]> Creatis software - gdcm.git/commitdiff
Avoid 'deprecated' warnings with Doxygen 1.5
authorjpr <jpr>
Wed, 13 Feb 2008 19:07:13 +0000 (19:07 +0000)
committerjpr <jpr>
Wed, 13 Feb 2008 19:07:13 +0000 (19:07 +0000)
Doc/doxygen.config.in

index 8103cd5d968bc50c320c6bb2b92d116f744d5a98..a40c74ef8116751c504d9becf1f3adf5393df2da 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-# Doxyfile 1.2.14
+# Doxyfile 1.5.2
 
 # This file describes the settings to be used by the documentation system
 # doxygen (www.doxygen.org) for a project
 # Values that contain spaces should be placed between quotes (" ")
 
 #---------------------------------------------------------------------------
-# General configuration options
+# Project related configuration options
 #---------------------------------------------------------------------------
+# This tag specifies the encoding used for all characters in the config file that 
+# follow. The default is UTF-8 which is also the encoding used for all text before 
+# the first occurrence of this tag. Doxygen uses libiconv (or the iconv built into 
+# libc) for the transcoding. See http://www.gnu.org/software/libiconv for the list of 
+# possible encodings.
+
+DOXYFILE_ENCODING      = UTF-8
 
 # The PROJECT_NAME tag is a single word (or a sequence of words surrounded 
 # by quotes) that should identify the project.
@@ -32,15 +39,190 @@ PROJECT_NUMBER         = @GDCM_MAJOR_VERSION@.@GDCM_MINOR_VERSION@.@GDCM_BUILD_V
 
 OUTPUT_DIRECTORY       = @GDCM_BINARY_DIR@/Doc/
 
+# If the CREATE_SUBDIRS tag is set to YES, then doxygen will create 
+# 4096 sub-directories (in 2 levels) under the output directory of each output 
+# format and will distribute the generated files over these directories. 
+# Enabling this option can be useful when feeding doxygen a huge amount of 
+# source files, where putting all generated files in the same directory would 
+# otherwise cause performance problems for the file system.
+
+CREATE_SUBDIRS         = NO
+
 # The OUTPUT_LANGUAGE tag is used to specify the language in which all 
 # documentation generated by doxygen is written. Doxygen will use this 
 # information to generate all constant output in the proper language. 
 # The default language is English, other supported languages are: 
-# Brazilian, Chinese, Croatian, Czech, Danish, Dutch, Finnish, French, 
-# German, Greek, Hungarian, Italian, Japanese, Korean, Norwegian, Polish, 
-# Portuguese, Romanian, Russian, Slovak, Slovene, Spanish and Swedish.
+# Afrikaans, Arabic, Brazilian, Catalan, Chinese, Chinese-Traditional, 
+# Croatian, Czech, Danish, Dutch, Finnish, French, German, Greek, Hungarian, 
+# Italian, Japanese, Japanese-en (Japanese with English messages), Korean, 
+# Korean-en, Lithuanian, Norwegian, Polish, Portuguese, Romanian, Russian, 
+# Serbian, Slovak, Slovene, Spanish, Swedish, and Ukrainian.
 
 OUTPUT_LANGUAGE        = English
+# If the BRIEF_MEMBER_DESC tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# include brief member descriptions after the members that are listed in 
+# the file and class documentation (similar to JavaDoc). 
+# Set to NO to disable this.
+
+BRIEF_MEMBER_DESC      = YES
+
+# If the REPEAT_BRIEF tag is set to YES (the default) Doxygen will prepend 
+# the brief description of a member or function before the detailed description. 
+# Note: if both HIDE_UNDOC_MEMBERS and BRIEF_MEMBER_DESC are set to NO, the 
+# brief descriptions will be completely suppressed.
+
+REPEAT_BRIEF           = YES
+
+# This tag implements a quasi-intelligent brief description abbreviator 
+# that is used to form the text in various listings. Each string 
+# in this list, if found as the leading text of the brief description, will be 
+# stripped from the text and the result after processing the whole list, is 
+# used as the annotated text. Otherwise, the brief description is used as-is. 
+# If left blank, the following values are used ("$name" is automatically 
+# replaced with the name of the entity): "The $name class" "The $name widget" 
+# "The $name file" "is" "provides" "specifies" "contains" 
+# "represents" "a" "an" "the"
+
+ABBREVIATE_BRIEF       = 
+
+# If the ALWAYS_DETAILED_SEC and REPEAT_BRIEF tags are both set to YES then 
+# Doxygen will generate a detailed section even if there is only a brief 
+# description.
+
+ALWAYS_DETAILED_SEC    = NO
+
+# If the INLINE_INHERITED_MEMB tag is set to YES, doxygen will show all 
+# inherited members of a class in the documentation of that class as if those 
+# members were ordinary class members. Constructors, destructors and assignment 
+# operators of the base classes will not be shown.
+
+INLINE_INHERITED_MEMB  = YES
+
+# If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then Doxygen will prepend the full 
+# path before files name in the file list and in the header files. If set 
+# to NO the shortest path that makes the file name unique will be used.
+
+FULL_PATH_NAMES        = NO
+
+# If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then the STRIP_FROM_PATH tag 
+# can be used to strip a user-defined part of the path. Stripping is 
+# only done if one of the specified strings matches the left-hand part of 
+# the path. The tag can be used to show relative paths in the file list. 
+# If left blank the directory from which doxygen is run is used as the 
+# path to strip.
+
+STRIP_FROM_PATH        = 
+
+# The STRIP_FROM_INC_PATH tag can be used to strip a user-defined part of 
+# the path mentioned in the documentation of a class, which tells 
+# the reader which header file to include in order to use a class. 
+# If left blank only the name of the header file containing the class 
+# definition is used. Otherwise one should specify the include paths that 
+# are normally passed to the compiler using the -I flag.
+
+STRIP_FROM_INC_PATH    = 
+
+# If the SHORT_NAMES tag is set to YES, doxygen will generate much shorter 
+# (but less readable) file names. This can be useful is your file systems 
+# doesn't support long names like on DOS, Mac, or CD-ROM.
+
+SHORT_NAMES            = NO
+
+# If the JAVADOC_AUTOBRIEF tag is set to YES then Doxygen 
+# will interpret the first line (until the first dot) of a JavaDoc-style 
+# comment as the brief description. If set to NO, the JavaDoc 
+# comments will behave just like the Qt-style comments (thus requiring an 
+# explicit @brief command for a brief description.
+
+JAVADOC_AUTOBRIEF      = NO
+
+# The MULTILINE_CPP_IS_BRIEF tag can be set to YES to make Doxygen 
+# treat a multi-line C++ special comment block (i.e. a block of //! or /// 
+# comments) as a brief description. This used to be the default behaviour. 
+# The new default is to treat a multi-line C++ comment block as a detailed 
+# description. Set this tag to YES if you prefer the old behaviour instead.
+
+MULTILINE_CPP_IS_BRIEF = NO
+
+# If the DETAILS_AT_TOP tag is set to YES then Doxygen 
+# will output the detailed description near the top, like JavaDoc.
+# If set to NO, the detailed description appears after the member 
+# documentation.
+
+DETAILS_AT_TOP         = NO
+
+# If the INHERIT_DOCS tag is set to YES (the default) then an undocumented 
+# member inherits the documentation from any documented member that it 
+# re-implements.
+
+INHERIT_DOCS           = YES
+
+# If the SEPARATE_MEMBER_PAGES tag is set to YES, then doxygen will produce 
+# a new page for each member. If set to NO, the documentation of a member will 
+# be part of the file/class/namespace that contains it.
+
+SEPARATE_MEMBER_PAGES  = NO
+
+# The TAB_SIZE tag can be used to set the number of spaces in a tab. 
+# Doxygen uses this value to replace tabs by spaces in code fragments.
+
+TAB_SIZE               = 8
+
+# This tag can be used to specify a number of aliases that acts 
+# as commands in the documentation. An alias has the form "name=value". 
+# For example adding "sideeffect=\par Side Effects:\n" will allow you to 
+# put the command \sideeffect (or @sideeffect) in the documentation, which 
+# will result in a user-defined paragraph with heading "Side Effects:". 
+# You can put \n's in the value part of an alias to insert newlines.
+
+ALIASES                = 
+
+# Set the OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C tag to YES if your project consists of C 
+# sources only. Doxygen will then generate output that is more tailored for C. 
+# For instance, some of the names that are used will be different. The list 
+# of all members will be omitted, etc.
+
+OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C  = NO
+
+# Set the OPTIMIZE_OUTPUT_JAVA tag to YES if your project consists of Java 
+# sources only. Doxygen will then generate output that is more tailored for Java. 
+# For instance, namespaces will be presented as packages, qualified scopes 
+# will look different, etc.
+
+OPTIMIZE_OUTPUT_JAVA   = NO
+
+# If you use STL classes (i.e. std::string, std::vector, etc.) but do not want to 
+# include (a tag file for) the STL sources as input, then you should 
+# set this tag to YES in order to let doxygen match functions declarations and 
+# definitions whose arguments contain STL classes (e.g. func(std::string); v.s. 
+# func(std::string) {}). This also make the inheritance and collaboration 
+# diagrams that involve STL classes more complete and accurate.
+
+BUILTIN_STL_SUPPORT    = NO
+
+# If you use Microsoft's C++/CLI language, you should set this option to YES to
+# enable parsing support.
+
+CPP_CLI_SUPPORT        = NO
+
+# If member grouping is used in the documentation and the DISTRIBUTE_GROUP_DOC 
+# tag is set to YES, then doxygen will reuse the documentation of the first 
+# member in the group (if any) for the other members of the group. By default 
+# all members of a group must be documented explicitly.
+
+DISTRIBUTE_GROUP_DOC   = NO
+
+# Set the SUBGROUPING tag to YES (the default) to allow class member groups of 
+# the same type (for instance a group of public functions) to be put as a 
+# subgroup of that type (e.g. under the Public Functions section). Set it to 
+# NO to prevent subgrouping. Alternatively, this can be done per class using 
+# the \nosubgrouping command.
+
+SUBGROUPING            = YES
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# Build related configuration options
+#---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the EXTRACT_ALL tag is set to YES doxygen will assume all entities in 
 # documentation are documented, even if no documentation was available. 
@@ -64,6 +246,12 @@ EXTRACT_STATIC         = YES
 # If set to NO only classes defined in header files are included.
 
 EXTRACT_LOCAL_CLASSES  = YES
+# This flag is only useful for Objective-C code. When set to YES local 
+# methods, which are defined in the implementation section but not in 
+# the interface are included in the documentation. 
+# If set to NO (the default) only methods in the interface are included.
+
+EXTRACT_LOCAL_METHODS  = NO
 
 # If the HIDE_UNDOC_MEMBERS tag is set to YES, Doxygen will hide all 
 # undocumented members of documented classes, files or namespaces. 
@@ -75,50 +263,24 @@ HIDE_UNDOC_MEMBERS     = NO
 
 # If the HIDE_UNDOC_CLASSES tag is set to YES, Doxygen will hide all 
 # undocumented classes that are normally visible in the class hierarchy. 
-# If set to NO (the default) these class will be included in the various 
+# If set to NO (the default) these classes will be included in the various 
 # overviews. This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled.
 
 HIDE_UNDOC_CLASSES     = NO
 
-# If the BRIEF_MEMBER_DESC tag is set to YES (the default) Doxygen will 
-# include brief member descriptions after the members that are listed in 
-# the file and class documentation (similar to JavaDoc). 
-# Set to NO to disable this.
+# If the HIDE_FRIEND_COMPOUNDS tag is set to YES, Doxygen will hide all 
+# friend (class|struct|union) declarations. 
+# If set to NO (the default) these declarations will be included in the 
+# documentation.
 
-BRIEF_MEMBER_DESC      = YES
+HIDE_FRIEND_COMPOUNDS  = NO
 
-# If the REPEAT_BRIEF tag is set to YES (the default) Doxygen will prepend 
-# the brief description of a member or function before the detailed description. 
-# Note: if both HIDE_UNDOC_MEMBERS and BRIEF_MEMBER_DESC are set to NO, the 
-# brief descriptions will be completely suppressed.
-
-REPEAT_BRIEF           = YES
-
-# If the ALWAYS_DETAILED_SEC and REPEAT_BRIEF tags are both set to YES then 
-# Doxygen will generate a detailed section even if there is only a brief 
-# description.
-
-ALWAYS_DETAILED_SEC    = NO
+# If the HIDE_IN_BODY_DOCS tag is set to YES, Doxygen will hide any 
+# documentation blocks found inside the body of a function. 
+# If set to NO (the default) these blocks will be appended to the 
+# function's detailed documentation block.
 
-# If the INLINE_INHERITED_MEMB tag is set to YES, doxygen will show all inherited 
-# members of a class in the documentation of that class as if those members were 
-# ordinary class members. Constructors, destructors and assignment operators of 
-# the base classes will not be shown.
-
-INLINE_INHERITED_MEMB  = YES
-
-# If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then Doxygen will prepend the full 
-# path before files name in the file list and in the header files. If set 
-# to NO the shortest path that makes the file name unique will be used.
-
-FULL_PATH_NAMES        = NO
-
-# If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then the STRIP_FROM_PATH tag 
-# can be used to strip a user defined part of the path. Stripping is 
-# only done if one of the specified strings matches the left-hand part of 
-# the path. It is allowed to use relative paths in the argument list.
-
-STRIP_FROM_PATH        = 
+HIDE_IN_BODY_DOCS      = NO
 
 # The INTERNAL_DOCS tag determines if documentation 
 # that is typed after a \internal command is included. If the tag is set 
@@ -127,25 +289,15 @@ STRIP_FROM_PATH        =
 
 INTERNAL_DOCS          = NO
 
-# Setting the STRIP_CODE_COMMENTS tag to YES (the default) will instruct 
-# doxygen to hide any special comment blocks from generated source code 
-# fragments. Normal C and C++ comments will always remain visible.
-
-STRIP_CODE_COMMENTS    = YES
 
 # If the CASE_SENSE_NAMES tag is set to NO then Doxygen will only generate 
-# file names in lower case letters. If set to YES upper case letters are also 
+# file names in lower-case letters. If set to YES upper-case letters are also 
 # allowed. This is useful if you have classes or files whose names only differ 
 # in case and if your file system supports case sensitive file names. Windows 
-# users are adviced to set this option to NO.
+# and Mac users are advised to set this option to NO.
 
 CASE_SENSE_NAMES       = YES
 
-# If the SHORT_NAMES tag is set to YES, doxygen will generate much shorter 
-# (but less readable) file names. This can be useful is your file systems 
-# doesn't support long names like on DOS, Mac, or CD-ROM.
-
-SHORT_NAMES            = NO
 
 # If the HIDE_SCOPE_NAMES tag is set to NO (the default) then Doxygen 
 # will show members with their full class and namespace scopes in the 
@@ -153,32 +305,13 @@ SHORT_NAMES            = NO
 
 HIDE_SCOPE_NAMES       = NO
 
-# If the VERBATIM_HEADERS tag is set to YES (the default) then Doxygen 
-# will generate a verbatim copy of the header file for each class for 
-# which an include is specified. Set to NO to disable this.
-
-VERBATIM_HEADERS       = YES
 
 # If the SHOW_INCLUDE_FILES tag is set to YES (the default) then Doxygen 
-# will put list of the files that are included by a file in the documentation 
+# will put list of the files that are included by a file in the documentation 
 # of that file.
 
 SHOW_INCLUDE_FILES     = YES
 
-# If the JAVADOC_AUTOBRIEF tag is set to YES then Doxygen 
-# will interpret the first line (until the first dot) of a JavaDoc-style 
-# comment as the brief description. If set to NO, the JavaDoc 
-# comments  will behave just like the Qt-style comments (thus requiring an 
-# explict @brief command for a brief description.
-
-JAVADOC_AUTOBRIEF      = NO
-
-# If the INHERIT_DOCS tag is set to YES (the default) then an undocumented 
-# member inherits the documentation from any documented member that it 
-# reimplements.
-
-INHERIT_DOCS           = YES
-
 # If the INLINE_INFO tag is set to YES (the default) then a tag [inline] 
 # is inserted in the documentation for inline members.
 
@@ -191,17 +324,22 @@ INLINE_INFO            = YES
 
 SORT_MEMBER_DOCS       = YES
 
-# If member grouping is used in the documentation and the DISTRIBUTE_GROUP_DOC 
-# tag is set to YES, then doxygen will reuse the documentation of the first 
-# member in the group (if any) for the other members of the group. By default 
-# all members of a group must be documented explicitly.
+# If the SORT_BRIEF_DOCS tag is set to YES then doxygen will sort the 
+# brief documentation of file, namespace and class members alphabetically 
+# by member name. If set to NO (the default) the members will appear in 
+# declaration order.
 
-DISTRIBUTE_GROUP_DOC   = NO
+SORT_BRIEF_DOCS        = NO
 
-# The TAB_SIZE tag can be used to set the number of spaces in a tab. 
-# Doxygen uses this value to replace tabs by spaces in code fragments.
+# If the SORT_BY_SCOPE_NAME tag is set to YES, the class list will be 
+# sorted by fully-qualified names, including namespaces. If set to 
+# NO (the default), the class list will be sorted only by class name, 
+# not including the namespace part. 
+# Note: This option is not very useful if HIDE_SCOPE_NAMES is set to YES.
+# Note: This option applies only to the class list, not to the 
+# alphabetical list.
 
-TAB_SIZE               = 8
+SORT_BY_SCOPE_NAME     = NO
 
 # The GENERATE_TODOLIST tag can be used to enable (YES) or 
 # disable (NO) the todo list. This list is created by putting \todo 
@@ -221,14 +359,11 @@ GENERATE_TESTLIST      = YES
 
 GENERATE_BUGLIST       = YES
 
-# This tag can be used to specify a number of aliases that acts 
-# as commands in the documentation. An alias has the form "name=value". 
-# For example adding "sideeffect=\par Side Effects:\n" will allow you to 
-# put the command \sideeffect (or @sideeffect) in the documentation, which 
-# will result in a user defined paragraph with heading "Side Effects:". 
-# You can put \n's in the value part of an alias to insert newlines.
+# The GENERATE_DEPRECATEDLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the deprecated list. This list is created by putting 
+# \deprecated commands in the documentation.
 
-ALIASES                = 
+GENERATE_DEPRECATEDLIST= YES
 
 # The ENABLED_SECTIONS tag can be used to enable conditional 
 # documentation sections, marked by \if sectionname ... \endif.
@@ -236,7 +371,7 @@ ALIASES                =
 ENABLED_SECTIONS       = 
 
 # The MAX_INITIALIZER_LINES tag determines the maximum number of lines 
-# the initial value of a variable or define consist of for it to appear in 
+# the initial value of a variable or define consists of for it to appear in 
 # the documentation. If the initializer consists of more lines than specified 
 # here it will be hidden. Use a value of 0 to hide initializers completely. 
 # The appearance of the initializer of individual variables and defines in the 
@@ -245,19 +380,28 @@ ENABLED_SECTIONS       =
 
 MAX_INITIALIZER_LINES  = 30
 
-# Set the OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C tag to YES if your project consists of C sources 
-# only. Doxygen will then generate output that is more tailored for C. 
-# For instance some of the names that are used will be different. The list 
-# of all members will be omitted, etc.
-
-OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C  = NO
-
 # Set the SHOW_USED_FILES tag to NO to disable the list of files generated 
 # at the bottom of the documentation of classes and structs. If set to YES the 
 # list will mention the files that were used to generate the documentation.
 
 SHOW_USED_FILES        = YES
 
+# If the sources in your project are distributed over multiple directories 
+# then setting the SHOW_DIRECTORIES tag to YES will show the directory hierarchy 
+# in the documentation. The default is NO.
+
+SHOW_DIRECTORIES       = NO
+
+# The FILE_VERSION_FILTER tag can be used to specify a program or script that 
+# doxygen should invoke to get the current version for each file (typically from the 
+# version control system). Doxygen will invoke the program by executing (via 
+# popen()) the command <command> <input-file>, where <command> is the value of 
+# the FILE_VERSION_FILTER tag, and <input-file> is the name of an input file 
+# provided by doxygen. Whatever the program writes to standard output 
+# is used as the file version. See the manual for examples.
+
+FILE_VERSION_FILTER    = 
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # configuration options related to warning and progress messages
 #---------------------------------------------------------------------------
@@ -279,10 +423,27 @@ WARNINGS               = YES
 
 WARN_IF_UNDOCUMENTED   = YES
 
+# If WARN_IF_DOC_ERROR is set to YES, doxygen will generate warnings for 
+# potential errors in the documentation, such as not documenting some 
+# parameters in a documented function, or documenting parameters that 
+# don't exist or using markup commands wrongly.
+
+WARN_IF_DOC_ERROR      = YES
+
+# This WARN_NO_PARAMDOC option can be abled to get warnings for 
+# functions that are documented, but have no documentation for their parameters 
+# or return value. If set to NO (the default) doxygen will only warn about 
+# wrong or incomplete parameter documentation, but not about the absence of 
+# documentation.
+
+WARN_NO_PARAMDOC       = NO
+
 # The WARN_FORMAT tag determines the format of the warning messages that 
 # doxygen can produce. The string should contain the $file, $line, and $text 
 # tags, which will be replaced by the file and line number from which the 
-# warning originated and the warning text.
+# warning originated and the warning text. Optionally the format may contain 
+# $version, which will be replaced by the version of the file (if it could 
+# be obtained via FILE_VERSION_FILTER)
 
 WARN_FORMAT            = "$file:$line: $text"
 
@@ -301,16 +462,24 @@ WARN_LOGFILE           =
 # directories like "/usr/src/myproject". Separate the files or directories 
 # with spaces.
 
-INPUT  = @GDCM_DOCUMENTATION_INPUT@
+INPUT                  = @GDCM_DOCUMENTATION_INPUT@
+
+# This tag can be used to specify the character encoding of the source files that 
+# doxygen parses. Internally doxygen uses the UTF-8 encoding, which is also the default 
+# input encoding. Doxygen uses libiconv (or the iconv built into libc) for the transcoding. 
+# See http://www.gnu.org/software/libiconv for the list of possible encodings.
+
+INPUT_ENCODING         = UTF-8
 
 # If the value of the INPUT tag contains directories, you can use the 
 # FILE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
 # and *.h) to filter out the source-files in the directories. If left 
 # blank the following patterns are tested: 
-# *.c *.cc *.cxx *.cpp *.c++ *.java *.ii *.ixx *.ipp *.i++ *.inl *.h *.hh *.hxx *.hpp 
-# *.h++ *.idl *.odl
+# *.c *.cc *.cxx *.cpp *.c++ *.java *.ii *.ixx *.ipp *.i++ *.inl *.h *.hh *.hxx 
+# *.hpp *.h++ *.idl *.odl *.cs *.php *.php3 *.inc *.m *.mm *.py
 
-FILE_PATTERNS          = *.h *.cxx
+FILE_PATTERNS          = *.h \
+                         *.cxx
 
 # The RECURSIVE tag can be used to turn specify whether or not subdirectories 
 # should be searched for input files as well. Possible values are YES and NO. 
@@ -324,29 +493,43 @@ RECURSIVE              = NO
 
 EXCLUDE                = @GDCM_DOCUMENTATION_EXCLUDE@
 
-# The EXCLUDE_SYMLINKS tag can be used select whether or not files or directories 
-# that are symbolic links (a Unix filesystem feature) are excluded from the input.
+# The EXCLUDE_SYMLINKS tag can be used select whether or not files or 
+# directories that are symbolic links (a Unix filesystem feature) are excluded 
+# from the input.
 
 EXCLUDE_SYMLINKS       = NO
 
 # If the value of the INPUT tag contains directories, you can use the 
 # EXCLUDE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard patterns to exclude 
-# certain files from those directories.
+# certain files from those directories. Note that the wildcards are matched 
+# against the file with absolute path, so to exclude all test directories 
+# for example use the pattern */test/*
 
 EXCLUDE_PATTERNS       = 
 
+# The EXCLUDE_SYMBOLS tag can be used to specify one or more symbol names 
+# (namespaces, classes, functions, etc.) that should be excluded from the output. 
+# The symbol name can be a fully qualified name, a word, or if the wildcard * is used, 
+# a substring. Examples: ANamespace, AClass, AClass::ANamespace, ANamespace::*Test
+
+EXCLUDE_SYMBOLS        = 
+
 # The EXAMPLE_PATH tag can be used to specify one or more files or 
 # directories that contain example code fragments that are included (see 
 # the \include command).
 
-EXAMPLE_PATH = @GDCM_SOURCE_DIR@/Example @GDCM_SOURCE_DIR@/Testing @GDCM_SOURCE_DIR@/gdcmPython/demo @GDCM_SOURCE_DIR@/vtk
+EXAMPLE_PATH           = @GDCM_SOURCE_DIR@/Example \
+                         @GDCM_SOURCE_DIR@/Testing \
+                         @GDCM_SOURCE_DIR@/gdcmPython/demo \
+                         @GDCM_SOURCE_DIR@/vtk
 
 # If the value of the EXAMPLE_PATH tag contains directories, you can use the 
 # EXAMPLE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
 # and *.h) to filter out the source-files in the directories. If left 
 # blank all files are included.
 
-EXAMPLE_PATTERNS       = *.py *.cxx
+EXAMPLE_PATTERNS       = *.py \
+                         *.cxx
 
 # If the EXAMPLE_RECURSIVE tag is set to YES then subdirectories will be 
 # searched for input files to be used with the \include or \dontinclude 
@@ -366,13 +549,22 @@ IMAGE_PATH             =
 # by executing (via popen()) the command <filter> <input-file>, where <filter> 
 # is the value of the INPUT_FILTER tag, and <input-file> is the name of an 
 # input file. Doxygen will then use the output that the filter program writes 
-# to standard output.
+# to standard output.  If FILTER_PATTERNS is specified, this tag will be 
+# ignored.
 
 INPUT_FILTER           = 
+# The FILTER_PATTERNS tag can be used to specify filters on a per file pattern 
+# basis.  Doxygen will compare the file name with each pattern and apply the 
+# filter if there is a match.  The filters are a list of the form: 
+# pattern=filter (like *.cpp=my_cpp_filter). See INPUT_FILTER for further 
+# info on how filters are used. If FILTER_PATTERNS is empty, INPUT_FILTER 
+# is applied to all files.
+
+FILTER_PATTERNS        = 
 
 # If the FILTER_SOURCE_FILES tag is set to YES, the input filter (if set using 
 # INPUT_FILTER) will be used to filter the input files when producing source 
-# files to browse.
+# files to browse (i.e. when SOURCE_BROWSER is set to YES).
 
 FILTER_SOURCE_FILES    = NO
 
@@ -381,7 +573,9 @@ FILTER_SOURCE_FILES    = NO
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the SOURCE_BROWSER tag is set to YES then a list of source files will 
-# be generated. Documented entities will be cross-referenced with these sources.
+# be generated. Documented entities will be cross-referenced with these sources. 
+# Note: To get rid of all source code in the generated output, make sure also 
+# VERBATIM_HEADERS is set to NO.
 
 SOURCE_BROWSER         = YES
 
@@ -389,6 +583,11 @@ SOURCE_BROWSER         = YES
 # of functions and classes directly in the documentation.
 
 INLINE_SOURCES         = YES
+# Setting the STRIP_CODE_COMMENTS tag to YES (the default) will instruct 
+# doxygen to hide any special comment blocks from generated source code 
+# fragments. Normal C and C++ comments will always remain visible.
+
+STRIP_CODE_COMMENTS    = YES
 
 # If the REFERENCED_BY_RELATION tag is set to YES (the default) 
 # then for each documented function all documented 
@@ -402,6 +601,27 @@ REFERENCED_BY_RELATION = YES
 
 REFERENCES_RELATION    = YES
 
+# If the REFERENCES_LINK_SOURCE tag is set to YES (the default)
+# and SOURCE_BROWSER tag is set to YES, then the hyperlinks from
+# functions in REFERENCES_RELATION and REFERENCED_BY_RELATION lists will
+# link to the source code.  Otherwise they will link to the documentstion.
+
+REFERENCES_LINK_SOURCE = YES
+
+# If the USE_HTAGS tag is set to YES then the references to source code 
+# will point to the HTML generated by the htags(1) tool instead of doxygen 
+# built-in source browser. The htags tool is part of GNU's global source 
+# tagging system (see http://www.gnu.org/software/global/global.html). You 
+# will need version 4.8.6 or higher.
+
+USE_HTAGS              = NO
+
+# If the VERBATIM_HEADERS tag is set to YES (the default) then Doxygen 
+# will generate a verbatim copy of the header file for each class for 
+# which an include is specified. Set to NO to disable this.
+
+VERBATIM_HEADERS       = YES
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # configuration options related to the alphabetical class index
 #---------------------------------------------------------------------------
@@ -458,10 +678,12 @@ HTML_HEADER            =
 
 HTML_FOOTER            = 
 
-# The HTML_STYLESHEET tag can be used to specify a user defined cascading 
+# The HTML_STYLESHEET tag can be used to specify a user-defined cascading 
 # style sheet that is used by each HTML page. It can be used to 
 # fine-tune the look of the HTML output. If the tag is left blank doxygen 
-# will generate a default style sheet
+# will generate a default style sheet. Note that doxygen will try to copy 
+# the style sheet file to the HTML output directory, so don't put your own 
+# stylesheet in the HTML output directory as well, or it will be erased!
 
 HTML_STYLESHEET        = 
 
@@ -478,6 +700,20 @@ HTML_ALIGN_MEMBERS     = YES
 
 GENERATE_HTMLHELP      = NO
 
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the CHM_FILE tag can 
+# be used to specify the file name of the resulting .chm file. You 
+# can add a path in front of the file if the result should not be 
+# written to the html output directory.
+
+CHM_FILE               = 
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the HHC_LOCATION tag can 
+# be used to specify the location (absolute path including file name) of 
+# the HTML help compiler (hhc.exe). If non-empty doxygen will try to run 
+# the HTML help compiler on the generated index.hhp.
+
+HHC_LOCATION           = 
+
 # If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the GENERATE_CHI flag 
 # controls if a separate .chi index file is generated (YES) or that 
 # it should be included in the master .chm file (NO).
@@ -491,7 +727,7 @@ GENERATE_CHI           = NO
 BINARY_TOC             = NO
 
 # The TOC_EXPAND flag can be set to YES to add extra items for group members 
-# to the contents of the Html help documentation and to the tree view.
+# to the contents of the HTML help documentation and to the tree view.
 
 TOC_EXPAND             = NO
 
@@ -509,10 +745,9 @@ ENUM_VALUES_PER_LINE   = 4
 # If the GENERATE_TREEVIEW tag is set to YES, a side panel will be
 # generated containing a tree-like index structure (just like the one that 
 # is generated for HTML Help). For this to work a browser that supports 
-# JavaScript and frames is required (for instance Mozilla, Netscape 4.0+, 
-# or Internet explorer 4.0+). Note that for large projects the tree generation 
-# can take a very long time. In such cases it is better to disable this feature. 
-# Windows users are probably better off using the HTML help feature.
+# JavaScript, DHTML, CSS and frames is required (for instance Mozilla 1.0+, 
+# Netscape 6.0+, Internet explorer 5.0+, or Konqueror). Windows users are 
+# probably better off using the HTML help feature.
 
 GENERATE_TREEVIEW      = NO
 
@@ -536,6 +771,16 @@ GENERATE_LATEX         = NO
 # put in front of it. If left blank `latex' will be used as the default path.
 
 LATEX_OUTPUT           = latex
+# The LATEX_CMD_NAME tag can be used to specify the LaTeX command name to be 
+# invoked. If left blank `latex' will be used as the default command name.
+
+LATEX_CMD_NAME         = latex
+
+# The MAKEINDEX_CMD_NAME tag can be used to specify the command name to 
+# generate index for LaTeX. If left blank `makeindex' will be used as the 
+# default command name.
+
+MAKEINDEX_CMD_NAME     = makeindex
 
 # If the COMPACT_LATEX tag is set to YES Doxygen generates more compact 
 # LaTeX documents. This may be useful for small projects and may help to 
@@ -581,12 +826,18 @@ USE_PDFLATEX           = NO
 
 LATEX_BATCHMODE        = NO
 
+# If LATEX_HIDE_INDICES is set to YES then doxygen will not 
+# include the index chapters (such as File Index, Compound Index, etc.) 
+# in the output.
+
+LATEX_HIDE_INDICES     = NO
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # configuration options related to the RTF output
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the GENERATE_RTF tag is set to YES Doxygen will generate RTF output 
-# The RTF output is optimised for Word 97 and may not look very pretty with 
+# The RTF output is optimized for Word 97 and may not look very pretty with 
 # other RTF readers or editors.
 
 GENERATE_RTF           = NO
@@ -613,7 +864,7 @@ COMPACT_RTF            = NO
 RTF_HYPERLINKS         = NO
 
 # Load stylesheet definitions from file. Syntax is similar to doxygen's 
-# config file, i.e. a series of assigments. You only have to provide 
+# config file, i.e. a series of assignments. You only have to provide 
 # replacements, missing definitions are set to their default value.
 
 RTF_STYLESHEET_FILE    = 
@@ -657,12 +908,35 @@ MAN_LINKS              = NO
 
 # If the GENERATE_XML tag is set to YES Doxygen will 
 # generate an XML file that captures the structure of 
-# the code including all documentation. Note that this 
-# feature is still experimental and incomplete at the 
-# moment.
+# the code including all documentation.
 
 GENERATE_XML           = NO
 
+# The XML_OUTPUT tag is used to specify where the XML pages will be put. 
+# If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
+# put in front of it. If left blank `xml' will be used as the default path.
+
+XML_OUTPUT             = xml
+
+# The XML_SCHEMA tag can be used to specify an XML schema, 
+# which can be used by a validating XML parser to check the 
+# syntax of the XML files.
+
+XML_SCHEMA             = 
+
+# The XML_DTD tag can be used to specify an XML DTD, 
+# which can be used by a validating XML parser to check the 
+# syntax of the XML files.
+
+XML_DTD                = 
+
+# If the XML_PROGRAMLISTING tag is set to YES Doxygen will 
+# dump the program listings (including syntax highlighting 
+# and cross-referencing information) to the XML output. Note that 
+# enabling this will significantly increase the size of the XML output.
+
+XML_PROGRAMLISTING     = YES
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # configuration options for the AutoGen Definitions output
 #---------------------------------------------------------------------------
@@ -675,6 +949,39 @@ GENERATE_XML           = NO
 
 GENERATE_AUTOGEN_DEF   = NO
 
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the Perl module output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_PERLMOD tag is set to YES Doxygen will 
+# generate a Perl module file that captures the structure of 
+# the code including all documentation. Note that this 
+# feature is still experimental and incomplete at the 
+# moment.
+
+GENERATE_PERLMOD       = NO
+
+# If the PERLMOD_LATEX tag is set to YES Doxygen will generate 
+# the necessary Makefile rules, Perl scripts and LaTeX code to be able 
+# to generate PDF and DVI output from the Perl module output.
+
+PERLMOD_LATEX          = NO
+
+# If the PERLMOD_PRETTY tag is set to YES the Perl module output will be 
+# nicely formatted so it can be parsed by a human reader.  This is useful 
+# if you want to understand what is going on.  On the other hand, if this 
+# tag is set to NO the size of the Perl module output will be much smaller 
+# and Perl will parse it just the same.
+
+PERLMOD_PRETTY         = YES
+
+# The names of the make variables in the generated doxyrules.make file 
+# are prefixed with the string contained in PERLMOD_MAKEVAR_PREFIX. 
+# This is useful so different doxyrules.make files included by the same 
+# Makefile don't overwrite each other's variables.
+
+PERLMOD_MAKEVAR_PREFIX = 
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # Configuration options related to the preprocessor   
 #---------------------------------------------------------------------------
@@ -694,7 +1001,7 @@ MACRO_EXPANSION        = NO
 
 # If the EXPAND_ONLY_PREDEF and MACRO_EXPANSION tags are both set to YES 
 # then the macro expansion is limited to the macros specified with the 
-# PREDEFINED and EXPAND_AS_PREDEFINED tags.
+# PREDEFINED and EXPAND_AS_DEFINED tags.
 
 EXPAND_ONLY_PREDEF     = NO
 
@@ -720,11 +1027,13 @@ INCLUDE_FILE_PATTERNS  =
 # are defined before the preprocessor is started (similar to the -D option of 
 # gcc). The argument of the tag is a list of macros of the form: name 
 # or name=definition (no spaces). If the definition and the = are 
-# omitted =1 is assumed.
+# omitted =1 is assumed. To prevent a macro definition from being 
+# undefined via #undef or recursively expanded use the := operator 
+# instead of the = operator.
 
 PREDEFINED             = 
 
-# If the MACRO_EXPANSION and EXPAND_PREDEF_ONLY tags are set to YES then 
+# If the MACRO_EXPANSION and EXPAND_ONLY_PREDEF tags are set to YES then 
 # this tag can be used to specify a list of macro names that should be expanded. 
 # The macro definition that is found in the sources will be used. 
 # Use the PREDEFINED tag if you want to use a different macro definition.
@@ -733,16 +1042,30 @@ EXPAND_AS_DEFINED      =
 
 # If the SKIP_FUNCTION_MACROS tag is set to YES (the default) then 
 # doxygen's preprocessor will remove all function-like macros that are alone 
-# on a line and do not end with a semicolon. Such function macros are typically 
-# used for boiler-plate code, and will confuse the parser if not removed.
+# on a line, have an all uppercase name, and do not end with a semicolon. Such 
+# function macros are typically used for boiler-plate code, and will confuse 
+# the parser if not removed.
 
 SKIP_FUNCTION_MACROS   = YES
 
 #---------------------------------------------------------------------------
-# Configuration::addtions related to external references   
+# Configuration::additions related to external references   
 #---------------------------------------------------------------------------
 
-# The TAGFILES tag can be used to specify one or more tagfiles.
+# The TAGFILES option can be used to specify one or more tagfiles. 
+# Optionally an initial location of the external documentation 
+# can be added for each tagfile. The format of a tag file without 
+# this location is as follows: 
+#   TAGFILES = file1 file2 ... 
+# Adding location for the tag files is done as follows: 
+#   TAGFILES = file1=loc1 "file2 = loc2" ... 
+# where "loc1" and "loc2" can be relative or absolute paths or 
+# URLs. If a location is present for each tag, the installdox tool 
+# does not have to be run to correct the links.
+# Note that each tag file must have a unique name
+# (where the name does NOT include the path)
+# If a tag file is not located in the directory in which doxygen 
+# is run, you must also specify the path to the tagfile here.
 
 TAGFILES               = 
 
@@ -773,13 +1096,28 @@ PERL_PATH              = /usr/bin/perl
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the CLASS_DIAGRAMS tag is set to YES (the default) Doxygen will 
-# generate a inheritance diagram (in Html, RTF and LaTeX) for classes with base or 
-# super classes. Setting the tag to NO turns the diagrams off. Note that this 
-# option is superceded by the HAVE_DOT option below. This is only a fallback. It is 
-# recommended to install and use dot, since it yield more powerful graphs.
+# generate a inheritance diagram (in HTML, RTF and LaTeX) for classes with base 
+# or super classes. Setting the tag to NO turns the diagrams off. Note that 
+# this option is superseded by the HAVE_DOT option below. This is only a 
+# fallback. It is recommended to install and use dot, since it yields more 
+# powerful graphs.
 
 CLASS_DIAGRAMS         = YES
 
+# You can define message sequence charts within doxygen comments using the \msc 
+# command. Doxygen will then run the mscgen tool (see http://www.mcternan.me.uk/mscgen/) to 
+# produce the chart and insert it in the documentation. The MSCGEN_PATH tag allows you to 
+# specify the directory where the mscgen tool resides. If left empty the tool is assumed to 
+# be found in the default search path.
+
+MSCGEN_PATH            = 
+
+# If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will hide 
+# inheritance and usage relations if the target is undocumented 
+# or is not a class.
+
+HIDE_UNDOC_RELATIONS   = YES
+
 # If you set the HAVE_DOT tag to YES then doxygen will assume the dot tool is 
 # available from the path. This tool is part of Graphviz, a graph visualization 
 # toolkit from AT&T and Lucent Bell Labs. The other options in this section 
@@ -801,17 +1139,22 @@ CLASS_GRAPH            = YES
 
 COLLABORATION_GRAPH    = YES
 
+# If the GROUP_GRAPHS and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
+# will generate a graph for groups, showing the direct groups dependencies
+
+GROUP_GRAPHS           = YES
+
+# If the UML_LOOK tag is set to YES doxygen will generate inheritance and 
+# collaboration diagrams in a style similar to the OMG's Unified Modeling 
+# Language.
+
+UML_LOOK               = NO
+
 # If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will show the 
 # relations between templates and their instances.
 
 TEMPLATE_RELATIONS     = YES
 
-# If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will hide 
-# inheritance and usage relations if the target is undocumented 
-# or is not a class.
-
-HIDE_UNDOC_RELATIONS   = YES
-
 # If the ENABLE_PREPROCESSING, SEARCH_INCLUDES, INCLUDE_GRAPH, and HAVE_DOT 
 # tags are set to YES then doxygen will generate a graph for each documented 
 # file showing the direct and indirect include dependencies of the file with 
@@ -826,19 +1169,42 @@ INCLUDE_GRAPH          = YES
 
 INCLUDED_BY_GRAPH      = YES
 
+# If the CALL_GRAPH and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen will 
+# generate a call dependency graph for every global function or class method. 
+# Note that enabling this option will significantly increase the time of a run. 
+# So in most cases it will be better to enable call graphs for selected 
+# functions only using the \callgraph command.
+
+CALL_GRAPH             = NO
+
+# If the CALLER_GRAPH and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen will 
+# generate a caller dependency graph for every global function or class method. 
+# Note that enabling this option will significantly increase the time of a run. 
+# So in most cases it will be better to enable caller graphs for selected 
+# functions only using the \callergraph command.
+
+CALLER_GRAPH           = NO
+
 # If the GRAPHICAL_HIERARCHY and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
 # will graphical hierarchy of all classes instead of a textual one.
 
 GRAPHICAL_HIERARCHY    = YES
 
+# If the DIRECTORY_GRAPH, SHOW_DIRECTORIES and HAVE_DOT tags are set to YES 
+# then doxygen will show the dependencies a directory has on other directories 
+# in a graphical way. The dependency relations are determined by the #include
+# relations between the files in the directories.
+
+DIRECTORY_GRAPH        = YES
+
 # The DOT_IMAGE_FORMAT tag can be used to set the image format of the images 
-# generated by dot. Possible values are gif, jpg, and png
-# If left blank gif will be used.
+# generated by dot. Possible values are png, jpg, or gif
+# If left blank png will be used.
 
 DOT_IMAGE_FORMAT       = png
 
 # The tag DOT_PATH can be used to specify the path where the dot tool can be 
-# found. If left blank, it is assumed the dot tool can be found on the path.
+# found. If left blank, it is assumed the dot tool can be found in the path.
 
 DOT_PATH               = @GDCM_DOCUMENTATION_DOT_PATH@
 
@@ -848,21 +1214,28 @@ DOT_PATH               = @GDCM_DOCUMENTATION_DOT_PATH@
 
 DOTFILE_DIRS           = 
 
-# The MAX_DOT_GRAPH_WIDTH tag can be used to set the maximum allowed width 
-# (in pixels) of the graphs generated by dot. If a graph becomes larger than 
-# this value, doxygen will try to truncate the graph, so that it fits within 
-# the specified constraint. Beware that most browsers cannot cope with very 
-# large images.
+# The MAX_DOT_GRAPH_MAX_NODES tag can be used to set the maximum number of 
+# nodes that will be shown in the graph. If the number of nodes in a graph 
+# becomes larger than this value, doxygen will truncate the graph, which is 
+# visualized by representing a node as a red box. Note that doxygen will always 
+# show the root nodes and its direct children regardless of this setting.
+
+DOT_GRAPH_MAX_NODES    = 50
+
+# Set the DOT_TRANSPARENT tag to YES to generate images with a transparent 
+# background. This is disabled by default, which results in a white background. 
+# Warning: Depending on the platform used, enabling this option may lead to 
+# badly anti-aliased labels on the edges of a graph (i.e. they become hard to 
+# read).
 
-MAX_DOT_GRAPH_WIDTH    = 1024
+DOT_TRANSPARENT        = NO
 
-# The MAX_DOT_GRAPH_HEIGHT tag can be used to set the maximum allows height 
-# (in pixels) of the graphs generated by dot. If a graph becomes larger than 
-# this value, doxygen will try to truncate the graph, so that it fits within 
-# the specified constraint. Beware that most browsers cannot cope with very 
-# large images.
+# Set the DOT_MULTI_TARGETS tag to YES allow dot to generate multiple output 
+# files in one run (i.e. multiple -o and -T options on the command line). This 
+# makes dot run faster, but since only newer versions of dot (>1.8.10) 
+# support this, this feature is disabled by default.
 
-MAX_DOT_GRAPH_HEIGHT   = 1024
+DOT_MULTI_TARGETS      = NO
 
 # If the GENERATE_LEGEND tag is set to YES (the default) Doxygen will 
 # generate a legend page explaining the meaning of the various boxes and 
@@ -871,13 +1244,13 @@ MAX_DOT_GRAPH_HEIGHT   = 1024
 GENERATE_LEGEND        = YES
 
 # If the DOT_CLEANUP tag is set to YES (the default) Doxygen will 
-# remove the intermedate dot files that are used to generate 
+# remove the intermediate dot files that are used to generate 
 # the various graphs.
 
 DOT_CLEANUP            = YES
 
 #---------------------------------------------------------------------------
-# Configuration::addtions related to the search engine   
+# Configuration::additions related to the search engine   
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # The SEARCHENGINE tag specifies whether or not a search engine should be