]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
BUG: Remove the Print indent mess. Please only one Print per class default paramater...
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
3          reason to have to methods, moreover with the second takeing the ostream as
4          *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
5
6 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
7    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
8          smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
9          Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
10          code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
11          working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
12          problematic getIPAddress
13
14 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
15    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
16      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
17      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
18      shared libs.
19
20 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
21    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
22      sort DICOM files
23
24 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
25    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack 
26               for dealing with BIGENDIAN processors
27                         - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
28                         When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
29                         and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
30                         PixelWriteConveror, and avoid modifying the Pixel Area.
31                         Note :
32               Probabely, the same operation will have to be done when we want 
33               to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
34               and we are working onj Little Endian Processor
35                                                 
36 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
37    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
38      table.
39    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
40    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
41      all the dict content.
42    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
43      print
44    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
45
46 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
47    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
48                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
49
50 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
51    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
52    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
53    * gdcmPython/demo/ : add a new test
54
55 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
56    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
57         * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
58         * enhancement of Example/PrintDicomDir
59
60 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
61    * Now, python test might work on systems
62    * Add the PrintDicomDir test
63
64 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
65    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
66                 Explicit Big Endian Transfer Syntax files
67           (group and elem not swaped)
68         
69 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
70    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
71                 Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
72                           begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
73                           To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
74                           Document::HandleOutOfGroup0002() method 
75          * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
76               (related pb not yet solved)
77
78 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
79    * Bug fix for the python part use
80    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
81
82 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
83    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
84
85 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
86    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
87      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
88      the transfer syntax
89
90 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
91    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
92    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
93             to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
94                  and Transfer Syntax is Big Endian
95                  We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
96          * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
97          * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
98
99 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
100    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
101    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
102    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
103    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
104    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
105    gdcm::Global would destroy at exit).
106
107 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
108    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
109          environment. static const string in a header file used to be ill
110          initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
111          issue.
112
113 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
114    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
115       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
116       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
117       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
118          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
119
120 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
121    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
122      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
123      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
124      redirected to a file (ofstream).
125    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
126      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
127
128 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
129    * Removal of useless and dangerous methods :
130          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
131          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
132         * Removal of usless methods :
133          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
134    * Commenting out of probabely useless methods :
135          Dict::GetDictEntryNames()
136          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
137          DictSet::GetPubDictEntryNames()
138          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()                      
139         * ENH : New Dicom Dictionnary (with Value Multiplicity) is now used     
140         * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version    
141         * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
142            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
143                           Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods                        
144    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
145            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
146                                      Unused till now...                   
147         * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
148            should be used to write a method to replace the former
149            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
150
151 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
152    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
153      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
154      data in the DocEntry structure
155
156 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
157    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
158      And now use a static function call instead, with a global variable. i
159      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
160      and easier to use...hopefully
161
162 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
163    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
164
165 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
166    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
167
168 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
169    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
170      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
171
172 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
173    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
174    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
175      a file
176    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
177      when specifying the VR
178    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
179    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
180
181 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
182    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
183           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
184         * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
185         * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
186            in order to allow further VR modification by user
187    * REM : removal of once-called method File::WriteBase        
188                 integration of its code in formerly one-line method File::Write
189
190 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
191    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
192      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
193    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
194      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
195      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
196    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
197
198 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
199    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
200      empty Print Method
201    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
202
203 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
204    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
205    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
206    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
207    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
208    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
209
210 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
211    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
212      problems when compiling with the python wrapping
213
214 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
215    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
216      writting in ImplicitVR
217
218 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
219    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
220      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
221      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
222      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
223
224 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
225    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
226      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
227
228 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
229    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
230      Rename Decompressed to Raw
231    * Use the API changes in gdcm::File.
232    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
233      Memory leaks fixed
234
235 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
236    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
237      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
238      of Frames' field
239
240 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
241    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
242    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
243
244 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
245    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
246      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
247      solve it.
248
249 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
250    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
251      DocEntry. Now use methods of the Document !
252
253 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
254    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
255  
256 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
257    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
258    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
259    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
260    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
261      test to 0.0
262    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
263    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
264      containing found sequences
265
266 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
267    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
268      not at all time
269    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
270      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
271               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
272      and tests are now made on good variables
273
274 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
275    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
276    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
277      length
278    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
279    * Add vtkGdcmWriter example and test
280
281 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
282    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
283    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
284    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
285      SetValue
286    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
287    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
288
289 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
290    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
291    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
292
293 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
294    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
295      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
296      file isn't readable. 
297
298 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
299    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
300    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
301    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
302    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
303      method that is redondant with AddEntry.
304    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
305      SQItem
306
307 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
308    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
309    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
310    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
311
312 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
313    * Huge cleanup:
314      - Remove printf / sprintf
315      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
316      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
317        source
318      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
319        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
320      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
321        (plus it is not up to date)
322      - remove 'using namespace std' this is BAD !
323
324 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
325    * Remove memory leaks on the DicomDir
326    * Remove some useless data in DicomDirObject
327    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
328
329 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
330    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
331
332 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
333    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
334      future, with convertion)
335    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
336      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
337      from the output of the class
338
339 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
340    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
341
342 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
343    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
344      and vtkErrorMacro use.
345    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
346
347 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
348    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
349      file name in input
350    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
351    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
352      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
353      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
354      immediately after thee instruction.
355    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
356      file has been opened : the test must be made on the content of the 
357      pointer and not directly on the pointer !
358      Code formatting
359
360 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
361    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
362      the python part recompiles
363
364 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
365    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
366      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
367      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
368      all linux)
369
370 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
371    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
372      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
373      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
374      screen resolution, it's produce errors).
375      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
376    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
377    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
378      under windows at compilation
379    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
380      for grayscale images
381    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
382
383 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
384    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
385    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
386      tests on the image size X, Y, Z
387
388 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
389    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
390    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
391      between the class name and the file name
392
393 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
394    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
395      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
396      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
397      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
398      this variable content.
399
400 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
401    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
402      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
403      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
404      DocEntryArchive
405    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
406      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
407      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
408    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
409      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
410
411 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
412    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
413
414 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
415    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
416    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
417      the header.
418    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
419      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
420      write
421    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
422      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
423      is now on RGB data (as before my last commit
424    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
425
426 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
427    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
428      Add a print information of the type of the entry
429    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
430      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
431    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
432      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
433    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
434      any.
435    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
436
437 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
438    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
439      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
440      opened or not.
441
442 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
443    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
444      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
445    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
446      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
447      DocEntryArchive
448    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
449      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
450    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
451      - test the pixels written
452      - add test points to quickly find where is the error
453      - can set a file name input and output in arguments
454    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
455      amelioration of the test output
456
457 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
458    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
459      all replaced DocEntry's
460    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
461      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
462      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
463      header initial state.
464
465 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
466    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
467
468 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
469    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
470      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
471      then, it musn't change in the time.
472    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
473      header correctly. At this time, the change is only made for the first
474      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
475      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
476      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
477      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
478    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
479    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
480      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
481      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
482
483 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
484    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
485    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
486
487 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
488    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
489      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
490      is copied).
491    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
492      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
493    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
494
495 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
496    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
497      Two problems appear when doing it :
498       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
499         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
500         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
501         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
502         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
503         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
504         the gdcmBinEntry.
505       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
506         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
507         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
508         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
509         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
510    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
511
512 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
513    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
514    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
515      squeeze method
516
517 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
518    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
519    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
520      after it have been deleted
521
522 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
523    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
524    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
525    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
526      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
527      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
528
529 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
530     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
531     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
532     3. Use const ref when possible
533     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
534     5. A few more comments
535     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
536
537 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
538   * ENH: Slightly bigger patch:
539     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
540     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
541     3. File was not close properly in gdcmDict
542     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
543     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
544     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
545     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
546     8. Do not repeat virtual in subclasses
547     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
548
549 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
550   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
551     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
552     of a null character as defined by standard
553   
554 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
555   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
556     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
557
558 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
559   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
560   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
561     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
562
563 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
564   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
565     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
566     a verbose message is generated.
567     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
568     correctly close is a call to CloseFile.
569     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
570   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
571     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
572     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
573     header. A verbose is generated if these two size mismatch
574
575 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
576   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
577     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
578     break under windows (with msvc6 compilation).
579
580 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
581   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
582     compiling with MSVC6)
583
584 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
585   * Bugs fix for the Windows build with VC6
586   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
587     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
588     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
589     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
590   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
591     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
592     gdcm.i file)
593   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
594     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
595     std::cerr of vtk.
596
597 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
598   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
599   * gdcmPython/gdcm.i:
600     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
601     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
602       NOT need to be wrapped anymore.
603   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
604     DicomDir::Method) new example added.
605
606 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
607   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
608     A DicomString can contain as many \0 as they want
609     and it is *always* of even length.
610     We only support odd length for very rare case. 
611     And in the near future this should be removed.
612
613 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
614   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
615     little endian. This should -heopfully- fix some tests
616
617 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
618   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
619     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
620     the one comiled into lib
621
622 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
623   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
624     This should definitely solve any leak problem, and we should be
625     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
626
627 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
628   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
629   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
630   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
631   
632 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
633   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
634   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
635     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
636   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
637   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
638     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
639     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
640       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
641       no longer exists.
642
643 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
644   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
645    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
646    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
647    the class.
648   
649 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
650   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
651     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
652     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
653
654 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
655   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
656   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
657     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
658     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
659     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
660       CloseFile() anymore.
661     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
662       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
663       into File::Pixel_Data.
664
665 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
666   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
667     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
668   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
669     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
670     method:
671     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
672     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
673       method to those classes.
674     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
675       -- Added a ::Print() method.
676       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
677       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
678          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
679
680 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
681   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
682     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
683     doxygen.
684   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
685   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
686     pointlessly wrapped (see
687     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
688   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
689     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
690     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
691     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
692     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
693       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
694            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
695       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
696          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
697
698 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
699   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
700     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
701
702 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
703   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
704     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
705     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
706   * TODO added new entry.
707   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
708     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
709     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
710     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
711       variable names for semantical coherence.
712
713 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
714   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
715   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
716   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
717   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
718   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
719   compilation time jpeg option.
720
721 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
722   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
723     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
724     reproduce at home.
725   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
726   Thanks dcmtk crew !
727
728 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
729   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
730   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
731     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
732   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
733   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
734   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
735   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
736     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
737     from File:: to PixelConvert::.
738
739 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
740   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
741     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
742      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
743      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
744
745 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
746   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
747   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
748   like this:
749     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
750   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
751   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
752   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
753
754 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
755   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
756     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
757     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
758     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
759     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
760       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
761       (for the time being this is better than having them attach to
762        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
763     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
764       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
765     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
766       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
767       gdcmPixelConvert::
768
769 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
770   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
771   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
772     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
773       clean up of RLE related code. 
774   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
775     - src/gdcmRLE.cxx removed
776     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
777     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
778     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
779   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
780     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
781       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
782       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
783
784 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
785   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
786     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
787       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
788       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
789       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
790       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
791       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
792       offsets.
793   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
794     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
795         with the retired Parse7Fe0().
796     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
797     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
798
799 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
800   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
801     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
802     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
803     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
804   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
805     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
806       to return an unused length.
807
808 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
809   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
810     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
811     to use to do simple stuff.
812
813 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
814   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
815     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
816     copying of the file within different directory, configure header file to
817     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
818     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
819
820 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
821   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
822      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
823        with it's binary name).
824      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
825        the Website to be more complete.
826      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
827        doxygenated documentation.
828      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
829        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
830                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
831   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
832   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
833    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
834
835 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
836   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
837    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
838
839 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
840   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
841     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
842     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
843     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
844     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
845   * GDCMHOME clean up:
846     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
847       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
848       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
849   * Autotools clean up:
850     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
851     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
852
853 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
854   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
855   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
856   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
857
858 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
859   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
860     describing TODO entries and used it for new entries.
861   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
862     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
863     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
864   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
865     documentation itself, but the website) moved to html and
866     placed in directory Doc/Website:
867     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
868     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
869     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
870   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
871   * CMakeLists.txt changed accordingly.
872   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
873     DeveloppersPython.html
874   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
875
876 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
877   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
878     of gdcm Web site.
879
880 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
881   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
882     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
883     we can now delete[] it safely 
884   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
885     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
886   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
887
888 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
889   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
890     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
891     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
892     pointed content.
893
894 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
895   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
896   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
897
898 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
899   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
900     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
901     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
902     an example of usage.
903     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
904       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
905     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
906       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
907     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
908     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
909     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
910
911 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
912   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
913     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
914     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
915     in class 
916     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
917       and associated accessors. Doxygenation of the class.
918     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
919       accessors added.
920     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
921       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
922     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
923     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
924
925 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
926   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
927     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
928       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
929            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
930            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
931            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
932            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
933            the same group and element all share the same (group, element)
934            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
935            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
936            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
937            consider the following definition of a TagKey:
938            - let Group, Element be the string representation of the
939              group and element dicom tag members,
940            - let ItemNumber be the string representation of the integer
941              index of the considered item number of a sequence,
942            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
943            the form:
944               /ItemNumber#Group|Element
945            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
946            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
947               Group|Element<SeqTag>
948            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
949            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
950            string e.g.
951                0028|1201
952            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
953            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
954            string e.g.
955                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
956     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
957       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
958       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
959     - src/gdcmDocEntry.cxx:
960       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
961          Key member.
962       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
963     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
964     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
965       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
966       -- now has a new BaseTagKey member.
967       -- STYLE.
968   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
969     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
970     truly belongs.
971     This poses the problem with the semantics of the following lines
972        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
973        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
974        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
975     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
976     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
977     order to get things working the dicom dictionary was altered !
978     Please fix things urgently...
979   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
980     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
981     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
982     set to OW:
983       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
984       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
985       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
986   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
987     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
988   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
989
990 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
991   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
992
993 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
994   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
995     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
996   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
997   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
998
999 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1000   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
1001     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
1002   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
1003     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
1004   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1005     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1006   * TODO updated
1007   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1008     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1009   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1010   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1011     exception_on_error parameter.
1012     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1013     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1014     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1015
1016 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1017   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1018   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1019     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1020   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1021   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1022   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1023     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1024   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1025
1026 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1027   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1028     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1029
1030 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1031   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1032        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1033  
1034 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1035   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
1036         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1037
1038 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1039    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1040    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1041      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1042      is now in static in the gdcmDebug class
1043    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1044    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1045
1046 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1047    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1048      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1049    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1050      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1051      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1052      that displays position and size).
1053    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1054      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1055      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1056      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1057      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1058      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1059      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1060         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
1061      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1062      commiting changes).
1063    * Test/CMakeLists.txt:
1064       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1065       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1066         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1067         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1068    * TODO updated.
1069
1070 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1071    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1072      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1073      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1074      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1075      - removal of typedef duplication.
1076      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1077      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1078    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1079       - printf polluting ctest removed.
1080       - TAB removal for comminting
1081    * Test:
1082      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1083        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
1084        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1085        this test creates them.
1086        Note: we need to validate each reference image, but before that
1087              I'd like to rename them with a more explicit name...
1088      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1089    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
1090      including each header needed).
1091
1092 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1093    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1094      test suite to the Example directory. Are concerned:
1095      - PrintHeader.cxx
1096      - TestDcm2Acr.cxx
1097      - TestFindTags.cxx
1098      - TestWrite.cxx was
1099      - TestWriteSimple.cxx
1100    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1101      image gdcmData/oldACR00001.ima
1102
1103 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1104    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1105      with removal from gdcmData):
1106       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1107       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1108       - US.3405.1.dcm
1109      Added the following because after last cvs update, they cause
1110        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
1111      to segfault:
1112       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1113       - oldACR00001.ima
1114    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1115      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1116      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1117      form of test...
1118    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1119      we don't need to black list the following images anymore:
1120       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1121       - OT-PAL-8-face.dcm
1122       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1123    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1124      fixes and the beautified code ;-)
1125      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1126      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1127      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1128            improve the test suite). The bug could be detected by using
1129            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1130            or by using
1131            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1132            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1133
1134 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1135    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1136          - replace by uggly but working old code :-(
1137    A lot of things should be OK again.
1138    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
1139    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1140    (twice, withing a fortnigh ...)      
1141
1142 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1143    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1144      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1145    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1146      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1147      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1148                    - OT-PAL-8-face.dcm
1149                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1150    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1151      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1152      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1153      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1154      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
1155      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1156      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1157      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1158      image.
1159    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1160      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1161      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1162      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1163    
1164 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1165   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1166   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
1167                           (instead of infinite loop)
1168   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
1169
1170 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1171    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1172
1173 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1174    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1175            when SamplesPerPixel =3
1176          - now Write is no longer confused by 
1177           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1178          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
1179                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1180    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
1181            (in order to split the job that has not to be done 
1182            for gdcmDicomDir)
1183
1184 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1185    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1186      loop on the same image until memory went out. 
1187      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1188    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1189      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1190
1191 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1192    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
1193             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1194             is added a the end, when necessary.
1195             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
1196               now written correctly
1197             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
1198               (even for odd groups) 
1199         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1200                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1201
1202 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1203    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1204    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
1205      coding style).
1206
1207 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1208    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1209      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1210    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1211
1212 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1213    FIX : gdcmDocument.cxx
1214       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1215         code 'beautyfication' :-(
1216       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1217
1218 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1219    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
1220             : to allow user to create his own Sequences
1221    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1222
1223    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1224
1225    - gdcmBinEntry
1226      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1227   
1228    - gdcmDocEntry
1229      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1230      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1231   
1232    - gdcmDocEntrySet
1233      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1234      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1235      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1236      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1237      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
1238      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1239                                             guint16 element,
1240                                             std::string vr     = "unkn",
1241                                             std::string fourth = "unkn",
1242                                             std::string name   = "unkn"); 
1243      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
1244      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1245      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1246      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
1247      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1248      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1249      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1250      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1251   
1252    - gdcmDocument
1253      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1254      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1255      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1256      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1257      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1258                                         FILE *_fp, FileType type);
1259      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1260      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1261      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1262      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1263      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1264      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1265      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1266      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1267                                             guint16 element,
1268                                             std::string vr     = "unkn",
1269                                             std::string fourth = "unkn",
1270                                             std::string name   = "unkn");
1271      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1272      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1273      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1274      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1275                                                                                                                  
1276         - gdcmElementSet
1277           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1278           
1279    - gdcmSeqEntry
1280           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1281  
1282    - gdcmSQItem
1283      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1284      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
1285      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1286      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1287
1288    - gdcmValEntry
1289          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
1290                                   
1291 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1292     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1293       The default constructor invoked by the line
1294          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1295       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1296       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1297       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1298     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1299       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1300       Could anyone explain why ?
1301     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1302       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
1303       code related to gdcmBinEntry).
1304
1305 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1306     * In order to fix memory leaks:
1307      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1308        some delete calls.
1309      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1310      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1311        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1312        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1313        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1314      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1315      - src/gdcmDocument.cxx:
1316        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1317           from dynamic stores.
1318        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1319           was causing memory leaks.
1320      - src/gdcmSQItem.cxx:
1321        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1322           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1323        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1324           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1325           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1326           This avoids SegFaulting.
1327      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1328     * Conclusion:
1329      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1330        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1331        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1332      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1333        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1334      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1335        segfaults).
1336     * Erroneous leading white fix:
1337      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1338        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1339      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1340      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1341     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1342     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1343
1344
1345 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1346     * In order to fix writing of dicom files:
1347      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1348      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1349      - src/gdcmDocument.cxx:
1350        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1351        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1352        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1353           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1354           manner.
1355        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1356           to only declared) and build on top of
1357           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1358        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1359      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1360        for usage in destructor and treatement of promotion in
1361        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1362      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1363       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1364     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1365       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1366       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1367       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1368
1369 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1370     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1371       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1372       learned that:
1373           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1374           soon as possible by globally disabling memory caching.
1375           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1376           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1377       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1378       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1379       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1380     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1381       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1382       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1383       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1384         with 1.
1385       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1386       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1387       understand why the list is empty...).
1388     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1389     * Doc/License.txt added.
1390
1391 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1392     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1393       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1394         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1395         the padding problem.
1396       - general clean up, simplification, and coding style.
1397       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1398     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1399
1400 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
1401    *  gdcmSeqEntry.cxx
1402            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1403                 - fix the display of SQItem ordinal number
1404       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1405                 - remove some useless never written private methods     
1406                 
1407 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1408    * gdcmBinEntry.cxx 
1409       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1410            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1411               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1412                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1413    * dcmDocument.cxx
1414       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1415               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1416            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1417       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1418    * gdcmFile.cxx
1419       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1420    * gdcmSQItem.h
1421       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1422             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1423             \warning : some pb remaining around this number
1424                                 will be solved asap
1425       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1426    * gdcmValEntry.cxx 
1427       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1428
1429 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1430     * Memory leak hunt with the following command:
1431       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1432                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1433       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1434       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1435       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1436           grep "MEMORY LEAK" src/*
1437       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1438       -----
1439           #include <string>
1440           int main() {
1441              std::string name;
1442              char * test = "babo";
1443              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1444                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1445              name.clear();   //// Doesn't help !
1446              return 0;
1447           }
1448       -----
1449           #include <string>
1450           #include <iostream>
1451           int main() {
1452              std::string line;
1453              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1454              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1455                                         //// of 1320 bytes in call to
1456                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1457             return 0;
1458           }
1459       -----
1460
1461
1462 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1463     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1464       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1465         and related, moved away to gdcmDocument.
1466       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1467         the corresponding protected accessors of inherited class
1468         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1469         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1470       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1471       - Clean up of undefined or unused methods.
1472     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1473       account the changes to gdcmHeader.h).
1474     * src/gdcmDocument.h:
1475       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1476         changes to gdcmHeader.h).
1477       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1478         (see changes to gdcmHeader.h).
1479       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1480       - Clean up of undefined or unused methods.
1481     * src/gdcmDocument.cxx:
1482       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1483       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1484       - some std::string properly set to VRKey
1485     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1486       references to gdcmDocument. 
1487     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1488     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1489       cvs repository gdcmData.
1490
1491 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1492     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1493     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1494       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1495     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1496     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1497       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1498     * src/gdcmDocument.cxx: 
1499       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1500         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1501       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1502         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1503         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1504         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1505         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1506               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1507               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1508     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1509     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1510       now taken into account.
1511     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1512       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1513     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1514       on posix.
1515     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1516       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1517     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1518
1519 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1520     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1521       gdcmGlob
1522     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1523     * src/gdcmUtil.h : export methods
1524
1525 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1526     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1527       to right behavior
1528     * Initial addition of automatic python testing
1529     * Initial addition of automatic image comparison
1530
1531 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1532     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1533       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1534
1535 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1536      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1537      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1538      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1539
1540 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1541      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1542        new concepts (and new classes) :
1543        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1544         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1545         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1546        a Sequence is composed of Items.
1547        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1548        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1549        (never taken into account)
1550        Our unability to add a new 'entry' in the header
1551        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1552        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1553        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1554        nothing is finished.
1555        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1556
1557 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1558      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1559      
1560 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1561      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1562        file prefix (SetFilePrefix)
1563
1564 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1565      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1566        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1567        baseline.
1568      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1569        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1570
1571 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1572      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1573        dicom image
1574
1575 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1576      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1577      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1578        between the developper and user version.
1579      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1580      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1581
1582 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1583      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1584        when using cmake.
1585
1586 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1587      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1588                src directory, now generated in the build dir.
1589             2. Tests as mentionned smarter
1590             3. Some clean up
1591             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1592           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1593           where we could set the institution name / patient name...
1594
1595        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1596               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1597                  (this was not true before)
1598
1599 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1600      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1601            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1602      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1603            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1604            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1605      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1606            tree-like structure of a Dicom Header.
1607      * FIX Test code cleaning     
1608            
1609 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1610      * ENH: Adding automatic testing
1611        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1612        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1613        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1614        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1615           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1616           too many projects
1617      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1618      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1619        one file instead of seven + some small cleanup
1620
1621 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1622      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1623      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1624            Header printing. Example given with :
1625            > PrintHeader fileName  2 new
1626           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1627            
1628 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1629      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1630          1. I have added some unsigned where needed
1631          2. Some function parameter not used -> (void)
1632          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1633          4. g++ don't like character '\' in comment
1634          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1635                     this really need to be fixed
1636          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1637          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1638                     this also really need to be fixed
1639          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1640                     remove compression file 
1641                     (as we only do decompression, right ?)     
1642      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1643
1644 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1645      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1646            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1647            defaulted to yspacing
1648            
1649 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1650      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1651      * ENH add parameters :
1652                bool  exception_on_error = false, 
1653                bool  enable_sequences   = false,
1654                bool  ignore_shadow      = false
1655            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1656      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1657            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1658               
1659 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1660      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1661      
1662 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1663      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1664      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1665              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1666              
1667 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1668      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1669          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1670
1671 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1672      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1673        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1674        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1675        in gdcmHeader.
1676      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1677        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1678        already does the job.
1679      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1680        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1681
1682 2004-03-30 Benoit Regrain
1683      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1684        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1685        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1686
1687 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1688      * ENH : Check on file type to be written moved
1689              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1690      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1691              when end-of-list is reached
1692            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1693
1694 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1695      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1696      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1697      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1698        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1699
1700 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1701      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1702        now contains all the gdcmGlobal related code.
1703      * minor coding style and doxygenation changes.
1704
1705 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1706      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1707        now contains all the Debug related code.
1708      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1709      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1710        CreateCleanString) removed.
1711      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1712      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1713      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1714      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1715        src/gdcmDirList.cxx)
1716
1717 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1718      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1719
1720 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1721      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1722            big endian made volumes
1723      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1724            end user to instanciate class gdcmParser
1725           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1726
1727 2004-03-22 Benoit Regrain
1728      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1729      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1730              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1731
1732 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1733      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1734            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1735            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1736            or build from the files held (recursively) in a Directory
1737            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1738            gdcmObject::SetBoundaries() added
1739
1740 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1741      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1742                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1743      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1744            DICOMDIR
1745      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1746            about the name
1747
1748 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1749      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1750                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1751
1752 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1753      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1754            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1755            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1756            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1757            to allow making gdcDicomDir object.
1758      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1759           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1760
1761 2004-02-11 Benoit Regrain
1762      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1763              when using from python
1764
1765 2004-02-10 Benoit Regrain
1766      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1767      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1768      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1769              directory parsing
1770
1771 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1772      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1773              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1774              - class gdcmMeta created
1775      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1776              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1777      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1778
1779 2004-02-05 Benoit Regrain
1780      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1781              header entries
1782      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1783      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1784
1785 2004-02-04 Benoit Regrain
1786      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1787      * FIX : sort the images in the dicom dir
1788      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1789      * ADD : a python demo
1790
1791 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1792      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1793      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1794              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1795              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1796              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1797      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1798            to make full checking easier
1799         
1800 2004-02-04 Benoit Regrain
1801      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1802      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1803
1804 2004-02-03 Benoit Regrain
1805      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1806      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1807      * Bug fix and print add-on
1808
1809 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1810      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1811      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1812      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1813      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1814            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1815         
1816 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1817      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1818              iterator on last
1819              of the last synonym :-(
1820      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1821              for DICOMDIR ;-)
1822      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1823      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1824      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1825            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1826       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1827
1828 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1829      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1830            no longer writes 'Un' on disk
1831      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1832      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1833            the length (for Palette expanded images)
1834            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1835      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1836            (that broke Write). Replaced by UL.
1837            Aware user will reload the field if he 
1838            thinks it's necesssary
1839              
1840 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1841      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1842        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1843        IsReadable() methods.
1844        
1845      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1846       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1847       but so usefull for people that miss them ;-)
1848       
1849      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1850        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1851
1852 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1853      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1854
1855 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1856      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1857              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1858         The TRUE value for this param has to be used 
1859         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1860         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1861      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1862              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1863         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1864         
1865      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1866              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1867              Fixed
1868
1869      * gdcmHeader add the method
1870              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1871         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1872         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1873         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1874
1875 2004-01-26 Benoit Regrain
1876      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1877        in the print and add a third level of print to print them
1878
1879 2004-01-23 Benoit Regrain
1880      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1881      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1882      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1883        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1884
1885 2004-01-22 Benoit Regrain
1886      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1887      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1888
1889 2004-01-19 Benoit Regrain
1890      * Add the use of shadow dictionaries
1891      * bug fix and coding style
1892
1893 2004-01-19 Benoit Regrain
1894      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1895      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1896      * Add the update of header entries using the shadow library
1897
1898 2004-01-19 Benoit Regrain
1899      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1900      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1901        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1902        of dicom dir parsing
1903      * bug fix under python
1904
1905 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1906     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1907     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1908     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1909     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1910
1911 2004-01-15 Benoit Regrain
1912      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1913        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1914        when the gdcmDictSet will be destroyed
1915      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1916        gdcmDictSet
1917
1918 2004-01-15 Benoit Regrain
1919      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1920        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1921        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1922        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1923      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1924
1925 2004-01-14 Benoit Regrain
1926      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1927      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1928      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1929      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1930
1931 2004-01-13 Benoit Regrain
1932      * src/*.[h|cxx] : coding style
1933      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1934
1935 2004-01-13 Benoit Regrain
1936      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1937      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1938        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1939      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1940
1941 2004-01-12 Benoit Regrain
1942      * src/*.h : add comments
1943      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1944      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1945        directly setted in the source code
1946      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1947        gdcmTS and gdcmVR
1948
1949 2004-01-09 Benoit Regrain
1950      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1951      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1952
1953 2004-01-07 Benoit Regrain
1954      * Modification to compile with the distutils.
1955      * Bug fix in code
1956
1957 2003-12-10 Benoit Regrain
1958      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1959        can use a gdcmHeaderHelper to load data
1960      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1961        made in the source code
1962
1963 2003-12-10 Benoit Regrain
1964      * Update Windows projects and .cvsignore files
1965
1966 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1967      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1968            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1969            if he wants to.
1970            gdcmElValSet:Print takes it into account
1971
1972 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1973      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1974      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1975      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1976
1977 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1978       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1979              on the ListTag listElem member,
1980              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1981       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1982              with the tagHt member and the listElem member.
1983              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1984
1985       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1986              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1987                             if bug fixing is necessary), for internal
1988                             use only
1989              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1990                             or to allow Parser going on.
1991              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1992              with a length (not 0000) is found
1993       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1994                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1995                 (to be written)
1996
1997 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1998      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1999      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
2000           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
2001      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
2002
2003 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2004      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2005
2006 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2007      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2008           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2009
2010 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2011      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2012      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2013              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2014              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2015
2016 2003-11-05 Benoit Regrain
2017      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2018                        : Explicit error messages
2019      * in __init__.py  : Related modif
2020
2021 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2022      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2023            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2024            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2025      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2026                     (vtkGdcmReader compliant)           
2027       
2028 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2029      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2030        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2031        
2032 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2033      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
2034            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2035
2036 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2037      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
2038                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2039              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2040              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2041              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2042              such an image :
2043              After gdcmHeader :
2044               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2045               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2046               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2047      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2048              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2049
2050 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2051      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2052              
2053 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2054      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
2055            being coherents dicom files.
2056      
2057 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2058      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2059            from medcon lib !
2060      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
2061      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2062      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2063      * ENH: Add include dir to medcon lib
2064      * FIX: only one function is being exported for now ! 
2065            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2066             
2067 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2068       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2069         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2070           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2071       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2072
2073 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2074       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2075         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2076         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2077       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2078       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2079
2080 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2081       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2082                                                
2083 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2084       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2085       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2086       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2087       
2088 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2089       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2090       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2091       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2092       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2093       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2094       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
2095              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2096         But it fasten debug compilation time.
2097             
2098 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2099       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2100         (they are compressed as 2 planes images, 
2101          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2102
2103 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2104       * Now CheckRead takes into account :
2105          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2106          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2107       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2108        (breaks DicomWorks)
2109
2110 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2111       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
2112              one should remove the '\'
2113         
2114 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2115       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
2116         (wrong lengths in header)
2117         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2118       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2119         (breaks DicomWorks)
2120
2121 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2122       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
2123         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2124
2125 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2126       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2127       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2128
2129 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2130       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2131      
2132 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2133       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2134         (the patch is easy to remove)
2135       * cosmetic changes to avoid warnings
2136       
2137 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2138       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
2139         no need to press 'r' now.
2140    
2141 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2142       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2143         to new Jpeg Lossless decompressor
2144       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2145       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2146       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2147                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
2148 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2149       * general anonymisation in gdcmData
2150       * adding the 'color files' from
2151         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2152       * adding some well knowed bugged-header images
2153       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2154         waiting for their inclusion in Python testsuite
2155
2156 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2157     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2158       no longer seg faults when file is not found
2159
2160 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2161      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
2162        MultiFrame images
2163
2164 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2165      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2166
2167 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2168      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2169         OpenFile takes it into account
2170      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2171      * Missing elements added in dicomV3.dic
2172       (just to be affraid : have a look at
2173        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2174        and do it again next year ;->
2175
2176 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2177      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
2178        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2179        But there are NOT. It's fixed !
2180        
2181 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2182      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2183      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
2184          
2185 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2186      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2187              an ACR-NEMA / DICOM one.
2188      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
2189              is not gdcm Readable
2190      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
2191              is now decoded.
2192         
2193 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2194      * FIX: CMake generate now documentation
2195      * ENH: out of source doc build !
2196      * ENH: Generate both user and dev documentation
2197      * ENH: Should work on windows too
2198      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
2199      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
2200      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2201      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
2202                      
2203 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2204      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2205      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2206      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
2207         window level & window width
2208
2209 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2210      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2211      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2212      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2213      
2214 2003-10-06  Emanuel Ollart
2215      * FIX : compilation process wad broken.
2216              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2217         
2218 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2219      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2220      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2221      
2222 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2223      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2224            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2225                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2226       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2227
2228 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2229       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
2230         to remain compliant with already defined strings, 
2231         like Transfert Syntax UID and others)
2232
2233 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2234       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2235              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2236         
2237 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2238       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2239       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2240
2241 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2242       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2243         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2244               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2245       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2246
2247 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2248       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2249
2250 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2251       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2252         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2253
2254 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2255       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2256          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2257          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2258          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2259           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
2260                                             YBR_RCT files.
2261           (no sample found :-(
2262
2263 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2264       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2265         Two reasons: - clear things
2266                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2267                        suffer anymore VC++ complains
2268
2269 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2270       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2271       * removed leaks
2272
2273 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2274       * The lines are now eigthy characters long.for 
2275         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
2276
2277 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2278       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2279         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2280         previous commis of Malaterre)
2281       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2282         before the last Malaterre's commit.
2283
2284 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2285       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2286         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2287       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2288         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2289
2290 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2291       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2292         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2293         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2294
2295 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2296       * Cosmetic changes:
2297         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2298           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2299           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2300           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2301         - PACKAGER corrected
2302         - DEVELOPPER added.
2303         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2304       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2305
2306 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2307       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2308
2309 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2310       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2311
2312 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2313       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2314
2315 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2316       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2317
2318 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2319       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2320         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2321         heuristics to get informations (look at different places).
2322       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2323         sorting DICOM images based on different strategies.
2324       * modified Makefiles accordingly.
2325
2326 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2327       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2328         when building in debug mode
2329       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2330         src/win32/gdcmdll.dsp
2331       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2332
2333 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2334       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2335             to valgrind.
2336
2337 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2338       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2339       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
2340                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2341       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2342
2343 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2344       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2345         the file
2346       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2347       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2348         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2349       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2350         symbols... future problem ?
2351
2352 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2353       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2354       * modified gdcm.dsw accordingly
2355
2356 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2357       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2358
2359 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2360       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2361         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2362       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2363         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2364         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2365
2366 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2367       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2368
2369 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2370       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2371       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2372       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2373       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2374       * PACKAGER : adding all concerning windows
2375
2376 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2377       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2378         garbage debug code.
2379       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2380       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2381         test suite reported error.
2382       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2383         packaging a new release).
2384       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2385       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2386       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2387         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2388         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2389
2390 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2391       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2392       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2393
2394 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2395       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2396         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2397         is made in an internal list to prevent this problem.
2398         Bug fix when output is empty.
2399         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2400         correction.
2401       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2402
2403 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2404       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2405       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2406         files. Added method to remove all files on the input
2407         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2408         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2409
2410 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2411       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2412         when using make instal.
2413       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2414         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2415
2416 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2417       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2418       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2419
2420 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2421       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2422         linux and WINDOWS !
2423       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2424       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2425
2426 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2427       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2428         addon of the jpeg library)
2429       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2430       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2431       * INSTALL now points to web documentation
2432
2433 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2434       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2435         gdcmUtil.h anymore.
2436       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2437         clean target.
2438       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2439         - to allow compilation with gcc 3.x
2440           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2441           -- small fixes on exceptions.
2442           Note: linking not tested !
2443         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2444           building stage.
2445       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2446         dependent convertion).
2447
2448 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2449       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2450         Changelog):
2451         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2452         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2453           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2454         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2455
2456 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2457       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2458         compile
2459       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2460         (FileName -> Filename)
2461
2462 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2463       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2464         - UpdateProgress method should now be effective
2465         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2466           to volumes),
2467         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2468           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2469           accelerating things).
2470         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2471           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2472           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2473           in the stack (for the caller to notice the problem).
2474
2475 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2476       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2477
2478 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2479       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2480         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2481         under Windows... thanks Windows !)
2482
2483 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2484       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2485         debug stage).
2486       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2487
2488 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2489       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2490
2491 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2492       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2493         called with different flags than the default ones (with automake).
2494         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2495            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2496         and went for warning fixes:
2497         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2498           up from unused variables.
2499         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2500       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2501
2502 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2503       * gdcmPython/gdcm.i:
2504         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2505           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2506           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2507         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2508           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2509           exported to Python a as cvar.
2510       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2511         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2512         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2513         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2514         C++ static methods).
2515       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2516         with the above changes.
2517
2518 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2519       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2520
2521 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2522       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2523         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2524         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2525          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2526          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2527            a wrapper
2528          - Wrapper interface which wrap sources
2529         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2530         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2531       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2532         files for compilation
2533
2534 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2535       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2536         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2537         - vtk/Makefile.am now builds a library
2538         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2539           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2540           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2541           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2542           import library.
2543         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2544           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2545           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2546           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2547           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2548         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2549           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2550         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2551           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2552       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2553       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2554         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2555         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2556         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2557         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2558         collision of various stl members (principally cout...).
2559       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2560         file.
2561       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2562         comply with above changes)
2563
2564 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2565       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2566       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2567         vtk data structure (an image Flip was required).
2568       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2569       * cosmetic changes in documentation.
2570
2571 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2572       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2573         unexisting file is given as argument.
2574       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2575         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2576         containing those images is now available at
2577           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2578         with the name gdcmData.
2579         All the python scripts (including the package initialisation file
2580         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2581         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2582
2583 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2584       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2585         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2586         demo of the usage of this class.
2587         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2588         at configure (or autogen.sh) stage.
2589
2590 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2591       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2592         Notes on valgrind:
2593           - maximum info is obtained with a command of the form:
2594             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2595                      --show-reachable=yes PrintHeader
2596           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2597             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2598             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2599             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2600              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2601       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2602         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2603         Note: some images don't seem to work e.g.
2604             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2605       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2606         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2607         make gdcm more thread friendly.
2608
2609 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2610       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2611           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2612         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2613           gdcmHeader::_dicom_vr.
2614         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2615         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2616           VRHT*.
2617         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2618
2619 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2620       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2621         make install stage.
2622
2623 2003-04-9 JPR
2624       * UpdateGroupLength replaced by new one
2625
2626 2003-04-7 JPR
2627       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2628         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2629
2630 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2631       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2632       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2633       * src:
2634         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2635         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2636           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2637         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2638           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2639           carried the same semantics.
2640           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2641         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2642           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2643         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2644       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2645       * gdcmGetXSize added
2646       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2647       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2648
2649 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2650       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2651         (to avoid double call by end user).
2652       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2653         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2654
2655 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2656       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2657         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2658           the html.users end users oriented documentation and
2659           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2660           oriented documentation.
2661         - README changed accordingly
2662         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2663         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2664           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2665         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2666           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2667           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2668       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2669         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2670       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2671         ill-formed documentation sections.
2672       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2673
2674 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2675       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2676       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2677         un*ces with sh-utils test utility.
2678       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2679       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2680       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2681       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2682       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2683
2684 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2685       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2686       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2687
2688 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2689       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2690       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2691       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2692       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2693         compilation work.
2694       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2695       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2696
2697 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2698       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2699         hence the user doesn't need this explicit call.
2700         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2701           i.e. LoadElements() call removed.
2702       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2703         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2704       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2705         for adding user defined new tags.
2706         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2707         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2708           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2709
2710 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2711       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2712         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2713         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2714         with the autotools, included the python wrappers part.
2715       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2716
2717 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2718       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2719
2720 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2721       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2722         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2723         for usage).
2724       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2725         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2726         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2727       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2728         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2729
2730 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2731       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2732         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2733         value of GDCM_DICT_PATH.
2734       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2735
2736 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2737       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2738       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2739       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2740         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2741         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2742
2743 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2744       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2745         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2746         gdcmHeader.h
2747       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2748         (as opposed to gdcm.h)
2749       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2750       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2751         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2752       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2753
2754 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2755       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2756         bug.
2757
2758 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2759       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2760         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2761         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2762         of hidding away the python related distutils specific files
2763         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2764         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2765         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2766         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2767
2768 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2769       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2770       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2771         among the list of sources.
2772
2773 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2774       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2775       * modifications in MSVC projects
2776
2777 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2778       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2779         looks like we can move back to original usage of exception within
2780         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2781         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2782       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2783         README file for usage added.
2784       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2785         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2786         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2787         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2788       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2789       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2790         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2791           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2792           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2793           instance of class gdcmHeader.
2794         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2795           require no instances at all to be invocated.
2796         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2797           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2798           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2799       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2800         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2801       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2802         the above to be effective.
2803       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2804         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2805       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2806         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2807         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2808         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2809         (for python dectection).
2810       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2811         now avoids publishing the empty entries.
2812
2813 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2814       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2815         ExtraPath reused :-P
2816       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2817
2818 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2819       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2820       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2821       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2822         and links
2823
2824 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2825       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2826         method. Doxygenation.
2827       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2828
2829 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2830       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2831         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2832         when using "python setup.py install".
2833       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2834         reexports the working classes.
2835       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2836         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2837         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2838         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2839         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2840         subdir (see the README file). This problem probably due to
2841         an combination of g++ and dynamic loading.
2842       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2843
2844 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2845       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2846         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2847         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2848         again in a python subdir, but the package itself is now in
2849         python/gdcmPython.
2850       * setup.py was cleaned up:
2851         - pythonIncludePath removed
2852         - python setup.py bdist target is now functional.
2853       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2854         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2855         accordingly.
2856
2857 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2858       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2859       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2860         distutils installer is operational.
2861       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2862           shadow classes (from gdcm.py).
2863         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2864           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2865         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2866
2867 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2868       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2869         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2870         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2871         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2872         dictionary.
2873         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2874           are now in the "???" group.
2875         - python/gdcm.i changed accordingly,
2876         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2877           of the above new functionalities in Python.
2878
2879 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2880       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2881         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2882           were definitively removed.
2883         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2884       * src/gdcmElValSet.cxx:
2885         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2886         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2887         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2888         - Added GetElementByName(string).
2889       * src/gdcmHeader.cxx: added
2890         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2891         - GetPubElValRepByName(string)
2892         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2893         - GetShaElValRepByName(string)
2894         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2895         - GetShaElValRepByName(string)
2896         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2897         - GetElValRepByName(string)
2898         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2899         - GetElValRepByName(string)
2900       * Doc/requirements.txt added.
2901
2902 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2903       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2904       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2905         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2906         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2907         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2908       * python/testSuite.py changed accordingly.
2909
2910 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2911       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2912         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2913              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2914               cannot be exported. [...]
2915               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2916               be exported. [...]
2917               This is caused by a designed limitation that once a template
2918               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2919               exported."
2920         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2921         limitation" of VC++ is a pitfall.
2922         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2923         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2924         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2925         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2926         library.
2927         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2928       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2929          dll under windows !!!!)
2930       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2931       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2932         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2933       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2934         (one) of image(s).
2935       * removed glib references
2936       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2937
2938 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2939       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2940         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2941         the files of the testsuite without using unittest.
2942       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2943       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2944       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2945         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2946
2947 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2948       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2949         values, but limits itself to values which are below a user specified
2950         size (by default 1024 bytes).
2951       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2952         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2953         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2954         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2955       * python/testSuite.py
2956         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2957         - two new examples added.
2958       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2959
2960 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2961       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2962         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2963       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2964       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2965       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2966
2967 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2968       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2969         the vr was also RET.
2970       * python/testSuite.py more tests added.
2971
2972 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2973       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2974       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2975       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2976         7.18 Integer types (see stdint.h)
2977         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2978       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2979         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2980         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2981         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2982         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2983         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2984         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2985         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2986
2987 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2988       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2989         VR files.
2990       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2991
2992 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2993       * Adaptation for porting to VC++:
2994         - src/gdcm.h
2995           o forced to use std namespace (for string to be known)
2996           o all class use __declspec export style on WIN32
2997         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2998           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2999       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
3000         variable GDCM_DICT_PATH.
3001       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
3002
3003 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3004       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3005         to native Python dictionary.
3006       * python/demo/test.py:
3007         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3008         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3009       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3010         PubElVals hashing table.
3011       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3012
3013 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3014       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3015         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3016       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3017       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3018       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3019         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3020       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3021
3022 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3023       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3024         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3025         that we can import de shadow classes without errors].
3026
3027 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3028       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3029       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3030       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3031       * src/Makefile prepared for python wrapping
3032
3033 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3034       * src/gdcmHeader.cxx :
3035         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3036           (see gdcmHeader::LoadElements).
3037         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3038           ReadInt16 and ReadInt32)
3039
3040 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3041       * src/gdcmHeader.cxx :
3042         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3043           method.
3044         - SetLgrElem renamed to SetLength
3045         - GetLgrElem renamed to GetLength
3046         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3047       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3048       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3049         due to IdoDude was cleaned out.
3050
3051 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3052       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3053         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3054         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3055         returning the unecessary skL (skipped length).
3056         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3057         it was redundant with the File position internals (by using
3058         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3059         jajun.
3060       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3061         on the libido specificities which are handled through class
3062         inheritance.
3063       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3064         added.
3065
3066 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3067       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3068         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3069
3070 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3071       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3072
3073 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3074       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3075         and _IdDcmSWAP_LONG.
3076
3077 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3078       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3079         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3080