861      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1862      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1863            the length (for Palette expanded images)
1864            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1865      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1866            (that broke Write). Replaced by UL.
1867            Aware user will reload the field if he
1868            thinks it's necesssary
1869
1870 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1871      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR
1872        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new
1873        IsReadable() methods.
1874
1875      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1876       (no DOUBLE images in kosher DICOM,
1877       but so usefull for people that miss them ;-)
1878
1879      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1880        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1881
1882 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1883      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1884
1885 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1886      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow',
1887              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1888         The TRUE value for this param has to be used
1889         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1890         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1891      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1892              (even when an 'icone image sequence' is announced by the
1893         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1894
1895      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow
1896              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1897              Fixed
1898
1899      * gdcmHeader add the method
1900              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1901         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1902         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless*
1903         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
1904
1905 2004-01-26 Benoit Regrain
1906      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields
1907        in the print and add a third level of print to print them
1908
1909 2004-01-23 Benoit Regrain
1910      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1911      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1912      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1913        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1914
1915 2004-01-22 Benoit Regrain
1916      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1917      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1918
1919 2004-01-19 Benoit Regrain
1920      * Add the use of shadow dictionaries
1921      * bug fix and coding style
1922
1923 2004-01-19 Benoit Regrain
1924      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1925      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1926      * Add the update of header entries using the shadow library
1927
1928 2004-01-19 Benoit Regrain
1929      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1930      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1931        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1932        of dicom dir parsing
1933      * bug fix under python
1934
1935 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1936     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1937     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1938     * ADD add file gdcmHeader2.cxx
1939     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1940
1941 2004-01-15 Benoit Regrain
1942      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1943        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1944        when the gdcmDictSet will be destroyed
1945      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1946        gdcmDictSet
1947
1948 2004-01-15 Benoit Regrain
1949      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1950        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1951        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1952        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1953      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1954
1955 2004-01-14 Benoit Regrain
1956      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1957      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1958      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1959      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1960
1961 2004-01-13 Benoit Regrain
1962      * src/*.[h|cxx] : coding style
1963      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1964
1965 2004-01-13 Benoit Regrain
1966      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1967      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1968        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1969      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1970
1971 2004-01-12 Benoit Regrain
1972      * src/*.h : add comments
1973      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1974      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
1975        directly setted in the source code
1976      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
1977        gdcmTS and gdcmVR
1978
1979 2004-01-09 Benoit Regrain
1980      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1981      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1982
1983 2004-01-07 Benoit Regrain
1984      * Modification to compile with the distutils.
1985      * Bug fix in code
1986
1987 2003-12-10 Benoit Regrain
1988      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1989        can use a gdcmHeaderHelper to load data
1990      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1991        made in the source code
1992
1993 2003-12-10 Benoit Regrain
1994      * Update Windows projects and .cvsignore files
1995
1996 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1997      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1998            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1999            if he wants to.
2000            gdcmElValSet:Print takes it into account
2001
2002 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2003      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
2004      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
2005      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
2006
2007 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
2008       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
2009              on the ListTag listElem member,
2010              not longer on the TagElValueHT tagHt member
2011       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
2012              with the tagHt member and the listElem member.
2013              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
2014
2015       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
2016              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
2017                             if bug fixing is necessary), for internal
2018                             use only
2019              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
2020                             or to allow Parser going on.
2021              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
2022              with a length (not 0000) is found
2023       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
2024                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
2025                 (to be written)
2026
2027 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
2028      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
2029      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
2030           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
2031      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
2032
2033 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2034      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2035
2036 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2037      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2038           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2039
2040 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2041      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2042      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2043              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2044              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2045
2046 2003-11-05 Benoit Regrain
2047      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2048                        : Explicit error messages
2049      * in __init__.py  : Related modif
2050
2051 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2052      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2053            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2054            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2055      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2056                     (vtkGdcmReader compliant)
2057
2058 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2059      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2060        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2061
2062 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2063      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h
2064            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2065
2066 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2067      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw
2068                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2069              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2070              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2071              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2072              such an image :
2073              After gdcmHeader :
2074               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2075               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2076               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2077      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2078              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2079
2080 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2081      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2082
2083 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2084      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm
2085            being coherents dicom files.
2086
2087 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2088      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2089            from medcon lib !
2090      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type
2091      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2092      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2093      * ENH: Add include dir to medcon lib
2094      * FIX: only one function is being exported for now !
2095            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2096
2097 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2098       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2099         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2100           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2101       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2102
2103 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2104       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2105         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2106         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2107       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2108       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2109
2110 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2111       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2112
2113 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2114       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2115       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2116       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2117
2118 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2119       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2120       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2121       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2122       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2123       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2124       * FIX: More pragma disable fro VC++,
2125              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2126         But it fasten debug compilation time.
2127
2128 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2129       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2130         (they are compressed as 2 planes images,
2131          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2132
2133 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2134       * Now CheckRead takes into account :
2135          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2136          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2137       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2138        (breaks DicomWorks)
2139
2140 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2141       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt
2142              one should remove the '\'
2143
2144 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2145       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image
2146         (wrong lengths in header)
2147         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2148       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2149         (breaks DicomWorks)
2150
2151 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2152       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script
2153         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2154
2155 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2156       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2157       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2158
2159 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2160       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2161
2162 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2163       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2164         (the patch is easy to remove)
2165       * cosmetic changes to avoid warnings
2166
2167 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2168       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up,
2169         no need to press 'r' now.
2170
2171 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2172       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2173         to new Jpeg Lossless decompressor
2174       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2175       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2176       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2177                                                   UNIT 11, Hop Cardio
2178 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2179       * general anonymisation in gdcmData
2180       * adding the 'color files' from
2181         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2182       * adding some well knowed bugged-header images
2183       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2184         waiting for their inclusion in Python testsuite
2185
2186 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2187     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2188       no longer seg faults when file is not found
2189
2190 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2191      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess
2192        MultiFrame images
2193
2194 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2195      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2196
2197 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2198      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2199         OpenFile takes it into account
2200      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2201      * Missing elements added in dicomV3.dic
2202       (just to be affraid : have a look at
2203        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2204        and do it again next year ;->
2205
2206 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2207      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of
2208        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2209        But there are NOT. It's fixed !
2210
2211 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2212      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2213      * FIX: vtkgdcm was not being installed
2214
2215 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2216      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2217              an ACR-NEMA / DICOM one.
2218      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file
2219              is not gdcm Readable
2220      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)"
2221              is now decoded.
2222
2223 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2224      * FIX: CMake generate now documentation
2225      * ENH: out of source doc build !
2226      * ENH: Generate both user and dev documentation
2227      * ENH: Should work on windows too
2228      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed
2229      * FIX: make install should be ok now on ùnix plateform
2230      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2231      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file
2232
2233 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2234      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2235      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2236      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control
2237         window level & window width
2238
2239 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2240      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2241      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2242      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2243
2244 2003-10-06  Emanuel Ollart
2245      * FIX : compilation process wad broken.
2246              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2247
2248 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2249      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2250      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2251
2252 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2253      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2254            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2255                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2256       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2257
2258 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2259       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces,
2260         to remain compliant with already defined strings,
2261         like Transfert Syntax UID and others)
2262
2263 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2264       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added,
2265              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2266
2267 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2268       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2269       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2270
2271 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2272       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2273         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2274               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2275       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2276
2277 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2278       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2279
2280 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2281       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added,
2282         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2283
2284 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2285       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2286          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2287          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2288          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2289           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT,
2290                                             YBR_RCT files.
2291           (no sample found :-(
2292
2293 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2294       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2295         Two reasons: - clear things
2296                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2297                        suffer anymore VC++ complains
2298
2299 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2300       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2301       * removed leaks
2302
2303 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2304       * The lines are now eigthy characters long.for
2305         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx
2306
2307 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2308       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2309         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2310         previous commis of Malaterre)
2311       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2312         before the last Malaterre's commit.
2313
2314 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2315       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2316         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2317       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2318         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2319
2320 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2321       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2322         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2323         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2324
2325 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2326       * Cosmetic changes:
2327         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2328           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2329           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2330           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2331         - PACKAGER corrected
2332         - DEVELOPPER added.
2333         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2334       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2335
2336 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2337       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2338
2339 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2340       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2341
2342 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2343       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2344
2345 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2346       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2347
2348 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2349       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2350         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2351         heuristics to get informations (look at different places).
2352       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2353         sorting DICOM images based on different strategies.
2354       * modified Makefiles accordingly.
2355
2356 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2357       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2358         when building in debug mode
2359       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2360         src/win32/gdcmdll.dsp
2361       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2362
2363 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2364       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2365             to valgrind.
2366
2367 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2368       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2369       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp :
2370                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2371       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2372
2373 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2374       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2375         the file
2376       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2377       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2378         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2379       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2380         symbols... future problem ?
2381
2382 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2383       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2384       * modified gdcm.dsw accordingly
2385
2386 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2387       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2388
2389 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2390       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2391         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2392       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2393         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2394         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2395
2396 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2397       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2398
2399 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2400       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2401       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2402       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2403       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2404       * PACKAGER : adding all concerning windows
2405
2406 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2407       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2408         garbage debug code.
2409       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2410       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2411         test suite reported error.
2412       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2413         packaging a new release).
2414       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2415       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2416       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2417         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2418         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2419
2420 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2421       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2422       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2423
2424 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2425       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2426         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2427         is made in an internal list to prevent this problem.
2428         Bug fix when output is empty.
2429         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2430         correction.
2431       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2432
2433 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2434       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2435       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2436         files. Added method to remove all files on the input
2437         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2438         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2439
2440 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2441       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2442         when using make instal.
2443       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2444         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2445
2446 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2447       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2448       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2449
2450 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2451       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2452         linux and WINDOWS !
2453       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2454       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2455
2456 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2457       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2458         addon of the jpeg library)
2459       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2460       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2461       * INSTALL now points to web documentation
2462
2463 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2464       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2465         gdcmUtil.h anymore.
2466       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2467         clean target.
2468       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2469         - to allow compilation with gcc 3.x
2470           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2471           -- small fixes on exceptions.
2472           Note: linking not tested !
2473         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2474           building stage.
2475       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2476         dependent convertion).
2477
2478 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2479       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2480         Changelog):
2481         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2482         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2483           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2484         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2485
2486 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2487       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2488         compile
2489       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2490         (FileName -> Filename)
2491
2492 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2493       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2494         - UpdateProgress method should now be effective
2495         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2496           to volumes),
2497         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2498           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2499           accelerating things).
2500         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2501           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2502           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2503           in the stack (for the caller to notice the problem).
2504
2505 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2506       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2507
2508 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2509       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2510         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2511         under Windows... thanks Windows !)
2512
2513 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2514       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2515         debug stage).
2516       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2517
2518 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2519       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2520
2521 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2522       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2523         called with different flags than the default ones (with automake).
2524         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2525            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2526         and went for warning fixes:
2527         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2528           up from unused variables.
2529         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2530       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2531
2532 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2533       * gdcmPython/gdcm.i:
2534         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2535           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2536           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2537         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2538           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2539           exported to Python a as cvar.
2540       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2541         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2542         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2543         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2544         C++ static methods).
2545       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2546         with the above changes.
2547
2548 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2549       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2550
2551 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2552       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2553         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2554         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2555          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2556          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2557            a wrapper
2558          - Wrapper interface which wrap sources
2559         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2560         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2561       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2562         files for compilation
2563
2564 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2565       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2566         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2567         - vtk/Makefile.am now builds a library
2568         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2569           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2570           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2571           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2572           import library.
2573         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2574           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2575           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2576           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2577           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2578         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2579           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2580         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2581           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2582       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2583       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2584         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2585         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2586         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2587         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2588         collision of various stl members (principally cout...).
2589       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2590         file.
2591       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2592         comply with above changes)
2593
2594 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2595       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2596       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2597         vtk data structure (an image Flip was required).
2598       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2599       * cosmetic changes in documentation.
2600
2601 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2602       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2603         unexisting file is given as argument.
2604       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2605         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2606         containing those images is now available at
2607           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2608         with the name gdcmData.
2609         All the python scripts (including the package initialisation file
2610         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2611         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2612
2613 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2614       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2615         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2616         demo of the usage of this class.
2617         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2618         at configure (or autogen.sh) stage.
2619
2620 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2621       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2622         Notes on valgrind:
2623           - maximum info is obtained with a command of the form:
2624             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2625                      --show-reachable=yes PrintHeader
2626           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2627             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2628             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2629             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2630              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2631       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2632         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2633         Note: some images don't seem to work e.g.
2634             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2635       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2636         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2637         make gdcm more thread friendly.
2638
2639 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2640       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2641           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2642         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2643           gdcmHeader::_dicom_vr.
2644         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2645         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2646           VRHT*.
2647         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2648
2649 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2650       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2651         make install stage.
2652
2653 2003-04-9 JPR
2654       * UpdateGroupLength replaced by new one
2655
2656 2003-04-7 JPR
2657       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2658         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2659
2660 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2661       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2662       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2663       * src:
2664         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2665         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2666           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2667         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2668           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2669           carried the same semantics.
2670           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2671         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2672           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2673         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2674       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2675       * gdcmGetXSize added
2676       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2677       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2678
2679 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2680       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2681         (to avoid double call by end user).
2682       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2683         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2684
2685 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2686       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2687         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2688           the html.users end users oriented documentation and
2689           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2690           oriented documentation.
2691         - README changed accordingly
2692         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2693         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2694           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2695         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2696           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2697           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2698       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2699         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2700       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2701         ill-formed documentation sections.
2702       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2703
2704 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2705       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2706       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2707         un*ces with sh-utils test utility.
2708       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2709       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2710       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2711       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2712       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2713
2714 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2715       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2716       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2717
2718 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2719       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2720       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2721       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2722       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2723         compilation work.
2724       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2725       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2726
2727 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2728       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2729         hence the user doesn't need this explicit call.
2730         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2731           i.e. LoadElements() call removed.
2732       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2733         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2734       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2735         for adding user defined new tags.
2736         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2737         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2738           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2739
2740 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2741       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2742         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2743         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2744         with the autotools, included the python wrappers part.
2745       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2746
2747 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2748       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2749
2750 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2751       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2752         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2753         for usage).
2754       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2755         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2756         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2757       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2758         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2759
2760 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2761       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2762         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2763         value of GDCM_DICT_PATH.
2764       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2765
2766 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2767       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2768       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2769       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2770         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2771         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2772
2773 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2774       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2775         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2776         gdcmHeader.h
2777       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2778         (as opposed to gdcm.h)
2779       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2780       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2781         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2782       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2783
2784 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2785       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2786         bug.
2787
2788 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2789       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2790         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2791         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2792         of hidding away the python related distutils specific files
2793         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2794         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2795         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2796         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2797
2798 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2799       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2800       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2801         among the list of sources.
2802
2803 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2804       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2805       * modifications in MSVC projects
2806
2807 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2808       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2809         looks like we can move back to original usage of exception within
2810         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2811         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2812       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2813         README file for usage added.
2814       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2815         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2816         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2817         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2818       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2819       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2820         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2821           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2822           Dicom public dictionary were not accessible without an
2823           instance of class gdcmHeader.
2824         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2825           require no instances at all to be invocated.
2826         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2827           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2828           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2829       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2830         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2831       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2832         the above to be effective.
2833       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2834         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2835       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2836         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2837         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2838         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2839         (for python dectection).
2840       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2841         now avoids publishing the empty entries.
2842
2843 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2844       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2845         ExtraPath reused :-P
2846       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2847
2848 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2849       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2850       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2851       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2852         and links
2853
2854 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2855       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2856         method. Doxygenation.
2857       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2858
2859 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2860       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2861         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2862         when using "python setup.py install".
2863       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2864         reexports the working classes.
2865       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2866         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2867         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2868         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2869         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2870         subdir (see the README file). This problem probably due to
2871         an combination of g++ and dynamic loading.
2872       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2873
2874 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2875       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2876         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2877         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2878         again in a python subdir, but the package itself is now in
2879         python/gdcmPython.
2880       * setup.py was cleaned up:
2881         - pythonIncludePath removed
2882         - python setup.py bdist target is now functional.
2883       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2884         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2885         accordingly.
2886
2887 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2888       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2889       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2890         distutils installer is operational.
2891       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2892           shadow classes (from gdcm.py).
2893         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2894           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2895         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2896
2897 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2898       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2899         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2900         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2901         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2902         dictionary.
2903         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2904           are now in the "???" group.
2905         - python/gdcm.i changed accordingly,
2906         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2907           of the above new functionalities in Python.
2908
2909 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2910       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2911         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2912           were definitively removed.
2913         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2914       * src/gdcmElValSet.cxx:
2915         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2916         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2917         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2918         - Added GetElementByName(string).
2919       * src/gdcmHeader.cxx: added
2920         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2921         - GetPubElValRepByName(string)
2922         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2923         - GetShaElValRepByName(string)
2924         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2925         - GetShaElValRepByName(string)
2926         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2927         - GetElValRepByName(string)
2928         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2929         - GetElValRepByName(string)
2930       * Doc/requirements.txt added.
2931
2932 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2933       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2934       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2935         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2936         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2937         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2938       * python/testSuite.py changed accordingly.
2939
2940 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2941       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2942         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2943              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2944               cannot be exported. [...]
2945               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2946               be exported. [...]
2947               This is caused by a designed limitation that once a template
2948               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2949               exported."
2950         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2951         limitation" of VC++ is a pitfall.
2952         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2953         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2954         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2955         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2956         library.
2957         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2958       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2959          dll under windows !!!!)
2960       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2961       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2962         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2963       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2964         (one) of image(s).
2965       * removed glib references
2966       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2967
2968 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2969       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2970         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2971         the files of the testsuite without using unittest.
2972       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2973       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2974       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2975         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2976
2977 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2978       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2979         values, but limits itself to values which are below a user specified
2980         size (by default 1024 bytes).
2981       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2982         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2983         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2984         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2985       * python/testSuite.py
2986         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2987         - two new examples added.
2988       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2989
2990 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2991       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2992         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2993       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2994       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2995       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2996
2997 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2998       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2999         the vr was also RET.
3000       * python/testSuite.py more tests added.
3001
3002 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3003       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
3004       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
3005       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
3006         7.18 Integer types (see stdint.h)
3007         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
3008       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
3009         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
3010         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
3011         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
3012         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
3013         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
3014         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
3015         The rest of the changes we the necessary adaptations.
3016
3017 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3018       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
3019         VR files.
3020       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
3021
3022 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3023       * Adaptation for porting to VC++:
3024         - src/gdcm.h
3025           o forced to use std namespace (for string to be known)
3026           o all class use __declspec export style on WIN32
3027         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
3028           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
3029       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
3030         variable GDCM_DICT_PATH.
3031       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
3032
3033 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3034       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3035         to native Python dictionary.
3036       * python/demo/test.py:
3037         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3038         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3039       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3040         PubElVals hashing table.
3041       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3042
3043 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3044       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3045         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3046       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3047       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3048       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3049         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3050       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3051
3052 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3053       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3054         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3055         that we can import de shadow classes without errors].
3056
3057 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3058       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3059       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3060       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3061       * src/Makefile prepared for python wrapping
3062
3063 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3064       * src/gdcmHeader.cxx :
3065         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3066           (see gdcmHeader::LoadElements).
3067         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3068           ReadInt16 and ReadInt32)
3069
3070 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3071       * src/gdcmHeader.cxx :
3072         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3073           method.
3074         - SetLgrElem renamed to SetLength
3075         - GetLgrElem renamed to GetLength
3076         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3077       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3078       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3079         due to IdoDude was cleaned out.
3080
3081 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3082       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3083         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3084         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3085         returning the unecessary skL (skipped length).
3086         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3087         it was redundant with the File position internals (by using
3088         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3089         jajun.
3090       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3091         on the libido specificities which are handled through class
3092         inheritance.
3093       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3094         added.
3095
3096 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3097       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3098         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3099
3100 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3101       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3102
3103 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3104       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3105         and _IdDcmSWAP_LONG.
3106
3107 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3108       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3109         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3110