Example/PrintFile.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: PrintFile.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2009/05/28 15:44:34 $
   7   Version:   $Revision: 1.93 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmDocument.h"
  20 #include "gdcmSeqEntry.h"
  21 #include "gdcmSQItem.h"
  22 #include "gdcmDataEntry.h"
  23
  24 #include "gdcmFileHelper.h"
  25 #include "gdcmDebug.h"
  26 #include "gdcmDirList.h"
  27 #include "gdcmGlobal.h"
  28 #include "gdcmDictSet.h"
  29 #include "gdcmArgMgr.h"
  30 #include "gdcmOrientation.h"
  31 #include <iostream>
  32
  33 /// \todo : code factorization, for 'single file' an 'whole directory' processing
  34
  35 void ShowLutData(GDCM_NAME_SPACE::File *f);
  36
  37      // Nothing is written yet to get LUT Data user friendly
  38      // The following is to be moved into a PixelReadConvert method
  39      // Let here, waiting for a clever idea on the way to do it.
  40
  41 void ShowLutData(GDCM_NAME_SPACE::File *f)
  42 {
  43    GDCM_NAME_SPACE::SeqEntry *modLutSeq = f->GetSeqEntry(0x0028,0x3000);
  44    if ( modLutSeq !=0 )
  45    {
  46       GDCM_NAME_SPACE::SQItem *sqi= modLutSeq->GetFirstSQItem();
  47       if ( sqi != 0 )
  48       {
  49          std::string lutDescriptor = sqi->GetEntryString(0x0028,0x3002);
  50          if (   /*lutDescriptor   == GDCM_UNFOUND*/ 0 )
  51          {
  52             std::cout << "LUT Descriptor is missing" << std::endl;
  53             return;
  54          }
  55          int length;   // LUT length in Bytes
  56          int deb;      // Subscript of the first Lut Value
  57          int nbits;    // Lut item size (in Bits)
  58
  59          int nbRead;    // nb of items in LUT descriptor (must be = 3)
  60
  61          nbRead = sscanf( lutDescriptor.c_str(),
  62                            "%d\\%d\\%d",
  63                               &length, &deb, &nbits );
  64          std::cout << "length " << length
  65                   << " deb " << deb
  66                   << " nbits " << nbits
  67                   << std::endl;
  68          if ( nbRead != 3 )
  69          {
  70             std::cout << "Wrong LUT descriptor" << std::endl;
  71          }
  72          //LUT Data (CTX dependent)
  73          GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *b = sqi->GetDataEntry(0x0028,0x3006);
  74          if ( b != 0 )
  75          {
  76             int BitsAllocated = f->GetBitsAllocated();
  77             if ( BitsAllocated <= 8 )
  78             {
  79                int mult;
  80                if ( ( nbits == 16 ) && ( BitsAllocated == 8 ) )
  81                {
  82                // when LUT item size is different than pixel size
  83                   mult = 2; // high byte must be = low byte
  84                }
  85                else
  86                {
  87                // See PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619
  88                   mult = 1;
  89                }
  90                uint8_t *lut = b->GetBinArea();
  91                for( int i=0; i < length; ++i )
  92                {
  93                   std::cout << i+deb << " : \t"
  94                               << (int) (lut[i*mult + 1]) << std::endl;
  95                }
  96             }
  97             else
  98             {
  99                uint16_t *lut = (uint16_t *)(b->GetBinArea());
 100                for( int i=0; i < length; ++i )
 101                {
 102                   std::cout << i+deb << " : \t"
 103                               << (int) (((uint16_t *)lut)[i])
 104                               << std::endl;
 105                }
 106             }
 107          }
 108          else
 109             std::cout << "No LUT Data DataEntry (0x0028,0x3006) found?!? "
 110                         << std::endl;
 111       }
 112       else
 113          std::cout << "No First SQ Item within (0x0028,0x3000) ?!? "
 114                      << std::endl;
 115    }
 116    else
 117       std::cout << "No LUT Data SeqEntry (0x0028,0x3000) found "
 118                   << std::endl;
 119 }
 120
 121 int main(int argc, char *argv[])
 122 {
 123
 124    START_USAGE(usage)
 125    " \n PrintFile : \n                                                        ",
 126    " Display the header of a ACR-NEMA/PAPYRUS/DICOM File                      ",
 127    " usage: PrintFile {filein=inputFileName|dirin=inputDirectoryName}[level=n]",
 128    "                       [forceload=listOfElementsToForceLoad] [rec] [noex] ",
 129    "                       [4DLoc= ][dict= privateDirectory]                  ",
 130    "                       [ { [noshadowseq] | [noshadow][noseq] } ] [load]   ",
 131    "                       [debug] [warning]                                  ",
 132    "      level = 0,1,2 : depending on the amount of details user wants to see",
 133    "      rec : user wants to parse recursively the directory                 ",
 134    "      load : user wants to load the pixels, as well (to see warning info) ",
 135    "      noex : user doesn't want extra 'user friendly' info                 ",
 136    "      4DLoc: group-elem(in hexa, no space) of the DataEntry holdind 4thDim",
 137    "      listOfElementsToForceLoad : group-elem,g2-e2,... (in hexa, no space)",
 138    "                                of Elements to load whatever their length ",
 139    "      privateDirectory : source file full path name of Shadow Group elems ",
 140    "      noshadowseq: user doesn't want to load Private Sequences            ",
 141    "      noshadow   : user doesn't want to load Private groups (odd number)  ",
 142    "      noseq      : user doesn't want to load Sequences                    ",
 143    "      debug      : user wants to run the program in 'debug mode'          ",
 144    "      warning    : user wants to be warned about any oddity in the File   ",
 145    "      showlut :user wants to display the Palette Color (as an int array)  ",
 146    FINISH_USAGE
 147
 148    // Initialize Arguments Manager
 149    GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr *am= new GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr(argc, argv);
 150
 151    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage") )
 152    {
 153       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
 154       delete am;
 155       return 1;
 156    }
 157
 158    const char *fileName = am->ArgMgrGetString("filein");
 159    const char *dirName  = am->ArgMgrGetString("dirin");
 160
 161    if ( (fileName == 0 && dirName == 0) ||
 162         (fileName != 0 && dirName != 0) )
 163    {
 164       std::cerr << std::endl
 165         << "Either 'filein=' or 'dirin=' must be present;"
 166         << std::endl << "Not both" << std::endl;
 167       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
 168       delete am;
 169       return 1;
 170    }
 171
 172    bool noex = ( 0 != am->ArgMgrDefined("noex") );
 173    bool rec  = ( 0 != am->ArgMgrDefined("rec") );
 174
 175    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
 176       GDCM_NAME_SPACE::Debug::DebugOn();
 177
 178    if (am->ArgMgrDefined("warning"))
 179       GDCM_NAME_SPACE::Debug::WarningOn();
 180
 181    int loadMode = GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL;
 182    if ( am->ArgMgrDefined("noshadowseq") )
 183       loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ;
 184    else
 185    {
 186       if ( am->ArgMgrDefined("noshadow") )
 187          loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOW;
 188       if ( am->ArgMgrDefined("noseq") )
 189          loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSEQ;
 190    }
 191
 192    int level = am->ArgMgrGetInt("level", 1);
 193
 194    int forceLoadNb;
 195    uint16_t *elemsToForceLoad
 196                            = am->ArgMgrGetXInt16Enum("forceload", &forceLoadNb);
 197
 198    int nbP =0;
 199    uint16_t *FourthDimLoc;
 200    if ( am->ArgMgrDefined("4DLoc") )
 201    {
 202       FourthDimLoc = am->ArgMgrGetXInt16Enum("4DLoc", &nbP);
 203
 204       if (nbP != 1)
 205       {
 206          std::cout << "4DLoc must have 2 and only 2 components!" << std::endl;
 207          delete am;
 208          return 1;
 209       }
 210    }
 211
 212    bool load = ( 0 != am->ArgMgrDefined("load") );
 213
 214    bool showlut = ( 0 != am->ArgMgrDefined("SHOWLUT") );
 215
 216    bool ddict = am->ArgMgrDefined("dict") ? true : false;
 217    const char *dict = 0;
 218
 219    if (ddict)
 220    {
 221      dict = am->ArgMgrGetString("dict",0);
 222    }
 223
 224    /* if unused Param we give up */
 225    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
 226    {
 227       am->ArgMgrUsage(usage);
 228       delete am;
 229       return 1;
 230    }
 231
 232    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
 233
 234    // ----------- End Arguments Manager ---------
 235
 236
 237    if (ddict)
 238    {
 239       GDCM_NAME_SPACE::Global::GetDicts()->GetDefaultPubDict()->AddDict(dict);
 240    }
 241
 242    if ( fileName != 0 ) // ====== Deal with a single file ======
 243    {
 244       GDCM_NAME_SPACE::File *f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
 245       f->SetLoadMode(loadMode);
 246       f->SetFileName( fileName );
 247    f->SetMaxSizeLoadEntry(0xffff);
 248
 249       for (int ri=0; ri<forceLoadNb; ri++)
 250       {
 251          f->AddForceLoadElement((uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri],
 252                                 (uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri+1] );
 253       }
 254 // TODO : find why such a polution
 255 // To avoid polluting the output with messages
 256 // 'Last system error was : No such file or directory'
 257
 258 errno = 0;
 259
 260
 261       bool res = false;
 262       try
 263         {
 264         res = f->Load();
 265         }
 266       catch(std::exception &ex)
 267         {
 268         std::cerr << "sorry an exception was thrown: " << ex.what() << std::endl;
 269         }
 270       // GDCM_NAME_SPACE::File::IsReadable() is no usable here, because we deal with
 271       // any kind of gdcm-Parsable *document*
 272       // not only GDCM_NAME_SPACE::File (as opposed to GDCM_NAME_SPACE::DicomDir)
 273       if ( !res )
 274       {
 275          std::cout << "Cannot process file [" << fileName << "]" << std::endl;
 276          std::cout << "Either it doesn't exist, or it's read protected "
 277                    << std::endl;
 278          std::cout << "or it's not a Dicom File, or its 'header' is bugged"
 279                    << std::endl;
 280          std::cout << "use 'PrintFile filein=... debug' to try to guess the pb"
 281                    << std::endl;
 282          f->Delete();
 283          return 0;
 284       }
 285
 286       if (nbP == 1)
 287          f->SetFourthDimensionLocation(FourthDimLoc[0],FourthDimLoc[1]);
 288
 289
 290       GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fh = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(f);
 291       fh->SetPrintLevel( level );
 292
 293       fh->Print();
 294
 295       std::cout << "\n\n" << std::endl;
 296
 297       std::cout <<std::endl;
 298       std::cout <<" dataSize    " << fh->GetImageDataSize()    << std::endl;
 299       std::cout <<" dataSizeRaw " << fh->GetImageDataRawSize() << std::endl;
 300 if (!noex)
 301 {
 302       int nX,nY,nZ,nT,sPP,planarConfig;
 303       std::string pixelType;
 304       nX=f->GetXSize();
 305       nY=f->GetYSize();
 306       nZ=f->GetZSize();
 307       nT=f->GetTSize();
 308       std::cout << " DIMX=" << nX << " DIMY=" << nY
 309                 << " DIMZ=" << nZ << " DIMT=" << nT
 310                 << std::endl;
 311
 312       pixelType    = f->GetPixelType();
 313       sPP          = f->GetSamplesPerPixel();
 314       std::cout << " pixelType= ["            << pixelType
 315                 << "] SamplesPerPixel= ["     << sPP
 316                 << "] ";
 317
 318       if (sPP == 3)
 319       {
 320          planarConfig = f->GetPlanarConfiguration();
 321          std::cout << " PlanarConfiguration= [" << planarConfig
 322                 << "] "<< std::endl;
 323       }
 324       std::cout << " PhotometricInterpretation= ["
 325                 << f->GetEntryString(0x0028,0x0004)
 326                 << "] "<< std::endl;
 327
 328       int numberOfScalarComponents=f->GetNumberOfScalarComponents();
 329       std::cout << " NumberOfScalarComponents = " << numberOfScalarComponents
 330                 <<std::endl
 331                 << " LUT = " << (f->HasLUT() ? "TRUE" : "FALSE")
 332                 << std::endl;
 333
 334       if ( f->GetDataEntry(0x0002,0x0010) )
 335          if ( f->GetDataEntry(0x0002,0x0010)->IsNotLoaded() )
 336          {
 337             std::cout << "Transfer Syntax not loaded. " << std::endl
 338                      << "Better you increase MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE"
 339                   << std::endl;
 340             f->Delete();
 341             return 0;
 342          }
 343
 344       std::string transferSyntaxName = f->GetTransferSyntaxName();
 345       std::cout << " TransferSyntaxName= [" << transferSyntaxName << "]"
 346                 << std::endl;
 347       std::cout << " SwapCode= " << f->GetSwapCode() << std::endl;
 348       std::cout << " ------" << std::endl;
 349
 350
 351       std::cout << "\n\n" << std::endl;
 352       std::cout << "X spacing " << f->GetXSpacing() << std::endl;
 353       std::cout << "Y spacing " << f->GetYSpacing() << std::endl;
 354       std::cout << "Z spacing " << f->GetZSpacing() << std::endl;
 355
 356 //------------------------------
 357
 358
 359
 360
 361
 362       // Let's get and print some usefull fields about 'Orientation'
 363       // ------------------------------------------------------------
 364
 365       std::string strPatientPosition =
 366                                       f->GetEntryString(0x0018,0x5100);
 367       if ( strPatientPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 368         && strPatientPosition != "" )
 369             std::cout << "PatientPosition (0x0010,0x5100)= ["
 370                       << strPatientPosition << "]" << std::endl;
 371
 372       std::string strViewPosition =
 373                                       f->GetEntryString(0x0018,0x5101);
 374       if ( strViewPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 375         && strViewPosition != "" )
 376             std::cout << "View Position (0x0018,0x5101)= ["
 377                       << strViewPosition << "]" << std::endl;
 378
 379      std::string strPatientOrientation =
 380                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0020);
 381       if ( strPatientOrientation != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 382         && strPatientOrientation != "")
 383          std::cout << "PatientOrientation (0x0020,0x0020)= ["
 384                    << strPatientOrientation << "]" << std::endl;
 385
 386       std::string strImageOrientationPatient =
 387                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0037);
 388       if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 389         && strImageOrientationPatient != "" )
 390          std::cout << "ImageOrientationPatient (0x0020,0x0037)= ["
 391                    << strImageOrientationPatient << "]" << std::endl;
 392
 393       std::string strImageOrientationRET =
 394                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0035);
 395       if ( strImageOrientationRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 396         && strImageOrientationRET != "" )
 397          std::cout << "ImageOrientationRET (0x0020,0x0035)= ["
 398                    << strImageOrientationRET << "]" << std::endl;
 399
 400       std::string strImagePositionPatient =
 401                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0032);
 402       if ( strImagePositionPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 403         && strImagePositionPatient != "" )
 404          std::cout << "ImagePositionPatient (0x0020,0x0032)= ["
 405                    << strImagePositionPatient << "]" << std::endl;
 406
 407       std::string strImagePositionPatientRET =
 408                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0030);
 409       if ( strImagePositionPatientRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 410         && strImagePositionPatientRET != "" )
 411          std::cout << "ImagePositionPatientRET (0x0020,0x0030)= ["
 412                    << strImagePositionPatientRET << "]" << std::endl;
 413
 414      float iop[6];
 415      //bool riop =
 416         f->GetImageOrientationPatient(iop);
 417      float ipp[3];
 418      //bool ripp =
 419         f->GetImagePositionPatient(ipp);
 420
 421      std::cout << "Image Position (0x0020,0x0032|0x0030) : "
 422                << ipp[0] << " , " << ipp[1] << " , "<< ipp[2]
 423                << std::endl;
 424      std::cout << "Image Orientation (0x0020,0x0037|0x0035) : "
 425                << iop[0] << " , " << iop[1] << " , "<< iop[2] << " , "
 426                << iop[3] << " , " << iop[4] << " , "<< iop[5]
 427                << std::endl;
 428
 429
 430       // Let's compute 'user friendly' results about 'Orientation'
 431       // ---------------------------------------------------------
 432
 433       GDCM_NAME_SPACE::Orientation *o = GDCM_NAME_SPACE::Orientation::New();
 434
 435       if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND ||
 436            strImageOrientationRET     != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 437       {
 438
 439          GDCM_NAME_SPACE::OrientationType orient = o->GetOrientationType( f );
 440
 441          std::cout << "TypeOrientation = " << orient << " (-> "
 442                    << o->GetOrientationTypeString(orient) << " )" << std::endl;
 443       }
 444
 445       std::string ori = o->GetOrientation ( f );
 446       if (ori != "\\" )
 447          std::cout << "Orientation [" << ori << "]" << std::endl;
 448       o->Delete();
 449
 450
 451 /*
 452 std::vector <double> valueVector;
 453 GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *e_0018_5212 = f->GetDataEntry(0x0018, 0x5212);
 454 bool resJP = e_0018_5212->GetDSValue(valueVector);
 455 if (resJP) {
 456    double test;
 457    for ( int i=0; i < 3; i++ ) {
 458        test = valueVector[i];
 459        std::cout << " test " << test << std::endl;
 460     }
 461 }
 462 //e_0018_5212->Delete();
 463 */
 464
 465
 466 /* -----------------------------
 467
 468 // Try :
 469 std::cout << std::endl << std::endl << "===========Try Get Numerical ======="
 470           << std::endl;
 471 GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *e;
 472 bool res;
 473 std::vector<double> vd;
 474
 475 // Transfert Syntax
 476 e=f->GetDataEntry(0x0002,0x0010);
 477 if (e){
 478   res=e->GetNumerical(vd);
 479   if (!res){
 480     std::cout << "0x0002,0x0010 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 481   }
 482 }
 483 // Columns
 484 e=f->GetDataEntry(0x0028,0x0011);
 485 if (e){
 486   res=e->GetNumerical(vd);
 487   if (!res){
 488     std::cout << "0x0028,0x0011 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 489   } else {
 490     std::cout << "0x0028,0x0011 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 491     std::cout << vd[0]<< std::endl;
 492   }
 493 }
 494 // Im Orient (Pat)
 495 e=f->GetDataEntry(0x0020,0x0032);
 496 if (e){
 497   res=e->GetNumerical(vd);
 498   if (!res){
 499     std::cout << "0x0020,0x0032 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 500   } else {
 501     std::cout << "0x0020,0x0032 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 502     for(int l=0; l<vd.size(); l++)
 503       std::cout << "vd[" << l << "]=" << vd[l]<< std::endl;
 504   }
 505 }
 506
 507 // Pixel Spacing
 508
 509 e=f->GetDataEntry(0x0028,0x0030);
 510 if (e){
 511   res=e->GetNumerical(vd);
 512   if (!res){
 513     std::cout << "0x0028,0x0030 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 514   } else {
 515     std::cout << "0x0028,0x0030 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 516     for(int l=0; l<vd.size(); l++)
 517       std::cout << "vd[" << l << "]=" << vd[l]<< std::endl;
 518   }
 519 }
 520
 521 ----------------------------------------------*/
 522
 523 }
 524 //------------------------------
 525
 526
 527       // Display the LUT as an int array (for debugging purpose)
 528       if ( f->HasLUT() && showlut )
 529       {
 530          uint8_t* lutrgba = fh->GetLutRGBA();
 531          if ( lutrgba == 0 )
 532          {
 533             std::cout << "Lut RGBA (Palette Color) not built " << std::endl;
 534
 535            // Nothing is written yet to get LUT Data user friendly
 536            // The following is to be moved into a PixelRedaConvert method
 537
 538             GDCM_NAME_SPACE::SeqEntry *modLutSeq = f->GetSeqEntry(0x0028,0x3000);
 539             if ( modLutSeq !=0 )
 540             {
 541                GDCM_NAME_SPACE::SQItem *sqi= modLutSeq->GetFirstSQItem();
 542                if ( !sqi )
 543                {
 544                   std::string lutDescriptor = sqi->GetEntryString(0x0028,0x3002);
 545                   int length;   // LUT length in Bytes
 546                   int deb;      // Subscript of the first Lut Value
 547                   int nbits;    // Lut item size (in Bits)
 548                   int nbRead;   // nb of items in LUT descriptor (must be = 3)
 549
 550                   nbRead = sscanf( lutDescriptor.c_str(),
 551                                     "%d\\%d\\%d",
 552                                      &length, &deb, &nbits );
 553                   if ( nbRead != 3 )
 554                   {
 555                       std::cout << "Wrong LUT descriptor" << std::endl;
 556                   }
 557                   GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *b = sqi->GetDataEntry(0x0028,0x3006);
 558                   if ( b != 0 )
 559                   {
 560                      if ( b->GetLength() != 0 )
 561                      {
 562                         std::cout << "---------------------------------------"
 563                                << " We should never reach this point      "
 564                                << std::endl;
 565                         //LoadEntryBinArea(b);    //LUT Data (CTX dependent)
 566                      }
 567                  }
 568               }
 569             }
 570             else
 571                std::cout << "No LUT Data (0x0028,0x3000) found " << std::endl;
 572         }
 573         /*
 574          else
 575          {
 576             if ( fh->GetLutItemSize() == 8 )
 577             {
 578                for (int i=0;i<fh->GetLutItemNumber();i++)
 579                   std::cout << i << " : \t"
 580                          << (int)(lutrgba[i*4])   << " "
 581                          << (int)(lutrgba[i*4+1]) << " "
 582                          << (int)(lutrgba[i*4+2]) << std::endl;
 583             }
 584             else // LutItemSize assumed to be = 16
 585             {
 586                uint16_t* lutrgba16 = (uint16_t*)lutrgba;
 587                for (int i=0;i<fh->GetLutItemNumber();i++)
 588                   std::cout << i << " : \t"
 589                          << (int)(lutrgba16[i*4])   << " "
 590                          << (int)(lutrgba16[i*4+1]) << " "
 591                          << (int)(lutrgba16[i*4+2]) << std::endl;
 592             }
 593          }
 594          */
 595       }
 596       else if (showlut)
 597       {
 598          std::cout << "Try LUT Data "<< std::endl;
 599          ShowLutData(f);
 600       }
 601
 602       // Parsability of the GDCM_NAME_SPACE::Document already checked, after Load() !
 603
 604       if ( f->IsReadable() )
 605       {
 606          std::cout <<std::endl<<fileName<<" is Readable"<<std::endl;
 607       }
 608       else if ( f->GetSeqEntry(0x0041,0x1010) )
 609       {
 610          std::cout <<std::endl<<fileName<<" looks like a 'PAPYRUS image' file"
 611                    <<std::endl;
 612       }
 613       else if ( f->GetSeqEntry(0x0004,0x1220) )
 614       {
 615          std::cout <<std::endl<<fileName<<" looks like a 'DICOMDIR file'"
 616                    <<std::endl;
 617       }
 618       else
 619       {
 620          std::cout <<std::endl<<fileName<<" doesn't look like an image file "
 621              <<std::endl;
 622       }
 623
 624       std::cout<<std::flush;
 625       f->Delete();
 626       fh->Delete();
 627    }
 628          // ===========================================================================
 629    else  // =============================== Deal with a Directory =====================
 630    {     // ===========================================================================
 631       std::cout << "dirName [" << dirName << "]" << std::endl;
 632
 633       GDCM_NAME_SPACE::DirList dirList(dirName,rec); // gets recursively (or not) the file list
 634       GDCM_NAME_SPACE::DirListType fileList = dirList.GetFilenames();
 635       GDCM_NAME_SPACE::File *f;
 636       bool res;
 637
 638       if (fileList.size() == 0)
 639       {
 640          std::cout << "No file found in : [" << dirName << "]" << std::endl;
 641       }
 642
 643       for( GDCM_NAME_SPACE::DirListType::iterator it  = fileList.begin();
 644                                  it != fileList.end();
 645                                  ++it )
 646       {
 647          std::cout << std::endl<<" Start processing :[" << it->c_str() << "]"
 648                    << std::endl;
 649          f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
 650          f->SetLoadMode(loadMode);
 651          f->SetFileName( it->c_str() );
 652
 653          for (int ri=0; ri<forceLoadNb; ri++)
 654          {
 655             printf("%04x,%04x\n",elemsToForceLoad[2*ri],
 656                                  elemsToForceLoad[2*ri+1]);
 657             f->AddForceLoadElement((uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri],
 658                                    (uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri+1]);
 659          }
 660          res = f->Load();
 661
 662          if ( !res )
 663          {
 664             std::cout << "Cannot process file [" << it->c_str() << "]"
 665                       << std::endl;
 666             std::cout << "Either it doesn't exist, or it's read protected "
 667                       << std::endl;
 668             std::cout << "or it's not a Dicom File, or its 'header' is bugged"
 669                       << std::endl;
 670             std::cout << "use 'PrintFile filein=... debug' "
 671                       << "to try to guess the pb"
 672                       << std::endl;
 673             f->Delete();
 674             continue;
 675          }
 676
 677          GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fh = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(f);
 678          fh->SetPrintLevel( level );
 679          fh->Print();
 680
 681 //------------------------------
 682 if (!noex)
 683 {
 684          // Lets's get and print some usefull fields about 'Orientation'
 685          // ------------------------------------------------------------
 686
 687          std::string strPatientPosition =
 688                                        f->GetEntryString(0x0018,0x5100);
 689          if ( strPatientPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 690          && strPatientPosition != "" )
 691                std::cout << "PatientPosition (0x0010,0x5100)= ["
 692                         << strPatientPosition << "]" << std::endl;
 693
 694          std::string strViewPosition =
 695                                        f->GetEntryString(0x0018,0x5101);
 696          if ( strViewPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 697          && strViewPosition != "" )
 698                std::cout << "strViewPosition (0x0010,0x5101)= ["
 699                         << strViewPosition << "]" << std::endl;
 700
 701          std::string strPatientOrientation =
 702                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0020);
 703          if ( strPatientOrientation != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 704          && strPatientOrientation != "")
 705             std::cout << "PatientOrientation (0x0020,0x0020)= ["
 706                       << strPatientOrientation << "]" << std::endl;
 707
 708          std::string strImageOrientationPatient =
 709                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0037);
 710          if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 711          && strImageOrientationPatient != "" )
 712             std::cout << "ImageOrientationPatient (0x0020,0x0037)= ["
 713                      << strImageOrientationPatient << "]" << std::endl;
 714
 715          std::string strImageOrientationRET =
 716                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0035);
 717          if ( strImageOrientationRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 718          && strImageOrientationRET != "" )
 719          {
 720             std::cout << "ImageOrientationRET (0x0020,0x0035)= ["
 721                      << strImageOrientationRET << "]" << std::endl;
 722          }
 723
 724          // Let's compute 'user friendly' results about 'Orientation'
 725          // ---------------------------------------------------------
 726
 727          GDCM_NAME_SPACE::Orientation *o = GDCM_NAME_SPACE::Orientation::New();
 728
 729
 730          if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND ||
 731             strImageOrientationRET     != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 732          {
 733
 734             GDCM_NAME_SPACE::OrientationType orient = o->GetOrientationType( f );
 735
 736             std::cout << "TypeOrientation = " << orient << " (-> "
 737                      << o->GetOrientationTypeString(orient) << " )" << std::endl;
 738          }
 739
 740          std::string ori = o->GetOrientation ( f );
 741          if (ori != "\\" )
 742             std::cout << "Orientation [" << ori << "]" << std::endl;
 743          o->Delete();
 744 }
 745 //-------------------------------
 746
 747          if (f->IsReadable())
 748          {
 749             if (load)  // just to see warning messages at load time !
 750             {
 751                uint8_t *pixels = fh->GetImageData(); (void)pixels;
 752                uint32_t lgth   = fh->GetImageDataSize(); (void)lgth;
 753             }
 754
 755             std::cout <<std::endl<<it->c_str()<<" is Readable"<<std::endl;
 756          }
 757          else
 758             std::cout <<std::endl<<it->c_str()<<" is NOT Readable"<<std::endl;
 759          std::cout << "\n\n" << std::endl;
 760
 761
 762
 763          f->Delete();
 764          fh->Delete();
 765       }
 766       std::cout<<std::flush;
 767    }
 768    return 0;
 769 }