Example/exColorToRGB.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exColorToRGB.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2007/05/23 14:18:05 $
   7   Version:   $Revision: 1.10 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmFileHelper.h"
  21 #include "gdcmDocument.h"
  22 #include "gdcmDataEntry.h"
  23 #include "gdcmSeqEntry.h"
  24
  25 #include <stdlib.h> // for exit
  26
  27 int main(int argc, char *argv[])
  28 {
  29
  30    std::cout << "------------------------------------------------" << std::endl;
  31    std::cout << "Tranforms a full gdcm-readable 'color' Dicom image "
  32           << " (e.g Palette Color, YBR, 3-Planes RGB) "
  33           << " into an 'RGB_Pixels' Dicom Image "
  34           << " "            << std::endl;
  35
  36    if (argc < 3)
  37    {
  38       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  39       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  40       return 1;
  41    }
  42
  43    std::string fileName = argv[1];
  44    std::string output   = argv[2];
  45
  46
  47 // ============================================================
  48 //   Read the input image.
  49 // ============================================================
  50    // a GDCM_NAME_SPACE::File contains all the Dicom Field but the Pixels Element
  51
  52    std::cout << argv[1] << std::endl;
  53
  54    GDCM_NAME_SPACE::File *f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
  55    f->SetLoadMode( GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL);
  56    f->SetFileName( fileName );
  57    bool res = f->Load();
  58
  59    if (!res)
  60    {
  61        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  62                  << "DICOM / ACR File"
  63                  <<std::endl;
  64        f->Delete();
  65        return 0;
  66    }
  67    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  68
  69 /*
  70    if (!f->IsMonochrome())
  71    {
  72        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a 'color' File "
  73                  << " "
  74                  <<std::endl;
  75        f->Delete();
  76        return 0;
  77    }
  78 */
  79
  80 // ============================================================
  81 //   Load the pixels in memory.
  82 // ============================================================
  83
  84    // We need a GDCM_NAME_SPACE::FileHelper, since we want to load the pixels
  85    GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fh = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(f);
  86
  87    // uint8_t DOESN'T mean it's mandatory for the image to be a 8 bits one !
  88    // It's just for prototyping.
  89    // Feel free to cast it.
  90
  91    uint8_t *imageData = fh->GetImageData();
  92
  93    if ( imageData == 0 )
  94    {
  95        std::cerr << "Sorry, Pixels of" << fileName <<"  are not "
  96                  << " gdcm-readable."       << std::endl;
  97        f->Delete();
  98        return 0;
  99    }
 100
 101
 102    // ------ User wants write a new image without shadow groups -------------
 103    // ------                              without Sequences     -------------
 104
 105
 106    GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *copy = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New( );
 107    copy->SetFileName( output );
 108    copy->Load();
 109
 110    GDCM_NAME_SPACE::DocEntry *d = f->GetFirstEntry();
 111    while(d)
 112    {
 113       // We skip SeqEntries, since user cannot do much with them
 114       if ( !(dynamic_cast<GDCM_NAME_SPACE::SeqEntry*>(d))
 115       // We skip Shadow Groups, since nobody knows what they mean
 116            && !( d->GetGroup()%2 ) )
 117       {
 118
 119          if ( GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *de = dynamic_cast<GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *>(d) )
 120          {
 121             copy->GetFile()->InsertEntryBinArea( de->GetBinArea(),de->GetLength(),
 122                                                  de->GetGroup(),de->GetElement(),
 123                                                  de->GetVR() );
 124          }
 125          else
 126          {
 127           // We skip GDCM_NAME_SPACE::SeqEntries
 128          }
 129       }
 130       d = f->GetNextEntry();
 131    }
 132
 133    // User knows the image is a 'color' one -RGB, YBR, Palette Color-
 134    // and wants to write it as RGB
 135    copy->SetImageData(imageData, fh->GetImageDataSize());
 136    copy->SetWriteModeToRGB();
 137
 138    copy->WriteDcmExplVR( output );
 139
 140    f->Delete();
 141    fh->Delete();
 142    copy->Delete();
 143
 144    exit (0);
 145 }
 146