]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
ENH: Adding jpegls to gdcm
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2005-06-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2    * Adding potential support for JPEG-LS DICOM files.
3
4 2005-05-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
5    * Adding potential support for mpeg and jpeg2000 through two new lin
6          - JasPer for JPEG2000
7          - libmpeg2 from the MPEG consortium
8          Also adding intial work to use this lib.
9
10 2005-04-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
11    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : update the test printed results and
12      description.
13
14 2005-04-20 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
15    * FIX : Numerical exception on borland (cannot divide by 0, doh !)
16                  But this is a case where we should really signify the user there is
17                                          few chance the serie is really a serie...
18
19 2005-04-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
20    * FIX : on X, the python part is correctly installed. All files are
21      installed in gdcm sub-directory
22
23 2005-04-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
24    * Builder/ : add something to facilitate the RPM creation of gdcm
25
26 2005-04-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
27    * Fix gdcmDirList::IsDirectory. Apparently borland did not like the ending
28          '/'
29    * Also fix compilation on gcc 3.3.5 does not have ios::failure either ...
30
31 2005-04-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
32    * vtk/vtkGdcmWriter fix bug when writing spacing. The Y spacing comes first
33            then the X spacing.
34          * Fix compilation on gcc 2.96 (which does not have ios::failure)
35
36 2005-04-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
37    * src/gdcmDictGroupName.[h|cxx] : add a correlation between a group (number)
38      and it's representation name (for the NIH)
39
40 2005-03-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
41    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : problems of around of double to uint8, when
42      conversion of YBR to RGB pixels. So, now, the conversion is made using 
43      integers only
44
45 2005-03-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
46    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : now use test files (invented file
47      format) to replace 'at-run' dicom files generated by the 
48      TestAllReadCompareDicom test
49
50 2005-03-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
51    * src/gdcmFileHelper.cxx : remove memory leaks and bugs when writing files
52
53 2005-02-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
54    * src/gdcmFileHelper.cxx : JPR bad personal choices fix
55
56 2005-02-11 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
57    * Testing/TestMAkeIcon.cxx : complete the test
58
59 2005-02-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
60    * Testing/TestWriteSimple.cxx, TestSequence.cxx : fix memroy leaks
61
62 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
63    * src/gdcmFileHelper.[h|cxx] : now correctly set the VR of the datas when 
64      writting the file
65
66 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
67    * Test/VTKTestWriteSeq.cxx : add a VTK test to write sequences
68
69 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
70    * Test/ : accelerate tests (it's not very significant accelerations).
71      Remove TestCopyDicom that is redundant with TestCopyRescaleDicom
72
73 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
74    * Testing/TestSequence.cxx : add test for sequences of images... test that
75      we have the same serie or the same study UID
76
77 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
78    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Now string are correctly converted in python
79      string type
80    * src/gdcmDict.h : remove commented code
81    * src/gdcmDocument.cxx : initialize values
82    * src/gdcmFile.cxx : bug fix when reading values
83    * gdcmPython/demo/ : change file names. Remove useless files
84
85 2005-02-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
86    * src/gdcmFile.cxx : remove the default array of initialization.
87      The static array contained pointers to non-static values (comming from
88      strings). To have coherences, when creating files, these values can't be
89      static. So, the array can't be static, too ! To simplify, the array have
90      been replaced by repeted lines to insert values in the File
91
92 2005-02-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
93    * src/gdcmBinEntry.cxx : bug fix for BIG_ENDIAN part when writing the content
94    * gdcmPython/gdcm.i : rename gdcmHeader to gdcmHelper
95
96 2005-02-02 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
97    * FIX SQItem::AddEntry inserts now *in the right place* any Entry
98               (Dicom Element) into the Sequence Item
99
100 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
101    * src/*.cxx : first parss to normalize file organisation
102
103 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
104    * src/gdcmDirList.[h|cxx] : add method to find a directory
105    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : bug fix under Windows
106
107 2005-01-31 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
108    * Finish cleaning up my JPEG mess. Should be ok now.
109    * Getting toward a RLE very similar to JPEG. Every RLE stuff is now self
110           contained within the RLE* class(doh!)
111
112 2005-01-30 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
113    * SerieHeader::SetDirectory() allow recursive exploration of the Directory
114         * SerieHeader::AddFileName() creates as many Coherent Files lists 
115                       (same Serie UID) as it founds different Serie UID 
116                                            amongst the files instead of discarting any file 
117                                                 that doesn't match with the first one he found.
118         * SerieHeader::OrderGdcmFileList has now one parameter : 
119                        the Coherent Files list the user wants to sort
120    * SerieHeader::GetFirstCoherentFileList()  |
121    * SerieHeader::GetLastCoherentFileList()   | allow to parse 
122                        the set of Coherent Files lists 
123    * const SerieHeader::GdcmFileList &GetGdcmFileList() is kept, for backwards
124                        compatibility (it returns the *first* Coherent Files list, 
125                                                 since there was only one before)
126         * Test/TestSerieHeader gets gdcmData as a default root directory                
127                                           
128 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
129    * Remove friend between DocEntry and File classes
130    * Remove friend between PixelReadConverter and RLEFramesInfo, 
131      JPEGFragmentsInfo
132
133 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
134    * src/gdcmFile.cxx, gdcmDocument.cxx : fix the bug on the group|element
135      0002|0000. The value was incorrect.
136
137 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
138    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the gestion of UID
139
140 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
141    * src/gdcmUtil.cxx : compilation fix on Win32
142    * src/gdcmUtil.[h|cxx] : Set the default GDCM UID in a static constant
143      variable, to be easy found. Add methods to change the default UID.
144      Amelioration of the CreateUniqueUID to use the correct default UID.
145    * src/gdcmFile.cxx : correct use of the CreateUniqueUID method to create
146      a new file
147
148 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
149    * Test/TestVR.cxx : fix memory leaks
150
151 2005-01-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
152    * Rewrite the base 256 to base 10 conversion, using string operation only.
153          This allows us to get rid of the problematic 64bits integer type (does not
154          always exist on target platform).
155
156 2005-01-27 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
157    * Add construct and destructor to class gdcm::Debug to close the debug file
158           automatically
159    * Don't let uset to open twice the same file
160    * gdcm has now an official UID prefix,
161           supplied by http://www.medicalconnections.co.uk
162           1.2.826.0.1.3680043.2.1143
163           (Thx to Mathieu for providing URL)
164    * Add a forty-entries private Dicom Dictionary (Philips MR Intera)
165          to be able to perform some more tests
166    * gdcm::ContentEntry : Contructors and Destructor are now protected,
167          in order to be sure no user will try to use them.
168          (at user level, only the children classes are meaningfull)
169
170 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
171    * move RLEInfo & JPEGInfo from Document to File
172
173 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
174    * FIX : remove so many friend between classes
175
176 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
177    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : Bug fix when getting the value
178    * src/gdcmContentEntry.[h|cxx], gdcmValEntry.cxx : amelioration of code
179
180 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
181    In order to avoid missbehaviour :
182    . gdcm::DocEntry is now specialized in
183      - gdcm::SeqEntry (Dicom Sequence) as opposed to :
184      - gdcm::ContentEntry (Dicom entry with a 'content')
185    . gdcm::ContentEntry is specialized in
186      - gdcm::ValEntry (Dicom entry with a std::string representable value, i.e.
187        characters value, or integers)
188      - gdcm::BinEntry (Dicom entry with a non strig representable value
189    (user hasn't any longer to thing about the precedence of his dynamic_casts)
190
191 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
192    * Test/VTKTest*.cxx : bug fix under linux
193
194 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
195    * src/ : rename some methods on Entry (SetXxx, InsertXxx) to have a better
196      use with python. Some methods are moved from Document to ElementSet or
197      DocEntrySet. The equivalent methods to ElementSet have been added to 
198      SQItem and are virtual in DocEntrySet. Methods that may have the same code
199      in SQItem and ElementSet is directly placed in DocEntrySet
200
201 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
202    * Test/VTKTest*.cxx : remove the show variable in each test method because
203      it's useless (the viewer variable replace this variable)
204
205 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
206    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix on potential memory leak
207    * src/gdcmSQItem.cxx : initialize the SQItemNumber value in the constructor
208    * src/gdcmSQItem.[h|cxx], gdcmElementSet.[h|cxx], gdcmDicomDir*.[h|cxx] : 
209      Add ClearXxx methods to remove all the content of the list or map
210    * gdcmDocEntrySet.h : add GetFirst/NextEntry in pure virtual
211
212 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
213    * methods ReplaceOrCreate renamed as Insert
214      (nobody will be any longer confused by 'CreateOrReplace')
215   
216 2005-01-24 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
217    * Grealty simplify the JPEg decompression, no need to differenciate based on 
218      the JPEG possible type (with/without fragment, with/without multiple frame). 
219      Everything is done throught the JPEG IO Suspension mechanism in IJG
220
221 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
222    * Stage 3 of normalization :
223      in order to avoid any missunderstanding while reading method names :
224      - All the methods xxxEntry now deal with dicom Entries
225      - Methods GetEntry splitted into
226         GetEntryValue
227         GetEntryBinArea
228      - Method SetEntry renamed as SetEntryValue
229      - Method SetEntryBinArea let as it was
230
231 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
232     - Add empty nutshell for JPEG-LS (JPG-LS in NOT jpeg 'lossless')
233     - Position correctly the entry points for JPEG2000 and JPEG-LS
234       (Now Fragments info is get from the file, even for JPEG2000 and JPEG-LS)
235
236 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
237    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDict.h : rename AddNewXxx methods to AddXxx.
238    * src/gdcmDict.h : rename GetDictEntry moethod to GetEntry, to be coherent 
239      with other method names
240    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Add the typemaps for the TagName type
241    * Test/TestDicomDirElement.cxx : add new test
242
243 2005-01-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
244    * Finish the CreateUniqueUID stuff. Seems to compiled/runs on every
245      plateforms ITK support. Had some troubles with uint64_t on Win32, go to
246      http://msdn.microsoft.com/library/default.asp?url=/library/en-us/vclang/html/_langref_data_type_ranges.asp
247      for more info. Basically you can not used 'unsigned' __int8 in an ostream.
248      So can't you use __int64 in ostream at all.
249
250 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
251    * bug fix for compilation on MSVC6
252    * gdcmPython/gdcm.i : rename of classes missed
253
254 2005-01-21 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
255    * Stage 2 of names normalization :
256      - A gdcm::Document is now either a gdcm::DicomDir or a gdcm::File
257        (easy to understand ...)
258      - gdcm::FileHelper replaces old class gdcm::File
259
260 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
261    * gdcmDicomDirElement.[h|cxx] : change the AddEntry method. Now, it gets a
262      type and not a string. So, there remove problems on the format of the
263      string.
264
265 2005-01-20 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
266    * Add Example/TestPapyrus.cxx
267      - reads a Papyrus file (gdcm::Header compliant),
268      - gets the pixels of all the images, using low level iterators
269      - writes an multiframes Dicom image.
270    (Just to show it's *possible* to do that)
271     Uses SQItems accessors (we could use it as a 'Test' program, to improve test
272     coverage ...)
273
274 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
275    * src/gdcmDicomDirObject.h : set the FillObject method in protected.
276      Thus, DicomDirXXX are created with a flad that indicates if the created
277      object is empty or not (when not empty, the DicomDirElement is used to
278      fill the object)
279
280 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
281    * src/gdcmDicomDir.cxx : simplify the NewPatient method, like made in
282      gdcm::DicomDirPatient, gdcm::DicomDirStudy, gdcm::DicomDirSerie
283
284 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
285    * src/gdcmSQItem[h|cxx] : rename some methods to have coherent names
286
287 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
288    * src/gdcmDicomDir*.[h|cxx] : rename methods to be logik in their name.
289      Remove all access to the hash-tables or lists in the objects.
290
291 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
292    * src/gdcmDebug.h : remove the Debug test in the gdcmErrorMacro
293    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : rename the Initialise method to Initialize, to
294      be complient with all the gdcm source code
295
296 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
297    * src/gdcmDocEntry.h : DocEntry is now secure. User can't change the
298      DictEntry or the VR.
299
300 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
301    * gdcmPython/ : change GDCM_DATA_PATH to GDCM_DATA_ROOT to be complient with
302      all in gdcm
303
304 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
305    * Test/ : rename VTK tests to have a best name for the tests
306    * gdcmPython/demo/*.py.in : Change the InitTraversal/GetNextEntry use to
307      GetFirstEntry/GetNextEntry use
308
309 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
310    * In SerieHeader::ImagePositionPatientOrdering()
311      // a Dicom 'Serie' may contain scout views
312      // and images may have differents directions.
313      // -> More than one may have the same 'pos'
314      // Sorting has then NO meaning !
315      Thx to Eduardo Davila for reporting bug.
316
317 2005-01-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
318    * Test/ShowDicom.cxx, ShowDicomSeq.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : change the
319      test. Now it's on image content and not on the resulting visualisation...
320      might solve the problem on linux when using the OpenGL drivers
321
322 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
323    * ENH for DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, 
324              DicomDirSerie, DicomDirImage
325              Dict, DictSet classes :
326          -add method GetFirstEntry to replace call to InitTraversal+GetNextEntry
327          -remove InitTraversal method.
328    * UPD Test programs + Example programs
329
330 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
331    * remove useless and never updated keyword \ingroup         
332    * Solve pb when structure (list, map, ...) is empty.
333      Thx to Benoit for reporting bug
334
335 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
336    * Taking into account of 'Transfer Syntax' value
337        (for 'true' Dicom V3 files, the 'ACR-NEMA' heuristics sometimes gives
338          unaccurate result)
339
340 2005-01-17 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
341    * src/gdcmUtil.cxx : bug fix to find the Windows MAC address. Now, there
342      is no memory access violation
343    * gdcmPython/demo : add python demos using VTK
344
345 2005-01-16 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
346     * FIX 'Dictionnary' is now spelt 'Dictionary'
347           'wether' is now spelt 'whether'
348           'archieve' is now spelt 'archive'   ;-)
349
350 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
351     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
352           related methods, in order not to expose internal mechanisms
353         InitTraversal();
354         GetNextEntry();
355     * REM methods that exposed internal mechanisms :
356         DicomDir::GetDicomDirPatients()
357         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
358         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
359         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
360     * UPD Test programs :
361         makeDicomDir.cxx
362         BuildUpDicomDir.cxx
363         TestDicomDir.cxx
364      * UPD Example program
365         PrintDicomDir.cxx
366     * ADD DictSet methods
367         InitTraversal()
368         GetNextEntry()
369
370 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
371    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
372     reason to have to methods, moreover with the second taking the ostream as
373     *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
374
375 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
376    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
377     smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
378     Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
379     code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
380     working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
381     problematic GctestetIPAddress
382
383 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
384    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
385      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
386      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
387      shared libs.
388
389 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
390    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
391      sort DICOM files
392
393 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
394    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack
395          for dealing with BIGENDIAN processors
396          - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
397          When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
398          and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
399          PixelWriteConvertor, and avoid modifying the Pixel Area.
400          Note :
401          Probabely, the same operation will have to be done when we want 
402          to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
403          and we are working on Little Endian Processor
404                   
405 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
406    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
407      table.
408    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
409    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
410      all the dict content.
411    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
412      print
413    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
414
415 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
416    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
417                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
418
419 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
420    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
421    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
422    * gdcmPython/demo/ : add a new test
423
424 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
425    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
426    * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
427    * enhancement of Example/PrintDicomDir
428
429 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
430    * Now, python test might work on systems
431    * Add the PrintDicomDir test
432
433 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
434    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
435            Explicit Big Endian Transfer Syntax files
436           (group and elem not swaped)
437    
438 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
439    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
440            Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
441            begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
442            To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
443            Document::HandleOutOfGroup0002() method 
444     * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
445               (related pb not yet solved)
446
447 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
448    * Bug fix for the python part use
449    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
450
451 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
452    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
453
454 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
455    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
456      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
457      the transfer syntax
458
459 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
460    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
461    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
462        to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
463        and Transfer Syntax is Big Endian
464        We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
465     * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
466     * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
467
468 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
469    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
470    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
471    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
472    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
473    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
474    gdcm::Global would destroy at exit).
475
476 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
477    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
478     environment. static const string in a header file used to be ill
479     initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
480     issue.
481
482 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
483    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
484       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
485       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
486       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
487          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
488
489 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
490    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
491      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
492      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
493      redirected to a file (ofstream).
494    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
495      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
496
497 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
498    * Removal of useless and dangerous methods :
499          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
500          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
501    * Removal of usless methods :
502          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
503    * Commenting out of probabely useless methods :
504          Dict::GetDictEntryNames()
505          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
506          DictSet::GetPubDictEntryNames()
507          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()         
508    * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used    
509    * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version   
510    * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
511            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
512            Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods           
513    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
514            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
515                       Unused till now...           
516    * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
517            should be used to write a method to replace the former
518            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
519
520 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
521    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
522      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
523      data in the DocEntry structure
524
525 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
526    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
527      And now use a static function call instead, with a global variable. i
528      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
529      and easier to use...hopefully
530
531 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
532    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
533
534 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
535    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
536
537 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
538    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
539      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
540
541 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
542    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
543    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
544      a file
545    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
546      when specifying the VR
547    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
548    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
549
550 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
551    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
552           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
553    * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
554    * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
555            in order to allow further VR modification by user
556    * REM : removal of once-called method File::WriteBase   
557            integration of its code in formerly one-line method File::Write
558
559 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
560    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
561      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
562    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
563      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
564      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
565    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
566
567 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
568    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
569      empty Print Method
570    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
571
572 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
573    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
574    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
575    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
576    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
577    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
578
579 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
580    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
581      problems when compiling with the python wrapping
582
583 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
584    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
585      writting in ImplicitVR
586
587 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
588    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
589      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
590      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
591      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
592
593 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
594    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
595      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
596
597 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
598    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
599      Rename Decompressed to Raw
600    * Use the API changes in gdcm::File.
601    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
602      Memory leaks fixed
603
604 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
605    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
606      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
607      of Frames' field
608
609 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
610    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
611    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
612
613 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
614    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
615      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
616      solve it.
617
618 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
619    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
620      DocEntry. Now use methods of the Document !
621
622 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
623    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
624  
625 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
626    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
627    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
628    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
629    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
630      test to 0.0
631    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
632    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
633      containing found sequences
634
635 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
636    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
637      not at all time
638    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
639      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
640               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
641      and tests are now made on good variables
642
643 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
644    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
645    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
646      length
647    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
648    * Add vtkGdcmWriter example and test
649
650 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
651    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
652    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
653    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
654      SetValue
655    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
656    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
657
658 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
659    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
660    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
661
662 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
663    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
664      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
665      file isn't readable. 
666
667 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
668    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
669    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
670    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
671    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
672      method that is redondant with AddEntry.
673    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
674      SQItem
675
676 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
677    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
678    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
679    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
680
681 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
682    * Huge cleanup:
683      - Remove printf / sprintf
684      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
685      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
686        source
687      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
688        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
689      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
690        (plus it is not up to date)
691      - remove 'using namespace std' this is BAD !
692
693 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
694    * Remove memory leaks on the DicomDir
695    * Remove some useless data in DicomDirObject
696    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
697
698 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
699    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
700
701 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
702    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
703      future, with convertion)
704    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
705      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
706      from the output of the class
707
708 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
709    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
710
711 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
712    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
713      and vtkErrorMacro use.
714    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
715
716 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
717    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
718      file name in input
719    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
720    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
721      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
722      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
723      immediately after thee instruction.
724    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
725      file has been opened : the test must be made on the content of the 
726      pointer and not directly on the pointer !
727      Code formatting
728
729 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
730    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
731      the python part recompiles
732
733 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
734    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
735      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
736      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
737      all linux)
738
739 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
740    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
741      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
742      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
743      screen resolution, it's produce errors).
744      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
745    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
746    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
747      under windows at compilation
748    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
749      for grayscale images
750    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
751
752 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
753    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
754    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
755      tests on the image size X, Y, Z
756
757 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
758    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
759    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
760      between the class name and the file name
761
762 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
763    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
764      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
765      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
766      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
767      this variable content.
768
769 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
770    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
771      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
772      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
773      DocEntryArchive
774    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
775      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
776      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
777    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
778      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
779
780 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
781    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
782
783 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
784    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
785    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
786      the header.
787    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
788      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
789      write
790    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
791      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
792      is now on RGB data (as before my last commit
793    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
794
795 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
796    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
797      Add a print information of the type of the entry
798    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
799      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
800    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
801      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
802    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
803      any.
804    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
805
806 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
807    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
808      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
809      opened or not.
810
811 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
812    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
813      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
814    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
815      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
816      DocEntryArchive
817    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
818      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
819    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
820      - test the pixels written
821      - add test points to quickly find where is the error
822      - can set a file name input and output in arguments
823    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
824      amelioration of the test output
825
826 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
827    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
828      all replaced DocEntry's
829    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
830      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
831      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
832      header initial state.
833
834 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
835    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
836
837 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
838    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
839      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
840      then, it musn't change in the time.
841    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
842      header correctly. At this time, the change is only made for the first
843      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
844      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
845      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
846      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
847    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
848    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
849      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
850      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
851
852 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
853    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
854    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
855
856 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
857    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
858      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
859      is copied).
860    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
861      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
862    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
863
864 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
865    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
866      Two problems appear when doing it :
867       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
868         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
869         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
870         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
871         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
872         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
873         the gdcmBinEntry.
874       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
875         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
876         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
877         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
878         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
879    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
880
881 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
882    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
883    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
884      squeeze method
885
886 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
887    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
888    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
889      after it have been deleted
890
891 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
892    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
893    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
894    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
895      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
896      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
897
898 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
899     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
900     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
901     3. Use const ref when possible
902     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
903     5. A few more comments
904     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
905
906 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
907   * ENH: Slightly bigger patch:
908     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
909     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
910     3. File was not close properly in gdcmDict
911     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
912     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
913     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
914     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
915     8. Do not repeat virtual in subclasses
916     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
917
918 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
919   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
920     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
921     of a null character as defined by standard
922   
923 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
924   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
925     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
926
927 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
928   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
929   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
930     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
931
932 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
933   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
934     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
935     a verbose message is generated.
936     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
937     correctly close is a call to CloseFile.
938     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
939   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
940     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
941     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
942     header. A verbose is generated if these two size mismatch
943
944 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
945   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
946     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
947     break under windows (with msvc6 compilation).
948
949 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
950   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
951     compiling with MSVC6)
952
953 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
954   * Bugs fix for the Windows build with VC6
955   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
956     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
957     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
958     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
959   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
960     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
961     gdcm.i file)
962   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
963     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
964     std::cerr of vtk.
965
966 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
967   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
968   * gdcmPython/gdcm.i:
969     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
970     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
971       NOT need to be wrapped anymore.
972   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
973     DicomDir::Method) new example added.
974
975 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
976   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
977     A DicomString can contain as many \0 as they want
978     and it is *always* of even length.
979     We only support odd length for very rare case. 
980     And in the near future this should be removed.
981
982 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
983   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
984     little endian. This should -heopfully- fix some tests
985
986 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
987   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
988     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
989     the one comiled into lib
990
991 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
992   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
993     This should definitely solve any leak problem, and we should be
994     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
995
996 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
997   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
998   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
999   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
1000   
1001 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1002   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
1003   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
1004     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
1005   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
1006   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
1007     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
1008     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
1009       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
1010       no longer exists.
1011
1012 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1013   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
1014    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
1015    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
1016    the class.
1017   
1018 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1019   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
1020     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
1021     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
1022
1023 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1024   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
1025   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
1026     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
1027     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
1028     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
1029       CloseFile() anymore.
1030     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
1031       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
1032       into File::Pixel_Data.
1033
1034 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1035   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
1036     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
1037   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
1038     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
1039     method:
1040     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
1041     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
1042       method to those classes.
1043     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
1044       -- Added a ::Print() method.
1045       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
1046       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
1047          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
1048
1049 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1050   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
1051     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
1052     doxygen.
1053   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
1054   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
1055     pointlessly wrapped (see
1056     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
1057   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
1058     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
1059     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
1060     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
1061     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1062       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
1063            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
1064       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
1065          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
1066
1067 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1068   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
1069     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
1070
1071 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1072   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
1073     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
1074     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
1075   * TODO added new entry.
1076   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
1077     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1078     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
1079     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
1080       variable names for semantical coherence.
1081
1082 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1083   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
1084   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
1085   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
1086   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
1087   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
1088   compilation time jpeg option.
1089
1090 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1091   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
1092     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
1093     reproduce at home.
1094   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
1095   Thanks dcmtk crew !
1096
1097 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1098   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
1099   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
1100     matters, as stated in warning note at beginning of %include section).
1101   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
1102   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
1103   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
1104   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
1105     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
1106     from File:: to PixelConvert::.
1107
1108 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1109   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
1110     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1111      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
1112      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
1113
1114 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1115   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
1116   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
1117   like this:
1118     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
1119   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
1120   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
1121   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
1122
1123 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1124   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
1125     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
1126     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
1127     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
1128     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
1129       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
1130       (for the time being this is better than having them attach to
1131        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
1132     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
1133       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
1134     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
1135       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
1136       gdcmPixelConvert::
1137
1138 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1139   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
1140   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
1141     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
1142       clean up of RLE related code. 
1143   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
1144     - src/gdcmRLE.cxx removed
1145     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
1146     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
1147     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
1148   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
1149     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
1150       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
1151       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
1152
1153 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1154   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
1155     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
1156       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
1157       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
1158       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
1159       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
1160       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
1161       offsets.
1162   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
1163     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
1164         with the retired Parse7Fe0().
1165     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
1166     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
1167
1168 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1169   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
1170     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
1171     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
1172     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
1173   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
1174     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
1175       to return an unused length.
1176
1177 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1178   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
1179     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
1180     to use to do simple stuff.
1181
1182 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1183   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
1184     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
1185     copying of the file within different directory, configure header file to
1186     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
1187     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
1188
1189 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1190   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
1191      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
1192        with it's binary name).
1193      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
1194        the Website to be more complete.
1195      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
1196        doxygenated documentation.
1197      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
1198        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
1199                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
1200   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
1201   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
1202    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1203
1204 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1205   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
1206    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1207
1208 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1209   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
1210     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
1211     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
1212     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
1213     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
1214   * GDCMHOME clean up:
1215     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
1216       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
1217       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
1218   * Autotools clean up:
1219     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
1220     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
1221
1222 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1223   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
1224   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
1225   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
1226
1227 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1228   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
1229     describing TODO entries and used it for new entries.
1230   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
1231     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
1232     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
1233   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
1234     documentation itself, but the website) moved to html and
1235     placed in directory Doc/Website:
1236     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
1237     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
1238     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
1239   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
1240   * CMakeLists.txt changed accordingly.
1241   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
1242     DeveloppersPython.html
1243   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
1244
1245 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1246   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
1247     of gdcm Web site.
1248
1249 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
1250   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
1251     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
1252     we can now delete[] it safely 
1253   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
1254     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
1255   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
1256
1257 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1258   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
1259     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
1260     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
1261     pointed content.
1262
1263 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1264   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
1265   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
1266
1267 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1268   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
1269     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
1270     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
1271     an example of usage.
1272     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
1273       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
1274     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
1275       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
1276     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
1277     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
1278     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
1279
1280 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1281   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
1282     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
1283     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
1284     in class 
1285     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
1286       and associated accessors. Doxygenation of the class.
1287     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
1288       accessors added.
1289     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
1290       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
1291     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
1292     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
1293
1294 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1295   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
1296     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
1297       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
1298            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
1299            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
1300            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
1301            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
1302            the same group and element all share the same (group, element)
1303            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
1304            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
1305            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
1306            consider the following definition of a TagKey:
1307            - let Group, Element be the string representation of the
1308              group and element dicom tag members,
1309            - let ItemNumber be the string representation of the integer
1310              index of the considered item number of a sequence,
1311            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
1312            the form:
1313               /ItemNumber#Group|Element
1314            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
1315            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
1316               Group|Element<SeqTag>
1317            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
1318            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
1319            string e.g.
1320                0028|1201
1321            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
1322            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
1323            string e.g.
1324                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
1325     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
1326       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
1327       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
1328     - src/gdcmDocEntry.cxx:
1329       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
1330          Key member.
1331       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
1332     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
1333     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
1334       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
1335       -- now has a new BaseTagKey member.
1336       -- STYLE.
1337   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
1338     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
1339     truly belongs.
1340     This poses the problem with the semantics of the following lines
1341        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
1342        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
1343        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
1344     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
1345     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
1346     order to get things working the dicom dictionary was altered !
1347     Please fix things urgently...
1348   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
1349     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
1350     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
1351     set to OW:
1352       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
1353       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
1354       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
1355   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
1356     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
1357   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
1358
1359 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1360   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
1361
1362 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1363   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
1364     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
1365   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
1366   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
1367
1368 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1369   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
1370     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
1371   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
1372     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
1373   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1374     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1375   * TODO updated
1376   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1377     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1378   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1379   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1380     exception_on_error parameter.
1381     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1382     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1383     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1384
1385 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1386   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1387   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1388     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1389   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1390   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1391   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1392     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1393   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1394
1395 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1396   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1397     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1398
1399 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1400   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1401        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1402  
1403 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1404   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
1405         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1406
1407 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1408    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1409    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1410      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1411      is now in static in the gdcmDebug class
1412    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1413    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1414
1415 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1416    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1417      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1418    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1419      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1420      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1421      that displays position and size).
1422    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1423      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1424      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1425      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1426      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1427      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1428      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1429         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
1430      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1431      commiting changes).
1432    * Test/CMakeLists.txt:
1433       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1434       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1435         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1436         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1437    * TODO updated.
1438
1439 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1440    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1441      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1442      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1443      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1444      - removal of typedef duplication.
1445      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1446      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1447    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1448       - printf polluting ctest removed.
1449       - TAB removal for comminting
1450    * Test:
1451      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1452        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
1453        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1454        this test creates them.
1455        Note: we need to validate each reference image, but before that
1456              I'd like to rename them with a more explicit name...
1457      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1458    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
1459      including each header needed).
1460
1461 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1462    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1463      test suite to the Example directory. Are concerned:
1464      - PrintHeader.cxx
1465      - TestDcm2Acr.cxx
1466      - TestFindTags.cxx
1467      - TestWrite.cxx was
1468      - TestWriteSimple.cxx
1469    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1470      image gdcmData/oldACR00001.ima
1471
1472 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1473    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1474      with removal from gdcmData):
1475       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1476       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1477       - US.3405.1.dcm
1478      Added the following because after last cvs update, they cause
1479        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
1480      to segfault:
1481       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1482       - oldACR00001.ima
1483    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1484      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1485      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1486      form of test...
1487    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1488      we don't need to black list the following images anymore:
1489       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1490       - OT-PAL-8-face.dcm
1491       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1492    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1493      fixes and the beautified code ;-)
1494      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1495      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1496      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1497            improve the test suite). The bug could be detected by using
1498            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1499            or by using
1500            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1501            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1502
1503 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1504    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1505          - replace by uggly but working old code :-(
1506    A lot of things should be OK again.
1507    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
1508    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1509    (twice, withing a fortnigh ...)    
1510
1511 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1512    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1513      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1514    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1515      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1516      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1517                    - OT-PAL-8-face.dcm
1518                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1519    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1520      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1521      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1522      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1523      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
1524      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1525      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1526      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1527      image.
1528    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1529      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1530      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1531      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1532    
1533 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1534   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1535   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
1536                           (instead of infinite loop)
1537   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
1538
1539 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1540    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1541
1542 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1543    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1544            when SamplesPerPixel =3
1545          - now Write is no longer confused by 
1546           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1547          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
1548                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1549    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
1550            (in order to split the job that has not to be done 
1551            for gdcmDicomDir)
1552
1553 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1554    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1555      loop on the same image until memory went out. 
1556      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1557    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1558      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1559
1560 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1561    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
1562             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1563             is added a the end, when necessary.
1564             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
1565               now written correctly
1566             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
1567               (even for odd groups) 
1568         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1569                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1570
1571 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1572    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1573    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
1574      coding style).
1575
1576 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1577    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1578      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1579    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1580
1581 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1582    FIX : gdcmDocument.cxx
1583       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1584         code 'beautyfication' :-(
1585       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1586
1587 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1588    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
1589             : to allow user to create his own Sequences
1590    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1591
1592    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1593
1594    - gdcmBinEntry
1595      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1596   
1597    - gdcmDocEntry
1598      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1599      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1600   
1601    - gdcmDocEntrySet
1602      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1603      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1604      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1605      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1606      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);            
1607      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1608                                             guint16 element,
1609                                             std::string vr     = "unkn",
1610                                             std::string fourth = "unkn",
1611                                             std::string name   = "unkn"); 
1612      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
1613      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1614      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1615      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
1616      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1617      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1618      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1619      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1620   
1621    - gdcmDocument
1622      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1623      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1624      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1625      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1626      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1627                                         FILE *_fp, FileType type);
1628      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1629      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1630      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1631      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1632      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1633      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1634      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1635      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1636                                             guint16 element,
1637                                             std::string vr     = "unkn",
1638                                             std::string fourth = "unkn",
1639                                             std::string name   = "unkn");
1640      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1641      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1642      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1643      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1644                                              
1645    - gdcmElementSet
1646      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1647      
1648    - gdcmSeqEntry
1649      ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1650  
1651    - gdcmSQItem
1652      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1653      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);         
1654      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1655      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1656
1657    - gdcmValEntry
1658     ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
1659               
1660 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1661     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1662       The default constructor invoked by the line
1663          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1664       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1665       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1666       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1667     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1668       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1669       Could anyone explain why ?
1670     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1671       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
1672       code related to gdcmBinEntry).
1673
1674 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1675     * In order to fix memory leaks:
1676      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1677        some delete calls.
1678      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1679      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1680        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1681        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1682        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1683      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1684      - src/gdcmDocument.cxx:
1685        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1686           from dynamic stores.
1687        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1688           was causing memory leaks.
1689      - src/gdcmSQItem.cxx:
1690        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1691           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1692        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1693           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1694           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1695           This avoids SegFaulting.
1696      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1697     * Conclusion:
1698      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1699        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1700        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1701      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1702        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1703      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1704        segfaults).
1705     * Erroneous leading white fix:
1706      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1707        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1708      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1709      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1710     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1711     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1712
1713
1714 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1715     * In order to fix writing of dicom files:
1716      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1717      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1718      - src/gdcmDocument.cxx:
1719        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1720        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1721        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1722           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1723           manner.
1724        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1725           to only declared) and build on top of
1726           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1727        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1728      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1729        for usage in destructor and treatement of promotion in
1730        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1731      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1732       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1733     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1734       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1735       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1736       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1737
1738 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1739     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1740       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1741       learned that:
1742           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1743           soon as possible by globally disabling memory caching.
1744           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1745           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1746       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1747       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1748       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1749     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1750       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1751       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1752       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1753         with 1.
1754       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1755       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1756       understand why the list is empty...).
1757     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1758     * Doc/License.txt added.
1759
1760 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1761     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1762       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1763         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1764         the padding problem.
1765       - general clean up, simplification, and coding style.
1766       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1767     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1768
1769 2004-06-14 Jean-Pierre Roux      
1770    *  gdcmSeqEntry.cxx
1771       - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1772       - fix the display of SQItem ordinal number
1773       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1774       - remove some useless never written private methods   
1775       
1776 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1777    * gdcmBinEntry.cxx 
1778       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1779       - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1780          a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1781          a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1782    * dcmDocument.cxx
1783       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1784          according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1785       - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1786       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1787    * gdcmFile.cxx
1788       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1789    * gdcmSQItem.h
1790       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1791             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1792             \warning : some pb remaining around this number
1793             will be solved asap
1794       - AddEntry now takes the Item Number as a param    
1795    * gdcmValEntry.cxx 
1796       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param   
1797
1798 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1799     * Memory leak hunt with the following command:
1800       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1801                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1802       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1803       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1804       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1805           grep "MEMORY LEAK" src/*
1806       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1807       -----
1808           #include <string>
1809           int main() {
1810              std::string name;
1811              char * test = "babo";
1812              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1813                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1814              name.clear();   //// Doesn't help !
1815              return 0;
1816           }
1817       -----
1818           #include <string>
1819           #include <iostream>
1820           int main() {
1821              std::string line;
1822              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1823              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1824                                         //// of 1320 bytes in call to
1825                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1826             return 0;
1827           }
1828       -----
1829
1830
1831 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1832     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1833       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1834         and related, moved away to gdcmDocument.
1835       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1836         the corresponding protected accessors of inherited class
1837         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1838         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1839       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1840       - Clean up of undefined or unused methods.
1841     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1842       account the changes to gdcmHeader.h).
1843     * src/gdcmDocument.h:
1844       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1845         changes to gdcmHeader.h).
1846       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1847         (see changes to gdcmHeader.h).
1848       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1849       - Clean up of undefined or unused methods.
1850     * src/gdcmDocument.cxx:
1851       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1852       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1853       - some std::string properly set to VRKey
1854     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1855       references to gdcmDocument. 
1856     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1857     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1858       cvs repository gdcmData.
1859
1860 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1861     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1862     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1863       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1864     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1865     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1866       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1867     * src/gdcmDocument.cxx: 
1868       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1869         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1870       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1871         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1872         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1873         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1874         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1875               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1876               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1877     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1878     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1879       now taken into account.
1880     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1881       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1882     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1883       on posix.
1884     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1885       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1886     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1887
1888 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1889     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1890       gdcmGlob
1891     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1892     * src/gdcmUtil.h : export methods
1893
1894 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1895     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1896       to right behavior
1897     * Initial addition of automatic python testing
1898     * Initial addition of automatic image comparison
1899
1900 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1901     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1902       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1903
1904 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1905      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1906      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1907      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1908
1909 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1910      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1911        new concepts (and new classes) :
1912        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1913         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1914         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1915        a Sequence is composed of Items.
1916        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1917        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1918        (never taken into account)
1919        Our unability to add a new 'entry' in the header
1920        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1921        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1922        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1923        nothing is finished.
1924        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1925
1926 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1927      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1928      
1929 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1930      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1931        file prefix (SetFilePrefix)
1932
1933 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1934      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1935        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1936        baseline.
1937      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1938        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1939
1940 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1941      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1942        dicom image
1943
1944 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1945      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1946      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1947        between the developper and user version.
1948      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1949      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1950
1951 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1952      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1953        when using cmake.
1954
1955 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1956      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1957                src directory, now generated in the build dir.
1958             2. Tests as mentionned smarter
1959             3. Some clean up
1960             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1961           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1962           where we could set the institution name / patient name...
1963
1964        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1965               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1966                  (this was not true before)
1967
1968 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1969      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1970            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1971      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1972            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1973       Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1974      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1975            tree-like structure of a Dicom Header.
1976      * FIX Test code cleaning     
1977            
1978 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1979      * ENH: Adding automatic testing
1980        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1981        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1982        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1983        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1984           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1985           too many projects
1986      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1987      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1988        one file instead of seven + some small cleanup
1989
1990 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1991      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1992      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1993            Header printing. Example given with :
1994       > PrintHeader fileName  2 new
1995           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1996       
1997 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1998      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1999          1. I have added some unsigned where needed
2000          2. Some function parameter not used -> (void)
2001          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
2002          4. g++ don't like character '\' in comment
2003          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
2004                     this really need to be fixed
2005          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
2006          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
2007                     this also really need to be fixed
2008          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
2009                     remove compression file 
2010                     (as we only do decompression, right ?)     
2011      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
2012
2013 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
2014      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
2015            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
2016            defaulted to yspacing
2017       
2018 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
2019      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
2020      * ENH add parameters :
2021                bool  exception_on_error = false, 
2022                bool  enable_sequences   = false,
2023           bool  ignore_shadow      = false
2024            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
2025      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
2026            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
2027          
2028 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
2029      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
2030      
2031 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
2032      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
2033      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
2034              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
2035         
2036 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
2037      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
2038          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
2039
2040 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2041      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
2042        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
2043        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
2044        in gdcmHeader.
2045      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
2046        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
2047        already does the job.
2048      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
2049        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
2050
2051 2004-03-30 Benoit Regrain
2052      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
2053        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
2054        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
2055
2056 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
2057      * ENH : Check on file type to be written moved
2058              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
2059      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
2060              when end-of-list is reached
2061       : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
2062
2063 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2064      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
2065      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
2066      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
2067        equivalent to ExplicitVR in existing code).
2068
2069 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2070      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
2071        now contains all the gdcmGlobal related code.
2072      * minor coding style and doxygenation changes.
2073
2074 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2075      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
2076        now contains all the Debug related code.
2077      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
2078      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
2079        CreateCleanString) removed.
2080      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
2081      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
2082      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
2083      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
2084        src/gdcmDirList.cxx)
2085
2086 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
2087      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
2088
2089 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
2090      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
2091            big endian made volumes
2092      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
2093            end user to instanciate class gdcmParser
2094           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
2095
2096 2004-03-22 Benoit Regrain
2097      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
2098      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
2099              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
2100
2101 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
2102      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
2103            an already existing DICOMDIR file is consistent with
2104            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
2105            or build from the files held (recursively) in a Directory
2106            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
2107            gdcmObject::SetBoundaries() added
2108
2109 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
2110      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
2111                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
2112      * FIX now file names and directory name are written properly in the
2113            DICOMDIR
2114      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
2115            about the name
2116
2117 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2118      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
2119                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
2120
2121 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
2122      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
2123            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
2124            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
2125            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
2126       to allow making gdcDicomDir object.
2127      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
2128           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
2129
2130 2004-02-11 Benoit Regrain
2131      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
2132              when using from python
2133              
2134 2004-02-10 Benoit Regrain
2135      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
2136      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
2137      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
2138              directory parsing
2139
2140 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
2141      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
2142              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
2143              - class gdcmMeta created
2144      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
2145              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
2146      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
2147
2148 2004-02-05 Benoit Regrain
2149      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
2150              header entries
2151      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
2152      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
2153
2154 2004-02-04 Benoit Regrain
2155      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
2156      * FIX : sort the images in the dicom dir
2157      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
2158      * ADD : a python demo
2159
2160 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
2161      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
2162      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
2163              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
2164              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
2165              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
2166      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
2167            to make full checking easier
2168         
2169 2004-02-04 Benoit Regrain
2170      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
2171      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
2172
2173 2004-02-03 Benoit Regrain
2174      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
2175      * gdcmDicomDir : add the load of directory
2176      * Bug fix and print add-on
2177
2178 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
2179      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
2180      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
2181      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
2182      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
2183            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
2184         
2185 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
2186      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
2187              iterator on last
2188              of the last synonym :-(
2189      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
2190              for DICOMDIR ;-)
2191      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
2192      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
2193      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
2194            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
2195       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
2196
2197 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
2198      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
2199            no longer writes 'Un' on disk
2200      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
2201      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
2202            the length (for Palette expanded images)
2203            and Raw Length (non expanded image + Palette)
2204      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
2205            (that broke Write). Replaced by UL.
2206            Aware user will reload the field if he 
2207            thinks it's necesssary
2208              
2209 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
2210      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
2211        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
2212        IsReadable() methods.
2213        
2214      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
2215       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
2216       but so usefull for people that miss them ;-)
2217       
2218      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
2219        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
2220
2221 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
2222      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
2223
2224 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
2225      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
2226              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
2227         The TRUE value for this param has to be used 
2228         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
2229         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
2230      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
2231              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
2232         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
2233         
2234      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
2235              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
2236              Fixed
2237
2238      * gdcmHeader add the method
2239              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
2240         to get *all* the Header Entries with the same tag.
2241         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
2242         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
2243
2244 2004-01-26 Benoit Regrain
2245      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
2246        in the print and add a third level of print to print them
2247
2248 2004-01-23 Benoit Regrain
2249      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
2250      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
2251      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
2252        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
2253
2254 2004-01-22 Benoit Regrain
2255      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
2256      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
2257
2258 2004-01-19 Benoit Regrain
2259      * Add the use of shadow dictionaries
2260      * bug fix and coding style
2261
2262 2004-01-19 Benoit Regrain
2263      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
2264      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
2265      * Add the update of header entries using the shadow library
2266
2267 2004-01-19 Benoit Regrain
2268      * removal of file gdcmHeader2.cxx
2269      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
2270        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
2271        of dicom dir parsing
2272      * bug fix under python
2273
2274 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
2275     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
2276     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
2277     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
2278     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
2279
2280 2004-01-15 Benoit Regrain
2281      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
2282        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
2283        when the gdcmDictSet will be destroyed
2284      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
2285        gdcmDictSet
2286
2287 2004-01-15 Benoit Regrain
2288      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
2289        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
2290        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
2291        some memory and vtk seems to have some problems with that.
2292      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
2293
2294 2004-01-14 Benoit Regrain
2295      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
2296      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
2297      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
2298      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
2299
2300 2004-01-13 Benoit Regrain
2301      * src/*.[h|cxx] : coding style
2302      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
2303
2304 2004-01-13 Benoit Regrain
2305      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
2306      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
2307        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
2308      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
2309
2310 2004-01-12 Benoit Regrain
2311      * src/*.h : add comments
2312      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
2313      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
2314        directly setted in the source code
2315      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
2316        gdcmTS and gdcmVR
2317
2318 2004-01-09 Benoit Regrain
2319      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
2320      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
2321
2322 2004-01-07 Benoit Regrain
2323      * Modification to compile with the distutils.
2324      * Bug fix in code
2325
2326 2003-12-10 Benoit Regrain
2327      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
2328        can use a gdcmHeaderHelper to load data
2329      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
2330        made in the source code
2331
2332 2003-12-10 Benoit Regrain
2333      * Update Windows projects and .cvsignore files
2334
2335 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
2336      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
2337            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
2338            if he wants to.
2339            gdcmElValSet:Print takes it into account
2340
2341 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2342      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
2343      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
2344      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
2345
2346 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
2347       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
2348              on the ListTag listElem member,
2349              not longer on the TagElValueHT tagHt member
2350       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
2351              with the tagHt member and the listElem member.
2352         (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
2353
2354       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
2355              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
2356                        if bug fixing is necessary), for internal
2357              use only
2358         UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
2359                        or to allow Parser going on.
2360         Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
2361         with a length (not 0000) is found
2362       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
2363            because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
2364       (to be written)
2365
2366 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
2367      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
2368      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
2369           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
2370      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
2371
2372 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2373      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2374
2375 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2376      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2377           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2378
2379 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2380      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2381      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2382              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2383              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2384
2385 2003-11-05 Benoit Regrain
2386      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2387                        : Explicit error messages
2388      * in __init__.py  : Related modif
2389
2390 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2391      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2392            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2393            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2394      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2395                     (vtkGdcmReader compliant)           
2396       
2397 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2398      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2399        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2400        
2401 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2402      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
2403            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2404
2405 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2406      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
2407                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2408              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2409              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2410              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2411              such an image :
2412              After gdcmHeader :
2413               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2414               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2415               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2416      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2417              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2418
2419 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2420      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2421              
2422 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2423      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
2424       being coherents dicom files.
2425      
2426 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2427      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2428            from medcon lib !
2429      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
2430      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2431      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2432      * ENH: Add include dir to medcon lib
2433      * FIX: only one function is being exported for now ! 
2434            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2435             
2436 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2437       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2438         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2439           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2440       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2441
2442 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2443       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2444         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2445         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2446       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2447       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2448
2449 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2450       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2451                                                
2452 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2453       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2454       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2455       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2456       
2457 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2458       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2459       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2460       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2461       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2462       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2463       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
2464              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2465         But it fasten debug compilation time.
2466             
2467 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2468       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2469         (they are compressed as 2 planes images, 
2470          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2471
2472 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2473       * Now CheckRead takes into account :
2474          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2475          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2476       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2477        (breaks DicomWorks)
2478
2479 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2480       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
2481              one should remove the '\'
2482         
2483 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2484       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
2485         (wrong lengths in header)
2486         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2487       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2488         (breaks DicomWorks)
2489
2490 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2491       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
2492         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2493
2494 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2495       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2496       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2497
2498 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2499       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2500      
2501 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2502       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2503         (the patch is easy to remove)
2504       * cosmetic changes to avoid warnings
2505       
2506 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2507       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
2508         no need to press 'r' now.
2509    
2510 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2511       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2512         to new Jpeg Lossless decompressor
2513       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2514       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2515       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2516                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
2517 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2518       * general anonymisation in gdcmData
2519       * adding the 'color files' from
2520         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2521       * adding some well knowed bugged-header images
2522       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2523         waiting for their inclusion in Python testsuite
2524
2525 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2526     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2527       no longer seg faults when file is not found
2528
2529 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2530      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
2531        MultiFrame images
2532
2533 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2534      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2535
2536 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2537      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2538         OpenFile takes it into account
2539      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2540      * Missing elements added in dicomV3.dic
2541       (just to be affraid : have a look at
2542        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2543        and do it again next year ;->
2544
2545 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2546      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
2547        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2548        But there are NOT. It's fixed !
2549        
2550 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2551      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2552      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
2553          
2554 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2555      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2556              an ACR-NEMA / DICOM one.
2557      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
2558              is not gdcm Readable
2559      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
2560              is now decoded.
2561         
2562 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2563      * FIX: CMake generate now documentation
2564      * ENH: out of source doc build !
2565      * ENH: Generate both user and dev documentation
2566      * ENH: Should work on windows too
2567      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
2568      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
2569      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2570      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
2571                      
2572 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2573      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2574      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2575      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
2576         window level & window width
2577
2578 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2579      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2580      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2581      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2582      
2583 2003-10-06  Emanuel Ollart
2584      * FIX : compilation process wad broken.
2585              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2586         
2587 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2588      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2589      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2590      
2591 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2592      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2593            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2594                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2595       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2596
2597 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2598       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
2599         to remain compliant with already defined strings, 
2600         like Transfert Syntax UID and others)
2601
2602 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2603       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2604              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2605         
2606 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2607       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2608       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2609
2610 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2611       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2612         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2613               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2614       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2615
2616 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2617       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2618
2619 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2620       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2621         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2622
2623 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2624       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2625          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2626          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2627          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2628           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
2629                                        YBR_RCT files.
2630           (no sample found :-(
2631
2632 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2633       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2634         Two reasons: - clear things
2635                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2636                        suffer anymore VC++ complains
2637
2638 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2639       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2640       * removed leaks
2641
2642 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2643       * The lines are now eigthy characters long.for 
2644         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
2645
2646 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2647       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2648         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2649         previous commis of Malaterre)
2650       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2651         before the last Malaterre's commit.
2652
2653 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2654       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2655         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2656       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2657         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2658
2659 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2660       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2661         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2662         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2663
2664 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2665       * Cosmetic changes:
2666         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2667           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2668           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2669           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2670         - PACKAGER corrected
2671         - DEVELOPPER added.
2672         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2673       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2674
2675 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2676       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2677
2678 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2679       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2680
2681 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2682       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2683
2684 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2685       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2686
2687 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2688       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2689         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2690         heuristics to get informations (look at different places).
2691       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2692         sorting DICOM images based on different strategies.
2693       * modified Makefiles accordingly.
2694
2695 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2696       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2697         when building in debug mode
2698       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2699         src/win32/gdcmdll.dsp
2700       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2701
2702 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2703       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2704             to valgrind.
2705
2706 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2707       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2708       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
2709                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2710       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2711
2712 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2713       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2714         the file
2715       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2716       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2717         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2718       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2719         symbols... future problem ?
2720
2721 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2722       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2723       * modified gdcm.dsw accordingly
2724
2725 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2726       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2727
2728 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2729       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2730         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2731       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2732         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2733         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2734
2735 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2736       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2737
2738 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2739       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2740       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2741       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2742       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2743       * PACKAGER : adding all concerning windows
2744
2745 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2746       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2747         garbage debug code.
2748       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2749       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2750         test suite reported error.
2751       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2752         packaging a new release).
2753       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2754       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2755       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2756         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2757         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2758
2759 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2760       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2761       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2762
2763 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2764       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2765         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2766         is made in an internal list to prevent this problem.
2767         Bug fix when output is empty.
2768         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2769         correction.
2770       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2771
2772 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2773       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2774       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2775         files. Added method to remove all files on the input
2776         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2777         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2778
2779 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2780       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2781         when using make instal.
2782       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2783         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2784
2785 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2786       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2787       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2788
2789 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2790       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2791         linux and WINDOWS !
2792       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2793       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2794
2795 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2796       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2797         addon of the jpeg library)
2798       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2799       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2800       * INSTALL now points to web documentation
2801
2802 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2803       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2804         gdcmUtil.h anymore.
2805       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2806         clean target.
2807       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2808         - to allow compilation with gcc 3.x
2809           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2810           -- small fixes on exceptions.
2811           Note: linking not tested !
2812         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2813           building stage.
2814       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2815         dependent convertion).
2816
2817 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2818       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2819         Changelog):
2820         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2821         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2822           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2823         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2824
2825 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2826       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2827         compile
2828       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2829         (FileName -> Filename)
2830
2831 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2832       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2833         - UpdateProgress method should now be effective
2834         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2835           to volumes),
2836         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2837           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2838           accelerating things).
2839         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2840           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2841           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2842           in the stack (for the caller to notice the problem).
2843
2844 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2845       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2846
2847 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2848       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2849         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2850         under Windows... thanks Windows !)
2851
2852 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2853       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2854         debug stage).
2855       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2856
2857 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2858       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2859
2860 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2861       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2862         called with different flags than the default ones (with automake).
2863         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2864            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2865         and went for warning fixes:
2866         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2867           up from unused variables.
2868         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2869       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2870
2871 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2872       * gdcmPython/gdcm.i:
2873         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2874           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2875           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2876         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2877           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2878           exported to Python a as cvar.
2879       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2880         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2881         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2882         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2883         C++ static methods).
2884       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2885         with the above changes.
2886
2887 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2888       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2889
2890 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2891       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2892         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2893         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2894          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2895          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2896            a wrapper
2897          - Wrapper interface which wrap sources
2898         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2899         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2900       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2901         files for compilation
2902
2903 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2904       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2905         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2906         - vtk/Makefile.am now builds a library
2907         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2908           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2909           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2910           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2911           import library.
2912         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2913           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2914           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2915           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2916           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2917         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2918           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2919         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2920           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2921       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2922       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2923         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2924         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2925         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2926         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2927         collision of various stl members (principally cout...).
2928       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2929         file.
2930       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2931         comply with above changes)
2932
2933 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2934       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2935       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2936         vtk data structure (an image Flip was required).
2937       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2938       * cosmetic changes in documentation.
2939
2940 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2941       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2942         unexisting file is given as argument.
2943       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2944         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2945         containing those images is now available at
2946           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2947         with the name gdcmData.
2948         All the python scripts (including the package initialisation file
2949         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2950         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2951
2952 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2953       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2954         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2955         demo of the usage of this class.
2956         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2957         at configure (or autogen.sh) stage.
2958
2959 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2960       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2961         Notes on valgrind:
2962           - maximum info is obtained with a command of the form:
2963             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2964                      --show-reachable=yes PrintHeader
2965           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2966             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2967             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2968             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2969              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2970       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2971         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2972         Note: some images don't seem to work e.g.
2973             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2974       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2975         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2976         make gdcm more thread friendly.
2977
2978 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2979       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2980           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2981         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2982           gdcmHeader::_dicom_vr.
2983         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2984         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2985           VRHT*.
2986         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2987
2988 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2989       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2990         make install stage.
2991
2992 2003-04-9 JPR
2993       * UpdateGroupLength replaced by new one
2994
2995 2003-04-7 JPR
2996       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2997         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2998
2999 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3000       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
3001       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
3002       * src:
3003         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
3004         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
3005           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
3006         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
3007           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
3008           carried the same semantics.
3009           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
3010         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
3011           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
3012         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
3013       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
3014       * gdcmGetXSize added
3015       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
3016       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
3017
3018 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3019       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
3020         (to avoid double call by end user).
3021       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
3022         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
3023
3024 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3025       * gdcm/Doc many doxygen changes:
3026         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
3027           the html.users end users oriented documentation and
3028           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
3029           oriented documentation.
3030         - README changed accordingly
3031         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
3032         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
3033           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
3034         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
3035           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
3036           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
3037       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
3038         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
3039       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
3040         ill-formed documentation sections.
3041       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
3042
3043 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3044       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
3045       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
3046         un*ces with sh-utils test utility.
3047       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
3048       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
3049       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
3050       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
3051       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
3052
3053 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3054       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
3055       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
3056
3057 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3058       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
3059       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
3060       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
3061       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
3062         compilation work.
3063       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
3064       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
3065
3066 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3067       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
3068         hence the user doesn't need this explicit call.
3069         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
3070           i.e. LoadElements() call removed.
3071       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
3072         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
3073       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
3074         for adding user defined new tags.
3075         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
3076         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
3077           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
3078
3079 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
3080       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
3081         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
3082         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
3083         with the autotools, included the python wrappers part.
3084       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
3085
3086 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3087       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
3088
3089 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3090       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
3091         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
3092         for usage).
3093       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
3094         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
3095         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
3096       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
3097         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
3098
3099 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3100       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
3101         in InstallMode or PreInstallMode but with an environment given
3102         value of GDCM_DICT_PATH.
3103       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
3104
3105 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3106       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
3107       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
3108       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
3109         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
3110         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
3111
3112 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3113       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
3114         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
3115         gdcmHeader.h
3116       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
3117         (as opposed to gdcm.h)
3118       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
3119       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
3120         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
3121       * autogen.sh removed history related references to crea package.
3122
3123 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3124       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
3125         bug.
3126
3127 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3128       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
3129         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
3130         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
3131         of hidding away the python related distutils specific files
3132         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
3133         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
3134         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
3135         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
3136
3137 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3138       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
3139       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
3140         among the list of sources.
3141
3142 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3143       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
3144       * modifications in MSVC projects
3145
3146 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3147       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
3148         looks like we can move back to original usage of exception within
3149         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
3150         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
3151       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
3152         README file for usage added.
3153       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
3154         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
3155         testing the proper parsing of a Dicom related file.
3156         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
3157       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
3158       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
3159         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
3160           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
3161           Dicom public dictionary were not accessible without an
3162           instance of class gdcmHeader.
3163         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
3164           require no instances at all to be invocated.
3165         - within gdcmDictSet this change required to change some method
3166           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
3167           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
3168       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
3169         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
3170       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
3171         the above to be effective.
3172       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
3173         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
3174       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
3175         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
3176         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
3177         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
3178         (for python dectection).
3179       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
3180         now avoids publishing the empty entries.
3181
3182 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3183       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
3184         ExtraPath reused :-P
3185       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
3186
3187 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3188       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
3189       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
3190       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
3191         and links
3192
3193 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3194       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
3195         method. Doxygenation.
3196       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
3197
3198 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3199       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
3200         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
3201         when using "python setup.py install".
3202       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
3203         reexports the working classes.
3204       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
3205         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
3206         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
3207         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
3208         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
3209         subdir (see the README file). This problem probably due to
3210         an combination of g++ and dynamic loading.
3211       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
3212
3213 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3214       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
3215         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
3216         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
3217         again in a python subdir, but the package itself is now in
3218         python/gdcmPython.
3219       * setup.py was cleaned up:
3220         - pythonIncludePath removed
3221         - python setup.py bdist target is now functional.
3222       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
3223         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
3224         accordingly.
3225
3226 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3227       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
3228       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
3229         distutils installer is operational.
3230       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
3231           shadow classes (from gdcm.py).
3232         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
3233           instead of gdcmPython/demo/load.py.
3234         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
3235
3236 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3237       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
3238         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
3239         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
3240         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
3241         dictionary.
3242         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had an unspecified fourth field
3243           are now in the "???" group.
3244         - python/gdcm.i changed accordingly,
3245         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
3246           of the above new functionalities in Python.
3247
3248 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3249       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
3250         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
3251           were definitively removed.
3252         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
3253       * src/gdcmElValSet.cxx:
3254         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
3255         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
3256         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
3257         - Added GetElementByName(string).
3258       * src/gdcmHeader.cxx: added
3259         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
3260         - GetPubElValRepByName(string)
3261         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
3262         - GetShaElValRepByName(string)
3263         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
3264         - GetShaElValRepByName(string)
3265         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
3266         - GetElValRepByName(string)
3267         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
3268         - GetElValRepByName(string)
3269       * Doc/requirements.txt added.
3270
3271 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3272       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
3273       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
3274         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
3275         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
3276         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
3277       * python/testSuite.py changed accordingly.
3278
3279 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
3280       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
3281         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
3282              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
3283               cannot be exported. [...]
3284               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
3285               be exported. [...]
3286               This is caused by a designed limitation that once a template
3287               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
3288               exported."
3289         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
3290         limitation" of VC++ is a pitfall.
3291         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
3292         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
3293         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
3294         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
3295         library.
3296         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
3297       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
3298          dll under windows !!!!)
3299       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
3300       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
3301         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
3302       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
3303         (one) of image(s).
3304       * removed glib references
3305       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
3306
3307 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3308       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
3309         that only displays required tags and testAll.py that parses all
3310         the files of the testsuite without using unittest.
3311       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
3312       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
3313       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
3314         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
3315
3316 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3317       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
3318         values, but limits itself to values which are below a user specified
3319         size (by default 1024 bytes).
3320       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
3321         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
3322         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
3323         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
3324       * python/testSuite.py
3325         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
3326         - two new examples added.
3327       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
3328
3329 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3330       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
3331         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindLength().
3332       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
3333       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
3334       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
3335
3336 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3337       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
3338         the vr was also RET.
3339       * python/testSuite.py more tests added.
3340
3341 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3342       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
3343       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
3344       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
3345         7.18 Integer types (see stdint.h)
3346         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
3347       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
3348         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
3349         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
3350         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
3351         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
3352         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
3353         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
3354         The rest of the changes we the necessary adaptations.
3355
3356 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3357       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
3358         VR files.
3359       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
3360
3361 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3362       * Adaptation for porting to VC++:
3363         - src/gdcm.h
3364           o forced to use std namespace (for string to be known)
3365           o all class use __declspec export style on WIN32
3366         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
3367           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
3368       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
3369         variable GDCM_DICT_PATH.
3370       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
3371
3372 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3373       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3374         to native Python dictionary.
3375       * python/demo/test.py:
3376         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3377         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3378       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3379         PubElVals hashing table.
3380       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3381
3382 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3383       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3384         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3385       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3386       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3387       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3388         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3389       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3390
3391 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3392       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3393         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3394         that we can import the shadow classes without errors].
3395
3396 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3397       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3398       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3399       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3400       * src/Makefile prepared for python wrapping
3401
3402 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3403       * src/gdcmHeader.cxx :
3404         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3405           (see gdcmHeader::LoadElements).
3406         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3407           ReadInt16 and ReadInt32)
3408
3409 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3410       * src/gdcmHeader.cxx :
3411         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3412           method.
3413         - SetLgrElem renamed to SetLength
3414         - GetLgrElem renamed to GetLength
3415         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3416       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3417       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3418         due to IdoDude was cleaned out.
3419
3420 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3421       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3422         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3423         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3424         returning the unecessary skL (skipped length).
3425         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3426         it was redundant with the File position internals (by using
3427         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3428         jajun.
3429       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3430         on the libido specificities which are handled through class
3431         inheritance.
3432       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3433         added.
3434
3435 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3436       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3437         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3438
3439 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3440       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3441
3442 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3443       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3444         and _IdDcmSWAP_LONG.
3445
3446 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3447       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3448         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3449