]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
Update ChangeLog
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
2     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
3                related methods, in order not to expose internal mechanisms
4         InitTraversal();
5         GetNextEntry();                          
6          * REM methods that exposed internal mechanisms :
7         DicomDir::GetDicomDirPatients()
8         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
9         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
10         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
11          * UPD Test programs :
12              makeDicomDir.cxx
13              BuildUpDicomDir.cxx
14              TestDicomDir.cxx
15           * UPD Example program
16              PrintDicomDir.cxx
17     * ADD DictSet methods
18         InitTraversal()
19         GetNextEntry()
20
21 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
22    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
23          reason to have to methods, moreover with the second takeing the ostream as
24          *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
25
26 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
27    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
28          smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
29          Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
30          code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
31          working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
32          problematic getIPAddress
33
34 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
35    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
36      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
37      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
38      shared libs.
39
40 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
41    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
42      sort DICOM files
43
44 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
45    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack 
46               for dealing with BIGENDIAN processors
47                         - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
48                         When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
49                         and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
50                         PixelWriteConveror, and avoid modifying the Pixel Area.
51                         Note :
52               Probabely, the same operation will have to be done when we want 
53               to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
54               and we are working onj Little Endian Processor
55                                                 
56 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
57    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
58      table.
59    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
60    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
61      all the dict content.
62    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
63      print
64    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
65
66 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
67    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
68                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
69
70 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
71    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
72    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
73    * gdcmPython/demo/ : add a new test
74
75 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
76    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
77         * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
78         * enhancement of Example/PrintDicomDir
79
80 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
81    * Now, python test might work on systems
82    * Add the PrintDicomDir test
83
84 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
85    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
86                 Explicit Big Endian Transfer Syntax files
87           (group and elem not swaped)
88         
89 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
90    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
91                 Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
92                           begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
93                           To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
94                           Document::HandleOutOfGroup0002() method 
95          * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
96               (related pb not yet solved)
97
98 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
99    * Bug fix for the python part use
100    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
101
102 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
103    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
104
105 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
106    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
107      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
108      the transfer syntax
109
110 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
111    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
112    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
113             to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
114                  and Transfer Syntax is Big Endian
115                  We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
116          * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
117          * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
118
119 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
120    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
121    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
122    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
123    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
124    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
125    gdcm::Global would destroy at exit).
126
127 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
128    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
129          environment. static const string in a header file used to be ill
130          initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
131          issue.
132
133 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
134    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
135       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
136       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
137       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
138          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
139
140 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
141    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
142      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
143      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
144      redirected to a file (ofstream).
145    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
146      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
147
148 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
149    * Removal of useless and dangerous methods :
150          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
151          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
152         * Removal of usless methods :
153          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
154    * Commenting out of probabely useless methods :
155          Dict::GetDictEntryNames()
156          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
157          DictSet::GetPubDictEntryNames()
158          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()                      
159         * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used      
160         * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version    
161         * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
162            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
163                           Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods                        
164    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
165            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
166                                      Unused till now...                   
167         * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
168            should be used to write a method to replace the former
169            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
170
171 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
172    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
173      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
174      data in the DocEntry structure
175
176 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
177    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
178      And now use a static function call instead, with a global variable. i
179      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
180      and easier to use...hopefully
181
182 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
183    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
184
185 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
186    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
187
188 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
189    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
190      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
191
192 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
193    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
194    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
195      a file
196    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
197      when specifying the VR
198    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
199    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
200
201 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
202    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
203           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
204         * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
205         * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
206            in order to allow further VR modification by user
207    * REM : removal of once-called method File::WriteBase        
208                 integration of its code in formerly one-line method File::Write
209
210 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
211    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
212      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
213    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
214      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
215      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
216    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
217
218 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
219    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
220      empty Print Method
221    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
222
223 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
224    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
225    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
226    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
227    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
228    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
229
230 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
231    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
232      problems when compiling with the python wrapping
233
234 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
235    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
236      writting in ImplicitVR
237
238 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
239    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
240      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
241      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
242      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
243
244 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
245    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
246      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
247
248 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
249    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
250      Rename Decompressed to Raw
251    * Use the API changes in gdcm::File.
252    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
253      Memory leaks fixed
254
255 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
256    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
257      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
258      of Frames' field
259
260 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
261    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
262    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
263
264 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
265    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
266      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
267      solve it.
268
269 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
270    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
271      DocEntry. Now use methods of the Document !
272
273 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
274    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
275  
276 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
277    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
278    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
279    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
280    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
281      test to 0.0
282    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
283    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
284      containing found sequences
285
286 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
287    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
288      not at all time
289    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
290      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
291               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
292      and tests are now made on good variables
293
294 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
295    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
296    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
297      length
298    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
299    * Add vtkGdcmWriter example and test
300
301 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
302    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
303    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
304    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
305      SetValue
306    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
307    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
308
309 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
310    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
311    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
312
313 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
314    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
315      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
316      file isn't readable. 
317
318 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
319    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
320    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
321    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
322    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
323      method that is redondant with AddEntry.
324    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
325      SQItem
326
327 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
328    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
329    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
330    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
331
332 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
333    * Huge cleanup:
334      - Remove printf / sprintf
335      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
336      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
337        source
338      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
339        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
340      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
341        (plus it is not up to date)
342      - remove 'using namespace std' this is BAD !
343
344 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
345    * Remove memory leaks on the DicomDir
346    * Remove some useless data in DicomDirObject
347    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
348
349 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
350    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
351
352 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
353    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
354      future, with convertion)
355    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
356      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
357      from the output of the class
358
359 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
360    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
361
362 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
363    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
364      and vtkErrorMacro use.
365    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
366
367 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
368    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
369      file name in input
370    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
371    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
372      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
373      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
374      immediately after thee instruction.
375    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
376      file has been opened : the test must be made on the content of the 
377      pointer and not directly on the pointer !
378      Code formatting
379
380 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
381    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
382      the python part recompiles
383
384 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
385    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
386      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
387      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
388      all linux)
389
390 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
391    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
392      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
393      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
394      screen resolution, it's produce errors).
395      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
396    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
397    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
398      under windows at compilation
399    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
400      for grayscale images
401    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
402
403 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
404    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
405    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
406      tests on the image size X, Y, Z
407
408 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
409    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
410    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
411      between the class name and the file name
412
413 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
414    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
415      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
416      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
417      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
418      this variable content.
419
420 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
421    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
422      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
423      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
424      DocEntryArchive
425    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
426      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
427      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
428    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
429      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
430
431 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
432    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
433
434 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
435    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
436    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
437      the header.
438    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
439      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
440      write
441    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
442      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
443      is now on RGB data (as before my last commit
444    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
445
446 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
447    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
448      Add a print information of the type of the entry
449    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
450      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
451    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
452      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
453    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
454      any.
455    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
456
457 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
458    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
459      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
460      opened or not.
461
462 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
463    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
464      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
465    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
466      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
467      DocEntryArchive
468    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
469      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
470    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
471      - test the pixels written
472      - add test points to quickly find where is the error
473      - can set a file name input and output in arguments
474    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
475      amelioration of the test output
476
477 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
478    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
479      all replaced DocEntry's
480    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
481      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
482      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
483      header initial state.
484
485 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
486    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
487
488 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
489    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
490      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
491      then, it musn't change in the time.
492    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
493      header correctly. At this time, the change is only made for the first
494      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
495      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
496      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
497      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
498    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
499    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
500      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
501      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
502
503 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
504    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
505    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
506
507 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
508    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
509      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
510      is copied).
511    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
512      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
513    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
514
515 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
516    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
517      Two problems appear when doing it :
518       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
519         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
520         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
521         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
522         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
523         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
524         the gdcmBinEntry.
525       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
526         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
527         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
528         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
529         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
530    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
531
532 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
533    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
534    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
535      squeeze method
536
537 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
538    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
539    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
540      after it have been deleted
541
542 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
543    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
544    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
545    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
546      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
547      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
548
549 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
550     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
551     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
552     3. Use const ref when possible
553     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
554     5. A few more comments
555     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
556
557 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
558   * ENH: Slightly bigger patch:
559     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
560     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
561     3. File was not close properly in gdcmDict
562     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
563     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
564     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
565     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
566     8. Do not repeat virtual in subclasses
567     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
568
569 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
570   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
571     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
572     of a null character as defined by standard
573   
574 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
575   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
576     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
577
578 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
579   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
580   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
581     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
582
583 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
584   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
585     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
586     a verbose message is generated.
587     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
588     correctly close is a call to CloseFile.
589     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
590   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
591     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
592     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
593     header. A verbose is generated if these two size mismatch
594
595 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
596   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
597     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
598     break under windows (with msvc6 compilation).
599
600 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
601   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
602     compiling with MSVC6)
603
604 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
605   * Bugs fix for the Windows build with VC6
606   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
607     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
608     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
609     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
610   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
611     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
612     gdcm.i file)
613   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
614     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
615     std::cerr of vtk.
616
617 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
618   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
619   * gdcmPython/gdcm.i:
620     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
621     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
622       NOT need to be wrapped anymore.
623   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
624     DicomDir::Method) new example added.
625
626 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
627   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
628     A DicomString can contain as many \0 as they want
629     and it is *always* of even length.
630     We only support odd length for very rare case. 
631     And in the near future this should be removed.
632
633 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
634   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
635     little endian. This should -heopfully- fix some tests
636
637 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
638   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
639     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
640     the one comiled into lib
641
642 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
643   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
644     This should definitely solve any leak problem, and we should be
645     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
646
647 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
648   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
649   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
650   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
651   
652 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
653   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
654   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
655     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
656   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
657   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
658     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
659     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
660       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
661       no longer exists.
662
663 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
664   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
665    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
666    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
667    the class.
668   
669 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
670   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
671     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
672     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
673
674 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
675   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
676   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
677     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
678     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
679     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
680       CloseFile() anymore.
681     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
682       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
683       into File::Pixel_Data.
684
685 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
686   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
687     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
688   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
689     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
690     method:
691     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
692     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
693       method to those classes.
694     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
695       -- Added a ::Print() method.
696       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
697       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
698          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
699
700 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
701   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
702     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
703     doxygen.
704   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
705   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
706     pointlessly wrapped (see
707     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
708   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
709     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
710     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
711     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
712     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
713       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
714            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
715       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
716          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
717
718 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
719   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
720     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
721
722 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
723   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
724     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
725     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
726   * TODO added new entry.
727   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
728     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
729     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
730     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
731       variable names for semantical coherence.
732
733 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
734   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
735   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
736   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
737   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
738   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
739   compilation time jpeg option.
740
741 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
742   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
743     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
744     reproduce at home.
745   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
746   Thanks dcmtk crew !
747
748 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
749   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
750   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
751     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
752   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
753   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
754   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
755   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
756     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
757     from File:: to PixelConvert::.
758
759 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
760   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
761     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
762      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
763      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
764
765 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
766   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
767   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
768   like this:
769     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
770   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
771   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
772   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
773
774 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
775   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
776     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
777     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
778     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
779     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
780       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
781       (for the time being this is better than having them attach to
782        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
783     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
784       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
785     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
786       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
787       gdcmPixelConvert::
788
789 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
790   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
791   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
792     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
793       clean up of RLE related code. 
794   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
795     - src/gdcmRLE.cxx removed
796     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
797     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
798     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
799   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
800     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
801       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
802       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
803
804 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
805   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
806     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
807       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
808       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
809       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
810       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
811       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
812       offsets.
813   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
814     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
815         with the retired Parse7Fe0().
816     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
817     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
818
819 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
820   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
821     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
822     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
823     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
824   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
825     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
826       to return an unused length.
827
828 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
829   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
830     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
831     to use to do simple stuff.
832
833 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
834   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
835     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
836     copying of the file within different directory, configure header file to
837     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
838     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
839
840 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
841   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
842      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
843        with it's binary name).
844      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
845        the Website to be more complete.
846      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
847        doxygenated documentation.
848      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
849        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
850                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
851   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
852   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
853    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
854
855 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
856   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
857    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
858
859 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
860   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
861     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
862     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
863     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
864     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
865   * GDCMHOME clean up:
866     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
867       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
868       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
869   * Autotools clean up:
870     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
871     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
872
873 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
874   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
875   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
876   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
877
878 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
879   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
880     describing TODO entries and used it for new entries.
881   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
882     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
883     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
884   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
885     documentation itself, but the website) moved to html and
886     placed in directory Doc/Website:
887     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
888     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
889     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
890   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
891   * CMakeLists.txt changed accordingly.
892   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
893     DeveloppersPython.html
894   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
895
896 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
897   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
898     of gdcm Web site.
899
900 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
901   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
902     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
903     we can now delete[] it safely 
904   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
905     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
906   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
907
908 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
909   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
910     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
911     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
912     pointed content.
913
914 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
915   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
916   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
917
918 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
919   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
920     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
921     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
922     an example of usage.
923     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
924       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
925     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
926       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
927     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
928     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
929     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
930
931 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
932   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
933     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
934     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
935     in class 
936     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
937       and associated accessors. Doxygenation of the class.
938     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
939       accessors added.
940     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
941       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
942     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
943     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
944
945 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
946   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
947     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
948       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
949            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
950            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
951            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
952            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
953            the same group and element all share the same (group, element)
954            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
955            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
956            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
957            consider the following definition of a TagKey:
958            - let Group, Element be the string representation of the
959              group and element dicom tag members,
960            - let ItemNumber be the string representation of the integer
961              index of the considered item number of a sequence,
962            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
963            the form:
964               /ItemNumber#Group|Element
965            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
966            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
967               Group|Element<SeqTag>
968            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
969            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
970            string e.g.
971                0028|1201
972            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
973            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
974            string e.g.
975                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
976     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
977       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
978       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
979     - src/gdcmDocEntry.cxx:
980       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
981          Key member.
982       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
983     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
984     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
985       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
986       -- now has a new BaseTagKey member.
987       -- STYLE.
988   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
989     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
990     truly belongs.
991     This poses the problem with the semantics of the following lines
992        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
993        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
994        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
995     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
996     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
997     order to get things working the dicom dictionary was altered !
998     Please fix things urgently...
999   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
1000     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
1001     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
1002     set to OW:
1003       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
1004       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
1005       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
1006   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
1007     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
1008   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
1009
1010 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1011   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
1012
1013 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1014   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
1015     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
1016   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
1017   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
1018
1019 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1020   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
1021     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
1022   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
1023     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
1024   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
1025     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
1026   * TODO updated
1027   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
1028     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1029   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
1030   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
1031     exception_on_error parameter.
1032     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
1033     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
1034     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1035
1036 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1037   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
1038   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1039     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1040   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
1041   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
1042   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
1043     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
1044   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
1045
1046 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1047   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
1048     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
1049
1050 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
1051   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
1052        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
1053  
1054 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
1055   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
1056         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
1057
1058 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1059    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
1060    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
1061      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
1062      is now in static in the gdcmDebug class
1063    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
1064    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
1065
1066 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1067    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
1068      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
1069    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
1070      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
1071      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
1072      that displays position and size).
1073    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
1074      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
1075      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
1076      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
1077      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
1078      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
1079      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
1080         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
1081      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
1082      commiting changes).
1083    * Test/CMakeLists.txt:
1084       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
1085       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
1086         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
1087         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
1088    * TODO updated.
1089
1090 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1091    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
1092      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
1093      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
1094      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
1095      - removal of typedef duplication.
1096      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
1097      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
1098    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
1099       - printf polluting ctest removed.
1100       - TAB removal for comminting
1101    * Test:
1102      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
1103        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
1104        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
1105        this test creates them.
1106        Note: we need to validate each reference image, but before that
1107              I'd like to rename them with a more explicit name...
1108      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
1109    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
1110      including each header needed).
1111
1112 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1113    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
1114      test suite to the Example directory. Are concerned:
1115      - PrintHeader.cxx
1116      - TestDcm2Acr.cxx
1117      - TestFindTags.cxx
1118      - TestWrite.cxx was
1119      - TestWriteSimple.cxx
1120    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
1121      image gdcmData/oldACR00001.ima
1122
1123 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1124    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
1125      with removal from gdcmData):
1126       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
1127       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
1128       - US.3405.1.dcm
1129      Added the following because after last cvs update, they cause
1130        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
1131      to segfault:
1132       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
1133       - oldACR00001.ima
1134    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
1135      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
1136      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
1137      form of test...
1138    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1139      we don't need to black list the following images anymore:
1140       - 8BitsUncompressedColor.dcm
1141       - OT-PAL-8-face.dcm
1142       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1143    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
1144      fixes and the beautified code ;-)
1145      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
1146      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
1147      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
1148            improve the test suite). The bug could be detected by using
1149            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1150            or by using
1151            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
1152            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
1153
1154 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
1155    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
1156          - replace by uggly but working old code :-(
1157    A lot of things should be OK again.
1158    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
1159    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
1160    (twice, withing a fortnigh ...)      
1161
1162 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1163    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
1164      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
1165    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
1166      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
1167      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
1168                    - OT-PAL-8-face.dcm
1169                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
1170    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
1171      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
1172      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
1173      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
1174      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
1175      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
1176      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
1177      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
1178      image.
1179    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
1180      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
1181      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
1182      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
1183    
1184 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1185   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
1186   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
1187                           (instead of infinite loop)
1188   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
1189
1190 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1191    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
1192
1193 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1194    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
1195            when SamplesPerPixel =3
1196          - now Write is no longer confused by 
1197           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
1198          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
1199                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
1200    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
1201            (in order to split the job that has not to be done 
1202            for gdcmDicomDir)
1203
1204 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1205    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
1206      loop on the same image until memory went out. 
1207      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
1208    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
1209      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
1210
1211 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
1212    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
1213             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
1214             is added a the end, when necessary.
1215             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
1216               now written correctly
1217             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
1218               (even for odd groups) 
1219         Note : only Explicit Value Representation was checked.
1220                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
1221
1222 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1223    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
1224    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
1225      coding style).
1226
1227 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1228    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
1229      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
1230    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
1231
1232 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1233    FIX : gdcmDocument.cxx
1234       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
1235         code 'beautyfication' :-(
1236       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
1237
1238 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
1239    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
1240             : to allow user to create his own Sequences
1241    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
1242
1243    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
1244
1245    - gdcmBinEntry
1246      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1247   
1248    - gdcmDocEntry
1249      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1250      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
1251   
1252    - gdcmDocEntrySet
1253      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
1254      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1255      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
1256      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
1257      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
1258      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1259                                             guint16 element,
1260                                             std::string vr     = "unkn",
1261                                             std::string fourth = "unkn",
1262                                             std::string name   = "unkn"); 
1263      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
1264      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1265      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1266      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
1267      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
1268      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1269      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
1270      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
1271   
1272    - gdcmDocument
1273      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
1274      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
1275      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
1276      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
1277      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
1278                                         FILE *_fp, FileType type);
1279      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1280      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
1281      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
1282      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
1283      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
1284      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
1285      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
1286      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
1287                                             guint16 element,
1288                                             std::string vr     = "unkn",
1289                                             std::string fourth = "unkn",
1290                                             std::string name   = "unkn");
1291      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1292      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1293      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1294      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1295                                                                                                                  
1296         - gdcmElementSet
1297           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1298           
1299    - gdcmSeqEntry
1300           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1301  
1302    - gdcmSQItem
1303      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1304      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
1305      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1306      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1307
1308    - gdcmValEntry
1309          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
1310                                   
1311 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1312     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1313       The default constructor invoked by the line
1314          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1315       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1316       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1317       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1318     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1319       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1320       Could anyone explain why ?
1321     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1322       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
1323       code related to gdcmBinEntry).
1324
1325 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1326     * In order to fix memory leaks:
1327      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1328        some delete calls.
1329      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1330      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1331        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1332        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1333        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1334      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1335      - src/gdcmDocument.cxx:
1336        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1337           from dynamic stores.
1338        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1339           was causing memory leaks.
1340      - src/gdcmSQItem.cxx:
1341        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1342           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1343        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1344           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1345           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1346           This avoids SegFaulting.
1347      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1348     * Conclusion:
1349      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1350        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1351        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1352      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1353        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1354      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1355        segfaults).
1356     * Erroneous leading white fix:
1357      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1358        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1359      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1360      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1361     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1362     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1363
1364
1365 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1366     * In order to fix writing of dicom files:
1367      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1368      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1369      - src/gdcmDocument.cxx:
1370        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1371        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1372        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1373           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1374           manner.
1375        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1376           to only declared) and build on top of
1377           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1378        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1379      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1380        for usage in destructor and treatement of promotion in
1381        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1382      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1383       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1384     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1385       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1386       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1387       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1388
1389 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1390     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1391       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1392       learned that:
1393           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1394           soon as possible by globally disabling memory caching.
1395           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1396           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1397       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1398       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1399       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1400     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1401       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1402       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1403       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1404         with 1.
1405       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1406       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1407       understand why the list is empty...).
1408     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1409     * Doc/License.txt added.
1410
1411 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1412     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1413       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1414         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1415         the padding problem.
1416       - general clean up, simplification, and coding style.
1417       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1418     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1419
1420 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
1421    *  gdcmSeqEntry.cxx
1422            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1423                 - fix the display of SQItem ordinal number
1424       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1425                 - remove some useless never written private methods     
1426                 
1427 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1428    * gdcmBinEntry.cxx 
1429       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1430            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1431               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1432                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1433    * dcmDocument.cxx
1434       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1435               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1436            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1437       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1438    * gdcmFile.cxx
1439       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1440    * gdcmSQItem.h
1441       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1442             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1443             \warning : some pb remaining around this number
1444                                 will be solved asap
1445       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1446    * gdcmValEntry.cxx 
1447       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1448
1449 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1450     * Memory leak hunt with the following command:
1451       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1452                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1453       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1454       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1455       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1456           grep "MEMORY LEAK" src/*
1457       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1458       -----
1459           #include <string>
1460           int main() {
1461              std::string name;
1462              char * test = "babo";
1463              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1464                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1465              name.clear();   //// Doesn't help !
1466              return 0;
1467           }
1468       -----
1469           #include <string>
1470           #include <iostream>
1471           int main() {
1472              std::string line;
1473              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1474              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1475                                         //// of 1320 bytes in call to
1476                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1477             return 0;
1478           }
1479       -----
1480
1481
1482 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1483     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1484       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1485         and related, moved away to gdcmDocument.
1486       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1487         the corresponding protected accessors of inherited class
1488         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1489         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1490       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1491       - Clean up of undefined or unused methods.
1492     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1493       account the changes to gdcmHeader.h).
1494     * src/gdcmDocument.h:
1495       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1496         changes to gdcmHeader.h).
1497       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1498         (see changes to gdcmHeader.h).
1499       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1500       - Clean up of undefined or unused methods.
1501     * src/gdcmDocument.cxx:
1502       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1503       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1504       - some std::string properly set to VRKey
1505     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1506       references to gdcmDocument. 
1507     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1508     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1509       cvs repository gdcmData.
1510
1511 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1512     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1513     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1514       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1515     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1516     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1517       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1518     * src/gdcmDocument.cxx: 
1519       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1520         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1521       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1522         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1523         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1524         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1525         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1526               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1527               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1528     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1529     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1530       now taken into account.
1531     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1532       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1533     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1534       on posix.
1535     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1536       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1537     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1538
1539 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1540     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1541       gdcmGlob
1542     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1543     * src/gdcmUtil.h : export methods
1544
1545 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1546     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1547       to right behavior
1548     * Initial addition of automatic python testing
1549     * Initial addition of automatic image comparison
1550
1551 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1552     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1553       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1554
1555 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1556      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1557      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1558      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1559
1560 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1561      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1562        new concepts (and new classes) :
1563        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1564         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1565         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1566        a Sequence is composed of Items.
1567        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1568        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1569        (never taken into account)
1570        Our unability to add a new 'entry' in the header
1571        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1572        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1573        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1574        nothing is finished.
1575        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1576
1577 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1578      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1579      
1580 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1581      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1582        file prefix (SetFilePrefix)
1583
1584 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1585      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1586        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1587        baseline.
1588      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1589        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1590
1591 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1592      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1593        dicom image
1594
1595 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1596      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1597      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1598        between the developper and user version.
1599      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1600      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1601
1602 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1603      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1604        when using cmake.
1605
1606 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1607      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1608                src directory, now generated in the build dir.
1609             2. Tests as mentionned smarter
1610             3. Some clean up
1611             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1612           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1613           where we could set the institution name / patient name...
1614
1615        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1616               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1617                  (this was not true before)
1618
1619 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1620      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1621            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1622      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1623            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1624            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1625      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1626            tree-like structure of a Dicom Header.
1627      * FIX Test code cleaning     
1628            
1629 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1630      * ENH: Adding automatic testing
1631        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1632        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1633        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1634        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1635           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1636           too many projects
1637      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1638      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1639        one file instead of seven + some small cleanup
1640
1641 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1642      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1643      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1644            Header printing. Example given with :
1645            > PrintHeader fileName  2 new
1646           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1647            
1648 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1649      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1650          1. I have added some unsigned where needed
1651          2. Some function parameter not used -> (void)
1652          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1653          4. g++ don't like character '\' in comment
1654          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1655                     this really need to be fixed
1656          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1657          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1658                     this also really need to be fixed
1659          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1660                     remove compression file 
1661                     (as we only do decompression, right ?)     
1662      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1663
1664 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1665      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1666            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1667            defaulted to yspacing
1668            
1669 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1670      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1671      * ENH add parameters :
1672                bool  exception_on_error = false, 
1673                bool  enable_sequences   = false,
1674                bool  ignore_shadow      = false
1675            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1676      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1677            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1678               
1679 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1680      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1681      
1682 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1683      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1684      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1685              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1686              
1687 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1688      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1689          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1690
1691 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1692      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1693        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1694        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1695        in gdcmHeader.
1696      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1697        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1698        already does the job.
1699      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1700        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1701
1702 2004-03-30 Benoit Regrain
1703      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1704        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1705        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1706
1707 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1708      * ENH : Check on file type to be written moved
1709              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1710      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1711              when end-of-list is reached
1712            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1713
1714 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1715      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1716      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1717      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1718        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1719
1720 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1721      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1722        now contains all the gdcmGlobal related code.
1723      * minor coding style and doxygenation changes.
1724
1725 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1726      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1727        now contains all the Debug related code.
1728      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1729      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1730        CreateCleanString) removed.
1731      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1732      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1733      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1734      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1735        src/gdcmDirList.cxx)
1736
1737 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1738      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1739
1740 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1741      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1742            big endian made volumes
1743      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1744            end user to instanciate class gdcmParser
1745           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1746
1747 2004-03-22 Benoit Regrain
1748      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1749      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1750              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1751
1752 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1753      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1754            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1755            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1756            or build from the files held (recursively) in a Directory
1757            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1758            gdcmObject::SetBoundaries() added
1759
1760 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1761      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1762                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1763      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1764            DICOMDIR
1765      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1766            about the name
1767
1768 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1769      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1770                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1771
1772 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1773      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1774            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1775            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1776            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1777            to allow making gdcDicomDir object.
1778      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1779           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1780
1781 2004-02-11 Benoit Regrain
1782      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1783              when using from python
1784
1785 2004-02-10 Benoit Regrain
1786      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1787      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1788      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1789              directory parsing
1790
1791 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1792      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1793              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1794              - class gdcmMeta created
1795      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1796              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1797      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1798
1799 2004-02-05 Benoit Regrain
1800      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1801              header entries
1802      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1803      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1804
1805 2004-02-04 Benoit Regrain
1806      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1807      * FIX : sort the images in the dicom dir
1808      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1809      * ADD : a python demo
1810
1811 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1812      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1813      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1814              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1815              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1816              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1817      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1818            to make full checking easier
1819         
1820 2004-02-04 Benoit Regrain
1821      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1822      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1823
1824 2004-02-03 Benoit Regrain
1825      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1826      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1827      * Bug fix and print add-on
1828
1829 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1830      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1831      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1832      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1833      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1834            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1835         
1836 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1837      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1838              iterator on last
1839              of the last synonym :-(
1840      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1841              for DICOMDIR ;-)
1842      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1843      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1844      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1845            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1846       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1847
1848 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1849      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1850            no longer writes 'Un' on disk
1851      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1852      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1853            the length (for Palette expanded images)
1854            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1855      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1856            (that broke Write). Replaced by UL.
1857            Aware user will reload the field if he 
1858            thinks it's necesssary
1859              
1860 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1861      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1862        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1863        IsReadable() methods.
1864        
1865      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1866       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1867       but so usefull for people that miss them ;-)
1868       
1869      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1870        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1871
1872 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1873      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1874
1875 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1876      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1877              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1878         The TRUE value for this param has to be used 
1879         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1880         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1881      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1882              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1883         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1884         
1885      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1886              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1887              Fixed
1888
1889      * gdcmHeader add the method
1890              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1891         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1892         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1893         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
1894
1895 2004-01-26 Benoit Regrain
1896      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1897        in the print and add a third level of print to print them
1898
1899 2004-01-23 Benoit Regrain
1900      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1901      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1902      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1903        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1904
1905 2004-01-22 Benoit Regrain
1906      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1907      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1908
1909 2004-01-19 Benoit Regrain
1910      * Add the use of shadow dictionaries
1911      * bug fix and coding style
1912
1913 2004-01-19 Benoit Regrain
1914      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1915      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1916      * Add the update of header entries using the shadow library
1917
1918 2004-01-19 Benoit Regrain
1919      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1920      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1921        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1922        of dicom dir parsing
1923      * bug fix under python
1924
1925 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1926     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1927     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1928     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1929     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1930
1931 2004-01-15 Benoit Regrain
1932      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1933        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1934        when the gdcmDictSet will be destroyed
1935      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1936        gdcmDictSet
1937
1938 2004-01-15 Benoit Regrain
1939      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1940        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1941        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1942        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1943      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1944
1945 2004-01-14 Benoit Regrain
1946      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1947      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1948      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1949      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1950
1951 2004-01-13 Benoit Regrain
1952      * src/*.[h|cxx] : coding style
1953      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1954
1955 2004-01-13 Benoit Regrain
1956      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1957      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1958        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1959      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1960
1961 2004-01-12 Benoit Regrain
1962      * src/*.h : add comments
1963      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1964      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
1965        directly setted in the source code
1966      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
1967        gdcmTS and gdcmVR
1968
1969 2004-01-09 Benoit Regrain
1970      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1971      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1972
1973 2004-01-07 Benoit Regrain
1974      * Modification to compile with the distutils.
1975      * Bug fix in code
1976
1977 2003-12-10 Benoit Regrain
1978      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1979        can use a gdcmHeaderHelper to load data
1980      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1981        made in the source code
1982
1983 2003-12-10 Benoit Regrain
1984      * Update Windows projects and .cvsignore files
1985
1986 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1987      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1988            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1989            if he wants to.
1990            gdcmElValSet:Print takes it into account
1991
1992 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1993      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1994      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1995      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1996
1997 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1998       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1999              on the ListTag listElem member,
2000              not longer on the TagElValueHT tagHt member
2001       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
2002              with the tagHt member and the listElem member.
2003              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
2004
2005       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
2006              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
2007                             if bug fixing is necessary), for internal
2008                             use only
2009              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
2010                             or to allow Parser going on.
2011              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
2012              with a length (not 0000) is found
2013       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
2014                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
2015                 (to be written)
2016
2017 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
2018      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
2019      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
2020           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
2021      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
2022
2023 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2024      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
2025
2026 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2027      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
2028           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
2029
2030 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
2031      * in testSuite.py : new files names for checking the package
2032      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
2033              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
2034              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
2035
2036 2003-11-05 Benoit Regrain
2037      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
2038                        : Explicit error messages
2039      * in __init__.py  : Related modif
2040
2041 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
2042      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
2043            to be used by aware (vtk) users that want to manage
2044            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
2045      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
2046                     (vtkGdcmReader compliant)           
2047       
2048 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2049      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
2050        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
2051        
2052 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2053      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
2054            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
2055
2056 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
2057      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
2058                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
2059              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
2060              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
2061              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
2062              such an image :
2063              After gdcmHeader :
2064               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
2065               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
2066               GetImageDataRaw returns the gray Plane
2067      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
2068              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
2069
2070 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
2071      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
2072              
2073 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2074      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
2075            being coherents dicom files.
2076      
2077 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2078      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
2079            from medcon lib !
2080      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
2081      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
2082      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
2083      * ENH: Add include dir to medcon lib
2084      * FIX: only one function is being exported for now ! 
2085            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
2086             
2087 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
2088       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
2089         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
2090           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
2091       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
2092
2093 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
2094       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
2095         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
2096         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
2097       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
2098       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
2099
2100 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2101       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
2102                                                
2103 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2104       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
2105       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
2106       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
2107       
2108 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2109       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
2110       * ENH: Try adding a search script for python site-package
2111       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
2112       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
2113       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
2114       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
2115              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
2116         But it fasten debug compilation time.
2117             
2118 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
2119       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
2120         (they are compressed as 2 planes images, 
2121          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
2122
2123 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2124       * Now CheckRead takes into account :
2125          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
2126          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
2127       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2128        (breaks DicomWorks)
2129
2130 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2131       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
2132              one should remove the '\'
2133         
2134 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
2135       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
2136         (wrong lengths in header)
2137         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
2138       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
2139         (breaks DicomWorks)
2140
2141 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2142       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
2143         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
2144
2145 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2146       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
2147       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
2148
2149 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2150       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
2151      
2152 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
2153       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
2154         (the patch is easy to remove)
2155       * cosmetic changes to avoid warnings
2156       
2157 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2158       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
2159         no need to press 'r' now.
2160    
2161 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
2162       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
2163         to new Jpeg Lossless decompressor
2164       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
2165       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
2166       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
2167                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
2168 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2169       * general anonymisation in gdcmData
2170       * adding the 'color files' from
2171         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
2172       * adding some well knowed bugged-header images
2173       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
2174         waiting for their inclusion in Python testsuite
2175
2176 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
2177     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
2178       no longer seg faults when file is not found
2179
2180 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2181      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
2182        MultiFrame images
2183
2184 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2185      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
2186
2187 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
2188      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
2189         OpenFile takes it into account
2190      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
2191      * Missing elements added in dicomV3.dic
2192       (just to be affraid : have a look at
2193        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
2194        and do it again next year ;->
2195
2196 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
2197      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
2198        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
2199        But there are NOT. It's fixed !
2200        
2201 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2202      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
2203      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
2204          
2205 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
2206      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
2207              an ACR-NEMA / DICOM one.
2208      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
2209              is not gdcm Readable
2210      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
2211              is now decoded.
2212         
2213 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2214      * FIX: CMake generate now documentation
2215      * ENH: out of source doc build !
2216      * ENH: Generate both user and dev documentation
2217      * ENH: Should work on windows too
2218      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
2219      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
2220      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
2221      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
2222                      
2223 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2224      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2225      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2226      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
2227         window level & window width
2228
2229 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2230      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
2231      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
2232      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
2233      
2234 2003-10-06  Emanuel Ollart
2235      * FIX : compilation process wad broken.
2236              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
2237         
2238 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2239      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
2240      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
2241      
2242 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
2243      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2244            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2245                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2246       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2247
2248 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2249       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
2250         to remain compliant with already defined strings, 
2251         like Transfert Syntax UID and others)
2252
2253 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2254       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2255              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2256         
2257 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2258       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
2259       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
2260
2261 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2262       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
2263         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
2264               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
2265       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
2266
2267 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2268       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
2269
2270 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2271       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
2272         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
2273
2274 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
2275       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
2276          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
2277          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
2278          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
2279           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
2280                                             YBR_RCT files.
2281           (no sample found :-(
2282
2283 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2284       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
2285         Two reasons: - clear things
2286                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
2287                        suffer anymore VC++ complains
2288
2289 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2290       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
2291       * removed leaks
2292
2293 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2294       * The lines are now eigthy characters long.for 
2295         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
2296
2297 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2298       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2299         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2300         previous commis of Malaterre)
2301       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2302         before the last Malaterre's commit.
2303
2304 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2305       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2306         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2307       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2308         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2309
2310 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2311       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2312         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2313         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2314
2315 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2316       * Cosmetic changes:
2317         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2318           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2319           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2320           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2321         - PACKAGER corrected
2322         - DEVELOPPER added.
2323         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2324       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2325
2326 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2327       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2328
2329 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2330       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2331
2332 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2333       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2334
2335 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2336       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2337
2338 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2339       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2340         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2341         heuristics to get informations (look at different places).
2342       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2343         sorting DICOM images based on different strategies.
2344       * modified Makefiles accordingly.
2345
2346 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2347       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2348         when building in debug mode
2349       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2350         src/win32/gdcmdll.dsp
2351       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2352
2353 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2354       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2355             to valgrind.
2356
2357 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2358       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2359       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
2360                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2361       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2362
2363 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2364       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2365         the file
2366       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2367       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2368         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2369       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2370         symbols... future problem ?
2371
2372 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2373       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2374       * modified gdcm.dsw accordingly
2375
2376 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2377       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2378
2379 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2380       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2381         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2382       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2383         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2384         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2385
2386 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2387       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2388
2389 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2390       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2391       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2392       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2393       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2394       * PACKAGER : adding all concerning windows
2395
2396 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2397       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2398         garbage debug code.
2399       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2400       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2401         test suite reported error.
2402       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2403         packaging a new release).
2404       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2405       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2406       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2407         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2408         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2409
2410 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2411       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2412       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2413
2414 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2415       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2416         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2417         is made in an internal list to prevent this problem.
2418         Bug fix when output is empty.
2419         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2420         correction.
2421       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2422
2423 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2424       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2425       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2426         files. Added method to remove all files on the input
2427         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2428         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2429
2430 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2431       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2432         when using make instal.
2433       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2434         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2435
2436 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2437       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2438       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2439
2440 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2441       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2442         linux and WINDOWS !
2443       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2444       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2445
2446 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2447       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2448         addon of the jpeg library)
2449       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2450       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2451       * INSTALL now points to web documentation
2452
2453 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2454       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2455         gdcmUtil.h anymore.
2456       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2457         clean target.
2458       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2459         - to allow compilation with gcc 3.x
2460           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2461           -- small fixes on exceptions.
2462           Note: linking not tested !
2463         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2464           building stage.
2465       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2466         dependent convertion).
2467
2468 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2469       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2470         Changelog):
2471         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2472         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2473           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2474         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2475
2476 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2477       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2478         compile
2479       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2480         (FileName -> Filename)
2481
2482 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2483       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2484         - UpdateProgress method should now be effective
2485         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2486           to volumes),
2487         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2488           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2489           accelerating things).
2490         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2491           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2492           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2493           in the stack (for the caller to notice the problem).
2494
2495 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2496       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2497
2498 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2499       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2500         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2501         under Windows... thanks Windows !)
2502
2503 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2504       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2505         debug stage).
2506       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2507
2508 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2509       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2510
2511 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2512       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2513         called with different flags than the default ones (with automake).
2514         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2515            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2516         and went for warning fixes:
2517         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2518           up from unused variables.
2519         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2520       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2521
2522 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2523       * gdcmPython/gdcm.i:
2524         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2525           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2526           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2527         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2528           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2529           exported to Python a as cvar.
2530       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2531         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2532         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2533         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2534         C++ static methods).
2535       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2536         with the above changes.
2537
2538 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2539       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2540
2541 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2542       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2543         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2544         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2545          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2546          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2547            a wrapper
2548          - Wrapper interface which wrap sources
2549         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2550         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2551       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2552         files for compilation
2553
2554 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2555       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2556         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2557         - vtk/Makefile.am now builds a library
2558         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2559           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2560           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2561           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2562           import library.
2563         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2564           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2565           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2566           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2567           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2568         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2569           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2570         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2571           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2572       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2573       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2574         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2575         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2576         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2577         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2578         collision of various stl members (principally cout...).
2579       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2580         file.
2581       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2582         comply with above changes)
2583
2584 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2585       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2586       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2587         vtk data structure (an image Flip was required).
2588       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2589       * cosmetic changes in documentation.
2590
2591 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2592       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2593         unexisting file is given as argument.
2594       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2595         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2596         containing those images is now available at
2597           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2598         with the name gdcmData.
2599         All the python scripts (including the package initialisation file
2600         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2601         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2602
2603 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2604       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2605         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2606         demo of the usage of this class.
2607         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2608         at configure (or autogen.sh) stage.
2609
2610 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2611       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2612         Notes on valgrind:
2613           - maximum info is obtained with a command of the form:
2614             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2615                      --show-reachable=yes PrintHeader
2616           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2617             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2618             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2619             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2620              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2621       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2622         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2623         Note: some images don't seem to work e.g.
2624             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2625       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2626         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2627         make gdcm more thread friendly.
2628
2629 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2630       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2631           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2632         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2633           gdcmHeader::_dicom_vr.
2634         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2635         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2636           VRHT*.
2637         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2638
2639 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2640       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2641         make install stage.
2642
2643 2003-04-9 JPR
2644       * UpdateGroupLength replaced by new one
2645
2646 2003-04-7 JPR
2647       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2648         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2649
2650 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2651       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2652       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2653       * src:
2654         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2655         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2656           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2657         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2658           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2659           carried the same semantics.
2660           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2661         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2662           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2663         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2664       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2665       * gdcmGetXSize added
2666       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2667       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2668
2669 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2670       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2671         (to avoid double call by end user).
2672       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2673         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2674
2675 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2676       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2677         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2678           the html.users end users oriented documentation and
2679           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2680           oriented documentation.
2681         - README changed accordingly
2682         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2683         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2684           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2685         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2686           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2687           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2688       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2689         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2690       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2691         ill-formed documentation sections.
2692       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2693
2694 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2695       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2696       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2697         un*ces with sh-utils test utility.
2698       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2699       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2700       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2701       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2702       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2703
2704 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2705       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2706       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2707
2708 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2709       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2710       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2711       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2712       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2713         compilation work.
2714       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2715       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2716
2717 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2718       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2719         hence the user doesn't need this explicit call.
2720         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2721           i.e. LoadElements() call removed.
2722       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2723         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2724       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2725         for adding user defined new tags.
2726         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2727         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2728           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2729
2730 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2731       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2732         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2733         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2734         with the autotools, included the python wrappers part.
2735       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2736
2737 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2738       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2739
2740 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2741       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2742         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2743         for usage).
2744       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2745         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2746         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2747       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2748         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2749
2750 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2751       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2752         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2753         value of GDCM_DICT_PATH.
2754       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2755
2756 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2757       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2758       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2759       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2760         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2761         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2762
2763 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2764       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2765         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2766         gdcmHeader.h
2767       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2768         (as opposed to gdcm.h)
2769       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2770       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2771         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2772       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2773
2774 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2775       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2776         bug.
2777
2778 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2779       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2780         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2781         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2782         of hidding away the python related distutils specific files
2783         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2784         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2785         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2786         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2787
2788 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2789       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2790       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2791         among the list of sources.
2792
2793 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2794       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2795       * modifications in MSVC projects
2796
2797 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2798       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2799         looks like we can move back to original usage of exception within
2800         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2801         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2802       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2803         README file for usage added.
2804       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2805         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2806         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2807         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2808       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2809       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2810         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2811           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2812           Dicom public dictionary were not accessible without an
2813           instance of class gdcmHeader.
2814         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2815           require no instances at all to be invocated.
2816         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2817           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2818           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2819       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2820         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2821       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2822         the above to be effective.
2823       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2824         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2825       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2826         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2827         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2828         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2829         (for python dectection).
2830       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2831         now avoids publishing the empty entries.
2832
2833 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2834       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2835         ExtraPath reused :-P
2836       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2837
2838 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2839       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2840       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2841       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2842         and links
2843
2844 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2845       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2846         method. Doxygenation.
2847       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2848
2849 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2850       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2851         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2852         when using "python setup.py install".
2853       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2854         reexports the working classes.
2855       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2856         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2857         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2858         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2859         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2860         subdir (see the README file). This problem probably due to
2861         an combination of g++ and dynamic loading.
2862       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2863
2864 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2865       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2866         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2867         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2868         again in a python subdir, but the package itself is now in
2869         python/gdcmPython.
2870       * setup.py was cleaned up:
2871         - pythonIncludePath removed
2872         - python setup.py bdist target is now functional.
2873       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2874         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2875         accordingly.
2876
2877 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2878       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2879       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2880         distutils installer is operational.
2881       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2882           shadow classes (from gdcm.py).
2883         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2884           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2885         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2886
2887 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2888       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2889         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2890         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2891         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2892         dictionary.
2893         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2894           are now in the "???" group.
2895         - python/gdcm.i changed accordingly,
2896         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2897           of the above new functionalities in Python.
2898
2899 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2900       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2901         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2902           were definitively removed.
2903         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2904       * src/gdcmElValSet.cxx:
2905         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2906         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2907         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2908         - Added GetElementByName(string).
2909       * src/gdcmHeader.cxx: added
2910         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2911         - GetPubElValRepByName(string)
2912         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2913         - GetShaElValRepByName(string)
2914         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2915         - GetShaElValRepByName(string)
2916         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2917         - GetElValRepByName(string)
2918         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2919         - GetElValRepByName(string)
2920       * Doc/requirements.txt added.
2921
2922 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2923       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2924       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2925         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2926         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2927         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2928       * python/testSuite.py changed accordingly.
2929
2930 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2931       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2932         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2933              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2934               cannot be exported. [...]
2935               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2936               be exported. [...]
2937               This is caused by a designed limitation that once a template
2938               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2939               exported."
2940         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2941         limitation" of VC++ is a pitfall.
2942         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2943         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2944         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2945         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2946         library.
2947         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2948       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2949          dll under windows !!!!)
2950       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2951       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2952         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2953       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2954         (one) of image(s).
2955       * removed glib references
2956       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2957
2958 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2959       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2960         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2961         the files of the testsuite without using unittest.
2962       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2963       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2964       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2965         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2966
2967 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2968       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2969         values, but limits itself to values which are below a user specified
2970         size (by default 1024 bytes).
2971       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2972         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2973         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2974         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2975       * python/testSuite.py
2976         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2977         - two new examples added.
2978       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2979
2980 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2981       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2982         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2983       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2984       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2985       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2986
2987 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2988       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2989         the vr was also RET.
2990       * python/testSuite.py more tests added.
2991
2992 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2993       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2994       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2995       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2996         7.18 Integer types (see stdint.h)
2997         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2998       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2999         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
3000         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
3001         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
3002         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
3003         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
3004         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
3005         The rest of the changes we the necessary adaptations.
3006
3007 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3008       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
3009         VR files.
3010       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
3011
3012 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3013       * Adaptation for porting to VC++:
3014         - src/gdcm.h
3015           o forced to use std namespace (for string to be known)
3016           o all class use __declspec export style on WIN32
3017         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
3018           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
3019       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
3020         variable GDCM_DICT_PATH.
3021       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
3022
3023 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3024       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
3025         to native Python dictionary.
3026       * python/demo/test.py:
3027         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
3028         - takes an optional filename argument (the file to parse).
3029       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
3030         PubElVals hashing table.
3031       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
3032
3033 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3034       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
3035         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
3036       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
3037       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
3038       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
3039         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
3040       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
3041
3042 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3043       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
3044         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
3045         that we can import de shadow classes without errors].
3046
3047 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3048       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
3049       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
3050       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
3051       * src/Makefile prepared for python wrapping
3052
3053 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3054       * src/gdcmHeader.cxx :
3055         - Parsing of header is now separated from loading of element values
3056           (see gdcmHeader::LoadElements).
3057         - general clean up of hopefully all file access (creation of
3058           ReadInt16 and ReadInt32)
3059
3060 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3061       * src/gdcmHeader.cxx :
3062         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
3063           method.
3064         - SetLgrElem renamed to SetLength
3065         - GetLgrElem renamed to GetLength
3066         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
3067       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
3068       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
3069         due to IdoDude was cleaned out.
3070
3071 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3072       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
3073         concentrates on finding the value representation (when it exists).
3074         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
3075         returning the unecessary skL (skipped length).
3076         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
3077         it was redundant with the File position internals (by using
3078         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
3079         jajun.
3080       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
3081         on the libido specificities which are handled through class
3082         inheritance.
3083       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
3084         added.
3085
3086 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3087       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
3088         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
3089
3090 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3091       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
3092
3093 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3094       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
3095         and _IdDcmSWAP_LONG.
3096
3097 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3098       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
3099         May 23 2002. Needless to say we are running late...
3100