vtk/vtkgdcmViewer.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: vtkgdcmViewer.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2009/11/03 14:05:23 $
   7   Version:   $Revision: 1.32 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18 // This example illustrates how the vtkGdcmReader vtk class can be
  19 // used in order to:
  20 //  * produce a simple (vtk based) Dicom image STACK VIEWER.
  21 //  * dump the stack considered as a volume in a vtkStructuredPoints
  22 //    vtk file: the vtk gdcm wrappers can be seen as a simple way to convert
  23 //    a stack of Dicom images into a native vtk volume.
  24 //
  25 // Usage:
  26 //  * the filenames of the Dicom images constituting the stack should be
  27 //    given as command line arguments,
  28 //  * you can navigate through the stack by hitting any character key,
  29 //  * the produced vtk file is named "foo.vtk" (in the invocation directory).
  30 //
  31 //----------------------------------------------------------------------------
  32 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
  33 #include <vtkImageViewer.h>
  34 #include <vtkStructuredPoints.h>
  35 #include <vtkStructuredPointsWriter.h>
  36 #include <vtkCommand.h>
  37 #include <vtkRenderer.h>
  38 #include <vtkImageMapToColors.h>
  39 #include <vtkLookupTable.h>
  40
  41 #include "vtkGdcmReader.h"
  42 #include "gdcmDocument.h"  // for NO_SHADOWSEQ
  43 #ifndef vtkFloatingPointType
  44 #define vtkFloatingPointType float
  45 #endif
  46
  47 //----------------------------------------------------------------------------
  48 // Callback for the interaction
  49 class vtkgdcmObserver : public vtkCommand
  50 {
  51 public:
  52    virtual char const *GetClassName() const
  53    {
  54       return "vtkgdcmObserver";
  55    }
  56    static vtkgdcmObserver *New()
  57    {
  58       return new vtkgdcmObserver;
  59    }
  60    vtkgdcmObserver()
  61    {
  62       this->ImageViewer = NULL;
  63    }
  64    virtual void Execute(vtkObject *, unsigned long event, void* )
  65    {
  66       if ( this->ImageViewer )
  67       {
  68          if ( event == vtkCommand::CharEvent )
  69          {
  70             int max = ImageViewer->GetWholeZMax();
  71             int slice = (ImageViewer->GetZSlice() + 1 ) % ++max;
  72             ImageViewer->SetZSlice( slice );
  73             ImageViewer->Render();
  74          }
  75       }
  76    }
  77    vtkImageViewer *ImageViewer;
  78 };
  79
  80
  81 int main(int argc, char *argv[])
  82 {
  83    if( argc < 2 )
  84       return 0;
  85
  86    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  87    reader->AllowLookupTableOff();
  88
  89    if( argc == 2 )
  90       reader->SetFileName( argv[1] );
  91    else
  92       for(int i=1; i< argc; i++)
  93          reader->AddFileName( argv[i] );
  94
  95 // TODO : allow user to choose Load Mode
  96    reader->SetLoadMode(GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ);
  97    reader->Update();
  98
  99
 100
 101 std::cout << "[0][0]==========" <<
 102 reader->GetOutput()->GetScalarComponentAsFloat(0,0,0,0) <<
 103 "===================="
 104 << std::endl;
 105 std::cout << "[127][127]==========" <<
 106 reader->GetOutput()->GetScalarComponentAsFloat(0,127,0,0) <<
 107 "===================="
 108 << std::endl;
 109
 110
 111    //print debug info:
 112    reader->GetOutput()->Print( cout );
 113
 114    vtkRenderWindowInteractor *iren = vtkRenderWindowInteractor::New();
 115
 116    vtkImageViewer *viewer = vtkImageViewer::New();
 117
 118    if( reader->GetLookupTable() )
 119    {
 120       //convert to color:
 121       vtkImageMapToColors *map = vtkImageMapToColors::New ();
 122       map->SetInput (reader->GetOutput());
 123       map->SetLookupTable (reader->GetLookupTable());
 124       map->SetOutputFormatToRGB();
 125       viewer->SetInput ( map->GetOutput() );
 126       map->Delete();
 127    }
 128    else
 129    {
 130
 131    // For a single medical image, it would be more efficient to use
 132    // 0028|1050 [DS] [Window Center]
 133    // 0028|1051 [DS] [Window Width]
 134    // but vtkgdcmReader doesn't know about them :-(
 135
 136       vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 137       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 138       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 139
 140       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
 141    }
 142    viewer->SetupInteractor (iren);
 143
 144    //vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 145    //viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 146    //viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 147
 148    // Here is where we setup the observer,
 149    vtkgdcmObserver *obs = vtkgdcmObserver::New();
 150    obs->ImageViewer = viewer;
 151    iren->AddObserver(vtkCommand::CharEvent,obs);
 152    obs->Delete();
 153
 154    //viewer->Render();
 155    iren->Initialize();
 156    iren->Start();
 157
 158    //if you wish you can export dicom to a vtk file
 159
 160    vtkStructuredPointsWriter *writer = vtkStructuredPointsWriter::New();
 161    writer->SetInput( reader->GetOutput());
 162    writer->SetFileName( "foo.vtk" );
 163    writer->SetFileTypeToBinary();
 164    //writer->Write();
 165
 166 std::cout << "==========" << std::endl;
 167
 168 std::cout << "==========" <<
 169 reader->GetOutput()->GetScalarComponentAsFloat(0,0,0,0) <<
 170 "===================="
 171 << std::endl;
 172
 173
 174
 175    reader->Delete();
 176    iren->Delete();
 177    viewer->Delete();
 178    writer->Delete();
 179
 180    return 0;
 181 }