]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* src/gdcmUtil.cxx : change call to Util::Format to sprintf because of
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2005-06-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2    * src/gdcmUtil.cxx : change call to Util::Format to sprintf because of 
3      lantency with the Util::Format function
4
5 2005-06-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
6    * Adding users file in CVSROOT for mail blaming 
7
8 2005-06-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
9    * Adding potential support for JPEG-LS DICOM files.
10
11 2005-05-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
12    * Adding potential support for mpeg and jpeg2000 through two new lin
13          - JasPer for JPEG2000
14          - libmpeg2 from the MPEG consortium
15          Also adding intial work to use this lib.
16
17 2005-04-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
18    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : update the test printed results and
19      description.
20
21 2005-04-20 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
22    * FIX : Numerical exception on borland (cannot divide by 0, doh !)
23                  But this is a case where we should really signify the user there is
24                                          few chance the serie is really a serie...
25
26 2005-04-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
27    * FIX : on X, the python part is correctly installed. All files are
28      installed in gdcm sub-directory
29
30 2005-04-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
31    * Builder/ : add something to facilitate the RPM creation of gdcm
32
33 2005-04-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
34    * Fix gdcmDirList::IsDirectory. Apparently borland did not like the ending
35          '/'
36    * Also fix compilation on gcc 3.3.5 does not have ios::failure either ...
37
38 2005-04-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
39    * vtk/vtkGdcmWriter fix bug when writing spacing. The Y spacing comes first
40            then the X spacing.
41          * Fix compilation on gcc 2.96 (which does not have ios::failure)
42
43 2005-04-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
44    * src/gdcmDictGroupName.[h|cxx] : add a correlation between a group (number)
45      and it's representation name (for the NIH)
46
47 2005-03-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
48    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : problems of around of double to uint8, when
49      conversion of YBR to RGB pixels. So, now, the conversion is made using 
50      integers only
51
52 2005-03-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
53    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : now use test files (invented file
54      format) to replace 'at-run' dicom files generated by the 
55      TestAllReadCompareDicom test
56
57 2005-03-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
58    * src/gdcmFileHelper.cxx : remove memory leaks and bugs when writing files
59
60 2005-02-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
61    * src/gdcmFileHelper.cxx : JPR bad personal choices fix
62
63 2005-02-11 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
64    * Testing/TestMAkeIcon.cxx : complete the test
65
66 2005-02-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
67    * Testing/TestWriteSimple.cxx, TestSequence.cxx : fix memroy leaks
68
69 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
70    * src/gdcmFileHelper.[h|cxx] : now correctly set the VR of the datas when 
71      writting the file
72
73 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
74    * Test/VTKTestWriteSeq.cxx : add a VTK test to write sequences
75
76 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
77    * Test/ : accelerate tests (it's not very significant accelerations).
78      Remove TestCopyDicom that is redundant with TestCopyRescaleDicom
79
80 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
81    * Testing/TestSequence.cxx : add test for sequences of images... test that
82      we have the same serie or the same study UID
83
84 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
85    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Now string are correctly converted in python
86      string type
87    * src/gdcmDict.h : remove commented code
88    * src/gdcmDocument.cxx : initialize values
89    * src/gdcmFile.cxx : bug fix when reading values
90    * gdcmPython/demo/ : change file names. Remove useless files
91
92 2005-02-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
93    * src/gdcmFile.cxx : remove the default array of initialization.
94      The static array contained pointers to non-static values (comming from
95      strings). To have coherences, when creating files, these values can't be
96      static. So, the array can't be static, too ! To simplify, the array have
97      been replaced by repeted lines to insert values in the File
98
99 2005-02-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
100    * src/gdcmBinEntry.cxx : bug fix for BIG_ENDIAN part when writing the content
101    * gdcmPython/gdcm.i : rename gdcmHeader to gdcmHelper
102
103 2005-02-02 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
104    * FIX SQItem::AddEntry inserts now *in the right place* any Entry
105               (Dicom Element) into the Sequence Item
106
107 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
108    * src/*.cxx : first parss to normalize file organisation
109
110 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
111    * src/gdcmDirList.[h|cxx] : add method to find a directory
112    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : bug fix under Windows
113
114 2005-01-31 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
115    * Finish cleaning up my JPEG mess. Should be ok now.
116    * Getting toward a RLE very similar to JPEG. Every RLE stuff is now self
117           contained within the RLE* class(doh!)
118
119 2005-01-30 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
120    * SerieHeader::SetDirectory() allow recursive exploration of the Directory
121         * SerieHeader::AddFileName() creates as many Coherent Files lists 
122                       (same Serie UID) as it founds different Serie UID 
123                                            amongst the files instead of discarting any file 
124                                                 that doesn't match with the first one he found.
125         * SerieHeader::OrderGdcmFileList has now one parameter : 
126                        the Coherent Files list the user wants to sort
127    * SerieHeader::GetFirstCoherentFileList()  |
128    * SerieHeader::GetLastCoherentFileList()   | allow to parse 
129                        the set of Coherent Files lists 
130    * const SerieHeader::GdcmFileList &GetGdcmFileList() is kept, for backwards
131                        compatibility (it returns the *first* Coherent Files list, 
132                                                 since there was only one before)
133         * Test/TestSerieHeader gets gdcmData as a default root directory                
134                                           
135 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
136    * Remove friend between DocEntry and File classes
137    * Remove friend between PixelReadConverter and RLEFramesInfo, 
138      JPEGFragmentsInfo
139
140 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
141    * src/gdcmFile.cxx, gdcmDocument.cxx : fix the bug on the group|element
142      0002|0000. The value was incorrect.
143
144 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
145    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the gestion of UID
146
147 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
148    * src/gdcmUtil.cxx : compilation fix on Win32
149    * src/gdcmUtil.[h|cxx] : Set the default GDCM UID in a static constant
150      variable, to be easy found. Add methods to change the default UID.
151      Amelioration of the CreateUniqueUID to use the correct default UID.
152    * src/gdcmFile.cxx : correct use of the CreateUniqueUID method to create
153      a new file
154
155 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
156    * Test/TestVR.cxx : fix memory leaks
157
158 2005-01-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
159    * Rewrite the base 256 to base 10 conversion, using string operation only.
160          This allows us to get rid of the problematic 64bits integer type (does not
161          always exist on target platform).
162
163 2005-01-27 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
164    * Add construct and destructor to class gdcm::Debug to close the debug file
165           automatically
166    * Don't let uset to open twice the same file
167    * gdcm has now an official UID prefix,
168           supplied by http://www.medicalconnections.co.uk
169           1.2.826.0.1.3680043.2.1143
170           (Thx to Mathieu for providing URL)
171    * Add a forty-entries private Dicom Dictionary (Philips MR Intera)
172          to be able to perform some more tests
173    * gdcm::ContentEntry : Contructors and Destructor are now protected,
174          in order to be sure no user will try to use them.
175          (at user level, only the children classes are meaningfull)
176
177 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
178    * move RLEInfo & JPEGInfo from Document to File
179
180 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
181    * FIX : remove so many friend between classes
182
183 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
184    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : Bug fix when getting the value
185    * src/gdcmContentEntry.[h|cxx], gdcmValEntry.cxx : amelioration of code
186
187 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
188    In order to avoid missbehaviour :
189    . gdcm::DocEntry is now specialized in
190      - gdcm::SeqEntry (Dicom Sequence) as opposed to :
191      - gdcm::ContentEntry (Dicom entry with a 'content')
192    . gdcm::ContentEntry is specialized in
193      - gdcm::ValEntry (Dicom entry with a std::string representable value, i.e.
194        characters value, or integers)
195      - gdcm::BinEntry (Dicom entry with a non strig representable value
196    (user hasn't any longer to thing about the precedence of his dynamic_casts)
197
198 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
199    * Test/VTKTest*.cxx : bug fix under linux
200
201 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
202    * src/ : rename some methods on Entry (SetXxx, InsertXxx) to have a better
203      use with python. Some methods are moved from Document to ElementSet or
204      DocEntrySet. The equivalent methods to ElementSet have been added to 
205      SQItem and are virtual in DocEntrySet. Methods that may have the same code
206      in SQItem and ElementSet is directly placed in DocEntrySet
207
208 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
209    * Test/VTKTest*.cxx : remove the show variable in each test method because
210      it's useless (the viewer variable replace this variable)
211
212 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
213    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix on potential memory leak
214    * src/gdcmSQItem.cxx : initialize the SQItemNumber value in the constructor
215    * src/gdcmSQItem.[h|cxx], gdcmElementSet.[h|cxx], gdcmDicomDir*.[h|cxx] : 
216      Add ClearXxx methods to remove all the content of the list or map
217    * gdcmDocEntrySet.h : add GetFirst/NextEntry in pure virtual
218
219 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
220    * methods ReplaceOrCreate renamed as Insert
221      (nobody will be any longer confused by 'CreateOrReplace')
222   
223 2005-01-24 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
224    * Grealty simplify the JPEg decompression, no need to differenciate based on 
225      the JPEG possible type (with/without fragment, with/without multiple frame). 
226      Everything is done throught the JPEG IO Suspension mechanism in IJG
227
228 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
229    * Stage 3 of normalization :
230      in order to avoid any missunderstanding while reading method names :
231      - All the methods xxxEntry now deal with dicom Entries
232      - Methods GetEntry splitted into
233         GetEntryValue
234         GetEntryBinArea
235      - Method SetEntry renamed as SetEntryValue
236      - Method SetEntryBinArea let as it was
237
238 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
239     - Add empty nutshell for JPEG-LS (JPG-LS in NOT jpeg 'lossless')
240     - Position correctly the entry points for JPEG2000 and JPEG-LS
241       (Now Fragments info is get from the file, even for JPEG2000 and JPEG-LS)
242
243 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
244    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDict.h : rename AddNewXxx methods to AddXxx.
245    * src/gdcmDict.h : rename GetDictEntry moethod to GetEntry, to be coherent 
246      with other method names
247    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Add the typemaps for the TagName type
248    * Test/TestDicomDirElement.cxx : add new test
249
250 2005-01-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
251    * Finish the CreateUniqueUID stuff. Seems to compiled/runs on every
252      plateforms ITK support. Had some troubles with uint64_t on Win32, go to
253      http://msdn.microsoft.com/library/default.asp?url=/library/en-us/vclang/html/_langref_data_type_ranges.asp
254      for more info. Basically you can not used 'unsigned' __int8 in an ostream.
255      So can't you use __int64 in ostream at all.
256
257 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
258    * bug fix for compilation on MSVC6
259    * gdcmPython/gdcm.i : rename of classes missed
260
261 2005-01-21 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
262    * Stage 2 of names normalization :
263      - A gdcm::Document is now either a gdcm::DicomDir or a gdcm::File
264        (easy to understand ...)
265      - gdcm::FileHelper replaces old class gdcm::File
266
267 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
268    * gdcmDicomDirElement.[h|cxx] : change the AddEntry method. Now, it gets a
269      type and not a string. So, there remove problems on the format of the
270      string.
271
272 2005-01-20 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
273    * Add Example/TestPapyrus.cxx
274      - reads a Papyrus file (gdcm::Header compliant),
275      - gets the pixels of all the images, using low level iterators
276      - writes an multiframes Dicom image.
277    (Just to show it's *possible* to do that)
278     Uses SQItems accessors (we could use it as a 'Test' program, to improve test
279     coverage ...)
280
281 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
282    * src/gdcmDicomDirObject.h : set the FillObject method in protected.
283      Thus, DicomDirXXX are created with a flad that indicates if the created
284      object is empty or not (when not empty, the DicomDirElement is used to
285      fill the object)
286
287 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
288    * src/gdcmDicomDir.cxx : simplify the NewPatient method, like made in
289      gdcm::DicomDirPatient, gdcm::DicomDirStudy, gdcm::DicomDirSerie
290
291 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
292    * src/gdcmSQItem[h|cxx] : rename some methods to have coherent names
293
294 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
295    * src/gdcmDicomDir*.[h|cxx] : rename methods to be logik in their name.
296      Remove all access to the hash-tables or lists in the objects.
297
298 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
299    * src/gdcmDebug.h : remove the Debug test in the gdcmErrorMacro
300    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : rename the Initialise method to Initialize, to
301      be complient with all the gdcm source code
302
303 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
304    * src/gdcmDocEntry.h : DocEntry is now secure. User can't change the
305      DictEntry or the VR.
306
307 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
308    * gdcmPython/ : change GDCM_DATA_PATH to GDCM_DATA_ROOT to be complient with
309      all in gdcm
310
311 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
312    * Test/ : rename VTK tests to have a best name for the tests
313    * gdcmPython/demo/*.py.in : Change the InitTraversal/GetNextEntry use to
314      GetFirstEntry/GetNextEntry use
315
316 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
317    * In SerieHeader::ImagePositionPatientOrdering()
318      // a Dicom 'Serie' may contain scout views
319      // and images may have differents directions.
320      // -> More than one may have the same 'pos'
321      // Sorting has then NO meaning !
322      Thx to Eduardo Davila for reporting bug.
323
324 2005-01-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
325    * Test/ShowDicom.cxx, ShowDicomSeq.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : change the
326      test. Now it's on image content and not on the resulting visualisation...
327      might solve the problem on linux when using the OpenGL drivers
328
329 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
330    * ENH for DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, 
331              DicomDirSerie, DicomDirImage
332              Dict, DictSet classes :
333          -add method GetFirstEntry to replace call to InitTraversal+GetNextEntry
334          -remove InitTraversal method.
335    * UPD Test programs + Example programs
336
337 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
338    * remove useless and never updated keyword \ingroup         
339    * Solve pb when structure (list, map, ...) is empty.
340      Thx to Benoit for reporting bug
341
342 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
343    * Taking into account of 'Transfer Syntax' value
344        (for 'true' Dicom V3 files, the 'ACR-NEMA' heuristics sometimes gives
345          unaccurate result)
346
347 2005-01-17 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
348    * src/gdcmUtil.cxx : bug fix to find the Windows MAC address. Now, there
349      is no memory access violation
350    * gdcmPython/demo : add python demos using VTK
351
352 2005-01-16 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
353     * FIX 'Dictionnary' is now spelt 'Dictionary'
354           'wether' is now spelt 'whether'
355           'archieve' is now spelt 'archive'   ;-)
356
357 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
358     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
359           related methods, in order not to expose internal mechanisms
360         InitTraversal();
361         GetNextEntry();
362     * REM methods that exposed internal mechanisms :
363         DicomDir::GetDicomDirPatients()
364         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
365         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
366         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
367     * UPD Test programs :
368         makeDicomDir.cxx
369         BuildUpDicomDir.cxx
370         TestDicomDir.cxx
371      * UPD Example program
372         PrintDicomDir.cxx
373     * ADD DictSet methods
374         InitTraversal()
375         GetNextEntry()
376
377 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
378    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
379     reason to have to methods, moreover with the second taking the ostream as
380     *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
381
382 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
383    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
384     smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
385     Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
386     code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
387     working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
388     problematic GctestetIPAddress
389
390 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
391    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
392      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
393      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
394      shared libs.
395
396 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
397    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
398      sort DICOM files
399
400 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
401    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack
402          for dealing with BIGENDIAN processors
403          - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
404          When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
405          and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
406          PixelWriteConvertor, and avoid modifying the Pixel Area.
407          Note :
408          Probabely, the same operation will have to be done when we want 
409          to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
410          and we are working on Little Endian Processor
411                   
412 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
413    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
414      table.
415    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
416    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
417      all the dict content.
418    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
419      print
420    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
421
422 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
423    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
424                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
425
426 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
427    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
428    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
429    * gdcmPython/demo/ : add a new test
430
431 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
432    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
433    * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
434    * enhancement of Example/PrintDicomDir
435
436 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
437    * Now, python test might work on systems
438    * Add the PrintDicomDir test
439
440 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
441    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
442            Explicit Big Endian Transfer Syntax files
443           (group and elem not swaped)
444    
445 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
446    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
447            Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
448            begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
449            To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
450            Document::HandleOutOfGroup0002() method 
451     * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
452               (related pb not yet solved)
453
454 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
455    * Bug fix for the python part use
456    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
457
458 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
459    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
460
461 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
462    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
463      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
464      the transfer syntax
465
466 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
467    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
468    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
469        to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
470        and Transfer Syntax is Big Endian
471        We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
472     * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
473     * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
474
475 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
476    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
477    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
478    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
479    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
480    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
481    gdcm::Global would destroy at exit).
482
483 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
484    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
485     environment. static const string in a header file used to be ill
486     initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
487     issue.
488
489 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
490    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
491       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
492       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
493       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
494          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
495
496 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
497    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
498      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
499      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
500      redirected to a file (ofstream).
501    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
502      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
503
504 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
505    * Removal of useless and dangerous methods :
506          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
507          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
508    * Removal of usless methods :
509          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
510    * Commenting out of probabely useless methods :
511          Dict::GetDictEntryNames()
512          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
513          DictSet::GetPubDictEntryNames()
514          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()         
515    * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used    
516    * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version   
517    * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
518            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
519            Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods           
520    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
521            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
522                       Unused till now...           
523    * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
524            should be used to write a method to replace the former
525            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
526
527 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
528    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
529      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
530      data in the DocEntry structure
531
532 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
533    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
534      And now use a static function call instead, with a global variable. i
535      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
536      and easier to use...hopefully
537
538 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
539    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
540
541 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
542    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
543
544 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
545    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
546      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
547
548 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
549    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
550    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
551      a file
552    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
553      when specifying the VR
554    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
555    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
556
557 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
558    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
559           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
560    * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
561    * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
562            in order to allow further VR modification by user
563    * REM : removal of once-called method File::WriteBase   
564            integration of its code in formerly one-line method File::Write
565
566 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
567    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
568      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
569    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
570      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
571      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
572    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
573
574 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
575    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
576      empty Print Method
577    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
578
579 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
580    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
581    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
582    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
583    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
584    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
585
586 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
587    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
588      problems when compiling with the python wrapping
589
590 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
591    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
592      writting in ImplicitVR
593
594 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
595    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
596      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
597      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
598      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
599
600 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
601    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
602      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
603
604 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
605    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
606      Rename Decompressed to Raw
607    * Use the API changes in gdcm::File.
608    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
609      Memory leaks fixed
610
611 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
612    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
613      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
614      of Frames' field
615
616 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
617    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
618    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
619
620 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
621    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
622      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
623      solve it.
624
625 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
626    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
627      DocEntry. Now use methods of the Document !
628
629 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
630    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
631  
632 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
633    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
634    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
635    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
636    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
637      test to 0.0
638    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
639    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
640      containing found sequences
641
642 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
643    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
644      not at all time
645    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
646      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
647               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
648      and tests are now made on good variables
649
650 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
651    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
652    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
653      length
654    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
655    * Add vtkGdcmWriter example and test
656
657 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
658    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
659    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
660    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
661      SetValue
662    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
663    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
664
665 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
666    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
667    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
668
669 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
670    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
671      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
672      file isn't readable. 
673
674 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
675    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
676    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
677    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
678    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
679      method that is redondant with AddEntry.
680    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
681      SQItem
682
683 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
684    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
685    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
686    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
687
688 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
689    * Huge cleanup:
690      - Remove printf / sprintf
691      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
692      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
693        source
694      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
695        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
696      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
697        (plus it is not up to date)
698      - remove 'using namespace std' this is BAD !
699
700 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
701    * Remove memory leaks on the DicomDir
702    * Remove some useless data in DicomDirObject
703    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
704
705 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
706    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
707
708 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
709    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
710      future, with convertion)
711    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
712      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
713      from the output of the class
714
715 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
716    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
717
718 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
719    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
720      and vtkErrorMacro use.
721    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
722
723 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
724    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
725      file name in input
726    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
727    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
728      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
729      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
730      immediately after thee instruction.
731    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
732      file has been opened : the test must be made on the content of the 
733      pointer and not directly on the pointer !
734      Code formatting
735
736 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
737    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
738      the python part recompiles
739
740 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
741    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
742      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
743      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
744      all linux)
745
746 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
747    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
748      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
749      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
750      screen resolution, it's produce errors).
751      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
752    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
753    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
754      under windows at compilation
755    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
756      for grayscale images
757    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
758
759 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
760    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
761    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
762      tests on the image size X, Y, Z
763
764 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
765    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
766    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
767      between the class name and the file name
768
769 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
770    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
771      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
772      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
773      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
774      this variable content.
775
776 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
777    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
778      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
779      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
780      DocEntryArchive
781    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
782      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
783      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
784    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
785      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
786
787 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
788    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
789
790 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
791    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
792    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
793      the header.
794    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
795      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
796      write
797    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
798      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
799      is now on RGB data (as before my last commit
800    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
801
802 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
803    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
804      Add a print information of the type of the entry
805    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
806      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
807    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
808      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
809    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
810      any.
811    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
812
813 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
814    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
815      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
816      opened or not.
817
818 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
819    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
820      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
821    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
822      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
823      DocEntryArchive
824    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
825      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
826    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
827      - test the pixels written
828      - add test points to quickly find where is the error
829      - can set a file name input and output in arguments
830    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
831      amelioration of the test output
832
833 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
834    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
835      all replaced DocEntry's
836    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
837      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
838      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
839      header initial state.
840
841 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
842    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
843
844 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
845    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
846      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
847      then, it musn't change in the time.
848    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
849      header correctly. At this time, the change is only made for the first
850      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
851      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
852      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
853      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
854    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
855    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
856      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
857      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
858
859 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
860    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
861    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
862
863 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
864    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
865      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
866      is copied).
867    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
868      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
869    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
870
871 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
872    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
873      Two problems appear when doing it :
874       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
875         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
876         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
877         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
878         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
879         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
880         the gdcmBinEntry.
881       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
882         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
883         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
884         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
885         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
886    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
887
888 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
889    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
890    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
891      squeeze method
892
893 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
894    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
895    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
896      after it have been deleted
897
898 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
899    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
900    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
901    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
902      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
903      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
904
905 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
906     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
907     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
908     3. Use const ref when possible
909     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
910     5. A few more comments
911     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
912
913 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
914   * ENH: Slightly bigger patch:
915     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
916     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
917     3. File was not close properly in gdcmDict
918     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
919     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
920     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
921     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
922     8. Do not repeat virtual in subclasses
923     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
924
925 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
926   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
927     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
928     of a null character as defined by standard
929   
930 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
931   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
932     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
933
934 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
935   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
936   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
937     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
938
939 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
940   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
941     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
942     a verbose message is generated.
943     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
944     correctly close is a call to CloseFile.
945     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
946   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
947     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
948     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
949     header. A verbose is generated if these two size mismatch
950
951 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
952   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
953     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
954     break under windows (with msvc6 compilation).
955
956 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
957   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
958     compiling with MSVC6)
959
960 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
961   * Bugs fix for the Windows build with VC6
962   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
963     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
964     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
965     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
966   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
967     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
968     gdcm.i file)
969   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
970     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
971     std::cerr of vtk.
972
973 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
974   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
975   * gdcmPython/gdcm.i:
976     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
977     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
978       NOT need to be wrapped anymore.
979   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
980     DicomDir::Method) new example added.
981
982 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
983   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
984     A DicomString can contain as many \0 as they want
985     and it is *always* of even length.
986     We only support odd length for very rare case. 
987     And in the near future this should be removed.
988
989 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
990   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
991     little endian. This should -heopfully- fix some tests
992
993 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
994   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
995     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
996     the one comiled into lib
997
998 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
999   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
1000     This should definitely solve any leak problem, and we should be
1001     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
1002
1003 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1004   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
1005   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
1006   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
1007   
1008 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1009   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
1010   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
1011     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
1012   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
1013   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
1014     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
1015     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
1016       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
1017       no longer exists.
1018
1019 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1020   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
1021    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
1022    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
1023    the class.
1024   
1025 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1026   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
1027     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
1028     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
1029
1030 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1031   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
1032   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
1033     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
1034     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
1035     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
1036       CloseFile() anymore.
1037     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
1038       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
1039       into File::Pixel_Data.
1040
1041 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1042   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
1043     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
1044   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
1045     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
1046     method:
1047     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
1048     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
1049       method to those classes.
1050     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
1051       -- Added a ::Print() method.
1052       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
1053       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
1054          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
1055
1056 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1057   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
1058     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
1059     doxygen.
1060   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
1061   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
1062     pointlessly wrapped (see
1063     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
1064   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
1065     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
1066     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
1067     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
1068     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1069       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
1070            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
1071       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
1072          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
1073
1074 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1075   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
1076     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
1077
1078 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1079   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
1080     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
1081     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
1082   * TODO added new entry.
1083   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
1084     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1085     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
1086     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
1087       variable names for semantical coherence.
1088
1089 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1090   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
1091   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
1092   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
1093   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
1094   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
1095   compilation time jpeg option.
1096
1097 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1098   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
1099     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
1100     reproduce at home.
1101   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
1102   Thanks dcmtk crew !
1103
1104 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1105   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
1106   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
1107     matters, as stated in warning note at beginning of %include section).
1108   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
1109   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
1110   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
1111   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
1112     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
1113     from File:: to PixelConvert::.
1114
1115 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1116   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
1117     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1118      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
1119      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
1120
1121 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1122   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
1123   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
1124   like this:
1125     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
1126   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
1127   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
1128   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
1129
1130 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1131   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
1132     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
1133     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
1134     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
1135     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
1136       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
1137       (for the time being this is better than having them attach to
1138        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
1139     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
1140       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
1141     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
1142       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
1143       gdcmPixelConvert::
1144
1145 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1146   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
1147   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
1148     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
1149       clean up of RLE related code. 
1150   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
1151     - src/gdcmRLE.cxx removed
1152     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
1153     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
1154     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
1155   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
1156     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
1157       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
1158       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
1159
1160 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1161   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
1162     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
1163       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
1164       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
1165       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
1166       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
1167       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
1168       offsets.
1169   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
1170     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
1171         with the retired Parse7Fe0().
1172     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
1173     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
1174
1175 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1176   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
1177     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
1178     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
1179     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
1180   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
1181     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
1182       to return an unused length.
1183
1184 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1185   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
1186     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
1187     to use to do simple stuff.
1188
1189 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1190   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
1191     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
1192     copying of the file within different directory, configure header file to
1193     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
1194     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
1195
1196 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1197   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
1198      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
1199        with it's binary name).
1200      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
1201        the Website to be more complete.
1202      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
1203        doxygenated documentation.
1204      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
1205        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
1206                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
1207   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
1208   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
1209    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1210
1211 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1212   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
1213    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1214
1215 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1216   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
1217     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
1218     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
1219     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
1220     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
1221   * GDCMHOME clean up:
1222     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
1223       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
1224       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
1225   * Autotools clean up:
1226     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
1227     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
1228
1229 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1230   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
1231   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
1232   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
1233
1234 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1235   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
1236     describing TODO entries and used it for new entries.
1237   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
1238     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
1239     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
1240   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
1241     documentation itself, but the website) moved to html and
1242     placed in directory Doc/Website:
1243     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
1244     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
1245     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
1246   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
1247   * CMakeLists.txt changed accordingly.
1248   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
1249     DeveloppersPython.html
1250   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
1251
1252 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1253   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
1254     of gdcm Web site.
1255
1256 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
1257   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
1258     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
1259     we can now delete[] it safely 
1260   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
1261     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
1262   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
1263
1264 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1265   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
1266     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
1267     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
1268     pointed content.
1269
1270 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1271   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
1272   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
1273
1274 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1275   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
1276     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
1277     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
1278     an example of usage.
1279     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
1280       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
1281     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
1282       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
1283     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
1284     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
1285     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
1286
1287 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1288   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
1289     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
1290     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
1291     in class 
1292     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
1293       and associated accessors. Doxygenation of the class.
1294     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
1295       accessors added.
1296     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
1297       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
1298     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
1299     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
1300
1301 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1302   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
1303     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
1304       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
1305            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
1306            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
1307            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
1308            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
1309            the same group and element all share the same (group, element)
1310            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
1311            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
1312            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
1313            consider the following definition of a TagKey:
1314            - let Group, Element be the string representation of the
1315              group and element dicom tag members,
1316            - let ItemNumber be the string representation of the integer
1317              index of the considered item number of a sequence,
1318            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
1319            the form:
1320               /ItemNumber#Group|Element
1321            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
1322            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
1323               Group|Element<SeqTag>
1324            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
1325            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
1326            string e.g.
1327                0028|1201
1328            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
1329            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
1330            string e.g.
1331                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
1332     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
1333       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
1334       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
1335     - src/gdcmDocEntry.cxx:
1336       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
1337          Key member.
1338       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
1339     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
1340     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
1341       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
1342       -- now has a new BaseTagKey member.
1343       -- STYLE.
1344   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
1345     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
1346     truly belongs.
1347     This poses the problem with the semantics of the following lines
1348        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
1349        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
1350        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
1351     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
1352     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
1353     order to get things working the dicom dictionary was altered !
1354     Please fix things urgently...
1355   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
1356     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
1357     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
1358     set to OW:
1359       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
1360       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
1361       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
1362   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
1363     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
1364   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
1365
1366 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1367   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
1368
1369 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1370   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
1371     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
1372   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
1373   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
1374
1375 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1376   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
1377     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
1378   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
1379     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
1380   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1381     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1382   * TODO updated
1383   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1384     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1385   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1386   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1387     exception_on_error parameter.
1388     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1389     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1390     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1391
1392 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1393   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1394   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1395     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1396   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1397   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1398   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1399     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1400   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1401
1402 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1403   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1404     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1405
1406 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1407   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1408        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1409  
1410 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1411   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
1412         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1413
1414 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1415    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1416    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1417      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1418      is now in static in the gdcmDebug class
1419    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1420    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1421
1422 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1423    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1424      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1425    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1426      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1427      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1428      that displays position and size).
1429    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1430      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1431      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1432      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1433      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1434      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1435      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1436         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
1437      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1438      commiting changes).
1439    * Test/CMakeLists.txt:
1440       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1441       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1442         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1443         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1444    * TODO updated.
1445
1446 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1447    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1448      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1449      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1450      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1451      - removal of typedef duplication.
1452      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1453      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1454    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1455       - printf polluting ctest removed.
1456       - TAB removal for comminting
1457    * Test:
1458      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1459        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
1460        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1461        this test creates them.
1462        Note: we need to validate each reference image, but before that
1463              I'd like to rename them with a more explicit name...
1464      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1465    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
1466      including each header needed).
1467
1468 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1469    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1470      test suite to the Example directory. Are concerned:
1471      - PrintHeader.cxx
1472      - TestDcm2Acr.cxx
1473      - TestFindTags.cxx
1474      - TestWrite.cxx was
1475      - TestWriteSimple.cxx
1476    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1477      image gdcmData/oldACR00001.ima
1478
1479 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1480    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1481      with removal from gdcmData):
1482       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1483       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1484       - US.3405.1.dcm
1485      Added the following because after last cvs update, they cause
1486        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
1487      to segfault:
1488       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1489       - oldACR00001.ima
1490    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1491      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1492      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1493      form of test...
1494    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1495      we don't need to black list the following images anymore:
1496       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1497       - OT-PAL-8-face.dcm
1498       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1499    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1500      fixes and the beautified code ;-)
1501      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1502      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1503      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1504            improve the test suite). The bug could be detected by using
1505            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1506            or by using
1507            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1508            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1509
1510 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1511    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1512          - replace by uggly but working old code :-(
1513    A lot of things should be OK again.
1514    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
1515    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1516    (twice, withing a fortnigh ...)    
1517
1518 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1519    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1520      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1521    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1522      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1523      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1524                    - OT-PAL-8-face.dcm
1525                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1526    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1527      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1528      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1529      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1530      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
1531      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1532      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1533      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1534      image.
1535    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1536      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1537      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1538      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1539    
1540 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1541   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1542   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
1543                           (instead of infinite loop)
1544   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
1545
1546 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1547    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1548
1549 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1550    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1551            when SamplesPerPixel =3
1552          - now Write is no longer confused by 
1553           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1554          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
1555                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1556    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
1557            (in order to split the job that has not to be done 
1558            for gdcmDicomDir)
1559
1560 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1561    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1562      loop on the same image until memory went out. 
1563      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1564    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1565      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1566
1567 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1568    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
1569             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1570             is added a the end, when necessary.
1571             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
1572               now written correctly
1573             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
1574               (even for odd groups) 
1575         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1576                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1577
1578 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1579    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1580    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
1581      coding style).
1582
1583 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1584    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1585      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1586    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1587
1588 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1589    FIX : gdcmDocument.cxx
1590       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1591         code 'beautyfication' :-(
1592       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1593
1594 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1595    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
1596             : to allow user to create his own Sequences
1597    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1598
1599    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1600
1601    - gdcmBinEntry
1602      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1603   
1604    - gdcmDocEntry
1605      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1606      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1607   
1608    - gdcmDocEntrySet
1609      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1610      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1611      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1612      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1613      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);            
1614      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1615                                             guint16 element,
1616                                             std::string vr     = "unkn",
1617                                             std::string fourth = "unkn",
1618                                             std::string name   = "unkn"); 
1619      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
1620      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1621      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1622      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
1623      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1624      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1625      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1626      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1627   
1628    - gdcmDocument
1629      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1630      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1631      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1632      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1633      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1634                                         FILE *_fp, FileType type);
1635      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1636      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1637      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1638      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1639      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1640      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1641      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1642      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1643                                             guint16 element,
1644                                             std::string vr     = "unkn",
1645                                             std::string fourth = "unkn",
1646                                             std::string name   = "unkn");
1647      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1648      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1649      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1650      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1651                                              
1652    - gdcmElementSet
1653      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1654      
1655    - gdcmSeqEntry
1656      ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1657  
1658    - gdcmSQItem
1659      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1660      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);         
1661      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1662      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1663
1664    - gdcmValEntry
1665     ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
1666               
1667 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1668     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1669       The default constructor invoked by the line
1670          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1671       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1672       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1673       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1674     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1675       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1676       Could anyone explain why ?
1677     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1678       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
1679       code related to gdcmBinEntry).
1680
1681 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1682     * In order to fix memory leaks:
1683      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1684        some delete calls.
1685      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1686      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1687        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1688        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1689        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1690      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1691      - src/gdcmDocument.cxx:
1692        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1693           from dynamic stores.
1694        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1695           was causing memory leaks.
1696      - src/gdcmSQItem.cxx:
1697        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1698           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1699        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1700           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1701           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1702           This avoids SegFaulting.
1703      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1704     * Conclusion:
1705      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1706        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1707        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1708      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1709        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1710      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1711        segfaults).
1712     * Erroneous leading white fix:
1713      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1714        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1715      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1716      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1717     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1718     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1719
1720
1721 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1722     * In order to fix writing of dicom files:
1723      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1724      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1725      - src/gdcmDocument.cxx:
1726        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1727        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1728        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1729           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1730           manner.
1731        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1732           to only declared) and build on top of
1733           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1734        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1735      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1736        for usage in destructor and treatement of promotion in
1737        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1738      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1739       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1740     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1741       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1742       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1743       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1744
1745 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1746     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1747       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1748       learned that:
1749           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1750           soon as possible by globally disabling memory caching.
1751           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1752           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1753       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1754       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1755       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1756     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1757       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1758       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1759       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1760         with 1.
1761       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1762       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1763       understand why the list is empty...).
1764     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1765     * Doc/License.txt added.
1766
1767 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1768     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1769       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1770         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1771         the padding problem.
1772       - general clean up, simplification, and coding style.
1773       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1774     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1775
1776 2004-06-14 Jean-Pierre Roux      
1777    *  gdcmSeqEntry.cxx
1778       - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1779       - fix the display of SQItem ordinal number
1780       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1781       - remove some useless never written private methods   
1782       
1783 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1784    * gdcmBinEntry.cxx 
1785       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1786       - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1787          a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1788          a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1789    * dcmDocument.cxx
1790       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1791          according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1792       - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1793       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1794    * gdcmFile.cxx
1795       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1796    * gdcmSQItem.h
1797       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1798             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1799             \warning : some pb remaining around this number
1800             will be solved asap
1801       - AddEntry now takes the Item Number as a param    
1802    * gdcmValEntry.cxx 
1803       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param   
1804
1805 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1806     * Memory leak hunt with the following command:
1807       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1808                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1809       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1810       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1811       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1812           grep "MEMORY LEAK" src/*
1813       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1814       -----
1815           #include <string>
1816           int main() {
1817              std::string name;
1818              char * test = "babo";
1819              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1820                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1821              name.clear();   //// Doesn't help !
1822              return 0;
1823           }
1824       -----
1825           #include <string>
1826           #include <iostream>
1827           int main() {
1828              std::string line;
1829              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1830              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1831                                         //// of 1320 bytes in call to
1832                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1833             return 0;
1834           }
1835       -----
1836
1837
1838 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1839     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1840       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1841         and related, moved away to gdcmDocument.
1842       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1843         the corresponding protected accessors of inherited class
1844         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1845         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1846       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1847       - Clean up of undefined or unused methods.
1848     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1849       account the changes to gdcmHeader.h).
1850     * src/gdcmDocument.h:
1851       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1852         changes to gdcmHeader.h).
1853       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1854         (see changes to gdcmHeader.h).
1855       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1856       - Clean up of undefined or unused methods.
1857     * src/gdcmDocument.cxx:
1858       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1859       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1860       - some std::string properly set to VRKey
1861     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1862       references to gdcmDocument. 
1863     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1864     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1865       cvs repository gdcmData.
1866
1867 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1868     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1869     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1870       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1871     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1872     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1873       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1874     * src/gdcmDocument.cxx: 
1875       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1876         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1877       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1878         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1879         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1880         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1881         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1882               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1883               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1884     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1885     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1886       now taken into account.
1887     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1888       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1889     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1890       on posix.
1891     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1892       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1893     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1894
1895 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1896     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1897       gdcmGlob
1898     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1899     * src/gdcmUtil.h : export methods
1900
1901 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1902     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1903       to right behavior
1904     * Initial addition of automatic python testing
1905     * Initial addition of automatic image comparison
1906
1907 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1908     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1909       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1910
1911 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1912      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1913      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1914      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1915
1916 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1917      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1918        new concepts (and new classes) :
1919        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1920         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1921         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1922        a Sequence is composed of Items.
1923        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1924        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1925        (never taken into account)
1926        Our unability to add a new 'entry' in the header
1927        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1928        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1929        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1930        nothing is finished.
1931        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1932
1933 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1934      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1935      
1936 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1937      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1938        file prefix (SetFilePrefix)
1939
1940 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1941      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1942        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1943        baseline.
1944      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1945        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1946
1947 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1948      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1949        dicom image
1950
1951 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1952      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1953      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1954        between the developper and user version.
1955      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1956      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1957
1958 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1959      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1960        when using cmake.
1961
1962 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1963      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1964                src directory, now generated in the build dir.
1965             2. Tests as mentionned smarter
1966             3. Some clean up
1967             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1968           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1969           where we could set the institution name / patient name...
1970
1971        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1972               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1973                  (this was not true before)
1974
1975 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1976      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1977            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1978      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1979            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1980       Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1981      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1982            tree-like structure of a Dicom Header.
1983      * FIX Test code cleaning     
1984            
1985 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1986      * ENH: Adding automatic testing
1987        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1988        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1989        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1990        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1991           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1992           too many projects
1993      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1994      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1995        one file instead of seven + some small cleanup
1996
1997 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1998      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1999      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
2000            Header printing. Example given with :
2001       > PrintHeader fileName  2 new
2002           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
2003       
2004 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2005      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
2006          1. I have added some unsigned where needed
2007          2. Some function parameter not used -> (void)
2008          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
2009          4. g++ don't like character '\' in comment
2010          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
2011                     this really need to be fixed
2012          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
2013          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
2014                     this also really need to be fixed
2015          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
2016                     remove compression file 
2017                     (as we only do decompression, right ?)     
2018      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
2019
2020 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
2021      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
2022            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
2023            defaulted to yspacing
2024       
2025 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
2026      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
2027      * ENH add parameters :
2028                bool  exception_on_error = false, 
2029                bool  enable_sequences   = false,
2030           bool  ignore_shadow      = false
2031            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
2032      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
2033            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
2034          
2035 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
2036      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
2037      
2038 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
2039      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
2040      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
2041              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
2042         
2043 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
2044      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
2045          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
2046
2047 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2048      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
2049        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
2050        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
2051        in gdcmHeader.
2052      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
2053        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
2054        already does the job.
2055      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
2056        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
2057
2058 2004-03-30 Benoit Regrain
2059      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
2060        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
2061        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
2062
2063 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
2064      * ENH : Check on file type to be written moved
2065              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
2066      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
2067              when end-of-list is reached
2068       : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
2069
2070 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2071      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
2072      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
2073      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
2074        equivalent to ExplicitVR in existing code).
2075
2076 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2077      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
2078        now contains all the gdcmGlobal related code.
2079      * minor coding style and doxygenation changes.
2080
2081 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2082      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
2083        now contains all the Debug related code.
2084      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
2085      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
2086        CreateCleanString) removed.
2087      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
2088      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
2089      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
2090      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
2091        src/gdcmDirList.cxx)
2092
2093 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
2094      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
2095
2096 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
2097      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
2098            big endian made volumes
2099      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
2100            end user to instanciate class gdcmParser
2101           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
2102
2103 2004-03-22 Benoit Regrain
2104      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
2105      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
2106              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
2107
2108 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
2109      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
2110            an already existing DICOMDIR file is consistent with
2111            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
2112            or build from the files held (recursively) in a Directory
2113            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
2114            gdcmObject::SetBoundaries() added
2115
2116 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
2117      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
2118                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
2119      * FIX now file names and directory name are written properly in the
2120            DICOMDIR
2121      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
2122            about the name
2123
2124 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2125      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
2126                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
2127
2128 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
2129      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
2130            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
2131            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
2132            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
2133       to allow making gdcDicomDir object.
2134      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
2135           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
2136
2137 2004-02-11 Benoit Regrain
2138      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
2139              when using from python
2140              
2141 2004-02-10 Benoit Regrain
2142      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
2143      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
2144      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
2145              directory parsing
2146
2147 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
2148      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
2149              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
2150              - class gdcmMeta created
2151      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
2152              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
2153      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
2154
2155 2004-02-05 Benoit Regrain
2156      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
2157              header entries
2158      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
2159      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
2160
2161 2004-02-04 Benoit Regrain
2162      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
2163      * FIX : sort the images in the dicom dir
2164      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
2165      * ADD : a python demo
2166
2167 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
2168      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
2169      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
2170              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
2171              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
2172              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
2173      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
2174            to make full checking easier
2175         
2176 2004-02-04 Benoit Regrain
2177      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
2178      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
2179
2180 2004-02-03 Benoit Regrain
2181      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
2182      * gdcmDicomDir : add the load of directory
2183      * Bug fix and print add-on
2184
2185 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
2186      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
2187      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
2188      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
2189      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
2190            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
2191         
2192 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
2193      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
2194              iterator on last
2195              of the last synonym :-(
2196      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
2197              for DICOMDIR ;-)
2198      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
2199      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
2200      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
2201            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
2202       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
2203
2204 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
2205      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
2206            no longer writes 'Un' on disk
2207      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
2208      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
2209            the length (for Palette expanded images)
2210            and Raw Length (non expanded image + Palette)
2211      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
2212            (that broke Write). Replaced by UL.
2213            Aware user will reload the field if he 
2214            thinks it's necesssary
2215              
2216 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
2217      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
2218        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
2219        IsReadable() methods.
2220        
2221      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
2222       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
2223       but so usefull for people that miss them ;-)
2224       
2225      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
2226        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
2227
2228 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
2229      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
2230
2231 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
2232      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
2233              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
2234         The TRUE value for this param has to be used 
2235         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
2236         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
2237      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
2238              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
2239         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
2240         
2241      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
2242              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
2243              Fixed
2244
2245      * gdcmHeader add the method
2246              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
2247         to get *all* the Header Entries with the same tag.
2248         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
2249         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
2250
2251 2004-01-26 Benoit Regrain
2252      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
2253        in the print and add a third level of print to print them
2254
2255 2004-01-23 Benoit Regrain
2256      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
2257      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
2258      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
2259        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
2260
2261 2004-01-22 Benoit Regrain
2262      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
2263      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
2264
2265 2004-01-19 Benoit Regrain
2266      * Add the use of shadow dictionaries
2267      * bug fix and coding style
2268
2269 2004-01-19 Benoit Regrain
2270      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
2271      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
2272      * Add the update of header entries using the shadow library
2273
2274 2004-01-19 Benoit Regrain
2275      * removal of file gdcmHeader2.cxx
2276      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
2277        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
2278        of dicom dir parsing
2279      * bug fix under python
2280
2281 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
2282     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
2283     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
2284     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
2285     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
2286
2287 2004-01-15 Benoit Regrain
2288      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
2289        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
2290        when the gdcmDictSet will be destroyed
2291      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
2292        gdcmDictSet
2293
2294 2004-01-15 Benoit Regrain
2295      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
2296        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
2297        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
2298        some memory and vtk seems to have some problems with that.
2299      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
2300
2301 2004-01-14 Benoit Regrain
2302      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
2303      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
2304      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
2305      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
2306
2307 2004-01-13 Benoit Regrain
2308      * src/*.[h|cxx] : coding style
2309      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
2310
2311 2004-01-13 Benoit Regrain
2312      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
2313      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
2314        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
2315      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
2316
2317 2004-01-12 Benoit Regrain
2318      * src/*.h : add comments
2319      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
2320      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
2321        directly setted in the source code
2322      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
2323        gdcmTS and gdcmVR
2324
2325 2004-01-09 Benoit Regrain
2326      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
2327      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
2328
2329 2004-01-07 Benoit Regrain
2330      * Modification to compile with the distutils.
2331      * Bug fix in code
2332
2333 2003-12-10 Benoit Regrain
2334      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
2335        can use a gdcmHeaderHelper to load data
2336      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
2337        made in the source code
2338
2339 2003-12-10 Benoit Regrain
2340      * Update Windows projects and .cvsignore files
2341
2342 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
2343      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
2344            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
2345            if he wants to.
2346            gdcmElValSet:Print takes it into account
2347
2348 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2349      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
2350      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
2351      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
2352
2353 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
2354       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
2355              on the ListTag listElem member,
2356              not longer on the TagElValueHT tagHt member
2357       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
2358              with the tagHt member and the listElem member.
2359         (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
2360
2361       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
2362              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
2363                        if bug fixing is necessary), for internal
2364              use only
2365         UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
2366                        or to allow Parser going on.
2367         Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
2368         with a length (not 0000) is found
2369       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
2370            because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
2371       (to be written)
2372
2373 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
2374      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
2375      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
2376           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
2377      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
2378
2379 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2380      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2381
2382 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2383      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2384           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2385
2386 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2387      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2388      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2389              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2390              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2391
2392 2003-11-05 Benoit Regrain
2393      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2394                        : Explicit error messages
2395      * in __init__.py  : Related modif
2396
2397 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2398      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2399            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2400            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2401      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2402                     (vtkGdcmReader compliant)           
2403       
2404 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2405      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2406        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2407        
2408 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2409      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
2410            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2411
2412 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2413      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
2414                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2415              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2416              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2417              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2418              such an image :
2419              After gdcmHeader :
2420               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2421               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2422               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2423      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2424              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2425
2426 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2427      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2428              
2429 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2430      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
2431       being coherents dicom files.
2432      
2433 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2434      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2435            from medcon lib !
2436      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
2437      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2438      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2439      * ENH: Add include dir to medcon lib
2440      * FIX: only one function is being exported for now ! 
2441            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2442             
2443 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2444       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2445         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2446           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2447       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2448
2449 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2450       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2451         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2452         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2453       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2454       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2455
2456 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2457       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2458                                                
2459 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2460       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2461       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2462       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2463       
2464 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2465       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2466       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2467       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2468       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2469       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2470       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
2471              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2472         But it fasten debug compilation time.
2473             
2474 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2475       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2476         (they are compressed as 2 planes images, 
2477          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2478
2479 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2480       * Now CheckRead takes into account :
2481          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2482          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2483       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2484        (breaks DicomWorks)
2485
2486 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2487       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
2488              one should remove the '\'
2489         
2490 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2491       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
2492         (wrong lengths in header)
2493         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2494       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2495         (breaks DicomWorks)
2496
2497 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2498       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
2499         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2500
2501 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2502       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2503       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2504
2505 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2506       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2507      
2508 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2509       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2510         (the patch is easy to remove)
2511       * cosmetic changes to avoid warnings
2512       
2513 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2514       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
2515         no need to press 'r' now.
2516    
2517 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2518       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2519         to new Jpeg Lossless decompressor
2520       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2521       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2522       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2523                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
2524 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2525       * general anonymisation in gdcmData
2526       * adding the 'color files' from
2527         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2528       * adding some well knowed bugged-header images
2529       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2530         waiting for their inclusion in Python testsuite
2531
2532 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2533     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2534       no longer seg faults when file is not found
2535
2536 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2537      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
2538        MultiFrame images
2539
2540 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2541      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2542
2543 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2544      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2545         OpenFile takes it into account
2546      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2547      * Missing elements added in dicomV3.dic
2548       (just to be affraid : have a look at
2549        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2550        and do it again next year ;->
2551
2552 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2553      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
2554        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2555        But there are NOT. It's fixed !
2556        
2557 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2558      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2559      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
2560          
2561 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2562      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2563              an ACR-NEMA / DICOM one.
2564      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
2565              is not gdcm Readable
2566      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
2567              is now decoded.
2568         
2569 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2570      * FIX: CMake generate now documentation
2571      * ENH: out of source doc build !
2572      * ENH: Generate both user and dev documentation
2573      * ENH: Should work on windows too
2574      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
2575      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
2576      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2577      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
2578                      
2579 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2580      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2581      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2582      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
2583         window level & window width
2584
2585 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2586      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2587      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2588      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2589      
2590 2003-10-06  Emanuel Ollart
2591      * FIX : compilation process wad broken.
2592              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2593         
2594 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2595      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2596      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2597      
2598 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2599      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2600            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2601                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2602       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2603
2604 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2605       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
2606         to remain compliant with already defined strings, 
2607         like Transfert Syntax UID and others)
2608
2609 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2610       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2611              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2612         
2613 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2614       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2615       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2616
2617 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2618       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2619         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2620               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2621       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2622
2623 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2624       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2625
2626 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2627       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2628         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2629
2630 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2631       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2632          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2633          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2634          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2635           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
2636                                        YBR_RCT files.
2637           (no sample found :-(
2638
2639 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2640       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2641         Two reasons: - clear things
2642                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2643                        suffer anymore VC++ complains
2644
2645 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2646       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2647       * removed leaks
2648
2649 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2650       * The lines are now eigthy characters long.for 
2651         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
2652
2653 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2654       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2655         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2656         previous commis of Malaterre)
2657       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2658         before the last Malaterre's commit.
2659
2660 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2661       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2662         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2663       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2664         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2665
2666 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2667       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2668         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2669         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2670
2671 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2672       * Cosmetic changes:
2673         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2674           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2675           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2676           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2677         - PACKAGER corrected
2678         - DEVELOPPER added.
2679         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2680       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2681
2682 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2683       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2684
2685 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2686       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2687
2688 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2689       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2690
2691 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2692       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2693
2694 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2695       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2696         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2697         heuristics to get informations (look at different places).
2698       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2699         sorting DICOM images based on different strategies.
2700       * modified Makefiles accordingly.
2701
2702 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2703       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2704         when building in debug mode
2705       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2706         src/win32/gdcmdll.dsp
2707       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2708
2709 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2710       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2711             to valgrind.
2712
2713 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2714       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2715       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
2716                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2717       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2718
2719 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2720       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2721         the file
2722       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2723       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2724         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2725       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2726         symbols... future problem ?
2727
2728 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2729       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2730       * modified gdcm.dsw accordingly
2731
2732 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2733       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2734
2735 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2736       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2737         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2738       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2739         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2740         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2741
2742 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2743       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2744
2745 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2746       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2747       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2748       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2749       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2750       * PACKAGER : adding all concerning windows
2751
2752 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2753       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2754         garbage debug code.
2755       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2756       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2757         test suite reported error.
2758       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2759         packaging a new release).
2760       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2761       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2762       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2763         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2764         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2765
2766 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2767       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2768       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2769
2770 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2771       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2772         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2773         is made in an internal list to prevent this problem.
2774         Bug fix when output is empty.
2775         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2776         correction.
2777       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2778
2779 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2780       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2781       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2782         files. Added method to remove all files on the input
2783         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2784         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2785
2786 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2787       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2788         when using make instal.
2789       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2790         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2791
2792 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2793       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2794       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2795
2796 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2797       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2798         linux and WINDOWS !
2799       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2800       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2801
2802 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2803       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2804         addon of the jpeg library)
2805       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2806       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2807       * INSTALL now points to web documentation
2808
2809 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2810       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2811         gdcmUtil.h anymore.
2812       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2813         clean target.
2814       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2815         - to allow compilation with gcc 3.x
2816           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2817           -- small fixes on exceptions.
2818           Note: linking not tested !
2819         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2820           building stage.
2821       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2822         dependent convertion).
2823
2824 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2825       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2826         Changelog):
2827         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2828         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2829           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2830         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2831
2832 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2833       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2834         compile
2835       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2836         (FileName -> Filename)
2837
2838 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2839       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2840         - UpdateProgress method should now be effective
2841         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2842           to volumes),
2843         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2844           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2845           accelerating things).
2846         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2847           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2848           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2849           in the stack (for the caller to notice the problem).
2850
2851 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2852       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2853
2854 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2855       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2856         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2857         under Windows... thanks Windows !)
2858
2859 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2860       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2861         debug stage).
2862       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2863
2864 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2865       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2866
2867 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2868       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2869         called with different flags than the default ones (with automake).
2870         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2871            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2872         and went for warning fixes:
2873         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2874           up from unused variables.
2875         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2876       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2877
2878 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2879       * gdcmPython/gdcm.i:
2880         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2881           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2882           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2883         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2884           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2885           exported to Python a as cvar.
2886       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2887         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2888         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2889         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2890         C++ static methods).
2891       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2892         with the above changes.
2893
2894 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2895       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2896
2897 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2898       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2899         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2900         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2901          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2902          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2903            a wrapper
2904          - Wrapper interface which wrap sources
2905         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2906         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2907       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2908         files for compilation
2909
2910 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2911       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2912         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2913         - vtk/Makefile.am now builds a library
2914         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2915           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2916           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2917           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2918           import library.
2919         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2920           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2921           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2922           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2923           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2924         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2925           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2926         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2927           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2928       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2929       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2930         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2931         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2932         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2933         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2934         collision of various stl members (principally cout...).
2935       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2936         file.
2937       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2938         comply with above changes)
2939
2940 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2941       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2942       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2943         vtk data structure (an image Flip was required).
2944       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2945       * cosmetic changes in documentation.
2946
2947 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2948       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2949         unexisting file is given as argument.
2950       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2951         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2952         containing those images is now available at
2953           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2954         with the name gdcmData.
2955         All the python scripts (including the package initialisation file
2956         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2957         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2958
2959 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2960       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2961         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2962         demo of the usage of this class.
2963         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2964         at configure (or autogen.sh) stage.
2965
2966 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2967       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2968         Notes on valgrind:
2969           - maximum info is obtained with a command of the form:
2970             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2971                      --show-reachable=yes PrintHeader
2972           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2973             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2974             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2975             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2976              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2977       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2978         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2979         Note: some images don't seem to work e.g.
2980             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2981       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2982         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2983         make gdcm more thread friendly.
2984
2985 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2986       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2987           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2988         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2989           gdcmHeader::_dicom_vr.
2990         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2991         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2992           VRHT*.
2993         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2994
2995 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2996       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2997         make install stage.
2998
2999 2003-04-9 JPR
3000       * UpdateGroupLength replaced by new one
3001
3002 2003-04-7 JPR
3003       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
3004         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
3005
3006 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3007       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
3008       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
3009       * src:
3010         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
3011         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
3012           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
3013         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
3014           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
3015           carried the same semantics.
3016           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
3017         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
3018           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
3019         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
3020       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
3021       * gdcmGetXSize added
3022       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
3023       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
3024
3025 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3026       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
3027         (to avoid double call by end user).
3028       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
3029         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
3030
3031 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3032       * gdcm/Doc many doxygen changes:
3033         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
3034           the html.users end users oriented documentation and
3035           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
3036           oriented documentation.
3037         - README changed accordingly
3038         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
3039         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
3040           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
3041         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
3042           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
3043           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
3044       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
3045         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
3046       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
3047         ill-formed documentation sections.
3048       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
3049
3050 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3051       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
3052       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
3053         un*ces with sh-utils test utility.
3054       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
3055       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
3056       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
3057       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
3058       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
3059
3060 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3061       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
3062       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
3063
3064 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3065       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
3066       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
3067       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
3068       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
3069         compilation work.
3070       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
3071       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
3072
3073 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3074       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
3075         hence the user doesn't need this explicit call.
3076         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
3077           i.e. LoadElements() call removed.
3078       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
3079         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
3080       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
3081         for adding user defined new tags.
3082         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
3083         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
3084           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
3085
3086 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
3087       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
3088         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
3089         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
3090         with the autotools, included the python wrappers part.
3091       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
3092
3093 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3094       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
3095
3096 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3097       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
3098         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
3099         for usage).
3100       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
3101         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
3102         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
3103       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
3104         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
3105
3106 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3107       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
3108         in InstallMode or PreInstallMode but with an environment given
3109         value of GDCM_DICT_PATH.
3110       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
3111
3112 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3113       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
3114       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
3115       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
3116         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
3117         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
3118
3119 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3120       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
3121         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
3122         gdcmHeader.h
3123       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
3124         (as opposed to gdcm.h)
3125       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
3126       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
3127         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
3128       * autogen.sh removed history related references to crea package.
3129
3130 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3131       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
3132         bug.
3133
3134 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3135       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
3136         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
3137         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
3138         of hidding away the python related distutils specific files
3139         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
3140         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
3141         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
3142         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
3143
3144 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3145       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
3146       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
3147         among the list of sources.
3148
3149 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3150       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
3151       * modifications in MSVC projects
3152
3153 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3154       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
3155         looks like we can move back to original usage of exception within
3156         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
3157         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
3158       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
3159         README file for usage added.
3160       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
3161         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
3162         testing the proper parsing of a Dicom related file.
3163         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
3164       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
3165       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
3166         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
3167           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
3168           Dicom public dictionary were not accessible without an
3169           instance of class gdcmHeader.
3170         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
3171           require no instances at all to be invocated.
3172         - within gdcmDictSet this change required to change some method
3173           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
3174           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
3175       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
3176         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
3177       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
3178         the above to be effective.
3179       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
3180         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
3181       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
3182         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
3183         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
3184         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
3185         (for python dectection).
3186       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
3187         now avoids publishing the empty entries.
3188
3189 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3190       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
3191         ExtraPath reused :-P
3192       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
3193
3194 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3195       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
3196       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
3197       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
3198         and links
3199
3200 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3201       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
3202         method. Doxygenation.
3203       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
3204
3205 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3206       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
3207         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
3208         when using "python setup.py install".
3209       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
3210         reexports the working classes.
3211       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
3212         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
3213         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
3214         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
3215         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
3216         subdir (see the README file). This problem probably due to
3217         an combination of g++ and dynamic loading.
3218       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
3219
3220 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3221       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
3222         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
3223         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
3224         again in a python subdir, but the package itself is now in
3225         python/gdcmPython.
3226       * setup.py was cleaned up:
3227         - pythonIncludePath removed
3228         - python setup.py bdist target is now functional.
3229       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
3230         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
3231         accordingly.
3232
3233 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3234       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
3235       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
3236         distutils installer is operational.
3237       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
3238           shadow classes (from gdcm.py).
3239         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
3240           instead of gdcmPython/demo/load.py.
3241         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
3242
3243 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3244       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
3245         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
3246         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
3247         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
3248         dictionary.
3249         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had an unspecified fourth field
3250           are now in the "???" group.
3251         - python/gdcm.i changed accordingly,
3252         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
3253           of the above new functionalities in Python.
3254
3255 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3256       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
3257         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
3258           were definitively removed.
3259         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
3260       * src/gdcmElValSet.cxx:
3261         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
3262         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
3263         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
3264         - Added GetElementByName(string).
3265       * src/gdcmHeader.cxx: added
3266         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
3267         - GetPubElValRepByName(string)
3268         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
3269         - GetShaElValRepByName(string)
3270         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
3271         - GetShaElValRepByName(string)
3272         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
3273         - GetElValRepByName(string)
3274         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
3275         - GetElValRepByName(string)
3276       * Doc/requirements.txt added.
3277
3278 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3279       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
3280       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
3281         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
3282         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
3283         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
3284       * python/testSuite.py changed accordingly.
3285
3286 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
3287       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
3288         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
3289              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
3290               cannot be exported. [...]
3291               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
3292               be exported. [...]
3293               This is caused by a designed limitation that once a template
3294               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
3295               exported."
3296         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
3297         limitation" of VC++ is a pitfall.
3298         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
3299         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
3300         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
3301         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
3302         library.
3303         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
3304       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
3305          dll under windows !!!!)
3306       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
3307       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
3308         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
3309       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
3310         (one) of image(s).
3311       * removed glib references
3312       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
3313
3314 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3315       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
3316         that only displays required tags and testAll.py that parses all
3317         the files of the testsuite without using unittest.
3318       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
3319       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
3320       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
3321         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
3322
3323 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3324       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
3325         values, but limits itself to values which are below a user specified
3326         size (by default 1024 bytes).
3327       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
3328         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
3329         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
3330         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
3331       * python/testSuite.py
3332         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
3333         - two new examples added.
3334       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
3335
3336 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3337       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
3338         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindLength().
3339       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
3340       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
3341       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
3342
3343 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3344       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
3345         the vr was also RET.
3346       * python/testSuite.py more tests added.
3347
3348 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3349       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
3350       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
3351       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
3352         7.18 Integer types (see stdint.h)
3353         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
3354       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
3355         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
3356         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
3357         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
3358         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
3359         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
3360         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
3361         The rest of the changes we the necessary adaptations.
3362
3363 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3364       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
3365         VR files.
3366       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
3367
3368 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3369       * Adaptation for porting to VC++:
3370         - src/gdcm.h
3371           o forced to use std namespace (for string to be known)
3372           o all class use __declspec export style on WIN32
3373         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
3374           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
3375       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
3376         variable GDCM_DICT_PATH.
3377       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
3378
3379 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3380       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3381         to native Python dictionary.
3382       * python/demo/test.py:
3383         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3384         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3385       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3386         PubElVals hashing table.
3387       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3388
3389 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3390       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3391         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3392       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3393       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3394       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3395         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3396       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3397
3398 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3399       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3400         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3401         that we can import the shadow classes without errors].
3402
3403 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3404       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3405       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3406       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3407       * src/Makefile prepared for python wrapping
3408
3409 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3410       * src/gdcmHeader.cxx :
3411         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3412           (see gdcmHeader::LoadElements).
3413         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3414           ReadInt16 and ReadInt32)
3415
3416 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3417       * src/gdcmHeader.cxx :
3418         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3419           method.
3420         - SetLgrElem renamed to SetLength
3421         - GetLgrElem renamed to GetLength
3422         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3423       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3424       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3425         due to IdoDude was cleaned out.
3426
3427 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3428       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3429         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3430         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3431         returning the unecessary skL (skipped length).
3432         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3433         it was redundant with the File position internals (by using
3434         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3435         jajun.
3436       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3437         on the libido specificities which are handled through class
3438         inheritance.
3439       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3440         added.
3441
3442 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3443       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3444         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3445
3446 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3447       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3448
3449 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3450       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3451         and _IdDcmSWAP_LONG.
3452
3453 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3454       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3455         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3456